JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

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CHR:POS	annotation hgvs_c hgvs_p	disease trait -log10p odds or beta	AHAPIDS ahapids	ACHAPIDS achapids	ACTHAPIDS acthapids	ACTGHAPIDS actghapids	haplotypeids haplotypeids	study	initial sample size/ replication sample size	report genes	mapped gene	strongest snp risk allele	strand strand	impact	chr	ref	alt
chr2:69586326	c.164-29348A>G c.164-29348A>G	Metabolite levels (Dihydroxy docosatrienoic acid) others(10): Show Metabolite levels (Dihydroxy docosatrienoic acid) 0.13	a0001 a0002 a0003 a0004 a0007 a0001 a0002 a0003 a0004 a0007	a0001c0001 a0001c0004 a0001c0006 a0001c0008 a0001c0026 others(4): Show a0001c0001 a0001c0004 a0001c0006 a0001c0008 a0001c0026 a0002c0005 a0003c0014 a0004c0012 a0007c0017	a0001c0001t0007 a0001c0001t0037 a0001c0001t0077 a0001c0004t0017 a0001c0004t0067 others(10): Show a0001c0001t0007 a0001c0001t0037 a0001c0001t0077 a0001c0004t0017 a0001c0004t0067 a0001c0004t0068 a0001c0004t0070 a0001c0004t0071 a0001c0006t0016 a0001c0008t0069 a0001c0026t0152 a0002c0005t0040 a0003c0014t0025 a0004c0012t0061 a0007c0017t0066	a0001c0001t0007g0081 a0001c0001t0037g0009 a0001c0001t0077g0072 a0001c0004t0017g0073 a0001c0004t0017g0075 others(13): Show a0001c0001t0007g0081 a0001c0001t0037g0009 a0001c0001t0077g0072 a0001c0004t0017g0073 a0001c0004t0017g0075 a0001c0004t0017g0078 a0001c0004t0067g0077 a0001c0004t0068g0079 a0001c0004t0070g0071 a0001c0004t0071g0074 a0001c0006t0016g0017 a0001c0008t0069g0102 a0001c0026t0152g0295 a0002c0005t0040g0006 a0003c0014t0025g0285 a0003c0014t0025g0286 a0004c0012t0061g0067 a0007c0017t0066g0076	HG00099.hp2 HG01255.hp1 HG01891.hp2 HG02109.hp2 HG02132.hp2 others(13): Show HG00099.hp2 HG01255.hp1 HG01891.hp2 HG02109.hp2 HG02132.hp2 HG02145.hp2 HG02572.hp1 HG02630.hp1 HG02698.hp2 HG02723.hp1 HG02818.hp2 HG03041.hp2 HG03139.hp1 HG03225.hp1 HG03540.hp2 HG06807.hp1 NA18950.hp2 NA19240.hp1	Genome-wide association study of a heart failure r others(107): Show Genome-wide association study of a heart failure r elated metabolomic profile among African Americans in the Atherosclerosis Risk in Communities (ARIC) study.	1,260 African American individuals/ 1,260 African American individuals/	AAK1	AAK1	rs12987661-C	-	MODIFIER	chr2	T T	C C
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chr2:69586326	c.164-29348A>G c.164-29348A>G	Red blood cell count Red blood cell count	a0001 a0002 a0003 a0004 a0007 a0001 a0002 a0003 a0004 a0007	a0001c0001 a0001c0004 a0001c0006 a0001c0008 a0001c0026 others(4): Show a0001c0001 a0001c0004 a0001c0006 a0001c0008 a0001c0026 a0002c0005 a0003c0014 a0004c0012 a0007c0017	a0001c0001t0007 a0001c0001t0037 a0001c0001t0077 a0001c0004t0017 a0001c0004t0067 others(10): Show a0001c0001t0007 a0001c0001t0037 a0001c0001t0077 a0001c0004t0017 a0001c0004t0067 a0001c0004t0068 a0001c0004t0070 a0001c0004t0071 a0001c0006t0016 a0001c0008t0069 a0001c0026t0152 a0002c0005t0040 a0003c0014t0025 a0004c0012t0061 a0007c0017t0066	a0001c0001t0007g0081 a0001c0001t0037g0009 a0001c0001t0077g0072 a0001c0004t0017g0073 a0001c0004t0017g0075 others(13): Show a0001c0001t0007g0081 a0001c0001t0037g0009 a0001c0001t0077g0072 a0001c0004t0017g0073 a0001c0004t0017g0075 a0001c0004t0017g0078 a0001c0004t0067g0077 a0001c0004t0068g0079 a0001c0004t0070g0071 a0001c0004t0071g0074 a0001c0006t0016g0017 a0001c0008t0069g0102 a0001c0026t0152g0295 a0002c0005t0040g0006 a0003c0014t0025g0285 a0003c0014t0025g0286 a0004c0012t0061g0067 a0007c0017t0066g0076	HG00099.hp2 HG01255.hp1 HG01891.hp2 HG02109.hp2 HG02132.hp2 others(13): Show HG00099.hp2 HG01255.hp1 HG01891.hp2 HG02109.hp2 HG02132.hp2 HG02145.hp2 HG02572.hp1 HG02630.hp1 HG02698.hp2 HG02723.hp1 HG02818.hp2 HG03041.hp2 HG03139.hp1 HG03225.hp1 HG03540.hp2 HG06807.hp1 NA18950.hp2 NA19240.hp1	Leveraging Polygenic Functional Enrichment to Impr others(15): Show Leveraging Polygenic Functional Enrichment to Impr ove GWAS Power.	approximately 445,000 European ancestry individual others(2): Show approximately 445,000 European ancestry individual s/		AAK1	rs12987661-?	-	MODIFIER	chr2	T T	C C
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chr2:69586326	c.164-29348A>G c.164-29348A>G	Urate levels 0.0426 Urate levels 0.0426	a0001 a0002 a0003 a0004 a0007 a0001 a0002 a0003 a0004 a0007	a0001c0001 a0001c0004 a0001c0006 a0001c0008 a0001c0026 others(4): Show a0001c0001 a0001c0004 a0001c0006 a0001c0008 a0001c0026 a0002c0005 a0003c0014 a0004c0012 a0007c0017	a0001c0001t0007 a0001c0001t0037 a0001c0001t0077 a0001c0004t0017 a0001c0004t0067 others(10): Show a0001c0001t0007 a0001c0001t0037 a0001c0001t0077 a0001c0004t0017 a0001c0004t0067 a0001c0004t0068 a0001c0004t0070 a0001c0004t0071 a0001c0006t0016 a0001c0008t0069 a0001c0026t0152 a0002c0005t0040 a0003c0014t0025 a0004c0012t0061 a0007c0017t0066	a0001c0001t0007g0081 a0001c0001t0037g0009 a0001c0001t0077g0072 a0001c0004t0017g0073 a0001c0004t0017g0075 others(13): Show a0001c0001t0007g0081 a0001c0001t0037g0009 a0001c0001t0077g0072 a0001c0004t0017g0073 a0001c0004t0017g0075 a0001c0004t0017g0078 a0001c0004t0067g0077 a0001c0004t0068g0079 a0001c0004t0070g0071 a0001c0004t0071g0074 a0001c0006t0016g0017 a0001c0008t0069g0102 a0001c0026t0152g0295 a0002c0005t0040g0006 a0003c0014t0025g0285 a0003c0014t0025g0286 a0004c0012t0061g0067 a0007c0017t0066g0076	HG00099.hp2 HG01255.hp1 HG01891.hp2 HG02109.hp2 HG02132.hp2 others(13): Show HG00099.hp2 HG01255.hp1 HG01891.hp2 HG02109.hp2 HG02132.hp2 HG02145.hp2 HG02572.hp1 HG02630.hp1 HG02698.hp2 HG02723.hp1 HG02818.hp2 HG03041.hp2 HG03139.hp1 HG03225.hp1 HG03540.hp2 HG06807.hp1 NA18950.hp2 NA19240.hp1	Target genes, variants, tissues and transcriptiona others(48): Show Target genes, variants, tissues and transcriptiona l pathways influencing human serum urate levels.	288,649 European ancestry individuals, 125,725 Eas others(132): Show 288,649 European ancestry individuals, 125,725 Eas t Asian ancestry individuals, 33,671 African Ameri can individuals, 9,037 South Asian ancestry indivi duals, 608 Hispanic individuals/	AAK1	AAK1	rs12987661-T	-	MODIFIER	chr2	T T	C C
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Haplotype Detail Info [AAK1_chr2_69452997_69648739>a0001]

🧬 Gene Summary

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AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 42)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 0)

GWASCatalog Related Variants (Total: 35)

GTEx Related Variants (Page 1 of 31 - Total: 3041)