JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

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CHR:POS	annotation hgvs_c hgvs_p	disease trait -log10p odds or beta	AHAPIDS ahapids	ACHAPIDS achapids	ACTHAPIDS acthapids	ACTGHAPIDS actghapids	haplotypeids haplotypeids	study	initial sample size/ replication sample size	report genes	mapped gene	strongest snp risk allele	strand strand	impact	chr	ref	alt
chr5:131965922	c.1713+494C>T c.1713+494C>T	Alzheimer's disease in APOE e4- carriers others(9): Show Alzheimer's disease in APOE e4- carriers 1.1627907	a0001 a0002 a0003 a0001 a0002 a0003	a0001c0001 a0001c0007 a0002c0011 a0003c0005 a0001c0001 a0001c0007 a0002c0011 a0003c0005	a0001c0001t0002 a0001c0001t0010 a0001c0001t0012 a0001c0001t0014 a0001c0001t0021 others(9): Show a0001c0001t0002 a0001c0001t0010 a0001c0001t0012 a0001c0001t0014 a0001c0001t0021 a0001c0001t0023 a0001c0001t0024 a0001c0001t0027 a0001c0001t0028 a0001c0001t0029 a0001c0001t0030 a0001c0007t0002 a0002c0011t0002 a0003c0005t0002	a0001c0001t0002g0002 a0001c0001t0002g0003 a0001c0001t0002g0004 a0001c0001t0002g0013 a0001c0001t0002g0018 others(98): Show a0001c0001t0002g0002 a0001c0001t0002g0003 a0001c0001t0002g0004 a0001c0001t0002g0013 a0001c0001t0002g0018 a0001c0001t0002g0022 a0001c0001t0002g0025 a0001c0001t0002g0026 a0001c0001t0002g0027 a0001c0001t0002g0028 a0001c0001t0002g0030 a0001c0001t0002g0032 a0001c0001t0002g0038 a0001c0001t0002g0042 a0001c0001t0002g0043 a0001c0001t0002g0060 a0001c0001t0002g0077 a0001c0001t0002g0078 a0001c0001t0002g0096 a0001c0001t0002g0102 a0001c0001t0002g0121 a0001c0001t0002g0123 a0001c0001t0002g0124 a0001c0001t0002g0125 a0001c0001t0002g0126 a0001c0001t0002g0132 a0001c0001t0002g0142 a0001c0001t0002g0157 a0001c0001t0002g0158 a0001c0001t0002g0160 a0001c0001t0002g0162 a0001c0001t0002g0163 a0001c0001t0002g0164 a0001c0001t0002g0165 a0001c0001t0002g0166 a0001c0001t0002g0167 a0001c0001t0002g0168 a0001c0001t0002g0169 a0001c0001t0002g0170 a0001c0001t0002g0171 a0001c0001t0002g0172 a0001c0001t0002g0173 a0001c0001t0002g0174 a0001c0001t0002g0175 a0001c0001t0002g0178 a0001c0001t0002g0179 a0001c0001t0002g0180 a0001c0001t0002g0182 a0001c0001t0002g0183 a0001c0001t0002g0185 a0001c0001t0002g0190 a0001c0001t0002g0191 a0001c0001t0002g0193 a0001c0001t0002g0194 a0001c0001t0002g0195 a0001c0001t0002g0197 a0001c0001t0002g0198 a0001c0001t0002g0199 a0001c0001t0002g0200 a0001c0001t0002g0201 a0001c0001t0002g0202 a0001c0001t0002g0203 a0001c0001t0002g0204 a0001c0001t0002g0205 a0001c0001t0002g0206 a0001c0001t0002g0208 a0001c0001t0002g0210 a0001c0001t0002g0214 a0001c0001t0002g0216 a0001c0001t0002g0217 a0001c0001t0002g0218 a0001c0001t0002g0219 a0001c0001t0002g0221 a0001c0001t0002g0224 a0001c0001t0002g0225 a0001c0001t0002g0226 a0001c0001t0002g0227 a0001c0001t0002g0228 a0001c0001t0002g0231 a0001c0001t0002g0232 a0001c0001t0002g0235 a0001c0001t0002g0250 a0001c0001t0002g0252 a0001c0001t0002g0256 a0001c0001t0002g0263 a0001c0001t0002g0264 a0001c0001t0002g0265 a0001c0001t0010g0029 a0001c0001t0010g0215 a0001c0001t0012g0233 a0001c0001t0012g0234 a0001c0001t0014g0258 a0001c0001t0014g0259 a0001c0001t0021g0159 a0001c0001t0023g0192 a0001c0001t0024g0196 a0001c0001t0027g0156 a0001c0001t0028g0161 a0001c0001t0029g0220 a0001c0001t0030g0134 a0001c0007t0002g0212 a0002c0011t0002g0107 a0003c0005t0002g0207	HG00280.hp1 HG00280.hp2 HG00408.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp1 others(120): Show HG00280.hp1 HG00280.hp2 HG00408.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00673.hp1 HG00673.hp2 HG00733.hp1 HG00738.hp1 HG01070.hp1 HG01071.hp2 HG01099.hp1 HG01109.hp1 HG01123.hp2 HG01168.hp2 HG01175.hp1 HG01192.hp1 HG01192.hp2 HG01255.hp1 HG01255.hp2 HG01256.hp2 HG01257.hp2 HG01258.hp1 HG01433.hp2 HG01516.hp2 HG01884.hp2 HG01934.hp2 HG01943.hp2 HG01952.hp1 HG01978.hp1 HG01981.hp1 HG01993.hp2 HG02015.hp1 HG02027.hp1 HG02027.hp2 HG02040.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp1 HG02071.hp2 HG02135.hp1 HG02155.hp1 HG02165.hp1 HG02273.hp1 HG02486.hp1 HG02602.hp1 HG02630.hp2 HG02738.hp2 HG02896.hp2 HG02897.hp2 HG02965.hp1 HG02976.hp2 HG03209.hp2 HG03239.hp1 HG03486.hp1 HG03486.hp2 HG03579.hp1 HG03654.hp2 HG03688.hp2 HG03704.hp2 HG03834.hp1 HG03834.hp2 HG03927.hp1 HG04115.hp2 HG04184.hp2 NA18939.hp2 NA18940.hp2 NA18941.hp2 NA18944.hp2 NA18945.hp1 NA18946.hp1 NA18947.hp1 NA18948.hp1 NA18949.hp2 NA18951.hp2 NA18953.hp2 NA18954.hp2 NA18955.hp1 NA18956.hp2 NA18957.hp1 NA18959.hp2 NA18960.hp2 NA18962.hp2 NA18963.hp1 NA18964.hp1 NA18964.hp2 NA18966.hp2 NA18970.hp1 NA18974.hp1 NA18974.hp2 NA18979.hp2 NA18981.hp1 NA18984.hp2 NA18985.hp2 NA18988.hp2 NA18991.hp1 NA18995.hp2 NA18998.hp1 NA18999.hp1 NA19000.hp1 NA19005.hp2 NA19007.hp1 NA19010.hp2 NA19012.hp1 NA19054.hp1 NA19055.hp2 NA19062.hp1 NA19063.hp1 NA19064.hp1 NA19065.hp1 NA19066.hp2 NA19067.hp2 NA19070.hp1 NA19074.hp2 NA19076.hp2 NA19078.hp1 NA19079.hp2 NA19080.hp1 NA19081.hp2 NA19082.hp2 NA19083.hp1 NA19083.hp2 NA19084.hp1 NA19091.hp1 NA20752.hp2 NA20905.hp2	A novel Alzheimer disease locus located near the g others(25): Show A novel Alzheimer disease locus located near the g ene encoding tau protein.	7,184 cases, 26,968 controls/718 European ancestry others(40): Show 7,184 cases, 26,968 controls/718 European ancestry cases, 1,699 European ancestry controls	ACSL6	ACSL6	rs476428-G	-	MODIFIER	chr5	G G	A A
chr5:131945765	c.8469C>G c.8469C>G	Triglyceride to HDL cholesterol ratio 0.0 others(2): Show Triglyceride to HDL cholesterol ratio 0.048	a0001 a0002 a0001 a0002	a0001c0001 a0002c0011 a0001c0001 a0002c0011	a0001c0001t0002 a0002c0011t0002 a0001c0001t0002 a0002c0011t0002	a0001c0001t0002g0096 a0001c0001t0002g0102 a0001c0001t0002g0121 a0001c0001t0002g0250 a0002c0011t0002g0107 a0001c0001t0002g0096 a0001c0001t0002g0102 a0001c0001t0002g0121 a0001c0001t0002g0250 a0002c0011t0002g0107	HG00733.hp1 HG01256.hp2 HG03654.hp2 HG04115.hp2 HG04184.hp2 HG00733.hp1 HG01256.hp2 HG03654.hp2 HG04115.hp2 HG04184.hp2	Comprehensive genetic study of the insulin resista others(38): Show Comprehensive genetic study of the insulin resista nce marker TG:HDL-C in the UK Biobank.	402,398 European ancestry individuals/ 402,398 European ancestry individuals/		MEIKIN - ACSL6	rs664732-C	-	MODIFIER	chr5	G G	C C
chr5:131945765	c.8469C>G c.8469C>G	Triglyceride to HDL cholesterol ratio 0.0 others(3): Show Triglyceride to HDL cholesterol ratio 0.0588	a0001 a0002 a0001 a0002	a0001c0001 a0002c0011 a0001c0001 a0002c0011	a0001c0001t0002 a0002c0011t0002 a0001c0001t0002 a0002c0011t0002	a0001c0001t0002g0096 a0001c0001t0002g0102 a0001c0001t0002g0121 a0001c0001t0002g0250 a0002c0011t0002g0107 a0001c0001t0002g0096 a0001c0001t0002g0102 a0001c0001t0002g0121 a0001c0001t0002g0250 a0002c0011t0002g0107	HG00733.hp1 HG01256.hp2 HG03654.hp2 HG04115.hp2 HG04184.hp2 HG00733.hp1 HG01256.hp2 HG03654.hp2 HG04115.hp2 HG04184.hp2	Comprehensive genetic study of the insulin resista others(38): Show Comprehensive genetic study of the insulin resista nce marker TG:HDL-C in the UK Biobank.	185,749 European ancestry individuals/ 185,749 European ancestry individuals/		MEIKIN - ACSL6	rs664732-C	-	MODIFIER	chr5	G G	C C
chr5:131995059	c.50-808G>A c.50-808G>A	COVID-19 (critical illness vs population or mild symptoms) others(18): Show COVID-19 (critical illness vs population or mild symptoms)	a0001 a0004 a0005 a0001 a0004 a0005	a0001c0001 a0001c0003 a0001c0009 a0004c0008 a0005c0010 a0001c0001 a0001c0003 a0001c0009 a0004c0008 a0005c0010	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 others(18): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0011 a0001c0001t0012 a0001c0001t0014 a0001c0001t0015 a0001c0001t0019 a0001c0001t0023 a0001c0001t0024 a0001c0001t0025 a0001c0001t0027 a0001c0001t0028 a0001c0001t0030 a0001c0003t0013 a0001c0009t0007 a0004c0008t0004 a0005c0010t0003	a0001c0001t0001g0128 a0001c0001t0001g0129 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0144 a0001c0001t0001g0181 others(106): Show a0001c0001t0001g0128 a0001c0001t0001g0129 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0144 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factors under others(24): Show Whole genome sequencing reveals host factors under lying critical Covid-19.	5,989 European ancestry cases, 42,891 European anc others(210): Show 5,989 European ancestry cases, 42,891 European anc estry controls, 788 South Asian ancestry cases, 3, 793 South Asian ancestry controls, 440 African anc estry cases, 1,350 African ancestry controls, 274 East Asian ancestry cases, 366 East Asian ancestry controls/		ACSL6	rs56162149-T	-	MODIFIER	chr5	C C	T T
chr5:131995059	c.50-808G>A c.50-808G>A	COVID-19 (critical illness vs population or mild symptoms) others(21): Show COVID-19 (critical illness vs population or mild symptoms) 1.2	a0001 a0004 a0005 a0001 a0004 a0005	a0001c0001 a0001c0003 a0001c0009 a0004c0008 a0005c0010 a0001c0001 a0001c0003 a0001c0009 a0004c0008 a0005c0010	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 others(18): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0011 a0001c0001t0012 a0001c0001t0014 a0001c0001t0015 a0001c0001t0019 a0001c0001t0023 a0001c0001t0024 a0001c0001t0025 a0001c0001t0027 a0001c0001t0028 a0001c0001t0030 a0001c0003t0013 a0001c0009t0007 a0004c0008t0004 a0005c0010t0003	a0001c0001t0001g0128 a0001c0001t0001g0129 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0144 a0001c0001t0001g0181 others(106): Show a0001c0001t0001g0128 a0001c0001t0001g0129 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0144 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factors under others(24): Show Whole genome sequencing reveals host factors under lying critical Covid-19.	5,989 European ancestry cases, 42,891 European anc others(15): Show 5,989 European ancestry cases, 42,891 European anc estry controls/		ACSL6	rs56162149-T	-	MODIFIER	chr5	C C	T T
chr5:132005848	c.49+5657C>G c.49+5657C>G	Cortical surface area 1.5816824 Cortical surface area 1.5816824	a0001 a0005 a0001 a0005	a0001c0001 a0005c0010 a0001c0001 a0005c0010	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0015 others(3): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0015 a0001c0001t0019 a0001c0001t0031 a0005c0010t0003	a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0144 others(31): Show a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0144 a0001c0001t0001g0238 a0001c0001t0001g0239 a0001c0001t0001g0240 a0001c0001t0001g0242 a0001c0001t0001g0243 a0001c0001t0001g0244 a0001c0001t0001g0245 a0001c0001t0001g0246 a0001c0001t0001g0247 a0001c0001t0001g0248 a0001c0001t0001g0249 a0001c0001t0002g0142 a0001c0001t0002g0250 a0001c0001t0003g0011 a0001c0001t0003g0012 a0001c0001t0003g0020 a0001c0001t0003g0021 a0001c0001t0003g0034 a0001c0001t0003g0137 a0001c0001t0003g0139 a0001c0001t0003g0141 a0001c0001t0003g0145 a0001c0001t0003g0146 a0001c0001t0003g0148 a0001c0001t0003g0149 a0001c0001t0003g0150 a0001c0001t0004g0147 a0001c0001t0015g0140 a0001c0001t0019g0033 a0001c0001t0031g0241 a0005c0010t0003g0138	HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 others(45): Show HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00733.hp1 HG00735.hp2 HG00741.hp2 HG01069.hp1 HG01069.hp2 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01081.hp2 HG01099.hp2 HG01106.hp1 HG01109.hp2 HG01168.hp1 HG01169.hp1 HG01175.hp2 HG01243.hp2 HG01256.hp1 HG01258.hp2 HG01361.hp1 HG01433.hp1 HG01891.hp1 HG01891.hp2 HG01981.hp2 HG02109.hp1 HG02257.hp1 HG02257.hp2 HG02258.hp2 HG02273.hp2 HG02559.hp2 HG02572.hp1 HG02622.hp2 HG02683.hp2 HG02717.hp2 HG02723.hp1 HG02897.hp1 HG03098.hp2 HG03130.hp1 HG03139.hp1 HG03195.hp2 HG03225.hp2 HG03471.hp1 HG03486.hp2 HG03540.hp2 NA18522.hp2 NA18906.hp2 NA20805.hp2	The genetic architecture of the human cerebral cor others(4): Show The genetic architecture of the human cerebral cor tex.	33,992 European ancestry individuals/14,727 Europe others(42): Show 33,992 European ancestry individuals/14,727 Europe an ancestry individuals, 2,943 individuals	NR	ACSL6, ACSL6-AS1	rs7714191-C	-	MODIFIER	chr5	G G	C C
chr5:132011827	c.-274C>T c.-274C>T	Atopic dermatitis 0.98 Atopic dermatitis 0.98	a0001 a0005 a0001 a0005	a0001c0001 a0001c0009 a0005c0010 a0001c0001 a0001c0009 a0005c0010	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 others(5): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 a0001c0001t0015 a0001c0001t0019 a0001c0001t0031 a0001c0009t0007 a0005c0010t0003	a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0144 others(39): Show a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0144 a0001c0001t0001g0238 a0001c0001t0001g0239 a0001c0001t0001g0240 a0001c0001t0001g0242 a0001c0001t0001g0243 a0001c0001t0001g0244 a0001c0001t0001g0245 a0001c0001t0001g0246 a0001c0001t0001g0247 a0001c0001t0001g0248 a0001c0001t0001g0249 a0001c0001t0002g0142 a0001c0001t0002g0250 a0001c0001t0003g0011 a0001c0001t0003g0012 a0001c0001t0003g0020 a0001c0001t0003g0021 a0001c0001t0003g0034 a0001c0001t0003g0137 a0001c0001t0003g0139 a0001c0001t0003g0141 a0001c0001t0003g0145 a0001c0001t0003g0146 a0001c0001t0003g0148 a0001c0001t0003g0149 a0001c0001t0003g0150 a0001c0001t0004g0019 a0001c0001t0004g0135 a0001c0001t0004g0136 a0001c0001t0004g0147 a0001c0001t0007g0151 a0001c0001t0007g0152 a0001c0001t0007g0154 a0001c0001t0007g0155 a0001c0001t0015g0140 a0001c0001t0019g0033 a0001c0001t0031g0241 a0001c0009t0007g0153 a0005c0010t0003g0138	HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 others(54): Show HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00733.hp1 HG00735.hp2 HG00741.hp2 HG01069.hp1 HG01069.hp2 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01081.hp2 HG01099.hp2 HG01106.hp1 HG01109.hp2 HG01168.hp1 HG01169.hp1 HG01175.hp2 HG01243.hp2 HG01256.hp1 HG01258.hp2 HG01361.hp1 HG01433.hp1 HG01496.hp1 HG01891.hp1 HG01891.hp2 HG01981.hp2 HG02109.hp1 HG02257.hp1 HG02257.hp2 HG02258.hp1 HG02258.hp2 HG02273.hp2 HG02451.hp2 HG02559.hp2 HG02572.hp1 HG02622.hp1 HG02622.hp2 HG02647.hp1 HG02683.hp2 HG02717.hp2 HG02723.hp1 HG02723.hp2 HG02897.hp1 HG02965.hp2 HG03041.hp2 HG03098.hp2 HG03130.hp1 HG03139.hp1 HG03195.hp2 HG03225.hp2 HG03471.hp1 HG03486.hp2 HG03540.hp2 NA18522.hp1 NA18522.hp2 NA18906.hp2 NA20805.hp2	European and multi-ancestry genome-wide associatio others(89): Show European and multi-ancestry genome-wide associatio n meta-analysis of atopic dermatitis highlights im portance of systemic immune regulation.	60,653 European ancestry cases, 804,329 European a others(86): Show 60,653 European ancestry cases, 804,329 European a ncestry controls/387,407 European ancestry cases, 2,517,257 European ancestry controls		ACSL6	rs4705908-A	-	MODIFIER	chr5	G G	A A
chr5:132000412	c.50-6161G>A c.50-6161G>A	Whole body fat free mass (UKB data field 23101) others(16): Show Whole body fat free mass (UKB data field 23101) 0.0112804	a0001 a0005 a0001 a0005	a0001c0001 a0001c0009 a0005c0010 a0001c0001 a0001c0009 a0005c0010	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 others(7): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 a0001c0001t0009 a0001c0001t0015 a0001c0001t0019 a0001c0001t0030 a0001c0001t0031 a0001c0009t0007 a0005c0010t0003	a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0144 others(48): Show a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0144 a0001c0001t0001g0238 a0001c0001t0001g0239 a0001c0001t0001g0240 a0001c0001t0001g0242 a0001c0001t0001g0243 a0001c0001t0001g0244 a0001c0001t0001g0245 a0001c0001t0001g0246 a0001c0001t0001g0247 a0001c0001t0001g0248 a0001c0001t0001g0249 a0001c0001t0001g0261 a0001c0001t0002g0142 a0001c0001t0002g0250 a0001c0001t0002g0263 a0001c0001t0002g0264 a0001c0001t0002g0265 a0001c0001t0003g0011 a0001c0001t0003g0012 a0001c0001t0003g0020 a0001c0001t0003g0021 a0001c0001t0003g0034 a0001c0001t0003g0137 a0001c0001t0003g0139 a0001c0001t0003g0141 a0001c0001t0003g0145 a0001c0001t0003g0146 a0001c0001t0003g0148 a0001c0001t0003g0149 a0001c0001t0003g0150 a0001c0001t0003g0266 a0001c0001t0004g0019 a0001c0001t0004g0135 a0001c0001t0004g0136 a0001c0001t0004g0147 a0001c0001t0004g0229 a0001c0001t0004g0260 a0001c0001t0007g0151 a0001c0001t0007g0152 a0001c0001t0007g0154 a0001c0001t0007g0155 a0001c0001t0009g0130 a0001c0001t0015g0140 a0001c0001t0019g0033 a0001c0001t0030g0134 a0001c0001t0031g0241 a0001c0009t0007g0153 a0005c0010t0003g0138	HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 others(63): Show HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00733.hp1 HG00735.hp2 HG00741.hp2 HG01069.hp1 HG01069.hp2 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01081.hp2 HG01099.hp2 HG01106.hp1 HG01109.hp2 HG01168.hp1 HG01169.hp1 HG01175.hp2 HG01243.hp2 HG01256.hp1 HG01258.hp2 HG01361.hp1 HG01433.hp1 HG01496.hp1 HG01891.hp1 HG01891.hp2 HG01981.hp2 HG02109.hp1 HG02257.hp1 HG02257.hp2 HG02258.hp1 HG02258.hp2 HG02273.hp2 HG02280.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02559.hp1 HG02559.hp2 HG02572.hp1 HG02622.hp1 HG02622.hp2 HG02630.hp2 HG02647.hp1 HG02647.hp2 HG02683.hp2 HG02717.hp2 HG02723.hp1 HG02723.hp2 HG02897.hp1 HG02965.hp1 HG02965.hp2 HG02976.hp2 HG03041.hp2 HG03098.hp2 HG03130.hp1 HG03139.hp1 HG03195.hp2 HG03225.hp2 HG03453.hp1 HG03471.hp1 HG03471.hp2 HG03486.hp2 HG03540.hp2 NA18522.hp1 NA18522.hp2 NA18906.hp2 NA20805.hp2	New role of fat-free mass in cancer risk linked wi others(26): Show New role of fat-free mass in cancer risk linked wi th genetic predisposition.	337,739 European ancestry individuals/ 337,739 European ancestry individuals/		ACSL6	rs17132288-T	-	MODIFIER	chr5	C C	T T
chr5:131986601	c.864+221C>A c.864+221C>A	Leukocyte telomere length or severe COVID-19 infection (MTAG) others(21): Show Leukocyte telomere length or severe COVID-19 infection (MTAG)	a0001 a0002 a0001 a0002	a0001c0001 a0001c0002 a0002c0011 a0001c0001 a0001c0002 a0002c0011	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0006 a0001c0001t0009 others(7): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0006 a0001c0001t0009 a0001c0001t0016 a0001c0001t0017 a0001c0001t0020 a0001c0001t0022 a0001c0001t0031 a0001c0002t0001 a0002c0011t0002	a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 others(105): Show a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0009 a0001c0001t0001g0010 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0015 a0001c0001t0001g0017 a0001c0001t0001g0039 a0001c0001t0001g0040 a0001c0001t0001g0044 a0001c0001t0001g0045 a0001c0001t0001g0046 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a0002c0011t0002g0107	HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00408.hp2 others(130): Show HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00408.hp2 HG00438.hp1 HG00544.hp2 HG00609.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp1 HG00642.hp2 HG00733.hp1 HG00733.hp2 HG00735.hp1 HG00735.hp2 HG00738.hp2 HG00741.hp1 HG00741.hp2 HG01069.hp2 HG01070.hp2 HG01081.hp2 HG01099.hp2 HG01106.hp1 HG01106.hp2 HG01109.hp2 HG01123.hp1 HG01167.hp1 HG01168.hp1 HG01169.hp1 HG01175.hp2 HG01243.hp1 HG01256.hp1 HG01256.hp2 HG01257.hp1 HG01258.hp2 HG01361.hp2 HG01496.hp2 HG01516.hp1 HG01884.hp2 HG01891.hp1 HG01934.hp1 HG01943.hp1 HG01952.hp2 HG01978.hp2 HG01981.hp2 HG01993.hp1 HG02015.hp2 HG02055.hp1 HG02056.hp2 HG02071.hp1 HG02109.hp1 HG02135.hp2 HG02145.hp2 HG02155.hp2 HG02165.hp2 HG02257.hp2 HG02273.hp2 HG02451.hp1 HG02486.hp2 HG02602.hp2 HG02683.hp1 HG02683.hp2 HG02738.hp1 HG03540.hp1 HG03579.hp1 HG03579.hp2 HG03654.hp1 HG03654.hp2 HG03688.hp1 HG03704.hp1 HG03927.hp2 HG04115.hp1 HG04115.hp2 HG04184.hp1 HG04184.hp2 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others(94): Show 472,174 European ancestry individuals with telomer e measurements, 13,769 European ancestry COVID-19 cases, 1,072,442 European ancestry controls/		ACSL6	rs77937-?	-	MODIFIER	chr5	G G	T T
chr5:131984769	c.916+638G>A c.916+638G>A	Alanine aminotransferase levels 0.005 Alanine aminotransferase levels 0.005	a0001 a0002 a0001 a0002	a0001c0001 a0001c0007 a0002c0011 a0001c0001 a0001c0007 a0002c0011	a0001c0001t0002 a0001c0001t0010 a0001c0001t0029 a0001c0007t0002 a0002c0011t0002 a0001c0001t0002 a0001c0001t0010 a0001c0001t0029 a0001c0007t0002 a0002c0011t0002	a0001c0001t0002g0004 a0001c0001t0002g0013 a0001c0001t0002g0018 a0001c0001t0002g0028 a0001c0001t0002g0030 others(35): Show a0001c0001t0002g0004 a0001c0001t0002g0013 a0001c0001t0002g0018 a0001c0001t0002g0028 a0001c0001t0002g0030 a0001c0001t0002g0038 a0001c0001t0002g0042 a0001c0001t0002g0043 a0001c0001t0002g0060 a0001c0001t0002g0077 a0001c0001t0002g0078 a0001c0001t0002g0096 a0001c0001t0002g0102 a0001c0001t0002g0124 a0001c0001t0002g0125 a0001c0001t0002g0132 a0001c0001t0002g0180 a0001c0001t0002g0183 a0001c0001t0002g0185 a0001c0001t0002g0194 a0001c0001t0002g0208 a0001c0001t0002g0210 a0001c0001t0002g0214 a0001c0001t0002g0216 a0001c0001t0002g0217 a0001c0001t0002g0218 a0001c0001t0002g0219 a0001c0001t0002g0221 a0001c0001t0002g0224 a0001c0001t0002g0225 a0001c0001t0002g0226 a0001c0001t0002g0232 a0001c0001t0002g0250 a0001c0001t0002g0252 a0001c0001t0002g0256 a0001c0001t0010g0029 a0001c0001t0010g0215 a0001c0001t0029g0220 a0001c0007t0002g0212 a0002c0011t0002g0107	HG00280.hp1 HG00408.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00673.hp1 others(44): Show HG00280.hp1 HG00408.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00673.hp1 HG00733.hp1 HG01192.hp1 HG01255.hp1 HG01256.hp2 HG01433.hp2 HG01516.hp2 HG01884.hp2 HG01943.hp2 HG01952.hp1 HG01978.hp1 HG01981.hp1 HG02027.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp1 HG02071.hp2 HG02273.hp1 HG02602.hp1 HG02738.hp2 HG03209.hp2 HG03239.hp1 HG03486.hp1 HG03579.hp1 HG03688.hp2 HG03834.hp2 HG03927.hp1 HG04115.hp2 HG04184.hp2 NA18944.hp2 NA18954.hp2 NA18957.hp1 NA18959.hp2 NA18962.hp2 NA18964.hp1 NA18966.hp2 NA18979.hp2 NA18981.hp1 NA18984.hp2 NA18995.hp2 NA19005.hp2 NA19010.hp2 NA19012.hp1 NA19065.hp1 NA19074.hp2 NA19083.hp2	Integrative common and rare variant analyses provi others(61): Show Integrative common and rare variant analyses provi de insights into the genetic architecture of liver cirrhosis.	1,010,710 European ancestry individuals/ 1,010,710 European ancestry individuals/		ACSL6	rs253942-T	-	MODIFIER	chr5	C C	T T
chr5:131984769	c.916+638G>A c.916+638G>A	Triglyceride levels 0.0247988 Triglyceride levels 0.0247988	a0001 a0002 a0001 a0002	a0001c0001 a0001c0007 a0002c0011 a0001c0001 a0001c0007 a0002c0011	a0001c0001t0002 a0001c0001t0010 a0001c0001t0029 a0001c0007t0002 a0002c0011t0002 a0001c0001t0002 a0001c0001t0010 a0001c0001t0029 a0001c0007t0002 a0002c0011t0002	a0001c0001t0002g0004 a0001c0001t0002g0013 a0001c0001t0002g0018 a0001c0001t0002g0028 a0001c0001t0002g0030 others(35): Show a0001c0001t0002g0004 a0001c0001t0002g0013 a0001c0001t0002g0018 a0001c0001t0002g0028 a0001c0001t0002g0030 a0001c0001t0002g0038 a0001c0001t0002g0042 a0001c0001t0002g0043 a0001c0001t0002g0060 a0001c0001t0002g0077 a0001c0001t0002g0078 a0001c0001t0002g0096 a0001c0001t0002g0102 a0001c0001t0002g0124 a0001c0001t0002g0125 a0001c0001t0002g0132 a0001c0001t0002g0180 a0001c0001t0002g0183 a0001c0001t0002g0185 a0001c0001t0002g0194 a0001c0001t0002g0208 a0001c0001t0002g0210 a0001c0001t0002g0214 a0001c0001t0002g0216 a0001c0001t0002g0217 a0001c0001t0002g0218 a0001c0001t0002g0219 a0001c0001t0002g0221 a0001c0001t0002g0224 a0001c0001t0002g0225 a0001c0001t0002g0226 a0001c0001t0002g0232 a0001c0001t0002g0250 a0001c0001t0002g0252 a0001c0001t0002g0256 a0001c0001t0010g0029 a0001c0001t0010g0215 a0001c0001t0029g0220 a0001c0007t0002g0212 a0002c0011t0002g0107	HG00280.hp1 HG00408.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00673.hp1 others(44): Show HG00280.hp1 HG00408.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00673.hp1 HG00733.hp1 HG01192.hp1 HG01255.hp1 HG01256.hp2 HG01433.hp2 HG01516.hp2 HG01884.hp2 HG01943.hp2 HG01952.hp1 HG01978.hp1 HG01981.hp1 HG02027.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp1 HG02071.hp2 HG02273.hp1 HG02602.hp1 HG02738.hp2 HG03209.hp2 HG03239.hp1 HG03486.hp1 HG03579.hp1 HG03688.hp2 HG03834.hp2 HG03927.hp1 HG04115.hp2 HG04184.hp2 NA18944.hp2 NA18954.hp2 NA18957.hp1 NA18959.hp2 NA18962.hp2 NA18964.hp1 NA18966.hp2 NA18979.hp2 NA18981.hp1 NA18984.hp2 NA18995.hp2 NA19005.hp2 NA19010.hp2 NA19012.hp1 NA19065.hp1 NA19074.hp2 NA19083.hp2	The power of genetic diversity in genome-wide asso others(26): Show The power of genetic diversity in genome-wide asso ciation studies of lipids.	1,320,016 European ancestry individuals/ 1,320,016 European ancestry individuals/		ACSL6	rs253942-T	-	MODIFIER	chr5	C C	T T
chr5:131945765	c.8469C>G c.8469C>G	Triglycerides 0.0325 Triglycerides 0.0325	a0001 a0002 a0001 a0002	a0001c0001 a0002c0011 a0001c0001 a0002c0011	a0001c0001t0002 a0002c0011t0002 a0001c0001t0002 a0002c0011t0002	a0001c0001t0002g0096 a0001c0001t0002g0102 a0001c0001t0002g0121 a0001c0001t0002g0250 a0002c0011t0002g0107 a0001c0001t0002g0096 a0001c0001t0002g0102 a0001c0001t0002g0121 a0001c0001t0002g0250 a0002c0011t0002g0107	HG00733.hp1 HG01256.hp2 HG03654.hp2 HG04115.hp2 HG04184.hp2 HG00733.hp1 HG01256.hp2 HG03654.hp2 HG04115.hp2 HG04184.hp2	A cross-population atlas of genetic associations f others(24): Show A cross-population atlas of genetic associations f or 220 human phenotypes.	343,992 European ancestry individuals, 111,667 Eas others(29): Show 343,992 European ancestry individuals, 111,667 Eas t Asian ancestry individuals/		MEIKIN - ACSL6	rs664732-C	-	MODIFIER	chr5	G G	C C

pos	genename hgvs_c hgvs_p annotation	tissue expression gene -log10(pval) slope Tissue name in GTEx database(the target eQTL tissue name of the GTEx database) The -log10(nominal pvalue) in GTEx database Slope in GTEx database (positive value:alt allele has higher gene expression)	ahapid chapid thapid ghapid ahapid_count chapid_count thapid_count ghapid_count	AHAPIDS ahapids	ACHAPIDS achapids	ACTHAPIDS acthapids	ACTGHAPIDS actghapids	haplotypeids haplotypeids	af allele frequency in GTEx database	ms The number of samples with minor allele in GTEx database	ma The number of minor allele count in GTEx database	ver GTEx version	vid Variant ID in GTEx database	strand strand	impact	chr	ref	alt	external
131986333:splice 131986333:variant goto	ACSL6 intron_variant c.864+489A>G ACSL6 intron_variant c.864+489A>G	RAPGEF6 Adipose_Subcutaneous 12.684 -0.226	4 8 27 165	a0001 a0002 a0004 a0005 a0001 a0002 a0004 a0005	a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 a0001c0004 a0001c0009 others(3): Show a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 a0001c0004 a0001c0009 a0002c0011 a0004c0008 a0005c0010	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0006 others(22): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0006 a0001c0001t0007 a0001c0001t0009 a0001c0001t0011 a0001c0001t0015 a0001c0001t0016 a0001c0001t0017 a0001c0001t0018 a0001c0001t0019 a0001c0001t0020 a0001c0001t0022 a0001c0001t0025 a0001c0001t0026 a0001c0001t0030 a0001c0001t0031 a0001c0001t0032 a0001c0002t0001 a0001c0003t0013 a0001c0004t0001 a0001c0009t0007 a0002c0011t0002 a0004c0008t0004 a0005c0010t0003	a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 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Haplotype Detail Info [ACSL6_chr5_131944973_132016658>a0001]

🧬 Gene Summary

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AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 40)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 5)

GWASCatalog Related Variants (Total: 12)

GTEx Related Variants (Page 1 of 55 - Total: 5441)