JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Haplotype Detail Info [ACSS2_chr20_34871612_34932959>a0001]

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genename	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	ahapid	alen	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	aseq	chr	start	end
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ancestry individuals/		ACSS2	rs8123210-G	+	MODIFIER	chr20	G G	C C
chr20:34894237	c.374+11248C>T c.374+11248C>T	Gut microbiome abundance (class Clostridium sensu stricto sp. 17 (at 1 year) x Vaginal Birth interac others(68): Show Gut microbiome abundance (class Clostridium sensu stricto sp. 17 (at 1 year) x Vaginal Birth interaction 3.38	a0001 a0005 a0001 a0005	a0001c0002 a0001c0013 a0005c0011 a0001c0002 a0001c0013 a0005c0011	a0001c0002t0001 a0001c0013t0001 a0005c0011t0001 a0001c0002t0001 a0001c0013t0001 a0005c0011t0001	a0001c0002t0001g0024 a0001c0002t0001g0035 a0001c0002t0001g0036 a0001c0002t0001g0037 a0001c0002t0001g0059 others(9): Show a0001c0002t0001g0024 a0001c0002t0001g0035 a0001c0002t0001g0036 a0001c0002t0001g0037 a0001c0002t0001g0059 a0001c0002t0001g0070 a0001c0002t0001g0071 a0001c0002t0001g0073 a0001c0002t0001g0075 a0001c0002t0001g0087 a0001c0002t0001g0093 a0001c0002t0001g0109 a0001c0013t0001g0072 a0005c0011t0001g0074	HG00099.hp2 HG01069.hp1 HG01070.hp1 HG01109.hp2 HG01123.hp2 others(9): Show HG00099.hp2 HG01069.hp1 HG01070.hp1 HG01109.hp2 HG01123.hp2 HG01175.hp2 HG01928.hp2 HG02083.hp1 HG02698.hp1 HG02738.hp1 HG03017.hp1 HG04199.hp2 NA20300.hp2 NA20905.hp1	Gene-by-environment interactions modulate the infa others(38): Show Gene-by-environment interactions modulate the infa nt gut microbiota in asthma and atopy.	up to 688 European ancestry, South Asian ancestry, others(238): Show up to 688 European ancestry, South Asian ancestry, East Asian ancestry, African American or Afro-Car ibbean, Other admixed ancestry ancestry, Hispanic or Latin American, Greater Middle Eastern (Middle Eastern, North African or Persian), South East Asi an ancestry, unknown ancestry females/		ACSS2	rs13044142-T	+	MODIFIER	chr20	C C	T T
chr20:34882711	c.179-83T>C c.179-83T>C	Hip circumference adjusted for BMI 0.0253 others(3): Show Hip circumference adjusted for BMI 0.0253877	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0001 a0001c0001t0003	a0001c0001t0001g0152 a0001c0001t0001g0153 a0001c0001t0001g0156 a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0162 others(7): Show a0001c0001t0001g0152 a0001c0001t0001g0153 a0001c0001t0001g0156 a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0162 a0001c0001t0001g0169 a0001c0001t0001g0170 a0001c0001t0001g0171 a0001c0001t0001g0185 a0001c0001t0001g0203 a0001c0001t0001g0209 a0001c0001t0003g0186	HG00642.hp1 HG00733.hp2 HG01070.hp2 HG01106.hp2 HG01258.hp1 others(7): Show HG00642.hp1 HG00733.hp2 HG01070.hp2 HG01106.hp2 HG01258.hp1 HG01346.hp1 HG01517.hp2 HG01934.hp2 HG01975.hp1 HG06807.hp1 NA20129.hp1 NA20805.hp2	GWAS of allometric body-shape indices in UK Bioban others(109): Show GWAS of allometric body-shape indices in UK Bioban k identifies loci suggesting associations with mor phogenesis, organogenesis, adrenal cell renewal an d cancer.	186,825 British ancestry men/ 186,825 British ancestry men/	ACSS2	ACSS2	rs6088638-C	+	MODIFIER	chr20	T T	C C
chr20:34882711	c.179-83T>C c.179-83T>C	Multi-trait sex score Multi-trait sex score	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0001 a0001c0001t0003	a0001c0001t0001g0152 a0001c0001t0001g0153 a0001c0001t0001g0156 a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0162 others(7): Show a0001c0001t0001g0152 a0001c0001t0001g0153 a0001c0001t0001g0156 a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0162 a0001c0001t0001g0169 a0001c0001t0001g0170 a0001c0001t0001g0171 a0001c0001t0001g0185 a0001c0001t0001g0203 a0001c0001t0001g0209 a0001c0001t0003g0186	HG00642.hp1 HG00733.hp2 HG01070.hp2 HG01106.hp2 HG01258.hp1 others(7): Show HG00642.hp1 HG00733.hp2 HG01070.hp2 HG01106.hp2 HG01258.hp1 HG01346.hp1 HG01517.hp2 HG01934.hp2 HG01975.hp1 HG06807.hp1 NA20129.hp1 NA20805.hp2	The genetics of a "femaleness/maleness" score in c others(40): Show The genetics of a "femaleness/maleness" score in c ardiometabolic traits in the UK biobank.	161,906 European ancestry females/ 161,906 European ancestry females/		ACSS2	rs6088638-?	+	MODIFIER	chr20	T T	C C
chr20:34882711	c.179-83T>C c.179-83T>C	Body surface area 0.00560446 Body surface area 0.00560446	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0001 a0001c0001t0003	a0001c0001t0001g0152 a0001c0001t0001g0153 a0001c0001t0001g0156 a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0162 others(7): Show a0001c0001t0001g0152 a0001c0001t0001g0153 a0001c0001t0001g0156 a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0162 a0001c0001t0001g0169 a0001c0001t0001g0170 a0001c0001t0001g0171 a0001c0001t0001g0185 a0001c0001t0001g0203 a0001c0001t0001g0209 a0001c0001t0003g0186	HG00642.hp1 HG00733.hp2 HG01070.hp2 HG01106.hp2 HG01258.hp1 others(7): Show HG00642.hp1 HG00733.hp2 HG01070.hp2 HG01106.hp2 HG01258.hp1 HG01346.hp1 HG01517.hp2 HG01934.hp2 HG01975.hp1 HG06807.hp1 NA20129.hp1 NA20805.hp2	Body surface area is a potential obesity index: It others(66): Show Body surface area is a potential obesity index: It s genetic determination and its causality for late r-life diseases.	337,198 British ancestry individuals/ 337,198 British ancestry individuals/		ACSS2	rs6088638-?	+	MODIFIER	chr20	T T	C C
chr20:34882711	c.179-83T>C c.179-83T>C	Height 0.0457 Height 0.0457	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0001 a0001c0001t0003	a0001c0001t0001g0152 a0001c0001t0001g0153 a0001c0001t0001g0156 a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0162 others(7): Show a0001c0001t0001g0152 a0001c0001t0001g0153 a0001c0001t0001g0156 a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0162 a0001c0001t0001g0169 a0001c0001t0001g0170 a0001c0001t0001g0171 a0001c0001t0001g0185 a0001c0001t0001g0203 a0001c0001t0001g0209 a0001c0001t0003g0186	HG00642.hp1 HG00733.hp2 HG01070.hp2 HG01106.hp2 HG01258.hp1 others(7): Show HG00642.hp1 HG00733.hp2 HG01070.hp2 HG01106.hp2 HG01258.hp1 HG01346.hp1 HG01517.hp2 HG01934.hp2 HG01975.hp1 HG06807.hp1 NA20129.hp1 NA20805.hp2	A saturated map of common genetic variants associa others(22): Show A saturated map of common genetic variants associa ted with human height.	455,180 Hispanic or Latin American individuals/ 455,180 Hispanic or Latin American individuals/		ACSS2	rs6088638-C	+	MODIFIER	chr20	T T	C C
chr20:34893114	c.374+10125G>C c.374+10125G>C	Multi-trait sex score Multi-trait sex score	a0001 a0002 a0003 a0004 a0006 others(1): Show a0001 a0002 a0003 a0004 a0006 a0008	a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 a0001c0010 a0001c0014 others(5): Show a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 a0001c0010 a0001c0014 a0002c0004 a0003c0005 a0004c0006 a0006c0012 a0008c0008	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0002t0001 a0001c0002t0002 a0001c0003t0001 others(7): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0002t0001 a0001c0002t0002 a0001c0003t0001 a0001c0010t0001 a0001c0014t0001 a0002c0004t0001 a0003c0005t0001 a0004c0006t0001 a0006c0012t0001 a0008c0008t0001	a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0151 others(201): Show a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0151 a0001c0001t0001g0152 a0001c0001t0001g0153 a0001c0001t0001g0154 a0001c0001t0001g0156 a0001c0001t0001g0157 a0001c0001t0001g0158 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🧬 Gene Summary

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⚡ Splicing Related Variants (Total: 34)

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GTEx Related Variants (Page 1 of 95 - Total: 9434)