JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Haplotype Detail Info [A3GALT2_chr1_33301766_33326098>a0001c0001t0000g0030]

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chr1:33315380	c.24-2491delT c.24-2491delT	Smoking and associated risk behaviours (confirmatory factor analysis Factor 6) others(38): Show Smoking and associated risk behaviours (confirmatory factor analysis Factor 6)	a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 others(4): Show a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 a0006 a0008 a0009 a0011	a0001c0001 a0001c0006 a0001c0014 a0002c0002 a0003c0003 others(6): Show a0001c0001 a0001c0006 a0001c0014 a0002c0002 a0003c0003 a0004c0007 a0005c0005 a0006c0004 a0008c0009 a0009c0013 a0011c0012	a0001c0001t0000 a0001c0006t0000 a0001c0014t0000 a0002c0002t0000 a0003c0003t0000 others(6): Show a0001c0001t0000 a0001c0006t0000 a0001c0014t0000 a0002c0002t0000 a0003c0003t0000 a0004c0007t0000 a0005c0005t0000 a0006c0004t0000 a0008c0009t0000 a0009c0013t0000 a0011c0012t0000	a0001c0001t0000g0001 a0001c0001t0000g0002 a0001c0001t0000g0004 a0001c0001t0000g0005 a0001c0001t0000g0006 others(164): Show a0001c0001t0000g0001 a0001c0001t0000g0002 a0001c0001t0000g0004 a0001c0001t0000g0005 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Show The Polygenic and Monogenic Basis of Blood Traits and Diseases.	408,112 British individuals/ 408,112 British individuals/	A3GALT2, RP11-415J8.3	A3GALT2	rs10753280-C	-	MODIFIER	chr1	A A	C C

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Haplotype Detail Info [A3GALT2_chr1_33301766_33326098>a0001c0001t0000g0030]

🧬 Gene Summary

🧬 JoGo Online Haplotype Explorer A3GALT2_chr1_33301766_33326098

AVariants in Amino-acids (protein) level Haplotype (Total: 0)

CVariants in Coding level Haplotype (Total: 0)

TVariants in Transcript level Haplotype (Total: 0)

GVariants in Genebody level Haplotype (Total: 32)

AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 1)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 1)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 1)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 1)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 7)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 0)

GWASCatalog Related Variants (Total: 5)

GTEx Related Variants (Page 1 of 4 - Total: 335)