JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

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9106225:splice 9106225:variant goto	A2M intron_variant c.1104+11T>C A2M intron_variant c.1104+11T>C	KLRG1 Breast_Mammary_Tissue 15.572 0.301	5 6 6 84	a0001 a0003 a0004 a0010 a0011 a0001 a0003 a0004 a0010 a0011	a0001c0001 a0001c0026 a0003c0004 a0004c0006 a0010c0023 others(1): Show a0001c0001 a0001c0026 a0003c0004 a0004c0006 a0010c0023 a0011c0024	a0001c0001t0001 a0001c0026t0001 a0003c0004t0001 a0004c0006t0001 a0010c0023t0001 others(1): Show a0001c0001t0001 a0001c0026t0001 a0003c0004t0001 a0004c0006t0001 a0010c0023t0001 a0011c0024t0001	a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0009 a0001c0001t0001g0010 a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0022 others(79): Show a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0009 a0001c0001t0001g0010 a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0022 a0001c0001t0001g0023 a0001c0001t0001g0024 a0001c0001t0001g0025 a0001c0001t0001g0026 a0001c0001t0001g0027 a0001c0001t0001g0028 a0001c0001t0001g0029 a0001c0001t0001g0030 a0001c0001t0001g0152 a0001c0001t0001g0153 a0001c0001t0001g0154 a0001c0001t0001g0155 a0001c0001t0001g0156 a0001c0001t0001g0157 a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0159 a0001c0001t0001g0160 a0001c0001t0001g0161 a0001c0001t0001g0162 a0001c0001t0001g0164 a0001c0001t0001g0165 a0001c0001t0001g0166 a0001c0001t0001g0167 a0001c0001t0001g0168 a0001c0001t0001g0169 a0001c0001t0001g0170 a0001c0001t0001g0171 a0001c0001t0001g0172 a0001c0001t0001g0173 a0001c0001t0001g0174 a0001c0001t0001g0175 a0001c0001t0001g0176 a0001c0001t0001g0177 a0001c0001t0001g0178 a0001c0001t0001g0179 a0001c0001t0001g0180 a0001c0001t0001g0181 a0001c0001t0001g0182 a0001c0001t0001g0183 a0001c0001t0001g0184 a0001c0001t0001g0185 a0001c0001t0001g0186 a0001c0001t0001g0188 a0001c0001t0001g0189 a0001c0001t0001g0190 a0001c0001t0001g0191 a0001c0001t0001g0192 a0001c0001t0001g0193 a0001c0001t0001g0194 a0001c0001t0001g0195 a0001c0001t0001g0196 a0001c0001t0001g0197 a0001c0001t0001g0198 a0001c0001t0001g0200 a0001c0001t0001g0201 a0001c0001t0001g0202 a0001c0001t0001g0203 a0001c0001t0001g0206 a0001c0001t0001g0207 a0001c0001t0001g0208 a0001c0001t0001g0209 a0001c0001t0001g0215 a0001c0001t0001g0216 a0001c0001t0001g0218 a0001c0001t0001g0221 a0001c0001t0001g0222 a0001c0001t0001g0223 a0001c0001t0001g0224 a0001c0001t0001g0225 a0001c0001t0001g0226 a0001c0026t0001g0219 a0003c0004t0001g0001 a0003c0004t0001g0163 a0004c0006t0001g0187 a0004c0006t0001g0199 a0004c0006t0001g0204 a0004c0006t0001g0205 a0010c0023t0001g0213 a0011c0024t0001g0214	HG00099.hp2 HG00140.hp2 HG00408.hp1 HG00544.hp1 HG00558.hp2 others(101): Show HG00099.hp2 HG00140.hp2 HG00408.hp1 HG00544.hp1 HG00558.hp2 HG00609.hp1 HG00621.hp1 HG00639.hp2 HG00733.hp1 HG00735.hp2 HG00741.hp1 HG00741.hp2 HG01069.hp1 HG01071.hp1 HG01074.hp1 HG01074.hp2 HG01106.hp2 HG01109.hp2 HG01175.hp2 HG01192.hp1 HG01256.hp1 HG01257.hp1 HG01358.hp2 HG01361.hp2 HG01433.hp1 HG01433.hp2 HG01496.hp1 HG01515.hp2 HG01928.hp2 HG01934.hp2 HG01952.hp2 HG01978.hp1 HG02015.hp2 HG02040.hp2 HG02071.hp1 HG02129.hp1 HG02129.hp2 HG02132.hp2 HG02273.hp1 HG02280.hp2 HG02300.hp1 HG02523.hp2 HG02559.hp1 HG02602.hp1 HG02602.hp2 HG02630.hp1 HG02683.hp1 HG02683.hp2 HG02698.hp2 HG02735.hp1 HG02886.hp1 HG02895.hp1 HG03490.hp1 HG03516.hp1 HG03704.hp1 HG03831.hp2 HG03834.hp2 HG03927.hp2 HG03942.hp1 HG04199.hp1 HG04204.hp1 HG04204.hp2 NA18940.hp2 NA18943.hp1 NA18947.hp1 NA18955.hp2 NA18957.hp2 NA18960.hp1 NA18962.hp2 NA18963.hp1 NA18965.hp1 NA18967.hp1 NA18969.hp1 NA18970.hp2 NA18971.hp2 NA18972.hp1 NA18973.hp2 NA18974.hp2 NA18975.hp2 NA18979.hp1 NA18981.hp2 NA18983.hp2 NA18990.hp2 NA18993.hp2 NA18998.hp1 NA18999.hp1 NA19001.hp2 NA19003.hp1 NA19012.hp2 NA19056.hp2 NA19057.hp2 NA19063.hp2 NA19068.hp2 NA19074.hp1 NA19076.hp2 NA19080.hp2 NA19081.hp2 NA19082.hp1 NA19083.hp2 NA19085.hp1 NA19086.hp1 NA19088.hp1 NA19090.hp2 NA19091.hp2 NA20805.hp2 homoSapiens_chm13v2.hp1	0.323	277	330	10	chr12_9106225_A_G_b38	-	MODIFIER	chr12	A A	G G	TogoVar

Haplotype Detail Info [A2M_chr12_9062708_9120919>a0001c0001t0001g0027]

🧬 Gene Summary

🧬 JoGo Online Haplotype Explorer A2M_chr12_9062708_9120919

AVariants in Amino-acids (protein) level Haplotype (Total: 1)

CVariants in Coding level Haplotype (Total: 0)

TVariants in Transcript level Haplotype (Total: 0)

GVariants in Genebody level Haplotype (Total: 14)

AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 1)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 1)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 1)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 1)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 70)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 0)

GWASCatalog Related Variants (Total: 0)

GTEx Related Variants (Page 1 of 4 - Total: 376)