JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

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122092843	-	17	-0.9819	-0.9819	-0.9819	0.0000	acceptor	a0001c0001t0004	HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01496.hp2 HG01891.hp2 HG02055.hp1 others(7): Show HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01496.hp2 HG01891.hp2 HG02055.hp1 HG02109.hp1 HG02486.hp1 HG02630.hp2 HG03225.hp1 HG03486.hp2 NA18522.hp1 NA20129.hp2	HG02135.hp2 HG02165.hp2 NA18612.hp1 NA18947.hp1 NA18950.hp1 others(17): Show HG02135.hp2 HG02165.hp2 NA18612.hp1 NA18947.hp1 NA18950.hp1 NA18955.hp2 NA18957.hp1 NA18974.hp1 NA18975.hp1 NA18980.hp2 NA18986.hp1 NA18994.hp1 NA19000.hp1 NA19005.hp1 NA19007.hp2 NA19064.hp2 NA19070.hp2 NA19080.hp2 NA19082.hp1 NA19084.hp1 NA19087.hp1 NA19091.hp2	AASS	chr7	122068549	122149249
122092951	-	17	0.9861	0.9861	0.9861	0.0000	donor	a0001c0001t0004	HG02135.hp2 HG02165.hp2 NA18612.hp1 NA18947.hp1 NA18950.hp1 others(17): Show HG02135.hp2 HG02165.hp2 NA18612.hp1 NA18947.hp1 NA18950.hp1 NA18955.hp2 NA18957.hp1 NA18974.hp1 NA18975.hp1 NA18980.hp2 NA18986.hp1 NA18994.hp1 NA19000.hp1 NA19005.hp1 NA19007.hp2 NA19064.hp2 NA19070.hp2 NA19080.hp2 NA19082.hp1 NA19084.hp1 NA19087.hp1 NA19091.hp2	HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01496.hp2 HG01891.hp2 HG02055.hp1 others(7): Show HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01496.hp2 HG01891.hp2 HG02055.hp1 HG02109.hp1 HG02486.hp1 HG02630.hp2 HG03225.hp1 HG03486.hp2 NA18522.hp1 NA20129.hp2	AASS	chr7	122068549	122149249
122091703	-	18	-0.9400	-0.9400	-0.9400	0.0001	acceptor	a0001c0001t0004	HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01496.hp2 HG01891.hp2 HG02055.hp1 others(7): Show HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01496.hp2 HG01891.hp2 HG02055.hp1 HG02109.hp1 HG02486.hp1 HG02630.hp2 HG03225.hp1 HG03486.hp2 NA18522.hp1 NA20129.hp2	HG02135.hp2 HG02165.hp2 NA18612.hp1 NA18947.hp1 NA18950.hp1 others(17): Show HG02135.hp2 HG02165.hp2 NA18612.hp1 NA18947.hp1 NA18950.hp1 NA18955.hp2 NA18957.hp1 NA18974.hp1 NA18975.hp1 NA18980.hp2 NA18986.hp1 NA18994.hp1 NA19000.hp1 NA19005.hp1 NA19007.hp2 NA19064.hp2 NA19070.hp2 NA19080.hp2 NA19082.hp1 NA19084.hp1 NA19087.hp1 NA19091.hp2	AASS	chr7	122068549	122149249
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122086012	-	19	-0.9982	-0.9982	-0.9982	0.0000	acceptor	a0001c0001t0004	HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01496.hp2 HG01891.hp2 HG02055.hp1 others(7): Show HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01496.hp2 HG01891.hp2 HG02055.hp1 HG02109.hp1 HG02486.hp1 HG02630.hp2 HG03225.hp1 HG03486.hp2 NA18522.hp1 NA20129.hp2	HG02135.hp2 HG02165.hp2 NA18612.hp1 NA18947.hp1 NA18950.hp1 others(17): Show HG02135.hp2 HG02165.hp2 NA18612.hp1 NA18947.hp1 NA18950.hp1 NA18955.hp2 NA18957.hp1 NA18974.hp1 NA18975.hp1 NA18980.hp2 NA18986.hp1 NA18994.hp1 NA19000.hp1 NA19005.hp1 NA19007.hp2 NA19064.hp2 NA19070.hp2 NA19080.hp2 NA19082.hp1 NA19084.hp1 NA19087.hp1 NA19091.hp2	AASS	chr7	122068549	122149249
122086179	-	19	0.9097	0.9094	0.9091	0.0006	donor	a0001c0001t0004	NA18950.hp1 NA18950.hp1	HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01891.hp2 HG02055.hp1 HG02109.hp1 others(6): Show HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01891.hp2 HG02055.hp1 HG02109.hp1 HG02486.hp1 HG02630.hp2 HG03225.hp1 HG03486.hp2 NA18522.hp1 NA20129.hp2	AASS	chr7	122068549	122149249
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pos	genename hgvs_c hgvs_p annotation	tissue expression gene -log10(pval) slope Tissue name in GTEx database(the target eQTL tissue name of the GTEx database) The -log10(nominal pvalue) in GTEx database Slope in GTEx database (positive value:alt allele has higher gene expression)	ahapid chapid thapid ghapid ahapid_count chapid_count thapid_count ghapid_count	AHAPIDS ahapids	ACHAPIDS achapids	ACTHAPIDS acthapids	ACTGHAPIDS actghapids	haplotypeids haplotypeids	af allele frequency in GTEx database	ms The number of samples with minor allele in GTEx database	ma The number of minor allele count in GTEx database	ver GTEx version	vid Variant ID in GTEx database	strand strand	impact	chr	ref	alt	external
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Haplotype Detail Info [AASS_chr7_122068549_122149249>a0001c0001t0004]

🧬 Gene Summary

🧬 JoGo Online Haplotype Explorer AASS_chr7_122068549_122149249

AVariants in Amino-acids (protein) level Haplotype (Total: 0)

CVariants in Coding level Haplotype (Total: 0)

TVariants in Transcript level Haplotype (Total: 3)

AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 1)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 1)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 46)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 9)

GWASCatalog Related Variants (Total: 0)

GTEx Related Variants (Page 1 of 1 - Total: 76)