JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

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NA21309.hp2 homoSapiens_chm13v2.hp1	Modulation of genetic associations with serum urat others(38): Show Modulation of genetic associations with serum urat e levels by body-mass-index in humans.	up to 5,529 European ancestry male individuals, up others(47): Show up to 5,529 European ancestry male individuals, up to 9,753 European ancestry female individuals/	ASAH2B, A1CF	ASAH2B, A1CF	rs4256922-C	-	MODIFIER	chr10	T T	C C
chr10:50890011	c.-4524G>A c.-4524G>A	Narcolepsy with cataplexy 1.8 Narcolepsy with cataplexy 1.8	a0001 a0002 a0001 a0002	a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 a0001c0009 a0002c0004 others(1): Show a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 a0001c0009 a0002c0004 a0002c0006	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0005 a0001c0001t0009 others(12): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0005 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 a0001c0001t0012 a0001c0001t0014 a0001c0001t0017 a0001c0001t0019 a0001c0001t0038 a0001c0002t0004 a0001c0003t0001 a0001c0009t0004 a0002c0004t0006 a0002c0004t0044 a0002c0006t0006	a0001c0001t0001g0134 a0001c0001t0002g0126 a0001c0001t0003g0033 a0001c0001t0003g0061 a0001c0001t0003g0128 others(52): Show a0001c0001t0001g0134 a0001c0001t0002g0126 a0001c0001t0003g0033 a0001c0001t0003g0061 a0001c0001t0003g0128 a0001c0001t0003g0205 a0001c0001t0003g0259 a0001c0001t0003g0260 a0001c0001t0003g0261 a0001c0001t0003g0263 a0001c0001t0003g0270 a0001c0001t0005g0005 a0001c0001t0005g0010 a0001c0001t0005g0201 a0001c0001t0005g0202 a0001c0001t0005g0206 a0001c0001t0005g0240 a0001c0001t0005g0243 a0001c0001t0005g0265 a0001c0001t0005g0268 a0001c0001t0005g0271 a0001c0001t0005g0272 a0001c0001t0005g0273 a0001c0001t0005g0277 a0001c0001t0005g0278 a0001c0001t0005g0282 a0001c0001t0009g0026 a0001c0001t0009g0159 a0001c0001t0010g0031 a0001c0001t0012g0075 a0001c0001t0012g0223 a0001c0001t0014g0279 a0001c0001t0017g0266 a0001c0001t0019g0241 a0001c0001t0019g0242 a0001c0001t0038g0168 a0001c0002t0004g0002 a0001c0002t0004g0069 a0001c0002t0004g0070 a0001c0002t0004g0071 a0001c0002t0004g0073 a0001c0002t0004g0077 a0001c0002t0004g0079 a0001c0002t0004g0160 a0001c0002t0004g0248 a0001c0002t0004g0249 a0001c0002t0004g0250 a0001c0002t0004g0254 a0001c0002t0004g0256 a0001c0002t0004g0267 a0001c0003t0001g0218 a0001c0009t0004g0255 a0001c0009t0004g0257 a0002c0004t0006g0226 a0002c0004t0006g0269 a0002c0004t0044g0049 a0002c0006t0006g0045	HG00639.hp1 HG00735.hp2 HG00741.hp2 HG01071.hp1 HG01123.hp2 others(63): Show HG00639.hp1 HG00735.hp2 HG00741.hp2 HG01071.hp1 HG01123.hp2 HG01243.hp1 HG01243.hp2 HG01891.hp1 HG02055.hp1 HG02074.hp2 HG02129.hp2 HG02135.hp1 HG02257.hp1 HG02257.hp2 HG02280.hp1 HG02451.hp1 HG02486.hp1 HG02523.hp1 HG02572.hp1 HG02572.hp2 HG02602.hp1 HG02622.hp1 HG02622.hp2 HG02630.hp1 HG02630.hp2 HG02647.hp1 HG02717.hp2 HG02723.hp2 HG02735.hp2 HG02886.hp1 HG02895.hp1 HG02895.hp2 HG02897.hp1 HG03041.hp1 HG03098.hp1 HG03195.hp1 HG03225.hp1 HG03453.hp1 HG03471.hp2 HG03688.hp1 HG03688.hp2 HG03710.hp1 HG03831.hp2 HG03927.hp1 NA18522.hp1 NA18522.hp2 NA18944.hp1 NA18965.hp2 NA18969.hp2 NA18977.hp2 NA18981.hp1 NA18994.hp1 NA19002.hp1 NA19004.hp2 NA19007.hp1 NA19009.hp1 NA19009.hp2 NA19043.hp1 NA19043.hp2 NA19072.hp2 NA19074.hp2 NA19076.hp1 NA19080.hp1 NA19083.hp2 NA19240.hp1 NA19240.hp2 NA20129.hp1 NA21309.hp1	A polymorphism in CCR1/CCR3 is associated with nar others(8): Show A polymorphism in CCR1/CCR3 is associated with nar colepsy.	409 Japanese ancestry cases, 1,562 Japanese ancest others(71): Show 409 Japanese ancestry cases, 1,562 Japanese ancest ry controls/240 Japanese ancestry cases, 869 Japan ese ancestry controls	A1CF	A1CF - MIX23P2	rs4290173-C	-	MODIFIER	chr10	C C	T T
chr10:50879173	c.-94+6408A>C c.-94+6408A>C	Cognitive function 0.58 Cognitive function 0.58	a0001 a0002 a0003 a0001 a0002 a0003	a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 a0001c0005 a0001c0009 others(4): Show a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 a0001c0005 a0001c0009 a0001c0011 a0001c0012 a0002c0004 a0003c0010	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 others(34): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 a0001c0001t0012 a0001c0001t0014 a0001c0001t0017 a0001c0001t0019 a0001c0001t0020 a0001c0001t0021 a0001c0001t0022 a0001c0001t0023 a0001c0001t0025 a0001c0001t0027 a0001c0001t0028 a0001c0001t0030 a0001c0001t0035 a0001c0001t0036 a0001c0001t0038 a0001c0001t0046 a0001c0001t0049 a0001c0002t0004 a0001c0002t0013 a0001c0003t0001 a0001c0003t0007 a0001c0003t0047 a0001c0005t0001 a0001c0005t0024 a0001c0005t0048 a0001c0009t0004 a0001c0011t0002 a0001c0012t0034 a0002c0004t0006 a0002c0004t0018 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Haplotype Detail Info [A1CF_chr10_50794409_50890627>a0001c0001t0009]

🧬 Gene Summary

🧬 JoGo Online Haplotype Explorer A1CF_chr10_50794409_50890627

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TVariants in Transcript level Haplotype (Total: 6)

AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 1)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 1)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 23)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 0)

GWASCatalog Related Variants (Total: 5)

GTEx Related Variants (Page 1 of 12 - Total: 1150)