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Haplotype Detail Info [A1CF_chr10_50794409_50890627>a0003]

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CHR:POS	annotation hgvs_c hgvs_p	disease trait -log10p odds or beta	AHAPIDS ahapids	ACHAPIDS achapids	ACTHAPIDS acthapids	ACTGHAPIDS actghapids	haplotypeids haplotypeids	study	initial sample size/ replication sample size	report genes	mapped gene	strongest snp risk allele	strand strand	impact	chr	ref	alt
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chr10:50882740	c.-94+2841G>A c.-94+2841G>A	Liver enzyme levels (gamma-glutamyl transferase) others(8): Show Liver enzyme levels (gamma-glutamyl transferase)	a0001 a0003 a0001 a0003	a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 a0003c0010 a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 a0003c0010	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 others(8): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 a0001c0001t0020 a0001c0001t0021 a0001c0001t0023 a0001c0001t0025 a0001c0001t0046 a0001c0002t0004 a0001c0003t0001 a0003c0010t0001	a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0011 a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0022 others(58): Show a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0011 a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0022 a0001c0001t0001g0024 a0001c0001t0001g0035 a0001c0001t0001g0090 a0001c0001t0001g0091 a0001c0001t0001g0099 a0001c0001t0001g0100 a0001c0001t0001g0101 a0001c0001t0001g0102 a0001c0001t0001g0103 a0001c0001t0001g0106 a0001c0001t0001g0108 a0001c0001t0001g0111 a0001c0001t0001g0113 a0001c0001t0001g0116 a0001c0001t0001g0117 a0001c0001t0001g0118 a0001c0001t0001g0119 a0001c0001t0001g0120 a0001c0001t0001g0121 a0001c0001t0001g0122 a0001c0001t0001g0129 a0001c0001t0001g0130 a0001c0001t0001g0131 a0001c0001t0001g0132 a0001c0001t0001g0133 a0001c0001t0001g0134 a0001c0001t0001g0135 a0001c0001t0001g0138 a0001c0001t0001g0139 a0001c0001t0001g0140 a0001c0001t0001g0142 a0001c0001t0001g0146 a0001c0001t0001g0147 a0001c0001t0001g0148 a0001c0001t0001g0149 a0001c0001t0001g0246 a0001c0001t0002g0126 a0001c0001t0002g0145 a0001c0001t0003g0115 a0001c0001t0003g0125 a0001c0001t0003g0127 a0001c0001t0003g0128 a0001c0001t0003g0141 a0001c0001t0005g0107 a0001c0001t0005g0143 a0001c0001t0005g0144 a0001c0001t0007g0023 a0001c0001t0020g0112 a0001c0001t0021g0110 a0001c0001t0023g0114 a0001c0001t0025g0123 a0001c0001t0046g0124 a0001c0002t0004g0019 a0001c0002t0004g0105 a0001c0003t0001g0104 a0001c0003t0001g0109 a0001c0003t0001g0137 a0003c0010t0001g0136	HG00140.hp2 HG00280.hp1 HG00544.hp2 HG00597.hp1 HG00621.hp1 others(68): Show HG00140.hp2 HG00280.hp1 HG00544.hp2 HG00597.hp1 HG00621.hp1 HG00673.hp2 HG00738.hp2 HG00741.hp1 HG01071.hp1 HG01081.hp1 HG01109.hp1 HG01123.hp1 HG01167.hp2 HG01257.hp1 HG01361.hp2 HG01515.hp1 HG01516.hp1 HG01517.hp1 HG01975.hp1 HG01978.hp1 HG02080.hp2 HG02109.hp2 HG02135.hp1 HG02148.hp1 HG02523.hp2 HG02683.hp2 HG02698.hp2 HG02738.hp1 HG03491.hp2 HG03492.hp2 HG03688.hp2 HG03942.hp2 HG04115.hp2 HG04184.hp1 HG04204.hp2 NA18946.hp1 NA18947.hp2 NA18950.hp1 NA18954.hp2 NA18955.hp2 NA18960.hp2 NA18962.hp1 NA18964.hp1 NA18966.hp1 NA18970.hp2 NA18975.hp1 NA18977.hp1 NA18980.hp2 NA18984.hp2 NA18986.hp1 NA18987.hp1 NA18991.hp2 NA19002.hp2 NA19003.hp1 NA19011.hp1 NA19012.hp1 NA19058.hp2 NA19060.hp2 NA19065.hp2 NA19066.hp1 NA19072.hp1 NA19075.hp1 NA19077.hp1 NA19081.hp2 NA19083.hp1 NA19086.hp1 NA19087.hp2 NA19090.hp1 NA20129.hp2 NA20752.hp1 NA20905.hp1 NA21309.hp2 homoSapiens_chm13v2.hp1	Variance-quantitative trait loci enable systematic others(81): Show Variance-quantitative trait loci enable systematic discovery of gene-environment interactions for ca rdiometabolic serum biomarkers.	5,694 African ancestry individuals, 1,988 East Asi others(103): Show 5,694 African ancestry individuals, 1,988 East Asi an ancestry individuals, 336,298 European ancestry individuals, 6,036 South Asian ancestry individua ls/		A1CF	rs10994838-?	-	MODIFIER	chr10	C C	T T
chr10:50879173	c.-94+6408A>C c.-94+6408A>C	Cognitive function 0.58 Cognitive function 0.58	a0001 a0002 a0003 a0001 a0002 a0003	a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 a0001c0005 a0001c0009 others(4): Show a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 a0001c0005 a0001c0009 a0001c0011 a0001c0012 a0002c0004 a0003c0010	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 others(34): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 a0001c0001t0012 a0001c0001t0014 a0001c0001t0017 a0001c0001t0019 a0001c0001t0020 a0001c0001t0021 a0001c0001t0022 a0001c0001t0023 a0001c0001t0025 a0001c0001t0027 a0001c0001t0028 a0001c0001t0030 a0001c0001t0035 a0001c0001t0036 a0001c0001t0038 a0001c0001t0046 a0001c0001t0049 a0001c0002t0004 a0001c0002t0013 a0001c0003t0001 a0001c0003t0007 a0001c0003t0047 a0001c0005t0001 a0001c0005t0024 a0001c0005t0048 a0001c0009t0004 a0001c0011t0002 a0001c0012t0034 a0002c0004t0006 a0002c0004t0018 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Haplotype Detail Info [A1CF_chr10_50794409_50890627>a0003]

🧬 Gene Summary

🧬 JoGo Online Haplotype Explorer A1CF_chr10_50794409_50890627

AVariants in Amino-acids (protein) level Haplotype (Total: 1)

AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 23)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 0)

GWASCatalog Related Variants (Total: 5)

GTEx Related Variants (Page 1 of 29 - Total: 2888)