JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Haplotype Detail Info [ABCC1_chr16_15944616_16148053>a0005c0016]

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chr16:16017755	c.615+1134A>T c.615+1134A>T	Basophil percentage of white cells variance others(12): Show Basophil percentage of white cells variance 0.0223992	a0001 a0002 a0004 a0005 a0011 a0001 a0002 a0004 a0005 a0011	a0001c0001 a0001c0003 a0001c0005 a0001c0006 a0001c0020 others(9): Show a0001c0001 a0001c0003 a0001c0005 a0001c0006 a0001c0020 a0001c0023 a0001c0028 a0001c0029 a0001c0037 a0002c0010 a0002c0011 a0004c0038 a0005c0016 a0011c0018	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 others(19): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0024 a0001c0003t0001 a0001c0003t0004 a0001c0005t0001 a0001c0005t0002 a0001c0005t0004 a0001c0005t0007 a0001c0006t0002 a0001c0020t0002 a0001c0023t0001 a0001c0028t0002 a0001c0029t0002 a0001c0037t0012 a0002c0010t0002 a0002c0011t0003 a0002c0011t0007 a0004c0038t0006 a0005c0016t0006 a0011c0018t0003	a0001c0001t0001g0040 a0001c0001t0001g0068 a0001c0001t0001g0069 a0001c0001t0001g0083 a0001c0001t0001g0125 others(47): Show a0001c0001t0001g0040 a0001c0001t0001g0068 a0001c0001t0001g0069 a0001c0001t0001g0083 a0001c0001t0001g0125 a0001c0001t0001g0134 a0001c0001t0001g0138 a0001c0001t0001g0174 a0001c0001t0001g0179 a0001c0001t0001g0213 a0001c0001t0001g0222 a0001c0001t0003g0011 a0001c0001t0003g0071 a0001c0001t0003g0124 a0001c0001t0003g0143 a0001c0001t0003g0236 a0001c0001t0004g0132 a0001c0001t0004g0247 a0001c0001t0007g0079 a0001c0001t0008g0054 a0001c0001t0008g0057 a0001c0001t0024g0211 a0001c0003t0001g0144 a0001c0003t0001g0165 a0001c0003t0004g0055 a0001c0003t0004g0237 a0001c0005t0001g0058 a0001c0005t0001g0065 a0001c0005t0002g0067 a0001c0005t0004g0131 a0001c0005t0004g0169 a0001c0005t0004g0241 a0001c0005t0007g0228 a0001c0006t0002g0013 a0001c0006t0002g0053 a0001c0006t0002g0073 a0001c0006t0002g0075 a0001c0020t0002g0194 a0001c0023t0001g0077 a0001c0028t0002g0066 a0001c0029t0002g0173 a0001c0037t0012g0041 a0002c0010t0002g0127 a0002c0010t0002g0128 a0002c0010t0002g0129 a0002c0011t0003g0126 a0002c0011t0003g0130 a0002c0011t0003g0223 a0002c0011t0007g0052 a0004c0038t0006g0092 a0005c0016t0006g0088 a0011c0018t0003g0123	HG00099.hp2 HG00323.hp1 HG00408.hp2 HG00438.hp2 HG00544.hp2 others(47): Show HG00099.hp2 HG00323.hp1 HG00408.hp2 HG00438.hp2 HG00544.hp2 HG00597.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp2 HG01071.hp2 HG01081.hp2 HG01109.hp1 HG01257.hp1 HG01496.hp1 HG01928.hp2 HG01934.hp1 HG01934.hp2 HG01978.hp2 HG01981.hp1 HG02015.hp1 HG02080.hp2 HG02129.hp1 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG02148.hp1 HG02148.hp2 HG02165.hp1 HG02300.hp2 HG02451.hp1 HG02647.hp1 HG03669.hp1 HG03942.hp1 HG03942.hp2 NA18612.hp2 NA18943.hp1 NA18952.hp1 NA18953.hp2 NA18960.hp1 NA18960.hp2 NA18965.hp1 NA18965.hp2 NA18966.hp2 NA18968.hp2 NA18971.hp2 NA18978.hp1 NA18983.hp2 NA19000.hp1 NA19002.hp2 NA19057.hp1 NA19065.hp2 NA19068.hp1 NA19074.hp2 NA19082.hp2	Genome-wide analyses of variance in blood cell phe others(71): Show Genome-wide analyses of variance in blood cell phe notypes provide new insights into complex trait bi ology and prediction.	404,531 European ancestry individuals/ 404,531 European ancestry individuals/		ABCC1	rs165974-T	+	MODIFIER	chr16	A A	T T
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chr16:16043356	c.810-1094T>C c.810-1094T>C	Mean corpuscular hemoglobin concentration others(10): Show Mean corpuscular hemoglobin concentration 0.0210805	a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 others(4): Show a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 a0006 a0007 a0009 a0011	a0001c0001 a0001c0005 a0001c0006 a0001c0007 a0001c0008 others(22): Show a0001c0001 a0001c0005 a0001c0006 a0001c0007 a0001c0008 a0001c0012 a0001c0014 a0001c0017 a0001c0020 a0001c0022 a0001c0023 a0001c0028 a0001c0029 a0001c0037 a0001c0040 a0002c0010 a0002c0011 a0003c0024 a0003c0025 a0004c0026 a0004c0038 a0004c0039 a0005c0016 a0006c0019 a0007c0027 a0009c0021 a0011c0018	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 others(50): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0010 a0001c0001t0011 a0001c0001t0012 a0001c0001t0014 a0001c0001t0016 a0001c0001t0017 a0001c0001t0018 a0001c0001t0020 a0001c0001t0024 a0001c0005t0001 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Haplotype Detail Info [ABCC1_chr16_15944616_16148053>a0005c0016]

🧬 Gene Summary

🧬 JoGo Online Haplotype Explorer ABCC1_chr16_15944616_16148053

AVariants in Amino-acids (protein) level Haplotype (Total: 1)

CVariants in Coding level Haplotype (Total: 5)

AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 1)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 60)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 5)

GWASCatalog Related Variants (Total: 15)

GTEx Related Variants (Page 1 of 4 - Total: 352)