JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Haplotype Detail Info [ABCG2_chr4_88085269_88163639>a0002c0002]

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genename	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	chapid	clen	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	cseq	chr	start	end
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genename	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	achapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	clen	cseq	chr	start	end
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chr4:88124179	c.532-2387T>C c.532-2387T>C	Lipoprotein-associated phospholipase A2 activity change in response to statin therapy others(46): Show Lipoprotein-associated phospholipase A2 activity change in response to statin therapy 2.8	a0001 a0002 a0004 a0005 a0008 others(2): Show a0001 a0002 a0004 a0005 a0008 a0009 a0010	a0001c0001 a0001c0005 a0002c0002 a0002c0004 a0004c0006 others(4): Show a0001c0001 a0001c0005 a0002c0002 a0002c0004 a0004c0006 a0005c0007 a0008c0011 a0009c0010 a0010c0009	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 others(21): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 a0001c0001t0013 a0001c0001t0014 a0001c0001t0016 a0001c0005t0001 a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0004 a0002c0002t0011 a0002c0002t0012 a0002c0004t0001 a0002c0004t0007 a0002c0004t0015 a0004c0006t0001 a0005c0007t0001 a0008c0011t0001 a0009c0010t0001 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chr4:88139757	c.203+36A>G c.203+36A>G	Serum uric acid levels 0.029 Serum uric acid levels 0.029	a0002 a0006 a0002 a0006	a0002c0002 a0002c0004 a0006c0008 a0002c0002 a0002c0004 a0006c0008	a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0004 a0002c0002t0011 a0002c0002t0012 others(4): Show a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0004 a0002c0002t0011 a0002c0002t0012 a0002c0004t0001 a0002c0004t0007 a0002c0004t0015 a0006c0008t0001	a0002c0002t0001g0002 a0002c0002t0001g0008 a0002c0002t0001g0035 a0002c0002t0001g0037 a0002c0002t0001g0041 others(63): Show a0002c0002t0001g0002 a0002c0002t0001g0008 a0002c0002t0001g0035 a0002c0002t0001g0037 a0002c0002t0001g0041 a0002c0002t0001g0043 a0002c0002t0001g0048 a0002c0002t0001g0054 a0002c0002t0001g0055 a0002c0002t0001g0056 a0002c0002t0001g0057 a0002c0002t0001g0060 a0002c0002t0001g0063 a0002c0002t0001g0064 a0002c0002t0001g0065 a0002c0002t0001g0066 a0002c0002t0001g0067 a0002c0002t0001g0070 a0002c0002t0001g0073 a0002c0002t0001g0074 a0002c0002t0001g0171 a0002c0002t0001g0242 a0002c0002t0001g0266 a0002c0002t0002g0001 a0002c0002t0002g0009 a0002c0002t0002g0011 a0002c0002t0002g0013 a0002c0002t0002g0014 a0002c0002t0002g0016 a0002c0002t0002g0017 a0002c0002t0002g0018 a0002c0002t0002g0033 a0002c0002t0002g0034 a0002c0002t0002g0036 a0002c0002t0002g0038 a0002c0002t0002g0039 a0002c0002t0002g0040 a0002c0002t0002g0042 a0002c0002t0002g0044 a0002c0002t0002g0047 a0002c0002t0002g0051 a0002c0002t0002g0052 a0002c0002t0002g0059 a0002c0002t0002g0061 a0002c0002t0002g0068 a0002c0002t0002g0069 a0002c0002t0002g0086 a0002c0002t0002g0187 a0002c0002t0002g0199 a0002c0002t0002g0245 a0002c0002t0002g0246 a0002c0002t0002g0249 a0002c0002t0002g0267 a0002c0002t0002g0280 a0002c0002t0002g0281 a0002c0002t0004g0332 a0002c0002t0011g0046 a0002c0002t0012g0273 a0002c0004t0001g0012 a0002c0004t0001g0206 a0002c0004t0001g0207 a0002c0004t0001g0208 a0002c0004t0001g0248 a0002c0004t0001g0323 a0002c0004t0007g0342 a0002c0004t0007g0344 a0002c0004t0015g0330 a0006c0008t0001g0050	HG00423.hp2 HG00597.hp2 HG01071.hp2 HG01109.hp1 HG01169.hp1 others(65): Show HG00423.hp2 HG00597.hp2 HG01071.hp2 HG01109.hp1 HG01169.hp1 HG01257.hp2 HG01258.hp2 HG01433.hp1 HG01516.hp1 HG01928.hp1 HG01943.hp2 HG01952.hp1 HG01952.hp2 HG01978.hp2 HG01981.hp2 HG01993.hp1 HG02004.hp1 HG02015.hp1 HG02015.hp2 HG02027.hp1 HG02080.hp1 HG02080.hp2 HG02083.hp1 HG02083.hp2 HG02132.hp2 HG02135.hp2 HG02148.hp2 HG02155.hp1 HG02155.hp2 HG02273.hp2 HG02293.hp1 HG02293.hp2 HG02300.hp2 HG02451.hp1 HG02523.hp2 HG02559.hp1 HG02602.hp1 HG02723.hp2 HG02965.hp2 HG03017.hp1 HG03041.hp2 HG03654.hp2 HG03831.hp2 HG03927.hp1 NA18612.hp1 NA18747.hp1 NA18747.hp2 NA18941.hp2 NA18942.hp1 NA18945.hp2 NA18965.hp1 NA18979.hp2 NA18981.hp2 NA18982.hp2 NA18983.hp1 NA18988.hp2 NA19000.hp1 NA19005.hp2 NA19011.hp1 NA19054.hp1 NA19054.hp2 NA19064.hp2 NA19065.hp2 NA19074.hp2 NA19079.hp1 NA19085.hp1 NA19090.hp1 NA20805.hp1 NA20805.hp2 NA20905.hp2	A genome-wide association study identifies common others(76): Show A genome-wide association study identifies common variants influencing serum uric acid concentration s in a Chinese population.	3,451 Han Chinese ancestry individuals/8,830 Chine others(23): Show 3,451 Han Chinese ancestry individuals/8,830 Chine se ancestry individuals	ABCG2	ABCG2	rs4148152-C	-	MODIFIER	chr4	T T	C C
chr4:88143429	c.-19-3415T>G c.-19-3415T>G	Serum uric acid levels 0.029 Serum uric acid levels 0.029	a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 others(3): Show a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 a0008 a0009 a0010	a0001c0001 a0002c0002 a0002c0004 a0003c0003 a0004c0006 others(4): Show a0001c0001 a0002c0002 a0002c0004 a0003c0003 a0004c0006 a0005c0007 a0008c0011 a0009c0010 a0010c0009	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 others(16): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0013 a0001c0001t0016 a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0004 a0002c0004t0001 a0002c0004t0015 a0003c0003t0001 a0003c0003t0003 a0004c0006t0001 a0005c0007t0001 a0008c0011t0001 a0009c0010t0001 a0010c0009t0001	a0001c0001t0001g0049 a0001c0001t0001g0062 a0001c0001t0001g0082 a0001c0001t0001g0083 a0001c0001t0001g0094 others(175): Show a0001c0001t0001g0049 a0001c0001t0001g0062 a0001c0001t0001g0082 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NA19090.hp2 NA20300.hp1 NA20752.hp1 NA21309.hp2	A genome-wide association study identifies common others(76): Show A genome-wide association study identifies common variants influencing serum uric acid concentration s in a Chinese population.	3,451 Han Chinese ancestry individuals/8,830 Chine others(23): Show 3,451 Han Chinese ancestry individuals/8,830 Chine se ancestry individuals	ABCG2	ABCG2	rs3114018-T	-	MODIFIER	chr4	A A	C C
chr4:88143429	c.-19-3415T>G c.-19-3415T>G	Dental caries Dental caries	a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 others(3): Show a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 a0008 a0009 a0010	a0001c0001 a0002c0002 a0002c0004 a0003c0003 a0004c0006 others(4): Show a0001c0001 a0002c0002 a0002c0004 a0003c0003 a0004c0006 a0005c0007 a0008c0011 a0009c0010 a0010c0009	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 others(16): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0013 a0001c0001t0016 a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0004 a0002c0004t0001 a0002c0004t0015 a0003c0003t0001 a0003c0003t0003 a0004c0006t0001 a0005c0007t0001 a0008c0011t0001 a0009c0010t0001 a0010c0009t0001	a0001c0001t0001g0049 a0001c0001t0001g0062 a0001c0001t0001g0082 a0001c0001t0001g0083 a0001c0001t0001g0094 others(175): Show a0001c0001t0001g0049 a0001c0001t0001g0062 a0001c0001t0001g0082 a0001c0001t0001g0083 a0001c0001t0001g0094 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of dental caries patterns in the permanent de others(8): Show GWAS of dental caries patterns in the permanent de ntition.	920 European ancestry individuals/ 920 European ancestry individuals/	PKD2, SPP1, MEPE, IBSP, DMP1, DSPP, ABCG2	ABCG2	rs3114018-?	-	MODIFIER	chr4	A A	C C
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chr4:88107623	c.1195-357T>C c.1195-357T>C	Hyperuricemia 1.883 Hyperuricemia 1.883	a0001 a0002 a0003 a0006 a0001 a0002 a0003 a0006	a0001c0001 a0002c0002 a0003c0003 a0006c0008 a0001c0001 a0002c0002 a0003c0003 a0006c0008	a0001c0001t0001 a0002c0002t0001 a0003c0003t0001 a0003c0003t0003 a0003c0003t0004 others(1): Show a0001c0001t0001 a0002c0002t0001 a0003c0003t0001 a0003c0003t0003 a0003c0003t0004 a0006c0008t0001	a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0163 a0001c0001t0001g0166 a0002c0002t0001g0002 a0003c0003t0001g0004 others(51): Show a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0163 a0001c0001t0001g0166 a0002c0002t0001g0002 a0003c0003t0001g0004 a0003c0003t0001g0117 a0003c0003t0001g0178 a0003c0003t0001g0180 a0003c0003t0001g0182 a0003c0003t0001g0195 a0003c0003t0001g0196 a0003c0003t0001g0212 a0003c0003t0001g0214 a0003c0003t0001g0215 a0003c0003t0001g0216 a0003c0003t0001g0217 a0003c0003t0001g0247 a0003c0003t0001g0283 a0003c0003t0001g0284 a0003c0003t0001g0286 a0003c0003t0001g0287 a0003c0003t0001g0288 a0003c0003t0001g0289 a0003c0003t0001g0291 a0003c0003t0001g0292 a0003c0003t0001g0293 a0003c0003t0001g0294 a0003c0003t0001g0295 a0003c0003t0001g0297 a0003c0003t0001g0299 a0003c0003t0001g0301 a0003c0003t0001g0302 a0003c0003t0001g0303 a0003c0003t0001g0304 a0003c0003t0001g0305 a0003c0003t0001g0306 a0003c0003t0001g0307 a0003c0003t0001g0308 a0003c0003t0001g0309 a0003c0003t0001g0311 a0003c0003t0001g0312 a0003c0003t0001g0315 a0003c0003t0001g0327 a0003c0003t0001g0328 a0003c0003t0003g0006 a0003c0003t0003g0183 a0003c0003t0003g0250 a0003c0003t0003g0251 a0003c0003t0003g0252 a0003c0003t0003g0253 a0003c0003t0003g0262 a0003c0003t0003g0310 a0003c0003t0003g0313 a0003c0003t0004g0333 a0003c0003t0004g0334 a0006c0008t0001g0050	HG00323.hp1 HG00438.hp1 HG00597.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp2 others(54): Show HG00323.hp1 HG00438.hp1 HG00597.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp2 HG00735.hp1 HG00738.hp1 HG01074.hp2 HG01081.hp2 HG01106.hp2 HG01255.hp2 HG01257.hp2 HG01258.hp2 HG01346.hp2 HG01928.hp2 HG01943.hp1 HG01981.hp1 HG02027.hp2 HG02071.hp1 HG02132.hp1 HG02135.hp1 HG02602.hp2 HG02723.hp1 HG03239.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp1 HG03704.hp1 NA18612.hp2 NA18747.hp2 NA18939.hp2 NA18942.hp2 NA18945.hp1 NA18951.hp1 NA18952.hp1 NA18953.hp2 NA18955.hp1 NA18956.hp1 NA18960.hp2 NA18961.hp2 NA18963.hp2 NA18969.hp1 NA18972.hp1 NA18979.hp1 NA18980.hp1 NA18983.hp2 NA18986.hp1 NA18995.hp1 NA19003.hp1 NA19005.hp1 NA19057.hp1 NA19060.hp2 NA19064.hp1 NA19070.hp1 NA19078.hp1 NA19079.hp2 NA19083.hp1 NA19085.hp2 NA19088.hp1 NA20752.hp2	ABCG2 Polymorphism Is Associated with Hyperuricemi others(48): Show ABCG2 Polymorphism Is Associated with Hyperuricemi a in a Study of a Community-Based Korean Cohort.	234 Korean ancestry cases, 3,413 Korean ancestry c others(8): Show 234 Korean ancestry cases, 3,413 Korean ancestry c ontrols/	ABCG2	ABCG2	rs2054576-G	-	MODIFIER	chr4	A A	G G
chr4:88124179	c.532-2387T>C c.532-2387T>C	Coffee consumption 0.069 Coffee consumption 0.069	a0001 a0002 a0004 a0005 a0008 others(2): Show a0001 a0002 a0004 a0005 a0008 a0009 a0010	a0001c0001 a0001c0005 a0002c0002 a0002c0004 a0004c0006 others(4): Show a0001c0001 a0001c0005 a0002c0002 a0002c0004 a0004c0006 a0005c0007 a0008c0011 a0009c0010 a0010c0009	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 others(21): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 a0001c0001t0013 a0001c0001t0014 a0001c0001t0016 a0001c0005t0001 a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0004 a0002c0002t0011 a0002c0002t0012 a0002c0004t0001 a0002c0004t0007 a0002c0004t0015 a0004c0006t0001 a0005c0007t0001 a0008c0011t0001 a0009c0010t0001 a0010c0009t0001	a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0015 a0001c0001t0001g0019 a0001c0001t0001g0020 others(274): Show 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chr4:88114355	c.943+602C>T c.943+602C>T	Dementia 0.0258677 Dementia 0.0258677	a0001 a0002 a0001 a0002	a0001c0001 a0002c0002 a0002c0004 a0001c0001 a0002c0002 a0002c0004	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0012 others(3): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0012 a0002c0004t0001 a0002c0004t0007 a0002c0004t0015	a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0062 a0001c0001t0001g0071 a0001c0001t0001g0080 a0001c0001t0001g0082 others(69): Show a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0062 a0001c0001t0001g0071 a0001c0001t0001g0080 a0001c0001t0001g0082 a0001c0001t0001g0092 a0001c0001t0001g0096 a0001c0001t0001g0104 a0001c0001t0001g0110 a0001c0001t0001g0112 a0001c0001t0001g0115 a0001c0001t0001g0122 a0001c0001t0001g0125 a0001c0001t0001g0129 a0001c0001t0001g0133 a0001c0001t0001g0134 a0001c0001t0001g0135 a0001c0001t0001g0136 a0001c0001t0001g0137 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0144 a0001c0001t0001g0145 a0001c0001t0001g0146 a0001c0001t0001g0164 a0001c0001t0001g0165 a0001c0001t0001g0166 a0001c0001t0001g0167 a0001c0001t0001g0168 a0001c0001t0001g0169 a0001c0001t0001g0170 a0001c0001t0001g0179 a0001c0001t0001g0203 a0001c0001t0001g0209 a0001c0001t0001g0210 a0001c0001t0001g0211 a0001c0001t0001g0244 a0001c0001t0001g0255 a0001c0001t0001g0264 a0001c0001t0001g0318 a0001c0001t0001g0319 a0001c0001t0001g0320 a0001c0001t0002g0081 a0002c0002t0001g0002 a0002c0002t0001g0043 a0002c0002t0001g0054 a0002c0002t0001g0055 a0002c0002t0001g0056 a0002c0002t0001g0057 a0002c0002t0001g0060 a0002c0002t0001g0063 a0002c0002t0001g0064 a0002c0002t0001g0065 a0002c0002t0001g0066 a0002c0002t0001g0067 a0002c0002t0001g0070 a0002c0002t0001g0073 a0002c0002t0001g0074 a0002c0002t0001g0202 a0002c0002t0001g0266 a0002c0002t0002g0059 a0002c0002t0002g0061 a0002c0002t0002g0069 a0002c0002t0002g0086 a0002c0002t0002g0249 a0002c0002t0012g0273 a0002c0004t0001g0012 a0002c0004t0001g0206 a0002c0004t0001g0207 a0002c0004t0001g0208 a0002c0004t0001g0248 a0002c0004t0001g0323 a0002c0004t0007g0342 a0002c0004t0007g0344 a0002c0004t0015g0330	HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG01071.hp2 HG01109.hp1 HG01123.hp2 others(71): Show HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG01071.hp2 HG01109.hp1 HG01123.hp2 HG01167.hp1 HG01169.hp1 HG01169.hp2 HG01175.hp1 HG01192.hp1 HG01256.hp1 HG01257.hp2 HG01258.hp2 HG01261.hp2 HG01433.hp1 HG01433.hp2 HG01516.hp1 HG01516.hp2 HG01891.hp2 HG01928.hp1 HG01943.hp2 HG01952.hp2 HG01981.hp2 HG02015.hp1 HG02055.hp1 HG02080.hp1 HG02109.hp2 HG02132.hp2 HG02148.hp2 HG02273.hp2 HG02293.hp1 HG02293.hp2 HG02300.hp2 HG02559.hp1 HG02615.hp1 HG02622.hp2 HG02698.hp1 HG02723.hp2 HG02896.hp2 HG02965.hp2 HG03017.hp1 HG03225.hp1 HG03471.hp2 HG03491.hp2 HG03654.hp2 HG03669.hp2 HG03831.hp2 HG03927.hp1 HG04228.hp2 NA18939.hp1 NA18942.hp1 NA18947.hp2 NA18955.hp2 NA18956.hp2 NA18960.hp1 NA18961.hp1 NA18962.hp2 NA18963.hp1 NA18965.hp1 NA18966.hp1 NA18966.hp2 NA18968.hp1 NA18970.hp1 NA18971.hp1 NA18971.hp2 NA18981.hp2 NA18988.hp1 NA18988.hp2 NA18995.hp2 NA19054.hp1 NA19056.hp2 NA19062.hp1 NA19074.hp1 NA19079.hp1 NA19083.hp2 NA20752.hp2	A genome-wide association meta-analysis of all-cau others(25): Show A genome-wide association meta-analysis of all-cau se and vascular dementia.	2,263 African ancestry cases, 7,315 African ancest others(182): Show 2,263 African ancestry cases, 7,315 African ancest ry controls, 502 Asian ancestry cases, 2,758 Asian ancestry controls, 44,009 European ancestry cases , 466,606 European ancestry controls, 128 Hispanic cases, 1,271 Hispanic controls/		ABCG2	rs72659642-G	-	MODIFIER	chr4	G G	A A
chr4:88099782	c.1368-334C>T c.1368-334C>T	Glycated hemoglobin levels 0.0275 Glycated hemoglobin levels 0.0275	a0001 a0002 a0003 a0006 a0001 a0002 a0003 a0006	a0001c0001 a0002c0002 a0003c0003 a0006c0008 a0001c0001 a0002c0002 a0003c0003 a0006c0008	a0001c0001t0001 a0001c0001t0010 a0002c0002t0001 a0003c0003t0001 a0003c0003t0003 others(2): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0010 a0002c0002t0001 a0003c0003t0001 a0003c0003t0003 a0003c0003t0004 a0006c0008t0001	a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0163 a0001c0001t0001g0166 a0001c0001t0010g0078 a0002c0002t0001g0002 others(52): Show a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0163 a0001c0001t0001g0166 a0001c0001t0010g0078 a0002c0002t0001g0002 a0003c0003t0001g0004 a0003c0003t0001g0117 a0003c0003t0001g0178 a0003c0003t0001g0180 a0003c0003t0001g0182 a0003c0003t0001g0195 a0003c0003t0001g0196 a0003c0003t0001g0212 a0003c0003t0001g0214 a0003c0003t0001g0215 a0003c0003t0001g0216 a0003c0003t0001g0217 a0003c0003t0001g0247 a0003c0003t0001g0283 a0003c0003t0001g0284 a0003c0003t0001g0286 a0003c0003t0001g0287 a0003c0003t0001g0288 a0003c0003t0001g0289 a0003c0003t0001g0291 a0003c0003t0001g0292 a0003c0003t0001g0293 a0003c0003t0001g0294 a0003c0003t0001g0295 a0003c0003t0001g0297 a0003c0003t0001g0299 a0003c0003t0001g0301 a0003c0003t0001g0302 a0003c0003t0001g0303 a0003c0003t0001g0304 a0003c0003t0001g0305 a0003c0003t0001g0306 a0003c0003t0001g0307 a0003c0003t0001g0308 a0003c0003t0001g0309 a0003c0003t0001g0311 a0003c0003t0001g0312 a0003c0003t0001g0315 a0003c0003t0001g0327 a0003c0003t0001g0328 a0003c0003t0003g0006 a0003c0003t0003g0183 a0003c0003t0003g0250 a0003c0003t0003g0251 a0003c0003t0003g0252 a0003c0003t0003g0253 a0003c0003t0003g0262 a0003c0003t0003g0310 a0003c0003t0003g0313 a0003c0003t0004g0333 a0003c0003t0004g0334 a0006c0008t0001g0050	HG00323.hp1 HG00438.hp1 HG00597.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp2 others(55): Show HG00323.hp1 HG00438.hp1 HG00597.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp2 HG00735.hp1 HG00738.hp1 HG01074.hp2 HG01081.hp2 HG01106.hp2 HG01255.hp2 HG01257.hp2 HG01258.hp2 HG01346.hp2 HG01928.hp2 HG01943.hp1 HG01981.hp1 HG02027.hp2 HG02071.hp1 HG02132.hp1 HG02135.hp1 HG02602.hp2 HG02723.hp1 HG03209.hp1 HG03239.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp1 HG03704.hp1 NA18612.hp2 NA18747.hp2 NA18939.hp2 NA18942.hp2 NA18945.hp1 NA18951.hp1 NA18952.hp1 NA18953.hp2 NA18955.hp1 NA18956.hp1 NA18960.hp2 NA18961.hp2 NA18963.hp2 NA18969.hp1 NA18972.hp1 NA18979.hp1 NA18980.hp1 NA18983.hp2 NA18986.hp1 NA18995.hp1 NA19003.hp1 NA19005.hp1 NA19057.hp1 NA19060.hp2 NA19064.hp1 NA19070.hp1 NA19078.hp1 NA19079.hp2 NA19083.hp1 NA19085.hp2 NA19088.hp1 NA20752.hp2	Genetics of 35 blood and urine biomarkers in the U others(10): Show Genetics of 35 blood and urine biomarkers in the U K Biobank.	327,177 European ancestry individuals, 4,847 Afric others(64): Show 327,177 European ancestry individuals, 4,847 Afric an ancestry individuals, 6,895 South Asian ancestr y individuals/	NR	ABCG2	rs4148157-A	-	MODIFIER	chr4	G G	A A
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chr4:88124179	c.532-2387T>C c.532-2387T>C	Serum uric acid levels 0.16428572 Serum uric acid levels 0.16428572	a0001 a0002 a0004 a0005 a0008 others(2): Show a0001 a0002 a0004 a0005 a0008 a0009 a0010	a0001c0001 a0001c0005 a0002c0002 a0002c0004 a0004c0006 others(4): Show a0001c0001 a0001c0005 a0002c0002 a0002c0004 a0004c0006 a0005c0007 a0008c0011 a0009c0010 a0010c0009	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 others(21): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 a0001c0001t0013 a0001c0001t0014 a0001c0001t0016 a0001c0005t0001 a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0004 a0002c0002t0011 a0002c0002t0012 a0002c0004t0001 a0002c0004t0007 a0002c0004t0015 a0004c0006t0001 a0005c0007t0001 a0008c0011t0001 a0009c0010t0001 a0010c0009t0001	a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0015 a0001c0001t0001g0019 a0001c0001t0001g0020 others(274): 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chr4:88107623	c.1195-357T>C c.1195-357T>C	Urate levels 0.1531 Urate levels 0.1531	a0001 a0002 a0003 a0006 a0001 a0002 a0003 a0006	a0001c0001 a0002c0002 a0003c0003 a0006c0008 a0001c0001 a0002c0002 a0003c0003 a0006c0008	a0001c0001t0001 a0002c0002t0001 a0003c0003t0001 a0003c0003t0003 a0003c0003t0004 others(1): Show a0001c0001t0001 a0002c0002t0001 a0003c0003t0001 a0003c0003t0003 a0003c0003t0004 a0006c0008t0001	a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0163 a0001c0001t0001g0166 a0002c0002t0001g0002 a0003c0003t0001g0004 others(51): Show a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0163 a0001c0001t0001g0166 a0002c0002t0001g0002 a0003c0003t0001g0004 a0003c0003t0001g0117 a0003c0003t0001g0178 a0003c0003t0001g0180 a0003c0003t0001g0182 a0003c0003t0001g0195 a0003c0003t0001g0196 a0003c0003t0001g0212 a0003c0003t0001g0214 a0003c0003t0001g0215 a0003c0003t0001g0216 a0003c0003t0001g0217 a0003c0003t0001g0247 a0003c0003t0001g0283 a0003c0003t0001g0284 a0003c0003t0001g0286 a0003c0003t0001g0287 a0003c0003t0001g0288 a0003c0003t0001g0289 a0003c0003t0001g0291 a0003c0003t0001g0292 a0003c0003t0001g0293 a0003c0003t0001g0294 a0003c0003t0001g0295 a0003c0003t0001g0297 a0003c0003t0001g0299 a0003c0003t0001g0301 a0003c0003t0001g0302 a0003c0003t0001g0303 a0003c0003t0001g0304 a0003c0003t0001g0305 a0003c0003t0001g0306 a0003c0003t0001g0307 a0003c0003t0001g0308 a0003c0003t0001g0309 a0003c0003t0001g0311 a0003c0003t0001g0312 a0003c0003t0001g0315 a0003c0003t0001g0327 a0003c0003t0001g0328 a0003c0003t0003g0006 a0003c0003t0003g0183 a0003c0003t0003g0250 a0003c0003t0003g0251 a0003c0003t0003g0252 a0003c0003t0003g0253 a0003c0003t0003g0262 a0003c0003t0003g0310 a0003c0003t0003g0313 a0003c0003t0004g0333 a0003c0003t0004g0334 a0006c0008t0001g0050	HG00323.hp1 HG00438.hp1 HG00597.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp2 others(54): Show HG00323.hp1 HG00438.hp1 HG00597.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp2 HG00735.hp1 HG00738.hp1 HG01074.hp2 HG01081.hp2 HG01106.hp2 HG01255.hp2 HG01257.hp2 HG01258.hp2 HG01346.hp2 HG01928.hp2 HG01943.hp1 HG01981.hp1 HG02027.hp2 HG02071.hp1 HG02132.hp1 HG02135.hp1 HG02602.hp2 HG02723.hp1 HG03239.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp1 HG03704.hp1 NA18612.hp2 NA18747.hp2 NA18939.hp2 NA18942.hp2 NA18945.hp1 NA18951.hp1 NA18952.hp1 NA18953.hp2 NA18955.hp1 NA18956.hp1 NA18960.hp2 NA18961.hp2 NA18963.hp2 NA18969.hp1 NA18972.hp1 NA18979.hp1 NA18980.hp1 NA18983.hp2 NA18986.hp1 NA18995.hp1 NA19003.hp1 NA19005.hp1 NA19057.hp1 NA19060.hp2 NA19064.hp1 NA19070.hp1 NA19078.hp1 NA19079.hp2 NA19083.hp1 NA19085.hp2 NA19088.hp1 NA20752.hp2	Target genes, variants, tissues and transcriptiona others(48): Show Target genes, variants, tissues and transcriptiona l pathways influencing human serum urate levels.	288,649 European ancestry individuals, 125,725 Eas others(132): Show 288,649 European ancestry individuals, 125,725 Eas t Asian ancestry individuals, 33,671 African Ameri can individuals, 9,037 South Asian ancestry indivi duals, 608 Hispanic individuals/	ABCG2	ABCG2	rs2054576-A	-	MODIFIER	chr4	A A	G G
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chr4:88118477	c.690-217A>G c.690-217A>G	Renal underexcretion gout 1.81 Renal underexcretion gout 1.81	a0001 a0002 a0001 a0002	a0001c0001 a0002c0002 a0001c0001 a0002c0002	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0014 a0002c0002t0001 others(2): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0014 a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0011	a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0026 a0001c0001t0001g0027 a0001c0001t0001g0028 a0001c0001t0001g0053 others(73): Show a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0026 a0001c0001t0001g0027 a0001c0001t0001g0028 a0001c0001t0001g0053 a0001c0001t0001g0071 a0001c0001t0001g0077 a0001c0001t0001g0080 a0001c0001t0001g0092 a0001c0001t0001g0096 a0001c0001t0001g0104 a0001c0001t0001g0110 a0001c0001t0001g0111 a0001c0001t0001g0112 a0001c0001t0001g0115 a0001c0001t0001g0122 a0001c0001t0001g0125 a0001c0001t0001g0126 a0001c0001t0001g0127 a0001c0001t0001g0129 a0001c0001t0001g0133 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0144 a0001c0001t0001g0145 a0001c0001t0001g0146 a0001c0001t0001g0164 a0001c0001t0001g0165 a0001c0001t0001g0166 a0001c0001t0001g0167 a0001c0001t0001g0168 a0001c0001t0001g0169 a0001c0001t0001g0170 a0001c0001t0001g0179 a0001c0001t0001g0203 a0001c0001t0001g0209 a0001c0001t0001g0210 a0001c0001t0001g0211 a0001c0001t0001g0264 a0001c0001t0001g0318 a0001c0001t0001g0319 a0001c0001t0001g0320 a0001c0001t0002g0081 a0001c0001t0004g0339 a0001c0001t0014g0116 a0002c0002t0001g0008 a0002c0002t0001g0035 a0002c0002t0001g0037 a0002c0002t0001g0041 a0002c0002t0001g0202 a0002c0002t0001g0242 a0002c0002t0002g0001 a0002c0002t0002g0009 a0002c0002t0002g0011 a0002c0002t0002g0013 a0002c0002t0002g0014 a0002c0002t0002g0016 a0002c0002t0002g0017 a0002c0002t0002g0018 a0002c0002t0002g0033 a0002c0002t0002g0034 a0002c0002t0002g0036 a0002c0002t0002g0038 a0002c0002t0002g0039 a0002c0002t0002g0040 a0002c0002t0002g0042 a0002c0002t0002g0044 a0002c0002t0002g0047 a0002c0002t0002g0051 a0002c0002t0002g0052 a0002c0002t0002g0068 a0002c0002t0002g0187 a0002c0002t0002g0199 a0002c0002t0002g0245 a0002c0002t0002g0246 a0002c0002t0002g0267 a0002c0002t0002g0280 a0002c0002t0002g0281 a0002c0002t0011g0046	HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00423.hp2 HG00597.hp2 HG01123.hp2 others(75): Show HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00423.hp2 HG00597.hp2 HG01123.hp2 HG01175.hp1 HG01256.hp1 HG01261.hp2 HG01433.hp2 HG01516.hp2 HG01891.hp2 HG01952.hp1 HG01978.hp2 HG01993.hp1 HG02004.hp1 HG02015.hp2 HG02027.hp1 HG02040.hp1 HG02080.hp2 HG02083.hp1 HG02083.hp2 HG02109.hp1 HG02109.hp2 HG02135.hp2 HG02155.hp1 HG02155.hp2 HG02486.hp2 HG02523.hp2 HG02602.hp1 HG02615.hp1 HG02622.hp2 HG02698.hp1 HG02886.hp2 HG03225.hp1 HG03471.hp2 HG03491.hp2 HG03669.hp2 HG04184.hp1 NA18612.hp1 NA18747.hp1 NA18939.hp1 NA18941.hp2 NA18945.hp2 NA18947.hp1 NA18947.hp2 NA18956.hp2 NA18960.hp1 NA18961.hp1 NA18962.hp2 NA18966.hp1 NA18966.hp2 NA18968.hp1 NA18970.hp1 NA18971.hp1 NA18971.hp2 NA18979.hp2 NA18982.hp2 NA18983.hp1 NA18986.hp2 NA18988.hp1 NA18995.hp2 NA19000.hp1 NA19005.hp2 NA19011.hp1 NA19043.hp2 NA19054.hp2 NA19056.hp2 NA19057.hp2 NA19062.hp1 NA19062.hp2 NA19064.hp2 NA19065.hp2 NA19074.hp1 NA19074.hp2 NA19083.hp2 NA19090.hp1 NA20752.hp2 NA20805.hp1 NA20805.hp2 NA20905.hp2	GWAS of clinically defined gout and subtypes ident others(72): Show GWAS of clinically defined gout and subtypes ident ifies multiple susceptibility loci that include ur ate transporter genes.	619 Japanese ancestry cases, 1,213 Japanese ancest others(73): Show 619 Japanese ancestry cases, 1,213 Japanese ancest ry controls/696 Japanese ancestry cases, 1,268 Jap anese ancestry controls	ABCG2	ABCG2	rs1871744-T	-	MODIFIER	chr4	T T	C C
chr4:88157772	c.-20+614A>G c.-20+614A>G	LDL peak particle diameter (total fat intake interaction) others(21): Show LDL peak particle diameter (total fat intake interaction) 0.04	a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 others(3): Show a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 a0008 a0009 a0010	a0001c0001 a0001c0005 a0002c0002 a0002c0004 a0003c0003 others(5): Show a0001c0001 a0001c0005 a0002c0002 a0002c0004 a0003c0003 a0004c0006 a0005c0007 a0008c0011 a0009c0010 a0010c0009	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 others(23): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 a0001c0001t0013 a0001c0001t0014 a0001c0001t0016 a0001c0005t0001 a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0004 a0002c0002t0012 a0002c0004t0001 a0002c0004t0007 a0002c0004t0015 a0003c0003t0001 a0003c0003t0003 a0003c0003t0004 a0004c0006t0001 a0005c0007t0001 a0008c0011t0001 a0009c0010t0001 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chr4:88107623	c.1195-357T>C c.1195-357T>C	Adenosine 3',5'-cyclic monophosphate (camp) levels others(18): Show Adenosine 3',5'-cyclic monophosphate (camp) levels 0.187821	a0001 a0002 a0003 a0006 a0001 a0002 a0003 a0006	a0001c0001 a0002c0002 a0003c0003 a0006c0008 a0001c0001 a0002c0002 a0003c0003 a0006c0008	a0001c0001t0001 a0002c0002t0001 a0003c0003t0001 a0003c0003t0003 a0003c0003t0004 others(1): Show a0001c0001t0001 a0002c0002t0001 a0003c0003t0001 a0003c0003t0003 a0003c0003t0004 a0006c0008t0001	a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0163 a0001c0001t0001g0166 a0002c0002t0001g0002 a0003c0003t0001g0004 others(51): Show a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0163 a0001c0001t0001g0166 a0002c0002t0001g0002 a0003c0003t0001g0004 a0003c0003t0001g0117 a0003c0003t0001g0178 a0003c0003t0001g0180 a0003c0003t0001g0182 a0003c0003t0001g0195 a0003c0003t0001g0196 a0003c0003t0001g0212 a0003c0003t0001g0214 a0003c0003t0001g0215 a0003c0003t0001g0216 a0003c0003t0001g0217 a0003c0003t0001g0247 a0003c0003t0001g0283 a0003c0003t0001g0284 a0003c0003t0001g0286 a0003c0003t0001g0287 a0003c0003t0001g0288 a0003c0003t0001g0289 a0003c0003t0001g0291 a0003c0003t0001g0292 a0003c0003t0001g0293 a0003c0003t0001g0294 a0003c0003t0001g0295 a0003c0003t0001g0297 a0003c0003t0001g0299 a0003c0003t0001g0301 a0003c0003t0001g0302 a0003c0003t0001g0303 a0003c0003t0001g0304 a0003c0003t0001g0305 a0003c0003t0001g0306 a0003c0003t0001g0307 a0003c0003t0001g0308 a0003c0003t0001g0309 a0003c0003t0001g0311 a0003c0003t0001g0312 a0003c0003t0001g0315 a0003c0003t0001g0327 a0003c0003t0001g0328 a0003c0003t0003g0006 a0003c0003t0003g0183 a0003c0003t0003g0250 a0003c0003t0003g0251 a0003c0003t0003g0252 a0003c0003t0003g0253 a0003c0003t0003g0262 a0003c0003t0003g0310 a0003c0003t0003g0313 a0003c0003t0004g0333 a0003c0003t0004g0334 a0006c0008t0001g0050	HG00323.hp1 HG00438.hp1 HG00597.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp2 others(54): Show HG00323.hp1 HG00438.hp1 HG00597.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp2 HG00735.hp1 HG00738.hp1 HG01074.hp2 HG01081.hp2 HG01106.hp2 HG01255.hp2 HG01257.hp2 HG01258.hp2 HG01346.hp2 HG01928.hp2 HG01943.hp1 HG01981.hp1 HG02027.hp2 HG02071.hp1 HG02132.hp1 HG02135.hp1 HG02602.hp2 HG02723.hp1 HG03239.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp1 HG03704.hp1 NA18612.hp2 NA18747.hp2 NA18939.hp2 NA18942.hp2 NA18945.hp1 NA18951.hp1 NA18952.hp1 NA18953.hp2 NA18955.hp1 NA18956.hp1 NA18960.hp2 NA18961.hp2 NA18963.hp2 NA18969.hp1 NA18972.hp1 NA18979.hp1 NA18980.hp1 NA18983.hp2 NA18986.hp1 NA18995.hp1 NA19003.hp1 NA19005.hp1 NA19057.hp1 NA19060.hp2 NA19064.hp1 NA19070.hp1 NA19078.hp1 NA19079.hp2 NA19083.hp1 NA19085.hp2 NA19088.hp1 NA20752.hp2	Genomic atlas of the plasma metabolome prioritizes others(42): Show Genomic atlas of the plasma metabolome prioritizes metabolites implicated in human diseases.	6,756 European ancestry individuals/ 6,756 European ancestry individuals/		ABCG2	rs2054576-G	-	MODIFIER	chr4	A A	G G
chr4:88124179	c.532-2387T>C c.532-2387T>C	Body mass index Body mass index	a0001 a0002 a0004 a0005 a0008 others(2): Show a0001 a0002 a0004 a0005 a0008 a0009 a0010	a0001c0001 a0001c0005 a0002c0002 a0002c0004 a0004c0006 others(4): Show a0001c0001 a0001c0005 a0002c0002 a0002c0004 a0004c0006 a0005c0007 a0008c0011 a0009c0010 a0010c0009	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 others(21): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 a0001c0001t0013 a0001c0001t0014 a0001c0001t0016 a0001c0005t0001 a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0004 a0002c0002t0011 a0002c0002t0012 a0002c0004t0001 a0002c0004t0007 a0002c0004t0015 a0004c0006t0001 a0005c0007t0001 a0008c0011t0001 a0009c0010t0001 a0010c0009t0001	a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0015 a0001c0001t0001g0019 a0001c0001t0001g0020 others(274): Show a0001c0001t0001g0003 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Haplotype Detail Info [ABCG2_chr4_88085269_88163639>a0002c0002]

🧬 Gene Summary

🧬 JoGo Online Haplotype Explorer ABCG2_chr4_88085269_88163639

AVariants in Amino-acids (protein) level Haplotype (Total: 1)

CVariants in Coding level Haplotype (Total: 0)

AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 1)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 30)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 6)

GWASCatalog Related Variants (Total: 42)

GTEx Related Variants (Page 1 of 3 - Total: 268)