JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Haplotype Detail Info [AGAP3_chr7_151081475_151149434>a0001c0001t0002g0160]

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chr7:151101893	c.331+14821G>A c.331+14821G>A	Body mass index Body mass index	a0001 a0004 a0006 a0007 a0001 a0004 a0006 a0007	a0001c0001 a0001c0003 a0001c0004 a0001c0006 a0001c0009 others(3): Show a0001c0001 a0001c0003 a0001c0004 a0001c0006 a0001c0009 a0004c0016 a0006c0015 a0007c0014	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 others(9): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0003t0001 a0001c0004t0001 a0001c0006t0001 a0001c0009t0001 a0004c0016t0001 a0006c0015t0001 a0007c0014t0001	a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0004 a0001c0001t0001g0011 a0001c0001t0001g0012 a0001c0001t0001g0017 others(167): Show a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0004 a0001c0001t0001g0011 a0001c0001t0001g0012 a0001c0001t0001g0017 a0001c0001t0001g0018 a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0024 a0001c0001t0001g0025 a0001c0001t0001g0026 a0001c0001t0001g0028 a0001c0001t0001g0029 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Genomes cell l ines reveals an association of the NQO1 gene with the response of multiple anticancer drugs.	680 lymphoblastoid cell lines from Han Chinese anc others(145): Show 680 lymphoblastoid cell lines from Han Chinese anc estry, Japanese ancestry, Kenyan ancestry, Mexican ancestry, Tuscan ancestry, Yoruban ancestry, Brit ish ancestry, Columbian ancestry individuals/		AGAP3	rs10273337-?	+	MODIFIER	chr7	A A	G G
chr7:151098522	c.331+11450G>A c.331+11450G>A	Cortical surface area Cortical surface area	a0001 a0004 a0005 a0006 a0007 others(1): Show a0001 a0004 a0005 a0006 a0007 a0008	a0001c0001 a0001c0003 a0001c0004 a0001c0006 a0001c0009 others(9): Show a0001c0001 a0001c0003 a0001c0004 a0001c0006 a0001c0009 a0001c0011 a0001c0013 a0001c0017 a0001c0018 a0004c0016 a0005c0012 a0006c0015 a0007c0014 a0008c0010	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 others(16): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0003t0001 a0001c0004t0001 a0001c0006t0001 a0001c0009t0001 a0001c0011t0001 a0001c0013t0001 a0001c0017t0001 a0001c0018t0001 a0004c0016t0001 a0005c0012t0002 a0006c0015t0001 a0007c0014t0001 a0008c0010t0001	a0001c0001t0001g0002 a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0004 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 others(288): Show a0001c0001t0001g0002 a0001c0001t0001g0003 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multivariate genome-wide association s tudy identifies 780 unique genetic loci associated with cortical morphology.	35,657 White British ancestry individuals/ 35,657 White British ancestry individuals/	NR	AGAP3	rs7385751-G	+	MODIFIER	chr7	G G	A A
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GVariants in Genebody level Haplotype (Total: 68)

AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 1)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 1)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 1)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 1)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 34)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 3)

GWASCatalog Related Variants (Total: 10)