JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Haplotype Detail Info [C3orf52_chr3_112081389_112123210>a0001c0001t0002g0107]

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112106097:splice 112106097:variant goto	C3orf52 intron_variant c.396+3132G>A C3orf52 intron_variant c.396+3132G>A	SLC9C1 Testis 4.666 0.354	1 3 5 36	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0011 a0001c0012 a0001c0001 a0001c0011 a0001c0012	a0001c0001t0002 a0001c0001t0007 a0001c0001t0011 a0001c0011t0002 a0001c0012t0002 a0001c0001t0002 a0001c0001t0007 a0001c0001t0011 a0001c0011t0002 a0001c0012t0002	a0001c0001t0002g0007 a0001c0001t0002g0008 a0001c0001t0002g0017 a0001c0001t0002g0018 a0001c0001t0002g0031 others(31): Show a0001c0001t0002g0007 a0001c0001t0002g0008 a0001c0001t0002g0017 a0001c0001t0002g0018 a0001c0001t0002g0031 a0001c0001t0002g0032 a0001c0001t0002g0033 a0001c0001t0002g0072 a0001c0001t0002g0073 a0001c0001t0002g0098 a0001c0001t0002g0099 a0001c0001t0002g0102 a0001c0001t0002g0103 a0001c0001t0002g0104 a0001c0001t0002g0106 a0001c0001t0002g0107 a0001c0001t0002g0108 a0001c0001t0002g0109 a0001c0001t0002g0126 a0001c0001t0002g0127 a0001c0001t0002g0128 a0001c0001t0002g0129 a0001c0001t0002g0130 a0001c0001t0002g0133 a0001c0001t0002g0136 a0001c0001t0002g0137 a0001c0001t0002g0138 a0001c0001t0002g0139 a0001c0001t0002g0141 a0001c0001t0002g0142 a0001c0001t0007g0033 a0001c0001t0007g0132 a0001c0001t0007g0134 a0001c0001t0011g0135 a0001c0011t0002g0140 a0001c0012t0002g0131	HG00323.hp1 HG00621.hp1 HG01515.hp2 HG01884.hp2 HG01934.hp1 others(43): Show HG00323.hp1 HG00621.hp1 HG01515.hp2 HG01884.hp2 HG01934.hp1 HG02004.hp1 HG02027.hp2 HG02055.hp1 HG02055.hp2 HG02145.hp2 HG02155.hp2 HG02258.hp2 HG02280.hp2 HG02486.hp2 HG02572.hp2 HG02622.hp2 HG02683.hp1 HG02723.hp1 HG02735.hp1 HG02735.hp2 HG02809.hp2 HG02818.hp1 HG02886.hp1 HG02896.hp2 HG02970.hp2 HG03471.hp2 HG03490.hp2 HG03491.hp1 HG03516.hp2 HG03540.hp2 HG03579.hp1 HG03688.hp2 HG03710.hp2 HG03834.hp2 HG03942.hp2 HG04204.hp2 NA18939.hp1 NA18940.hp2 NA18941.hp2 NA18984.hp2 NA18989.hp1 NA18993.hp1 NA19001.hp2 NA19003.hp1 NA19030.hp2 NA19043.hp1 NA19055.hp2 NA20129.hp1	0.048	39	40	10	chr3_112106097_G_A_b38	+	MODIFIER	chr3	G G	A A	TogoVar

Haplotype Detail Info [C3orf52_chr3_112081389_112123210>a0001c0001t0002g0107]

🧬 Gene Summary

🧬 JoGo Online Haplotype Explorer C3orf52_chr3_112081389_112123210

AVariants in Amino-acids (protein) level Haplotype (Total: 1)

CVariants in Coding level Haplotype (Total: 0)

TVariants in Transcript level Haplotype (Total: 1)

GVariants in Genebody level Haplotype (Total: 34)

AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 1)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 1)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 1)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 1)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 10)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 0)

GWASCatalog Related Variants (Total: 0)

GTEx Related Variants (Page 1 of 1 - Total: 77)