JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Haplotype Detail Info [CCDC138_chr2_108781771_108881578>a0003c0003t0001g0139]

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genename	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	actghapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	chr	start	end
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Haplotype Detail Info [CCDC138_chr2_108781771_108881578>a0003c0003t0001g0139]

🧬 Gene Summary

🧬 JoGo Online Haplotype Explorer CCDC138_chr2_108781771_108881578

AVariants in Amino-acids (protein) level Haplotype (Total: 2)

CVariants in Coding level Haplotype (Total: 0)

TVariants in Transcript level Haplotype (Total: 1)

GVariants in Genebody level Haplotype (Total: 132)

AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 1)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 1)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 1)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 1)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 28)