JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

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CHR:POS	annotation hgvs_c hgvs_p	disease trait -log10p odds or beta	AHAPIDS ahapids	ACHAPIDS achapids	ACTHAPIDS acthapids	ACTGHAPIDS actghapids	haplotypeids haplotypeids	study	initial sample size/ replication sample size	report genes	mapped gene	strongest snp risk allele	strand strand	impact	chr	ref	alt
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Haplotype Detail Info [CCDC138_chr2_108781771_108881578>a0004c0007t0002]

🧬 Gene Summary

🧬 JoGo Online Haplotype Explorer CCDC138_chr2_108781771_108881578

AVariants in Amino-acids (protein) level Haplotype (Total: 2)

CVariants in Coding level Haplotype (Total: 0)

TVariants in Transcript level Haplotype (Total: 2)

AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 1)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 1)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 28)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 0)

GWASCatalog Related Variants (Total: 1)

GTEx Related Variants (Page 1 of 19 - Total: 1866)