JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Haplotype Detail Info [CNDP2_chr18_74491363_74528454>a0001c0001t0002g0037]

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chr18:74499889	C C	G G	0.3797	5_prime_UTR_variant 5_prime_UTR_variant	MODIFIER	HG00323.hp1 HG00544.hp1 HG00597.hp2 others(158): Show HG00323.hp1 HG00544.hp1 HG00597.hp2 HG00609.hp2 HG00639.hp2 HG00735.hp1 HG00738.hp1 HG01069.hp1 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01074.hp1 HG01074.hp2 HG01106.hp2 HG01109.hp2 HG01123.hp2 HG01175.hp1 HG01243.hp1 HG01255.hp1 HG01255.hp2 HG01256.hp1 HG01256.hp2 HG01257.hp1 HG01258.hp2 HG01261.hp1 HG01358.hp2 HG01884.hp1 HG01891.hp1 HG01934.hp2 HG01943.hp1 HG01943.hp2 HG01952.hp2 HG01975.hp1 HG01978.hp1 HG02004.hp2 HG02015.hp1 HG02040.hp1 HG02055.hp1 HG02056.hp1 HG02074.hp1 HG02109.hp1 HG02109.hp2 HG02132.hp1 HG02148.hp1 HG02257.hp2 HG02258.hp2 HG02300.hp1 HG02451.hp1 HG02486.hp2 HG02523.hp2 HG02572.hp2 HG02615.hp2 HG02622.hp1 HG02622.hp2 HG02630.hp1 HG02630.hp2 HG02647.hp1 HG02647.hp2 HG02683.hp2 HG02698.hp1 HG02717.hp1 HG02723.hp2 HG02735.hp1 HG02738.hp2 HG02809.hp1 HG02809.hp2 HG02818.hp1 HG02886.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp1 HG02895.hp2 HG02896.hp1 HG02897.hp1 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chr18:74499889	c.-85C>G c.-85C>G	Gamma-glutamyl-2-aminobutyrate levels (advanced age) others(18): Show Gamma-glutamyl-2-aminobutyrate levels (advanced age) 0.1665	a0001 a0002 a0003 a0006 a0007 others(1): Show a0001 a0002 a0003 a0006 a0007 a0008	a0001c0001 a0001c0003 a0001c0005 a0001c0016 a0001c0017 others(7): Show a0001c0001 a0001c0003 a0001c0005 a0001c0016 a0001c0017 a0002c0002 a0002c0006 a0002c0007 a0003c0004 a0006c0013 a0007c0011 a0008c0012	a0001c0001t0002 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 a0001c0001t0007 a0001c0001t0009 others(34): Show a0001c0001t0002 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 a0001c0001t0007 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 a0001c0001t0037 a0001c0001t0038 a0001c0001t0042 a0001c0001t0046 a0001c0003t0002 a0001c0003t0006 a0001c0003t0007 a0001c0003t0009 a0001c0003t0021 a0001c0003t0023 a0001c0003t0048 a0001c0005t0002 a0001c0016t0009 a0001c0017t0002 a0002c0002t0002 a0002c0002t0006 a0002c0002t0007 a0002c0002t0010 a0002c0002t0022 a0002c0002t0039 a0002c0002t0040 a0002c0002t0041 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Haplotype Detail Info [CNDP2_chr18_74491363_74528454>a0001c0001t0002g0037]

🧬 Gene Summary

🧬 JoGo Online Haplotype Explorer CNDP2_chr18_74491363_74528454

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CVariants in Coding level Haplotype (Total: 0)

TVariants in Transcript level Haplotype (Total: 8)

GVariants in Genebody level Haplotype (Total: 37)

AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 1)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 1)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 1)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 1)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 22)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 0)

GWASCatalog Related Variants (Total: 9)

GTEx Related Variants (Page 1 of 6 - Total: 557)