JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

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15719748:splice 15719748:variant goto	c.24T>A p.Gly8Gly c.24T>A p.Gly8Gly	1237012	Benign	ITGA8:8516 ITGA8:8516	SO:0001819 synonymous_variant SO:0001819 synonymous_variant	MedGen:C3661900 MedGen:C3661900	-	4	5	11	16	a0001 a0002 a0004 a0012 a0001 a0002 a0004 a0012	a0001c0008 a0001c0011 a0002c0006 a0004c0004 a0012c0017 a0001c0008 a0001c0011 a0002c0006 a0004c0004 a0012c0017	a0001c0008t0009 a0001c0008t0010 a0001c0011t0001 a0001c0011t0010 a0002c0006t0017 others(6): Show a0001c0008t0009 a0001c0008t0010 a0001c0011t0001 a0001c0011t0010 a0002c0006t0017 a0002c0006t0019 a0004c0004t0002 a0004c0004t0009 a0004c0004t0011 a0004c0004t0015 a0012c0017t0008	a0001c0008t0009g0046 a0001c0008t0010g0036 a0001c0008t0010g0038 a0001c0011t0001g0048 a0001c0011t0010g0035 others(11): Show a0001c0008t0009g0046 a0001c0008t0010g0036 a0001c0008t0010g0038 a0001c0011t0001g0048 a0001c0011t0010g0035 a0002c0006t0017g0034 a0002c0006t0017g0037 a0002c0006t0019g0044 a0002c0006t0019g0045 a0004c0004t0002g0047 a0004c0004t0002g0051 a0004c0004t0009g0043 a0004c0004t0009g0049 a0004c0004t0011g0053 a0004c0004t0015g0052 a0012c0017t0008g0050	HG01109.hp1 HG01891.hp1 HG02145.hp2 HG02258.hp2 HG02280.hp1 others(11): Show HG01109.hp1 HG01891.hp1 HG02145.hp2 HG02258.hp2 HG02280.hp1 HG02615.hp2 HG02622.hp1 HG02630.hp2 HG02965.hp1 HG02970.hp1 HG03471.hp2 HG03516.hp1 NA18906.hp2 NA19030.hp2 NA19043.hp2 NA20129.hp1	LOW	chr10	A A	T T	TogoVar
15677622:splice 15677622:variant goto	c.646G>C p.Val216Leu c.646G>C p.Val216Leu	776499	Benign	ITGA8:8516 ITGA8:8516	SO:0001583 missense_variant SO:0001583 missense_variant	MedGen:C3661900 MedGen:C3661900	-	5	8	13	15	a0004 a0008 a0012 a0013 a0014 a0004 a0008 a0012 a0013 a0014	a0004c0004 a0004c0013 a0004c0024 a0004c0025 a0008c0012 others(3): Show a0004c0004 a0004c0013 a0004c0024 a0004c0025 a0008c0012 a0012c0017 a0013c0022 a0014c0023	a0004c0004t0002 a0004c0004t0009 a0004c0004t0011 a0004c0004t0015 a0004c0013t0014 others(8): Show a0004c0004t0002 a0004c0004t0009 a0004c0004t0011 a0004c0004t0015 a0004c0013t0014 a0004c0013t0022 a0004c0024t0039 a0004c0025t0002 a0008c0012t0002 a0008c0012t0022 a0012c0017t0008 a0013c0022t0005 a0014c0023t0040	a0004c0004t0002g0047 a0004c0004t0002g0051 a0004c0004t0009g0043 a0004c0004t0009g0049 a0004c0004t0011g0053 others(10): Show a0004c0004t0002g0047 a0004c0004t0002g0051 a0004c0004t0009g0043 a0004c0004t0009g0049 a0004c0004t0011g0053 a0004c0004t0015g0052 a0004c0013t0014g0033 a0004c0013t0022g0218 a0004c0024t0039g0212 a0004c0025t0002g0106 a0008c0012t0002g0080 a0008c0012t0022g0217 a0012c0017t0008g0050 a0013c0022t0005g0129 a0014c0023t0040g0214	HG01109.hp1 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02280.hp1 HG02451.hp2 others(10): Show HG01109.hp1 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02280.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp2 HG02572.hp1 HG02630.hp1 HG02630.hp2 HG02886.hp2 HG03225.hp2 HG03471.hp2 HG03579.hp2 NA18906.hp2 NA20129.hp1	MODERATE	chr10	C C	G G	TogoVar
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15655383:splice 15655383:variant goto	c.972C>T p.Thr324Thr c.972C>T p.Thr324Thr	2721693	Benign	ITGA8:8516 ITGA8:8516	SO:0001819 synonymous_variant SO:0001819 synonymous_variant	MedGen:C3661900 MedGen:C3661900	-	1	1	1	1	a0004 a0004	a0004c0025 a0004c0025	a0004c0025t0002 a0004c0025t0002	a0004c0025t0002g0106 a0004c0025t0002g0106	HG02886.hp2 HG02886.hp2	LOW	chr10	G G	A A	TogoVar

CHR:POS	annotation hgvs_c hgvs_p	disease trait -log10p odds or beta	AHAPIDS ahapids	ACHAPIDS achapids	ACTHAPIDS acthapids	ACTGHAPIDS actghapids	haplotypeids haplotypeids	study	initial sample size/ replication sample size	report genes	mapped gene	strongest snp risk allele	strand strand	impact	chr	ref	alt
chr10:15519544	c.2983-132A>G c.2983-132A>G	Parkinson's disease 1.19 Parkinson's disease 1.19	a0001 a0004 a0001 a0004	a0001c0001 a0001c0008 a0004c0013 a0001c0001 a0001c0008 a0004c0013	a0001c0001t0002 a0001c0001t0012 a0001c0001t0034 a0001c0001t0035 a0001c0008t0010 others(1): Show a0001c0001t0002 a0001c0001t0012 a0001c0001t0034 a0001c0001t0035 a0001c0008t0010 a0004c0013t0022	a0001c0001t0002g0060 a0001c0001t0002g0062 a0001c0001t0002g0066 a0001c0001t0002g0109 a0001c0001t0002g0137 others(13): Show a0001c0001t0002g0060 a0001c0001t0002g0062 a0001c0001t0002g0066 a0001c0001t0002g0109 a0001c0001t0002g0137 a0001c0001t0002g0150 a0001c0001t0002g0151 a0001c0001t0002g0161 a0001c0001t0002g0176 a0001c0001t0002g0189 a0001c0001t0002g0190 a0001c0001t0012g0020 a0001c0001t0012g0021 a0001c0001t0012g0023 a0001c0001t0034g0160 a0001c0001t0035g0162 a0001c0008t0010g0036 a0004c0013t0022g0218	HG00140.hp1 HG00323.hp2 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG00741.hp2 others(13): Show HG00140.hp1 HG00323.hp2 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG00741.hp2 HG01074.hp1 HG01074.hp2 HG01167.hp1 HG01169.hp1 HG02258.hp2 HG02698.hp1 HG02895.hp2 HG02965.hp2 HG03239.hp1 HG03490.hp1 HG03579.hp2 HG03942.hp1 NA18906.hp1	Genome-wide association study reveals genetic risk others(32): Show Genome-wide association study reveals genetic risk underlying Parkinson's disease.	1,713 European ancestry cases, 3,978 European ance others(77): Show 1,713 European ancestry cases, 3,978 European ance stry controls/3,361 European ancestry cases, 4,573 European ancestry controls	ITGA8	ITGA8	rs7077361-T	-	MODIFIER	chr10	T T	C C
chr10:15677622	c.646G>C p.Val216Leu c.646G>C p.Val216Leu	Quantitative traits 0.35 Quantitative traits 0.35	a0004 a0008 a0012 a0013 a0014 a0004 a0008 a0012 a0013 a0014	a0004c0004 a0004c0013 a0004c0024 a0004c0025 a0008c0012 others(3): Show a0004c0004 a0004c0013 a0004c0024 a0004c0025 a0008c0012 a0012c0017 a0013c0022 a0014c0023	a0004c0004t0002 a0004c0004t0009 a0004c0004t0011 a0004c0004t0015 a0004c0013t0014 others(8): Show a0004c0004t0002 a0004c0004t0009 a0004c0004t0011 a0004c0004t0015 a0004c0013t0014 a0004c0013t0022 a0004c0024t0039 a0004c0025t0002 a0008c0012t0002 a0008c0012t0022 a0012c0017t0008 a0013c0022t0005 a0014c0023t0040	a0004c0004t0002g0047 a0004c0004t0002g0051 a0004c0004t0009g0043 a0004c0004t0009g0049 a0004c0004t0011g0053 others(10): Show a0004c0004t0002g0047 a0004c0004t0002g0051 a0004c0004t0009g0043 a0004c0004t0009g0049 a0004c0004t0011g0053 a0004c0004t0015g0052 a0004c0013t0014g0033 a0004c0013t0022g0218 a0004c0024t0039g0212 a0004c0025t0002g0106 a0008c0012t0002g0080 a0008c0012t0022g0217 a0012c0017t0008g0050 a0013c0022t0005g0129 a0014c0023t0040g0214	HG01109.hp1 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02280.hp1 HG02451.hp2 others(10): Show HG01109.hp1 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02280.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp2 HG02572.hp1 HG02630.hp1 HG02630.hp2 HG02886.hp2 HG03225.hp2 HG03471.hp2 HG03579.hp2 NA18906.hp2 NA20129.hp1	Genome-wide association studies in an isolated fou others(50): Show Genome-wide association studies in an isolated fou nder population from the Pacific Island of Kosrae.	2,906 Kosraen individuals/ 2,906 Kosraen individuals/	ITGA8	ITGA8	rs7895372-G	-	MODERATE	chr10	C C	G G
chr10:15558672	c.2638-470G>T c.2638-470G>T	Periodontitis (CDC/AAP) 1.32 Periodontitis (CDC/AAP) 1.32	a0001 a0003 a0004 a0005 a0007 others(2): Show a0001 a0003 a0004 a0005 a0007 a0008 a0016	a0001c0001 a0001c0007 a0001c0008 a0001c0011 a0001c0014 others(8): Show a0001c0001 a0001c0007 a0001c0008 a0001c0011 a0001c0014 a0003c0003 a0004c0004 a0004c0013 a0004c0025 a0005c0005 a0007c0009 a0008c0012 a0016c0027	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 others(34): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0011 a0001c0001t0012 a0001c0001t0015 a0001c0001t0026 a0001c0001t0028 a0001c0001t0029 a0001c0001t0033 a0001c0001t0034 a0001c0001t0035 a0001c0001t0036 a0001c0001t0037 a0001c0001t0038 a0001c0001t0041 a0001c0001t0042 a0001c0007t0002 a0001c0007t0015 a0001c0008t0009 a0001c0008t0010 a0001c0011t0010 a0001c0014t0003 a0003c0003t0007 a0003c0003t0010 a0003c0003t0023 a0004c0004t0002 a0004c0004t0011 a0004c0004t0015 a0004c0013t0022 a0004c0025t0002 a0005c0005t0004 a0007c0009t0002 a0008c0012t0002 a0008c0012t0022 a0016c0027t0044	a0001c0001t0001g0108 a0001c0001t0002g0060 a0001c0001t0002g0062 a0001c0001t0002g0066 a0001c0001t0002g0075 others(83): Show a0001c0001t0001g0108 a0001c0001t0002g0060 a0001c0001t0002g0062 a0001c0001t0002g0066 a0001c0001t0002g0075 a0001c0001t0002g0076 a0001c0001t0002g0109 a0001c0001t0002g0137 a0001c0001t0002g0150 a0001c0001t0002g0151 a0001c0001t0002g0161 a0001c0001t0002g0170 a0001c0001t0002g0176 a0001c0001t0002g0181 a0001c0001t0002g0189 a0001c0001t0002g0190 a0001c0001t0003g0078 a0001c0001t0003g0079 a0001c0001t0003g0121 a0001c0001t0003g0122 a0001c0001t0003g0123 a0001c0001t0004g0112 a0001c0001t0004g0142 a0001c0001t0004g0153 a0001c0001t0004g0154 a0001c0001t0004g0166 a0001c0001t0004g0169 a0001c0001t0004g0171 a0001c0001t0004g0172 a0001c0001t0004g0173 a0001c0001t0004g0186 a0001c0001t0004g0195 a0001c0001t0004g0204 a0001c0001t0004g0206 a0001c0001t0007g0008 a0001c0001t0007g0018 a0001c0001t0008g0202 a0001c0001t0011g0119 a0001c0001t0011g0130 a0001c0001t0011g0211 a0001c0001t0012g0020 a0001c0001t0012g0021 a0001c0001t0012g0023 a0001c0001t0015g0084 a0001c0001t0026g0003 a0001c0001t0028g0042 a0001c0001t0029g0070 a0001c0001t0033g0073 a0001c0001t0034g0160 a0001c0001t0035g0162 a0001c0001t0036g0074 a0001c0001t0037g0096 a0001c0001t0038g0213 a0001c0001t0041g0215 a0001c0001t0042g0216 a0001c0007t0002g0138 a0001c0007t0002g0157 a0001c0007t0015g0069 a0001c0008t0009g0046 a0001c0008t0010g0036 a0001c0008t0010g0038 a0001c0011t0010g0035 a0001c0014t0003g0158 a0001c0014t0003g0159 a0003c0003t0007g0006 a0003c0003t0007g0007 a0003c0003t0007g0010 a0003c0003t0007g0011 a0003c0003t0007g0012 a0003c0003t0007g0030 a0003c0003t0010g0039 a0003c0003t0023g0041 a0004c0004t0002g0047 a0004c0004t0002g0051 a0004c0004t0011g0053 a0004c0004t0015g0052 a0004c0013t0022g0218 a0004c0025t0002g0106 a0005c0005t0004g0135 a0005c0005t0004g0149 a0005c0005t0004g0165 a0005c0005t0004g0168 a0007c0009t0002g0100 a0007c0009t0002g0131 a0007c0009t0002g0191 a0008c0012t0002g0080 a0008c0012t0022g0217 a0016c0027t0044g0219	HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00323.hp2 HG00642.hp1 HG00642.hp2 others(83): Show HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00323.hp2 HG00642.hp1 HG00642.hp2 HG00741.hp1 HG00741.hp2 HG01070.hp1 HG01074.hp1 HG01074.hp2 HG01099.hp2 HG01109.hp1 HG01167.hp1 HG01169.hp1 HG01257.hp1 HG01361.hp1 HG01433.hp2 HG01496.hp1 HG01884.hp1 HG01891.hp1 HG01975.hp1 HG01978.hp1 HG02040.hp2 HG02109.hp1 HG02109.hp2 HG02145.hp1 HG02155.hp1 HG02258.hp1 HG02258.hp2 HG02273.hp2 HG02280.hp1 HG02280.hp2 HG02451.hp1 HG02486.hp1 HG02559.hp1 HG02572.hp1 HG02615.hp1 HG02615.hp2 HG02630.hp2 HG02647.hp1 HG02698.hp1 HG02717.hp1 HG02738.hp1 HG02738.hp2 HG02818.hp2 HG02886.hp2 HG02895.hp1 HG02895.hp2 HG02897.hp2 HG02922.hp1 HG02965.hp1 HG02965.hp2 HG02970.hp2 HG03041.hp2 HG03098.hp1 HG03130.hp1 HG03139.hp1 HG03195.hp2 HG03209.hp1 HG03239.hp1 HG03453.hp1 HG03490.hp1 HG03540.hp2 HG03579.hp2 HG03669.hp2 HG03942.hp1 HG03942.hp2 HG04184.hp1 HG06807.hp1 HG06807.hp2 NA18522.hp2 NA18906.hp1 NA18940.hp2 NA18941.hp2 NA18951.hp2 NA18954.hp1 NA18957.hp1 NA18968.hp2 NA18983.hp1 NA19004.hp1 NA19030.hp1 NA19054.hp2 NA19056.hp2 NA19087.hp2 NA20129.hp1 NA20129.hp2 NA21309.hp1 NA21309.hp2	Genome-wide association study of chronic periodont others(36): Show Genome-wide association study of chronic periodont itis in a general German population.	up to 3,915 European ancestry individuals/ up to 3,915 European ancestry individuals/	ITGA8	ITGA8	rs28643277-A	-	MODIFIER	chr10	C C	A A
chr10:15612888	c.1553+772A>G c.1553+772A>G	Diisocyanate-induced asthma 33.99 Diisocyanate-induced asthma 33.99	a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 others(9): Show a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 a0007 a0009 a0010 a0011 a0013 a0015 a0016 a0017 a0018	a0001c0001 a0001c0008 a0001c0014 a0001c0020 a0002c0002 others(15): Show a0001c0001 a0001c0008 a0001c0014 a0001c0020 a0002c0002 a0002c0006 a0003c0003 a0004c0004 a0004c0013 a0004c0025 a0005c0005 a0007c0009 a0009c0016 a0010c0015 a0011c0019 a0013c0022 a0015c0028 a0016c0027 a0017c0026 a0018c0018	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0006 others(46): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0006 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0011 a0001c0001t0012 a0001c0001t0014 a0001c0001t0016 a0001c0001t0018 a0001c0001t0020 a0001c0001t0021 a0001c0001t0025 a0001c0001t0026 a0001c0001t0027 a0001c0001t0028 a0001c0001t0029 a0001c0001t0034 a0001c0001t0035 a0001c0001t0036 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chr10:15568092	c.2637+4119T>C c.2637+4119T>C	Gut microbial network clusters (Brown (at 3 months) x Any Formula feeding (3 Months) interactionothers(60): Show Gut microbial network clusters (Brown (at 3 months) x Any Formula feeding (3 Months) interaction 0.01	a0001 a0002 a0003 a0004 a0006 others(9): Show a0001 a0002 a0003 a0004 a0006 a0007 a0008 a0009 a0011 a0012 a0013 a0015 a0016 a0017	a0001c0001 a0001c0007 a0001c0008 a0001c0011 a0001c0014 others(18): Show a0001c0001 a0001c0007 a0001c0008 a0001c0011 a0001c0014 a0001c0020 a0002c0002 a0002c0021 a0003c0003 a0004c0004 a0004c0013 a0004c0024 a0004c0025 a0006c0010 a0007c0009 a0008c0012 a0009c0016 a0011c0019 a0012c0017 a0013c0022 a0015c0028 a0016c0027 a0017c0026	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0006 others(53): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0006 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0011 a0001c0001t0012 a0001c0001t0014 a0001c0001t0015 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chr10:15629439	c.1400-12880A>G c.1400-12880A>G	Volume of right cortico-amygdaloid transition area others(19): Show Volume of right cortico-amygdaloid transition area 0.0551095	a0001 a0002 a0004 a0015 a0001 a0002 a0004 a0015	a0001c0001 a0002c0002 a0004c0013 a0015c0028 a0001c0001 a0002c0002 a0004c0013 a0015c0028	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0006 others(13): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0006 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0011 a0001c0001t0016 a0001c0001t0020 a0001c0001t0026 a0001c0001t0036 a0001c0001t0038 a0002c0002t0005 a0002c0002t0013 a0004c0013t0014 a0015c0028t0006	a0001c0001t0001g0108 a0001c0001t0001g0110 a0001c0001t0001g0111 a0001c0001t0001g0125 a0001c0001t0001g0132 others(47): Show a0001c0001t0001g0108 a0001c0001t0001g0110 a0001c0001t0001g0111 a0001c0001t0001g0125 a0001c0001t0001g0132 a0001c0001t0001g0148 a0001c0001t0001g0152 a0001c0001t0001g0163 a0001c0001t0001g0188 a0001c0001t0001g0209 a0001c0001t0002g0109 a0001c0001t0002g0150 a0001c0001t0002g0151 a0001c0001t0002g0181 a0001c0001t0003g0103 a0001c0001t0003g0133 a0001c0001t0003g0144 a0001c0001t0003g0145 a0001c0001t0003g0147 a0001c0001t0003g0167 a0001c0001t0003g0179 a0001c0001t0003g0180 a0001c0001t0003g0198 a0001c0001t0003g0210 a0001c0001t0004g0089 a0001c0001t0004g0166 a0001c0001t0004g0171 a0001c0001t0004g0172 a0001c0001t0004g0173 a0001c0001t0004g0204 a0001c0001t0006g0001 a0001c0001t0006g0032 a0001c0001t0007g0018 a0001c0001t0008g0202 a0001c0001t0009g0072 a0001c0001t0011g0119 a0001c0001t0016g0093 a0001c0001t0016g0205 a0001c0001t0016g0207 a0001c0001t0020g0120 a0001c0001t0026g0003 a0001c0001t0036g0074 a0001c0001t0038g0213 a0002c0002t0005g0067 a0002c0002t0005g0118 a0002c0002t0005g0140 a0002c0002t0005g0192 a0002c0002t0005g0196 a0002c0002t0013g0025 a0002c0002t0013g0028 a0004c0013t0014g0033 a0015c0028t0006g0017	HG00140.hp1 HG01070.hp1 HG01070.hp2 HG01099.hp1 HG01109.hp2 others(47): Show HG00140.hp1 HG01070.hp1 HG01070.hp2 HG01099.hp1 HG01109.hp2 HG01169.hp1 HG01361.hp2 HG01496.hp2 HG01993.hp1 HG02040.hp1 HG02155.hp1 HG02155.hp2 HG02258.hp1 HG02273.hp2 HG02451.hp1 HG02486.hp1 HG02523.hp2 HG02630.hp1 HG02698.hp2 HG02723.hp1 HG02886.hp1 HG03041.hp1 HG03041.hp2 HG03239.hp2 HG03453.hp2 HG03490.hp1 HG03492.hp2 HG03942.hp2 HG04184.hp2 HG06807.hp2 NA18943.hp1 NA18946.hp2 NA18951.hp1 NA18951.hp2 NA18954.hp2 NA18957.hp1 NA18959.hp2 NA18962.hp1 NA18962.hp2 NA18966.hp1 NA18968.hp2 NA18977.hp1 NA18983.hp2 NA19002.hp1 NA19004.hp2 NA19009.hp2 NA19030.hp1 NA19054.hp1 NA19056.hp1 NA19087.hp1 NA19091.hp2 homoSapiens_chm13v2.hp1	Cross-ancestry and sex-stratified genome-wide asso others(52): Show Cross-ancestry and sex-stratified genome-wide asso ciation analyses of amygdala and subnucleus volume s.	16,899 European ancestry males, 2,397 East Asian a others(14): Show 16,899 European ancestry males, 2,397 East Asian a ncestry males/		ITGA8	rs12359169-C	-	MODIFIER	chr10	T T	C C
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pos	genename hgvs_c hgvs_p annotation	tissue expression gene -log10(pval) slope Tissue name in GTEx database(the target eQTL tissue name of the GTEx database) The -log10(nominal pvalue) in GTEx database Slope in GTEx database (positive value:alt allele has higher gene expression)	ahapid chapid thapid ghapid ahapid_count chapid_count thapid_count ghapid_count	AHAPIDS ahapids	ACHAPIDS achapids	ACTHAPIDS acthapids	ACTGHAPIDS actghapids	haplotypeids haplotypeids	af allele frequency in GTEx database	ms The number of samples with minor allele in GTEx database	ma The number of minor allele count in GTEx database	ver GTEx version	vid Variant ID in GTEx database	strand strand	impact	chr	ref	alt	external
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Haplotype Detail Info [ITGA8_chr10_15508954_15724922>a0004]

🧬 Gene Summary

🧬 JoGo Online Haplotype Explorer ITGA8_chr10_15508954_15724922

AVariants in Amino-acids (protein) level Haplotype (Total: 3)

AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 58)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 66)

GWASCatalog Related Variants (Total: 7)

GTEx Related Variants (Page 1 of 12 - Total: 1144)