JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Haplotype Detail Info [PDE8A_chr15_84976856_85144142>a0001]

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NA18987.hp1 NA18988.hp2 NA18990.hp1 NA18994.hp2 NA18995.hp2 NA18998.hp1 NA19001.hp2 NA19004.hp2 NA19011.hp2 NA19012.hp1 NA19030.hp2 NA19043.hp2 NA19054.hp1 NA19056.hp2 NA19058.hp2 NA19060.hp1 NA19062.hp1 NA19065.hp2 NA19066.hp1 NA19067.hp2 NA19068.hp2 NA19074.hp2 NA19077.hp2 NA19079.hp2 NA19081.hp2 NA19085.hp2 NA19086.hp2 NA19089.hp1 NA19090.hp2 NA19091.hp1 NA19240.hp1 NA19240.hp2 NA20129.hp1 NA20129.hp2 NA20300.hp1 NA20300.hp2 NA20905.hp1 NA20905.hp2 NA21309.hp1 NA21309.hp2	Multi-trait association analysis reveals shared ge others(65): Show Multi-trait association analysis reveals shared ge netic loci between Alzheimer's disease and cardiov ascular traits.	at least 757,601 European ancestry individuals (MT others(52): Show at least 757,601 European ancestry individuals (MT AG boosted by 455,258 Alzheimer's disease samples )/		PDE8A	rs3743157-A	+	MODIFIER	chr15	C C	A A
chr15:85094198	c.852+3017C>T c.852+3017C>T	Waist circumference adjusted for body mass index others(17): Show Waist circumference adjusted for body mass index 0.0586104	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0001	a0001c0001t0001g0019 a0001c0001t0001g0019	homoSapiens_chm13v2.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	GWAS of allometric body-shape indices in UK Bioban others(109): Show GWAS of allometric body-shape indices in UK Bioban k identifies loci suggesting associations with mor phogenesis, organogenesis, adrenal cell renewal an d cancer.	186,825 British ancestry men/ 186,825 British ancestry men/	PDE8A	PDE8A	rs77718466-T	+	MODIFIER	chr15	C C	T T
chr15:85010891	c.186+28543C>G c.186+28543C>G	Hip circumference adjusted for BMI 0.0244 others(3): Show Hip circumference adjusted for BMI 0.0244658	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0008 a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0008	a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0010 others(25): Show a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0010 a0001c0001t0001g0012 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0015 a0001c0001t0001g0017 a0001c0001t0001g0018 a0001c0001t0001g0019 a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0022 a0001c0001t0001g0023 a0001c0001t0001g0024 a0001c0001t0001g0025 a0001c0001t0001g0026 a0001c0001t0001g0027 a0001c0001t0001g0028 a0001c0001t0001g0029 a0001c0001t0001g0030 a0001c0001t0001g0031 a0001c0001t0001g0053 a0001c0001t0001g0054 a0001c0001t0001g0055 a0001c0001t0001g0292 a0001c0001t0003g0011 a0001c0001t0003g0013 a0001c0001t0008g0016	HG00323.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG01069.hp2 others(25): Show HG00323.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG01069.hp2 HG01070.hp2 HG01099.hp1 HG01123.hp1 HG01167.hp2 HG01169.hp2 HG01175.hp2 HG01261.hp2 HG01516.hp1 HG01975.hp2 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG02683.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp2 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG04204.hp2 NA18961.hp2 NA18966.hp2 NA18970.hp1 NA18978.hp2 NA19088.hp2 NA20752.hp2 NA20805.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	GWAS of allometric body-shape indices in UK Bioban others(109): Show GWAS of allometric body-shape indices in UK Bioban k identifies loci suggesting associations with mor phogenesis, organogenesis, adrenal cell renewal an d cancer.	219,872 British ancestry women/ 219,872 British ancestry women/	PDE8A	PDE8A	rs35816571-G	+	MODIFIER	chr15	C C	G G
chr15:85116953	c.1536-688T>C c.1536-688T>C	Bone density (confirmatory factor analysis Factor 19) others(13): Show Bone density (confirmatory factor analysis Factor 19)	a0001 a0006 a0001 a0006	a0001c0001 a0001c0002 a0006c0008 a0001c0001 a0001c0002 a0006c0008	a0001c0001t0001 a0001c0001t0004 a0001c0002t0001 a0006c0008t0001 a0001c0001t0001 a0001c0001t0004 a0001c0002t0001 a0006c0008t0001	a0001c0001t0001g0036 a0001c0001t0001g0166 a0001c0001t0001g0167 a0001c0001t0001g0177 a0001c0001t0001g0178 others(54): Show a0001c0001t0001g0036 a0001c0001t0001g0166 a0001c0001t0001g0167 a0001c0001t0001g0177 a0001c0001t0001g0178 a0001c0001t0001g0179 a0001c0001t0001g0180 a0001c0001t0001g0182 a0001c0001t0001g0183 a0001c0001t0001g0184 a0001c0001t0001g0185 a0001c0001t0001g0186 a0001c0001t0001g0187 a0001c0001t0001g0188 a0001c0001t0001g0189 a0001c0001t0001g0190 a0001c0001t0001g0276 a0001c0001t0001g0277 a0001c0001t0001g0278 a0001c0001t0001g0281 a0001c0001t0001g0282 a0001c0001t0001g0283 a0001c0001t0001g0284 a0001c0001t0001g0285 a0001c0001t0001g0286 a0001c0001t0001g0287 a0001c0001t0001g0288 a0001c0001t0001g0289 a0001c0001t0001g0290 a0001c0001t0001g0291 a0001c0001t0004g0062 a0001c0001t0004g0063 a0001c0002t0001g0297 a0001c0002t0001g0298 a0001c0002t0001g0299 a0001c0002t0001g0300 a0001c0002t0001g0301 a0001c0002t0001g0302 a0001c0002t0001g0303 a0001c0002t0001g0304 a0001c0002t0001g0305 a0001c0002t0001g0306 a0001c0002t0001g0307 a0001c0002t0001g0308 a0001c0002t0001g0309 a0001c0002t0001g0310 a0001c0002t0001g0311 a0001c0002t0001g0312 a0001c0002t0001g0313 a0001c0002t0001g0314 a0001c0002t0001g0315 a0001c0002t0001g0316 a0001c0002t0001g0317 a0001c0002t0001g0318 a0001c0002t0001g0319 a0001c0002t0001g0320 a0001c0002t0001g0344 a0006c0008t0001g0176 a0006c0008t0001g0181	HG01109.hp2 HG01243.hp2 HG01255.hp1 HG01346.hp2 HG01433.hp2 others(54): Show HG01109.hp2 HG01243.hp2 HG01255.hp1 HG01346.hp2 HG01433.hp2 HG01496.hp2 HG01884.hp1 HG01891.hp1 HG01891.hp2 HG02055.hp2 HG02109.hp2 HG02145.hp1 HG02258.hp2 HG02280.hp1 HG02280.hp2 HG02486.hp1 HG02559.hp1 HG02572.hp1 HG02622.hp2 HG02647.hp1 HG02647.hp2 HG02723.hp2 HG02809.hp1 HG02809.hp2 HG02818.hp1 HG02818.hp2 HG02886.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp1 HG02897.hp2 HG02922.hp1 HG02965.hp1 HG02970.hp2 HG02976.hp1 HG03041.hp1 HG03041.hp2 HG03130.hp1 HG03130.hp2 HG03225.hp1 HG03225.hp2 HG03453.hp2 HG03471.hp2 HG03516.hp2 HG03540.hp1 HG03540.hp2 HG04204.hp1 HG06807.hp1 NA18522.hp1 NA19030.hp2 NA19043.hp1 NA19043.hp2 NA19240.hp1 NA19240.hp2 NA20129.hp1 NA20129.hp2 NA20300.hp1 NA20905.hp2 NA21309.hp1 NA21309.hp2	Principled distillation of UK Biobank phenotype da others(51): Show Principled distillation of UK Biobank phenotype da ta reveals underlying structure in human variation .	115,532 European ancestry individuals/ 115,532 European ancestry individuals/		PDE8A	rs7167692-?	+	MODIFIER	chr15	T T	C C
chr15:85102221	c.1036+2023C>G c.1036+2023C>G	Medication use (diuretics) 0.06845347 Medication use (diuretics) 0.06845347	a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 others(4): Show a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 a0006 a0007 a0008 a0009	a0001c0001 a0001c0002 a0001c0004 a0001c0010 a0002c0003 others(7): Show a0001c0001 a0001c0002 a0001c0004 a0001c0010 a0002c0003 a0003c0005 a0004c0006 a0005c0007 a0006c0008 a0007c0009 a0008c0011 a0009c0012	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 others(14): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0002t0001 a0001c0004t0001 a0001c0010t0001 a0002c0003t0001 a0003c0005t0002 a0004c0006t0001 a0005c0007t0001 a0006c0008t0001 a0007c0009t0001 a0008c0011t0001 a0009c0012t0001	a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 others(333): Show a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0005 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chr15:85014909	c.186+32561C>T c.186+32561C>T	Total testosterone levels 0.0397313 Total testosterone levels 0.0397313	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0008 a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0008	a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0010 others(26): Show a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0010 a0001c0001t0001g0012 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0015 a0001c0001t0001g0017 a0001c0001t0001g0018 a0001c0001t0001g0019 a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0022 a0001c0001t0001g0023 a0001c0001t0001g0024 a0001c0001t0001g0025 a0001c0001t0001g0026 a0001c0001t0001g0027 a0001c0001t0001g0028 a0001c0001t0001g0029 a0001c0001t0001g0030 a0001c0001t0001g0031 a0001c0001t0001g0049 a0001c0001t0001g0053 a0001c0001t0001g0054 a0001c0001t0001g0055 a0001c0001t0001g0292 a0001c0001t0003g0011 a0001c0001t0003g0013 a0001c0001t0008g0016	HG00323.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG01069.hp2 others(26): Show HG00323.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG01069.hp2 HG01070.hp2 HG01099.hp1 HG01123.hp1 HG01167.hp2 HG01169.hp2 HG01175.hp2 HG01261.hp2 HG01516.hp1 HG01975.hp2 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG02683.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp2 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG03704.hp2 HG04204.hp2 NA18961.hp2 NA18966.hp2 NA18970.hp1 NA18978.hp2 NA19088.hp2 NA20752.hp2 NA20805.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	Using human genetics to understand the disease imp others(38): Show Using human genetics to understand the disease imp acts of testosterone in men and women.	230,454 European ancestry women/ 230,454 European ancestry women/	NR	PDE8A	rs12900736-C	+	MODIFIER	chr15	C C	T T
chr15:85116953	c.1536-688T>C c.1536-688T>C	Heel bone mineral density 0.0537914 Heel bone mineral density 0.0537914	a0001 a0006 a0001 a0006	a0001c0001 a0001c0002 a0006c0008 a0001c0001 a0001c0002 a0006c0008	a0001c0001t0001 a0001c0001t0004 a0001c0002t0001 a0006c0008t0001 a0001c0001t0001 a0001c0001t0004 a0001c0002t0001 a0006c0008t0001	a0001c0001t0001g0036 a0001c0001t0001g0166 a0001c0001t0001g0167 a0001c0001t0001g0177 a0001c0001t0001g0178 others(54): Show a0001c0001t0001g0036 a0001c0001t0001g0166 a0001c0001t0001g0167 a0001c0001t0001g0177 a0001c0001t0001g0178 a0001c0001t0001g0179 a0001c0001t0001g0180 a0001c0001t0001g0182 a0001c0001t0001g0183 a0001c0001t0001g0184 a0001c0001t0001g0185 a0001c0001t0001g0186 a0001c0001t0001g0187 a0001c0001t0001g0188 a0001c0001t0001g0189 a0001c0001t0001g0190 a0001c0001t0001g0276 a0001c0001t0001g0277 a0001c0001t0001g0278 a0001c0001t0001g0281 a0001c0001t0001g0282 a0001c0001t0001g0283 a0001c0001t0001g0284 a0001c0001t0001g0285 a0001c0001t0001g0286 a0001c0001t0001g0287 a0001c0001t0001g0288 a0001c0001t0001g0289 a0001c0001t0001g0290 a0001c0001t0001g0291 a0001c0001t0004g0062 a0001c0001t0004g0063 a0001c0002t0001g0297 a0001c0002t0001g0298 a0001c0002t0001g0299 a0001c0002t0001g0300 a0001c0002t0001g0301 a0001c0002t0001g0302 a0001c0002t0001g0303 a0001c0002t0001g0304 a0001c0002t0001g0305 a0001c0002t0001g0306 a0001c0002t0001g0307 a0001c0002t0001g0308 a0001c0002t0001g0309 a0001c0002t0001g0310 a0001c0002t0001g0311 a0001c0002t0001g0312 a0001c0002t0001g0313 a0001c0002t0001g0314 a0001c0002t0001g0315 a0001c0002t0001g0316 a0001c0002t0001g0317 a0001c0002t0001g0318 a0001c0002t0001g0319 a0001c0002t0001g0320 a0001c0002t0001g0344 a0006c0008t0001g0176 a0006c0008t0001g0181	HG01109.hp2 HG01243.hp2 HG01255.hp1 HG01346.hp2 HG01433.hp2 others(54): Show HG01109.hp2 HG01243.hp2 HG01255.hp1 HG01346.hp2 HG01433.hp2 HG01496.hp2 HG01884.hp1 HG01891.hp1 HG01891.hp2 HG02055.hp2 HG02109.hp2 HG02145.hp1 HG02258.hp2 HG02280.hp1 HG02280.hp2 HG02486.hp1 HG02559.hp1 HG02572.hp1 HG02622.hp2 HG02647.hp1 HG02647.hp2 HG02723.hp2 HG02809.hp1 HG02809.hp2 HG02818.hp1 HG02818.hp2 HG02886.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp1 HG02897.hp2 HG02922.hp1 HG02965.hp1 HG02970.hp2 HG02976.hp1 HG03041.hp1 HG03041.hp2 HG03130.hp1 HG03130.hp2 HG03225.hp1 HG03225.hp2 HG03453.hp2 HG03471.hp2 HG03516.hp2 HG03540.hp1 HG03540.hp2 HG04204.hp1 HG06807.hp1 NA18522.hp1 NA19030.hp2 NA19043.hp1 NA19043.hp2 NA19240.hp1 NA19240.hp2 NA20129.hp1 NA20129.hp2 NA20300.hp1 NA20905.hp2 NA21309.hp1 NA21309.hp2	Identification of 613 new loci associated with hee others(102): Show Identification of 613 new loci associated with hee l bone mineral density and a polygenic risk score for bone mineral density, osteoporosis and fractur e.	394,929 European ancestry individuals/ 394,929 European ancestry individuals/		PDE8A	rs7167692-?	+	MODIFIER	chr15	T T	C C
chr15:84997536	c.186+15188G>A c.186+15188G>A	Heel bone mineral density 0.0196378 Heel bone mineral density 0.0196378	a0001 a0009 a0001 a0009	a0001c0001 a0001c0004 a0009c0012 a0001c0001 a0001c0004 a0009c0012	a0001c0001t0001 a0001c0001t0005 a0001c0004t0001 a0009c0012t0001 a0001c0001t0001 a0001c0001t0005 a0001c0004t0001 a0009c0012t0001	a0001c0001t0001g0056 a0001c0001t0001g0060 a0001c0001t0001g0075 a0001c0001t0001g0077 a0001c0001t0001g0084 others(42): Show a0001c0001t0001g0056 a0001c0001t0001g0060 a0001c0001t0001g0075 a0001c0001t0001g0077 a0001c0001t0001g0084 a0001c0001t0001g0087 a0001c0001t0001g0088 a0001c0001t0001g0089 a0001c0001t0001g0090 a0001c0001t0001g0091 a0001c0001t0001g0092 a0001c0001t0001g0093 a0001c0001t0001g0094 a0001c0001t0001g0095 a0001c0001t0001g0096 a0001c0001t0001g0097 a0001c0001t0001g0098 a0001c0001t0001g0101 a0001c0001t0001g0102 a0001c0001t0001g0103 a0001c0001t0001g0106 a0001c0001t0001g0141 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0146 a0001c0001t0001g0147 a0001c0001t0001g0148 a0001c0001t0001g0149 a0001c0001t0001g0151 a0001c0001t0001g0153 a0001c0001t0001g0154 a0001c0001t0001g0161 a0001c0001t0001g0163 a0001c0001t0001g0164 a0001c0001t0001g0165 a0001c0001t0001g0169 a0001c0001t0001g0269 a0001c0001t0001g0280 a0001c0001t0001g0339 a0001c0001t0001g0340 a0001c0001t0001g0341 a0001c0001t0001g0342 a0001c0001t0005g0145 a0001c0001t0005g0150 a0001c0004t0001g0057 a0001c0004t0001g0064 a0001c0004t0001g0076 a0009c0012t0001g0078	HG00099.hp2 HG00558.hp2 HG00621.hp2 HG00639.hp1 HG00735.hp2 others(42): Show HG00099.hp2 HG00558.hp2 HG00621.hp2 HG00639.hp1 HG00735.hp2 HG01257.hp2 HG01261.hp1 HG01515.hp1 HG01516.hp2 HG01517.hp1 HG01978.hp2 HG02004.hp1 HG02027.hp2 HG02071.hp1 HG02148.hp1 HG02155.hp2 HG02738.hp2 HG03209.hp1 HG03490.hp2 HG03492.hp1 HG03669.hp2 HG03834.hp1 HG03927.hp2 NA18939.hp1 NA18941.hp2 NA18942.hp1 NA18948.hp1 NA18952.hp1 NA18969.hp2 NA18975.hp1 NA18978.hp1 NA18998.hp2 NA19001.hp1 NA19003.hp2 NA19009.hp1 NA19012.hp2 NA19054.hp2 NA19056.hp1 NA19067.hp1 NA19077.hp1 NA19079.hp1 NA19081.hp1 NA19086.hp1 NA19088.hp1 NA19090.hp1 NA19091.hp2 NA20805.hp2	Identification of 613 new loci associated with hee others(102): Show Identification of 613 new loci associated with hee l bone mineral density and a polygenic risk score for bone mineral density, osteoporosis and fractur e.	394,929 European ancestry individuals/ 394,929 European ancestry individuals/		PDE8A	rs6496586-?	+	MODIFIER	chr15	G G	A A
chr15:85062196	c.187-2174G>T c.187-2174G>T	Testicular germ cell tumor 1.17 Testicular germ cell tumor 1.17	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0002 a0001c0001 a0001c0002	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0008 a0001c0002t0001 a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0008 a0001c0002t0001	a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0010 others(65): Show a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0010 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0015 a0001c0001t0001g0017 a0001c0001t0001g0018 a0001c0001t0001g0019 a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0022 a0001c0001t0001g0023 a0001c0001t0001g0024 a0001c0001t0001g0025 a0001c0001t0001g0026 a0001c0001t0001g0027 a0001c0001t0001g0028 a0001c0001t0001g0029 a0001c0001t0001g0030 a0001c0001t0001g0031 a0001c0001t0001g0053 a0001c0001t0001g0054 a0001c0001t0001g0055 a0001c0001t0001g0075 a0001c0001t0001g0210 a0001c0001t0001g0292 a0001c0001t0001g0333 a0001c0001t0003g0011 a0001c0001t0003g0013 a0001c0001t0008g0016 a0001c0002t0001g0295 a0001c0002t0001g0296 a0001c0002t0001g0297 a0001c0002t0001g0298 a0001c0002t0001g0299 a0001c0002t0001g0300 a0001c0002t0001g0301 a0001c0002t0001g0302 a0001c0002t0001g0303 a0001c0002t0001g0304 a0001c0002t0001g0305 a0001c0002t0001g0306 a0001c0002t0001g0307 a0001c0002t0001g0308 a0001c0002t0001g0309 a0001c0002t0001g0310 a0001c0002t0001g0311 a0001c0002t0001g0312 a0001c0002t0001g0313 a0001c0002t0001g0314 a0001c0002t0001g0315 a0001c0002t0001g0316 a0001c0002t0001g0317 a0001c0002t0001g0318 a0001c0002t0001g0319 a0001c0002t0001g0320 a0001c0002t0001g0321 a0001c0002t0001g0322 a0001c0002t0001g0323 a0001c0002t0001g0324 a0001c0002t0001g0325 a0001c0002t0001g0326 a0001c0002t0001g0327 a0001c0002t0001g0328 a0001c0002t0001g0329 a0001c0002t0001g0330 a0001c0002t0001g0331 a0001c0002t0001g0344	HG00323.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG01069.hp2 others(65): Show HG00323.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG01069.hp2 HG01070.hp2 HG01123.hp1 HG01167.hp2 HG01169.hp2 HG01175.hp2 HG01255.hp1 HG01261.hp2 HG01346.hp1 HG01346.hp2 HG01433.hp2 HG01516.hp1 HG01884.hp1 HG01891.hp1 HG01975.hp2 HG02004.hp1 HG02109.hp1 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG02145.hp2 HG02280.hp2 HG02486.hp1 HG02559.hp1 HG02572.hp1 HG02572.hp2 HG02622.hp2 HG02630.hp1 HG02647.hp1 HG02683.hp1 HG02717.hp1 HG02723.hp2 HG02818.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp2 HG02922.hp1 HG02965.hp1 HG02965.hp2 HG02970.hp2 HG02976.hp1 HG02976.hp2 HG03041.hp2 HG03098.hp1 HG03130.hp1 HG03139.hp2 HG03209.hp2 HG03225.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp2 HG03516.hp1 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG04204.hp2 NA18961.hp2 NA18966.hp2 NA18970.hp1 NA18978.hp2 NA19030.hp1 NA19043.hp2 NA19088.hp2 NA19240.hp2 NA20129.hp1 NA20300.hp1 NA20300.hp2 NA20752.hp2 NA20805.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	Identification of 19 new risk loci and potential r others(78): Show Identification of 19 new risk loci and potential r egulatory mechanisms influencing susceptibility to testicular germ cell tumor.	5,518 European ancestry cases, 19,055 European anc others(78): Show 5,518 European ancestry cases, 19,055 European anc estry controls/1,801 European ancestry cases, 4,02 7 European ancestry controls	SLC28A1, PDE8A	PDE8A	rs56046484-G	+	MODIFIER	chr15	G G	T T
chr15:85143096	c.5193A>G c.5193A>G	Extensive white matter perivascular space burden others(8): Show Extensive white matter perivascular space burden	a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 others(4): Show a0001 a0002 a0003 a0004 a0005 a0006 a0007 a0008 a0009	a0001c0001 a0001c0002 a0001c0004 a0001c0010 a0002c0003 others(7): Show a0001c0001 a0001c0002 a0001c0004 a0001c0010 a0002c0003 a0003c0005 a0004c0006 a0005c0007 a0006c0008 a0007c0009 a0008c0011 a0009c0012	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 others(13): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0002t0001 a0001c0004t0001 a0001c0010t0001 a0002c0003t0001 a0003c0005t0002 a0004c0006t0001 a0005c0007t0001 a0006c0008t0001 a0007c0009t0001 a0008c0011t0001 a0009c0012t0001	a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0009 a0001c0001t0001g0012 others(300): Show a0001c0001t0001g0001 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chr15:84978503	c.-3660G>C c.-3660G>C	Height (standard GWA) 0.14673 Height (standard GWA) 0.14673	a0001 a0003 a0001 a0003	a0001c0001 a0001c0002 a0003c0005 a0001c0001 a0001c0002 a0003c0005	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0002t0001 others(1): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0002t0001 a0003c0005t0002	a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0009 others(57): Show a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0009 a0001c0001t0001g0010 a0001c0001t0001g0012 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0015 a0001c0001t0001g0017 a0001c0001t0001g0018 a0001c0001t0001g0019 a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0022 a0001c0001t0001g0023 a0001c0001t0001g0024 a0001c0001t0001g0025 a0001c0001t0001g0026 a0001c0001t0001g0027 a0001c0001t0001g0028 a0001c0001t0001g0029 a0001c0001t0001g0030 a0001c0001t0001g0031 a0001c0001t0001g0038 a0001c0001t0001g0047 a0001c0001t0001g0048 a0001c0001t0001g0276 a0001c0001t0001g0277 a0001c0001t0001g0278 a0001c0001t0003g0011 a0001c0001t0003g0013 a0001c0001t0007g0037 a0001c0001t0008g0016 a0001c0002t0001g0297 a0001c0002t0001g0298 a0001c0002t0001g0299 a0001c0002t0001g0300 a0001c0002t0001g0301 a0001c0002t0001g0302 a0001c0002t0001g0303 a0001c0002t0001g0304 a0001c0002t0001g0305 a0001c0002t0001g0306 a0001c0002t0001g0307 a0001c0002t0001g0308 a0001c0002t0001g0309 a0001c0002t0001g0310 a0001c0002t0001g0311 a0001c0002t0001g0312 a0001c0002t0001g0313 a0001c0002t0001g0314 a0001c0002t0001g0315 a0001c0002t0001g0316 a0001c0002t0001g0317 a0001c0002t0001g0318 a0001c0002t0001g0319 a0001c0002t0001g0320 a0001c0002t0001g0344 a0003c0005t0002g0032 a0003c0005t0002g0033 a0003c0005t0002g0034	HG00323.hp1 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG01070.hp2 HG01099.hp1 others(57): Show HG00323.hp1 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG01070.hp2 HG01099.hp1 HG01123.hp1 HG01167.hp2 HG01169.hp2 HG01175.hp2 HG01243.hp1 HG01255.hp1 HG01261.hp2 HG01346.hp2 HG01433.hp2 HG01516.hp1 HG01884.hp1 HG01891.hp1 HG01928.hp1 HG01952.hp2 HG02055.hp2 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG02280.hp2 HG02486.hp1 HG02559.hp1 HG02572.hp1 HG02615.hp2 HG02622.hp1 HG02622.hp2 HG02647.hp1 HG02723.hp2 HG02818.hp1 HG02886.hp2 HG02922.hp1 HG02922.hp2 HG02965.hp1 HG02970.hp2 HG02976.hp1 HG03041.hp2 HG03130.hp1 HG03130.hp2 HG03225.hp1 HG03239.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp2 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG04204.hp2 NA18906.hp2 NA18961.hp2 NA18966.hp2 NA18970.hp1 NA18978.hp2 NA19043.hp1 NA19043.hp2 NA19088.hp2 NA19240.hp2 NA20129.hp1 NA20300.hp1 NA20752.hp2 NA20805.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	Participation bias in the UK Biobank distorts gene others(41): Show Participation bias in the UK Biobank distorts gene tic associations and downstream analyses.	283,749 European ancestry individuals/ 283,749 European ancestry individuals/		SLC28A1 - PDE8A	rs7173332-C	+	MODIFIER	chr15	G G	C C
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chr15:85014909	c.186+32561C>T c.186+32561C>T	Testosterone levels 6.402 Testosterone levels 6.402	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0008 a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0008	a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0010 others(26): Show a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0010 a0001c0001t0001g0012 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0015 a0001c0001t0001g0017 a0001c0001t0001g0018 a0001c0001t0001g0019 a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0022 a0001c0001t0001g0023 a0001c0001t0001g0024 a0001c0001t0001g0025 a0001c0001t0001g0026 a0001c0001t0001g0027 a0001c0001t0001g0028 a0001c0001t0001g0029 a0001c0001t0001g0030 a0001c0001t0001g0031 a0001c0001t0001g0049 a0001c0001t0001g0053 a0001c0001t0001g0054 a0001c0001t0001g0055 a0001c0001t0001g0292 a0001c0001t0003g0011 a0001c0001t0003g0013 a0001c0001t0008g0016	HG00323.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG01069.hp2 others(26): Show HG00323.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG01069.hp2 HG01070.hp2 HG01099.hp1 HG01123.hp1 HG01167.hp2 HG01169.hp2 HG01175.hp2 HG01261.hp2 HG01516.hp1 HG01975.hp2 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG02683.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp2 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG03704.hp2 HG04204.hp2 NA18961.hp2 NA18966.hp2 NA18970.hp1 NA18978.hp2 NA19088.hp2 NA20752.hp2 NA20805.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	Cross-ancestry genome-wide association studies of others(60): Show Cross-ancestry genome-wide association studies of sex hormone concentrations in pre- and postmenopau sal women.	4,229 African ancestry individuals, 182,648 Europe others(24): Show 4,229 African ancestry individuals, 182,648 Europe an ancestry individuals/		PDE8A	rs12900736-?	+	MODIFIER	chr15	C C	T T
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chr15:84987540	c.186+5192C>T c.186+5192C>T	Kidney stone disease 1.13 Kidney stone disease 1.13	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0008 a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0008	a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0009 others(25): Show a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0009 a0001c0001t0001g0010 a0001c0001t0001g0012 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0015 a0001c0001t0001g0017 a0001c0001t0001g0018 a0001c0001t0001g0019 a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0022 a0001c0001t0001g0023 a0001c0001t0001g0024 a0001c0001t0001g0025 a0001c0001t0001g0026 a0001c0001t0001g0027 a0001c0001t0001g0028 a0001c0001t0001g0029 a0001c0001t0001g0030 a0001c0001t0001g0031 a0001c0001t0001g0047 a0001c0001t0001g0048 a0001c0001t0001g0049 a0001c0001t0003g0011 a0001c0001t0003g0013 a0001c0001t0008g0016	HG00323.hp1 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG01070.hp2 HG01099.hp1 others(25): Show HG00323.hp1 HG00642.hp1 HG00741.hp1 HG01070.hp2 HG01099.hp1 HG01123.hp1 HG01167.hp2 HG01169.hp2 HG01175.hp2 HG01261.hp2 HG01516.hp1 HG01928.hp1 HG01952.hp2 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG03239.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp2 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG03704.hp2 HG04204.hp2 NA18961.hp2 NA18966.hp2 NA18970.hp1 NA18978.hp2 NA19088.hp2 NA20752.hp2 NA20805.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	Central Adiposity Increases Risk of Kidney Stone D others(51): Show Central Adiposity Increases Risk of Kidney Stone D isease via Effects on Serum Calcium Concentrations .	17,101 European ancestry cases, 721,947 European a others(17): Show 17,101 European ancestry cases, 721,947 European a ncestry controls/		PDE8A	rs71397835-T	+	MODIFIER	chr15	C C	T T
chr15:84977098	c.-5065C>G c.-5065C>G	Kidney stone disease 1.13 Kidney stone disease 1.13	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0008 a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0008	a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0009 others(27): Show a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0006 a0001c0001t0001g0007 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0009 a0001c0001t0001g0010 a0001c0001t0001g0012 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0015 a0001c0001t0001g0017 a0001c0001t0001g0018 a0001c0001t0001g0019 a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0022 a0001c0001t0001g0023 a0001c0001t0001g0024 a0001c0001t0001g0025 a0001c0001t0001g0026 a0001c0001t0001g0027 a0001c0001t0001g0028 a0001c0001t0001g0029 a0001c0001t0001g0030 a0001c0001t0001g0031 a0001c0001t0001g0047 a0001c0001t0001g0048 a0001c0001t0001g0055 a0001c0001t0001g0239 a0001c0001t0001g0241 a0001c0001t0003g0011 a0001c0001t0003g0013 a0001c0001t0008g0016	HG00323.hp1 HG00642.hp1 HG00673.hp1 HG00741.hp1 HG01069.hp2 others(27): Show HG00323.hp1 HG00642.hp1 HG00673.hp1 HG00741.hp1 HG01069.hp2 HG01070.hp2 HG01099.hp1 HG01123.hp1 HG01167.hp2 HG01169.hp2 HG01175.hp2 HG01261.hp2 HG01516.hp1 HG01928.hp1 HG01952.hp2 HG02071.hp2 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG03239.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp2 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG04204.hp2 NA18961.hp2 NA18966.hp2 NA18970.hp1 NA18978.hp2 NA19088.hp2 NA20752.hp2 NA20805.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	Central Adiposity Increases Risk of Kidney Stone D others(51): Show Central Adiposity Increases Risk of Kidney Stone D isease via Effects on Serum Calcium Concentrations .	8,504 European ancestry cases, 388,819 European an others(16): Show 8,504 European ancestry cases, 388,819 European an cestry controls/		SLC28A1 - PDE8A	rs12439802-G	+	MODIFIER	chr15	C C	G G
chr15:85137301	c.2384-496C>A c.2384-496C>A	Pulse pressure 0.12513694 Pulse pressure 0.12513694	a0001 a0002 a0003 a0005 a0006 others(1): Show a0001 a0002 a0003 a0005 a0006 a0008	a0001c0001 a0001c0002 a0002c0003 a0003c0005 a0005c0007 others(2): Show a0001c0001 a0001c0002 a0002c0003 a0003c0005 a0005c0007 a0006c0008 a0008c0011	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 a0001c0002t0001 others(5): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 a0001c0002t0001 a0002c0003t0001 a0003c0005t0002 a0005c0007t0001 a0006c0008t0001 a0008c0011t0001	a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0035 a0001c0001t0001g0036 a0001c0001t0001g0047 a0001c0001t0001g0048 others(165): Show a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0035 a0001c0001t0001g0036 a0001c0001t0001g0047 a0001c0001t0001g0048 a0001c0001t0001g0065 a0001c0001t0001g0066 a0001c0001t0001g0091 a0001c0001t0001g0110 a0001c0001t0001g0144 a0001c0001t0001g0166 a0001c0001t0001g0167 a0001c0001t0001g0172 a0001c0001t0001g0177 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others(68): Show Discovery of rare variants associated with blood p ressure regulation through meta-analysis of 1.3 mi llion individuals.	810,865 European ancestry individuals, 21,077 Afri others(94): Show 810,865 European ancestry individuals, 21,077 Afri can American individuals, 33,689 South Asian ances try individuals, 4,586 Hispanic individuals/		PDE8A	rs8032301-T	+	MODIFIER	chr15	T T	C C
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chr15:85130465	c.2253+4091A>G c.2253+4091A>G	Psoriasis 1.053 Psoriasis 1.053	a0001 a0002 a0004 a0005 a0006 others(1): Show a0001 a0002 a0004 a0005 a0006 a0008	a0001c0001 a0001c0010 a0002c0003 a0004c0006 a0005c0007 others(2): Show a0001c0001 a0001c0010 a0002c0003 a0004c0006 a0005c0007 a0006c0008 a0008c0011	a0001c0001t0001 a0001c0001t0004 a0001c0010t0001 a0002c0003t0001 a0004c0006t0001 others(3): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0004 a0001c0010t0001 a0002c0003t0001 a0004c0006t0001 a0005c0007t0001 a0006c0008t0001 a0008c0011t0001	a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0009 a0001c0001t0001g0012 a0001c0001t0001g0035 a0001c0001t0001g0036 others(137): Show a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0009 a0001c0001t0001g0012 a0001c0001t0001g0035 a0001c0001t0001g0036 a0001c0001t0001g0038 a0001c0001t0001g0047 a0001c0001t0001g0048 a0001c0001t0001g0049 a0001c0001t0001g0050 a0001c0001t0001g0051 a0001c0001t0001g0052 a0001c0001t0001g0065 a0001c0001t0001g0066 a0001c0001t0001g0079 a0001c0001t0001g0080 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chr15:85006491	c.186+24143C>T c.186+24143C>T	Putamen iron levels (R2* MRI) 0.04059 Putamen iron levels (R2* MRI) 0.04059	a0001 a0004 a0007 a0009 a0001 a0004 a0007 a0009	a0001c0001 a0001c0004 a0001c0010 a0004c0006 a0007c0009 others(1): Show a0001c0001 a0001c0004 a0001c0010 a0004c0006 a0007c0009 a0009c0012	a0001c0001t0001 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 a0001c0004t0001 a0001c0010t0001 others(3): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 a0001c0004t0001 a0001c0010t0001 a0004c0006t0001 a0007c0009t0001 a0009c0012t0001	a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0009 a0001c0001t0001g0049 a0001c0001t0001g0050 a0001c0001t0001g0051 others(125): Show a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0009 a0001c0001t0001g0049 a0001c0001t0001g0050 a0001c0001t0001g0051 a0001c0001t0001g0052 a0001c0001t0001g0056 a0001c0001t0001g0058 a0001c0001t0001g0059 a0001c0001t0001g0060 a0001c0001t0001g0061 a0001c0001t0001g0065 a0001c0001t0001g0066 a0001c0001t0001g0067 a0001c0001t0001g0068 a0001c0001t0001g0069 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chr15:85137301	c.2384-496C>A c.2384-496C>A	Systolic blood pressure 0.2673 Systolic blood pressure 0.2673	a0001 a0002 a0003 a0005 a0006 others(1): Show a0001 a0002 a0003 a0005 a0006 a0008	a0001c0001 a0001c0002 a0002c0003 a0003c0005 a0005c0007 others(2): Show a0001c0001 a0001c0002 a0002c0003 a0003c0005 a0005c0007 a0006c0008 a0008c0011	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 a0001c0002t0001 others(5): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 a0001c0002t0001 a0002c0003t0001 a0003c0005t0002 a0005c0007t0001 a0006c0008t0001 a0008c0011t0001	a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0035 a0001c0001t0001g0036 a0001c0001t0001g0047 a0001c0001t0001g0048 others(165): Show a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0035 a0001c0001t0001g0036 a0001c0001t0001g0047 a0001c0001t0001g0048 a0001c0001t0001g0065 a0001c0001t0001g0066 a0001c0001t0001g0091 a0001c0001t0001g0110 a0001c0001t0001g0144 a0001c0001t0001g0166 a0001c0001t0001g0167 a0001c0001t0001g0172 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🧬 Gene Summary

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AAmino-acid (protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

📊 HaplotypeQTL Info

⚡ Splicing Related Variants (Total: 42)

🩺 Clinvar Related Variants (Total: 0)

GWASCatalog Related Variants (Total: 49)

GTEx Related Variants (Page 1 of 20 - Total: 1986)