Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chrX:101148092	A A	G G	1	a0001c0009 a0001c0009	1	HG02559.hp2 HG02559.hp2	synonymous_variant	LOW	c.2025A>G c.2025A>G	p.Glu675Glu p.Glu675Glu	CENPI	ENSG00000102384.14	transcript	ENST00000682095.1	protein_coding	20/22	2179/5584	2025/2271	675/756	chrX	101148092

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chrX:101162733	A A	G G	15	a0001c0001t0001g0171 a0001c0001t0003g0004 a0001c0001t0003g0139 others(12): Show a0001c0001t0001g0171 a0001c0001t0003g0004 a0001c0001t0003g0139 a0001c0001t0003g0140 a0001c0001t0003g0141 a0001c0001t0003g0142 a0001c0001t0003g0143 a0001c0001t0003g0148 a0001c0001t0003g0158 a0001c0001t0003g0159 a0001c0001t0003g0178 a0001c0001t0003g0179 a0001c0001t0003g0180 a0001c0001t0019g0004 a0003c0004t0003g0144	15	HG00597.hp2 HG01934.hp1 HG01978.hp2 others(12): Show HG00597.hp2 HG01934.hp1 HG01978.hp2 HG02129.hp1 NA18612.hp1 NA18747.hp1 NA18948.hp1 NA18957.hp2 NA18959.hp1 NA18979.hp2 NA18980.hp1 NA18989.hp1 NA19002.hp1 NA19005.hp1 NA20300.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.2137-100A>G c.2137-100A>G	CENPI	ENSG00000102384.14	transcript	ENST00000682095.1	protein_coding	21/21		chrX	101162733
chrX:101162737	G G	A A	1	a0001c0001t0004g0136 a0001c0001t0004g0136	1	HG03669.hp2 HG03669.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.2137-96G>A c.2137-96G>A	CENPI	ENSG00000102384.14	transcript	ENST00000682095.1	protein_coding	21/21		chrX	101162737
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chrX:101162827	C C	T T	1	a0001c0002t0002g0243 a0001c0002t0002g0243	1	HG02080.hp1 HG02080.hp1	splice_region_variant&intron_variant	LOW	c.2137-6C>T c.2137-6C>T	CENPI	ENSG00000102384.14	transcript	ENST00000682095.1	protein_coding	21/21		chrX	101162827

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JoGo Online Haplotype Explorer CENPI_chrX_101093204_101171126

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 6)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 9)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 34)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 275)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 9)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 41)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 277)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 282)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 5)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 3)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 36)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 928)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)