Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr12:51270066	C C	T T	1	a0001c0001t0001g0017 a0001c0001t0001g0017	1	HG04204.hp1 HG04204.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.-39+190G>A c.-39+190G>A	SMAGP	ENSG00000170545.17	transcript	ENST00000603798.6	protein_coding	1/3	chr12	51270066

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JoGo Online Haplotype Explorer SMAGP_chr12_51239558_51275415

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 3)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 34)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 393)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 3)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 35)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 393)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 410)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 21)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 450)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)