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chr1:62816930	A A	G G	1	a0001c0001t0011g0235 a0001c0001t0011g0235	1	HG02647.hp2 HG02647.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.394+122A>G c.394+122A>G	ATG4C	ENSG00000125703.15	transcript	ENST00000317868.9	protein_coding	4/10		chr1	62816930
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chr1:62821092	A A	G G	2	a0001c0001t0001g0013 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0013 a0001c0001t0001g0014	2	NA18965.hp2 NA18968.hp1 NA18965.hp2 NA18968.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.726-47A>G c.726-47A>G	ATG4C	ENSG00000125703.15	transcript	ENST00000317868.9	protein_coding	5/10		chr1	62821092
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JoGo Online Haplotype Explorer ATG4C_chr1_62779132_62870516

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🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 4)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 7)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 12)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 307)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 7)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 18)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 307)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 322)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 3)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 3)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 14)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 884)

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Annotation (SNP Array)