Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr2:171983081	G G	T T	32	a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0071 a0001c0001t0001g0270 others(29): Show a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0071 a0001c0001t0001g0270 a0001c0001t0001g0271 a0001c0001t0001g0272 a0001c0001t0001g0273 a0001c0001t0001g0288 a0001c0001t0001g0289 a0001c0001t0001g0290 a0001c0001t0001g0291 a0001c0001t0001g0292 a0001c0001t0001g0293 a0001c0001t0001g0294 a0001c0001t0001g0295 a0001c0001t0001g0296 a0001c0001t0001g0297 a0001c0001t0001g0298 a0001c0001t0001g0299 a0001c0001t0001g0300 a0001c0001t0001g0301 a0001c0001t0001g0302 a0001c0001t0001g0303 a0001c0001t0001g0304 a0001c0001t0001g0305 a0001c0001t0001g0306 a0001c0001t0001g0307 a0001c0001t0001g0308 a0001c0001t0001g0309 a0001c0001t0001g0311 a0001c0001t0001g0323 a0001c0001t0001g0324 a0001c0001t0001g0325	33	HG00140.hp2 HG00323.hp2 HG00733.hp2 others(30): Show HG00140.hp2 HG00323.hp2 HG00733.hp2 HG01361.hp1 HG01934.hp1 HG01943.hp1 HG01978.hp1 HG01981.hp1 HG02004.hp2 HG02040.hp2 HG02698.hp1 HG02818.hp1 HG03490.hp2 HG03492.hp2 HG03704.hp1 HG03710.hp2 HG03834.hp2 HG04204.hp2 HG04228.hp2 NA18959.hp1 NA18960.hp1 NA18964.hp1 NA18974.hp1 NA18985.hp2 NA18990.hp1 NA19003.hp2 NA19056.hp1 NA19057.hp1 NA19060.hp2 NA19080.hp1 NA19084.hp1 NA19085.hp2 NA20905.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.1093-104G>T c.1093-104G>T	HAT1	ENSG00000128708.13	transcript	ENST00000264108.5	protein_coding	10/10		chr2	171983081

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 2)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 1)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 325)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 2)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 2)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 325)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 326)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 0)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 0)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 819)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)