Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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JoGo Online Haplotype Explorer PAX8_chr2_113210997_113283921

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 4)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 10)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 38)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 254)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 10)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 47)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 254)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 300)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 3)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 6)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 26)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 711)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)