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ALDH2_chr12_111761933_111822532 / BRCA1_chr17_43039295_43130364 etc.

  Error connecting to IGV?   RSPO3_chr6_127113671_127204481  RSPO3_chr6_127113671_127204481 (clean+top1000)

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NA19030 hp1 a0001 c0001 t0003 g0249 AFR LWK RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19030 hp2 a0001 c0002 t0017 g0238 AFR LWK RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19043 hp1 a0001 c0001 t0016 g0115 AFR LWK RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19043 hp2 a0001 c0002 t0001 g0199 AFR LWK RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19056 hp1 a0001 c0001 t0002 g0002 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19056 hp2 a0001 c0002 t0001 g0004 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19058 hp1 a0001 c0001 t0002 g0094 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19058 hp2 a0001 c0002 t0001 g0004 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19060 hp1 a0001 c0001 t0002 g0096 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19060 hp2 a0001 c0002 t0001 g0226 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19062 hp1 a0001 c0001 t0002 g0120 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19062 hp2 a0001 c0002 t0001 g0233 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19078 hp1 a0001 c0002 t0001 g0227 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19078 hp2 a0001 c0001 t0002 g0052 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19080 hp1 a0001 c0002 t0001 g0001 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19080 hp2 a0001 c0001 t0002 g0080 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19081 hp1 a0001 c0002 t0001 g0189 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19081 hp2 a0001 c0001 t0002 g0092 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19084 hp1 a0001 c0002 t0001 g0221 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19084 hp2 a0001 c0001 t0002 g0073 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19087 hp1 a0001 c0002 t0001 g0035 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19087 hp2 a0001 c0002 t0001 g0041 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19091 hp1 a0001 c0001 t0002 g0103 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19091 hp2 a0001 c0002 t0009 g0001 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19240 hp1 a0001 c0001 t0005 g0154 AFR YRI RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA19240 hp2 a0001 c0002 t0001 g0183 AFR YRI RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA20129 hp1 a0001 c0001 t0007 g0147 AFR ASW RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA20129 hp2 a0001 c0001 t0011 g0258 AFR ASW RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA20752 hp1 a0001 c0001 t0002 g0002 EUR TSI RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA20752 hp2 a0001 c0002 t0001 g0231 EUR TSI RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA20805 hp1 a0001 c0002 t0001 g0174 EUR TSI RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA20805 hp2 a0001 c0001 t0002 g0148 EUR TSI RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
HG02109 hp1 a0001 c0001 t0003 g0250 AFR ACB RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
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HG02486 hp1 a0001 c0001 t0010 g0063 AFR ACB RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
HG02486 hp2 a0001 c0002 t0001 g0158 AFR ACB RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
HG02559 hp1 a0001 c0002 t0001 g0010 AFR ACB RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
HG02559 hp2 a0001 c0001 t0006 g0021 AFR ACB RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
HG03471 hp1 a0001 c0001 t0003 g0043 AFR MSL RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
HG03471 hp2 a0001 c0001 t0003 g0254 AFR MSL RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
HG06807 hp1 a0001 c0001 t0003 g0145 AFR USA RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
HG06807 hp2 a0001 c0001 t0002 g0017 AFR USA RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA18955 hp1 a0001 c0002 t0001 g0160 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA18955 hp2 a0001 c0001 t0002 g0089 EAS JPT RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA21309 hp1 a0001 c0002 t0001 g0030 AFR LWK RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
NA21309 hp2 a0001 c0002 t0004 g0205 AFR LWK RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
homoSapiens_chm13v2 hp1 a0001 c0001 t0002 g0086 REF REF RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481
homoSapiens_grch38 hp1 a0001 c0002 t0001 g0175 REF REF RSPO3_chr6_127113671_127204481 RSPO3 chr6 127113671 127204481

chr:pos ref alt #
# of ahapid:amino-acid(protein) level
 ahapids #
# of haplotypeids
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cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
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G
 A
A
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a0002
 1 HG03453.hp1
HG03453.hp1
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c.109G>A
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p.Val37Ile
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chr:pos ref alt #
# of chapid
 chapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr6:127148661 T
T
 C
C
 1 a0001c0004
a0001c0004
 1 HG03486.hp2
HG03486.hp2
 synonymous_variant LOW c.111T>C
c.111T>C
 p.Val37Val
p.Val37Val
 RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 2/5 633/4815 111/819 37/272 chr6 127148661
chr6:127155371 G
G
 A
A
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a0001c0004
a0002c0003
a0001c0001
a0001c0004
a0002c0003
 167 HG00280.hp1
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HG00323.hp1
HG00408.hp1
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 synonymous_variant LOW c.567G>A
c.567G>A
 p.Leu189Leu
p.Leu189Leu
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chr:pos ref alt #
# of thapid:transcript level
 thapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr6:127118688 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0015
a0001c0002t0015
 1 NA19012.hp2
NA19012.hp2
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-505T>C
c.-505T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/5 505 chr6 127118688
chr6:127118748 C
C
 G
G
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a0001c0002t0026
a0001c0002t0004
a0001c0002t0026
 14 HG00639.hp2
HG01069.hp2
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others(11): Show 
HG00639.hp2
HG01069.hp2
HG01081.hp2
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NA21309.hp2
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c.-445C>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/5 445 chr6 127118748
chr6:127118752 G
G
 C
C
 2 a0001c0001t0010
a0001c0001t0012
a0001c0001t0010
a0001c0001t0012
 5 HG01071.hp2
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others(2): Show 
HG01071.hp2
HG01168.hp1
HG01243.hp2
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c.-441G>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/5 441 chr6 127118752
chr6:127118902 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0012
a0001c0001t0012
 2 HG01243.hp2
HG02145.hp1
HG01243.hp2
HG02145.hp1
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-291T>C
c.-291T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/5 291 chr6 127118902
chr6:127118994 A
A
 T
T
 1 a0001c0002t0025
a0001c0002t0025
 1 NA19006.hp2
NA19006.hp2
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-199A>T
c.-199A>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/5 199 chr6 127118994
chr6:127196121 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0009
a0001c0002t0009
 4 NA18947.hp1
NA18966.hp2
NA18991.hp2
others(1): Show 
NA18947.hp1
NA18966.hp2
NA18991.hp2
NA19091.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*114A>G
c.*114A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 114 chr6 127196121
chr6:127196309 A
A
 T
T
 1 a0001c0002t0024
a0001c0002t0024
 1 HG01496.hp2
HG01496.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*302A>T
c.*302A>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 302 chr6 127196309
chr6:127196560 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0023
a0001c0002t0023
 1 HG02976.hp2
HG02976.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*553C>T
c.*553C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 553 chr6 127196560
chr6:127196638 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0016
a0001c0001t0016
 1 NA19043.hp1
NA19043.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*631T>C
c.*631T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 631 chr6 127196638
chr6:127196974 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0014
a0001c0001t0022
a0001c0001t0014
a0001c0001t0022
 3 HG01884.hp2
HG02257.hp1
HG02615.hp2
HG01884.hp2
HG02257.hp1
HG02615.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*967C>T
c.*967C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 967 chr6 127196974
chr6:127197235 T
T
 G
G
 1 a0001c0002t0017
a0001c0002t0017
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1228T>G
c.*1228T>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 1228 chr6 127197235
chr6:127197451 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0013
a0001c0001t0013
 2 NA18945.hp1
NA18950.hp1
NA18945.hp1
NA18950.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1444G>C
c.*1444G>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 1444 chr6 127197451
chr6:127197669 G
G
 T
T
 1 a0001c0002t0017
a0001c0002t0017
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1662G>T
c.*1662G>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 1662 chr6 127197669
chr6:127197785 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0018
a0001c0001t0018
 1 HG01515.hp1
HG01515.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1778G>A
c.*1778G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 1778 chr6 127197785
chr6:127197870 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0008
a0001c0001t0008
 6 HG00735.hp1
HG02083.hp1
HG03017.hp2
others(3): Show 
HG00735.hp1
HG02083.hp1
HG03017.hp2
HG03834.hp1
HG04204.hp1
NA18522.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1863C>G
c.*1863C>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 1863 chr6 127197870
chr6:127197918 T
T
 A
A
 1 a0001c0002t0017
a0001c0002t0017
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1911T>A
c.*1911T>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 1911 chr6 127197918
chr6:127198089 C
C
 A
A
 6 a0001c0001t0002
a0001c0001t0010
a0001c0001t0012
others(3): Show 
a0001c0001t0002
a0001c0001t0010
a0001c0001t0012
a0001c0001t0013
a0001c0001t0018
a0001c0001t0019
 115 HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
others(112): Show 
HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
HG00423.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp2
HG00597.hp1
HG00609.hp2
HG00621.hp1
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HG01071.hp2
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HG01109.hp1
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HG01978.hp2
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HG02615.hp1
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HG02735.hp2
HG02818.hp2
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HG02976.hp1
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HG03139.hp1
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HG03669.hp1
HG03834.hp2
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HG04184.hp2
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HG04228.hp1
HG06807.hp2
NA18522.hp1
NA18612.hp1
NA18747.hp2
NA18941.hp1
NA18942.hp2
NA18945.hp1
NA18948.hp1
NA18949.hp1
NA18950.hp1
NA18951.hp1
NA18953.hp1
NA18955.hp2
NA18956.hp1
NA18960.hp1
NA18960.hp2
NA18966.hp1
NA18969.hp2
NA18970.hp2
NA18975.hp1
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NA18980.hp1
NA18982.hp1
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NA18990.hp2
NA18999.hp2
NA19002.hp1
NA19003.hp1
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NA19056.hp1
NA19058.hp1
NA19060.hp1
NA19062.hp1
NA19078.hp2
NA19080.hp2
NA19081.hp2
NA19084.hp2
NA19091.hp1
NA20752.hp1
NA20805.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2082C>A
c.*2082C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 2082 chr6 127198089
chr6:127198115 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0019
a0001c0001t0019
 1 HG01496.hp1
HG01496.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2108G>A
c.*2108G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 2108 chr6 127198115
chr6:127198523 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0020
a0001c0001t0020
 1 HG02630.hp2
HG02630.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2516T>C
c.*2516T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 2516 chr6 127198523
chr6:127198577 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0011
a0001c0001t0011
 3 HG02145.hp2
HG02630.hp1
NA20129.hp2
HG02145.hp2
HG02630.hp1
NA20129.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2570C>T
c.*2570C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 2570 chr6 127198577
chr6:127198928 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0007
a0001c0002t0026
a0001c0001t0007
a0001c0002t0026
 7 HG00639.hp1
HG00639.hp2
HG00741.hp2
others(4): Show 
HG00639.hp1
HG00639.hp2
HG00741.hp2
HG01257.hp1
HG01516.hp1
HG02886.hp1
NA20129.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2921C>T
c.*2921C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 2921 chr6 127198928
chr6:127198988 T
T
 TA
TA
 7 a0001c0001t0003
a0001c0001t0011
a0001c0001t0016
others(4): Show 
a0001c0001t0003
a0001c0001t0011
a0001c0001t0016
a0001c0002t0003
a0001c0002t0017
a0001c0004t0003
a0002c0003t0003
 18 HG01891.hp2
HG02109.hp1
HG02145.hp2
others(15): Show 
HG01891.hp2
HG02109.hp1
HG02145.hp2
HG02630.hp1
HG02647.hp1
HG02895.hp1
HG03195.hp2
HG03453.hp1
HG03471.hp1
HG03471.hp2
HG03486.hp2
HG03540.hp2
HG06807.hp1
NA18906.hp1
NA19030.hp1
NA19030.hp2
NA19043.hp1
NA20129.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2984dupA
c.*2984dupA
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 2985 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127198988
chr6:127199004 A
A
 T
T
 1 a0001c0002t0021
a0001c0002t0021
 1 NA18950.hp2
NA18950.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2997A>T
c.*2997A>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 2997 chr6 127199004
chr6:127199133 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0017
a0001c0002t0017
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*3126A>G
c.*3126A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 3126 chr6 127199133
chr6:127199372 ATG
ATG
 A
A
 3 a0001c0001t0006
a0001c0001t0014
a0001c0001t0020
a0001c0001t0006
a0001c0001t0014
a0001c0001t0020
 9 HG02055.hp1
HG02257.hp1
HG02559.hp2
others(6): Show 
HG02055.hp1
HG02257.hp1
HG02559.hp2
HG02615.hp2
HG02630.hp2
HG02896.hp2
HG02922.hp1
HG03139.hp2
HG03579.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*3368_*3369delTG
c.*3368_*3369delTG
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 3368 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127199372
chr6:127199384 T
T
 C
C
 7 a0001c0001t0003
a0001c0001t0011
a0001c0001t0016
others(4): Show 
a0001c0001t0003
a0001c0001t0011
a0001c0001t0016
a0001c0002t0003
a0001c0002t0017
a0001c0004t0003
a0002c0003t0003
 18 HG01891.hp2
HG02109.hp1
HG02145.hp2
others(15): Show 
HG01891.hp2
HG02109.hp1
HG02145.hp2
HG02630.hp1
HG02647.hp1
HG02895.hp1
HG03195.hp2
HG03453.hp1
HG03471.hp1
HG03471.hp2
HG03486.hp2
HG03540.hp2
HG06807.hp1
NA18906.hp1
NA19030.hp1
NA19030.hp2
NA19043.hp1
NA20129.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*3377T>C
c.*3377T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 3377 chr6 127199384
chr6:127199451 TTAA
TTAA
 T
T
 3 a0001c0001t0005
a0001c0001t0007
a0001c0002t0026
a0001c0001t0005
a0001c0001t0007
a0001c0002t0026
 16 HG00639.hp1
HG00639.hp2
HG00741.hp2
others(13): Show 
HG00639.hp1
HG00639.hp2
HG00741.hp2
HG01243.hp1
HG01257.hp1
HG01516.hp1
HG02257.hp2
HG02258.hp2
HG02280.hp1
HG02886.hp1
HG02922.hp2
HG02965.hp1
HG03130.hp1
HG03516.hp2
NA19240.hp1
NA20129.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*3450_*3452delATA
c.*3450_*3452delATA
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 5/5 3450 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127199451

chr:pos ref alt #
# of ghapid:genebody level
 ghapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid genebody_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr6:127119341 C
C
 G
G
 1 a0001c0002t0001g0262
a0001c0002t0001g0262
 1 NA18612.hp2
NA18612.hp2
 intron_variant MODIFIER c.97+52C>G
c.97+52C>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127119341
chr6:127119560 G
G
 T
T
 2 a0001c0002t0001g0260
a0001c0002t0001g0261
a0001c0002t0001g0260
a0001c0002t0001g0261
 2 HG00621.hp2
HG02165.hp1
HG00621.hp2
HG02165.hp1
 intron_variant MODIFIER c.97+271G>T
c.97+271G>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127119560
chr6:127119589 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0023g0259
a0001c0002t0023g0259
 1 HG02976.hp2
HG02976.hp2
 intron_variant MODIFIER c.97+300C>T
c.97+300C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127119589
chr6:127119740 G
G
 C
C
 19 a0001c0001t0005g0011
a0001c0001t0005g0038
a0001c0002t0001g0003
others(16): Show 
a0001c0001t0005g0011
a0001c0001t0005g0038
a0001c0002t0001g0003
a0001c0002t0001g0007
a0001c0002t0001g0010
a0001c0002t0001g0025
a0001c0002t0001g0026
a0001c0002t0001g0027
a0001c0002t0001g0028
a0001c0002t0001g0029
a0001c0002t0001g0030
a0001c0002t0001g0031
a0001c0002t0001g0032
a0001c0002t0001g0033
a0001c0002t0001g0034
a0001c0002t0001g0035
a0001c0002t0001g0036
a0001c0002t0001g0037
a0001c0002t0025g0003
 25 HG00438.hp1
HG01081.hp1
HG01993.hp2
others(22): Show 
HG00438.hp1
HG01081.hp1
HG01993.hp2
HG02040.hp1
HG02055.hp2
HG02074.hp2
HG02083.hp2
HG02129.hp2
HG02155.hp2
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HG02280.hp1
HG02300.hp1
HG02559.hp1
HG02818.hp1
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HG03209.hp2
NA18906.hp2
NA18949.hp2
NA18973.hp2
NA18983.hp1
NA18995.hp2
NA19005.hp2
NA19006.hp2
NA19087.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.97+451G>C
c.97+451G>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127119740
chr6:127119973 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0001g0039
a0001c0002t0001g0039
 1 NA18953.hp2
NA18953.hp2
 intron_variant MODIFIER c.97+684G>A
c.97+684G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127119973
chr6:127120344 G
G
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0040
a0001c0002t0001g0040
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.97+1055G>C
c.97+1055G>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127120344
chr6:127120521 C
C
 T
T
 16 a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0249
others(13): Show 
a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0249
a0001c0001t0003g0250
a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0003g0255
a0001c0001t0008g0244
a0001c0001t0008g0245
a0001c0001t0008g0248
a0001c0001t0008g0251
a0001c0001t0008g0252
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0258
a0001c0004t0003g0243
a0002c0003t0003g0246
 16 HG00735.hp1
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others(13): Show 
HG00735.hp1
HG02083.hp1
HG02109.hp1
HG02145.hp2
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HG03486.hp2
HG03834.hp1
HG04204.hp1
NA19030.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.97+1232C>T
c.97+1232C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127120521
chr6:127120819 A
A
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0242
a0001c0002t0001g0242
 1 NA18970.hp1
NA18970.hp1
 intron_variant MODIFIER c.97+1530A>C
c.97+1530A>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127120819
chr6:127120835 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0041
a0001c0002t0001g0041
 1 NA19087.hp2
NA19087.hp2
 intron_variant MODIFIER c.97+1546T>C
c.97+1546T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127120835
chr6:127120947 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0001g0042
a0001c0002t0001g0042
 1 HG02717.hp1
HG02717.hp1
 intron_variant MODIFIER c.97+1658G>A
c.97+1658G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127120947
chr6:127121201 T
T
 A
A
 11 a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0249
others(8): Show 
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0249
a0001c0001t0003g0250
a0001c0001t0008g0244
a0001c0001t0008g0245
a0001c0001t0008g0248
a0001c0001t0008g0251
a0001c0001t0008g0252
a0001c0004t0003g0243
a0002c0003t0003g0246
 11 HG00735.hp1
HG02083.hp1
HG02109.hp1
others(8): Show 
HG00735.hp1
HG02083.hp1
HG02109.hp1
HG03017.hp2
HG03195.hp1
HG03453.hp1
HG03471.hp1
HG03486.hp2
HG03834.hp1
HG04204.hp1
NA19030.hp1
 intron_variant MODIFIER c.97+1912T>A
c.97+1912T>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127121201
chr6:127121292 G
G
 T
T
 2 a0001c0001t0005g0011
a0001c0001t0005g0038
a0001c0001t0005g0011
a0001c0001t0005g0038
 3 HG02258.hp2
HG02280.hp1
HG02922.hp2
HG02258.hp2
HG02280.hp1
HG02922.hp2
 intron_variant MODIFIER c.97+2003G>T
c.97+2003G>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127121292
chr6:127121406 CCT
CCT
 C
C
 11 a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0249
others(8): Show 
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0249
a0001c0001t0003g0250
a0001c0001t0008g0244
a0001c0001t0008g0245
a0001c0001t0008g0248
a0001c0001t0008g0251
a0001c0001t0008g0252
a0001c0004t0003g0243
a0002c0003t0003g0246
 11 HG00735.hp1
HG02083.hp1
HG02109.hp1
others(8): Show 
HG00735.hp1
HG02083.hp1
HG02109.hp1
HG03017.hp2
HG03195.hp1
HG03453.hp1
HG03471.hp1
HG03486.hp2
HG03834.hp1
HG04204.hp1
NA19030.hp1
 intron_variant MODIFIER c.97+2120_97+2121del
others(2): Show 
c.97+2120_97+2121delCT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127121406
chr6:127121559 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0002g0241
 1 HG01978.hp1
HG01978.hp1
 intron_variant MODIFIER c.97+2270A>G
c.97+2270A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127121559
chr6:127121592 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0006g0240
a0001c0001t0006g0240
 1 HG02896.hp2
HG02896.hp2
 intron_variant MODIFIER c.97+2303G>T
c.97+2303G>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127121592
chr6:127121763 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0044
a0001c0002t0001g0044
 1 HG03453.hp2
HG03453.hp2
 intron_variant MODIFIER c.97+2474T>C
c.97+2474T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127121763
chr6:127121866 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0045
a0001c0002t0001g0045
 1 NA18964.hp1
NA18964.hp1
 intron_variant MODIFIER c.97+2577T>C
c.97+2577T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127121866
chr6:127121947 T
T
 C
C
 106 a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0085
others(103): Show 
a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0002g0002
a0001c0001t0002g0008
a0001c0001t0002g0009
a0001c0001t0002g0012
a0001c0001t0002g0014
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a0001c0001t0002g0016
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0002g0046
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a0001c0001t0002g0049
a0001c0001t0002g0050
a0001c0001t0002g0051
a0001c0001t0002g0052
a0001c0001t0002g0053
a0001c0001t0002g0054
a0001c0001t0002g0055
a0001c0001t0002g0056
a0001c0001t0002g0057
a0001c0001t0002g0058
a0001c0001t0002g0059
a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0002g0064
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a0001c0001t0002g0067
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a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0071
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0073
a0001c0001t0002g0074
a0001c0001t0002g0075
a0001c0001t0002g0076
a0001c0001t0002g0077
a0001c0001t0002g0079
a0001c0001t0002g0080
a0001c0001t0002g0081
a0001c0001t0002g0083
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a0001c0001t0002g0090
a0001c0001t0002g0091
a0001c0001t0002g0092
a0001c0001t0002g0093
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a0001c0001t0002g0096
a0001c0001t0002g0097
a0001c0001t0002g0098
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a0001c0001t0002g0100
a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0103
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a0001c0001t0010g0013
a0001c0001t0010g0063
a0001c0001t0012g0135
a0001c0001t0012g0136
a0001c0001t0013g0102
a0001c0001t0013g0111
a0001c0001t0016g0115
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a0001c0002t0001g0066
a0001c0002t0001g0131
a0001c0002t0001g0132
a0001c0002t0001g0133
a0001c0002t0001g0134
a0001c0002t0001g0260
a0001c0002t0001g0261
 121 HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
others(118): Show 
HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
HG00423.hp1
HG00423.hp2
HG00438.hp2
HG00558.hp1
HG00558.hp2
HG00597.hp1
HG00609.hp2
HG00621.hp1
HG00621.hp2
HG00733.hp1
HG00735.hp2
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01071.hp2
HG01074.hp2
HG01099.hp1
HG01106.hp1
HG01109.hp1
HG01168.hp1
HG01169.hp1
HG01243.hp2
HG01255.hp1
HG01255.hp2
HG01256.hp2
HG01257.hp2
HG01258.hp2
HG01346.hp2
HG01358.hp2
HG01361.hp1
HG01433.hp1
HG01496.hp1
HG01515.hp1
HG01891.hp1
HG01943.hp1
HG01975.hp2
HG01978.hp1
HG01978.hp2
HG02004.hp2
HG02027.hp1
HG02040.hp2
HG02056.hp1
HG02074.hp1
HG02080.hp2
HG02135.hp1
HG02145.hp1
HG02165.hp1
HG02165.hp2
HG02273.hp1
HG02486.hp1
HG02523.hp1
HG02602.hp2
HG02615.hp1
HG02622.hp2
HG02647.hp2
HG02698.hp2
HG02717.hp2
HG02735.hp2
HG02818.hp2
HG02896.hp1
HG02897.hp1
HG02965.hp1
HG02970.hp2
HG02976.hp1
HG03139.hp1
HG03486.hp1
HG03491.hp1
HG03579.hp2
HG03669.hp1
HG03834.hp2
HG04115.hp2
HG04184.hp1
HG04184.hp2
HG04204.hp2
HG04228.hp1
HG06807.hp2
NA18612.hp1
NA18747.hp2
NA18941.hp1
NA18942.hp2
NA18945.hp1
NA18947.hp2
NA18948.hp1
NA18950.hp1
NA18951.hp1
NA18953.hp1
NA18955.hp2
NA18956.hp1
NA18960.hp1
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NA18970.hp2
NA18975.hp1
NA18977.hp1
NA18977.hp2
NA18980.hp1
NA18982.hp1
NA18985.hp1
NA18988.hp2
NA18990.hp2
NA18991.hp1
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NA19002.hp1
NA19003.hp1
NA19012.hp1
NA19043.hp1
NA19056.hp1
NA19058.hp1
NA19060.hp1
NA19062.hp1
NA19078.hp2
NA19080.hp2
NA19081.hp2
NA19084.hp2
NA19091.hp1
NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
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C
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A
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A
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T
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c.97+5284delT
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AT
 A
A
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c.97+5301delT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127124586
chr6:127124765 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0166
a0001c0002t0001g0166
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HG01074.hp1
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c.97+5476T>C
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T
 C
C
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a0001c0001t0002g0058
a0001c0001t0002g0059
a0001c0001t0002g0057
a0001c0001t0002g0058
a0001c0001t0002g0059
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HG02074.hp1
NA18960.hp2
HG00558.hp2
HG02074.hp1
NA18960.hp2
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c.97+5532T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127124821
chr6:127125104 A
A
 G
G
 5 a0001c0001t0002g0018
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others(2): Show 
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a0001c0001t0002g0128
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others(2): Show 
HG01358.hp2
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c.97+5815A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127125104
chr6:127125220 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0005g0011
a0001c0001t0005g0038
a0001c0001t0005g0011
a0001c0001t0005g0038
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HG02280.hp1
HG02922.hp2
HG02258.hp2
HG02280.hp1
HG02922.hp2
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c.97+5931T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127125220
chr6:127125465 G
G
 C
C
 129 a0001c0001t0001g0060
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 146 HG00280.hp1
HG00323.hp1
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others(143): Show 
HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
HG00423.hp1
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HG00558.hp2
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HG00609.hp2
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T
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C
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c.97+6957C>A
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C
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HG02622.hp1
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A
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HG02155.hp2
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HG02895.hp1
HG02922.hp2
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HG03453.hp1
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G
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c.97+9013A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0005g0011
a0001c0001t0005g0038
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HG02258.hp2
HG02280.hp1
HG02922.hp2
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c.97+9021G>A
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A
 ACTCCACC
others(22): Show 
ACTCCACCCTTGAACAAATAAAACTATCTT
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a0001c0001t0010g0063
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HG02486.hp1
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others(29): Show 
c.97+9098_97+9126dupAACTATCTTCTCCACCCTTGAACAAATAA
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127128366
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G
 A
A
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a0001c0002t0001g0169
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NA18975.hp2
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c.97+9313G>A
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chr6:127128679 A
A
 G
G
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others(7): Show 
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HG02083.hp1
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G
 C
C
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a0001c0002t0001g0170
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NA18969.hp1
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G
 A
A
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a0001c0002t0001g0171
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HG03209.hp1
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c.97+9655G>A
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G
 C
C
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a0001c0001t0002g0058
a0001c0001t0002g0059
a0001c0001t0002g0057
a0001c0001t0002g0058
a0001c0001t0002g0059
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HG00558.hp2
HG02074.hp1
NA18960.hp2
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c.97+9916G>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127129205
chr6:127129217 G
G
 T
T
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a0001c0001t0002g0125
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HG00735.hp2
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c.97+9928G>T
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C
 T
T
 1 a0001c0002t0001g0160
a0001c0002t0001g0160
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NA18955.hp1
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RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127129233
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C
 T
T
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a0001c0002t0015g0236
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NA19012.hp2
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c.97+10115C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127129404
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G
 T
T
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a0001c0001t0002g0056
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NA18969.hp2
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c.97+10149G>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127129438
chr6:127129699 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0001g0172
a0001c0002t0001g0172
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NA18747.hp1
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0002g0127
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HG02523.hp1
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c.97+10593G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127129882
chr6:127130078 C
C
 A
A
 1 a0001c0002t0001g0173
a0001c0002t0001g0173
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HG02109.hp2
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c.97+10789C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127130078
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G
 T
T
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a0001c0002t0001g0235
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HG03516.hp1
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C
 T
T
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c.97+11231C>T
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c.97+11259A>G
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A
 G
G
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HG02258.hp2
HG02280.hp1
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C
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T
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C
 G
G
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C
 T
T
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a0001c0002t0001g0173
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HG02109.hp2
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c.97+12272C>T
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chr6:127131645 C
C
 T
T
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a0001c0001t0002g0124
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HG02615.hp1
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c.97+12356C>T
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G
 A
A
 2 a0001c0001t0005g0011
a0001c0001t0005g0038
a0001c0001t0005g0011
a0001c0001t0005g0038
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HG02258.hp2
HG02280.hp1
HG02922.hp2
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c.97+12423G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127131712
chr6:127131790 C
C
 T
T
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c.97+12501C>T
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T
 C
C
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a0001c0002t0017g0238
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NA19030.hp2
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c.97+12735T>C
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chr6:127132210 A
A
 C
C
 2 a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0258
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0258
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NA20129.hp2
HG02145.hp2
NA20129.hp2
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c.97+12921A>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127132210
chr6:127132416 G
G
 C
C
 3 a0001c0001t0002g0057
a0001c0001t0002g0058
a0001c0001t0002g0059
a0001c0001t0002g0057
a0001c0001t0002g0058
a0001c0001t0002g0059
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HG02074.hp1
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HG00558.hp2
HG02074.hp1
NA18960.hp2
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c.97+13127G>C
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chr6:127132659 A
A
 G
G
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a0001c0001t0002g0123
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HG01891.hp1
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c.97+13370A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127132659
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G
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0174
a0001c0002t0001g0174
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NA20805.hp1
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c.97+13784G>C
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C
 T
T
 267 a0001c0001t0001g0060
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 intron_variant MODIFIER c.97+13813C>T
c.97+13813C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127133102
chr6:127133480 T
T
 C
C
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a0001c0001t0002g0138
 1 HG02258.hp1
HG02258.hp1
 intron_variant MODIFIER c.97+14191T>C
c.97+14191T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127133480
chr6:127133601 C
C
 G
G
 1 a0001c0002t0001g0242
a0001c0002t0001g0242
 1 NA18970.hp1
NA18970.hp1
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c.97+14312C>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127133601
chr6:127133642 AG
AG
 A
A
 36 a0001c0001t0001g0256
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others(33): Show 
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HG00735.hp1
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HG00438.hp1
HG00735.hp1
HG01081.hp1
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NA21309.hp1
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c.97+14354delG
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127133642
chr6:127133748 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0012g0135
a0001c0001t0012g0136
a0001c0001t0012g0135
a0001c0001t0012g0136
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HG02145.hp1
HG01243.hp2
HG02145.hp1
 intron_variant MODIFIER c.97+14459G>A
c.97+14459G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127133748
chr6:127133763 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0126
a0001c0001t0002g0126
 1 HG00423.hp1
HG00423.hp1
 intron_variant MODIFIER c.97+14474A>G
c.97+14474A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127133763
chr6:127133768 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0122
a0001c0001t0002g0122
 1 HG00733.hp1
HG00733.hp1
 intron_variant MODIFIER c.97+14479A>C
c.97+14479A>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127133768
chr6:127133884 A
A
 G
G
 161 a0001c0001t0001g0060
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others(181): Show 
HG00280.hp1
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c.97+14595A>G
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chr6:127133981 T
T
 G
G
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a0002c0003t0003g0246
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HG03453.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-14667T>G
c.98-14667T>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127133981
chr6:127133993 C
C
 T
T
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 136 HG00280.hp1
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c.98-14655C>T
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0020
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NA18522.hp1
HG03130.hp2
NA18522.hp1
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c.98-14412C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127134236
chr6:127134288 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0002g0247
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HG03195.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-14360C>A
c.98-14360C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127134288
chr6:127134447 AT
AT
 A
A
 15 a0001c0001t0002g0247
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others(12): Show 
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 15 HG00735.hp1
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others(12): Show 
HG00735.hp1
HG01884.hp2
HG02083.hp1
HG02109.hp1
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NA18906.hp1
NA19030.hp1
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c.98-14195delT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127134447
chr6:127134676 A
A
 C
C
 166 a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0061
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a0001c0001t0001g0061
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HG04184.hp2
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NA18522.hp2
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NA19091.hp1
NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-13671A>G
c.98-13671A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127134977
chr6:127134981 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0001g0256
 1 HG02622.hp1
HG02622.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-13667A>G
c.98-13667A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127134981
chr6:127135149 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0121
a0001c0001t0002g0121
 1 HG00621.hp1
HG00621.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-13499C>T
c.98-13499C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127135149
chr6:127135236 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0001g0037
a0001c0002t0001g0037
 1 HG02040.hp1
HG02040.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-13412A>G
c.98-13412A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127135236
chr6:127135249 G
G
 A
A
 43 a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0140
others(40): Show 
a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0140
a0001c0001t0003g0141
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a0001c0001t0003g0249
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 49 HG00438.hp1
HG00735.hp1
HG01081.hp1
others(46): Show 
HG00438.hp1
HG00735.hp1
HG01081.hp1
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NA18906.hp1
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NA19006.hp2
NA19030.hp1
NA19087.hp1
NA20129.hp2
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-13399G>A
c.98-13399G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127135249
chr6:127135350 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0001g0177
a0001c0002t0001g0177
 1 HG02080.hp1
HG02080.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-13298G>A
c.98-13298G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127135350
chr6:127135416 T
T
 TA
TA
 6 a0001c0001t0003g0043
a0001c0002t0001g0178
a0001c0002t0001g0179
others(3): Show 
a0001c0001t0003g0043
a0001c0002t0001g0178
a0001c0002t0001g0179
a0001c0002t0001g0180
a0001c0002t0001g0181
a0001c0002t0001g0182
 6 HG01106.hp2
HG01433.hp2
HG02056.hp2
others(3): Show 
HG01106.hp2
HG01433.hp2
HG02056.hp2
HG02698.hp1
HG03471.hp1
NA18985.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-13207dupA
c.98-13207dupA
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127135416
chr6:127135416 TA
TA
 T
T
 20 a0001c0001t0002g0008
a0001c0001t0002g0046
a0001c0001t0002g0057
others(17): Show 
a0001c0001t0002g0008
a0001c0001t0002g0046
a0001c0001t0002g0057
a0001c0001t0002g0058
a0001c0001t0002g0059
a0001c0001t0002g0064
a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0068
a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0002g0137
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a0001c0001t0005g0157
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a0001c0002t0001g0134
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 22 HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00558.hp1
others(19): Show 
HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00558.hp1
HG00558.hp2
HG01071.hp1
HG01099.hp1
HG01243.hp1
HG01891.hp1
HG02074.hp1
HG02735.hp2
HG02895.hp2
HG03130.hp1
HG03516.hp2
HG03834.hp1
HG04115.hp2
HG04204.hp2
HG04228.hp1
NA18612.hp2
NA18960.hp2
NA19030.hp1
NA19030.hp2
NA19062.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-13207delA
c.98-13207delA
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127135416
chr6:127135416 TAA
TAA
 T
T
 125 a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0085
others(122): Show 
a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0085
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a0001c0001t0002g0002
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a0001c0001t0002g0100
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a0001c0001t0002g0103
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 145 HG00408.hp1
HG00423.hp1
HG00438.hp1
others(142): Show 
HG00408.hp1
HG00423.hp1
HG00438.hp1
HG00438.hp2
HG00597.hp1
HG00609.hp2
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HG00639.hp1
HG00733.hp1
HG00735.hp1
HG00735.hp2
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HG01069.hp1
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HG01106.hp1
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HG01168.hp1
HG01169.hp1
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HG02027.hp1
HG02040.hp1
HG02040.hp2
HG02055.hp2
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HG02080.hp2
HG02083.hp1
HG02083.hp2
HG02109.hp1
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HG02145.hp1
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HG02622.hp2
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HG02818.hp2
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TAAA
 T
T
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C
 T
T
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HG02647.hp1
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c.98-13009C>T
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G
 A
A
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a0001c0002t0001g0025
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HG01081.hp1
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c.98-12864G>A
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chr6:127135837 G
G
 A
A
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a0001c0002t0001g0183
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NA19240.hp2
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c.98-12811G>A
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chr6:127135842 A
A
 G
G
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c.98-12806A>G
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T
 G
G
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G
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c.98-12168delA
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A
 G
G
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a0001c0002t0001g0226
 1 NA19060.hp2
NA19060.hp2
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c.98-12156A>G
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G
 A
A
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a0002c0003t0003g0246
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HG03453.hp1
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T
 A
A
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a0001c0001t0011g0257
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HG02145.hp2
HG02630.hp1
NA20129.hp2
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c.98-11868T>A
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G
 C
C
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a0001c0002t0001g0027
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HG02155.hp2
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chr6:127137163 G
G
 A
A
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c.98-11485G>A
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G
 A
A
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a0001c0002t0001g0028
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HG02129.hp2
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c.98-11439G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127137209
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G
 T
T
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a0001c0001t0002g0120
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NA19062.hp1
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c.98-11399G>T
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T
 C
C
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HG01884.hp2
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C
 T
T
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G
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C
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C
 T
T
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 T
T
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c.98-10789G>T
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A
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G
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G
 C
C
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HG00323.hp1
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HG00323.hp1
HG00408.hp1
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NA20752.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.98-10241G>C
c.98-10241G>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127138407
chr6:127138566 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0001g0039
a0001c0002t0001g0039
 1 NA18953.hp2
NA18953.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-10082A>G
c.98-10082A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127138566
chr6:127138570 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0184
a0001c0002t0001g0184
 1 HG02135.hp2
HG02135.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-10078T>C
c.98-10078T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127138570
chr6:127138645 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0020g0185
a0001c0001t0020g0185
 1 HG02630.hp2
HG02630.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-10003C>A
c.98-10003C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127138645
chr6:127139011 A
A
 G
G
 21 a0001c0001t0005g0011
a0001c0001t0005g0038
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others(18): Show 
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 27 HG00438.hp1
HG01081.hp1
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others(24): Show 
HG00438.hp1
HG01081.hp1
HG01993.hp2
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NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-9637A>G
c.98-9637A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127139011
chr6:127139204 G
G
 A
A
 158 a0001c0001t0001g0060
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others(155): Show 
a0001c0001t0001g0060
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a0001c0001t0002g0069
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a0001c0001t0002g0071
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a0002c0003t0003g0246
 181 HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
others(178): Show 
HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
HG00423.hp1
HG00438.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp2
HG00597.hp1
HG00609.hp2
HG00621.hp1
HG00639.hp1
HG00733.hp1
HG00735.hp1
HG00735.hp2
HG00741.hp2
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01071.hp2
HG01074.hp2
HG01081.hp1
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NA21309.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.98-9444G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127139204
chr6:127139246 C
C
 T
T
 2 a0001c0002t0001g0223
a0001c0002t0001g0224
a0001c0002t0001g0223
a0001c0002t0001g0224
 2 HG00323.hp2
HG01358.hp1
HG00323.hp2
HG01358.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-9402C>T
c.98-9402C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127139246
chr6:127139336 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0001g0183
a0001c0002t0001g0183
 1 NA19240.hp2
NA19240.hp2
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c.98-9312C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127139336
chr6:127139446 A
A
 C
C
 17 a0001c0002t0001g0003
a0001c0002t0001g0007
a0001c0002t0001g0010
others(14): Show 
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a0001c0002t0001g0007
a0001c0002t0001g0010
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 22 HG00438.hp1
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others(19): Show 
HG00438.hp1
HG01081.hp1
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NA21309.hp1
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c.98-9202A>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127139446
chr6:127139509 GATTTCTA
others(74): Show 
GATTTCTAATTATTTCTAACCTTAAAAAAAATATATCTTTTTTTTAAGGT
TAGAAAAAAAATATTTCTAACCTTAAAAAAAA
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0253
 1 HG02895.hp1
HG02895.hp1
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others(81): Show 
c.98-9108_98-9028delTATATCTTTTTTTTAAGGTTAGAAAAAAAA
TATTTCTAACCTTAAAAAAAAATTTCTAATTATTTCTAACCTTAAAAAAA
A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127139509
chr6:127139538 A
A
 T
T
 14 a0001c0001t0002g0121
a0001c0001t0002g0148
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others(11): Show 
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a0001c0001t0002g0148
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HG00621.hp1
HG00639.hp1
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c.98-9110A>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127139538
chr6:127139539 AT
AT
 A
A
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others(16): Show 
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a0001c0001t0002g0057
a0001c0001t0002g0247
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 19 HG00558.hp2
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others(16): Show 
HG00558.hp2
HG00735.hp1
HG01884.hp2
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NA19030.hp1
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c.98-9108delT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127139539
chr6:127139543 A
A
 C
C
 5 a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0011g0234
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others(2): Show 
a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0011g0234
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others(2): Show 
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HG02630.hp1
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c.98-9105A>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127139543
chr6:127139544 TC
TC
 T
T
 5 a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0011g0234
a0001c0001t0011g0257
others(2): Show 
a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0011g0234
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0258
a0001c0004t0003g0243
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HG02630.hp1
HG03471.hp2
others(2): Show 
HG02145.hp2
HG02630.hp1
HG03471.hp2
HG03486.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-9103delC
c.98-9103delC
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127139544
chr6:127139545 C
C
 CT
CT
 151 a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0061
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T
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C
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c.98-8641T>C
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G
 A
A
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c.98-8629G>A
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A
 G
G
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a0001c0002t0004g0222
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HG01515.hp2
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c.98-8616A>G
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C
 A
A
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a0001c0001t0008g0245
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a0001c0001t0008g0244
a0001c0001t0008g0245
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HG00735.hp1
HG02083.hp1
HG03834.hp1
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c.98-8271C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127140377
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A
 C
C
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HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
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HG00423.hp2
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G
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C
 A
A
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T
 C
C
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a0001c0001t0011g0234
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c.98-7409A>G
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 T
T
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a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
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HG03471.hp2
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G
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a0001c0001t0008g0244
a0001c0001t0008g0245
a0001c0001t0008g0248
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G
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 C
C
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 T
T
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C
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 A
A
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G
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C
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 A
A
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c.98-5650delT
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G
 A
A
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a0001c0002t0001g0132
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HG00423.hp2
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c.98-5574G>A
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G
 T
T
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a0001c0001t0003g0043
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HG03471.hp1
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c.98-5391G>T
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chr6:127143288 C
C
 T
T
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a0001c0002t0001g0037
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HG02040.hp1
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c.98-5360C>T
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chr6:127143514 G
G
 A
A
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a0001c0001t0011g0234
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HG02145.hp2
HG02630.hp1
NA20129.hp2
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c.98-5134G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127143514
chr6:127143609 C
C
 T
T
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A
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G
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C
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T
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C
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NA19003.hp1
NA19005.hp2
NA19006.hp2
NA19012.hp1
NA19030.hp1
NA19030.hp2
NA19043.hp1
NA19056.hp1
NA19058.hp1
NA19060.hp1
NA19062.hp1
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NA19081.hp2
NA19084.hp2
NA19087.hp1
NA19091.hp1
NA19240.hp1
NA20129.hp1
NA20129.hp2
NA20752.hp1
NA20805.hp2
NA21309.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-4749T>C
c.98-4749T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127143899
chr6:127143931 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
 2 HG02895.hp1
HG03471.hp2
HG02895.hp1
HG03471.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-4717T>C
c.98-4717T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127143931
chr6:127143962 A
A
 C
C
 2 a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0003g0255
a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0003g0255
 2 HG02622.hp1
HG02647.hp1
HG02622.hp1
HG02647.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-4686A>C
c.98-4686A>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127143962
chr6:127144157 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0074
a0001c0001t0002g0074
 1 HG00438.hp2
HG00438.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-4491G>A
c.98-4491G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127144157
chr6:127144460 T
T
 A
A
 3 a0001c0002t0001g0066
a0001c0002t0001g0260
a0001c0002t0001g0261
a0001c0002t0001g0066
a0001c0002t0001g0260
a0001c0002t0001g0261
 3 HG00621.hp2
HG02165.hp1
NA18977.hp1
HG00621.hp2
HG02165.hp1
NA18977.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-4188T>A
c.98-4188T>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127144460
chr6:127144594 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
 2 HG02895.hp1
HG03471.hp2
HG02895.hp1
HG03471.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-4054A>G
c.98-4054A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127144594
chr6:127144600 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0071
a0001c0001t0002g0071
 1 HG00609.hp2
HG00609.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-4048C>T
c.98-4048C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127144600
chr6:127144620 T
T
 G
G
 2 a0001c0002t0001g0190
a0001c0002t0001g0191
a0001c0002t0001g0190
a0001c0002t0001g0191
 2 HG01256.hp1
HG01258.hp1
HG01256.hp1
HG01258.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-4028T>G
c.98-4028T>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127144620
chr6:127144643 G
G
 GTTTTTTT
others(8): Show 
GTTTTTTTGTTTTTTT
 19 a0001c0001t0002g0008
a0001c0001t0002g0014
a0001c0001t0002g0020
others(16): Show 
a0001c0001t0002g0008
a0001c0001t0002g0014
a0001c0001t0002g0020
a0001c0001t0002g0046
a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0068
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0075
a0001c0001t0002g0076
a0001c0001t0002g0077
a0001c0001t0002g0113
a0001c0001t0002g0114
a0001c0001t0002g0122
a0001c0001t0005g0078
a0001c0001t0010g0013
a0001c0001t0010g0063
a0001c0001t0012g0135
a0001c0001t0012g0136
a0001c0001t0016g0115
 24 HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00733.hp1
others(21): Show 
HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00733.hp1
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01071.hp2
HG01074.hp2
HG01099.hp1
HG01168.hp1
HG01243.hp2
HG02145.hp1
HG02486.hp1
HG02698.hp2
HG02717.hp2
HG02735.hp2
HG02896.hp1
HG02897.hp1
HG02965.hp1
HG02976.hp1
HG03130.hp2
HG03834.hp2
HG04228.hp1
NA18522.hp1
NA19043.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-3998_98-3997ins
others(15): Show 
c.98-3998_98-3997insGTTTTTTTTTTTTTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127144643
chr6:127144643 G
G
 GTTTTTTT
others(9): Show 
GTTTTTTTGTTTTTTTT
 2 a0001c0001t0002g0079
a0001c0001t0002g0137
a0001c0001t0002g0079
a0001c0001t0002g0137
 2 HG03579.hp2
HG04115.hp2
HG03579.hp2
HG04115.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-3998_98-3997ins
others(16): Show 
c.98-3998_98-3997insGTTTTTTTTTTTTTTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127144643
chr6:127144643 G
G
 GTTTTTTT
others(11): Show 
GTTTTTTTTTTGTTTTTTT
 6 a0001c0001t0003g0140
a0001c0001t0003g0141
a0001c0001t0003g0144
others(3): Show 
a0001c0001t0003g0140
a0001c0001t0003g0141
a0001c0001t0003g0144
a0001c0001t0003g0145
a0001c0001t0014g0142
a0001c0001t0022g0143
 6 HG01884.hp2
HG02257.hp1
HG03195.hp2
others(3): Show 
HG01884.hp2
HG02257.hp1
HG03195.hp2
HG03540.hp2
HG06807.hp1
NA18906.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-3995_98-3994ins
others(18): Show 
c.98-3995_98-3994insGTTTTTTTTTTTTTTTTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127144643
chr6:127144643 G
G
 GTTTTTTT
others(12): Show 
GTTTTTTTTTTGTTTTTTTT
 1 a0001c0001t0006g0240
a0001c0001t0006g0240
 1 HG02896.hp2
HG02896.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-3995_98-3994ins
others(19): Show 
c.98-3995_98-3994insGTTTTTTTTTTTTTTTTTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127144643
chr6:127144643 G
G
 GTTTTTTT
others(7): Show 
GTTTTTTTTTTTTTT
 1 a0001c0001t0002g0080
a0001c0001t0002g0080
 1 NA19080.hp2
NA19080.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-3992_98-3991ins
others(14): Show 
c.98-3992_98-3991insTTTTTTTTTTTTTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127144643
chr6:127144643 G
G
 GTTTTTTT
others(8): Show 
GTTTTTTTTTTTTTTT
 81 a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0002g0002
others(78): Show 
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0002g0002
a0001c0001t0002g0009
a0001c0001t0002g0015
a0001c0001t0002g0016
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0002g0047
a0001c0001t0002g0049
a0001c0001t0002g0057
a0001c0001t0002g0058
a0001c0001t0002g0064
a0001c0001t0002g0065
a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0071
a0001c0001t0002g0073
a0001c0001t0002g0081
a0001c0001t0002g0083
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a0001c0001t0002g0086
a0001c0001t0002g0087
a0001c0001t0002g0088
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0002g0090
a0001c0001t0002g0091
a0001c0001t0002g0092
a0001c0001t0002g0093
a0001c0001t0002g0094
a0001c0001t0002g0095
a0001c0001t0002g0096
a0001c0001t0002g0097
a0001c0001t0002g0098
a0001c0001t0002g0099
a0001c0001t0002g0100
a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0103
a0001c0001t0002g0104
a0001c0001t0002g0112
a0001c0001t0002g0116
a0001c0001t0002g0117
a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0120
a0001c0001t0002g0121
a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0002g0124
a0001c0001t0002g0125
a0001c0001t0002g0126
a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0002g0128
a0001c0001t0002g0129
a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0002g0148
a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0005g0011
a0001c0001t0005g0038
a0001c0001t0005g0152
a0001c0001t0005g0155
a0001c0001t0007g0019
a0001c0001t0007g0147
a0001c0001t0007g0149
a0001c0001t0007g0150
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a0001c0001t0013g0102
a0001c0001t0014g0146
a0001c0001t0018g0082
a0001c0001t0019g0018
a0001c0002t0001g0003
a0001c0002t0001g0025
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a0001c0002t0001g0027
a0001c0002t0001g0028
a0001c0002t0001g0029
a0001c0002t0001g0030
a0001c0002t0001g0031
a0001c0002t0001g0032
a0001c0002t0001g0033
a0001c0002t0001g0034
a0001c0002t0001g0037
a0001c0002t0025g0003
 95 HG00408.hp1
HG00423.hp1
HG00438.hp1
others(92): Show 
HG00408.hp1
HG00423.hp1
HG00438.hp1
HG00558.hp2
HG00609.hp2
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HG00639.hp1
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HG01257.hp2
HG01258.hp2
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HG01358.hp2
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HG02258.hp2
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NA18522.hp2
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NA18747.hp2
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NA18960.hp1
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NA18970.hp2
NA18973.hp2
NA18975.hp1
NA18982.hp1
NA18983.hp1
NA18988.hp2
NA18990.hp2
NA18991.hp1
NA18995.hp2
NA19005.hp2
NA19006.hp2
NA19056.hp1
NA19058.hp1
NA19060.hp1
NA19062.hp1
NA19081.hp2
NA19084.hp2
NA19091.hp1
NA20129.hp1
NA20752.hp1
NA20805.hp2
NA21309.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-3992_98-3991ins
others(15): Show 
c.98-3992_98-3991insTTTTTTTTTTTTTTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127144643
chr6:127144643 G
G
 GTTTTTTT
others(9): Show 
GTTTTTTTTTTTTTTTT
 29 a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0002g0012
a0001c0001t0002g0050
others(26): Show 
a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0002g0012
a0001c0001t0002g0050
a0001c0001t0002g0051
a0001c0001t0002g0052
a0001c0001t0002g0053
a0001c0001t0002g0054
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a0001c0001t0002g0059
a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0002g0074
a0001c0001t0002g0105
a0001c0001t0002g0106
a0001c0001t0002g0107
a0001c0001t0002g0108
a0001c0001t0002g0109
a0001c0001t0002g0110
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0130
a0001c0001t0005g0154
a0001c0001t0005g0156
a0001c0001t0005g0157
a0001c0001t0006g0153
a0001c0001t0007g0151
a0001c0001t0013g0111
a0001c0002t0001g0007
a0001c0002t0001g0010
a0001c0002t0001g0035
a0001c0002t0001g0036
 33 HG00438.hp2
HG00597.hp1
HG00741.hp2
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HG00438.hp2
HG00597.hp1
HG00741.hp2
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c.98-3992_98-3991insTTTTTTTTTTTTTTTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127144643
chr6:127144643 G
G
 GTTTTTTT
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GTTTTTTTTTTTTTTTTT
 5 a0001c0001t0002g0048
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a0001c0001t0002g0048
a0001c0001t0002g0055
a0001c0001t0011g0234
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HG02027.hp1
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c.98-3992_98-3991insTTTTTTTTTTTTTTTTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127144643
chr6:127144643 G
G
 GTTTTTTT
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GTTTTTTTTTTTTTTTTTT
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others(2): Show 
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0250
a0001c0001t0008g0251
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HG02109.hp1
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c.98-3992_98-3991insTTTTTTTTTTTTTTTTTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127144643
chr6:127144643 G
G
 GTTTTTTT
others(12): Show 
GTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
 5 a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0008g0244
others(2): Show 
a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0008g0244
a0001c0001t0008g0248
a0001c0004t0003g0243
 5 HG02083.hp1
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HG02083.hp1
HG02895.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.98-3992_98-3991ins
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c.98-3992_98-3991insTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127144643
chr6:127144643 G
G
 GTTTTTTT
others(13): Show 
GTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
 3 a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0003g0255
a0001c0001t0008g0245
a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0003g0255
a0001c0001t0008g0245
 3 HG00735.hp1
HG02622.hp1
HG02647.hp1
HG00735.hp1
HG02622.hp1
HG02647.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-3992_98-3991ins
others(20): Show 
c.98-3992_98-3991insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127144643
chr6:127144645 T
T
 TTTTTTTT
others(13): Show 
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG
 1 a0001c0001t0003g0249
a0001c0001t0003g0249
 1 NA19030.hp1
NA19030.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-3992_98-3991ins
others(20): Show 
c.98-3992_98-3991insTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127144645
chr6:127144911 C
C
 T
T
 9 a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0140
a0001c0001t0003g0141
others(6): Show 
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0140
a0001c0001t0003g0141
a0001c0001t0003g0144
a0001c0001t0003g0145
a0001c0001t0003g0250
a0001c0001t0006g0240
a0001c0001t0014g0142
a0001c0001t0022g0143
 9 HG01884.hp2
HG02109.hp1
HG02257.hp1
others(6): Show 
HG01884.hp2
HG02109.hp1
HG02257.hp1
HG02896.hp2
HG03195.hp1
HG03195.hp2
HG03540.hp2
HG06807.hp1
NA18906.hp1
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c.98-3737C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127144911
chr6:127145101 C
C
 A
A
 1 a0001c0002t0001g0260
a0001c0002t0001g0260
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
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c.98-3547C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127145101
chr6:127145296 A
A
 C
C
 2 a0001c0001t0002g0047
a0001c0001t0002g0104
a0001c0001t0002g0047
a0001c0001t0002g0104
 2 HG01255.hp1
HG02004.hp2
HG01255.hp1
HG02004.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-3352A>C
c.98-3352A>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127145296
chr6:127145308 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0001g0166
a0001c0002t0001g0166
 1 HG01074.hp1
HG01074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.98-3340G>A
c.98-3340G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127145308
chr6:127145649 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0004
a0001c0002t0001g0004
 4 NA18956.hp2
NA19002.hp2
NA19056.hp2
others(1): Show 
NA18956.hp2
NA19002.hp2
NA19056.hp2
NA19058.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-2999T>C
c.98-2999T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127145649
chr6:127146101 T
T
 C
C
 25 a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0043
others(22): Show 
a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0140
a0001c0001t0003g0141
a0001c0001t0003g0144
a0001c0001t0003g0145
a0001c0001t0003g0249
a0001c0001t0003g0250
a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0003g0255
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a0001c0001t0008g0245
a0001c0001t0008g0248
a0001c0001t0008g0251
a0001c0001t0008g0252
a0001c0001t0011g0234
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0258
a0001c0001t0014g0142
a0001c0001t0022g0143
a0001c0004t0003g0243
a0002c0003t0003g0246
 25 HG00735.hp1
HG01884.hp2
HG02083.hp1
others(22): Show 
HG00735.hp1
HG01884.hp2
HG02083.hp1
HG02109.hp1
HG02145.hp2
HG02257.hp1
HG02622.hp1
HG02630.hp1
HG02647.hp1
HG02895.hp1
HG02896.hp2
HG03017.hp2
HG03195.hp1
HG03195.hp2
HG03453.hp1
HG03471.hp1
HG03471.hp2
HG03486.hp2
HG03540.hp2
HG03834.hp1
HG04204.hp1
HG06807.hp1
NA18906.hp1
NA19030.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.98-2547T>C
c.98-2547T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 1/4 chr6 127146101
chr6:127146299 GA
GA
 G
G
 116 a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0085
others(113): Show 
a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0002g0002
a0001c0001t0002g0008
a0001c0001t0002g0009
a0001c0001t0002g0012
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a0001c0001t0002g0057
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a0001c0001t0002g0059
a0001c0001t0002g0062
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a0001c0001t0002g0065
a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0068
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a0001c0001t0002g0070
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a0001c0001t0002g0090
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a0001c0001t0002g0109
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a0001c0001t0002g0123
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a0001c0001t0002g0137
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a0001c0001t0002g0148
a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0005g0011
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a0001c0001t0005g0154
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a0001c0001t0005g0156
a0001c0001t0005g0157
a0001c0001t0006g0153
a0001c0001t0007g0019
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a0001c0001t0007g0150
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a0001c0001t0008g0139
a0001c0001t0010g0013
a0001c0001t0010g0063
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a0001c0001t0012g0136
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a0001c0001t0013g0111
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a0001c0001t0018g0082
a0001c0001t0019g0018
 134 HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
others(131): Show 
HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
HG00423.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp2
HG00597.hp1
HG00609.hp2
HG00621.hp1
HG00639.hp1
HG00733.hp1
HG00735.hp2
HG00741.hp2
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01071.hp2
HG01074.hp2
HG01099.hp1
HG01106.hp1
HG01109.hp1
HG01168.hp1
HG01169.hp1
HG01243.hp1
HG01243.hp2
HG01255.hp1
HG01255.hp2
HG01256.hp2
HG01257.hp1
HG01257.hp2
HG01258.hp2
HG01346.hp2
HG01358.hp2
HG01361.hp1
HG01433.hp1
HG01496.hp1
HG01515.hp1
HG01516.hp1
HG01891.hp1
HG01943.hp1
HG01975.hp2
HG01978.hp1
HG01978.hp2
HG02004.hp2
HG02027.hp1
HG02040.hp2
HG02055.hp1
HG02074.hp1
HG02080.hp2
HG02135.hp1
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HG02165.hp2
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c.98-2339delA
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G
 C
C
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c.98-1983G>C
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T
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A
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a0001c0001t0003g0250
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HG02109.hp1
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c.98-1976T>A
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T
 C
C
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HG01256.hp1
HG01258.hp1
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c.98-1856T>C
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G
 A
A
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HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
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NA18522.hp1
NA18522.hp2
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A
 C
C
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C
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T
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c.98-1328C>T
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T
 A
A
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c.98-1306T>A
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C
 T
T
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HG03130.hp1
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G
 A
A
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a0001c0001t0003g0255
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HG02622.hp1
HG02647.hp1
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c.98-893G>A
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A
 G
G
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c.289+60A>G
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A
 G
G
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c.289+88A>G
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G
 A
A
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a0001c0002t0001g0237
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HG03540.hp1
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c.289+152G>A
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chr6:127149320 A
A
 T
T
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a0001c0001t0002g0103
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NA19091.hp1
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c.289+481A>T
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C
 A
A
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a0001c0002t0023g0259
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HG02976.hp2
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c.289+784C>A
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chr6:127149740 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
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NA19030.hp2
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c.290-686T>C
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G
 A
A
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 G
G
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G
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G
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GAT
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G
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GATAT
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a0001c0001t0008g0244
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a0001c0001t0008g0248
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HG00735.hp1
HG02083.hp1
HG03834.hp1
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GATATAT
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 T
T
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 G
G
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 C
C
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C
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HG03540.hp2
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c.436+469T>C
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A
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G
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NA19030.hp2
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 A
A
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c.436+907G>A
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A
 G
G
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c.436+1028A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0113
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HG02698.hp2
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c.436+1748G>A
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C
 T
T
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a0001c0002t0001g0237
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HG03540.hp1
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c.436+1782C>T
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chr6:127152637 C
C
 T
T
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NA18953.hp1
NA18985.hp1
NA19003.hp1
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c.436+2065C>T
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C
 G
G
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a0001c0001t0005g0154
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a0001c0001t0005g0154
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HG02257.hp2
NA19240.hp1
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c.436+2124C>G
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chr6:127152696 C
C
 T
T
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HG00735.hp2
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c.436+2124C>T
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chr6:127152828 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0001g0228
a0001c0002t0001g0228
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NA18964.hp2
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c.436+2256C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 3/4 chr6 127152828
chr6:127152920 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0074
a0001c0001t0002g0074
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HG00438.hp2
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c.437-2321G>A
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A
 G
G
 1 a0001c0002t0001g0169
a0001c0002t0001g0169
 1 NA18975.hp2
NA18975.hp2
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c.437-2257A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0104
a0001c0001t0002g0047
a0001c0001t0002g0104
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HG02004.hp2
HG01255.hp1
HG02004.hp2
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c.437-2086G>A
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G
 T
T
 165 a0001c0001t0001g0060
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 A
A
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A
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c.437-953T>C
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T
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c.437-930A>T
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HG00609.hp1
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c.437-882A>G
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A
 G
G
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NA19030.hp2
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 A
A
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T
 C
C
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a0001c0002t0001g0029
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HG02074.hp2
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c.634+145T>C
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A
 G
G
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c.634+254A>G
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 A
A
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c.634+402G>A
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G
 C
C
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c.634+431G>C
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G
 GTA
GTA
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G
 GTATA
GTATA
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others(4): Show 
c.634+451_634+454dupTATA
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127155876
chr6:127155876 G
G
 GTATATA
GTATATA
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a0001c0001t0002g0247
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c.634+449_634+454dupTATATA
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127155876
chr6:127155876 G
G
 GTATATAT
others(5): Show 
GTATATATATATA
 1 a0001c0001t0003g0250
a0001c0001t0003g0250
 1 HG02109.hp1
HG02109.hp1
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others(12): Show 
c.634+443_634+454dupTATATATATATA
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127155876
chr6:127155888 A
A
 ATATATGT
others(17): Show 
ATATATGTATATATATATATATATG
 2 a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
 2 HG02895.hp1
HG03471.hp2
HG02895.hp1
HG03471.hp2
 intron_variant MODIFIER c.634+454_634+455ins
others(24): Show 
c.634+454_634+455insTGTATATATATATATATATGTATA
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127155888
chr6:127155891 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0194
a0001c0002t0001g0194
 1 NA18948.hp2
NA18948.hp2
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c.634+453T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127155891
chr6:127155891 T
T
 TATATAC
TATATAC
 4 a0001c0001t0001g0256
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0002g0083
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others(1): Show 
HG02622.hp1
HG02647.hp1
NA18960.hp1
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others(6): Show 
c.634+454_634+455insTATACA
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127155891
chr6:127155893 C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0068
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0068
a0001c0001t0002g0072
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HG01071.hp1
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HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG04228.hp1
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c.634+455C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127155893
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T
 C
C
 153 a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0085
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a0001c0001t0002g0008
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c.634+685T>C
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T
 C
C
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a0001c0002t0004g0167
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HG01943.hp2
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c.634+717T>C
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T
 C
C
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c.634+858T>C
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C
 T
T
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a0001c0002t0017g0238
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NA19030.hp2
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c.634+1785C>T
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chr6:127157285 C
C
 T
T
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a0001c0002t0001g0224
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HG00323.hp2
HG01358.hp1
HG06807.hp1
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c.634+1847C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127157285
chr6:127157318 T
T
 G
G
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a0001c0001t0011g0258
a0001c0001t0011g0257
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NA20129.hp2
HG02145.hp2
NA20129.hp2
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c.634+1880T>G
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A
 AAACATT
AAACATT
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T
 C
C
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a0001c0001t0002g0114
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HG02976.hp1
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c.634+2041T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127157479
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A
 G
G
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c.634+2363A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127157801
chr6:127157812 G
G
 T
T
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a0001c0001t0011g0234
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HG02630.hp1
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c.634+2374G>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127157812
chr6:127158033 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0195
a0001c0002t0001g0195
 1 HG01099.hp2
HG01099.hp2
 intron_variant MODIFIER c.634+2595T>C
c.634+2595T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127158033
chr6:127158145 ACTTTAT
ACTTTAT
 A
A
 117 a0001c0001t0001g0060
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 135 HG00280.hp1
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others(132): Show 
HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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others(8): Show 
c.634+2714_634+2719delCTTTAT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127158145
chr6:127158592 A
A
 G
G
 3 a0001c0002t0001g0025
a0001c0002t0001g0026
a0001c0002t0001g0036
a0001c0002t0001g0025
a0001c0002t0001g0026
a0001c0002t0001g0036
 3 HG01081.hp1
HG01993.hp2
HG02300.hp1
HG01081.hp1
HG01993.hp2
HG02300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.634+3154A>G
c.634+3154A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127158592
chr6:127158633 G
G
 C
C
 3 a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0002g0130
a0001c0001t0019g0018
a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0002g0130
a0001c0001t0019g0018
 3 HG01496.hp1
HG01943.hp1
HG02273.hp1
HG01496.hp1
HG01943.hp1
HG02273.hp1
 intron_variant MODIFIER c.634+3195G>C
c.634+3195G>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127158633
chr6:127158658 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0007g0147
a0001c0001t0007g0147
 1 NA20129.hp1
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.634+3220T>C
c.634+3220T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127158658
chr6:127158695 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0009g0218
a0001c0002t0009g0218
 1 NA18966.hp2
NA18966.hp2
 intron_variant MODIFIER c.634+3257C>T
c.634+3257C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127158695
chr6:127158759 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.634+3321C>T
c.634+3321C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127158759
chr6:127159138 C
C
 G
G
 1 a0001c0002t0001g0217
a0001c0002t0001g0217
 1 HG02027.hp2
HG02027.hp2
 intron_variant MODIFIER c.634+3700C>G
c.634+3700C>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127159138
chr6:127159277 A
A
 T
T
 1 a0001c0002t0001g0173
a0001c0002t0001g0173
 1 HG02109.hp2
HG02109.hp2
 intron_variant MODIFIER c.634+3839A>T
c.634+3839A>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127159277
chr6:127159371 A
A
 T
T
 2 a0001c0002t0004g0215
a0001c0002t0004g0216
a0001c0002t0004g0215
a0001c0002t0004g0216
 2 HG01168.hp2
HG01169.hp2
HG01168.hp2
HG01169.hp2
 intron_variant MODIFIER c.634+3933A>T
c.634+3933A>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127159371
chr6:127159562 G
G
 T
T
 1 a0001c0002t0001g0040
a0001c0002t0001g0040
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.634+4124G>T
c.634+4124G>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127159562
chr6:127159644 C
C
 CT
CT
 21 a0001c0001t0002g0054
a0001c0001t0002g0059
a0001c0001t0002g0094
others(18): Show 
a0001c0001t0002g0054
a0001c0001t0002g0059
a0001c0001t0002g0094
a0001c0001t0002g0117
a0001c0001t0002g0124
a0001c0001t0002g0129
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a0001c0002t0001g0191
a0001c0002t0001g0214
a0001c0002t0001g0227
 21 HG00423.hp2
HG00558.hp1
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others(18): Show 
HG00423.hp2
HG00558.hp1
HG00741.hp2
HG01243.hp1
HG01243.hp2
HG01256.hp1
HG01358.hp2
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HG02056.hp1
HG02074.hp1
HG02109.hp2
HG02615.hp1
HG02615.hp2
HG03130.hp1
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NA18947.hp2
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NA19078.hp1
 intron_variant MODIFIER c.634+4228dupT
c.634+4228dupT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127159644
chr6:127159644 C
C
 CTT
CTT
 9 a0001c0001t0002g0148
a0001c0001t0005g0011
a0001c0001t0005g0038
others(6): Show 
a0001c0001t0002g0148
a0001c0001t0005g0011
a0001c0001t0005g0038
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 11 HG00639.hp1
HG01257.hp1
HG01516.hp1
others(8): Show 
HG00639.hp1
HG01257.hp1
HG01516.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.634+4227_634+4228d
others(4): Show 
c.634+4227_634+4228dupTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127159644
chr6:127159644 CT
CT
 C
C
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a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0003g0253
others(4): Show 
a0001c0001t0002g0084
a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0008g0139
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a0001c0002t0001g0197
 7 HG02258.hp1
HG02895.hp1
HG03471.hp2
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HG02258.hp1
HG02895.hp1
HG03471.hp2
NA18522.hp2
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NA18995.hp1
 intron_variant MODIFIER c.634+4228delT
c.634+4228delT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127159644
chr6:127159644 CTT
CTT
 C
C
 19 a0001c0001t0008g0251
a0001c0001t0008g0252
a0001c0002t0001g0003
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a0001c0002t0001g0003
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a0001c0002t0025g0003
 24 HG00438.hp1
HG01081.hp1
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others(21): Show 
HG00438.hp1
HG01081.hp1
HG01993.hp2
HG02040.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.634+4227_634+4228d
others(4): Show 
c.634+4227_634+4228delTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127159644
chr6:127159691 C
C
 A
A
 22 a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0140
others(19): Show 
a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0140
a0001c0001t0003g0141
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a0001c0001t0003g0253
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a0001c0001t0011g0257
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 22 HG00735.hp1
HG01884.hp2
HG02083.hp1
others(19): Show 
HG00735.hp1
HG01884.hp2
HG02083.hp1
HG02109.hp1
HG02145.hp2
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HG02647.hp1
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HG02896.hp2
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HG03195.hp2
HG03453.hp1
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HG03834.hp1
HG06807.hp1
NA18906.hp1
NA19030.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.634+4253C>A
c.634+4253C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127159691
chr6:127159763 C
C
 G
G
 3 a0001c0001t0002g0057
a0001c0001t0002g0058
a0001c0001t0002g0059
a0001c0001t0002g0057
a0001c0001t0002g0058
a0001c0001t0002g0059
 3 HG00558.hp2
HG02074.hp1
NA18960.hp2
HG00558.hp2
HG02074.hp1
NA18960.hp2
 intron_variant MODIFIER c.634+4325C>G
c.634+4325C>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127159763
chr6:127159842 T
T
 A
A
 2 a0001c0002t0001g0042
a0001c0002t0001g0158
a0001c0002t0001g0042
a0001c0002t0001g0158
 2 HG02486.hp2
HG02717.hp1
HG02486.hp2
HG02717.hp1
 intron_variant MODIFIER c.634+4404T>A
c.634+4404T>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127159842
chr6:127159908 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0005g0078
a0001c0001t0005g0078
 1 HG02965.hp1
HG02965.hp1
 intron_variant MODIFIER c.634+4470C>T
c.634+4470C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127159908
chr6:127160009 A
A
 C
C
 141 a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0085
others(138): Show 
a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0002g0002
a0001c0001t0002g0008
a0001c0001t0002g0009
a0001c0001t0002g0012
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a0001c0001t0002g0077
a0001c0001t0002g0079
a0001c0001t0002g0080
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a0001c0001t0002g0090
a0001c0001t0002g0091
a0001c0001t0002g0092
a0001c0001t0002g0093
a0001c0001t0002g0094
a0001c0001t0002g0095
a0001c0001t0002g0096
a0001c0001t0002g0097
a0001c0001t0002g0098
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a0001c0001t0002g0100
a0001c0001t0002g0101
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a0002c0003t0003g0246
 159 HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
others(156): Show 
HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
HG00423.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp2
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HG00609.hp2
HG00621.hp1
HG00639.hp1
HG00733.hp1
HG00735.hp1
HG00735.hp2
HG00741.hp2
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01071.hp2
HG01074.hp2
HG01099.hp1
HG01106.hp1
HG01109.hp1
HG01168.hp1
HG01169.hp1
HG01243.hp1
HG01243.hp2
HG01255.hp1
HG01255.hp2
HG01256.hp2
HG01257.hp1
HG01257.hp2
HG01258.hp2
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HG01358.hp2
HG01361.hp1
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HG01496.hp1
HG01515.hp1
HG01516.hp1
HG01884.hp2
HG01891.hp1
HG01943.hp1
HG01975.hp2
HG01978.hp1
HG01978.hp2
HG02004.hp2
HG02027.hp1
HG02040.hp2
HG02074.hp1
HG02080.hp2
HG02083.hp1
HG02109.hp1
HG02135.hp1
HG02145.hp1
HG02145.hp2
HG02165.hp2
HG02257.hp1
HG02257.hp2
HG02258.hp1
HG02258.hp2
HG02273.hp1
HG02280.hp1
HG02486.hp1
HG02523.hp1
HG02602.hp2
HG02615.hp1
HG02615.hp2
HG02622.hp1
HG02622.hp2
HG02630.hp1
HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG02698.hp2
HG02717.hp2
HG02735.hp2
HG02818.hp2
HG02886.hp1
HG02895.hp1
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HG02896.hp2
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HG03471.hp2
HG03486.hp1
HG03486.hp2
HG03491.hp1
HG03516.hp2
HG03540.hp2
HG03579.hp2
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HG03834.hp1
HG03834.hp2
HG04115.hp2
HG04184.hp1
HG04184.hp2
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HG06807.hp1
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NA18522.hp1
NA18522.hp2
NA18612.hp1
NA18747.hp2
NA18906.hp1
NA18941.hp1
NA18942.hp2
NA18945.hp1
NA18948.hp1
NA18949.hp1
NA18950.hp1
NA18951.hp1
NA18953.hp1
NA18955.hp2
NA18956.hp1
NA18960.hp1
NA18960.hp2
NA18963.hp1
NA18966.hp1
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NA18970.hp2
NA18975.hp1
NA18977.hp2
NA18980.hp1
NA18982.hp1
NA18985.hp1
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c.634+4571A>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0006g0165
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HG03579.hp1
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c.634+4668G>A
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chr6:127160140 G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0140
a0001c0001t0003g0141
a0001c0001t0003g0144
a0001c0001t0003g0145
a0001c0001t0003g0249
a0001c0001t0003g0250
a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0003g0255
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a0001c0001t0008g0244
a0001c0001t0008g0245
a0001c0001t0008g0248
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c.634+4702G>A
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G
 C
C
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a0001c0002t0001g0179
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HG01106.hp2
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c.634+4990G>C
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A
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0002g0247
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HG03195.hp1
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c.634+5037A>C
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A
 C
C
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a0001c0001t0003g0249
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NA19030.hp1
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c.634+5128A>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127160566
chr6:127160631 A
A
 C
C
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c.634+5193A>C
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chr6:127160665 A
A
 G
G
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NA19003.hp1
NA19012.hp1
NA19043.hp1
NA19056.hp1
NA19058.hp1
NA19060.hp1
NA19062.hp1
NA19078.hp2
NA19080.hp2
NA19081.hp2
NA19084.hp2
NA19091.hp1
NA19240.hp1
NA20129.hp1
NA20752.hp1
NA20805.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.634+5227A>G
c.634+5227A>G
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T
 C
C
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a0001c0002t0001g0042
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HG02717.hp1
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c.634+5228T>C
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chr6:127160804 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0043
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HG03471.hp1
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c.634+5366C>T
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chr6:127160863 C
C
 A
A
 121 a0001c0001t0001g0060
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others(118): Show 
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c.634+5425C>A
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chr6:127160928 G
G
 T
T
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a0001c0002t0001g0176
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HG00280.hp2
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c.634+5490G>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127160928
chr6:127160982 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0020
a0001c0001t0002g0020
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NA18522.hp1
HG03130.hp2
NA18522.hp1
 intron_variant MODIFIER c.634+5544C>T
c.634+5544C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127160982
chr6:127161062 C
C
 A
A
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HG00280.hp1
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C
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G
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T
 C
C
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0077
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HG03834.hp2
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T
 C
C
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a0001c0002t0004g0198
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HG01069.hp2
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c.634+6525T>C
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T
 C
C
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G
 A
A
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c.634+7053G>A
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 G
G
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NA19084.hp1
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c.634+7526A>G
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G
 A
A
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NA19043.hp2
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 A
A
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c.634+8287A>G
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C
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A
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c.634+8531C>A
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G
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A
 G
G
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C
 T
T
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G
 T
T
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C
 T
T
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a0001c0002t0001g0239
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HG02155.hp1
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c.634+9331C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127164769
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T
 G
G
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a0001c0001t0002g0015
a0001c0001t0002g0106
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HG01255.hp2
HG01433.hp1
HG01975.hp2
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c.634+9423T>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127164861
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G
 T
T
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c.634+9784G>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0118
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HG01256.hp2
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c.634+9882G>A
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C
 T
T
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A
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HG01256.hp2
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c.634+10658G>A
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G
 A
A
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HG03017.hp1
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T
 C
C
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A
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A
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C
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c.634+11883G>A
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G
 T
T
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a0001c0001t0002g0081
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NA18956.hp1
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c.634+12099G>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127167537
chr6:127167597 C
C
 G
G
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HG01243.hp1
HG03130.hp1
HG03516.hp2
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c.634+12159C>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127167597
chr6:127167695 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.634+12257T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127167695
chr6:127167718 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0118
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HG01256.hp2
 intron_variant MODIFIER c.634+12280G>A
c.634+12280G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127167718
chr6:127167769 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0163
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HG02970.hp1
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c.634+12331T>C
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chr6:127167856 C
C
 T
T
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c.634+12418C>T
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C
 T
T
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a0001c0002t0017g0238
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NA19030.hp2
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c.634+12809C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127168247
chr6:127168339 T
T
 C
C
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c.634+12901T>C
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AT
 A
A
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T
 TC
TC
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G
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.634+14423dupT
c.634+14423dupT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127169853
chr6:127170077 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0001g0212
a0001c0002t0001g0212
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NA18990.hp1
 intron_variant MODIFIER c.634+14639C>T
c.634+14639C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127170077
chr6:127170434 T
T
 TACACAC
TACACAC
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 135 HG00280.hp1
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others(132): Show 
HG00280.hp1
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HG00408.hp1
HG00423.hp1
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others(10): Show 
c.634+15010_634+15015dupCACACA
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chr6:127170434 T
T
 TACACACA
others(1): Show 
TACACACAC
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a0001c0001t0002g0108
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a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0002g0108
a0001c0001t0002g0220
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NA18980.hp1
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NA18949.hp1
NA18980.hp1
NA19002.hp1
 intron_variant MODIFIER c.634+15008_634+1501
others(12): Show 
c.634+15008_634+15015dupCACACACA
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127170434
chr6:127171163 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0002g0138
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HG02258.hp1
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c.634+15725C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127171163
chr6:127171164 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0002g0138
 1 HG02258.hp1
HG02258.hp1
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c.634+15726C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127171164
chr6:127171166 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0002g0138
 1 HG02258.hp1
HG02258.hp1
 intron_variant MODIFIER c.634+15728C>T
c.634+15728C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127171166
chr6:127171212 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0014g0146
a0001c0001t0014g0146
 1 HG02615.hp2
HG02615.hp2
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c.634+15774T>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127171212
chr6:127171214 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0014g0146
a0001c0001t0014g0146
 1 HG02615.hp2
HG02615.hp2
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c.634+15776C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127171214
chr6:127171221 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0124
a0001c0001t0002g0124
 1 HG02615.hp1
HG02615.hp1
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c.634+15783A>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127171221
chr6:127171230 C
C
 T
T
 118 a0001c0001t0001g0060
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c.634+15792C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127171230
chr6:127171454 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0004g0202
a0001c0002t0004g0202
 1 HG01516.hp2
HG01516.hp2
 intron_variant MODIFIER c.634+16016G>A
c.634+16016G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127171454
chr6:127171492 T
T
 C
C
 25 a0001c0001t0001g0256
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HG01884.hp2
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NA20129.hp2
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c.634+16054T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127171492
chr6:127171619 C
C
 T
T
 4 a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0090
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others(1): Show 
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0090
a0001c0001t0002g0091
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 5 HG01891.hp1
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others(2): Show 
HG01891.hp1
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C
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A
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c.634+16919C>T
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T
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c.634+17028A>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0080
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NA19080.hp2
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c.634+17173A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127172611
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T
 C
C
 1 a0001c0001t0011g0234
a0001c0001t0011g0234
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HG02630.hp1
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c.634+17285T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127172723
chr6:127172975 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0069
 1 NA18942.hp2
NA18942.hp2
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c.634+17537T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127172975
chr6:127173145 CCT
CCT
 C
C
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c.634+17710_634+17711delCT
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T
 G
G
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a0001c0002t0001g0026
a0001c0002t0001g0036
a0001c0002t0001g0025
a0001c0002t0001g0026
a0001c0002t0001g0036
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HG01993.hp2
HG02300.hp1
HG01081.hp1
HG01993.hp2
HG02300.hp1
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c.634+17714T>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127173152
chr6:127173363 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0163
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HG02970.hp1
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c.634+17925C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127173363
chr6:127173405 G
G
 C
C
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NA18747.hp1
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c.634+17967G>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127173405
chr6:127173553 T
T
 G
G
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a0001c0001t0002g0148
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NA20805.hp2
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c.634+18115T>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127173553
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0121
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HG00621.hp1
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c.634+18174G>A
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G
 A
A
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a0001c0002t0017g0238
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NA19030.hp2
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c.634+18420G>A
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T
 C
C
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NA20129.hp1
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HG01257.hp1
HG01516.hp1
NA20129.hp1
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c.634+18502T>C
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A
 AAC
AAC
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others(6): Show 
c.634+18661_634+18662insCA
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chr6:127174100 T
T
 C
C
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c.634+18662T>C
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A
 G
G
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NA19030.hp2
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c.634+18676A>G
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G
 A
A
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G
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NA19030.hp2
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c.634+20155T>C
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A
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c.635-19954G>A
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 A
A
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C
 T
T
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A
 C
C
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 C
C
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T
 C
C
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 A
A
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C
 G
G
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NA18960.hp1
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T
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 C
C
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C
 T
T
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C
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NA18522.hp2
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 C
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NA19030.hp2
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c.635-17290G>C
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chr6:127178741 C
C
 A
A
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a0001c0002t0017g0238
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NA19030.hp2
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c.635-17082C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127178741
chr6:127178915 G
G
 C
C
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HG00438.hp1
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c.635-16908G>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127178915
chr6:127178924 G
G
 C
C
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a0001c0002t0001g0237
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HG03540.hp1
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c.635-16899G>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127178924
chr6:127178929 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.635-16894G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127178929
chr6:127179377 C
C
 A
A
 2 a0001c0002t0001g0229
a0001c0002t0004g0162
a0001c0002t0001g0229
a0001c0002t0004g0162
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HG03239.hp2
HG03239.hp1
HG03239.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-16446C>A
c.635-16446C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127179377
chr6:127179600 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.635-16223T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127179600
chr6:127179750 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0101
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HG01346.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-16073A>G
c.635-16073A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127179750
chr6:127179949 T
T
 C
C
 3 a0001c0002t0001g0023
a0001c0002t0001g0203
a0001c0002t0001g0212
a0001c0002t0001g0023
a0001c0002t0001g0203
a0001c0002t0001g0212
 4 NA18983.hp2
NA18988.hp1
NA18990.hp1
others(1): Show 
NA18983.hp2
NA18988.hp1
NA18990.hp1
NA19003.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-15874T>C
c.635-15874T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127179949
chr6:127179975 T
T
 A
A
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-15848T>A
c.635-15848T>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127179975
chr6:127180325 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0074
a0001c0001t0002g0074
 1 HG00438.hp2
HG00438.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-15498G>A
c.635-15498G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127180325
chr6:127180402 CA
CA
 C
C
 9 a0001c0001t0002g0148
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others(6): Show 
a0001c0001t0002g0148
a0001c0001t0005g0152
a0001c0001t0005g0154
a0001c0001t0007g0019
a0001c0001t0007g0147
a0001c0001t0007g0149
a0001c0001t0007g0150
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 10 HG00639.hp1
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others(7): Show 
HG00639.hp1
HG00741.hp2
HG01257.hp1
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HG03486.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.635-15415delA
c.635-15415delA
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127180402
chr6:127180487 C
C
 CA
CA
 42 a0001c0001t0001g0085
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a0001c0001t0002g0090
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HG00423.hp2
HG00438.hp1
HG00741.hp1
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c.635-15308dupA
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127180487
chr6:127180487 CA
CA
 C
C
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others(108): Show 
HG00280.hp1
HG00323.hp1
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c.635-15308delA
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chr6:127180493 A
A
 C
C
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a0001c0001t0007g0147
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NA20129.hp1
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c.635-15330A>C
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chr6:127180494 A
A
 G
G
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c.635-15329A>G
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A
 C
C
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a0001c0002t0001g0034
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c.635-15328A>C
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T
 C
C
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c.635-15042T>C
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G
 C
C
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a0001c0001t0002g0056
a0001c0001t0002g0055
a0001c0001t0002g0056
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HG02027.hp1
NA18969.hp2
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c.635-14638G>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0051
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HG00597.hp1
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c.635-14619G>A
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chr6:127181265 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0258
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0258
 2 HG02145.hp2
NA20129.hp2
HG02145.hp2
NA20129.hp2
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chr6:127181494 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0008g0245
a0001c0001t0008g0245
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HG00735.hp1
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0086
a0001c0001t0002g0086
 1 homoSapiens_chm13v2.hp1
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chr6:127181623 T
T
 C
C
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a0001c0001t0018g0082
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HG01515.hp1
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chr6:127181688 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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chr6:127181694 G
G
 C
C
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127181694
chr6:127181846 G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0046
a0001c0001t0002g0067
others(3): Show 
a0001c0001t0002g0008
a0001c0001t0002g0046
a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0068
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0137
 8 HG00280.hp1
HG00323.hp1
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others(5): Show 
HG00280.hp1
HG00323.hp1
HG01069.hp1
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c.635-13977G>A
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G
 T
T
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a0001c0001t0008g0139
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NA18522.hp2
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RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127182076
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G
 A
A
 1 a0001c0002t0001g0239
a0001c0002t0001g0239
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HG02155.hp1
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c.635-13627G>A
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chr6:127182578 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0090
a0001c0001t0002g0090
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HG02970.hp2
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c.635-13245A>C
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chr6:127182768 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0056
a0001c0001t0002g0056
 1 NA18969.hp2
NA18969.hp2
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c.635-13055G>A
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G
 A
A
 1 a0001c0002t0001g0039
a0001c0002t0001g0039
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NA18953.hp2
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c.635-12755G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127183068
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C
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0088
a0001c0001t0002g0088
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HG02040.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-12446C>A
c.635-12446C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127183377
chr6:127183487 G
G
 A
A
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a0001c0002t0015g0236
a0001c0002t0001g0206
a0001c0002t0015g0236
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NA19012.hp2
HG02129.hp1
NA19012.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-12336G>A
c.635-12336G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127183487
chr6:127183657 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0001g0194
a0001c0002t0001g0194
 1 NA18948.hp2
NA18948.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-12166C>T
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RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127183657
chr6:127183732 C
C
 T
T
 3 a0001c0002t0001g0028
a0001c0002t0001g0032
a0001c0002t0001g0035
a0001c0002t0001g0028
a0001c0002t0001g0032
a0001c0002t0001g0035
 3 HG02129.hp2
NA18995.hp2
NA19087.hp1
HG02129.hp2
NA18995.hp2
NA19087.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-12091C>T
c.635-12091C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127183732
chr6:127183759 A
A
 G
G
 4 a0001c0002t0001g0190
a0001c0002t0001g0191
a0001c0002t0001g0208
others(1): Show 
a0001c0002t0001g0190
a0001c0002t0001g0191
a0001c0002t0001g0208
a0001c0002t0001g0210
 4 HG01256.hp1
HG01258.hp1
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others(1): Show 
HG01256.hp1
HG01258.hp1
HG03491.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.635-12064A>G
c.635-12064A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127183759
chr6:127183990 A
A
 G
G
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others(5): Show 
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a0001c0001t0003g0254
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others(5): Show 
HG00735.hp1
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HG02083.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.635-11833A>G
c.635-11833A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127183990
chr6:127184206 T
T
 C
C
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a0001c0001t0005g0155
 1 HG03130.hp1
HG03130.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-11617T>C
c.635-11617T>C
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chr6:127184556 T
T
 A
A
 17 a0001c0002t0001g0003
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a0001c0002t0001g0010
others(14): Show 
a0001c0002t0001g0003
a0001c0002t0001g0007
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 22 HG00438.hp1
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others(19): Show 
HG00438.hp1
HG01081.hp1
HG01993.hp2
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NA18995.hp2
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NA19006.hp2
NA19087.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-11267T>A
c.635-11267T>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127184556
chr6:127185092 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0033
a0001c0002t0001g0033
 1 NA18973.hp2
NA18973.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-10731T>C
c.635-10731T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127185092
chr6:127185119 C
C
 A
A
 8 a0001c0001t0003g0140
a0001c0001t0003g0141
a0001c0001t0003g0144
others(5): Show 
a0001c0001t0003g0140
a0001c0001t0003g0141
a0001c0001t0003g0144
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 8 HG02109.hp1
HG03195.hp2
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others(5): Show 
HG02109.hp1
HG03195.hp2
HG03453.hp1
HG03540.hp2
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NA18906.hp1
NA19030.hp1
NA19043.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-10704C>A
c.635-10704C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127185119
chr6:127185256 A
A
 C
C
 2 a0001c0002t0001g0260
a0001c0002t0001g0261
a0001c0002t0001g0260
a0001c0002t0001g0261
 2 HG00621.hp2
HG02165.hp1
HG00621.hp2
HG02165.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-10567A>C
c.635-10567A>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127185256
chr6:127185401 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0087
a0001c0001t0002g0087
 1 NA18941.hp1
NA18941.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-10422G>A
c.635-10422G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127185401
chr6:127185414 GT
GT
 G
G
 9 a0001c0001t0006g0021
a0001c0001t0006g0153
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others(6): Show 
a0001c0001t0006g0021
a0001c0001t0006g0153
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a0001c0001t0020g0185
a0001c0001t0022g0143
 10 HG01884.hp2
HG02055.hp1
HG02257.hp1
others(7): Show 
HG01884.hp2
HG02055.hp1
HG02257.hp1
HG02559.hp2
HG02615.hp2
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HG02896.hp2
HG02922.hp1
HG03139.hp2
HG03579.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-10407delT
c.635-10407delT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127185414
chr6:127185463 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0001g0199
a0001c0002t0001g0199
 1 NA19043.hp2
NA19043.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-10360G>A
c.635-10360G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127185463
chr6:127185582 T
T
 C
C
 9 a0001c0001t0006g0021
a0001c0001t0006g0153
a0001c0001t0006g0164
others(6): Show 
a0001c0001t0006g0021
a0001c0001t0006g0153
a0001c0001t0006g0164
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a0001c0001t0020g0185
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 10 HG01884.hp2
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others(7): Show 
HG01884.hp2
HG02055.hp1
HG02257.hp1
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HG03139.hp2
HG03579.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-10241T>C
c.635-10241T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127185582
chr6:127185617 C
C
 T
T
 17 a0001c0002t0001g0003
a0001c0002t0001g0007
a0001c0002t0001g0010
others(14): Show 
a0001c0002t0001g0003
a0001c0002t0001g0007
a0001c0002t0001g0010
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0047
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HG01255.hp1
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c.635-10189C>T
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chr6:127185832 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
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NA19030.hp2
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RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127185832
chr6:127185853 A
A
 T
T
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a0001c0002t0001g0032
a0001c0002t0001g0035
a0001c0002t0001g0028
a0001c0002t0001g0032
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NA18995.hp2
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HG02129.hp2
NA18995.hp2
NA19087.hp1
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c.635-9970A>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127185853
chr6:127185914 G
G
 T
T
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a0001c0001t0005g0154
a0001c0001t0005g0152
a0001c0001t0005g0154
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NA19240.hp1
HG02257.hp2
NA19240.hp1
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c.635-9909G>T
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T
 C
C
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a0001c0002t0001g0186
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HG00609.hp1
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c.635-9789T>C
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T
 C
C
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T
 C
C
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HG01884.hp2
HG02257.hp1
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c.635-9488T>C
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T
 C
C
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a0001c0002t0004g0225
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HG01081.hp2
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c.635-9395T>C
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A
 T
T
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a0001c0002t0001g0261
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T
 G
G
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a0001c0002t0017g0238
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NA19030.hp2
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c.635-8802T>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187021
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T
 A
A
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a0001c0002t0001g0223
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HG01358.hp1
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c.635-8685T>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187138
chr6:127187143 G
G
 A
A
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 1 NA19012.hp2
NA19012.hp2
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c.635-8680G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187143
chr6:127187174 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0001g0211
a0001c0002t0001g0211
 1 NA18941.hp2
NA18941.hp2
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c.635-8649C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187174
chr6:127187210 A
A
 G
G
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 9 HG00438.hp1
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others(6): Show 
HG00438.hp1
HG02040.hp1
HG02074.hp2
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c.635-8613A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187210
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T
 C
C
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NA19030.hp2
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c.635-8539T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187284
chr6:127187301 G
G
 C
C
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
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NA19030.hp2
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c.635-8522G>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187301
chr6:127187480 G
G
 A
A
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a0001c0002t0001g0223
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HG01358.hp1
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c.635-8343G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187480
chr6:127187534 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0017g0238
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NA19030.hp2
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c.635-8289T>C
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chr6:127187572 A
A
 G
G
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HG02486.hp2
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c.635-8251A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187572
chr6:127187670 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0003g0255
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HG02622.hp1
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c.635-8153A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187670
chr6:127187708 C
C
 G
G
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.635-8115C>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187708
chr6:127187735 T
T
 A
A
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a0001c0001t0008g0139
a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0008g0139
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NA18522.hp2
HG02258.hp1
NA18522.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-8088T>A
c.635-8088T>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187735
chr6:127187797 G
G
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0223
a0001c0002t0001g0223
 1 HG01358.hp1
HG01358.hp1
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c.635-8026G>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187797
chr6:127187862 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0090
a0001c0001t0002g0090
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HG02970.hp2
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c.635-7961A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127187862
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 G
G
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c.635-7439G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127188384
chr6:127188532 A
A
 C
C
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a0001c0002t0021g0219
 1 NA18950.hp2
NA18950.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-7291A>C
c.635-7291A>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127188532
chr6:127188589 C
C
 CAT
CAT
 44 a0001c0001t0002g0009
a0001c0001t0002g0016
a0001c0001t0002g0017
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a0001c0001t0002g0016
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0074
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 54 HG00408.hp1
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others(51): Show 
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HG00438.hp2
HG01099.hp2
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HG01891.hp2
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others(4): Show 
c.635-7217_635-7216dupAT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127188589
chr6:127188589 C
C
 CATAT
CATAT
 17 a0001c0001t0002g0083
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others(14): Show 
a0001c0001t0002g0083
a0001c0002t0001g0003
a0001c0002t0001g0007
a0001c0002t0001g0010
a0001c0002t0001g0025
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 22 HG00438.hp1
HG01081.hp1
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others(19): Show 
HG00438.hp1
HG01081.hp1
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others(6): Show 
c.635-7219_635-7216dupATAT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127188589
chr6:127188589 CAT
CAT
 C
C
 4 a0001c0001t0005g0155
a0001c0001t0005g0156
a0001c0001t0005g0157
others(1): Show 
a0001c0001t0005g0155
a0001c0001t0005g0156
a0001c0001t0005g0157
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 4 HG01243.hp1
HG03130.hp1
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others(1): Show 
HG01243.hp1
HG03130.hp1
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NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-7217_635-7216d
others(4): Show 
c.635-7217_635-7216delAT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127188589
chr6:127188743 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.635-7080T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127188743
chr6:127188888 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0180
a0001c0002t0001g0180
 1 HG02056.hp2
HG02056.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-6935T>C
c.635-6935T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127188888
chr6:127188890 G
G
 T
T
 21 a0001c0001t0001g0256
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others(18): Show 
a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0140
a0001c0001t0003g0141
a0001c0001t0003g0144
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a0001c0001t0003g0249
a0001c0001t0003g0250
a0001c0001t0003g0253
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a0001c0001t0003g0255
a0001c0001t0005g0078
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 21 HG00735.hp1
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others(18): Show 
HG00735.hp1
HG01891.hp2
HG02083.hp1
HG02109.hp1
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HG02622.hp1
HG02630.hp1
HG02647.hp1
HG02895.hp1
HG02965.hp1
HG03195.hp2
HG03453.hp1
HG03471.hp1
HG03471.hp2
HG03540.hp2
HG03834.hp1
HG06807.hp1
NA18906.hp1
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-6933G>T
c.635-6933G>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127188890
chr6:127188978 C
C
 A
A
 1 a0001c0002t0001g0034
a0001c0002t0001g0034
 1 NA18949.hp2
NA18949.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-6845C>A
c.635-6845C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127188978
chr6:127189060 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0006g0240
a0001c0001t0006g0240
 1 HG02896.hp2
HG02896.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-6763T>C
c.635-6763T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127189060
chr6:127189144 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0125
a0001c0001t0002g0125
 1 HG00735.hp2
HG00735.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-6679A>G
c.635-6679A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127189144
chr6:127189243 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0001g0177
a0001c0002t0001g0177
 1 HG02080.hp1
HG02080.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-6580G>A
c.635-6580G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127189243
chr6:127189321 G
G
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0176
a0001c0002t0001g0176
 1 HG00280.hp2
HG00280.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-6502G>C
c.635-6502G>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127189321
chr6:127189325 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0022g0143
a0001c0001t0022g0143
 1 HG01884.hp2
HG01884.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-6498T>A
c.635-6498T>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127189325
chr6:127190209 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-5614A>G
c.635-5614A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127190209
chr6:127190212 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0030
a0001c0002t0001g0030
 1 NA21309.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-5611T>C
c.635-5611T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127190212
chr6:127190240 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0004g0205
a0001c0002t0004g0205
 1 NA21309.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-5583A>G
c.635-5583A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127190240
chr6:127190321 G
G
 A
A
 4 a0001c0001t0005g0078
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a0001c0001t0011g0257
others(1): Show 
a0001c0001t0005g0078
a0001c0001t0011g0234
a0001c0001t0011g0257
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 4 HG02145.hp2
HG02630.hp1
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others(1): Show 
HG02145.hp2
HG02630.hp1
HG02965.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-5502G>A
c.635-5502G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127190321
chr6:127190378 G
G
 A
A
 156 a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0256
others(153): Show 
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a0001c0001t0001g0256
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a0001c0001t0002g0053
a0001c0001t0002g0054
a0001c0001t0002g0055
a0001c0001t0002g0056
a0001c0001t0002g0057
a0001c0001t0002g0058
a0001c0001t0002g0059
a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0002g0064
a0001c0001t0002g0065
a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0068
a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0071
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0073
a0001c0001t0002g0074
a0001c0001t0002g0075
a0001c0001t0002g0076
a0001c0001t0002g0077
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a0001c0001t0002g0081
a0001c0001t0002g0083
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a0001c0001t0002g0088
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a0001c0001t0002g0091
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a0001c0001t0002g0094
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a0001c0001t0002g0096
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A
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a0001c0001t0011g0258
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G
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A
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HG02055.hp1
HG02922.hp1
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A
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G
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a0001c0002t0017g0238
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NA19030.hp2
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T
 C
C
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a0001c0001t0003g0043
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HG03471.hp1
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A
 G
G
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a0001c0004t0003g0243
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HG03486.hp2
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C
 T
T
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a0001c0002t0001g0214
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HG01884.hp1
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T
 C
C
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NA18945.hp2
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C
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G
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a0001c0001t0002g0088
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HG02040.hp2
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T
 C
C
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a0001c0002t0017g0238
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NA19030.hp2
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T
 G
G
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a0001c0002t0017g0238
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C
 T
T
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A
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c.635-4442A>G
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A
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C
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C
 G
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G
 T
T
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NA19030.hp2
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c.635-3879G>T
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chr6:127192213 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.635-3610T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127192213
chr6:127192782 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0080
a0001c0001t0002g0080
 1 NA19080.hp2
NA19080.hp2
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c.635-3041A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127192782
chr6:127193873 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0002g0062
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NA19002.hp1
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c.635-1950T>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127193873
chr6:127193942 G
G
 T
T
 21 a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0140
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a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0140
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a0001c0001t0005g0078
a0001c0001t0008g0244
a0001c0001t0008g0245
a0001c0001t0008g0248
a0001c0001t0011g0234
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0258
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HG00735.hp1
HG01891.hp2
HG02083.hp1
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c.635-1881G>T
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A
 G
G
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a0001c0002t0017g0238
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NA19030.hp2
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c.635-1855A>G
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C
 A
A
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HG00438.hp1
HG01081.hp1
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c.635-1693C>A
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chr6:127194245 C
C
 A
A
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a0002c0003t0003g0246
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HG03453.hp1
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c.635-1578C>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127194245
chr6:127194248 G
G
 A
A
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a0001c0002t0001g0239
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HG02155.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-1575G>A
c.635-1575G>A
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chr6:127194273 A
A
 G
G
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a0001c0001t0011g0234
a0001c0001t0005g0078
a0001c0001t0011g0234
 2 HG02630.hp1
HG02965.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp1
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c.635-1550A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127194273
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G
 A
A
 24 a0001c0001t0002g0002
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others(21): Show 
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a0001c0001t0002g0018
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others(26): Show 
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HG00735.hp2
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c.635-1382G>A
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0098
a0001c0001t0002g0098
 1 HG01106.hp1
HG01106.hp1
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c.635-1369G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127194454
chr6:127194474 T
T
 C
C
 23 a0001c0001t0001g0256
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others(20): Show 
a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0140
a0001c0001t0003g0141
a0001c0001t0003g0144
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a0001c0001t0003g0250
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a0001c0001t0008g0245
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a0001c0001t0008g0251
a0001c0001t0008g0252
a0001c0001t0011g0234
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0258
a0001c0001t0016g0115
a0001c0002t0003g0168
a0002c0003t0003g0246
 23 HG00735.hp1
HG01891.hp2
HG02083.hp1
others(20): Show 
HG00735.hp1
HG01891.hp2
HG02083.hp1
HG02109.hp1
HG02145.hp2
HG02622.hp1
HG02630.hp1
HG02647.hp1
HG02895.hp1
HG02965.hp1
HG03017.hp2
HG03195.hp2
HG03453.hp1
HG03471.hp1
HG03471.hp2
HG03540.hp2
HG03834.hp1
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HG06807.hp1
NA18906.hp1
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-1349T>C
c.635-1349T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127194474
chr6:127194699 T
T
 A
A
 1 a0001c0002t0001g0207
a0001c0002t0001g0207
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HG01346.hp1
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c.635-1124T>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127194699
chr6:127194766 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-1057T>C
c.635-1057T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127194766
chr6:127194980 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0001g0197
a0001c0002t0001g0197
 1 NA18963.hp2
NA18963.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-843A>G
c.635-843A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127194980
chr6:127195019 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0001g0231
a0001c0002t0001g0231
 1 NA20752.hp2
NA20752.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-804C>T
c.635-804C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127195019
chr6:127195153 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-670T>C
c.635-670T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127195153
chr6:127195233 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0009g0218
a0001c0002t0009g0218
 1 NA18966.hp2
NA18966.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-590A>G
c.635-590A>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127195233
chr6:127195264 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0124
a0001c0001t0002g0124
 1 HG02615.hp1
HG02615.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-559G>A
c.635-559G>A
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127195264
chr6:127195278 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0137
a0001c0001t0002g0137
 1 HG04115.hp2
HG04115.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-545C>G
c.635-545C>G
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127195278
chr6:127195480 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-343T>C
c.635-343T>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127195480
chr6:127195585 A
A
 C
C
 1 a0001c0002t0001g0223
a0001c0002t0001g0223
 1 HG01358.hp1
HG01358.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-238A>C
c.635-238A>C
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127195585
chr6:127195633 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0017g0238
a0001c0002t0017g0238
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-190C>T
c.635-190C>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127195633
chr6:127195787 G
G
 T
T
 1 a0002c0003t0003g0246
a0002c0003t0003g0246
 1 HG03453.hp1
HG03453.hp1
 intron_variant MODIFIER c.635-36G>T
c.635-36G>T
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 chr6 127195787
chr6:127195797 TTTAAAAG
others(7): Show 
TTTAAAAGAGTATCC
 T
T
 3 a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
a0001c0002t0003g0168
a0001c0001t0003g0253
a0001c0001t0003g0254
a0001c0002t0003g0168
 3 HG01891.hp2
HG02895.hp1
HG03471.hp2
HG01891.hp2
HG02895.hp1
HG03471.hp2
 intron_variant MODIFIER c.635-23_635-10delAA
others(12): Show 
c.635-23_635-10delAAAAGAGTATCCTT
RSPO3 ENSG00000146374.14 transcript ENST00000356698.9 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr6 127195797

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  • Satellite
  • All Snps 1.4.2
  • RC
  • snRNA
  • SINE
  • GC %
  • Simple_repeat
  • RNA
  • Retroposon
  • Unknown
  • Low_complexity
  • LINE
  • scRNA
  • CpG Islands
  • Phastcons (20 way)
  • srpRNA
  • Common Snps 1.4.2
  • rRNA
  • LTR
  • tRNA

  • Axiom Genome-Wide Array (Japonica Array V1)
  • Axiom Genome-Wide Array (Japonica Array V2)
  • Axiom Genome-Wide ASI Array V1 (ASI V1)
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  1. Open IGV on your computer
  2. In IGV's menu bar: View → Preferences…
  3. Click on the "Advanced" tab
  4. Check "Enable port"
  5. Set the port number to 60151
  6. Click OK to save

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