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ALDH2_chr12_111761933_111822532 / BRCA1_chr17_43039295_43130364 etc.

  Error connecting to IGV?   MAGI3_chr1_113385515_113690923  MAGI3_chr1_113385515_113690923 (clean+top1000)

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Item Value
geneid 260425
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symbol MAGI3
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HG01192 hp1 a0001 c0001 t0001 g0151 AMR PUR MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
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HG01261 hp1 a0001 c0001 t0002 g0232 AMR CLM MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01261 hp2 a0001 c0002 t0008 g0155 AMR CLM MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01346 hp1 a0001 c0002 t0002 g0197 AMR CLM MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01346 hp2 a0001 c0001 t0001 g0222 AMR CLM MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01433 hp1 a0001 c0001 t0001 g0166 AMR CLM MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01433 hp2 a0001 c0001 t0004 g0045 AMR CLM MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01496 hp1 a0001 c0001 t0007 g0131 AMR CLM MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01496 hp2 a0001 c0001 t0003 g0078 AMR CLM MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01516 hp1 a0001 c0002 t0002 g0020 EUR IBS MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01516 hp2 a0001 c0001 t0001 g0152 EUR IBS MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01517 hp1 a0001 c0002 t0002 g0021 EUR IBS MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01517 hp2 a0001 c0001 t0002 g0219 EUR IBS MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01928 hp1 a0001 c0002 t0002 g0210 AMR PEL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01928 hp2 a0001 c0001 t0003 g0122 AMR PEL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01943 hp1 a0001 c0001 t0003 g0070 AMR PEL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01943 hp2 a0001 c0001 t0004 g0213 AMR PEL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01952 hp1 a0001 c0001 t0003 g0069 AMR PEL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01952 hp2 a0001 c0001 t0001 g0153 AMR PEL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02004 hp1 a0001 c0001 t0003 g0068 AMR PEL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02004 hp2 a0001 c0002 t0002 g0058 AMR PEL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02015 hp1 a0001 c0001 t0001 g0162 EAS KHV MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02015 hp2 a0001 c0001 t0003 g0094 EAS KHV MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02055 hp1 a0001 c0001 t0006 g0062 AFR ACB MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02055 hp2 a0001 c0001 t0014 g0063 AFR ACB MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02056 hp1 a0001 c0001 t0004 g0234 EAS KHV MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02056 hp2 a0001 c0001 t0003 g0102 EAS KHV MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02071 hp1 a0001 c0001 t0003 g0090 EAS KHV MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02071 hp2 a0001 c0001 t0004 g0004 EAS KHV MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02083 hp1 a0001 c0002 t0002 g0048 EAS KHV MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02083 hp2 a0001 c0001 t0003 g0079 EAS KHV MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02129 hp1 a0001 c0002 t0002 g0230 EAS KHV MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02129 hp2 a0001 c0001 t0004 g0019 EAS KHV MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02293 hp1 a0001 c0002 t0002 g0227 AMR PEL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02293 hp2 a0001 c0001 t0003 g0080 AMR PEL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02300 hp1 a0001 c0001 t0004 g0040 AMR PEL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02300 hp2 a0001 c0002 t0002 g0203 AMR PEL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02630 hp1 a0001 c0003 t0013 g0127 AFR GWD MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02630 hp2 a0001 c0001 t0001 g0160 AFR GWD MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02647 hp1 a0001 c0001 t0001 g0164 AFR GWD MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02647 hp2 a0001 c0001 t0002 g0180 AFR GWD MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02683 hp1 a0001 c0001 t0002 g0223 SAS PJL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02683 hp2 a0001 c0001 t0004 g0041 SAS PJL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02738 hp1 a0001 c0001 t0002 g0150 SAS PJL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02738 hp2 a0001 c0002 t0002 g0198 SAS PJL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02897 hp1 a0001 c0001 t0001 g0163 AFR GWD MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02897 hp2 a0001 c0009 t0002 g0057 AFR GWD MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02922 hp1 a0001 c0001 t0001 g0184 AFR ESN MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02922 hp2 a0001 c0001 t0002 g0192 AFR ESN MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02965 hp1 a0001 c0001 t0001 g0194 AFR ESN MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02965 hp2 a0001 c0003 t0006 g0130 AFR ESN MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02976 hp1 a0001 c0001 t0002 g0159 AFR ESN MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02976 hp2 a0001 c0001 t0001 g0139 AFR ESN MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03041 hp1 a0001 c0008 t0009 g0056 AFR GWD MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03041 hp2 a0001 c0004 t0002 g0195 AFR GWD MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03098 hp1 a0001 c0001 t0001 g0185 AFR MSL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03098 hp2 a0001 c0001 t0001 g0206 AFR MSL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03209 hp1 a0001 c0001 t0006 g0061 AFR MSL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03209 hp2 a0001 c0001 t0001 g0165 AFR MSL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03239 hp1 a0001 c0001 t0003 g0059 SAS PJL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03239 hp2 a0001 c0002 t0002 g0156 SAS PJL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03490 hp1 a0001 c0002 t0002 g0209 SAS PJL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03490 hp2 a0001 c0001 t0002 g0006 SAS PJL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03654 hp1 a0001 c0001 t0003 g0118 SAS PJL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03654 hp2 a0001 c0001 t0001 g0218 SAS PJL MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03834 hp1 a0001 c0001 t0001 g0138 SAS BEB MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03834 hp2 a0001 c0001 t0004 g0046 SAS BEB MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03927 hp1 a0001 c0002 t0002 g0220 SAS BEB MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG03927 hp2 a0001 c0001 t0001 g0135 SAS BEB MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG04115 hp1 a0001 c0001 t0011 g0186 SAS STU MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG04115 hp2 a0001 c0002 t0002 g0216 SAS STU MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG04199 hp1 a0001 c0001 t0004 g0191 SAS STU MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG04199 hp2 a0001 c0002 t0002 g0233 SAS STU MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG04204 hp1 a0001 c0001 t0001 g0211 SAS STU MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG04204 hp2 a0001 c0001 t0004 g0009 SAS STU MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18747 hp1 a0001 c0001 t0003 g0060 EAS CHB MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18747 hp2 a0001 c0001 t0005 g0083 EAS CHB MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18939 hp1 a0001 c0001 t0001 g0049 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18939 hp2 a0001 c0001 t0003 g0075 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18940 hp1 a0001 c0001 t0005 g0088 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18940 hp2 a0001 c0001 t0002 g0038 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18942 hp1 a0001 c0001 t0001 g0169 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18942 hp2 a0001 c0001 t0003 g0121 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18943 hp1 a0001 c0001 t0005 g0107 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18943 hp2 a0001 c0001 t0001 g0142 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18944 hp1 a0001 c0001 t0003 g0055 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18944 hp2 a0001 c0001 t0004 g0013 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18947 hp1 a0001 c0002 t0002 g0229 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18947 hp2 a0001 c0001 t0004 g0005 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18948 hp1 a0001 c0001 t0002 g0033 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18948 hp2 a0001 c0001 t0001 g0176 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18950 hp1 a0001 c0001 t0001 g0141 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18950 hp2 a0001 c0001 t0003 g0126 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18952 hp1 a0001 c0001 t0001 g0177 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18952 hp2 a0001 c0001 t0002 g0072 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18953 hp1 a0001 c0001 t0003 g0103 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
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NA18957 hp1 a0001 c0001 t0001 g0144 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18957 hp2 a0001 c0001 t0002 g0016 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
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NA19081 hp2 a0001 c0001 t0001 g0024 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA19082 hp1 a0001 c0002 t0002 g0043 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA19082 hp2 a0001 c0001 t0004 g0173 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA19083 hp1 a0001 c0001 t0003 g0084 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA19083 hp2 a0001 c0001 t0001 g0145 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA19091 hp1 a0001 c0001 t0003 g0100 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA19091 hp2 a0001 c0001 t0001 g0181 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA20752 hp1 a0001 c0002 t0008 g0221 EUR TSI MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA20752 hp2 a0001 c0001 t0003 g0065 EUR TSI MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA20805 hp1 a0003 c0007 t0002 g0204 EUR TSI MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA20805 hp2 a0001 c0001 t0001 g0154 EUR TSI MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA20905 hp1 a0001 c0001 t0001 g0168 SAS GIH MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA20905 hp2 a0001 c0001 t0003 g0119 SAS GIH MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01123 hp1 a0001 c0001 t0003 g0117 AMR CLM MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG01123 hp2 a0001 c0001 t0001 g0196 AMR CLM MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02559 hp1 a0001 c0001 t0002 g0161 AFR ACB MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
HG02559 hp2 a0001 c0001 t0002 g0231 AFR ACB MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18955 hp1 a0001 c0001 t0003 g0104 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA18955 hp2 a0001 c0002 t0002 g0032 EAS JPT MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA20300 hp1 a0001 c0001 t0003 g0125 AFR USA MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA20300 hp2 a0001 c0001 t0001 g0193 AFR USA MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA21309 hp1 a0001 c0003 t0002 g0178 AFR LWK MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
NA21309 hp2 a0001 c0001 t0010 g0134 AFR LWK MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
homoSapiens_chm13v2 hp1 a0001 c0002 t0006 g0132 REF REF MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923
homoSapiens_grch38 hp1 a0001 c0001 t0016 g0190 REF REF MAGI3_chr1_113385515_113690923 MAGI3 chr1 113385515 113690923

chr:pos ref alt #
# of ahapid:amino-acid(protein) level
 ahapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr1:113391145 G
G
 C
C
 1 a0004
a0004
 1 NA18990.hp2
NA18990.hp2
 missense_variant MODERATE c.112G>C
c.112G>C
 p.Glu38Gln
p.Glu38Gln
 MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/21 631/6874 112/4446 38/1481 chr1 113391145
chr1:113651069 G
G
 A
A
 1 a0002
a0002
 1 HG00099.hp1
HG00099.hp1
 missense_variant MODERATE c.2303G>A
c.2303G>A
 p.Arg768His
p.Arg768His
 MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 14/21 2822/6874 2303/4446 768/1481 chr1 113651069
chr1:113683521 G
G
 A
A
 1 a0003
a0003
 1 NA20805.hp1
NA20805.hp1
 missense_variant MODERATE c.3953G>A
c.3953G>A
 p.Gly1318Asp
p.Gly1318Asp
 MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 21/21 4472/6874 3953/4446 1318/1481 chr1 113683521

chr:pos ref alt #
# of chapid
 chapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr1:113391192 C
C
 T
T
 1 a0001c0004
a0001c0004
 2 HG00741.hp2
HG03041.hp2
HG00741.hp2
HG03041.hp2
 synonymous_variant LOW c.159C>T
c.159C>T
 p.Gly53Gly
p.Gly53Gly
 MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/21 678/6874 159/4446 53/1481 chr1 113391192
chr1:113580600 C
C
 T
T
 1 a0001c0009
a0001c0009
 1 HG02897.hp2
HG02897.hp2
 synonymous_variant LOW c.492C>T
c.492C>T
 p.Ser164Ser
p.Ser164Ser
 MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 3/21 1011/6874 492/4446 164/1481 chr1 113580600
chr1:113585502 G
G
 A
A
 1 a0001c0003
a0001c0003
 3 HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
 synonymous_variant LOW c.669G>A
c.669G>A
 p.Thr223Thr
p.Thr223Thr
 MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 4/21 1188/6874 669/4446 223/1481 chr1 113585502
chr1:113622966 C
C
 T
T
 1 a0001c0008
a0001c0008
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
 synonymous_variant LOW c.1332C>T
c.1332C>T
 p.Pro444Pro
p.Pro444Pro
 MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/21 1851/6874 1332/4446 444/1481 chr1 113622966
chr1:113653873 A
A
 G
G
 1 a0001c0002
a0001c0002
 38 HG00140.hp2
HG00642.hp1
HG01069.hp2
others(35): Show 
HG00140.hp2
HG00642.hp1
HG01069.hp2
HG01175.hp2
HG01243.hp2
HG01257.hp2
HG01258.hp1
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HG01928.hp1
HG02004.hp2
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HG02129.hp1
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NA18947.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 synonymous_variant LOW c.2484A>G
c.2484A>G
 p.Thr828Thr
p.Thr828Thr
 MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 15/21 3003/6874 2484/4446 828/1481 chr1 113653873
chr1:113683531 C
C
 T
T
 1 a0001c0003
a0001c0003
 3 HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
 synonymous_variant LOW c.3963C>T
c.3963C>T
 p.Gly1321Gly
p.Gly1321Gly
 MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 21/21 4482/6874 3963/4446 1321/1481 chr1 113683531

chr:pos ref alt #
# of thapid:transcript level
 thapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr1:113390656 C
C
 A
A
 24 a0001c0001t0001
a0001c0001t0002
a0001c0001t0003
others(21): Show 
a0001c0001t0001
a0001c0001t0002
a0001c0001t0003
a0001c0001t0004
a0001c0001t0005
a0001c0001t0006
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a0001c0002t0006
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a0001c0009t0002
a0002c0006t0004
a0003c0007t0002
a0004c0005t0001
 235 HG00099.hp1
HG00099.hp2
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others(232): Show 
HG00099.hp1
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NA19082.hp1
NA19082.hp2
NA19083.hp1
NA19083.hp2
NA19091.hp1
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NA20300.hp1
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NA21309.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-378C>A
c.-378C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/21 378 chr1 113390656
chr1:113390814 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0015
a0001c0001t0015
 1 NA19011.hp2
NA19011.hp2
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-220C>G
c.-220C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/21 220 chr1 113390814
chr1:113390860 C
C
 G
G
 9 a0001c0001t0003
a0001c0001t0005
a0001c0001t0006
others(6): Show 
a0001c0001t0003
a0001c0001t0005
a0001c0001t0006
a0001c0001t0007
a0001c0001t0012
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a0001c0003t0013
 74 HG00423.hp2
HG00621.hp1
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others(71): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG00621.hp2
HG01070.hp1
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NA18747.hp1
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NA18960.hp2
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NA18994.hp2
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NA19011.hp1
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NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-174C>G
c.-174C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/21 174 chr1 113390860
chr1:113390948 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0003
a0001c0001t0005
a0001c0001t0012
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c.-86G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/21 86 chr1 113390948
chr1:113390948 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0014
a0001c0001t0014
 1 HG02055.hp2
HG02055.hp2
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-86G>T
c.-86G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/21 86 chr1 113390948
chr1:113684050 C
C
 G
G
 1 a0001c0003t0013
a0001c0003t0013
 1 HG02630.hp1
HG02630.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*36C>G
c.*36C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 21/21 36 chr1 113684050
chr1:113684353 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0011
a0001c0001t0011
 1 HG04115.hp1
HG04115.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*339A>G
c.*339A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 21/21 339 chr1 113684353
chr1:113684601 G
G
 GA
GA
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c.*597dupA
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chr1:113685076 T
T
 A
A
 1 a0001c0008t0009
a0001c0008t0009
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1062T>A
c.*1062T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 21/21 1062 chr1 113685076
chr1:113685107 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0010
a0001c0001t0010
 1 NA21309.hp2
NA21309.hp2
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c.*1093C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 21/21 1093 chr1 113685107
chr1:113685578 A
A
 G
G
 7 a0001c0001t0001
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NA20905.hp1
NA21309.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1564A>G
c.*1564A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 21/21 1564 chr1 113685578
chr1:113685660 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0008
a0001c0002t0008
 2 HG01261.hp2
NA20752.hp1
HG01261.hp2
NA20752.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1646A>G
c.*1646A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 21/21 1646 chr1 113685660

chr:pos ref alt #
# of ghapid:genebody level
 ghapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid genebody_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr1:113391682 G
G
 A
A
 48 a0001c0001t0001g0001
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HG00099.hp1
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NA18940.hp2
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NA18957.hp2
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NA18962.hp2
NA18965.hp2
NA18967.hp1
NA18968.hp2
NA18971.hp1
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NA19056.hp1
NA19058.hp1
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NA19081.hp2
NA19082.hp1
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c.316+333G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113391682
chr1:113392241 T
T
 C
C
 6 a0001c0001t0001g0049
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 6 NA18939.hp1
NA18953.hp2
NA18980.hp1
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NA18939.hp1
NA18953.hp2
NA18980.hp1
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NA18998.hp2
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c.316+892T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113392241
chr1:113392283 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0055
 1 NA18944.hp1
NA18944.hp1
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c.316+934G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113392283
chr1:113392318 T
T
 G
G
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
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c.316+969T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113392318
chr1:113392332 G
G
 C
C
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+983G>C
c.316+983G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113392332
chr1:113392388 G
G
 A
A
 1 a0001c0009t0002g0057
a0001c0009t0002g0057
 1 HG02897.hp2
HG02897.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+1039G>A
c.316+1039G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113392388
chr1:113392699 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0002g0058
a0001c0002t0002g0058
 1 HG02004.hp2
HG02004.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+1350T>C
c.316+1350T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113392699
chr1:113393321 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0059
a0001c0001t0003g0059
 1 HG03239.hp1
HG03239.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+1972G>A
c.316+1972G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113393321
chr1:113393470 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0049
 1 NA18939.hp1
NA18939.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+2121G>A
c.316+2121G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113393470
chr1:113393786 A
A
 G
G
 2 a0001c0002t0002g0235
a0001c0002t0002g0236
a0001c0002t0002g0235
a0001c0002t0002g0236
 2 NA18978.hp1
NA19054.hp1
NA18978.hp1
NA19054.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+2437A>G
c.316+2437A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113393786
chr1:113394163 G
G
 T
T
 29 a0001c0001t0001g0211
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a0001c0001t0001g0222
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a0001c0001t0004g0234
a0001c0002t0002g0208
a0001c0002t0002g0209
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HG00642.hp1
HG01081.hp1
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c.316+2814G>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0001
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HG01070.hp2
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c.316+2977G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113394326
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G
 A
A
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 intron_variant MODIFIER c.316+3017G>A
c.316+3017G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113394366
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A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0207
a0001c0001t0002g0207
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HG01069.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+3073A>G
c.316+3073A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113394422
chr1:113394533 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0206
a0001c0001t0001g0206
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HG03098.hp2
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c.316+3184A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113394533
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0060
 1 NA18747.hp1
NA18747.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+3243G>A
c.316+3243G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113394592
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T
 C
C
 3 a0001c0001t0006g0061
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a0001c0001t0006g0062
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HG02055.hp2
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+3687T>C
c.316+3687T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113395036
chr1:113395087 G
G
 GTT
GTT
 10 a0001c0001t0001g0010
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others(7): Show 
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a0001c0001t0001g0202
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 10 HG00738.hp1
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others(7): Show 
HG00738.hp1
HG01099.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.316+3766_316+3767d
others(4): Show 
c.316+3766_316+3767dupTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113395087
chr1:113395087 G
G
 GTTT
GTTT
 25 a0001c0001t0001g0018
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others(22): Show 
a0001c0001t0001g0018
a0001c0001t0001g0024
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 25 HG00423.hp1
HG00642.hp2
HG01109.hp2
others(22): Show 
HG00423.hp1
HG00642.hp2
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NA18994.hp1
NA18995.hp1
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NA19056.hp1
NA19058.hp1
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NA19080.hp1
NA19081.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+3765_316+3767d
others(5): Show 
c.316+3765_316+3767dupTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113395087
chr1:113395087 G
G
 GTTTT
GTTTT
 14 a0001c0001t0002g0038
a0001c0001t0002g0039
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others(11): Show 
a0001c0001t0002g0038
a0001c0001t0002g0039
a0001c0001t0004g0036
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 14 HG00099.hp1
HG01069.hp2
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others(11): Show 
HG00099.hp1
HG01069.hp2
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NA18965.hp2
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NA19070.hp2
NA19082.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+3764_316+3767d
others(6): Show 
c.316+3764_316+3767dupTTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113395087
chr1:113395087 G
G
 GTTTTTTT
others(3): Show 
GTTTTTTTTTT
 2 a0001c0001t0007g0131
a0001c0002t0006g0132
a0001c0001t0007g0131
a0001c0002t0006g0132
 2 HG01496.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
HG01496.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+3758_316+3767d
others(12): Show 
c.316+3758_316+3767dupTTTTTTTTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113395087
chr1:113395087 G
G
 GTTTTTTT
others(6): Show 
GTTTTTTTTTTTTT
 1 a0001c0001t0007g0133
a0001c0001t0007g0133
 1 HG01255.hp2
HG01255.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+3755_316+3767d
others(15): Show 
c.316+3755_316+3767dupTTTTTTTTTTTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113395087
chr1:113395087 GTT
GTT
 G
G
 15 a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
others(12): Show 
a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
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a0001c0001t0011g0186
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 15 HG00738.hp2
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others(12): Show 
HG00738.hp2
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GTTT
 G
G
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 G
G
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GTTTTTT
 G
G
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C
 T
T
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HG02055.hp1
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HG03209.hp1
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c.316+3963C>T
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CGT
 C
C
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a0001c0001t0001g0206
a0001c0001t0005g0064
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HG03098.hp2
NA18990.hp1
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others(4): Show 
c.316+4291_316+4292delGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113395633
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A
 C
C
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HG02055.hp2
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c.316+4473A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113395822
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T
 C
C
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HG03927.hp2
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c.316+4528T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113395877
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A
 G
G
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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c.316+4540A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113395889
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C
 T
T
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a0001c0002t0002g0048
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HG02083.hp1
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c.316+4716C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113396065
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T
 TTG
TTG
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c.316+4969_316+4970dupTG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113396287
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T
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TTGTG
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C
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A
 T
T
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a0001c0001t0004g0034
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NA19004.hp1
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T
 C
C
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113397134
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C
 T
T
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T
 C
C
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HG02976.hp2
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c.316+6372T>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0054
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NA18953.hp2
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G
 A
A
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HG00423.hp2
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c.316+7194G>A
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G
 T
T
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HG03041.hp1
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c.316+7495G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113398844
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A
 T
T
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a0001c0001t0001g0196
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HG01123.hp2
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c.316+7578A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113398927
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C
 CA
CA
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c.316+7757T>G
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T
 C
C
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c.316+7766T>C
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G
 A
A
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c.316+8072G>A
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A
 C
C
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c.316+10223T>G
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chr1:113401821 C
C
 T
T
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a0001c0001t0002g0033
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NA18948.hp1
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c.316+10472C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113401821
chr1:113401859 C
C
 T
T
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a0001c0001t0003g0116
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NA19078.hp2
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c.316+10510C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113401859
chr1:113402187 C
C
 A
A
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c.316+10838C>A
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G
 A
A
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c.316+10940G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113402289
chr1:113402305 A
A
 T
T
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a0001c0001t0010g0134
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NA21309.hp2
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c.316+10956A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113402305
chr1:113402372 A
A
 G
G
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others(2): Show 
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HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.316+11023A>G
c.316+11023A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113402372
chr1:113403041 A
A
 G
G
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+11692A>G
c.316+11692A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113403041
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0014g0063
 1 HG02055.hp2
HG02055.hp2
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c.316+11847G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113403196
chr1:113403202 G
G
 T
T
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a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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c.316+11853G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113403202
chr1:113403262 G
G
 A
A
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others(2): Show 
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others(2): Show 
HG01070.hp1
HG01952.hp1
HG02004.hp1
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c.316+11913G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113403262
chr1:113403367 C
C
 A
A
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others(74): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
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HG01258.hp2
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HG01496.hp2
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HG01943.hp1
HG01952.hp1
HG02004.hp1
HG02015.hp2
HG02055.hp1
HG02055.hp2
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HG02071.hp1
HG02083.hp2
HG02293.hp2
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HG03239.hp1
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NA18747.hp1
NA18747.hp2
NA18939.hp2
NA18940.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18944.hp1
NA18950.hp2
NA18952.hp2
NA18953.hp1
NA18955.hp1
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NA18961.hp2
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NA20300.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+12018C>A
c.316+12018C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113403367
chr1:113403451 A
A
 G
G
 1 a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0002g0178
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NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+12102A>G
c.316+12102A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113403451
chr1:113403468 A
A
 G
G
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+12119A>G
c.316+12119A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113403468
chr1:113403572 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+12223C>T
c.316+12223C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113403572
chr1:113403613 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0070
a0001c0001t0003g0070
 1 HG01943.hp1
HG01943.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+12264G>A
c.316+12264G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113403613
chr1:113403642 T
T
 C
C
 2 a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 2 HG02630.hp1
HG02965.hp2
HG02630.hp1
HG02965.hp2
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c.316+12293T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113403642
chr1:113403866 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.316+12517A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113403866
chr1:113403970 G
G
 T
T
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
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a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+12621G>T
c.316+12621G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113403970
chr1:113404441 G
G
 T
T
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
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c.316+13092G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113404441
chr1:113404598 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0159
a0001c0001t0002g0159
 1 HG02976.hp1
HG02976.hp1
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c.316+13249T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113404598
chr1:113404806 AG
AG
 A
A
 3 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0002g0192
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0002g0192
 3 HG02922.hp1
HG02922.hp2
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HG02922.hp1
HG02922.hp2
HG03098.hp1
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c.316+13460delG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113404806
chr1:113404809 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0011
a0001c0001t0004g0011
 1 HG00423.hp1
HG00423.hp1
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c.316+13460G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113404809
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C
 T
T
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others(64): Show 
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 intron_variant MODIFIER c.316+13952C>T
c.316+13952C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113405301
chr1:113405474 C
C
 CA
CA
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 intron_variant MODIFIER c.316+14153dupA
c.316+14153dupA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113405474
chr1:113405474 C
C
 CAAAAAA
CAAAAAA
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others(20): Show 
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HG01258.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.316+14148_316+1415
others(10): Show 
c.316+14148_316+14153dupAAAAAA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113405474
chr1:113405474 C
C
 CAAAAAAA
CAAAAAAA
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others(18): Show 
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
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 21 HG00423.hp2
HG01070.hp1
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others(18): Show 
HG00423.hp2
HG01070.hp1
HG01952.hp1
HG02004.hp1
HG02071.hp1
NA18747.hp1
NA18747.hp2
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NA18944.hp1
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NA18983.hp2
NA18985.hp2
NA18990.hp1
NA18992.hp1
NA19003.hp2
NA19011.hp1
NA19060.hp2
NA19070.hp1
NA19074.hp2
NA19083.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+14147_316+1415
others(11): Show 
c.316+14147_316+14153dupAAAAAAA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113405474
chr1:113405474 C
C
 CAAAAAAA
others(1): Show 
CAAAAAAAA
 14 a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0003g0071
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others(11): Show 
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0003g0071
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 14 HG01123.hp1
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HG01496.hp2
others(11): Show 
HG01123.hp1
HG01243.hp1
HG01496.hp2
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HG02293.hp2
NA18939.hp2
NA18952.hp2
NA18965.hp1
NA18967.hp2
NA18980.hp2
NA18986.hp2
NA19004.hp2
NA19077.hp2
NA19081.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+14146_316+1415
others(12): Show 
c.316+14146_316+14153dupAAAAAAAA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113405474
chr1:113405474 C
C
 CAAAAAAA
others(4): Show 
CAAAAAAAAAAA
 1 a0001c0003t0013g0127
a0001c0003t0013g0127
 1 HG02630.hp1
HG02630.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+14143_316+1415
others(15): Show 
c.316+14143_316+14153dupAAAAAAAAAAA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113405474
chr1:113405474 C
C
 CAAAAAAA
others(5): Show 
CAAAAAAAAAAAA
 1 a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0006g0130
 1 HG02965.hp2
HG02965.hp2
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CA
 C
C
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c.316+14153delA
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C
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 C
C
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G
 T
T
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A
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NA20805.hp1
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C
 T
T
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C
 G
G
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C
 G
G
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c.316+14637C>G
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 T
T
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HG03209.hp1
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G
 A
A
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HG00738.hp2
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 G
G
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C
 T
T
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c.316+14955C>T
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G
 A
A
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A
 C
C
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c.316+15357A>C
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A
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c.316+15482C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113406831
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T
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c.316+16235dupT
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CT
 C
C
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c.316+16235delT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113407572
chr1:113407626 G
G
 T
T
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a0001c0002t0002g0210
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HG01928.hp1
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c.316+16277G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113407626
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C
 T
T
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.316+16288C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113407637
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A
 G
G
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HG02055.hp1
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HG03209.hp1
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c.316+16316A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113407665
chr1:113408485 A
A
 C
C
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others(64): Show 
HG00423.hp2
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NA19077.hp2
NA19078.hp2
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NA19083.hp1
NA19091.hp1
NA20300.hp1
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c.316+17136A>C
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others(19): Show 
TTGTCTTTAAAAGTCAAACTAATTGTC
 T
T
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
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HG02055.hp2
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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others(30): Show 
c.316+17204_316+17229delGTCTTTAAAAGTCAAACTAATTGTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113408525
chr1:113408752 C
C
 T
T
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a0001c0001t0004g0046
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HG03834.hp2
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c.316+17403C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113408752
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CT
 C
C
 49 a0001c0001t0001g0001
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 49 HG00099.hp1
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others(46): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp1
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NA19054.hp2
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NA19082.hp1
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A
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T
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C
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A
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G
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C
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G
 T
T
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C
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T
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C
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A
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T
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C
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T
 A
A
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a0001c0001t0004g0002
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 G
G
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C
 A
A
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a0001c0001t0004g0002
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G
 C
C
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C
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HG02015.hp2
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A
 G
G
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G
 T
T
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a0001c0001t0004g0002
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0159
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T
 G
G
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G
 GT
GT
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C
 T
T
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G
 T
T
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HG03041.hp1
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c.316+21577G>T
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T
 C
C
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T
 A
A
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a0001c0001t0003g0065
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c.316+22139T>A
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chr1:113413785 C
C
 A
A
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a0001c0001t0005g0083
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NA18747.hp2
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c.316+22436C>A
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T
 G
G
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a0001c0001t0004g0011
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HG00423.hp1
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c.316+22682T>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0036
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NA18965.hp2
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c.316+22953G>A
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chr1:113414307 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0196
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HG01123.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0007g0133
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a0001c0001t0007g0131
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a0001c0002t0006g0132
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homoSapiens_chm13v2.hp1
HG01255.hp2
HG01496.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.316+23033G>A
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A
 C
C
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a0001c0001t0004g0002
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chr1:113414396 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0002
a0001c0001t0004g0002
 1 NA18967.hp1
NA18967.hp1
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T
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0002
a0001c0001t0004g0002
 1 NA18967.hp1
NA18967.hp1
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chr1:113414403 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0002
a0001c0001t0004g0002
 1 NA18967.hp1
NA18967.hp1
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chr1:113414405 G
G
 C
C
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a0001c0001t0004g0002
 1 NA18967.hp1
NA18967.hp1
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c.316+23056G>C
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A
 T
T
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a0001c0001t0004g0002
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NA18967.hp1
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G
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0002
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 1 NA18967.hp1
NA18967.hp1
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c.316+23060G>T
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C
 T
T
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a0001c0001t0003g0117
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HG01123.hp1
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A
 G
G
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HG00423.hp2
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NA18960.hp2
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NA20300.hp1
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G
 A
A
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HG02055.hp1
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HG03209.hp1
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c.316+23517G>A
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G
 T
T
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a0001c0003t0013g0127
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chr1:113414898 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0011
a0001c0001t0004g0011
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HG00423.hp1
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A
 G
G
 2 a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
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HG02965.hp2
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c.316+23696A>G
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chr1:113415158 C
C
 T
T
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a0001c0002t0002g0210
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a0001c0001t0004g0214
a0001c0002t0002g0210
a0001c0002t0002g0212
a0001c0002t0002g0227
a0001c0002t0002g0228
a0001c0002t0002g0229
 6 HG00642.hp1
HG01081.hp1
HG01928.hp1
others(3): Show 
HG00642.hp1
HG01081.hp1
HG01928.hp1
HG02293.hp1
NA18947.hp1
NA19063.hp2
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chr1:113415260 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+23911G>A
c.316+23911G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113415260
chr1:113415377 G
G
 A
A
 2 a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
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HG02965.hp2
HG02630.hp1
HG02965.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24028G>A
c.316+24028G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113415377
chr1:113415377 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0060
 1 NA18747.hp1
NA18747.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24028G>T
c.316+24028G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113415377
chr1:113415455 C
C
 T
T
 4 a0001c0002t0002g0226
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a0001c0002t0002g0230
a0001c0002t0002g0235
a0001c0002t0002g0236
 4 HG02129.hp1
NA18960.hp1
NA18978.hp1
others(1): Show 
HG02129.hp1
NA18960.hp1
NA18978.hp1
NA19054.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24106C>T
c.316+24106C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113415455
chr1:113415692 C
C
 T
T
 1 a0001c0003t0013g0127
a0001c0003t0013g0127
 1 HG02630.hp1
HG02630.hp1
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c.316+24343C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113415692
chr1:113415696 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0009
a0001c0001t0004g0009
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HG04204.hp2
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c.316+24347C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113415696
chr1:113415753 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0002g0209
a0001c0002t0002g0209
 1 HG03490.hp1
HG03490.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24404A>G
c.316+24404A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113415753
chr1:113415980 T
T
 TATATAC
TATATAC
 72 a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0051
others(69): Show 
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0051
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a0001c0001t0001g0158
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a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0165
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0167
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0169
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a0001c0001t0001g0177
a0001c0001t0001g0181
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a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0196
a0001c0001t0001g0206
a0001c0001t0002g0149
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a0001c0001t0002g0207
a0001c0001t0002g0225
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a0001c0002t0002g0058
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a0004c0005t0001g0175
 72 HG00099.hp2
HG00140.hp1
HG00738.hp2
others(69): Show 
HG00099.hp2
HG00140.hp1
HG00738.hp2
HG00741.hp1
HG00741.hp2
HG01069.hp1
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NA18939.hp1
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NA18995.hp2
NA18998.hp2
NA19000.hp1
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NA20300.hp2
NA20805.hp2
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NA21309.hp1
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24636_316+2463
others(10): Show 
c.316+24636_316+24637insCATATA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113415980
chr1:113415983 ATATTAAT
others(12): Show 
ATATTAATTATATAATTAAT
 A
A
 28 a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0001g0218
others(25): Show 
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0001g0222
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 28 HG00140.hp2
HG00642.hp1
HG01081.hp1
others(25): Show 
HG00140.hp2
HG00642.hp1
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HG01928.hp1
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HG02559.hp2
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HG02683.hp1
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HG03927.hp1
HG04115.hp2
HG04199.hp2
HG04204.hp1
NA18947.hp1
NA18960.hp1
NA18978.hp1
NA19054.hp1
NA19058.hp2
NA19063.hp2
NA20752.hp1
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others(23): Show 
c.316+24637_316+24655delTTAATTATATAATTAATTA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113415983
chr1:113415987 T
T
 C
C
 67 a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
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others(64): Show 
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0059
a0001c0001t0003g0060
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a0001c0001t0005g0105
a0001c0001t0005g0107
a0001c0001t0012g0073
 67 HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
others(64): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
HG01123.hp1
HG01243.hp1
HG01258.hp2
HG01496.hp2
HG01928.hp2
HG01943.hp1
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HG02071.hp1
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HG03239.hp1
HG03654.hp1
NA18747.hp1
NA18747.hp2
NA18939.hp2
NA18940.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18944.hp1
NA18950.hp2
NA18952.hp2
NA18953.hp1
NA18955.hp1
NA18960.hp2
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NA18962.hp1
NA18965.hp1
NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA18971.hp2
NA18972.hp1
NA18973.hp2
NA18980.hp2
NA18983.hp2
NA18984.hp2
NA18985.hp2
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18990.hp1
NA18992.hp1
NA18994.hp2
NA18998.hp1
NA19000.hp2
NA19002.hp1
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NA19006.hp1
NA19011.hp1
NA19056.hp2
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NA19063.hp1
NA19070.hp1
NA19074.hp2
NA19077.hp2
NA19078.hp2
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c.316+24638T>C
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A
 G
G
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T
 C
C
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c.316+24654T>C
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T
 G
G
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c.316+24654T>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0002t0002g0209
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HG00621.hp1
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c.316+24658T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416007
chr1:113416007 T
T
 TATATTAA
others(220): Show 
TATATTAATTATATAATTAATTACATATATTAATTATGTAATTAATGACA
CATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACA
CATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACA
CATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGAC
ACATATTATTATGTGTAATTAATGACAC
 1 a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0002g0180
 1 HG02647.hp2
HG02647.hp2
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others(231): Show 
c.316+24669_316+24670insATAATTAATTACATATATTAATTATG
TAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATG
TAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATG
TAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGT
GTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTA
T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416007
chr1:113416007 T
T
 TATATTAA
others(16): Show 
TATATTAATTATGTAATTAATTAC
 7 a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0050
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others(4): Show 
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0052
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NA18953.hp2
others(4): Show 
HG04115.hp1
NA18939.hp1
NA18953.hp2
NA18980.hp1
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others(27): Show 
c.316+24678_316+24679insTACATATTAATTATGTAATTAAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416007
chr1:113416007 T
T
 TATATTAA
others(18): Show 
TATATTAATTATGTAATTAATTACAC
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
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others(29): Show 
c.316+24678_316+24679insTACACATATTAATTATGTAATTAAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416007
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T
 C
C
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others(64): Show 
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a0001c0001t0002g0089
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 67 HG00423.hp2
HG00621.hp1
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others(64): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
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NA18747.hp1
NA18747.hp2
NA18939.hp2
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NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18944.hp1
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NA18953.hp1
NA18955.hp1
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c.316+24663T>C
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A
 ATGTAATT
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ATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATT
ATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTATTA
TGTGTAATTAATGACACATATTATTATG
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a0001c0001t0011g0186
a0001c0004t0002g0183
a0001c0004t0002g0195
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HG03041.hp2
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c.316+24764_316+24765insTTATGTGTAATTAATGACACATATTA
TTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
AATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
A
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G
 A
A
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HG00423.hp2
HG00621.hp1
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NA19002.hp1
NA19003.hp2
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NA19006.hp1
NA19011.hp1
NA19056.hp2
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NA19063.hp1
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NA20300.hp1
NA20752.hp2
NA20905.hp2
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c.316+24670G>A
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chr1:113416024 T
T
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others(18): Show 
TAATTACACATATTAATTATGTAATG
 1 a0001c0002t0006g0132
a0001c0002t0006g0132
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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others(29): Show 
c.316+24678_316+24679insTACACATATTAATTATGTAATGAAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416024
chr1:113416024 T
T
 TAATTACA
others(43): Show 
TAATTACACATATTAATTATGTAATGAATGACACATATTAATTATGTAAT
G
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a0001c0001t0007g0133
 1 HG01255.hp2
HG01255.hp2
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others(54): Show 
c.316+24678_316+24679insTACACATATTAATTATGTAATGAATG
ACACATATTAATTATGTAATGAAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416024
chr1:113416024 T
T
 TAATTACA
others(68): Show 
TAATTACACATATTAATTATGTAATGAATGACACATATTAATTATGTAAT
GAATGACACATATTAATTATGTAATG
 1 a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0131
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HG01496.hp1
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others(79): Show 
c.316+24678_316+24679insTACACATATTAATTATGTAATGAATG
ACACATATTAATTATGTAATGAATGACACATATTAATTATGTAATGAAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416024
chr1:113416028 G
G
 C
C
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NA18990.hp1
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NA20300.hp1
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NA20905.hp2
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c.316+24679G>C
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G
 T
T
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c.316+24679G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416028
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C
 T
T
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HG03041.hp1
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c.316+24683C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416032
chr1:113416037 T
T
 C
C
 67 a0001c0001t0002g0072
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others(64): Show 
a0001c0001t0002g0072
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c.316+24688T>C
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A
 G
G
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c.316+24689A>G
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A
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ATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATT
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a0001c0002t0002g0058
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GTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTAT
GTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTAT
GTAATTAATGACACATATTATTATGT
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G
 A
A
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T
 G
G
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G
 C
C
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c.316+24704G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416053
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G
 T
T
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c.316+24704G>T
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C
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c.316+24708C>T
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HG00621.hp1
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NA18985.hp2
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NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24713T>C
c.316+24713T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416062
chr1:113416063 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24714A>G
c.316+24714A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416063
chr1:113416067 A
A
 ATGTAATT
others(45): Show 
ATGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATATTATT
ATG
 1 a0001c0001t0002g0225
a0001c0001t0002g0225
 1 NA19080.hp2
NA19080.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24739_316+2474
others(56): Show 
c.316+24739_316+24740insTTATGTGTAATTAATGACACATATTA
TTATGTGTAATTAATGACACATATTA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416067
chr1:113416073 T
T
 TTAATCAC
others(39): Show 
TTAATCACACATATCAATTATGTAATTAATCACACATATCAATTATG
 1 a0001c0001t0005g0083
a0001c0001t0005g0083
 1 NA18747.hp2
NA18747.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24728_316+2472
others(50): Show 
c.316+24728_316+24729insCACACATATCAATTATGTAATTAATC
ACACATATCAATTATGTAAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416073
chr1:113416074 T
T
 G
G
 3 a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0002t0006g0132
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0002t0006g0132
 3 HG01255.hp2
HG01496.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
HG01255.hp2
HG01496.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24725T>G
c.316+24725T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416074
chr1:113416078 G
G
 C
C
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a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
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a0001c0001t0003g0086
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a0001c0001t0003g0101
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a0001c0001t0005g0107
a0001c0001t0012g0073
 67 HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
others(64): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
HG01123.hp1
HG01243.hp1
HG01258.hp2
HG01496.hp2
HG01928.hp2
HG01943.hp1
HG01952.hp1
HG02004.hp1
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HG03239.hp1
HG03654.hp1
NA18747.hp1
NA18747.hp2
NA18939.hp2
NA18940.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18944.hp1
NA18950.hp2
NA18952.hp2
NA18953.hp1
NA18955.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18965.hp1
NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA18971.hp2
NA18972.hp1
NA18973.hp2
NA18980.hp2
NA18983.hp2
NA18984.hp2
NA18985.hp2
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18990.hp1
NA18992.hp1
NA18994.hp2
NA18998.hp1
NA19000.hp2
NA19002.hp1
NA19003.hp2
NA19004.hp2
NA19006.hp1
NA19011.hp1
NA19056.hp2
NA19060.hp2
NA19063.hp1
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NA19074.hp2
NA19077.hp2
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NA19081.hp1
NA19083.hp1
NA19091.hp1
NA20300.hp1
NA20752.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24729G>C
c.316+24729G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416078
chr1:113416078 G
G
 T
T
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24729G>T
c.316+24729G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416078
chr1:113416078 G
G
 TACATATA
others(43): Show 
TACATATATTAATTATGTAATTAATTACATATATTAATTATGTAATTAAT
G
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24728_316+2472
others(54): Show 
c.316+24728_316+24729insTACATATATTAATTATGTAATTAATT
ACATATATTAATTATGTAATTAAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416078
chr1:113416082 C
C
 T
T
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24733C>T
c.316+24733C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416082
chr1:113416087 T
T
 C
C
 67 a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
others(64): Show 
a0001c0001t0002g0072
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a0001c0001t0003g0055
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a0001c0001t0003g0067
a0001c0001t0003g0068
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a0001c0001t0003g0075
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a0001c0001t0003g0086
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a0001c0001t0003g0090
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HG00621.hp1
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others(64): Show 
HG00423.hp2
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c.316+24738T>C
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A
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HG02055.hp1
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HG03209.hp1
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c.316+24739A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416088
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T
 G
G
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G
 C
C
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HG00423.hp2
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G
 T
T
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a0001c0001t0006g0062
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HG02055.hp1
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c.316+24754G>T
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C
 T
T
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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 C
C
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others(64): Show 
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HG00621.hp1
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NA18747.hp1
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NA18940.hp1
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NA18944.hp1
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NA18972.hp1
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NA19000.hp2
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NA19081.hp1
NA19083.hp1
NA19091.hp1
NA20300.hp1
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c.316+24763T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416112
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A
 G
G
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HG02055.hp1
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HG03209.hp1
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c.316+24764A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416113
chr1:113416124 T
T
 G
G
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a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
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HG01496.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
HG01255.hp2
HG01496.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.316+24775T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416124
chr1:113416128 G
G
 C
C
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c.316+24779G>C
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G
 T
T
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c.316+24779G>T
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T
 C
C
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c.316+24788T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416137
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TA
 T
T
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a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0011g0186
a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
HG04115.hp1
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c.316+24790delA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416137
chr1:113416138 A
A
 AATTATGT
others(194): Show 
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ATTATGTGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TT
 1 a0001c0001t0002g0189
a0001c0001t0002g0189
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HG00738.hp2
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others(205): Show 
c.316+24814_316+24815insATTATGTAATTAATGACACATATTAT
TATGTGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATATT
AATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
AATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
ATTATGTAATTAATGACACATATTA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416138
chr1:113416138 A
A
 AATTATGT
others(219): Show 
AATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
ATTATGTGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATT
 2 a0001c0001t0001g0143
a0001c0001t0002g0161
a0001c0001t0001g0143
a0001c0001t0002g0161
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NA18992.hp2
HG02559.hp1
NA18992.hp2
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others(230): Show 
c.316+24814_316+24815insATTATGTAATTAATGACACATATTAT
TATGTGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATATT
AATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
AATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
AATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATATTA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416138
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A
 AATTATGT
others(191): Show 
AATTATGTAATTAATGACACATATTATGTGTAATTAATGACACATATTAT
TATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
 2 a0001c0001t0001g0139
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a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0140
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HG01099.hp1
HG02976.hp2
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others(202): Show 
c.316+24815_316+24816insGTGTAATTAATGACACATATTATTAT
GTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATT
ATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATT
ATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTATTA
TGTAATTAATGACACATATTAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416138
chr1:113416138 A
A
 AATTATGT
others(166): Show 
AATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATAT
TATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACAT
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a0001c0001t0001g0157
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HG00741.hp1
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others(177): Show 
c.316+24820_316+24821insGTAATTAATGACACATATTATTATGT
GTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTAT
GTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTAT
GTAATTAATGACACATATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416138
chr1:113416138 A
A
 AATTATGT
others(169): Show 
AATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATAT
TATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATT
 15 a0001c0001t0001g0138
a0001c0001t0001g0151
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others(12): Show 
a0001c0001t0001g0138
a0001c0001t0001g0151
a0001c0001t0001g0152
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 15 HG00099.hp2
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others(12): Show 
HG00099.hp2
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others(180): Show 
c.316+24820_316+24821insGTAATTAATGACACATATTATTATGT
GTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTAT
GTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTAT
GTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416138
chr1:113416138 A
A
 AATTATGT
others(194): Show 
AATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATAT
TATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TT
 27 a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0144
others(24): Show 
a0001c0001t0001g0141
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a0001c0001t0001g0144
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a0001c0001t0001g0147
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HG02015.hp1
HG02965.hp1
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c.316+24820_316+24821insGTAATTAATGACACATATTATTATGT
GTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTAT
GTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTAT
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TAATTAATGACACATATTATTATGT
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chr1:113416138 A
A
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AATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATTA
TTATGTGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
T
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a0001c0001t0001g0164
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HG02647.hp1
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c.316+24820_316+24821insGTAATTAATGACACATTATTATGTGT
AATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATG
TAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATG
TAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGT
AATTAATGACACATATTATTATGT
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chr1:113416138 A
A
 ATTATGTG
others(144): Show 
ATTATGTGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TT
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a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0051
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a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0050
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HG03209.hp2
NA18939.hp1
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c.316+24789_316+24790insTTATGTGTAATTAATGACACATATTA
TTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
AATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
AATTATGTAATTAATGACACATATT
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chr1:113416138 A
A
 ATTATGTG
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ATTATGTGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATT
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a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0137
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0137
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HG01257.hp1
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HG01081.hp2
HG01257.hp1
HG03927.hp2
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others(180): Show 
c.316+24789_316+24790insTTATGTGTAATTAATGACACATATTA
TTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
AATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
AATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
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A
 G
G
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a0001c0001t0006g0062
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a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.316+24789A>G
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A
 T
T
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a0001c0002t0002g0209
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HG03490.hp1
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c.316+24790A>T
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A
 G
G
 1 a0001c0002t0002g0209
a0001c0002t0002g0209
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HG03490.hp1
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c.316+24793A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416142
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T
 G
G
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a0001c0002t0006g0132
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HG01496.hp1
HG02630.hp1
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c.316+24800T>G
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G
 C
C
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c.316+24804G>C
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G
 T
T
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.316+24804G>T
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T
 TC
TC
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others(64): Show 
HG00423.hp2
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others(5): Show 
c.316+24812_316+24813insC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416161
chr1:113416161 T
T
 TTATTATG
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TTATTATGTGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACA
TATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACA
TATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACA
TATTAATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACA
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a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0182
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HG01175.hp1
HG02897.hp1
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others(202): Show 
c.316+24820_316+24821insGTAATTAATGACACATATTATTATGT
GTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTAT
GTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTAT
GTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTATTATG
TAATTAATGACACATATTATGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416161
chr1:113416162 T
T
 A
A
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a0001c0001t0002g0089
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 67 HG00423.hp2
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others(64): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
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NA18998.hp1
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NA19091.hp1
NA20300.hp1
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NA20905.hp2
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c.316+24813T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416162
chr1:113416162 T
T
 TA
TA
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others(7): Show 
a0001c0001t0002g0192
a0001c0001t0002g0225
a0001c0001t0007g0129
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 10 HG00621.hp2
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others(7): Show 
HG00621.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
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HG02965.hp2
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NA19080.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24814dupA
c.316+24814dupA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416162
chr1:113416162 T
T
 TG
TG
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
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a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
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HG02055.hp2
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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others(5): Show 
c.316+24813_316+24814insG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416162
chr1:113416166 A
A
 ATG
ATG
 31 a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
others(28): Show 
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0001g0222
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HG00642.hp1
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others(28): Show 
HG00140.hp2
HG00642.hp1
HG01081.hp1
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HG01255.hp1
HG01261.hp1
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HG02922.hp1
HG03098.hp1
HG03490.hp1
HG03654.hp2
HG03927.hp1
HG04115.hp2
HG04199.hp2
HG04204.hp1
NA18947.hp1
NA18960.hp1
NA18978.hp1
NA19054.hp1
NA19058.hp2
NA19063.hp2
NA20752.hp1
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others(6): Show 
c.316+24819_316+24820dupGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416166
chr1:113416177 G
G
 C
C
 67 a0001c0001t0002g0072
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others(64): Show 
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
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a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0065
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a0001c0001t0003g0067
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a0001c0001t0005g0107
a0001c0001t0012g0073
 67 HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
others(64): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
HG01123.hp1
HG01243.hp1
HG01258.hp2
HG01496.hp2
HG01928.hp2
HG01943.hp1
HG01952.hp1
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NA18747.hp1
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NA18955.hp1
NA18960.hp2
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NA19011.hp1
NA19056.hp2
NA19060.hp2
NA19063.hp1
NA19070.hp1
NA19074.hp2
NA19077.hp2
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NA19081.hp1
NA19083.hp1
NA19091.hp1
NA20300.hp1
NA20752.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24828G>C
c.316+24828G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416177
chr1:113416177 G
G
 T
T
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.316+24828G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416177
chr1:113416183 T
T
 G
G
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a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
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c.316+24834T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416183
chr1:113416186 T
T
 C
C
 67 a0001c0001t0002g0072
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a0001c0001t0003g0055
others(64): Show 
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0059
a0001c0001t0003g0060
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a0001c0001t0003g0067
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a0001c0001t0012g0073
 67 HG00423.hp2
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HG01070.hp1
others(64): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
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NA18747.hp2
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NA18943.hp1
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NA18950.hp2
NA18952.hp2
NA18953.hp1
NA18955.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18965.hp1
NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA18971.hp2
NA18972.hp1
NA18973.hp2
NA18980.hp2
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NA18984.hp2
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NA18989.hp1
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NA18998.hp1
NA19000.hp2
NA19002.hp1
NA19003.hp2
NA19004.hp2
NA19006.hp1
NA19011.hp1
NA19056.hp2
NA19060.hp2
NA19063.hp1
NA19070.hp1
NA19074.hp2
NA19077.hp2
NA19078.hp2
NA19081.hp1
NA19083.hp1
NA19091.hp1
NA20300.hp1
NA20752.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24837T>C
c.316+24837T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416186
chr1:113416187 A
A
 AATTATGT
others(137): Show 
AATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
AATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
ATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACAT
 1 a0001c0002t0002g0216
a0001c0002t0002g0216
 1 HG04115.hp2
HG04115.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24863_316+2486
others(148): Show 
c.316+24863_316+24864insATTATGTAATTAATGACACATATTAA
TTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAT
TATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATATTATGT
AATTAATGACACATATTA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416187
chr1:113416187 A
A
 AATTATGT
others(62): Show 
AATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATATTA
TTATGTAATTAATGACACAT
 1 a0001c0001t0002g0225
a0001c0001t0002g0225
 1 NA19080.hp2
NA19080.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24869_316+2487
others(73): Show 
c.316+24869_316+24870insAATTAATGACACATATTATTATGTAA
TTAATGACACATATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416187
chr1:113416187 A
A
 ATTATGTG
others(118): Show 
ATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATT
 1 a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0160
 1 HG02630.hp2
HG02630.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24838_316+2483
others(129): Show 
c.316+24838_316+24839insTTATGTGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416187
chr1:113416187 A
A
 ATTATGTG
others(164): Show 
ATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TATTATGTAATTAATGACACAT
 5 a0001c0001t0004g0214
a0001c0002t0002g0212
a0001c0002t0002g0227
others(2): Show 
a0001c0001t0004g0214
a0001c0002t0002g0212
a0001c0002t0002g0227
a0001c0002t0002g0228
a0001c0002t0002g0229
 5 HG00642.hp1
HG01081.hp1
HG02293.hp1
others(2): Show 
HG00642.hp1
HG01081.hp1
HG02293.hp1
NA18947.hp1
NA19063.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24838_316+2483
others(175): Show 
c.316+24838_316+24839insTTATGTGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416187
chr1:113416187 A
A
 ATTATGTG
others(188): Show 
ATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACAT
 14 a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0002g0217
others(11): Show 
a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0002g0217
a0001c0001t0002g0219
a0001c0001t0004g0213
a0001c0002t0002g0208
a0001c0002t0002g0215
a0001c0002t0002g0220
a0001c0002t0002g0226
a0001c0002t0002g0230
a0001c0002t0002g0233
a0001c0002t0002g0235
a0001c0002t0002g0236
a0001c0002t0008g0221
 14 HG00140.hp2
HG01255.hp1
HG01517.hp2
others(11): Show 
HG00140.hp2
HG01255.hp1
HG01517.hp2
HG01943.hp2
HG02129.hp1
HG03654.hp2
HG03927.hp1
HG04199.hp2
HG04204.hp1
NA18960.hp1
NA18978.hp1
NA19054.hp1
NA19058.hp2
NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24838_316+2483
others(199): Show 
c.316+24838_316+24839insTTATGTGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATATTAT
TATGTAATTAATGACACAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416187
chr1:113416187 A
A
 ATTATGTG
others(259): Show 
ATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATATTA
TGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATATTATTA
TGTAATTAATGACACAT
 1 a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0222
 1 HG01346.hp2
HG01346.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24838_316+2483
others(270): Show 
c.316+24838_316+24839insTTATGTGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATATTAT
TATGTAATTAATGACACATATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGT
GTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416187
chr1:113416187 A
A
 ATTATGTG
others(163): Show 
ATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATATT
ATTATGTAATTAATGACACAT
 1 a0001c0001t0004g0234
a0001c0001t0004g0234
 1 HG02056.hp1
HG02056.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24838_316+2483
others(174): Show 
c.316+24838_316+24839insTTATGTGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
TTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416187
chr1:113416187 A
A
 ATTATGTG
others(164): Show 
ATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGATACATAT
TAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATAT
TATTATGTAATTAATGACACAT
 1 a0001c0002t0002g0210
a0001c0002t0002g0210
 1 HG01928.hp1
HG01928.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24838_316+2483
others(175): Show 
c.316+24838_316+24839insTTATGTGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGATACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416187
chr1:113416187 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24838A>G
c.316+24838A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416187
chr1:113416188 A
A
 T
T
 10 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0002g0192
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0002g0192
a0001c0001t0002g0223
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0002g0232
a0001c0002t0002g0224
a0001c0004t0002g0183
a0001c0004t0002g0195
a0001c0009t0002g0057
 10 HG00741.hp2
HG01175.hp2
HG01261.hp1
others(7): Show 
HG00741.hp2
HG01175.hp2
HG01261.hp1
HG02559.hp2
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HG02922.hp2
HG03041.hp2
HG03098.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24839A>T
c.316+24839A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416188
chr1:113416189 T
T
 TA
TA
 10 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0002g0192
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0002g0192
a0001c0001t0002g0223
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0002g0232
a0001c0002t0002g0224
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a0001c0004t0002g0195
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A
 G
G
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G
 C
C
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c.316+24853G>C
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G
 T
T
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HG02055.hp1
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c.316+24853G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416202
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T
 G
G
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a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
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HG00621.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
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c.316+24859T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416208
chr1:113416210 T
T
 TTAATTAT
others(184): Show 
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATAT
TATTATGTAATTAATGACACATATTATGTAATTAATGACACA
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a0001c0001t0002g0232
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0002g0232
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HG01261.hp1
HG02559.hp2
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others(195): Show 
c.316+24863_316+24864insATTATGTAATTAATGACACATATTAA
TTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAA
TTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAT
TATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATATTATGT
AATTAATGACACATA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416210
chr1:113416211 T
T
 C
C
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others(64): Show 
HG00423.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.316+24862T>C
c.316+24862T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416211
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T
 TA
TA
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others(1): Show 
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c.316+24863dupA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416211
chr1:113416211 T
T
 TG
TG
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
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HG02055.hp2
HG03209.hp1
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others(5): Show 
c.316+24862_316+24863insG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416211
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T
 A
A
 74 a0001c0001t0001g0184
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G
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c.316+24869_316+24870insAATTAATGACACAGATTAATTATGTA
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chr1:113416217 G
G
 GTAATTAA
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G
 C
C
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 T
T
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HG02055.hp1
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c.316+24879G>T
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T
 G
G
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c.316+24885T>G
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T
 C
C
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c.316+24888T>C
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chr1:113416237 TA
TA
 T
T
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HG00621.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.316+24890delA
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A
 G
G
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HG02055.hp1
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HG03209.hp1
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c.316+24889A>G
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A
 G
G
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T
 C
C
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c.316+24913T>C
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TA
 T
T
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a0001c0001t0007g0133
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
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HG01496.hp1
HG01255.hp2
HG01496.hp1
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c.316+24915delA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416262
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A
 G
G
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a0001c0001t0006g0062
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a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
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HG02055.hp2
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.316+24914A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416263
chr1:113416267 A
A
 G
G
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a0001c0002t0002g0058
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HG02004.hp2
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c.316+24918A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416267
chr1:113416271 AATTAATT
others(6): Show 
AATTAATTACACAT
 A
A
 1 a0001c0009t0002g0057
a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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others(17): Show 
c.316+24931_316+24943delCACATATTAATTA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416271
chr1:113416278 T
T
 C
C
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a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
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HG00621.hp1
HG01070.hp1
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NA19091.hp1
NA20300.hp1
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NA20905.hp2
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c.316+24929T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416278
chr1:113416278 T
T
 G
G
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NA21309.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.316+24929T>G
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T
 G
G
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HG02965.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24935T>G
c.316+24935T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416284
chr1:113416284 T
T
 TATTAATT
others(5): Show 
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 79 a0001c0001t0001g0049
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others(76): Show 
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a0001c0001t0001g0162
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others(16): Show 
c.316+24969_316+24980dupGTAATTAATTAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416284
chr1:113416284 T
T
 TATTAATT
others(204): Show 
TATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACA
TATTAATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACAT
ATTATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATA
TTATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACAT
ATTAATTATGTA
 1 a0001c0001t0002g0192
a0001c0001t0002g0192
 1 HG02922.hp2
HG02922.hp2
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others(215): Show 
c.316+24953_316+24954insGACACATATTAATTATGTAATTAATG
ACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGA
CACATATTATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGAC
ACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGA
CACATATTAATTATGTAATTAATTATGTAATTAAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416284
chr1:113416284 T
T
 TATTAATT
others(179): Show 
TATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACA
TATTATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATA
TTAATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACAT
ATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTA
 2 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
 2 HG02922.hp1
HG03098.hp1
HG02922.hp1
HG03098.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24953_316+2495
others(190): Show 
c.316+24953_316+24954insGACACATATTAATTATGTAATTAATG
ACACATATTATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGAC
ACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGA
CACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATTA
TGTAATTAAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416284
chr1:113416284 T
T
 TATTAATT
others(200): Show 
TATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACA
TATTATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATA
TTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTA
ATTATGTA
 2 a0001c0001t0002g0223
a0001c0002t0002g0224
a0001c0001t0002g0223
a0001c0002t0002g0224
 2 HG01175.hp2
HG02683.hp1
HG01175.hp2
HG02683.hp1
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others(211): Show 
c.316+24953_316+24954insGACACATATTAATTATGTAATTAATG
ACACATATTATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGAC
ACATATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACA
TATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACA
TATTAATTATGTAATTAATTATGTAATTAAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416284
chr1:113416284 T
T
 TATTATTA
others(151): Show 
TATTATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATA
TTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATATTA
TTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATT
AATTATGTA
 1 a0001c0002t0002g0209
a0001c0002t0002g0209
 1 HG03490.hp1
HG03490.hp1
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others(162): Show 
c.316+24939_316+24940insTTATGTAATTAATGACACATATTATT
ATGTAATTAATGACACATATTATGTAATTAATGACACATATTATTATGTG
TAATTAATGACACATATTATTATGTGTAATTAATGACACATATTAATTAT
GTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416284
chr1:113416287 T
T
 C
C
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others(64): Show 
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0059
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a0001c0001t0003g0091
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a0001c0001t0003g0101
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a0001c0001t0003g0104
a0001c0001t0003g0106
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a0001c0001t0003g0125
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a0001c0001t0003g0128
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a0001c0001t0005g0107
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 67 HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
others(64): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
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HG01243.hp1
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HG02004.hp1
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NA18747.hp2
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NA18989.hp1
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NA18998.hp1
NA19000.hp2
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NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24938T>C
c.316+24938T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416287
chr1:113416288 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24939A>G
c.316+24939A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416288
chr1:113416296 A
A
 AATTAATG
others(6): Show 
AATTAATGACACAT
 3 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
 3 HG00621.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG00621.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24953_316+2495
others(17): Show 
c.316+24953_316+24954insGACACATATTAAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416296
chr1:113416296 A
A
 AATTAATG
others(80): Show 
AATTAATGACACATATTATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTA
ATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGACACAT
 2 a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 2 HG02630.hp1
HG02965.hp2
HG02630.hp1
HG02965.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24953_316+2495
others(91): Show 
c.316+24953_316+24954insGACACATATTATTATGTAATTAATGA
CACATATTAATTATGTAATTAATGACACATATTAATTATGTAATTAATGA
CACATATTAAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416296
chr1:113416296 A
A
 AATTAATT
others(6): Show 
AATTAATTACACAT
 1 a0001c0002t0006g0132
a0001c0002t0006g0132
 1 homoSapiens_chm13v2.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24955_316+2495
others(17): Show 
c.316+24955_316+24956insCACATATTAATTA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416296
chr1:113416296 A
A
 AATTAATT
others(55): Show 
AATTAATTACACATATTATTATGTAATTAATTACACATATTAATTATGTA
ATTAATTACACAT
 1 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0061
 1 HG03209.hp1
HG03209.hp1
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others(66): Show 
c.316+24955_316+24956insCACATATTATTATGTAATTAATTACA
CATATTAATTATGTAATTAATTACACATATTAATTA
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chr1:113416296 A
A
 AATTAATT
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AATTAATTACACATATTGATTATGTAATTAATTACACATATTGATTATGT
AATTAATTACACATATTATTATGTAATTAATTACACATATTAATTATGTA
ATTAATTACACAT
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a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
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HG02055.hp2
HG02055.hp1
HG02055.hp2
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c.316+24955_316+24956insCACATATTGATTATGTAATTAATTAC
ACATATTGATTATGTAATTAATTACACATATTATTATGTAATTAATTACA
CATATTAATTATGTAATTAATTACACATATTAATTA
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T
 TAATCACA
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TAATCACACATATC
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a0001c0001t0003g0079
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HG02083.hp2
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chr1:113416299 T
T
 TAATCACA
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TAATCACACATATCAATTATGTAATTAATCACACATATC
 2 a0001c0001t0003g0082
a0001c0001t0003g0124
a0001c0001t0003g0082
a0001c0001t0003g0124
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NA18967.hp2
NA18965.hp1
NA18967.hp2
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ACACATATCAAT
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T
 TAATCACA
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TAATCACACATATC
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a0001c0001t0003g0115
a0001c0001t0003g0091
a0001c0001t0003g0115
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NA19074.hp2
NA18961.hp2
NA19074.hp2
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T
 TAATCACA
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a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0076
a0001c0001t0003g0087
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NA18944.hp1
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T
 TAATCACA
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TAATCACACATATC
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a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0108
a0001c0001t0003g0110
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NA18972.hp1
NA18994.hp2
NA19003.hp2
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chr1:113416299 T
T
 TAATCACA
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a0001c0001t0003g0067
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NA19011.hp1
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chr1:113416299 T
T
 TAATCACA
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TAATTACACATATC
 1 a0001c0001t0003g0070
a0001c0001t0003g0070
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HG01943.hp1
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chr1:113416299 T
T
 TAATCACA
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 12 a0001c0001t0002g0072
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a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0003g0068
a0001c0001t0003g0069
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others(9): Show 
HG00621.hp1
HG01070.hp1
HG01952.hp1
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NA18952.hp2
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chr1:113416299 T
T
 TAATCACA
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TAATCACACATATCAATTATGTAATTAATCACACATATCAATTATGTAAT
TAATCACACATATCAATTATGTAATTAATCACACATATCAATTATGTAAT
TAATTACACATATC
 20 a0001c0001t0003g0059
a0001c0001t0003g0066
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others(17): Show 
a0001c0001t0003g0059
a0001c0001t0003g0066
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a0001c0001t0003g0075
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HG00423.hp2
HG01123.hp1
HG01928.hp2
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c.316+24953_316+24954insCACACATATCAATTATGTAATTAATC
ACACATATCAATTATGTAATTAATCACACATATCAATTATGTAATTAATC
ACACATATCAATTATGTAATTAATTACACATATCAAT
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chr1:113416299 T
T
 TAATCACA
others(81): Show 
TAATCACACATATCAATTATGTAATTAATCACACATATCAATTATGTAAT
TAATCACACATATCAATTATGTAATTAATTACACATATC
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others(10): Show 
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0077
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a0001c0001t0003g0080
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a0001c0001t0003g0090
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HG01243.hp1
HG01258.hp2
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ACACATATCAAT
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T
 TAATCACA
others(56): Show 
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TAATTACACATATC
 3 a0001c0001t0003g0065
a0001c0001t0003g0092
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a0001c0001t0003g0065
a0001c0001t0003g0092
a0001c0001t0005g0105
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NA18960.hp2
NA18985.hp2
NA20752.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+24953_316+2495
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ACACATATCAATTATGTAATTAATTACACATATCAAT
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T
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others(6): Show 
TAATTACACATATC
 1 a0001c0001t0005g0083
a0001c0001t0005g0083
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NA18747.hp2
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c.316+24955_316+24956insCACATATCAATTA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416299
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AT
 A
A
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0169
a0001c0001t0001g0170
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others(1): Show 
NA18942.hp1
NA18948.hp2
NA18973.hp1
NA19000.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24954delT
c.316+24954delT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416301
chr1:113416303 T
T
 G
G
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24954T>G
c.316+24954T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416303
chr1:113416305 T
T
 C
C
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24956T>C
c.316+24956T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416305
chr1:113416306 G
G
 A
A
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24957G>A
c.316+24957G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416306
chr1:113416307 T
T
 C
C
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24958T>C
c.316+24958T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416307
chr1:113416327 T
T
 C
C
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+24978T>C
c.316+24978T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416327
chr1:113416329 T
T
 C
C
 1 a0001c0008t0009g0056
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A
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C
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c.316+24982T>C
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NA19082.hp1
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c.316+24983dupA
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T
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HG03834.hp2
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C
 T
T
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C
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T
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 C
C
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HG02300.hp1
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A
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G
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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c.316+24992A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0138
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HG03834.hp1
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c.316+24994A>G
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T
 C
C
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T
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C
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T
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C
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c.316+25002T>C
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 G
G
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HG03041.hp1
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c.316+25011T>G
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T
 A
A
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A
 T
T
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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T
 A
A
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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T
 C
C
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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T
 A
A
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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 T
T
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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A
 T
T
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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T
 A
A
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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c.316+25050T>A
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A
 T
T
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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c.316+25051A>T
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T
 A
A
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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c.316+25054T>A
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A
 T
T
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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A
 AT
AT
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HG03209.hp1
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c.316+25061dupT
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chr1:113416409 A
A
 G
G
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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c.316+25060A>G
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AATATATATTAATTATATATTATTTATATATCAATTATATATTAATTATA
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A
 AATATATA
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A
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TATATATATTAATATAT
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NA18983.hp2
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ATATATATAATATATATTAATTATATATATTAATATATAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416418
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A
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NA18747.hp1
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ATATATATTAATTATATATATTAATTATATATATTAATATATAT
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A
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NA18942.hp2
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TATATAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416418
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HG02056.hp2
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416420
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T
 TATATATT
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TAATTAATTTTATATATTAATTCTATATAGTTAATTATATATTAATTACA
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TATAATATATATTAATTATATATATTAATATATATTAATTATATA
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NA19077.hp2
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113416420
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T
 A
A
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NA18971.hp2
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A
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0066
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NA18971.hp2
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A
 T
T
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A
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T
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T
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0071
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c.316+25096G>A
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G
 C
C
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a0001c0001t0003g0079
a0001c0001t0003g0066
a0001c0001t0003g0079
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NA18971.hp2
HG02083.hp2
NA18971.hp2
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c.316+25096G>C
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chr1:113416445 G
G
 T
T
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AAT
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T
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A
 C
C
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G
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c.316+25117T>G
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A
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a0001c0001t0003g0102
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HG02056.hp2
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A
 ATTTATAT
ATTTATAT
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T
 G
G
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c.316+25120T>G
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T
 TTAATTTT
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TTAATTTTATATATTAATTCTATATAGTTAATTATATATTAATTACAGTT
AATATATATTAATATATAACTATATATTAATTATATATATATTAATATAT
ATTAATATATATTAATATATATATTAATATATATTAATTATATATATTAA
TTATATATATTAATATATATTAATTATATATATTAATTATATATATTTAT
ATAG
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a0001c0001t0001g0206
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HG03098.hp2
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c.316+25121_316+25122insAATTTTATATATTAATTCTATATAGT
TAATTATATATTAATTACAGTTAATATATATTAATATATAACTATATATT
AATTATATATATATTAATATATATTAATATATATTAATATATATATTAAT
ATATATTAATTATATATATTAATTATATATATTAATATATATTAATTATA
TATATTAATTATATATATTTATATAGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416469
chr1:113416469 T
T
 TTAATTTT
others(216): Show 
TTAATTTTATATATTAATTCTATATAGTTAATTATATATTAATTACAGTT
AATATATATTAATATATAACTATATATTAATTATATATATTAATATATAA
CTATATATTAATTATATATATTAATATATATTAATATATATTAATATATA
TATTAATATATATTAATTATATATATTAATTATATATATTAATATATATT
AATTAATTATATATATTTATATAG
 1 a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0001g0218
 1 HG03654.hp2
HG03654.hp2
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others(227): Show 
c.316+25121_316+25122insAATTTTATATATTAATTCTATATAGT
TAATTATATATTAATTACAGTTAATATATATTAATATATAACTATATATT
AATTATATATATTAATATATAACTATATATTAATTATATATATTAATATA
TATTAATATATATTAATATATATATTAATATATATTAATTATATATATTA
ATTATATATATTAATATATATTAATTAATTATATATATTTATATAGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416469
chr1:113416469 T
T
 TTAATTTT
others(181): Show 
TTAATTTTATATATTAATTCTATATAGTTAATTATATATTAATTACAGTT
AATATATATTAATATATAACTATATATTAATTATATATATTAATATATAT
AATATATATTAATTATATATATTAATATATATTAATTATATATATTAATA
TATATTAATTATATATATTAATTATATATATTTATATAG
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a0001c0001t0003g0079
a0001c0001t0003g0066
a0001c0001t0003g0079
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NA18971.hp2
HG02083.hp2
NA18971.hp2
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c.316+25121_316+25122insAATTTTATATATTAATTCTATATAGT
TAATTATATATTAATTACAGTTAATATATATTAATATATAACTATATATT
AATTATATATATTAATATATATAATATATATTAATTATATATATTAATAT
ATATTAATTATATATATTAATATATATTAATTATATATATTAATTATATA
TATTTATATAGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416469
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T
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others(173): Show 
TTAATTTTATATATTAATTCTATATAGTTAATTATATATTAATTACAGTT
AATATATATTAATATATAACTATATATTAATTATATATATTAATATATAT
ATTAATATATATTAATATATATATTAATTATATATATTAATATATATTAA
TTATATATATTAATTATATATATTTATATAG
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a0001c0001t0001g0138
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HG03834.hp1
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c.316+25121_316+25122insAATTTTATATATTAATTCTATATAGT
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AATTATATATATTAATATATATATTAATATATATTAATATATATATTAAT
TATATATATTAATATATATTAATTATATATATTAATTATATATATTTATA
TAGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416469
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T
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TTAATTTTATATATTAATTCTATATAGTTAATTATATATTAATTACAGTT
AATATATATTAATATATAACTATATATTAATTATATATATTAATATATAT
TAATATATAACTATATATTAATTATATATATTAATATATATTAATATATA
TTAATATATATATTAATATATATTGATTATATATATTAATTATATATATT
AATATATATTAATTATATATATTAATTATATATATTTATATAG
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a0001c0003t0002g0178
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NA21309.hp1
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TAATTATATATTAATTACAGTTAATATATATTAATATATAACTATATATT
AATTATATATATTAATATATATTAATATATAACTATATATTAATTATATA
TATTAATATATATTAATATATATTAATATATATATTAATATATATTGATT
ATATATATTAATTATATATATTAATATATATTAATTATATATATTAATTA
TATATATTTATATAGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113416469
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T
 TTAATTTT
others(182): Show 
TTAATTTTATATATTAATTCTATATAGTTAATTATATATTAATTACAGTT
AATATATATTAATATATAACTATATATTAATTATATATATTAATATATAT
TAATATATATATTAATATATATTAATTATATATATTAATTATATATAAAT
ATATATTAATTATATATATTAATTATATATATTTATATAG
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TATATATTAATTATATATAAATATATATTAATTATATATATTAATTATAT
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T
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ATATATATTAATATATATATTAATTATATATATTTATATAG
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TATAG
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A
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G
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T
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 A
A
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A
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C
 T
T
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NA18967.hp2
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 A
A
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a0001c0001t0003g0124
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T
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G
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a0001c0001t0003g0124
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A
 C
C
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a0001c0001t0003g0124
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A
 G
G
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a0001c0001t0003g0124
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NA18967.hp2
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c.316+25951A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0003g0124
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A
 T
T
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a0001c0001t0003g0124
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c.316+25955A>T
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A
 G
G
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G
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A
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c.316+26407G>A
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A
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A
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G
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c.316+26907A>G
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T
 C
C
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A
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C
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C
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C
 T
T
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C
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G
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G
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A
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A
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C
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c.316+30339delT
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T
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 T
T
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A
 G
G
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HG01496.hp1
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c.316+31296A>G
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A
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G
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C
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T
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G
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T
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a0001c0001t0003g0076
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A
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G
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c.316+31828A>G
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C
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T
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NA19083.hp1
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NA20905.hp2
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others(7): Show 
c.316+31896_316+31898delCGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113423243
chr1:113423244 TCG
TCG
 T
T
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a0001c0001t0003g0065
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others(14): Show 
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a0001c0001t0003g0065
a0001c0001t0003g0078
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 17 HG00423.hp2
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others(14): Show 
HG00423.hp2
HG01496.hp2
HG01928.hp2
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others(6): Show 
c.316+31896_316+31897delCG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113423244
chr1:113423259 T
T
 G
G
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a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0144
a0001c0001t0001g0163
 2 HG02897.hp1
NA18957.hp1
HG02897.hp1
NA18957.hp1
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c.316+31910T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113423259
chr1:113423259 T
T
 TG
TG
 44 a0001c0001t0001g0135
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a0001c0001t0001g0137
others(41): Show 
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a0001c0001t0001g0136
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a0001c0001t0001g0166
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 44 HG00642.hp1
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others(41): Show 
HG00642.hp1
HG00738.hp1
HG01081.hp1
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HG04204.hp1
NA18942.hp1
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NA19091.hp2
NA20752.hp1
NA20905.hp1
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c.316+31920dupG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113423259
chr1:113423260 G
G
 T
T
 71 a0001c0001t0002g0072
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others(68): Show 
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
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 71 HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
others(68): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
HG01123.hp1
HG01243.hp1
HG01258.hp2
HG01496.hp2
HG01928.hp2
HG01943.hp1
HG01952.hp1
HG02004.hp1
HG02015.hp2
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG02056.hp2
HG02071.hp1
HG02083.hp2
HG02293.hp2
HG02630.hp1
HG02965.hp2
HG03209.hp1
HG03239.hp1
HG03654.hp1
NA18747.hp1
NA18747.hp2
NA18939.hp2
NA18940.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18944.hp1
NA18950.hp2
NA18952.hp2
NA18953.hp1
NA18955.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18965.hp1
NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA18971.hp2
NA18972.hp1
NA18973.hp2
NA18980.hp2
NA18983.hp2
NA18984.hp2
NA18985.hp2
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18990.hp1
NA18992.hp1
NA18994.hp2
NA18998.hp1
NA19000.hp2
NA19002.hp1
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NA19070.hp1
NA19074.hp2
NA19077.hp2
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NA19081.hp1
NA19083.hp1
NA19091.hp1
NA20300.hp1
NA20752.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+31911G>T
c.316+31911G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113423260
chr1:113423263 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0159
a0001c0001t0002g0159
 1 HG02976.hp1
HG02976.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+31914G>C
c.316+31914G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113423263
chr1:113423526 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+32177G>A
c.316+32177G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113423526
chr1:113423930 C
C
 G
G
 1 a0001c0002t0002g0208
a0001c0002t0002g0208
 1 HG00140.hp2
HG00140.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+32581C>G
c.316+32581C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113423930
chr1:113424005 C
C
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0001g0194
 2 HG02965.hp1
NA20300.hp2
HG02965.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+32656C>A
c.316+32656C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113424005
chr1:113424182 G
G
 A
A
 4 a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0002g0232
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0002g0232
a0001c0002t0008g0221
 4 HG01261.hp1
HG01346.hp2
HG02559.hp2
others(1): Show 
HG01261.hp1
HG01346.hp2
HG02559.hp2
NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+32833G>A
c.316+32833G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113424182
chr1:113424200 G
G
 T
T
 225 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
others(222): Show 
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a0001c0001t0001g0010
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a0001c0001t0001g0148
a0001c0001t0001g0151
a0001c0001t0001g0152
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a0001c0001t0001g0162
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c.316+33703A>G
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A
 AT
AT
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c.316+33951dupT
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AT
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A
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c.316+33951delT
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chr1:113425273 ATT
ATT
 A
A
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NA18747.hp1
NA18747.hp2
NA18939.hp2
NA18940.hp1
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others(6): Show 
c.316+33950_316+33951delTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113425273
chr1:113425273 ATTT
ATTT
 A
A
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others(2): Show 
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 5 NA18953.hp1
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others(2): Show 
NA18953.hp1
NA18973.hp2
NA19056.hp2
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NA19070.hp1
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others(7): Show 
c.316+33949_316+33951delTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113425273
chr1:113425314 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0014g0063
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HG02055.hp2
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c.316+33965G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113425314
chr1:113425322 G
G
 A
A
 2 a0001c0003t0006g0130
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a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
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HG02965.hp2
HG02630.hp1
HG02965.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+33973G>A
c.316+33973G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113425322
chr1:113425443 C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
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 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+34094C>T
c.316+34094C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113425443
chr1:113425444 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0034
a0001c0001t0004g0034
 1 NA19004.hp1
NA19004.hp1
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c.316+34095G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113425444
chr1:113425744 C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.316+34395C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113425744
chr1:113425862 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
 2 HG02922.hp1
HG03098.hp1
HG02922.hp1
HG03098.hp1
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c.316+34513A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113425862
chr1:113425963 C
C
 A
A
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a0001c0001t0001g0196
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HG01123.hp2
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113425963
chr1:113426192 T
T
 TATGTTTA
others(4): Show 
TATGTTTAGAGA
 1 a0001c0001t0003g0101
a0001c0001t0003g0101
 1 NA19006.hp1
NA19006.hp1
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others(15): Show 
c.316+34844_316+34854dupATGTTTAGAGA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113426192
chr1:113426309 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0078
a0001c0001t0003g0078
 1 HG01496.hp2
HG01496.hp2
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c.316+34960G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113426309
chr1:113426795 T
T
 G
G
 3 a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0002t0006g0132
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0002t0006g0132
 3 HG01255.hp2
HG01496.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
HG01255.hp2
HG01496.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+35446T>G
c.316+35446T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113426795
chr1:113426954 C
C
 A
A
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
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HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.316+35605C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113426954
chr1:113426958 A
A
 C
C
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a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0001g0194
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NA20300.hp2
HG02965.hp1
NA20300.hp2
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c.316+35609A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113426958
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0189
a0001c0001t0002g0189
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HG00738.hp2
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c.316+35817G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113427166
chr1:113427282 A
A
 T
T
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a0001c0001t0001g0160
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HG02630.hp2
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c.316+35933A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113427282
chr1:113427307 C
C
 T
T
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a0001c0001t0010g0134
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NA21309.hp2
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c.316+35958C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113427307
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G
 A
A
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a0001c0002t0002g0226
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NA18960.hp1
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c.316+36781G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113428130
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 G
G
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c.316+36803A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113428152
chr1:113428347 C
C
 T
T
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a0001c0001t0003g0082
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NA18965.hp1
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c.316+36998C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113428347
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C
 A
A
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a0001c0001t0003g0081
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HG01243.hp1
HG02293.hp2
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c.316+37020C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113428369
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T
 C
C
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 A
A
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a0001c0001t0010g0134
a0001c0001t0003g0068
a0001c0001t0010g0134
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HG02004.hp1
NA21309.hp2
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c.316+38273G>A
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 A
A
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NA18983.hp2
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A
 C
C
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a0001c0001t0002g0189
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HG00738.hp2
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c.316+38366A>C
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C
 G
G
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a0001c0002t0002g0220
a0001c0001t0001g0211
a0001c0002t0002g0220
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 T
T
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T
 G
G
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 T
T
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 76 HG00423.hp2
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HG00621.hp2
others(73): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
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HG01070.hp1
HG01123.hp1
HG01243.hp1
HG01255.hp2
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HG01496.hp1
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HG02004.hp1
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NA20905.hp2
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c.316+38904A>T
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C
 T
T
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NA18983.hp2
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c.316+38940C>T
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G
 A
A
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others(97): Show 
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T
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C
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T
 C
C
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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T
 G
G
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a0001c0001t0001g0176
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T
 A
A
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a0001c0003t0013g0127
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HG02630.hp1
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A
 G
G
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a0001c0001t0003g0092
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NA18985.hp2
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G
 T
T
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G
 T
T
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a0001c0001t0003g0092
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NA18985.hp2
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A
 G
G
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G
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T
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T
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G
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A
 G
G
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HG01496.hp2
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A
 C
C
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HG02055.hp2
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c.316+41003A>C
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T
 A
A
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HG00621.hp2
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G
 A
A
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c.316+41155G>A
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G
 T
T
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c.316+41937G>T
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A
 G
G
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c.316+42047A>G
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T
 G
G
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HG01099.hp1
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c.316+42316T>G
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 A
A
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NA19011.hp2
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c.316+42486G>A
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 C
C
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c.316+43101G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0138
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HG03834.hp1
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c.316+43488C>T
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0206
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HG03098.hp2
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c.316+43577T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113434926
chr1:113434964 A
A
 C
C
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a0001c0001t0001g0196
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HG01123.hp2
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c.316+43615A>C
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chr1:113435112 C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
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a0001c0001t0006g0061
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HG03209.hp1
HG02055.hp1
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HG03209.hp1
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c.316+43763C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113435112
chr1:113435116 G
G
 T
T
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
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a0001c0001t0006g0061
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HG02055.hp1
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c.316+43767G>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
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c.316+43941A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0003g0091
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NA19074.hp2
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c.316+44095G>A
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chr1:113435637 C
C
 T
T
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a0001c0002t0002g0179
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HG01243.hp2
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c.316+44288C>T
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C
 T
T
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a0001c0001t0003g0076
a0001c0001t0003g0091
a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0076
a0001c0001t0003g0091
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NA18944.hp1
NA18980.hp2
NA19074.hp2
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c.316+44338C>T
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A
 G
G
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HG01069.hp2
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CAT
 C
C
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others(64): Show 
HG00423.hp2
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NA19083.hp1
NA19091.hp1
NA20300.hp1
NA20752.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+44695_316+4469
others(6): Show 
c.316+44695_316+44696delAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113436043
chr1:113436304 C
C
 A
A
 2 a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0114
a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0114
 2 NA18747.hp1
NA19000.hp2
NA18747.hp1
NA19000.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+44955C>A
c.316+44955C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113436304
chr1:113436306 C
C
 A
A
 10 a0001c0001t0002g0161
a0001c0001t0002g0219
a0001c0001t0003g0060
others(7): Show 
a0001c0001t0002g0161
a0001c0001t0002g0219
a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0074
a0001c0001t0003g0077
a0001c0001t0003g0090
a0001c0001t0003g0095
a0001c0001t0003g0114
a0001c0001t0004g0011
a0001c0001t0007g0129
 10 HG00423.hp1
HG00621.hp1
HG00621.hp2
others(7): Show 
HG00423.hp1
HG00621.hp1
HG00621.hp2
HG01517.hp2
HG02071.hp1
HG02559.hp1
NA18747.hp1
NA18986.hp2
NA19000.hp2
NA19081.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+44957C>A
c.316+44957C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113436306
chr1:113436308 A
A
 C
C
 5 a0001c0001t0002g0149
a0001c0001t0003g0116
a0001c0001t0004g0234
others(2): Show 
a0001c0001t0002g0149
a0001c0001t0003g0116
a0001c0001t0004g0234
a0001c0004t0002g0183
a0001c0008t0009g0056
 5 HG00140.hp1
HG00741.hp2
HG02056.hp1
others(2): Show 
HG00140.hp1
HG00741.hp2
HG02056.hp1
HG03041.hp1
NA19078.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+44959A>C
c.316+44959A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113436308
chr1:113436568 T
T
 TTTAATTA
others(30): Show 
TTTAATTAAAATGGAAAGGATATTATTTAACCATTGAG
 1 a0001c0001t0002g0039
a0001c0001t0002g0039
 1 NA18978.hp2
NA18978.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+45220_316+4525
others(41): Show 
c.316+45220_316+45256dupTTAATTAAAATGGAAAGGATATTATT
TAACCATTGAG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113436568
chr1:113436606 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0108
a0001c0001t0003g0108
 1 NA19063.hp1
NA19063.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+45257C>T
c.316+45257C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113436606
chr1:113436680 ACATCATT
others(5): Show 
ACATCATTTTTTT
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0139
 1 HG02976.hp2
HG02976.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+45332_316+4534
others(16): Show 
c.316+45332_316+45343delCATCATTTTTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113436680
chr1:113436811 C
C
 CT
CT
 11 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0003g0092
a0001c0001t0006g0062
others(8): Show 
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0003g0092
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0001t0014g0063
a0001c0002t0002g0203
a0001c0002t0006g0132
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 11 HG00621.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
others(8): Show 
HG00621.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG02300.hp2
HG02630.hp1
HG02965.hp2
HG03098.hp1
NA18985.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+45482dupT
c.316+45482dupT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113436811
chr1:113437103 C
C
 T
T
 3 a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 3 HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+45754C>T
c.316+45754C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437103
chr1:113437260 A
A
 G
G
 1 a0002c0006t0004g0037
a0002c0006t0004g0037
 1 HG00099.hp1
HG00099.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+45911A>G
c.316+45911A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437260
chr1:113437262 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0140
 1 HG01099.hp1
HG01099.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+45913A>G
c.316+45913A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437262
chr1:113437599 TA
TA
 T
T
 67 a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
others(64): Show 
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0059
a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0065
a0001c0001t0003g0066
a0001c0001t0003g0067
a0001c0001t0003g0068
a0001c0001t0003g0069
a0001c0001t0003g0070
a0001c0001t0003g0071
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a0001c0001t0003g0078
a0001c0001t0003g0079
a0001c0001t0003g0080
a0001c0001t0003g0081
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a0001c0001t0003g0087
a0001c0001t0003g0090
a0001c0001t0003g0091
a0001c0001t0003g0092
a0001c0001t0003g0093
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a0001c0001t0003g0099
a0001c0001t0003g0100
a0001c0001t0003g0101
a0001c0001t0003g0102
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a0001c0001t0003g0104
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a0001c0001t0003g0109
a0001c0001t0003g0110
a0001c0001t0003g0111
a0001c0001t0003g0112
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a0001c0001t0003g0120
a0001c0001t0003g0121
a0001c0001t0003g0122
a0001c0001t0003g0123
a0001c0001t0003g0124
a0001c0001t0003g0125
a0001c0001t0003g0126
a0001c0001t0003g0128
a0001c0001t0005g0064
a0001c0001t0005g0083
a0001c0001t0005g0088
a0001c0001t0005g0098
a0001c0001t0005g0105
a0001c0001t0005g0107
a0001c0001t0012g0073
 67 HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
others(64): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
HG01123.hp1
HG01243.hp1
HG01258.hp2
HG01496.hp2
HG01928.hp2
HG01943.hp1
HG01952.hp1
HG02004.hp1
HG02015.hp2
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HG02071.hp1
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HG02293.hp2
HG03239.hp1
HG03654.hp1
NA18747.hp1
NA18747.hp2
NA18939.hp2
NA18940.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18944.hp1
NA18950.hp2
NA18952.hp2
NA18953.hp1
NA18955.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18965.hp1
NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA18971.hp2
NA18972.hp1
NA18973.hp2
NA18980.hp2
NA18983.hp2
NA18984.hp2
NA18985.hp2
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18990.hp1
NA18992.hp1
NA18994.hp2
NA18998.hp1
NA19000.hp2
NA19002.hp1
NA19003.hp2
NA19004.hp2
NA19006.hp1
NA19011.hp1
NA19056.hp2
NA19060.hp2
NA19063.hp1
NA19070.hp1
NA19074.hp2
NA19077.hp2
NA19078.hp2
NA19081.hp1
NA19083.hp1
NA19091.hp1
NA20300.hp1
NA20752.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46251delA
c.316+46251delA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437599
chr1:113437644 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0012g0073
a0001c0001t0012g0073
 1 NA19004.hp2
NA19004.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46295C>T
c.316+46295C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437644
chr1:113437723 CTTCT
CTTCT
 C
C
 6 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
others(3): Show 
a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0002t0006g0132
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 6 HG00621.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
others(3): Show 
HG00621.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46380_316+4638
others(8): Show 
c.316+46380_316+46383delTCTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437723
chr1:113437769 TCTTC
TCTTC
 T
T
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46425_316+4642
others(8): Show 
c.316+46425_316+46428delCTTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437769
chr1:113437798 T
T
 TTCTTCTT
others(5): Show 
TTCTTCTTTCTTC
 1 a0001c0002t0002g0031
a0001c0002t0002g0031
 1 NA18961.hp1
NA18961.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46450_316+4645
others(16): Show 
c.316+46450_316+46451insCTTCTTTCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437798
chr1:113437798 TTTCTTCT
others(13): Show 
TTTCTTCTTTTCTTCTTCTTC
 T
T
 1 a0001c0002t0002g0224
a0001c0002t0002g0224
 1 HG01175.hp2
HG01175.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46458_316+4647
others(24): Show 
c.316+46458_316+46477delTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437798
chr1:113437806 T
T
 C
C
 6 a0001c0001t0003g0080
a0001c0001t0003g0081
a0001c0001t0003g0082
others(3): Show 
a0001c0001t0003g0080
a0001c0001t0003g0081
a0001c0001t0003g0082
a0001c0001t0004g0002
a0001c0001t0004g0003
a0001c0001t0007g0129
 6 HG00621.hp2
HG01243.hp1
HG02293.hp2
others(3): Show 
HG00621.hp2
HG01243.hp1
HG02293.hp2
NA18965.hp1
NA18967.hp1
NA19006.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46457T>C
c.316+46457T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437806
chr1:113437806 T
T
 TCTTCTTC
others(12): Show 
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTC
 1 a0001c0002t0002g0007
a0001c0002t0002g0007
 1 NA19078.hp1
NA19078.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46457_316+4645
others(23): Show 
c.316+46457_316+46458insCTTCTTCTTCTTCTTCTTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437806
chr1:113437806 T
T
 TTTCTTCT
others(2): Show 
TTTCTTCTTC
 4 a0001c0001t0001g0199
a0001c0001t0004g0191
a0001c0002t0002g0197
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0199
a0001c0001t0004g0191
a0001c0002t0002g0197
a0001c0002t0002g0198
 4 HG01109.hp1
HG01346.hp1
HG02738.hp2
others(1): Show 
HG01109.hp1
HG01346.hp1
HG02738.hp2
HG04199.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46506_316+4651
others(13): Show 
c.316+46506_316+46514dupTTCTTCTTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437806
chr1:113437806 T
T
 TTTCTTCT
others(5): Show 
TTTCTTCTTCTTC
 1 a0001c0002t0002g0203
a0001c0002t0002g0203
 1 HG02300.hp2
HG02300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46503_316+4651
others(16): Show 
c.316+46503_316+46514dupTTCTTCTTCTTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437806
chr1:113437831 TTCTTCTT
others(26): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0157
 1 HG00741.hp1
HG00741.hp1
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others(37): Show 
c.316+46498_316+46530delTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTTC
TTCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437831
chr1:113437835 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0166
 2 HG01099.hp1
HG01433.hp1
HG01099.hp1
HG01433.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46486T>C
c.316+46486T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437835
chr1:113437837 TTCTTCTT
others(20): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0140
 2 HG01099.hp1
NA18984.hp1
HG01099.hp1
NA18984.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46504_316+4653
others(31): Show 
c.316+46504_316+46530delTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTC
T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437837
chr1:113437840 TTCTTCTT
others(17): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 T
T
 3 a0001c0001t0001g0163
a0001c0009t0002g0057
a0004c0005t0001g0175
a0001c0001t0001g0163
a0001c0009t0002g0057
a0004c0005t0001g0175
 3 HG02897.hp1
HG02897.hp2
NA18990.hp2
HG02897.hp1
HG02897.hp2
NA18990.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46507_316+4653
others(28): Show 
c.316+46507_316+46530delTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437840
chr1:113437841 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0166
 1 HG01433.hp1
HG01433.hp1
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c.316+46492T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437841
chr1:113437843 TTCTTCTT
others(14): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 T
T
 7 a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0181
others(4): Show 
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0181
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0002g0149
a0001c0001t0002g0161
a0001c0002t0002g0220
 7 HG00140.hp1
HG01433.hp1
HG02559.hp1
others(4): Show 
HG00140.hp1
HG01433.hp1
HG02559.hp1
HG02965.hp1
HG03927.hp1
NA18939.hp1
NA19091.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46510_316+4653
others(25): Show 
c.316+46510_316+46530delTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437843
chr1:113437844 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0010g0134
a0001c0001t0010g0134
 1 NA21309.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46495T>C
c.316+46495T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437844
chr1:113437846 TTCTTCTT
others(11): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 T
T
 9 a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0144
a0001c0001t0001g0147
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0144
a0001c0001t0001g0147
a0001c0001t0001g0148
a0001c0001t0001g0165
a0001c0001t0001g0172
a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0002g0207
 9 HG01069.hp1
HG01175.hp1
HG03209.hp2
others(6): Show 
HG01069.hp1
HG01175.hp1
HG03209.hp2
HG04204.hp1
NA18943.hp2
NA18957.hp1
NA18986.hp1
NA19003.hp1
NA19077.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46513_316+4653
others(22): Show 
c.316+46513_316+46530delTCCTCTTCTTCTTCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437846
chr1:113437847 T
T
 C
C
 10 a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0143
a0001c0001t0001g0158
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0143
a0001c0001t0001g0158
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0002g0159
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0234
a0001c0002t0002g0209
a0001c0002t0002g0212
 10 HG00099.hp2
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others(7): Show 
HG00099.hp2
HG00642.hp1
HG02056.hp1
HG02559.hp2
HG02647.hp1
HG02976.hp1
HG02976.hp2
HG03490.hp1
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NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46498T>C
c.316+46498T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437847
chr1:113437849 TTCTTCTT
others(8): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCC
 T
T
 13 a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0167
others(10): Show 
a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0167
a0001c0001t0001g0171
a0001c0001t0001g0174
a0001c0001t0001g0177
a0001c0001t0001g0188
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a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0173
a0001c0002t0002g0230
a0001c0004t0002g0183
 13 HG00741.hp2
HG02129.hp1
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others(10): Show 
HG00741.hp2
HG02129.hp1
HG02559.hp2
HG02647.hp2
HG02738.hp1
NA18952.hp1
NA18972.hp2
NA18980.hp1
NA18985.hp1
NA18995.hp2
NA19002.hp2
NA19064.hp2
NA19082.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46515_316+4652
others(19): Show 
c.316+46515_316+46529delCTCTTCTTCTTCTTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437849
chr1:113437850 T
T
 C
C
 11 a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0146
others(8): Show 
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0146
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0002g0225
a0001c0001t0003g0066
a0001c0001t0003g0102
a0001c0001t0010g0134
a0001c0002t0002g0208
a0001c0002t0002g0226
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 11 HG00140.hp2
HG01346.hp2
HG02056.hp2
others(8): Show 
HG00140.hp2
HG01346.hp2
HG02056.hp2
NA18947.hp1
NA18950.hp1
NA18960.hp1
NA18971.hp2
NA19074.hp1
NA19080.hp2
NA19083.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46501T>C
c.316+46501T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437850
chr1:113437850 T
T
 TCTC
TCTC
 3 a0001c0001t0003g0075
a0001c0001t0003g0080
a0001c0001t0003g0123
a0001c0001t0003g0075
a0001c0001t0003g0080
a0001c0001t0003g0123
 3 HG00423.hp2
HG02293.hp2
NA18939.hp2
HG00423.hp2
HG02293.hp2
NA18939.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46503_316+4650
others(7): Show 
c.316+46503_316+46504insCCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437850
chr1:113437852 TTCTTCTT
others(5): Show 
TTCTTCTTCTTCC
 T
T
 9 a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0146
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0146
a0001c0001t0001g0153
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0002g0192
a0001c0001t0003g0099
a0001c0001t0003g0112
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 9 HG01952.hp2
HG02922.hp1
HG02922.hp2
others(6): Show 
HG01952.hp2
HG02922.hp1
HG02922.hp2
NA18947.hp1
NA18950.hp1
NA18953.hp2
NA18984.hp2
NA18998.hp1
NA19074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46515_316+4652
others(16): Show 
c.316+46515_316+46526delCTCTTCTTCTTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437852
chr1:113437853 T
T
 C
C
 29 a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0143
others(26): Show 
a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0143
a0001c0001t0001g0151
a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0001g0158
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0002g0039
a0001c0001t0002g0159
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a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0067
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a0001c0001t0003g0114
a0001c0001t0003g0117
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a0001c0002t0002g0210
a0001c0002t0002g0212
a0001c0002t0002g0216
a0001c0002t0002g0227
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 29 HG00099.hp2
HG00642.hp1
HG01123.hp1
others(26): Show 
HG00099.hp2
HG00642.hp1
HG01123.hp1
HG01192.hp1
HG01261.hp1
HG01261.hp2
HG01517.hp2
HG01928.hp1
HG01943.hp2
HG01952.hp1
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HG02293.hp1
HG02647.hp1
HG02976.hp1
HG02976.hp2
HG03490.hp1
HG04115.hp1
HG04115.hp2
NA18747.hp1
NA18978.hp1
NA18978.hp2
NA18985.hp2
NA18992.hp2
NA18998.hp2
NA19000.hp2
NA19011.hp1
NA19054.hp1
NA20300.hp2
NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46504T>C
c.316+46504T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437853
chr1:113437855 TTCTTCTT
others(2): Show 
TTCTTCTTCC
 T
T
 9 a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0151
a0001c0001t0001g0152
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0151
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0158
a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0001g0206
a0001c0001t0002g0089
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a0001c0001t0004g0213
 9 HG00099.hp2
HG01192.hp1
HG01516.hp2
others(6): Show 
HG00099.hp2
HG01192.hp1
HG01516.hp2
HG01943.hp2
HG01952.hp1
HG03098.hp2
NA18983.hp2
NA18998.hp2
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46515_316+4652
others(13): Show 
c.316+46515_316+46523delCTCTTCTTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437855
chr1:113437856 T
T
 C
C
 25 a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0145
others(22): Show 
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0169
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0002g0217
a0001c0001t0002g0225
a0001c0001t0003g0066
a0001c0001t0003g0075
a0001c0001t0003g0080
a0001c0001t0003g0102
a0001c0001t0003g0120
a0001c0001t0003g0123
a0001c0001t0004g0214
a0001c0001t0005g0105
a0001c0001t0010g0134
a0001c0002t0002g0058
a0001c0002t0002g0208
a0001c0002t0002g0215
a0001c0002t0002g0226
a0001c0002t0002g0233
 25 HG00140.hp2
HG00423.hp2
HG01070.hp1
others(22): Show 
HG00140.hp2
HG00423.hp2
HG01070.hp1
HG01081.hp1
HG01081.hp2
HG01255.hp1
HG01346.hp2
HG02004.hp2
HG02056.hp2
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HG03654.hp2
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NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18948.hp2
NA18960.hp1
NA18960.hp2
NA18971.hp2
NA18973.hp1
NA19000.hp1
NA19058.hp2
NA19080.hp2
NA19083.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46507T>C
c.316+46507T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437856
chr1:113437856 T
T
 TCTC
TCTC
 3 a0001c0001t0003g0097
a0001c0001t0003g0124
a0001c0002t0002g0228
a0001c0001t0003g0097
a0001c0001t0003g0124
a0001c0002t0002g0228
 3 NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA19063.hp2
NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA19063.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46509_316+4651
others(7): Show 
c.316+46509_316+46510insCCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437856
chr1:113437856 T
T
 TCTCCTTC
others(2): Show 
TCTCCTTCTC
 3 a0001c0001t0003g0078
a0001c0001t0003g0079
a0001c0001t0003g0118
a0001c0001t0003g0078
a0001c0001t0003g0079
a0001c0001t0003g0118
 3 HG01496.hp2
HG02083.hp2
HG03654.hp1
HG01496.hp2
HG02083.hp2
HG03654.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46509_316+4651
others(13): Show 
c.316+46509_316+46510insCCTTCTCCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437856
chr1:113437856 T
T
 TCTCCTTC
others(14): Show 
TCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTC
 1 a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0168
 1 NA20905.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46509_316+4651
others(25): Show 
c.316+46509_316+46510insCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437856
chr1:113437856 TCTTCTTC
others(17): Show 
TCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTC
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0006g0061
 2 HG03098.hp1
HG03209.hp1
HG03098.hp1
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46513_316+4653
others(28): Show 
c.316+46513_316+46536delTCCTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437856
chr1:113437858 TTCTTCC
TTCTTCC
 T
T
 9 a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0002g0217
a0001c0001t0005g0098
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0002g0217
a0001c0001t0005g0098
a0001c0001t0010g0134
a0001c0002t0002g0156
a0001c0002t0002g0179
a0001c0002t0002g0226
a0001c0003t0002g0178
a0001c0004t0002g0195
 9 HG01243.hp2
HG01255.hp1
HG01346.hp2
others(6): Show 
HG01243.hp2
HG01255.hp1
HG01346.hp2
HG03041.hp2
HG03239.hp2
NA18960.hp1
NA18989.hp1
NA21309.hp1
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46515_316+4652
others(10): Show 
c.316+46515_316+46520delCTCTTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437858
chr1:113437859 T
T
 C
C
 30 a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0143
a0001c0001t0001g0154
others(27): Show 
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0143
a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0162
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0002g0039
a0001c0001t0002g0159
a0001c0001t0002g0219
a0001c0001t0002g0223
a0001c0001t0002g0232
a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0065
a0001c0001t0003g0067
a0001c0001t0003g0068
a0001c0001t0003g0092
a0001c0001t0003g0114
a0001c0001t0003g0117
a0001c0001t0004g0234
a0001c0001t0005g0088
a0001c0001t0011g0186
a0001c0002t0002g0209
a0001c0002t0002g0210
a0001c0002t0002g0212
a0001c0002t0002g0216
a0001c0002t0002g0227
a0001c0002t0002g0235
a0001c0002t0002g0236
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a0001c0002t0008g0221
 30 HG00642.hp1
HG01123.hp1
HG01261.hp1
others(27): Show 
HG00642.hp1
HG01123.hp1
HG01261.hp1
HG01261.hp2
HG01517.hp2
HG01928.hp1
HG02004.hp1
HG02015.hp1
HG02056.hp1
HG02293.hp1
HG02630.hp2
HG02647.hp1
HG02683.hp1
HG02976.hp1
HG02976.hp2
HG03490.hp1
HG04115.hp1
HG04115.hp2
NA18747.hp1
NA18940.hp1
NA18978.hp1
NA18978.hp2
NA18985.hp2
NA18992.hp2
NA19000.hp2
NA19011.hp1
NA19054.hp1
NA20752.hp1
NA20752.hp2
NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46510T>C
c.316+46510T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437859
chr1:113437859 TCTTCCTC
others(14): Show 
TCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTC
 T
T
 1 a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0014g0063
 1 HG02055.hp2
HG02055.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46515_316+4653
others(25): Show 
c.316+46515_316+46535delCTCTTCTTCTTCTTCTCCTTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437859
chr1:113437859 TCTTCCTC
others(26): Show 
TCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTC
 T
T
 1 a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0131
 1 HG01496.hp1
HG01496.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46515_316+4654
others(37): Show 
c.316+46515_316+46547delCTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTCCTT
CTCCTTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437859
chr1:113437861 TTCC
TTCC
 T
T
 36 a0001c0001t0001g0138
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0143
others(33): Show 
a0001c0001t0001g0138
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0143
a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0162
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0002g0039
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0159
a0001c0001t0002g0219
a0001c0001t0002g0223
a0001c0001t0002g0232
a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0065
a0001c0001t0003g0067
a0001c0001t0003g0068
a0001c0001t0003g0092
a0001c0001t0003g0096
a0001c0001t0003g0103
a0001c0001t0003g0114
a0001c0001t0003g0117
a0001c0001t0003g0122
a0001c0001t0004g0036
a0001c0001t0004g0234
a0001c0001t0007g0133
a0001c0001t0011g0186
a0001c0002t0002g0209
a0001c0002t0002g0210
a0001c0002t0002g0212
a0001c0002t0002g0216
a0001c0002t0002g0227
a0001c0002t0002g0235
a0001c0002t0002g0236
a0001c0002t0008g0155
a0001c0002t0008g0221
 36 HG00642.hp1
HG01123.hp1
HG01255.hp2
others(33): Show 
HG00642.hp1
HG01123.hp1
HG01255.hp2
HG01261.hp1
HG01261.hp2
HG01517.hp2
HG01928.hp1
HG01928.hp2
HG02004.hp1
HG02015.hp1
HG02056.hp1
HG02293.hp1
HG02630.hp2
HG02647.hp1
HG02683.hp1
HG02976.hp1
HG02976.hp2
HG03490.hp1
HG03834.hp1
HG04115.hp1
HG04115.hp2
NA18747.hp1
NA18952.hp2
NA18953.hp1
NA18965.hp2
NA18978.hp1
NA18978.hp2
NA18985.hp2
NA18992.hp2
NA19000.hp2
NA19011.hp1
NA19054.hp1
NA19056.hp2
NA20752.hp1
NA20752.hp2
NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46515_316+4651
others(7): Show 
c.316+46515_316+46517delCTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437861
chr1:113437862 T
T
 C
C
 40 a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0137
others(37): Show 
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0137
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0169
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0002g0189
a0001c0001t0002g0225
a0001c0001t0003g0059
a0001c0001t0003g0066
a0001c0001t0003g0075
a0001c0001t0003g0078
a0001c0001t0003g0079
a0001c0001t0003g0080
a0001c0001t0003g0082
a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0097
a0001c0001t0003g0102
a0001c0001t0003g0104
a0001c0001t0003g0108
a0001c0001t0003g0110
a0001c0001t0003g0118
a0001c0001t0003g0120
a0001c0001t0003g0121
a0001c0001t0003g0123
a0001c0001t0003g0124
a0001c0001t0003g0125
a0001c0001t0003g0128
a0001c0001t0004g0214
a0001c0001t0005g0105
a0001c0002t0002g0058
a0001c0002t0002g0208
a0001c0002t0002g0215
a0001c0002t0002g0228
a0001c0002t0002g0233
 40 HG00140.hp2
HG00423.hp2
HG00738.hp2
others(37): Show 
HG00140.hp2
HG00423.hp2
HG00738.hp2
HG01070.hp1
HG01081.hp1
HG01081.hp2
HG01257.hp1
HG01496.hp2
HG02004.hp2
HG02015.hp2
HG02056.hp2
HG02083.hp2
HG02293.hp2
HG03239.hp1
HG03654.hp1
HG03654.hp2
HG03927.hp2
HG04199.hp2
NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18948.hp2
NA18955.hp1
NA18960.hp2
NA18965.hp1
NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA18971.hp2
NA18972.hp1
NA18973.hp1
NA18994.hp2
NA19000.hp1
NA19003.hp2
NA19058.hp2
NA19063.hp1
NA19063.hp2
NA19080.hp2
NA19083.hp2
NA20300.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46513T>C
c.316+46513T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437862
chr1:113437862 T
T
 TCTC
TCTC
 3 a0001c0001t0003g0084
a0001c0001t0003g0095
a0001c0001t0003g0101
a0001c0001t0003g0084
a0001c0001t0003g0095
a0001c0001t0003g0101
 3 HG00621.hp1
NA19006.hp1
NA19083.hp1
HG00621.hp1
NA19006.hp1
NA19083.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46514_316+4651
others(7): Show 
c.316+46514_316+46515insTCC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437862
chr1:113437862 T
T
 TCTCCTTC
others(8): Show 
TCTCCTTCTCCTTCTC
 2 a0001c0001t0001g0196
a0001c0001t0003g0116
a0001c0001t0001g0196
a0001c0001t0003g0116
 2 HG01123.hp2
NA19078.hp2
HG01123.hp2
NA19078.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46514_316+4651
others(19): Show 
c.316+46514_316+46515insTCCTTCTCCTTCTCC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437862
chr1:113437862 T
T
 TCTCCTTC
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TCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTC
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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 T
T
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a0001c0003t0013g0127
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HG02630.hp1
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CTCCTTCTCCTTCTCC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437862
chr1:113437864 C
C
 T
T
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c.316+46515C>T
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C
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c.316+46519T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437868
chr1:113437868 T
T
 TCTCCTTC
others(8): Show 
TCTCCTTCTCCTTCTC
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a0001c0001t0003g0113
a0001c0001t0012g0073
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NA19004.hp2
NA19002.hp1
NA19004.hp2
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c.316+46521_316+46522insCCTTCTCCTTCTCCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437868
chr1:113437868 T
T
 TCTCCTTC
others(14): Show 
TCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTC
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a0001c0001t0003g0115
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NA18961.hp2
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others(25): Show 
c.316+46521_316+46522insCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437868
chr1:113437870 T
T
 TTCC
TTCC
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a0001c0001t0004g0017
a0001c0001t0004g0009
a0001c0001t0004g0017
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NA19080.hp1
HG04204.hp2
NA19080.hp1
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others(7): Show 
c.316+46523_316+46524insCTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437870
chr1:113437870 T
T
 TTCTTCTT
others(8): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCC
 1 a0001c0001t0004g0005
a0001c0001t0004g0005
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NA18947.hp2
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others(19): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCCTCTTCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437870
chr1:113437870 T
T
 TTCTTCTT
others(14): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 1 a0001c0001t0002g0033
a0001c0001t0002g0033
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NA18948.hp1
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others(25): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437870
chr1:113437870 T
T
 TTCTTCTT
others(20): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 1 a0001c0001t0004g0013
a0001c0001t0004g0013
 1 NA18944.hp2
NA18944.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46530_316+4653
others(31): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTTC
T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437870
chr1:113437870 T
T
 TTCTTCTT
others(23): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 1 a0001c0001t0004g0004
a0001c0001t0004g0004
 1 HG02071.hp2
HG02071.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46530_316+4653
others(34): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTC
TTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437870
chr1:113437874 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0050
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NA19074.hp1
NA19074.hp2
NA19077.hp1
NA19077.hp2
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NA20300.hp1
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NA20905.hp1
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NA21309.hp1
NA21309.hp2
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c.316+46525T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437874
chr1:113437874 T
T
 TCTTCTTC
others(41): Show 
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTC
 1 a0001c0002t0002g0008
a0001c0002t0002g0008
 1 NA18989.hp2
NA18989.hp2
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others(52): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTC
TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCT
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chr1:113437876 T
T
 C
C
 4 a0001c0001t0004g0017
a0001c0001t0004g0036
a0001c0001t0004g0041
others(1): Show 
a0001c0001t0004g0017
a0001c0001t0004g0036
a0001c0001t0004g0041
a0001c0002t0002g0007
 4 HG02683.hp2
NA18965.hp2
NA19078.hp1
others(1): Show 
HG02683.hp2
NA18965.hp2
NA19078.hp1
NA19080.hp1
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c.316+46527T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437876
chr1:113437876 T
T
 TTCTTCC
TTCTTCC
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a0001c0002t0002g0044
a0001c0001t0001g0010
a0001c0002t0002g0044
 2 HG01099.hp2
NA18968.hp2
HG01099.hp2
NA18968.hp2
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others(10): Show 
c.316+46530_316+46531insTCCTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437876
chr1:113437876 T
T
 TTCTTCTT
others(2): Show 
TTCTTCTTCC
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a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0004g0019
 2 HG01070.hp2
HG02129.hp2
HG01070.hp2
HG02129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46530_316+4653
others(13): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCCTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437876
chr1:113437876 T
T
 TTCTTCTT
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TTCTTCTTCTTCC
 4 a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0004g0045
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0004g0045
a0001c0002t0002g0042
a0001c0002t0002g0048
 4 HG01109.hp2
HG01433.hp2
HG02083.hp1
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HG01109.hp2
HG01433.hp2
HG02083.hp1
NA19070.hp2
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others(16): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCTTCCTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437876
chr1:113437876 T
T
 TTCTTCTT
others(8): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCC
 1 a0001c0001t0004g0011
a0001c0001t0004g0011
 1 HG00423.hp1
HG00423.hp1
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others(19): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCTTCTTCCTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437876
chr1:113437876 T
T
 TTCTTCTT
others(11): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 3 a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0004g0022
a0001c0001t0004g0040
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0004g0022
a0001c0001t0004g0040
 3 HG01192.hp2
HG02300.hp1
NA18994.hp1
HG01192.hp2
HG02300.hp1
NA18994.hp1
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others(22): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCTTCTTCTTCCTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437876
chr1:113437876 T
T
 TTCTTCTT
others(14): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 2 a0001c0001t0002g0038
a0001c0001t0004g0023
a0001c0001t0002g0038
a0001c0001t0004g0023
 2 NA18940.hp2
NA18971.hp1
NA18940.hp2
NA18971.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46530_316+4653
others(25): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437876
chr1:113437876 T
T
 TTCTTCTT
others(17): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 4 a0001c0001t0001g0024
a0001c0001t0002g0006
a0001c0001t0004g0012
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0024
a0001c0001t0002g0006
a0001c0001t0004g0012
a0001c0002t0002g0043
 4 HG03490.hp2
NA19058.hp1
NA19081.hp2
others(1): Show 
HG03490.hp2
NA19058.hp1
NA19081.hp2
NA19082.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46530_316+4653
others(28): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437876
chr1:113437876 T
T
 TTCTTCTT
others(20): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 2 a0001c0001t0004g0035
a0001c0001t0004g0047
a0001c0001t0004g0035
a0001c0001t0004g0047
 2 NA18995.hp1
NA19064.hp1
NA18995.hp1
NA19064.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46530_316+4653
others(31): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTC
T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437876
chr1:113437876 T
T
 TTCTTCTT
others(23): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 1 a0001c0001t0004g0025
a0001c0001t0004g0025
 1 NA19060.hp1
NA19060.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46530_316+4653
others(34): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC
CTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437876
chr1:113437876 T
T
 TTCTTCTT
others(26): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 1 a0001c0001t0004g0014
a0001c0001t0004g0014
 1 NA19054.hp2
NA19054.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46530_316+4653
others(37): Show 
c.316+46530_316+46531insTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC
TTCCTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437876
chr1:113437877 TCTCCTTC
others(2): Show 
TCTCCTTCTC
 T
T
 2 a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0007g0129
 2 HG00621.hp2
HG02055.hp1
HG00621.hp2
HG02055.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46531_316+4653
others(13): Show 
c.316+46531_316+46539delCCTTCTCCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437877
chr1:113437880 C
C
 T
T
 41 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
others(38): Show 
a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
a0001c0001t0001g0024
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0002g0006
a0001c0001t0002g0016
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a0001c0001t0004g0002
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 41 HG00099.hp1
HG00423.hp1
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others(38): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp1
HG00642.hp2
HG01070.hp2
HG01099.hp2
HG01109.hp2
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HG01517.hp1
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NA18955.hp2
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NA18961.hp1
NA18962.hp2
NA18965.hp2
NA18967.hp1
NA18968.hp2
NA18971.hp1
NA18983.hp1
NA18994.hp1
NA18995.hp1
NA19004.hp1
NA19006.hp2
NA19011.hp2
NA19054.hp2
NA19056.hp1
NA19058.hp1
NA19060.hp1
NA19064.hp1
NA19070.hp2
NA19078.hp1
NA19080.hp1
NA19081.hp2
NA19082.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46531C>T
c.316+46531C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437880
chr1:113437882 T
T
 C
C
 3 a0001c0001t0004g0003
a0001c0001t0004g0046
a0001c0002t0002g0031
a0001c0001t0004g0003
a0001c0001t0004g0046
a0001c0002t0002g0031
 3 HG03834.hp2
NA18961.hp1
NA19006.hp2
HG03834.hp2
NA18961.hp1
NA19006.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46533T>C
c.316+46533T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437882
chr1:113437882 T
T
 TTCC
TTCC
 2 a0001c0001t0004g0002
a0002c0006t0004g0037
a0001c0001t0004g0002
a0002c0006t0004g0037
 2 HG00099.hp1
NA18967.hp1
HG00099.hp1
NA18967.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46535_316+4653
others(7): Show 
c.316+46535_316+46536insCTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437882
chr1:113437882 T
T
 TTCTTCC
TTCTTCC
 2 a0001c0001t0004g0015
a0001c0001t0004g0034
a0001c0001t0004g0015
a0001c0001t0004g0034
 2 NA19004.hp1
NA19056.hp1
NA19004.hp1
NA19056.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46536_316+4653
others(10): Show 
c.316+46536_316+46537insTCCTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437882
chr1:113437882 T
T
 TTCTTCTT
others(2): Show 
TTCTTCTTCC
 2 a0001c0001t0002g0016
a0001c0002t0002g0032
a0001c0001t0002g0016
a0001c0002t0002g0032
 2 NA18955.hp2
NA18957.hp2
NA18955.hp2
NA18957.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46536_316+4653
others(13): Show 
c.316+46536_316+46537insTCTTCCTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437882
chr1:113437882 T
T
 TTCTTCTT
others(11): Show 
TTCTTCTTCTTCCTCTTCC
 1 a0001c0001t0004g0030
a0001c0001t0004g0030
 1 NA18983.hp1
NA18983.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46536_316+4653
others(22): Show 
c.316+46536_316+46537insTCTTCTTCCTCTTCCTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437882
chr1:113437882 T
T
 TTCTTCTT
others(8): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCC
 1 a0001c0001t0004g0028
a0001c0001t0004g0028
 1 NA18962.hp2
NA18962.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46536_316+4653
others(19): Show 
c.316+46536_316+46537insTCTTCTTCTTCCTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437882
chr1:113437882 T
T
 TTCTTCTT
others(23): Show 
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC
 1 a0001c0001t0015g0026
a0001c0001t0015g0026
 1 NA19011.hp2
NA19011.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46536_316+4653
others(34): Show 
c.316+46536_316+46537insTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC
CTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437882
chr1:113437886 C
C
 T
T
 13 a0001c0001t0002g0016
a0001c0001t0004g0002
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HG01516.hp1
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c.316+46537C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437886
chr1:113437888 T
T
 C
C
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a0001c0002t0002g0021
a0001c0002t0002g0020
a0001c0002t0002g0021
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HG01517.hp1
HG01516.hp1
HG01517.hp1
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c.316+46539T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437888
chr1:113437889 TCTCCTTC
others(26): Show 
TCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTC
 T
T
 1 a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0006g0130
 1 HG02965.hp2
HG02965.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46573_316+4660
others(37): Show 
c.316+46573_316+46605delCCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC
TCCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437889
chr1:113437892 C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0007g0129
a0001c0002t0002g0020
a0001c0002t0002g0021
a0001c0001t0007g0129
a0001c0002t0002g0020
a0001c0002t0002g0021
 3 HG00621.hp2
HG01516.hp1
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HG00621.hp2
HG01516.hp1
HG01517.hp1
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c.316+46543C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437892
chr1:113437895 TCTCCTTC
others(20): Show 
TCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTC
 T
T
 2 a0001c0001t0007g0133
a0001c0002t0006g0132
a0001c0001t0007g0133
a0001c0002t0006g0132
 2 HG01255.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
HG01255.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46576_316+4660
others(31): Show 
c.316+46576_316+46602delCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC
T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437895
chr1:113437898 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
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c.316+46549C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437898
chr1:113437900 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
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c.316+46551T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437900
chr1:113437904 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
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c.316+46555C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113437904
chr1:113437919 TCTC
TCTC
 T
T
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437919
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C
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CCTT
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a0001c0002t0002g0233
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 105 HG00423.hp1
HG00423.hp2
HG00621.hp1
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HG00423.hp1
HG00423.hp2
HG00621.hp1
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NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46575_316+4657
others(7): Show 
c.316+46575_316+46576insTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437922
chr1:113437922 C
C
 CCTTCTCC
others(2): Show 
CCTTCTCCTT
 11 a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0002g0189
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others(8): Show 
a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0002g0189
a0001c0001t0002g0225
a0001c0001t0003g0071
a0001c0001t0003g0077
a0001c0001t0003g0094
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 11 HG00738.hp2
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others(8): Show 
HG00738.hp2
HG02015.hp2
HG03654.hp2
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others(13): Show 
c.316+46575_316+46576insTCTCCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437922
chr1:113437922 C
C
 CCTTCTCC
others(8): Show 
CCTTCTCCTTCTCCTT
 3 a0001c0001t0003g0086
a0001c0001t0003g0087
a0001c0001t0003g0119
a0001c0001t0003g0086
a0001c0001t0003g0087
a0001c0001t0003g0119
 3 NA19060.hp2
NA19070.hp1
NA20905.hp2
NA19060.hp2
NA19070.hp1
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46575_316+4657
others(19): Show 
c.316+46575_316+46576insTCTCCTTCTCCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437922
chr1:113437922 C
C
 CCTTCTCC
others(14): Show 
CCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTT
 6 a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0076
a0001c0001t0003g0091
others(3): Show 
a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0076
a0001c0001t0003g0091
a0001c0001t0003g0106
a0001c0001t0003g0125
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 6 HG01258.hp2
NA18944.hp1
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others(3): Show 
HG01258.hp2
NA18944.hp1
NA18960.hp2
NA18980.hp2
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NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+46575_316+4657
others(25): Show 
c.316+46575_316+46576insTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437922
chr1:113437922 C
C
 CCTTCTCC
others(20): Show 
CCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTT
 3 a0001c0001t0003g0074
a0001c0001t0003g0090
a0001c0001t0003g0109
a0001c0001t0003g0074
a0001c0001t0003g0090
a0001c0001t0003g0109
 3 HG02071.hp1
NA18962.hp1
NA18986.hp2
HG02071.hp1
NA18962.hp1
NA18986.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46575_316+4657
others(31): Show 
c.316+46575_316+46576insTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC
T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437922
chr1:113437922 C
C
 CCTTCTCC
others(26): Show 
CCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTT
 1 a0001c0001t0003g0126
a0001c0001t0003g0126
 1 NA18950.hp2
NA18950.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46575_316+4657
others(37): Show 
c.316+46575_316+46576insTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC
TCCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437922
chr1:113437922 C
C
 CCTTCTCC
others(50): Show 
CCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCC
TTCTCCTT
 1 a0001c0001t0003g0110
a0001c0001t0003g0110
 1 NA18994.hp2
NA18994.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+46575_316+4657
others(61): Show 
c.316+46575_316+46576insTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTC
TCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113437922
chr1:113438942 G
G
 A
A
 2 a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 2 HG02630.hp1
HG02965.hp2
HG02630.hp1
HG02965.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+47593G>A
c.316+47593G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113438942
chr1:113438971 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0003g0087
a0001c0001t0005g0088
a0001c0001t0003g0087
a0001c0001t0005g0088
 2 NA18940.hp1
NA19070.hp1
NA18940.hp1
NA19070.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+47622G>A
c.316+47622G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113438971
chr1:113439229 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0002g0089
 1 NA18983.hp2
NA18983.hp2
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c.316+47880G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113439229
chr1:113439233 G
G
 A
A
 4 a0001c0001t0004g0012
a0001c0001t0004g0013
a0001c0001t0004g0014
others(1): Show 
a0001c0001t0004g0012
a0001c0001t0004g0013
a0001c0001t0004g0014
a0001c0001t0004g0028
 4 NA18944.hp2
NA18962.hp2
NA19054.hp2
others(1): Show 
NA18944.hp2
NA18962.hp2
NA19054.hp2
NA19058.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+47884G>A
c.316+47884G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113439233
chr1:113439739 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0166
 1 HG01433.hp1
HG01433.hp1
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c.316+48390G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113439739
chr1:113439756 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0003g0090
a0001c0001t0003g0090
 1 HG02071.hp1
HG02071.hp1
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c.316+48407A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113439756
chr1:113440005 T
T
 G
G
 67 a0001c0001t0002g0072
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a0001c0001t0003g0055
others(64): Show 
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
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a0001c0001t0003g0065
a0001c0001t0003g0066
a0001c0001t0003g0067
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a0001c0001t0003g0090
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a0001c0001t0003g0100
a0001c0001t0003g0101
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a0001c0001t0012g0073
 67 HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
others(64): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
HG01123.hp1
HG01243.hp1
HG01258.hp2
HG01496.hp2
HG01928.hp2
HG01943.hp1
HG01952.hp1
HG02004.hp1
HG02015.hp2
HG02056.hp2
HG02071.hp1
HG02083.hp2
HG02293.hp2
HG03239.hp1
HG03654.hp1
NA18747.hp1
NA18747.hp2
NA18939.hp2
NA18940.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18944.hp1
NA18950.hp2
NA18952.hp2
NA18953.hp1
NA18955.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18965.hp1
NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA18971.hp2
NA18972.hp1
NA18973.hp2
NA18980.hp2
NA18983.hp2
NA18984.hp2
NA18985.hp2
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18990.hp1
NA18992.hp1
NA18994.hp2
NA18998.hp1
NA19000.hp2
NA19002.hp1
NA19003.hp2
NA19004.hp2
NA19006.hp1
NA19011.hp1
NA19056.hp2
NA19060.hp2
NA19063.hp1
NA19070.hp1
NA19074.hp2
NA19077.hp2
NA19078.hp2
NA19081.hp1
NA19083.hp1
NA19091.hp1
NA20300.hp1
NA20752.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+48656T>G
c.316+48656T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113440005
chr1:113440026 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0006g0062
 1 HG02055.hp1
HG02055.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+48677T>G
c.316+48677T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113440026
chr1:113440040 TTAAC
TTAAC
 T
T
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C
 A
A
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A
 G
G
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.316+49017A>G
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C
 T
T
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NA19081.hp2
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A
 G
G
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a0001c0002t0002g0220
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HG03927.hp1
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chr1:113441032 C
C
 T
T
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T
 G
G
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c.316+49715T>G
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 G
G
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c.316+49772A>G
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C
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G
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G
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HG02630.hp1
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 C
C
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A
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 G
G
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G
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G
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A
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A
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c.316+55134G>A
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A
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G
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T
 G
G
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HG02055.hp1
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c.316+55761T>G
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C
 A
A
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NA18939.hp2
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c.316+55845C>A
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T
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C
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 A
A
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A
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G
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A
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NA19070.hp2
NA19078.hp1
NA19082.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+58037_316+5804
others(8): Show 
c.316+58037_316+58040dupTGTG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113449360
chr1:113449360 G
G
 GGTGTGT
GGTGTGT
 17 a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0199
a0001c0001t0001g0202
others(14): Show 
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0199
a0001c0001t0001g0202
a0001c0001t0003g0101
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a0001c0001t0007g0133
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a0001c0002t0002g0198
a0001c0002t0002g0200
a0001c0002t0002g0201
a0001c0002t0002g0203
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 17 HG00738.hp1
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HG00738.hp1
HG01069.hp2
HG01109.hp1
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NA18940.hp1
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NA20805.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113449360
chr1:113449360 G
G
 GGTGTGTG
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GGTGTGTGT
 7 a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0076
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others(4): Show 
a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0076
a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0103
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 7 NA18944.hp1
NA18950.hp2
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NA18944.hp1
NA18950.hp2
NA18953.hp1
NA18962.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.316+58033_316+5804
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113449360
chr1:113449360 G
G
 GGTGTGTG
others(3): Show 
GGTGTGTGTGT
 11 a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0003g0071
a0001c0001t0003g0091
others(8): Show 
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0003g0071
a0001c0001t0003g0091
a0001c0001t0003g0095
a0001c0001t0003g0097
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 11 HG00621.hp1
HG02056.hp2
NA18952.hp2
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HG00621.hp1
HG02056.hp2
NA18952.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.316+58031_316+5804
others(14): Show 
c.316+58031_316+58040dupTGTGTGTGTG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113449360
chr1:113449360 G
G
 GGTGTGTG
others(5): Show 
GGTGTGTGTGTGT
 23 a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0066
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others(20): Show 
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a0001c0001t0003g0066
a0001c0001t0003g0068
a0001c0001t0003g0069
a0001c0001t0003g0075
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 23 HG00423.hp2
HG01070.hp1
HG01243.hp1
others(20): Show 
HG00423.hp2
HG01070.hp1
HG01243.hp1
HG01496.hp2
HG01952.hp1
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NA18983.hp2
NA18985.hp2
NA18990.hp1
NA18992.hp1
NA18998.hp1
NA19060.hp2
NA19070.hp1
NA19078.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+58029_316+5804
others(16): Show 
c.316+58029_316+58040dupTGTGTGTGTGTG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113449360
chr1:113449360 G
G
 GGTGTGTG
others(7): Show 
GGTGTGTGTGTGTGT
 15 a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0067
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others(12): Show 
a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0067
a0001c0001t0003g0070
a0001c0001t0003g0074
a0001c0001t0003g0077
a0001c0001t0003g0084
a0001c0001t0003g0096
a0001c0001t0003g0106
a0001c0001t0003g0108
a0001c0001t0003g0110
a0001c0001t0003g0122
a0001c0001t0005g0083
a0001c0001t0005g0105
a0001c0001t0005g0107
a0001c0001t0012g0073
 15 HG01258.hp2
HG01928.hp2
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others(12): Show 
HG01258.hp2
HG01928.hp2
HG01943.hp1
NA18747.hp1
NA18747.hp2
NA18943.hp1
NA18960.hp2
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NA18994.hp2
NA19004.hp2
NA19011.hp1
NA19056.hp2
NA19063.hp1
NA19081.hp1
NA19083.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+58027_316+5804
others(18): Show 
c.316+58027_316+58040dupTGTGTGTGTGTGTG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113449360
chr1:113449360 G
G
 GGTGTGTG
others(9): Show 
GGTGTGTGTGTGTGTGT
 7 a0001c0001t0003g0059
a0001c0001t0003g0114
a0001c0001t0003g0117
others(4): Show 
a0001c0001t0003g0059
a0001c0001t0003g0114
a0001c0001t0003g0117
a0001c0001t0003g0119
a0001c0001t0003g0121
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a0001c0001t0005g0098
 7 HG01123.hp1
HG03239.hp1
NA18942.hp2
others(4): Show 
HG01123.hp1
HG03239.hp1
NA18942.hp2
NA18967.hp2
NA18989.hp1
NA19000.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+58025_316+5804
others(20): Show 
c.316+58025_316+58040dupTGTGTGTGTGTGTGTG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113449360
chr1:113449360 G
G
 GGTGTGTG
others(11): Show 
GGTGTGTGTGTGTGTGTGT
 1 a0001c0001t0003g0065
a0001c0001t0003g0065
 1 NA20752.hp2
NA20752.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+58023_316+5804
others(22): Show 
c.316+58023_316+58040dupTGTGTGTGTGTGTGTGTG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113449360
chr1:113449360 GGT
GGT
 G
G
 3 a0001c0001t0003g0118
a0001c0001t0004g0034
a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0003g0118
a0001c0001t0004g0034
a0001c0001t0007g0129
 3 HG00621.hp2
HG03654.hp1
NA19004.hp1
HG00621.hp2
HG03654.hp1
NA19004.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+58039_316+5804
others(6): Show 
c.316+58039_316+58040delTG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113449360
chr1:113449360 GGTGT
GGTGT
 G
G
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+58037_316+5804
others(8): Show 
c.316+58037_316+58040delTGTG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113449360
chr1:113449390 A
A
 T
T
 2 a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0128
a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0128
 2 NA18972.hp1
NA19003.hp2
NA18972.hp1
NA19003.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+58041A>T
c.316+58041A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113449390
chr1:113449391 C
C
 G
G
 2 a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0128
a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0128
 2 NA18972.hp1
NA19003.hp2
NA18972.hp1
NA19003.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+58042C>G
c.316+58042C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113449391
chr1:113449392 A
A
 T
T
 2 a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0128
a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0128
 2 NA18972.hp1
NA19003.hp2
NA18972.hp1
NA19003.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+58043A>T
c.316+58043A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113449392
chr1:113449395 G
G
 C
C
 2 a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0128
a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0128
 2 NA18972.hp1
NA19003.hp2
NA18972.hp1
NA19003.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+58046G>C
c.316+58046G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113449395
chr1:113449587 AT
AT
 A
A
 48 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
others(45): Show 
a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
a0001c0001t0001g0024
a0001c0001t0001g0027
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a0001c0001t0002g0033
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a0001c0001t0004g0002
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a0001c0001t0015g0026
a0001c0002t0002g0007
a0001c0002t0002g0008
a0001c0002t0002g0020
a0001c0002t0002g0021
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 48 HG00099.hp1
HG00423.hp1
HG00642.hp2
others(45): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp1
HG00642.hp2
HG01070.hp2
HG01099.hp2
HG01109.hp2
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HG01433.hp2
HG01516.hp1
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HG02129.hp2
HG02300.hp1
HG02683.hp2
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HG03834.hp2
HG04204.hp2
NA18940.hp2
NA18944.hp2
NA18947.hp2
NA18948.hp1
NA18955.hp2
NA18957.hp2
NA18961.hp1
NA18962.hp2
NA18965.hp2
NA18967.hp1
NA18968.hp2
NA18971.hp1
NA18978.hp2
NA18983.hp1
NA18989.hp2
NA18994.hp1
NA18995.hp1
NA19004.hp1
NA19006.hp2
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c.316+58247delT
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A
 G
G
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c.316+58351A>G
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G
 A
A
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HG02647.hp2
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C
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T
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 T
T
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c.316+58525delG
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A
 G
G
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a0001c0001t0004g0214
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113449977
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G
 A
A
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HG02630.hp1
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c.316+58961G>A
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T
 G
G
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a0001c0002t0002g0229
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NA18947.hp1
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G
 A
A
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c.316+59062G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113450411
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C
 T
T
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c.316+59918A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113451267
chr1:113451300 G
G
 C
C
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+59951G>C
c.316+59951G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113451300
chr1:113451404 A
A
 T
T
 5 a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0002t0006g0132
others(2): Show 
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0002t0006g0132
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 5 HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
others(2): Show 
HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+60055A>T
c.316+60055A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113451404
chr1:113451744 T
T
 A
A
 1 a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0002g0178
 1 NA21309.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+60395T>A
c.316+60395T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113451744
chr1:113452003 GTGC
GTGC
 G
G
 2 a0001c0001t0002g0159
a0001c0001t0002g0192
a0001c0001t0002g0159
a0001c0001t0002g0192
 2 HG02922.hp2
HG02976.hp1
HG02922.hp2
HG02976.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+60659_316+6066
others(7): Show 
c.316+60659_316+60661delGCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113452003
chr1:113452271 T
T
 G
G
 6 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
others(3): Show 
a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0002t0006g0132
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 6 HG00621.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
others(3): Show 
HG00621.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+60922T>G
c.316+60922T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113452271
chr1:113452455 T
T
 TAC
TAC
 28 a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0137
a0001c0001t0001g0140
others(25): Show 
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0137
a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0202
a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0002g0219
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a0001c0001t0002g0225
a0001c0001t0002g0231
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a0001c0002t0002g0197
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a0001c0002t0002g0209
a0001c0002t0002g0210
a0001c0002t0002g0212
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a0001c0002t0002g0224
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a0001c0002t0002g0233
a0001c0002t0002g0235
a0001c0002t0002g0236
a0001c0002t0008g0221
 28 HG00140.hp2
HG00642.hp1
HG00738.hp1
others(25): Show 
HG00140.hp2
HG00642.hp1
HG00738.hp1
HG01081.hp2
HG01099.hp1
HG01175.hp2
HG01257.hp1
HG01346.hp1
HG01346.hp2
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HG01928.hp1
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HG02056.hp1
HG02129.hp1
HG02293.hp1
HG02559.hp2
HG02683.hp1
HG03490.hp1
HG03654.hp2
HG04199.hp2
HG04204.hp1
NA18960.hp1
NA18978.hp1
NA19054.hp1
NA19058.hp2
NA19063.hp2
NA19080.hp2
NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+61139_316+6114
others(6): Show 
c.316+61139_316+61140dupAC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113452455
chr1:113452455 T
T
 TACAC
TACAC
 21 a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0138
a0001c0001t0001g0141
others(18): Show 
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0138
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0143
a0001c0001t0001g0144
a0001c0001t0001g0146
a0001c0001t0001g0147
a0001c0001t0001g0148
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0158
a0001c0001t0002g0149
a0001c0001t0002g0150
a0001c0001t0002g0207
a0001c0001t0004g0214
a0001c0002t0002g0156
a0001c0002t0002g0179
a0001c0002t0002g0216
a0001c0002t0002g0220
a0001c0002t0008g0155
 21 HG00099.hp2
HG00140.hp1
HG00741.hp1
others(18): Show 
HG00099.hp2
HG00140.hp1
HG00741.hp1
HG01069.hp1
HG01081.hp1
HG01243.hp2
HG01261.hp2
HG01516.hp2
HG02738.hp1
HG03239.hp2
HG03834.hp1
HG03927.hp1
HG03927.hp2
HG04115.hp2
NA18943.hp2
NA18950.hp1
NA18957.hp1
NA18992.hp2
NA19003.hp1
NA19074.hp1
NA19077.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+61137_316+6114
others(8): Show 
c.316+61137_316+61140dupACAC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113452455
chr1:113452455 T
T
 TACACAC
TACACAC
 6 a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0151
a0001c0001t0001g0153
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0151
a0001c0001t0001g0153
a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0002g0232
a0001c0002t0002g0058
 6 HG01192.hp1
HG01261.hp1
HG01952.hp2
others(3): Show 
HG01192.hp1
HG01261.hp1
HG01952.hp2
HG02004.hp2
NA19083.hp2
NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+61135_316+6114
others(10): Show 
c.316+61135_316+61140dupACACAC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113452455
chr1:113452455 TAC
TAC
 T
T
 5 a0001c0001t0001g0162
a0001c0001t0004g0022
a0001c0001t0004g0045
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0162
a0001c0001t0004g0022
a0001c0001t0004g0045
a0001c0002t0002g0020
a0001c0002t0002g0021
 5 HG01433.hp2
HG01516.hp1
HG01517.hp1
others(2): Show 
HG01433.hp2
HG01516.hp1
HG01517.hp1
HG02015.hp1
NA18994.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+61139_316+6114
others(6): Show 
c.316+61139_316+61140delAC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113452455
chr1:113452455 TACAC
TACAC
 T
T
 120 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
others(117): Show 
a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
a0001c0001t0001g0024
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0002g0006
a0001c0001t0002g0016
a0001c0001t0002g0033
a0001c0001t0002g0038
a0001c0001t0002g0039
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
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a0001c0001t0003g0060
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a0001c0001t0003g0086
a0001c0001t0003g0087
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a0001c0001t0003g0091
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a0001c0001t0003g0100
a0001c0001t0003g0101
a0001c0001t0003g0102
a0001c0001t0003g0103
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a0001c0001t0003g0106
a0001c0001t0003g0108
a0001c0001t0003g0109
a0001c0001t0003g0110
a0001c0001t0003g0111
a0001c0001t0003g0112
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a0001c0001t0003g0116
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a0001c0001t0003g0118
a0001c0001t0003g0119
a0001c0001t0003g0120
a0001c0001t0003g0121
a0001c0001t0003g0122
a0001c0001t0003g0123
a0001c0001t0003g0124
a0001c0001t0003g0125
a0001c0001t0003g0126
a0001c0001t0003g0128
a0001c0001t0004g0002
a0001c0001t0004g0003
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a0001c0001t0004g0009
a0001c0001t0004g0011
a0001c0001t0004g0012
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a0001c0001t0004g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0023
a0001c0001t0004g0025
a0001c0001t0004g0028
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a0001c0001t0004g0041
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a0001c0001t0005g0107
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0001t0012g0073
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0015g0026
a0001c0002t0002g0007
a0001c0002t0002g0008
a0001c0002t0002g0031
a0001c0002t0002g0032
a0001c0002t0002g0042
a0001c0002t0002g0043
a0001c0002t0002g0044
a0001c0002t0002g0048
a0001c0002t0006g0132
a0001c0003t0006g0130
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a0002c0006t0004g0037
 120 HG00099.hp1
HG00423.hp1
HG00423.hp2
others(117): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp1
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG00621.hp2
HG00642.hp2
HG01070.hp1
HG01070.hp2
HG01099.hp2
HG01109.hp2
HG01123.hp1
HG01192.hp2
HG01243.hp1
HG01255.hp2
HG01258.hp2
HG01496.hp1
HG01496.hp2
HG01928.hp2
HG01943.hp1
HG01952.hp1
HG02004.hp1
HG02015.hp2
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG02056.hp2
HG02071.hp1
HG02071.hp2
HG02083.hp1
HG02083.hp2
HG02129.hp2
HG02293.hp2
HG02300.hp1
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HG03209.hp1
HG03239.hp1
HG03490.hp2
HG03654.hp1
HG03834.hp2
HG04204.hp2
NA18747.hp1
NA18747.hp2
NA18939.hp2
NA18940.hp1
NA18940.hp2
NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18944.hp1
NA18944.hp2
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A
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T
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A
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G
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c.316+62346delG
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 G
G
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a0001c0002t0002g0058
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HG02004.hp2
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c.316+62472A>G
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G
 T
T
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c.316+62706G>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0004g0013
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NA18944.hp2
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c.316+62806A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113454155
chr1:113454244 G
G
 T
T
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c.316+62895G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113454244
chr1:113454325 C
C
 T
T
 48 a0001c0001t0001g0001
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others(45): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp1
HG00642.hp2
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HG01099.hp2
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NA18962.hp2
NA18965.hp2
NA18967.hp1
NA18968.hp2
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NA19056.hp1
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NA19070.hp2
NA19078.hp1
NA19080.hp1
NA19081.hp2
NA19082.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+62976C>T
c.316+62976C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113454325
chr1:113454481 A
A
 T
T
 2 a0001c0002t0002g0020
a0001c0002t0002g0021
a0001c0002t0002g0020
a0001c0002t0002g0021
 2 HG01516.hp1
HG01517.hp1
HG01516.hp1
HG01517.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+63132A>T
c.316+63132A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113454481
chr1:113454742 G
G
 A
A
 5 a0001c0001t0007g0131
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others(2): Show 
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a0001c0001t0007g0133
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 5 HG01255.hp2
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others(2): Show 
HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+63393G>A
c.316+63393G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113454742
chr1:113454848 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0006g0061
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+63499A>G
c.316+63499A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113454848
chr1:113454850 G
G
 A
A
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others(64): Show 
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 67 HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
others(64): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
HG01123.hp1
HG01243.hp1
HG01258.hp2
HG01496.hp2
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HG01943.hp1
HG01952.hp1
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HG02071.hp1
HG02083.hp2
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NA18747.hp1
NA18747.hp2
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NA18944.hp1
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NA18953.hp1
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NA18972.hp1
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A
 G
G
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c.316+63530A>G
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G
 A
A
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T
 C
C
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c.316+63715T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113455064
chr1:113455149 C
C
 T
T
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a0001c0001t0011g0186
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HG04115.hp1
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c.316+63800C>T
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C
 T
T
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c.316+64190C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113455539
chr1:113456055 A
A
 G
G
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a0001c0001t0002g0217
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HG01255.hp1
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c.316+64706A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113456055
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A
 AT
AT
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HG00423.hp1
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NA19083.hp2
NA19091.hp1
NA20752.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+64789dupT
c.316+64789dupT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113456117
chr1:113456117 A
A
 ATT
ATT
 15 a0001c0001t0003g0081
a0001c0001t0003g0082
a0001c0001t0003g0085
others(12): Show 
a0001c0001t0003g0081
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a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0113
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 15 HG01243.hp1
HG01517.hp1
HG01928.hp2
others(12): Show 
HG01243.hp1
HG01517.hp1
HG01928.hp2
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NA19078.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+64788_316+6478
others(6): Show 
c.316+64788_316+64789dupTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113456117
chr1:113456231 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0160
 1 HG02630.hp2
HG02630.hp2
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c.316+64882C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113456231
chr1:113456515 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0160
 1 HG02630.hp2
HG02630.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+65166A>T
c.316+65166A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113456515
chr1:113456680 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0046
a0001c0001t0004g0046
 1 HG03834.hp2
HG03834.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+65331C>A
c.316+65331C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113456680
chr1:113456853 CT
CT
 C
C
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others(2): Show 
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a0001c0001t0007g0133
a0001c0002t0006g0132
a0001c0003t0006g0130
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 5 HG01255.hp2
HG01496.hp1
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others(2): Show 
HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+65518delT
c.316+65518delT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113456853
chr1:113457183 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.316+65834A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113457183
chr1:113457233 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0046
a0001c0001t0004g0046
 1 HG03834.hp2
HG03834.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+65884A>C
c.316+65884A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113457233
chr1:113457677 G
G
 GGATA
GGATA
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+66337_316+6634
others(8): Show 
c.316+66337_316+66340dupGATA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113457677
chr1:113458234 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+66885A>G
c.316+66885A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113458234
chr1:113458325 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0036
a0001c0001t0004g0036
 1 NA18965.hp2
NA18965.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+66976A>G
c.316+66976A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113458325
chr1:113458384 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0096
a0001c0001t0003g0096
 1 NA19056.hp2
NA19056.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+67035G>A
c.316+67035G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113458384
chr1:113458411 T
T
 C
C
 3 a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0074
a0001c0001t0003g0114
a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0074
a0001c0001t0003g0114
 3 NA18747.hp1
NA18986.hp2
NA19000.hp2
NA18747.hp1
NA18986.hp2
NA19000.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+67062T>C
c.316+67062T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113458411
chr1:113458584 C
C
 G
G
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
 3 HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+67235C>G
c.316+67235C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113458584
chr1:113459397 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0086
a0001c0001t0003g0086
 1 NA19060.hp2
NA19060.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+68048A>G
c.316+68048A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113459397
chr1:113459441 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0160
 1 HG02630.hp2
HG02630.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+68092G>A
c.316+68092G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113459441
chr1:113459640 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0002g0179
a0001c0002t0002g0179
 1 HG01243.hp2
HG01243.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+68291G>A
c.316+68291G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113459640
chr1:113459843 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0120
a0001c0001t0003g0120
 1 HG01070.hp1
HG01070.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+68494A>G
c.316+68494A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113459843
chr1:113459915 T
T
 C
C
 6 a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0051
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0054
 6 NA18939.hp1
NA18953.hp2
NA18980.hp1
others(3): Show 
NA18939.hp1
NA18953.hp2
NA18980.hp1
NA18984.hp1
NA18985.hp1
NA18998.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+68566T>C
c.316+68566T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113459915
chr1:113460537 C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0002g0149
a0001c0001t0002g0150
a0001c0001t0002g0207
a0001c0001t0002g0149
a0001c0001t0002g0150
a0001c0001t0002g0207
 3 HG00140.hp1
HG01069.hp1
HG02738.hp1
HG00140.hp1
HG01069.hp1
HG02738.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+69188C>T
c.316+69188C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113460537
chr1:113460540 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0002g0043
a0001c0002t0002g0043
 1 NA19082.hp1
NA19082.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+69191T>C
c.316+69191T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113460540
chr1:113460575 C
C
 T
T
 6 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0131
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others(3): Show 
a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0002t0006g0132
a0001c0003t0006g0130
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 6 HG00621.hp2
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others(3): Show 
HG00621.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+69226C>T
c.316+69226C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113460575
chr1:113460638 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+69289T>A
c.316+69289T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113460638
chr1:113460639 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.316+69290C>T
c.316+69290C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113460639
chr1:113461431 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0002g0007
a0001c0002t0002g0007
 1 NA19078.hp1
NA19078.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+70082G>A
c.316+70082G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113461431
chr1:113462003 A
A
 T
T
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
 intron_variant MODIFIER c.316+70654A>T
c.316+70654A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113462003
chr1:113462261 T
T
 C
C
 76 a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
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others(73): Show 
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0059
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a0001c0001t0003g0065
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c.316+70912T>C
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C
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c.316+71369A>G
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T
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c.316+72055dupA
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chr1:113463714 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0092
a0001c0001t0003g0092
 1 NA18985.hp2
NA18985.hp2
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c.316+72365A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113463714
chr1:113463960 G
G
 C
C
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a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0137
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0137
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HG01081.hp2
HG01257.hp1
HG03927.hp2
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c.316+72611G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113463960
chr1:113464127 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0139
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HG02976.hp2
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c.316+72778A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113464127
chr1:113464140 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0049
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NA18939.hp1
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c.316+72791T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113464140
chr1:113464525 G
G
 T
T
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c.316+73176G>T
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C
 G
G
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a0001c0001t0003g0081
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a0001c0001t0003g0080
a0001c0001t0003g0081
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HG01243.hp1
HG02293.hp2
NA18965.hp1
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c.316+73184C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113464533
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A
 G
G
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.316+73273A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113464622
chr1:113464652 C
C
 T
T
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a0001c0001t0007g0133
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a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0002t0006g0132
 3 HG01255.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
HG01255.hp2
HG01496.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.316+73303C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113464652
chr1:113464873 C
C
 T
T
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a0001c0009t0002g0057
a0001c0001t0001g0163
a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
HG02897.hp1
HG02897.hp2
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c.316+73524C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113464873
chr1:113464912 G
G
 A
A
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a0001c0001t0004g0004
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HG02071.hp2
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c.316+73563G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113464912
chr1:113464936 C
C
 T
T
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others(2): Show 
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a0001c0001t0007g0133
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 5 HG01255.hp2
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others(2): Show 
HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.316+73587C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113464936
chr1:113465138 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0004
a0001c0001t0004g0004
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HG02071.hp2
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c.316+73789T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113465138
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AT
 A
A
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a0001c0001t0002g0159
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a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0002g0159
a0001c0001t0002g0192
 3 HG01099.hp1
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HG01099.hp1
HG02922.hp2
HG02976.hp1
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c.316+73924delT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113465271
chr1:113465490 T
T
 C
C
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.316+74141T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113465490
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A
 G
G
 67 a0001c0001t0002g0072
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others(64): Show 
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
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 67 HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
others(64): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
HG01123.hp1
HG01243.hp1
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HG01943.hp1
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HG02056.hp2
HG02071.hp1
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A
 G
G
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T
 C
C
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c.316+75240T>C
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TG
 T
T
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c.316+75315delG
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G
 A
A
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c.316+75775G>A
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A
 G
G
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T
 C
C
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c.316+76017T>C
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 G
G
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A
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T
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a0001c0001t0007g0129
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T
 G
G
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T
 C
C
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A
 G
G
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A
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c.316+77335G>A
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C
 G
G
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A
 T
T
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A
 G
G
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c.316+77682A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113469031
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0159
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HG01099.hp1
HG02922.hp2
HG02976.hp1
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c.316+77930C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113469279
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G
 T
T
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c.316+78288G>T
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 T
T
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T
 G
G
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T
 C
C
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C
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T
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a0001c0001t0003g0093
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T
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A
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a0001c0002t0002g0216
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HG04115.hp2
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c.317-78897T>A
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T
 A
A
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a0001c0001t0003g0103
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c.317-78478T>A
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 A
A
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113471483
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0016
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NA18957.hp2
NA19056.hp1
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c.317-77597G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113471918
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T
 A
A
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a0001c0001t0004g0173
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NA19082.hp2
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c.317-77491T>A
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G
 GT
GT
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HG02055.hp1
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c.317-77295dupT
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T
 G
G
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c.317-77304T>G
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G
 A
A
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others(1): Show 
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c.317-77292G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113472223
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C
 T
T
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a0001c0001t0004g0213
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HG01943.hp2
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c.317-77252C>T
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G
 A
A
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others(6): Show 
NA18952.hp1
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c.317-77251G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113472264
chr1:113472265 C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0004g0012
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a0001c0001t0004g0012
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NA19054.hp2
NA19058.hp1
NA18944.hp2
NA19054.hp2
NA19058.hp1
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c.317-77250C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113472265
chr1:113472312 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0164
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HG02647.hp1
 intron_variant MODIFIER c.317-77203C>T
c.317-77203C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113472312
chr1:113472734 T
T
 TTG
TTG
 4 a0001c0001t0001g0169
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0169
a0001c0001t0001g0170
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 4 NA18942.hp1
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others(1): Show 
NA18942.hp1
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NA19000.hp1
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others(6): Show 
c.317-76757_317-76756dupGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113472734
chr1:113472734 T
T
 TTGTG
TTGTG
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a0001c0001t0004g0047
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 2 NA18995.hp1
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T
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C
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A
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c.317-74918G>A
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HG00621.hp2
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c.317-74305T>C
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C
 T
T
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a0001c0002t0002g0235
a0001c0002t0002g0236
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NA18978.hp1
NA19054.hp1
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c.317-74300C>T
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C
 T
T
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a0001c0004t0002g0195
a0001c0004t0002g0183
a0001c0004t0002g0195
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HG00741.hp2
HG03041.hp2
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C
 T
T
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a0001c0002t0002g0226
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NA18960.hp1
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G
 A
A
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a0001c0001t0003g0121
a0001c0001t0003g0084
a0001c0001t0003g0121
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NA19083.hp1
NA18942.hp2
NA19083.hp1
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113475466
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G
 T
T
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a0001c0002t0002g0197
a0001c0002t0002g0203
a0001c0001t0001g0202
a0001c0002t0002g0197
a0001c0002t0002g0203
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HG00738.hp1
HG01346.hp1
HG02300.hp2
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c.317-73879G>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0171
a0001c0001t0001g0172
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others(6): Show 
NA18952.hp1
NA18972.hp2
NA18986.hp1
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0158
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0158
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HG00741.hp1
HG00099.hp2
HG00741.hp1
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c.317-73521G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113475994
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G
 A
A
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a0001c0001t0003g0084
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NA19083.hp1
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c.317-73502G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113476013
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G
 A
A
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a0001c0003t0013g0127
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HG02630.hp1
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c.317-73451G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113476064
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TC
 T
T
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a0001c0001t0002g0192
a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0002g0159
a0001c0001t0002g0192
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HG02922.hp2
HG02976.hp1
HG01099.hp1
HG02922.hp2
HG02976.hp1
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c.317-73406delC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113476108
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T
 G
G
 3 a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0002g0159
a0001c0001t0002g0192
a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0002g0159
a0001c0001t0002g0192
 3 HG01099.hp1
HG02922.hp2
HG02976.hp1
HG01099.hp1
HG02922.hp2
HG02976.hp1
 intron_variant MODIFIER c.317-73405T>G
c.317-73405T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113476110
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others(13): Show 
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 A
A
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a0001c0001t0010g0134
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NA21309.hp2
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others(24): Show 
c.317-73299_317-73280delTCTCTTTCACTTCTGCTCTG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113476215
chr1:113476614 C
C
 T
T
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a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0089
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others(64): Show 
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c.317-72901C>T
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A
 G
G
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HG02976.hp1
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c.317-72835A>G
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chr1:113476682 C
C
 G
G
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T
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A
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A
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T
 C
C
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HG02055.hp2
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HG02055.hp1
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A
 G
G
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0217
a0001c0001t0004g0213
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HG01255.hp1
HG01943.hp2
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T
 C
C
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G
 A
A
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a0001c0001t0003g0110
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NA18994.hp2
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C
 T
T
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G
 A
A
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G
 A
A
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NA18957.hp1
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 C
C
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a0001c0001t0003g0080
a0001c0001t0003g0081
a0001c0001t0003g0082
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NA18965.hp1
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C
 T
T
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c.317-68798C>T
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G
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 C
C
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G
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A
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NA19056.hp1
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c.317-66794G>A
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 A
A
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NA19058.hp2
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c.317-66724G>A
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 G
G
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c.317-66418A>G
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T
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TTG
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others(6): Show 
c.317-65600_317-65599dupGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113483893
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G
 T
T
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A
 C
C
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c.317-65371A>C
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chr1:113484358 G
G
 A
A
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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c.317-65157G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113484358
chr1:113484385 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.317-65130T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113484385
chr1:113484610 T
T
 TTA
TTA
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HG04199.hp1
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others(6): Show 
c.317-64892_317-64891dupTA
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 T
T
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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others(49): Show 
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TCCCCTCCCCTCCCTTCCC
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chr1:113484673 T
T
 C
C
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a0001c0002t0002g0209
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HG03490.hp1
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c.317-64842T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113484673
chr1:113484678 A
A
 C
C
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a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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c.317-64837A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113484678
chr1:113484678 ATCCCC
ATCCCC
 A
A
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HG00621.hp1
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HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01123.hp1
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NA19083.hp1
NA19091.hp1
NA20300.hp1
NA20752.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.317-64802_317-6479
others(9): Show 
c.317-64802_317-64798delCTCCC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113484678
chr1:113484678 ATCCCCTC
others(3): Show 
ATCCCCTCCCC
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0066
a0001c0001t0003g0066
 1 NA18971.hp2
NA18971.hp2
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others(14): Show 
c.317-64807_317-64798delCTCCCCTCCC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113484678
chr1:113484698 C
C
 CTCCCT
CTCCCT
 2 a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0001g0194
 2 HG02965.hp1
NA20300.hp2
HG02965.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.317-64813_317-6481
others(9): Show 
c.317-64813_317-64812insTTCCC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113484698
chr1:113484703 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0001g0194
 2 HG02965.hp1
NA20300.hp2
HG02965.hp1
NA20300.hp2
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c.317-64812C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113484703
chr1:113484708 C
C
 CTCCCTTC
others(3): Show 
CTCCCTTCCCT
 1 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0061
 1 HG03209.hp1
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.317-64803_317-6480
others(14): Show 
c.317-64803_317-64802insTTCCCTTCCC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113484708
chr1:113484708 C
C
 CTCCCTTC
others(8): Show 
CTCCCTTCCCTTCCCT
 3 a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0002g0231
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a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0002g0231
a0001c0003t0006g0130
 3 HG02559.hp2
HG02965.hp2
HG02976.hp2
HG02559.hp2
HG02965.hp2
HG02976.hp2
 intron_variant MODIFIER c.317-64803_317-6480
others(19): Show 
c.317-64803_317-64802insTTCCCTTCCCTTCCC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113484708
chr1:113484708 C
C
 CTCCCTTC
others(13): Show 
CTCCCTTCCCTTCCCTTCCCT
 1 a0001c0001t0002g0161
a0001c0001t0002g0161
 1 HG02559.hp1
HG02559.hp1
 intron_variant MODIFIER c.317-64803_317-6480
others(24): Show 
c.317-64803_317-64802insTTCCCTTCCCTTCCCTTCCC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113484708
chr1:113484708 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0001g0194
 2 HG02965.hp1
NA20300.hp2
HG02965.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.317-64807C>T
c.317-64807C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113484708
chr1:113484713 C
C
 CCTCCCTT
others(14): Show 
CCTCCCTTCCCTTCCCTTCCCT
 1 a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0135
 1 HG03927.hp2
HG03927.hp2
 intron_variant MODIFIER c.317-64802_317-6480
others(25): Show 
c.317-64802_317-64801insCTCCCTTCCCTTCCCTTCCCT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113484713
chr1:113484713 C
C
 CTCCCCTC
others(13): Show 
CTCCCCTCCCTTCCCTTCCCT
 1 a0001c0001t0002g0150
a0001c0001t0002g0150
 1 HG02738.hp1
HG02738.hp1
 intron_variant MODIFIER c.317-64798_317-6479
others(24): Show 
c.317-64798_317-64797insCTCCCTTCCCTTCCCTTCCC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113484713
chr1:113484713 C
C
 CTCCCCTC
others(38): Show 
CTCCCCTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCT
 1 a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0002g0178
 1 NA21309.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.317-64798_317-6479
others(49): Show 
c.317-64798_317-64797insCTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCT
TCCCTTCCCTTCCCTTCCC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113484713
chr1:113484713 C
C
 CTCCCCTC
others(35): Show 
CTCCCCTCTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCCT
 1 a0001c0001t0010g0134
a0001c0001t0010g0134
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NA21309.hp2
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CTTCCCTTCCCTTCCC
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C
 CTCCCT
CTCCCT
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C
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C
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HG02056.hp1
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C
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TTCC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113484713
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C
 T
T
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c.317-64802C>T
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G
 A
A
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others(64): Show 
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HG00621.hp1
HG01070.hp1
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NA18747.hp1
NA18747.hp2
NA18939.hp2
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c.317-64657G>A
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chr1:113484887 G
G
 T
T
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a0001c0001t0003g0094
 1 HG02015.hp2
HG02015.hp2
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c.317-64628G>T
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chr1:113484978 G
G
 A
A
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HG00642.hp1
HG01081.hp1
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c.317-64537G>A
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A
 T
T
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a0001c0001t0004g0191
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HG04199.hp1
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c.317-64473A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113485042
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C
 G
G
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a0001c0001t0006g0062
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a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
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HG02055.hp2
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.317-64435C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113485080
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T
 G
G
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.317-64376T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113485139
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T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0010
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HG01099.hp2
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c.317-64367T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113485148
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T
 A
A
 5 a0001c0001t0003g0066
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 5 HG01070.hp1
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others(2): Show 
HG01070.hp1
HG01952.hp1
HG02004.hp1
NA18971.hp2
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c.317-64269T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113485246
chr1:113485329 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0142
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NA18943.hp2
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c.317-64186G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113485329
chr1:113485647 C
C
 T
T
 10 a0001c0001t0001g0199
a0001c0001t0001g0202
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others(7): Show 
a0001c0001t0001g0199
a0001c0001t0001g0202
a0001c0001t0004g0191
a0001c0002t0002g0197
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 10 HG00738.hp1
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others(7): Show 
HG00738.hp1
HG01069.hp2
HG01109.hp1
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c.317-63868C>T
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chr1:113485895 C
C
 A
A
 4 a0001c0001t0004g0214
a0001c0002t0002g0210
a0001c0002t0002g0212
others(1): Show 
a0001c0001t0004g0214
a0001c0002t0002g0210
a0001c0002t0002g0212
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 4 HG00642.hp1
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others(1): Show 
HG00642.hp1
HG01081.hp1
HG01928.hp1
HG02293.hp1
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c.317-63620C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113485895
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T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0168
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NA20905.hp1
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c.317-63397T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113486118
chr1:113486314 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0101
a0001c0001t0003g0101
 1 NA19006.hp1
NA19006.hp1
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c.317-63201C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113486314
chr1:113486320 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0036
a0001c0001t0004g0036
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NA18965.hp2
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c.317-63195A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113486320
chr1:113486407 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0009
a0001c0001t0004g0009
 1 HG04204.hp2
HG04204.hp2
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c.317-63108C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113486407
chr1:113486554 A
A
 G
G
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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c.317-62961A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113486554
chr1:113486651 C
C
 CT
CT
 17 a0001c0001t0001g0001
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a0001c0001t0001g0202
others(14): Show 
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a0001c0001t0001g0199
a0001c0001t0001g0202
a0001c0001t0002g0006
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 17 HG00738.hp1
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others(14): Show 
HG00738.hp1
HG01069.hp2
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HG01258.hp1
HG01346.hp1
HG02071.hp2
HG02300.hp2
HG02738.hp2
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HG04199.hp1
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c.317-62846dupT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113486651
chr1:113486651 C
C
 CTT
CTT
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 59 HG00423.hp2
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others(56): Show 
HG00423.hp2
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NA18943.hp1
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NA18955.hp1
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NA18973.hp2
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NA18983.hp2
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NA18985.hp2
NA18989.hp1
NA18992.hp1
NA18994.hp2
NA18998.hp1
NA19000.hp2
NA19002.hp1
NA19003.hp2
NA19004.hp2
NA19006.hp1
NA19011.hp1
NA19060.hp2
NA19063.hp1
NA19070.hp1
NA19074.hp2
NA19077.hp2
NA19083.hp1
NA19091.hp1
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c.317-62847_317-62846dupTT
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chr1:113486651 C
C
 CTTT
CTTT
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a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0096
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a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0096
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HG01928.hp2
HG01943.hp1
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c.317-62848_317-62846dupTTT
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chr1:113486651 CT
CT
 C
C
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a0001c0001t0001g0172
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HG00621.hp2
HG01081.hp2
HG02965.hp1
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c.317-62846delT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113486651
chr1:113486881 T
T
 C
C
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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c.317-62634T>C
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A
 G
G
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a0001c0002t0002g0156
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HG03239.hp2
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c.317-62544A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113486971
chr1:113487419 T
T
 C
C
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a0001c0001t0002g0189
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HG00738.hp2
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c.317-62096T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113487419
chr1:113487555 T
T
 C
C
 48 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
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HG00642.hp2
others(45): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp1
HG00642.hp2
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HG01099.hp2
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c.317-61960T>C
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G
 GT
GT
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others(6): Show 
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a0001c0001t0002g0006
a0001c0001t0004g0017
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 9 HG00621.hp2
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others(6): Show 
HG00621.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
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NA19080.hp1
NA20905.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.317-61755dupT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113487750
chr1:113487800 G
G
 T
T
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a0001c0002t0002g0235
a0001c0002t0002g0236
a0001c0002t0002g0230
a0001c0002t0002g0235
a0001c0002t0002g0236
 3 HG02129.hp1
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HG02129.hp1
NA18978.hp1
NA19054.hp1
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c.317-61715G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113487800
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A
 G
G
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a0001c0001t0003g0074
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a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0074
a0001c0001t0003g0114
 3 NA18747.hp1
NA18986.hp2
NA19000.hp2
NA18747.hp1
NA18986.hp2
NA19000.hp2
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c.317-61532A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113487983
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C
 T
T
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others(64): Show 
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a0001c0001t0002g0089
a0001c0001t0003g0055
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 67 HG00423.hp2
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others(64): Show 
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01070.hp1
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NA18747.hp1
NA18747.hp2
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c.317-61211C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113488304
chr1:113488617 C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0006g0061
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 3 HG02055.hp1
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HG03209.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.317-60898C>T
c.317-60898C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113488617
chr1:113488675 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0003g0070
a0001c0001t0003g0122
a0001c0001t0003g0070
a0001c0001t0003g0122
 2 HG01928.hp2
HG01943.hp1
HG01928.hp2
HG01943.hp1
 intron_variant MODIFIER c.317-60840G>A
c.317-60840G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113488675
chr1:113488677 G
G
 A
A
 13 a0001c0001t0001g0167
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others(10): Show 
a0001c0001t0001g0167
a0001c0001t0001g0169
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0171
a0001c0001t0001g0172
a0001c0001t0001g0174
a0001c0001t0001g0176
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a0001c0001t0004g0173
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 13 NA18942.hp1
NA18948.hp2
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others(10): Show 
NA18942.hp1
NA18948.hp2
NA18952.hp1
NA18972.hp2
NA18973.hp1
NA18986.hp1
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A
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A
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G
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A
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A
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A
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A
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T
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A
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 C
C
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C
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A
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A
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G
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0189
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HG00738.hp2
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A
 T
T
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C
 T
T
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C
 T
T
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C
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c.317-56090G>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.317-56077G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113493438
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G
 A
A
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c.317-55972G>A
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A
 C
C
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
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a0001c0001t0006g0062
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HG02055.hp1
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HG03209.hp1
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c.317-55851A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113493664
chr1:113493672 T
T
 G
G
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a0001c0001t0004g0013
a0001c0001t0004g0014
a0001c0001t0004g0012
a0001c0001t0004g0013
a0001c0001t0004g0014
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NA18944.hp2
NA19054.hp2
NA19058.hp1
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c.317-55843T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113493672
chr1:113494066 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0184
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HG02922.hp1
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c.317-55449G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113494066
chr1:113494353 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0116
a0001c0001t0003g0116
 1 NA19078.hp2
NA19078.hp2
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c.317-55162C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113494353
chr1:113494656 TCTTTTAA
others(1): Show 
TCTTTTAAA
 T
T
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a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 2 HG02630.hp1
HG02965.hp2
HG02630.hp1
HG02965.hp2
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others(12): Show 
c.317-54858_317-54851delCTTTTAAA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113494656
chr1:113494667 GT
GT
 G
G
 2 a0001c0003t0006g0130
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a0001c0003t0006g0130
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HG02630.hp1
HG02965.hp2
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c.317-54847delT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113494667
chr1:113494720 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0071
a0001c0001t0003g0071
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NA19077.hp2
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c.317-54795G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113494720
chr1:113494785 A
A
 G
G
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a0001c0001t0005g0083
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a0001c0001t0005g0107
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NA18943.hp1
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NA18747.hp2
NA18943.hp1
NA18989.hp1
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c.317-54730A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113494785
chr1:113495358 C
C
 CT
CT
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c.317-54143dupT
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chr1:113495373 A
A
 T
T
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a0001c0002t0002g0021
a0001c0002t0002g0020
a0001c0002t0002g0021
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HG01516.hp1
HG01517.hp1
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c.317-54142A>T
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T
 C
C
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a0001c0001t0003g0100
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NA19091.hp1
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c.317-54023T>C
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chr1:113495930 CTA
CTA
 C
C
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c.317-53583_317-53582delAT
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chr1:113495931 T
T
 A
A
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a0001c0003t0002g0178
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NA21309.hp1
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c.317-53584T>A
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G
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0189
a0001c0001t0002g0189
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HG00738.hp2
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c.317-53132G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113496383
chr1:113496466 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0002g0032
a0001c0002t0002g0032
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NA18955.hp2
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c.317-53049A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113496466
chr1:113496512 G
G
 C
C
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a0001c0001t0001g0143
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NA18992.hp2
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c.317-53003G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113496512
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T
 G
G
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a0001c0001t0006g0062
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a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.317-52944T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113496571
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G
 A
A
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HG00140.hp2
HG00642.hp1
HG01081.hp1
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c.317-52823G>A
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AT
 A
A
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.317-52771delT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113496739
chr1:113496765 C
C
 T
T
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a0001c0001t0003g0060
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NA18747.hp1
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c.317-52750C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113496765
chr1:113497023 A
A
 G
G
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TAAGATCACACCACTGGAATAGGAACAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCG
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GTTCATCTCACTAGGGAGTGCCAGACAGTGGGCGCAGGCCAGTGTGTGTG
CGCACCGTGCGCGAGCCGAAGCAGGGCGAGGCATTGCCTCACCTGGGAAG
CGCAAGGGGTCAGGGAGTTCCCTTTCCGAGTCAAAGAAAGGGGTGATGGA
CGCACCTGGAAAATCGGGTCACTCCCACCCGAATATTGCGCTTTTCAGAC
CGGCTTAAGAAACGGCGCACCACGAGACTATATCCCACACCTGGCTCAGA
GGGTCCTACGCCCACGGAATCTCGCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTGAGA
TCAAACTGCAAGGCGGCAACGAGGCTGGGGGAGGGGCGCCCGCCATTGCC
CAGGCTTGCTTAGGTAAACAAAGCAGCCGGGAAGCTCGAACTGGGTGGAG
CCCACCACAGCTCAAGGAGGCCTGCCTGCCTCTGTAGGCTCCACCTCTGG
GAGCAGGGCACAGACAAACAAAAAGGCAGCAGTAACCTCTGCAGACTTAA
GTGTCCCTGTCTGACAGCTTTGAAGAGAGCAGTGGTTCTCCCAGCACGCA
GCTGGAGATCTGAGAACGGGCAGACTGCCTCCTCAAGTGGGTCCCTGACC
CCTGACCCCCGAGCAGCCTAACTGGGAGGCACCCCCCAGCAGGGGCACAC
TGACACCTCACACGGCAGGGTATTCCAACAGACCTGCAGCTGAGGGTCCT
GTCTGTTAGAAGGAAAACTAACAACCAGAAAGGACATCTACACCGAAAAC
CCATCTGTACATCACCATCATCAAAGACCAAAAGTAGATAAAACCACAAA
GATGGGGAAAAAACAGAACAGAAAAACTGGAAACTCTAAAACGCAGAGCG
CCTCTCCTCCTCCAAAGGAACGCAGTTCCTCACCAGCAACAGAACAAAGC
TGGATGGAGAATGATTTTGACGAGCTGAGAGAAGAAGGCTTCAGACGATC
AAATTACTCTGAGCTACGGGAGGACATTCAAACCAAAGGCAAAGAAGTTG
AAAACTTTGAAAAAAATTTAGAAGAATGTATAACTAGAATAACCAATACA
GAGAAGTGCTTAAAGGAGCTGATGGAGCTGAAAACCAAGGCTCGAGAACT
ACGTGAAGAATGCAGAAGCCTCAGGAGCCGATGCGATCAACTGGAAGAAA
GGGTATCAGCAATGGAAGATGAAATGAATGAAATGAAGCGAGAAGGGAAG
TTTAGAGAAAAAAGAATAAAAAGAAATGAGCAAAGCCTCCAAGAAATATG
GGACTATGTGAAAAGACCAAATCTACGTCTGATTGGTGTACCTGAAAGTG
ATGTGGAGAATGGAACCAAGTTGGAAAACACTCTGCAGGATATTATCCAG
GAGAACTTCCCCAATCTAGCAAGGCAGGCCAACGTTCAGATTCAGGAAAT
ACAGAGAACGCCACAAAGATACTCCTCGAGAAGAGCAACTCCAAGACACA
TAATTGTCAGATTCACCAAAGTTGAAATGAAGGAAAAAATGTTAAGGGCA
GCCAGAGAGAAAGGTCGGGTTACCCTCAAAGGGAAGCCTATCAGACTAAC
AGCAGATCTCTCGGCAGAAACCCTACAAGCCAGAAGAGAGTGGGGGCCAA
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C
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A
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A
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C
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T
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A
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G
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a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
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 A
A
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a0001c0001t0001g0222
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C
 G
G
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 T
T
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 C
C
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a0001c0001t0007g0131
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a0001c0002t0006g0132
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HG01255.hp2
HG01496.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
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A
 G
G
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0163
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HG02897.hp1
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0206
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HG03098.hp2
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 A
A
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 T
T
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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 A
A
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c.317-48979G>A
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C
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A
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C
 A
A
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a0001c0001t0007g0129
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A
 G
G
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 A
A
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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T
 C
C
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A
 G
G
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 T
T
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a0001c0001t0001g0194
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HG02965.hp1
NA20300.hp2
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 C
C
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a0001c0001t0002g0180
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HG02647.hp2
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0002g0180
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HG02647.hp2
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c.317-47761G>A
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T
 G
G
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G
 A
A
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 A
A
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c.317-47354G>A
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A
 C
C
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C
 A
A
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NA18995.hp1
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A
 C
C
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c.317-47158A>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0149
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HG00140.hp1
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c.317-47111G>A
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G
 A
A
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a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
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HG02630.hp1
HG02965.hp2
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c.317-46843G>A
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A
 G
G
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A
 C
C
 6 a0001c0001t0007g0129
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.317-46772A>C
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A
 G
G
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NA19080.hp2
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chr1:113502767 T
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 A
A
 107 a0001c0001t0001g0049
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c.317-46748T>A
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A
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G
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 A
A
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.317-46553G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0154
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NA20805.hp2
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G
 A
A
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HG01123.hp2
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c.317-46472G>A
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G
 A
A
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HG01109.hp1
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c.317-46448G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0194
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HG02965.hp1
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 T
T
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a0001c0002t0006g0132
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HG01255.hp2
HG01496.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
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others(8): Show 
c.317-46296_317-46293delTAAA
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T
 TA
TA
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c.317-46258dupA
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T
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TAA
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T
 TAAA
TAAA
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T
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TA
 T
T
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c.317-46258delA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113503219
chr1:113503219 TAA
TAA
 T
T
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GAA
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C
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C
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T
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A
 G
G
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 G
G
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A
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 C
C
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TAATA
 T
T
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 C
C
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c.317-43317G>A
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A
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CT
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A
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T
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T
 C
C
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A
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T
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C
 A
A
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HG01261.hp1
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c.317-40289C>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0003g0092
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NA18985.hp2
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c.317-40268G>A
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chr1:113509250 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0003g0092
a0001c0001t0003g0092
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NA18985.hp2
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c.317-40265T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113509250
chr1:113509251 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0092
a0001c0001t0003g0092
 1 NA18985.hp2
NA18985.hp2
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c.317-40264G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113509251
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TTG
 T
T
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TG
 T
T
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c.317-40146delG
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G
 T
T
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c.317-40146G>T
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C
 CT
CT
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T
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T
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A
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A
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T
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G
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A
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C
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C
 T
T
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T
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 T
T
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T
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C
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G
 C
C
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HG00621.hp2
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c.317-36301G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113513214
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A
 G
G
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 A
A
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NA18947.hp1
NA19063.hp2
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c.317-36201G>A
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A
 G
G
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NA18940.hp2
NA18978.hp2
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c.317-36139A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113513376
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 G
G
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NA18985.hp1
NA18986.hp1
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A
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c.317-35962T>C
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chr1:113513554 T
T
 G
G
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a0001c0001t0003g0116
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NA19078.hp2
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c.317-35961T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113513554
chr1:113513614 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0062
a0001c0001t0014g0063
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HG02055.hp2
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.317-35901A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113513614
chr1:113513634 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0139
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HG02976.hp2
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c.317-35881G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113513634
chr1:113513744 A
A
 T
T
 1 a0001c0002t0002g0007
a0001c0002t0002g0007
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NA19078.hp1
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c.317-35771A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113513744
chr1:113513882 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0014g0063
a0001c0001t0014g0063
 1 HG02055.hp2
HG02055.hp2
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c.317-35633G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113513882
chr1:113513936 A
A
 AAAAC
AAAAC
 3 a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0137
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0137
 3 HG01081.hp2
HG01257.hp1
HG03927.hp2
HG01081.hp2
HG01257.hp1
HG03927.hp2
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others(8): Show 
c.317-35576_317-35573dupACAA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113513936
chr1:113513943 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0030
a0001c0001t0004g0030
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NA18983.hp1
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c.317-35572C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113513943
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T
 C
C
 4 a0001c0001t0001g0135
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a0001c0001t0001g0136
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 4 HG01081.hp2
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others(1): Show 
HG01081.hp2
HG01257.hp1
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HG03927.hp2
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c.317-35555T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113513960
chr1:113513961 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0002g0220
a0001c0002t0002g0220
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HG03927.hp1
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c.317-35554G>A
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chr1:113514069 A
A
 T
T
 1 a0001c0002t0002g0212
a0001c0002t0002g0212
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HG00642.hp1
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c.317-35446A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113514069
chr1:113514101 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
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c.317-35414C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113514101
chr1:113514152 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0174
a0001c0001t0001g0174
 1 NA19002.hp2
NA19002.hp2
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c.317-35363T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113514152
chr1:113514219 G
G
 A
A
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others(65): Show 
HG00423.hp2
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HG01070.hp1
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NA18985.hp2
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NA18989.hp1
NA18990.hp1
NA18992.hp1
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NA19070.hp1
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NA19081.hp1
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NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.317-35296G>A
c.317-35296G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113514219
chr1:113514229 G
G
 A
A
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others(3): Show 
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 intron_variant MODIFIER c.317-35286G>A
c.317-35286G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113514229
chr1:113514308 A
A
 G
G
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others(5): Show 
a0001c0001t0003g0075
a0001c0001t0003g0078
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HG00423.hp2
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NA19060.hp2
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c.317-35207A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113514308
chr1:113514389 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0010
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T
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c.317-35072C>T
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C
 T
T
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a0001c0001t0003g0123
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HG00423.hp2
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 T
T
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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HG01123.hp2
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T
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G
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 T
T
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A
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T
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c.317-34615T>C
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T
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A
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T
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a0001c0001t0002g0159
a0001c0001t0002g0192
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HG02976.hp1
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c.317-34355A>T
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T
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a0001c0001t0003g0124
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NA18967.hp2
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T
 A
A
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a0001c0001t0003g0116
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c.317-34346T>A
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C
 T
T
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A
 G
G
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HG00741.hp2
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 T
T
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A
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c.317-33788T>C
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A
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c.317-33419G>A
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C
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T
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CA
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c.317-33101dupA
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C
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CAA
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CA
 C
C
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c.317-33101delA
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G
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A
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a0001c0001t0006g0062
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HG02055.hp1
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c.317-32410G>A
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GA
 G
G
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.317-32079delA
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T
 G
G
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a0001c0001t0001g0164
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HG02647.hp1
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G
 T
T
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a0001c0001t0001g0139
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HG02976.hp2
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c.317-31995G>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.317-31665G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113517850
chr1:113517864 A
A
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G
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a0001c0002t0002g0233
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HG04199.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0027
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HG01109.hp2
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c.317-31429G>A
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chr1:113518105 T
T
 G
G
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a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0206
a0001c0009t0002g0057
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HG02647.hp1
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0049
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113518176
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T
 A
A
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A
 C
C
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a0001c0001t0002g0161
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HG02559.hp1
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c.317-30960A>C
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C
 T
T
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HG01255.hp2
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T
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G
 C
C
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a0001c0001t0003g0079
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HG02083.hp2
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c.317-29611G>C
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A
 AT
AT
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c.317-29330dupT
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chr1:113520174 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0001
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HG01070.hp2
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T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0001
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HG01070.hp2
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c.317-29340T>C
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 A
A
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A
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c.317-28545A>G
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A
 AT
AT
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c.317-28411dupT
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chr1:113521088 A
A
 ATT
ATT
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c.317-28412_317-28411dupTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113521088
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C
 T
T
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a0001c0001t0003g0074
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NA18986.hp2
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c.317-28336C>T
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TTTG
 T
T
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HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
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others(7): Show 
c.317-28109_317-28107delGTT
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T
 G
G
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a0001c0001t0003g0077
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NA19081.hp1
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c.317-28106T>G
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chr1:113521409 TTTTG
TTTTG
 T
T
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others(1): Show 
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HG00621.hp2
HG02055.hp1
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others(8): Show 
c.317-28102_317-28099delGTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113521409
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T
 G
G
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c.317-28105T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113521410
chr1:113521410 TTTG
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 T
T
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others(60): Show 
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others(7): Show 
c.317-28102_317-28100delGTT
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G
 T
T
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HG01255.hp2
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c.317-28102G>T
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G
 T
T
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A
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A
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NA20300.hp2
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0196
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C
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T
 A
A
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A
 G
G
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T
 C
C
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c.317-25146T>C
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G
 A
A
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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c.317-24810G>A
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AGAGAT
 A
A
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G
 A
A
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T
 G
G
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HG01516.hp2
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T
 C
C
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a0001c0001t0006g0062
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HG03209.hp1
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c.317-24048T>C
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G
 T
T
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c.317-23558G>T
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G
 C
C
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c.317-23351G>C
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G
 A
A
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HG03098.hp2
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c.317-23298G>A
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chr1:113526311 C
C
 T
T
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G
 C
C
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G
 A
A
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G
 T
T
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HG03041.hp1
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113526813
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G
 T
T
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c.317-22498G>T
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T
 C
C
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c.317-22467T>C
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G
 T
T
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HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG03209.hp1
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CT
 C
C
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others(64): Show 
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G
 A
A
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T
 C
C
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T
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A
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T
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 C
C
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A
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c.317-19178dupA
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C
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T
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c.317-19167C>T
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C
 T
T
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C
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c.317-18985G>C
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TA
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T
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c.317-18901delA
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chr1:113530708 C
C
 T
T
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c.317-18807C>T
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 C
C
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G
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A
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HG03041.hp1
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A
 G
G
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c.317-18325A>G
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T
 C
C
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 A
A
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NA18943.hp2
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c.317-17834G>A
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 A
A
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HG03209.hp1
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c.317-17804G>A
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C
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CAG
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A
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HG02897.hp2
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 T
T
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HG02630.hp2
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c.317-17432G>T
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C
 T
T
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HG03209.hp1
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 A
A
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.317-16971C>A
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G
 C
C
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T
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G
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T
 C
C
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C
 T
T
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A
 G
G
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HG01192.hp1
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c.317-15815A>G
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C
 CT
CT
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T
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T
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 A
A
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T
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A
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T
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C
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A
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C
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CT
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G
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C
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T
 G
G
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A
 T
T
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
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c.317-12826A>T
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A
 G
G
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A
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HG01175.hp2
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c.317-12744G>A
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T
 C
C
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 A
A
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a0001c0001t0006g0061
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HG03209.hp1
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 T
T
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HG00621.hp2
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 T
T
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HG00099.hp2
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HG04115.hp1
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 A
A
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HG01123.hp1
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 A
A
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T
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C
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A
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C
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T
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A
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G
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C
 T
T
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A
 C
C
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T
 C
C
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T
 C
C
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A
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G
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 A
A
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A
 G
G
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T
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C
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T
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G
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T
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AAAT
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A
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A
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A
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A
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A
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 C
C
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a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0158
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HG00099.hp2
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c.317-7848G>A
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G
 A
A
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C
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T
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C
 T
T
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chr1:113541975 C
C
 G
G
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NA21309.hp1
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 G
G
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C
 T
T
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T
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c.317-6916C>T
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chr1:113542600 G
G
 A
A
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HG03098.hp1
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c.317-6915G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113542600
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C
 T
T
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c.317-6757C>T
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chr1:113542768 C
C
 G
G
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HG02897.hp1
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c.317-6747C>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.317-6670T>C
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A
 G
G
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c.317-6613A>G
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G
 A
A
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c.317-6461G>A
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c.317-5316T>C
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T
 C
C
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HG01257.hp2
HG01258.hp1
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c.317-5128T>C
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G
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A
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a0001c0001t0001g0164
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HG02647.hp1
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c.317-4986G>A
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TAAAC
 T
T
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0202
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HG00738.hp1
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c.317-4572A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.317-4571T>C
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G
 C
C
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.317-4492G>C
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C
 CT
CT
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HG00642.hp1
HG01069.hp2
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c.317-4469dupT
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GT
 G
G
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others(73): Show 
HG00140.hp1
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c.317-4422delT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113545083
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T
 G
G
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c.317-4427T>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0194
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HG02965.hp1
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c.317-4421A>G
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T
 C
C
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HG01257.hp2
HG01258.hp1
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c.317-4220T>C
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A
 ATT
ATT
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chr1:113545477 G
G
 C
C
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.317-4038G>C
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C
 A
A
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HG00621.hp2
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c.317-4004C>A
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A
 G
G
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c.317-3721A>G
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A
 C
C
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HG00621.hp2
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c.317-3391A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113546124
chr1:113546346 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.317-3169C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113546346
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T
 G
G
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C
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A
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A
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NA21309.hp1
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c.317-254C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113549261
chr1:113549276 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0002g0220
a0001c0002t0002g0220
 1 HG03927.hp1
HG03927.hp1
 intron_variant MODIFIER c.317-239G>A
c.317-239G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113549276
chr1:113549298 T
T
 C
C
 11 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
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a0001c0001t0007g0133
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0008t0009g0056
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 11 HG00642.hp2
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HG00642.hp2
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NA21309.hp1
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c.317-217T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113549298
chr1:113549352 T
T
 C
C
 1 a0001c0009t0002g0057
a0001c0009t0002g0057
 1 HG02897.hp2
HG02897.hp2
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c.317-163T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 chr1 113549352
chr1:113549489 G
G
 GTTT
GTTT
 8 a0001c0001t0001g0001
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a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0013g0127
 8 HG00642.hp2
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others(5): Show 
HG00642.hp2
HG01070.hp2
HG01099.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
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NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.317-16_317-14dupTT
others(1): Show 
c.317-16_317-14dupTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 1/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113549489
chr1:113549656 A
A
 G
G
 15 a0001c0001t0001g0029
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 15 HG01192.hp2
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NA18948.hp2
others(12): Show 
HG01192.hp2
NA18942.hp1
NA18948.hp2
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NA19091.hp2
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.433+25A>G
c.433+25A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113549656
chr1:113549684 A
A
 G
G
 29 a0001c0001t0001g0027
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others(26): Show 
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a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0050
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 29 HG00099.hp2
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HG00741.hp1
others(26): Show 
HG00099.hp2
HG00738.hp1
HG00741.hp1
HG01081.hp2
HG01109.hp2
HG01175.hp1
HG01192.hp1
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NA18939.hp1
NA18953.hp2
NA18980.hp1
NA18984.hp1
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NA18998.hp2
NA20805.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+53A>G
c.433+53A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113549684
chr1:113549909 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0161
a0001c0001t0002g0161
 1 HG02559.hp1
HG02559.hp1
 intron_variant MODIFIER c.433+278A>G
c.433+278A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113549909
chr1:113549972 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0061
 1 HG03209.hp1
HG03209.hp1
 intron_variant MODIFIER c.433+341C>G
c.433+341C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113549972
chr1:113550060 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+429G>A
c.433+429G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113550060
chr1:113550133 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0120
a0001c0001t0003g0120
 1 HG01070.hp1
HG01070.hp1
 intron_variant MODIFIER c.433+502G>A
c.433+502G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113550133
chr1:113550185 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+554C>T
c.433+554C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113550185
chr1:113550254 C
C
 CA
CA
 67 a0001c0001t0001g0153
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a0001c0001t0001g0158
others(64): Show 
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a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0158
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 67 HG00099.hp2
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others(64): Show 
HG00099.hp2
HG00140.hp1
HG00621.hp1
HG00741.hp1
HG01069.hp1
HG01070.hp1
HG01123.hp1
HG01243.hp1
HG01258.hp2
HG01261.hp1
HG01496.hp2
HG01928.hp2
HG01943.hp1
HG01952.hp1
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HG02004.hp1
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HG02056.hp2
HG02071.hp1
HG02293.hp2
HG02559.hp2
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HG03654.hp1
NA18747.hp1
NA18942.hp2
NA18944.hp1
NA18948.hp1
NA18950.hp2
NA18952.hp2
NA18953.hp1
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NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA18971.hp2
NA18972.hp1
NA18973.hp2
NA18978.hp2
NA18980.hp2
NA18983.hp2
NA18984.hp2
NA18985.hp2
NA18986.hp2
NA18990.hp1
NA18992.hp1
NA18994.hp2
NA18998.hp1
NA19000.hp2
NA19002.hp1
NA19003.hp2
NA19006.hp1
NA19011.hp1
NA19056.hp2
NA19060.hp2
NA19063.hp1
NA19070.hp1
NA19074.hp2
NA19078.hp2
NA19081.hp1
NA19083.hp1
NA19091.hp1
NA20300.hp1
NA20752.hp2
NA20805.hp1
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+636dupA
c.433+636dupA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113550254
chr1:113550254 C
C
 CAA
CAA
 6 a0001c0001t0002g0038
a0001c0001t0003g0071
a0001c0001t0003g0075
others(3): Show 
a0001c0001t0002g0038
a0001c0001t0003g0071
a0001c0001t0003g0075
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 6 HG00423.hp2
HG02083.hp2
NA18939.hp2
others(3): Show 
HG00423.hp2
HG02083.hp2
NA18939.hp2
NA18940.hp2
NA18965.hp1
NA19077.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+635_433+636dup
others(2): Show 
c.433+635_433+636dupAA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113550254
chr1:113550254 C
C
 CAAA
CAAA
 10 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0008t0009g0056
 10 HG00642.hp2
HG01070.hp2
HG01099.hp2
others(7): Show 
HG00642.hp2
HG01070.hp2
HG01099.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
HG03041.hp1
HG04204.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.433+634_433+636dup
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HG00642.hp1
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c.433+662G>A
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0050
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NA18998.hp2
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c.433+765A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113550396
chr1:113550635 A
A
 T
T
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HG00642.hp2
HG01070.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.433+1074G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113550705
chr1:113550718 T
T
 G
G
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a0001c0001t0002g0149
a0001c0001t0002g0207
a0001c0001t0002g0231
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HG00140.hp1
HG01069.hp1
HG02559.hp2
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c.433+1087T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113550718
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C
 CA
CA
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HG00642.hp2
HG01070.hp2
HG01099.hp2
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c.433+1138dupA
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chr1:113550764 A
A
 G
G
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.433+1133A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113550764
chr1:113550784 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
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c.433+1153A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113550784
chr1:113550786 A
A
 T
T
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a0001c0001t0007g0129
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a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0007g0129
a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
HG02965.hp1
HG00621.hp2
HG02897.hp2
HG02965.hp1
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c.433+1155A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113550786
chr1:113550788 T
T
 A
A
 1 a0001c0002t0002g0209
a0001c0002t0002g0209
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HG03490.hp1
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c.433+1157T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113550788
chr1:113550799 T
T
 A
A
 69 a0001c0001t0002g0033
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others(66): Show 
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others(66): Show 
HG00140.hp1
HG00423.hp2
HG00621.hp1
HG01069.hp1
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HG03239.hp1
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NA18939.hp2
NA18940.hp2
NA18942.hp2
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NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+1168T>A
c.433+1168T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113550799
chr1:113550943 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+1312T>G
c.433+1312T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113550943
chr1:113550944 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+1313T>C
c.433+1313T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113550944
chr1:113550970 AAG
AAG
 A
A
 13 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
others(10): Show 
a0001c0001t0001g0001
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a0001c0001t0007g0133
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 13 HG00642.hp2
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others(10): Show 
HG00642.hp2
HG01070.hp2
HG01099.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
HG03041.hp1
HG04204.hp1
NA18940.hp2
NA18973.hp2
NA19060.hp2
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.433+1341_433+1342d
others(4): Show 
c.433+1341_433+1342delGA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113550970
chr1:113550971 AG
AG
 A
A
 114 a0001c0001t0001g0199
a0001c0001t0002g0033
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others(111): Show 
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a0001c0001t0002g0033
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a0001c0001t0002g0219
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T
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C
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C
 T
T
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G
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A
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C
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A
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G
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 A
A
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HG02897.hp2
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 G
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c.433+3497A>G
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T
 C
C
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c.433+3512T>C
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C
 A
A
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NA18960.hp2
NA18989.hp1
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c.433+3540C>A
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G
 A
A
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HG00621.hp2
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c.433+3832G>A
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G
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c.433+3844T>G
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G
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C
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HG02647.hp2
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c.433+4049G>C
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A
 G
G
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c.433+4207A>G
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C
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HG01192.hp2
NA18942.hp1
NA18948.hp2
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c.433+4221T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113553852
chr1:113553870 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0182
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HG02897.hp1
HG01175.hp1
HG02897.hp1
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c.433+4239G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113553870
chr1:113553877 C
C
 T
T
 37 a0001c0001t0004g0002
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HG00423.hp1
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c.433+4246C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113553877
chr1:113554096 A
A
 G
G
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a0001c0001t0012g0073
 1 NA19004.hp2
NA19004.hp2
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c.433+4465A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113554096
chr1:113554280 CAT
CAT
 C
C
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a0001c0001t0001g0010
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others(7): Show 
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others(7): Show 
HG00642.hp2
HG01070.hp2
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others(4): Show 
c.433+4652_433+4653delAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113554280
chr1:113554283 A
A
 ATG
ATG
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others(5): Show 
a0001c0001t0001g0196
a0001c0001t0002g0006
a0001c0001t0002g0217
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 8 HG01123.hp2
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others(5): Show 
HG01123.hp2
HG01255.hp1
HG01517.hp2
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NA19080.hp2
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others(4): Show 
c.433+4670_433+4671dupGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113554283
chr1:113554538 A
A
 G
G
 10 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
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others(7): Show 
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a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0008t0009g0056
 10 HG00642.hp2
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others(7): Show 
HG00642.hp2
HG01070.hp2
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HG01255.hp2
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NA21309.hp1
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c.433+4907A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113554538
chr1:113554845 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0112
a0001c0001t0003g0112
 1 NA18998.hp1
NA18998.hp1
 intron_variant MODIFIER c.433+5214G>T
c.433+5214G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113554845
chr1:113554988 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+5357T>C
c.433+5357T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113554988
chr1:113555031 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+5400A>G
c.433+5400A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113555031
chr1:113555124 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+5493A>C
c.433+5493A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113555124
chr1:113555205 G
G
 A
A
 1 a0001c0009t0002g0057
a0001c0009t0002g0057
 1 HG02897.hp2
HG02897.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+5574G>A
c.433+5574G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113555205
chr1:113555457 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0010g0134
a0001c0001t0010g0134
 1 NA21309.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+5826A>G
c.433+5826A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113555457
chr1:113555564 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0061
 1 HG03209.hp1
HG03209.hp1
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c.433+5933G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113555564
chr1:113555766 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+6135A>G
c.433+6135A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113555766
chr1:113555779 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0001g0138
a0001c0002t0002g0209
a0001c0001t0001g0138
a0001c0002t0002g0209
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HG03834.hp1
HG03490.hp1
HG03834.hp1
 intron_variant MODIFIER c.433+6148T>C
c.433+6148T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113555779
chr1:113555877 G
G
 A
A
 38 a0001c0001t0001g0199
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others(35): Show 
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a0001c0002t0002g0007
a0001c0002t0002g0008
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 38 HG00140.hp2
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others(35): Show 
HG00140.hp2
HG00642.hp1
HG01069.hp2
HG01109.hp1
HG01175.hp2
HG01243.hp2
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HG01258.hp1
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NA18947.hp1
NA18955.hp2
NA18960.hp1
NA18961.hp1
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NA18978.hp1
NA18989.hp2
NA19054.hp1
NA19058.hp2
NA19063.hp2
NA19070.hp2
NA19078.hp1
NA19082.hp1
NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.433+6246G>A
c.433+6246G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113555877
chr1:113555908 TTAC
TTAC
 T
T
 10 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0007g0131
a0001c0001t0007g0133
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0008t0009g0056
 10 HG00642.hp2
HG01070.hp2
HG01099.hp2
others(7): Show 
HG00642.hp2
HG01070.hp2
HG01099.hp2
HG01255.hp2
HG01496.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
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HG04204.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.433+6280_433+6282d
others(5): Show 
c.433+6280_433+6282delCTA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113555908
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0185
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HG03098.hp1
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c.433+6302T>C
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AG
 A
A
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c.433+6614delG
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A
 AT
AT
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c.433+6943dupT
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AT
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A
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HG00423.hp2
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c.433+6943delT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113556552
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G
 A
A
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a0001c0004t0002g0183
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HG00741.hp2
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c.433+7173G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113556804
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T
 C
C
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NA18942.hp2
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c.433+7398T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113557029
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 A
A
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a0001c0002t0002g0229
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NA18947.hp1
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c.433+7512G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113557143
chr1:113557334 C
C
 T
T
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NA18960.hp1
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c.433+7703C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113557334
chr1:113557435 G
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 T
T
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HG00099.hp1
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c.433+7804G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113557435
chr1:113557542 A
A
 G
G
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NA18983.hp2
HG02630.hp2
NA18983.hp2
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c.433+7911A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113557542
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C
 T
T
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a0001c0001t0004g0047
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NA19064.hp1
NA18995.hp1
NA19064.hp1
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C
 T
T
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a0001c0003t0006g0130
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HG02965.hp2
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chr1:113558036 C
C
 A
A
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a0001c0001t0003g0115
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NA18961.hp2
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c.433+8405C>A
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chr1:113558145 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0027
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HG01109.hp2
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C
 T
T
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G
 A
A
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A
 G
G
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113558516
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C
 T
T
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NA18947.hp2
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c.433+8910C>T
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G
 T
T
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c.433+8957G>T
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A
 G
G
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HG01433.hp2
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c.433+9225A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113558856
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A
 T
T
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c.433+9375A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113559006
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T
 C
C
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HG00423.hp2
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A
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A
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T
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c.433+10781dupA
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A
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 A
A
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HG01261.hp2
HG01516.hp1
HG01517.hp1
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c.433+10782C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113560413
chr1:113560908 A
A
 C
C
 1 a0001c0009t0002g0057
a0001c0009t0002g0057
 1 HG02897.hp2
HG02897.hp2
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c.433+11277A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113560908
chr1:113561173 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0140
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HG01099.hp1
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c.433+11542A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113561173
chr1:113561351 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0061
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HG03209.hp1
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c.433+11720A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113561351
chr1:113561495 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0007g0129
a0001c0001t0007g0129
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
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c.433+11864A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113561495
chr1:113561629 C
C
 A
A
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HG02083.hp1
NA18955.hp2
NA18961.hp1
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c.433+11998C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113561629
chr1:113561661 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0002g0031
a0001c0002t0002g0031
 1 NA18961.hp1
NA18961.hp1
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c.433+12030C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113561661
chr1:113561732 C
C
 A
A
 37 a0001c0001t0004g0002
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 37 HG00099.hp1
HG00423.hp1
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others(34): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp1
HG01081.hp1
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HG01943.hp2
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NA19011.hp2
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NA19056.hp1
NA19058.hp1
NA19060.hp1
NA19064.hp1
NA19080.hp1
NA19082.hp2
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c.433+12101C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113561732
chr1:113561794 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0003g0084
a0001c0001t0003g0084
 1 NA19083.hp1
NA19083.hp1
 intron_variant MODIFIER c.433+12163T>C
c.433+12163T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113561794
chr1:113561833 C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0184
 3 HG01433.hp1
HG02922.hp1
HG02976.hp2
HG01433.hp1
HG02922.hp1
HG02976.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+12202C>T
c.433+12202C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113561833
chr1:113561941 A
A
 G
G
 1 a0001c0009t0002g0057
a0001c0009t0002g0057
 1 HG02897.hp2
HG02897.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+12310A>G
c.433+12310A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113561941
chr1:113561963 A
A
 G
G
 8 a0001c0001t0001g0049
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others(5): Show 
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a0001c0001t0001g0050
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 8 HG03654.hp2
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others(5): Show 
HG03654.hp2
HG04115.hp1
NA18939.hp1
NA18953.hp2
NA18980.hp1
NA18984.hp1
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NA18998.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+12332A>G
c.433+12332A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113561963
chr1:113562143 C
C
 T
T
 40 a0001c0001t0004g0002
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others(37): Show 
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 40 HG00099.hp1
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HG00741.hp2
others(37): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp1
HG00741.hp2
HG01081.hp1
HG01433.hp2
HG01943.hp2
HG02055.hp1
HG02056.hp1
HG02071.hp2
HG02129.hp2
HG02300.hp1
HG02683.hp2
HG03041.hp2
HG03834.hp2
HG04199.hp1
HG04204.hp2
NA18747.hp2
NA18940.hp1
NA18943.hp1
NA18944.hp2
NA18947.hp2
NA18960.hp2
NA18962.hp2
NA18965.hp2
NA18967.hp1
NA18971.hp1
NA18983.hp1
NA18989.hp1
NA18994.hp1
NA18995.hp1
NA19004.hp1
NA19006.hp2
NA19011.hp2
NA19054.hp2
NA19056.hp1
NA19058.hp1
NA19060.hp1
NA19064.hp1
NA19080.hp1
NA19082.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+12512C>T
c.433+12512C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113562143
chr1:113562202 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0102
a0001c0001t0003g0102
 1 HG02056.hp2
HG02056.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+12571G>A
c.433+12571G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113562202
chr1:113562233 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0002g0233
a0001c0002t0002g0233
 1 HG04199.hp2
HG04199.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+12602G>A
c.433+12602G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113562233
chr1:113562407 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0002g0224
a0001c0002t0002g0224
 1 HG01175.hp2
HG01175.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+12776A>G
c.433+12776A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113562407
chr1:113562444 A
A
 T
T
 1 a0001c0009t0002g0057
a0001c0009t0002g0057
 1 HG02897.hp2
HG02897.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+12813A>T
c.433+12813A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113562444
chr1:113562660 G
G
 GAAC
GAAC
 10 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
a0001c0001t0001g0211
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a0001c0001t0007g0133
a0001c0003t0002g0178
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a0001c0003t0013g0127
a0001c0008t0009g0056
 10 HG00642.hp2
HG01070.hp2
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others(7): Show 
HG00642.hp2
HG01070.hp2
HG01099.hp2
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HG01496.hp1
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HG02965.hp2
HG03041.hp1
HG04204.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.433+13034_433+1303
others(7): Show 
c.433+13034_433+13036dupACA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113562660
chr1:113562680 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0041
a0001c0001t0004g0041
 1 HG02683.hp2
HG02683.hp2
 intron_variant MODIFIER c.433+13049T>C
c.433+13049T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113562680
chr1:113562854 A
A
 C
C
 78 a0001c0001t0002g0006
a0001c0001t0002g0016
a0001c0001t0002g0033
others(75): Show 
a0001c0001t0002g0006
a0001c0001t0002g0016
a0001c0001t0002g0033
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G
 C
C
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C
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T
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A
 G
G
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HG02647.hp1
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T
 C
C
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c.433+14516T>C
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T
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T
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T
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T
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T
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A
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A
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G
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G
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A
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 A
A
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 T
T
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c.434-13543G>T
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GT
 G
G
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T
 G
G
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 A
A
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c.434-13529T>A
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A
 G
G
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c.434-13486A>G
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T
 G
G
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C
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A
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C
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A
 T
T
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G
 A
A
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a0001c0001t0005g0105
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T
 C
C
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a0001c0001t0003g0112
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C
 T
T
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A
 G
G
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 A
A
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C
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T
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A
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GT
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C
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A
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T
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A
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c.434-9458G>A
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T
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C
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NA19091.hp1
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c.434-9329T>C
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T
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 T
T
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c.434-8627A>T
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T
 C
C
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c.434-8156A>G
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A
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T
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A
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T
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A
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G
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T
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A
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A
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 G
G
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 T
T
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a0001c0001t0002g0039
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NA18978.hp2
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c.434-4596G>T
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A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0039
a0001c0001t0002g0039
 1 NA18978.hp2
NA18978.hp2
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c.434-4595A>G
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chr1:113575948 G
G
 C
C
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a0001c0001t0002g0039
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NA18978.hp2
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c.434-4594G>C
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C
 T
T
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c.434-4590C>T
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C
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c.434-4586_434-4585insGAGTCCCGAC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113575954
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G
 T
T
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a0001c0001t0002g0039
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NA18978.hp2
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c.434-4584G>T
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G
 T
T
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HG00642.hp1
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c.434-4422G>T
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C
 G
G
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HG00423.hp1
HG01081.hp1
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c.434-4362C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113576180
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0160
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HG02630.hp2
 intron_variant MODIFIER c.434-4230G>A
c.434-4230G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113576312
chr1:113576503 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0039
a0001c0001t0002g0039
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NA18978.hp2
 intron_variant MODIFIER c.434-4039T>A
c.434-4039T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113576503
chr1:113576504 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0039
a0001c0001t0002g0039
 1 NA18978.hp2
NA18978.hp2
 intron_variant MODIFIER c.434-4038C>T
c.434-4038C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113576504
chr1:113576544 A
A
 G
G
 9 a0001c0001t0002g0232
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others(6): Show 
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others(6): Show 
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NA18990.hp1
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NA20300.hp1
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c.434-3998A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 2/20 chr1 113576544
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A
 G
G
 78 a0001c0001t0002g0006
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A
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 A
A
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 A
A
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 G
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c.434-1484A>G
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T
 C
C
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HG03239.hp1
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c.434-1428T>C
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C
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T
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NA18986.hp1
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c.434-1345C>T
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C
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A
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HG01346.hp2
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c.434-795C>A
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A
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c.434-562G>A
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 C
C
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 C
C
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A
 G
G
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A
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C
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c.553+1976A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0027
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
HG01109.hp2
HG03209.hp2
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c.553+2064C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 3/20 chr1 113582725
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A
 G
G
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NA18944.hp1
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NA18980.hp2
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c.553+2130A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 3/20 chr1 113582791
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TATAA
 T
T
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c.553+2190_553+2193delAATA
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chr1:113582876 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0029
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HG01192.hp2
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c.553+2215G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 3/20 chr1 113582876
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AT
 A
A
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T
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G
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A
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a0001c0002t0002g0233
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 A
A
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a0001c0002t0002g0233
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A
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c.554-1614T>A
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C
 G
G
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A
 G
G
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HG04199.hp2
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c.554-1610A>G
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G
 A
A
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c.554-1590G>A
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A
 G
G
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c.554-1170A>G
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G
 A
A
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NA18978.hp1
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c.554-1075G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 3/20 chr1 113584312
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CT
 C
C
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G
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T
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A
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C
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T
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A
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CT
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c.554-398dupT
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 T
T
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A
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C
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C
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T
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A
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C
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A
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T
 C
C
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HG03654.hp2
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C
 T
T
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NA20300.hp2
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A
 C
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c.763+232A>C
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T
 C
C
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A
 T
T
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A
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T
 C
C
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C
 T
T
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
HG01109.hp2
HG03209.hp2
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c.763+1688C>T
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A
 G
G
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c.763+1800A>G
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C
 A
A
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a0001c0001t0003g0078
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HG01496.hp2
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c.763+1808C>A
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G
 A
A
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c.763+1880G>A
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A
 G
G
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HG00642.hp1
HG01928.hp1
HG02293.hp1
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c.763+1992A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 4/20 chr1 113587588
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A
 G
G
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others(2): Show 
NA18971.hp1
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NA19011.hp2
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c.763+2042A>G
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0029
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HG01192.hp2
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c.763+2369C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 4/20 chr1 113587965
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0152
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a0001c0001t0001g0151
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0154
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HG01516.hp2
NA20805.hp2
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c.763+2423C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 4/20 chr1 113588019
chr1:113588217 C
C
 G
G
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a0001c0004t0002g0183
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HG00741.hp2
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c.764-2267C>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0225
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NA19080.hp2
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c.764-1975C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 4/20 chr1 113588509
chr1:113588540 T
T
 C
C
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a0001c0001t0005g0083
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NA18747.hp2
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c.764-1944T>C
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0182
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HG01175.hp1
HG02897.hp1
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c.764-1941T>C
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G
 A
A
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G
 A
A
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c.764-1553G>A
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G
 A
A
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HG01109.hp2
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c.764-1436G>A
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G
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c.764-1366T>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0004g0173
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NA19082.hp2
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c.764-1252T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 4/20 chr1 113589232
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A
 G
G
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NA18950.hp1
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c.764-1174A>G
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G
 A
A
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HG00642.hp1
HG00741.hp2
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HG02129.hp1
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c.764-1033G>A
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A
 G
G
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others(1): Show 
a0001c0001t0002g0232
a0001c0001t0003g0068
a0001c0001t0003g0106
a0001c0001t0003g0122
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others(1): Show 
HG01258.hp2
HG01261.hp1
HG01928.hp2
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c.764-860A>G
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chr1:113589678 T
T
 C
C
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.764-806T>C
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A
 G
G
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others(39): Show 
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a0001c0001t0006g0062
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HG00140.hp2
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c.764-748A>G
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G
 A
A
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c.764-394G>A
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c.764-324delA
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c.764-310A>T
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C
 T
T
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HG02015.hp1
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c.764-258C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 4/20 chr1 113590226
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A
 G
G
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HG02630.hp2
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c.764-222A>G
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A
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c.764-77delT
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0211
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HG04204.hp1
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c.938+285G>A
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A
 G
G
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a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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C
 G
G
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a0001c0001t0006g0061
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HG03209.hp1
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A
 G
G
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A
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 T
T
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A
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A
 T
T
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A
 G
G
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T
 A
A
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A
 C
C
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HG03209.hp1
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c.938+1523A>C
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C
 G
G
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NA18986.hp2
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T
 G
G
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A
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C
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A
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c.939-1726G>A
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C
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C
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T
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C
 T
T
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A
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G
 T
T
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c.1018+1173A>G
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C
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T
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HG02055.hp1
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c.1018+1283C>T
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c.1018+2434C>T
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T
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HG02647.hp1
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c.1018+2529G>T
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C
 T
T
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T
 A
A
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T
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A
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T
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C
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T
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G
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A
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C
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T
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.1018+4593G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599153
chr1:113599318 A
A
 G
G
 1 a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0002g0178
 1 NA21309.hp1
NA21309.hp1
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c.1018+4758A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599318
chr1:113599394 C
C
 T
T
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a0001c0001t0003g0075
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others(7): Show 
a0001c0001t0002g0038
a0001c0001t0003g0075
a0001c0001t0003g0078
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a0001c0001t0003g0102
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 10 HG00423.hp2
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others(7): Show 
HG00423.hp2
HG01496.hp2
HG02056.hp2
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c.1018+4834C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599394
chr1:113599483 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0003g0116
a0001c0001t0003g0116
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NA19078.hp2
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c.1018+4923A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599483
chr1:113599503 C
C
 A
A
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a0001c0001t0004g0023
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others(4): Show 
a0001c0001t0004g0004
a0001c0001t0004g0023
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a0001c0001t0015g0026
 7 HG02071.hp2
NA18965.hp2
NA18971.hp1
others(4): Show 
HG02071.hp2
NA18965.hp2
NA18971.hp1
NA18995.hp1
NA19011.hp2
NA19060.hp1
NA19064.hp1
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c.1018+4943C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599503
chr1:113599521 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0001g0154
 1 NA20805.hp2
NA20805.hp2
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c.1018+4961G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599521
chr1:113599736 C
C
 T
T
 1 a0001c0009t0002g0057
a0001c0009t0002g0057
 1 HG02897.hp2
HG02897.hp2
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c.1018+5176C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599736
chr1:113599758 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0003g0075
a0001c0001t0003g0082
a0001c0001t0003g0075
a0001c0001t0003g0082
 2 NA18939.hp2
NA18965.hp1
NA18939.hp2
NA18965.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+5198G>A
c.1018+5198G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599758
chr1:113599762 C
C
 T
T
 3 a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 3 HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+5202C>T
c.1018+5202C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599762
chr1:113599775 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0008g0155
a0001c0002t0008g0155
 1 HG01261.hp2
HG01261.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1018+5215G>A
c.1018+5215G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599775
chr1:113599839 T
T
 C
C
 4 a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
others(1): Show 
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0009t0002g0057
 4 HG02630.hp1
HG02897.hp2
HG02965.hp2
others(1): Show 
HG02630.hp1
HG02897.hp2
HG02965.hp2
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+5279T>C
c.1018+5279T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599839
chr1:113599899 A
A
 T
T
 4 a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
others(1): Show 
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0009t0002g0057
 4 HG02630.hp1
HG02897.hp2
HG02965.hp2
others(1): Show 
HG02630.hp1
HG02897.hp2
HG02965.hp2
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+5339A>T
c.1018+5339A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599899
chr1:113599913 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0090
a0001c0001t0003g0090
 1 HG02071.hp1
HG02071.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+5353C>G
c.1018+5353C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599913
chr1:113599953 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0019
 1 HG02129.hp2
HG02129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1018+5393A>G
c.1018+5393A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113599953
chr1:113600050 T
T
 C
C
 71 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
others(68): Show 
a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
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a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0162
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0164
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a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0167
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0169
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0171
a0001c0001t0001g0172
a0001c0001t0001g0174
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0177
a0001c0001t0001g0181
a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0184
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a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0196
a0001c0001t0001g0199
a0001c0001t0001g0202
a0001c0001t0001g0206
a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0002g0150
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 71 HG00099.hp2
HG00621.hp2
HG00642.hp2
others(68): Show 
HG00099.hp2
HG00621.hp2
HG00642.hp2
HG00738.hp1
HG00741.hp1
HG01070.hp2
HG01081.hp2
HG01099.hp1
HG01099.hp2
HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01123.hp2
HG01175.hp1
HG01192.hp1
HG01192.hp2
HG01255.hp2
HG01257.hp1
HG01346.hp2
HG01433.hp1
HG01496.hp1
HG01516.hp2
HG01952.hp2
HG02015.hp1
HG02630.hp2
HG02647.hp1
HG02738.hp1
HG02897.hp1
HG02922.hp1
HG02965.hp1
HG02976.hp2
HG03041.hp1
HG03098.hp1
HG03098.hp2
HG03209.hp2
HG03654.hp2
HG03834.hp1
HG03927.hp2
HG04115.hp1
HG04204.hp1
NA18939.hp1
NA18942.hp1
NA18943.hp2
NA18948.hp2
NA18950.hp1
NA18952.hp1
NA18953.hp2
NA18957.hp1
NA18972.hp2
NA18973.hp1
NA18980.hp1
NA18984.hp1
NA18985.hp1
NA18986.hp1
NA18990.hp2
NA18992.hp2
NA18995.hp2
NA18998.hp2
NA19000.hp1
NA19002.hp2
NA19003.hp1
NA19004.hp2
NA19064.hp2
NA19074.hp1
NA19077.hp1
NA19081.hp2
NA19083.hp2
NA19091.hp2
NA20300.hp2
NA20805.hp2
NA20905.hp1
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1018+5490T>C
c.1018+5490T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113600050
chr1:113600123 T
T
 C
C
 4 a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0006g0062
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others(1): Show 
a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0006g0062
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 4 HG00741.hp2
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others(1): Show 
HG00741.hp2
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG03041.hp2
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c.1018+5563T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113600123
chr1:113600230 G
G
 T
T
 4 a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0006g0062
a0001c0004t0002g0183
others(1): Show 
a0001c0001t0002g0180
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HG00741.hp2
HG02055.hp1
HG02647.hp2
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C
 T
T
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a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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chr1:113600249 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0153
a0001c0001t0001g0153
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HG01952.hp2
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C
 T
T
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others(2): Show 
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 5 NA18971.hp1
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NA18971.hp1
NA18995.hp1
NA19011.hp2
NA19060.hp1
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A
 T
T
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others(13): Show 
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others(13): Show 
HG00621.hp1
NA18747.hp1
NA18952.hp2
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c.1018+5746A>T
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chr1:113600426 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0137
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HG01257.hp1
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c.1018+5866T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113600426
chr1:113600550 C
C
 G
G
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a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 3 HG02630.hp1
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NA21309.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
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c.1018+5990C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113600550
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TG
 T
T
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others(148): Show 
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NA21309.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+6049delG
c.1018+6049delG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113600606
chr1:113600638 C
C
 T
T
 8 a0001c0002t0002g0007
a0001c0002t0002g0008
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others(5): Show 
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a0001c0002t0002g0008
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 8 HG02083.hp1
NA18955.hp2
NA18961.hp1
others(5): Show 
HG02083.hp1
NA18955.hp2
NA18961.hp1
NA18968.hp2
NA18989.hp2
NA19070.hp2
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NA19082.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+6078C>T
c.1018+6078C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113600638
chr1:113600659 T
T
 C
C
 4 a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0006g0062
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HG02055.hp1
HG02647.hp2
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A
 G
G
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T
 C
C
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G
 A
A
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HG02897.hp2
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G
 C
C
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a0001c0001t0003g0102
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HG02056.hp2
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0163
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HG02897.hp1
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A
 G
G
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a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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c.1018+6347A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0002
a0001c0001t0004g0003
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NA19006.hp2
NA18967.hp1
NA19006.hp2
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c.1018+6604G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113601164
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T
 C
C
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c.1018+6640T>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0165
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HG00621.hp2
HG01109.hp2
HG03209.hp2
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c.1018+6735C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113601295
chr1:113601296 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0165
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a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0165
a0001c0001t0007g0129
 3 HG00621.hp2
HG01109.hp2
HG03209.hp2
HG00621.hp2
HG01109.hp2
HG03209.hp2
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c.1018+6736A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113601296
chr1:113601344 C
C
 G
G
 38 a0001c0001t0004g0002
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others(35): Show 
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 38 HG00099.hp1
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others(35): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp1
HG01081.hp1
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c.1018+6784C>G
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AAAAC
 A
A
 77 a0001c0001t0002g0006
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others(74): Show 
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G
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A
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c.1018+7429G>A
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TAGG
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T
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HG02897.hp2
HG02922.hp1
HG02965.hp1
HG02976.hp2
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NA19054.hp2
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NA19064.hp2
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NA19077.hp1
NA19078.hp1
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NA20300.hp2
NA20752.hp1
NA20805.hp2
NA20905.hp1
NA21309.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+7545_1018+754
others(7): Show 
c.1018+7545_1018+7547delGAG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113602102
chr1:113602124 A
A
 G
G
 38 a0001c0002t0002g0007
a0001c0002t0002g0008
a0001c0002t0002g0020
others(35): Show 
a0001c0002t0002g0007
a0001c0002t0002g0008
a0001c0002t0002g0020
a0001c0002t0002g0021
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 38 HG00140.hp2
HG00642.hp1
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others(35): Show 
HG00140.hp2
HG00642.hp1
HG01069.hp2
HG01175.hp2
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HG01257.hp2
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HG03490.hp1
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HG04199.hp2
NA18947.hp1
NA18955.hp2
NA18960.hp1
NA18961.hp1
NA18968.hp2
NA18978.hp1
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NA19054.hp1
NA19058.hp2
NA19063.hp2
NA19070.hp2
NA19078.hp1
NA19082.hp1
NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+7564A>G
c.1018+7564A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113602124
chr1:113602185 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0012g0073
a0001c0001t0012g0073
 1 NA19004.hp2
NA19004.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1018+7625C>T
c.1018+7625C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113602185
chr1:113602244 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0150
a0001c0001t0002g0150
 1 HG02738.hp1
HG02738.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+7684A>C
c.1018+7684A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113602244
chr1:113602650 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0149
a0001c0001t0002g0149
 1 HG00140.hp1
HG00140.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+8090G>A
c.1018+8090G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113602650
chr1:113602876 C
C
 T
T
 1 a0001c0009t0002g0057
a0001c0009t0002g0057
 1 HG02897.hp2
HG02897.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1018+8316C>T
c.1018+8316C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113602876
chr1:113602969 C
C
 CAT
CAT
 6 a0001c0001t0003g0066
a0001c0001t0003g0067
a0001c0001t0003g0069
others(3): Show 
a0001c0001t0003g0066
a0001c0001t0003g0067
a0001c0001t0003g0069
a0001c0001t0003g0071
a0001c0001t0003g0096
a0001c0001t0003g0120
 6 HG01070.hp1
HG01952.hp1
NA18971.hp2
others(3): Show 
HG01070.hp1
HG01952.hp1
NA18971.hp2
NA19011.hp1
NA19056.hp2
NA19077.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1018+8420_1018+842
others(6): Show 
c.1018+8420_1018+8421dupAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113602969
chr1:113603042 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0018
a0001c0001t0001g0018
 1 HG00642.hp2
HG00642.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1018+8482A>G
c.1018+8482A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113603042
chr1:113603102 CGAAATGA
others(16): Show 
CGAAATGAAAATGAAAATGAAATG
 C
C
 3 a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 3 HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+8561_1018+858
others(27): Show 
c.1018+8561_1018+8583delAAATGGAAATGAAAATGAAAATG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113603102
chr1:113603166 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0184
 3 HG01433.hp1
HG02922.hp1
HG02976.hp2
HG01433.hp1
HG02922.hp1
HG02976.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1018+8606G>A
c.1018+8606G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113603166
chr1:113603174 A
A
 G
G
 3 a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 3 HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+8614A>G
c.1018+8614A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113603174
chr1:113603261 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0202
a0001c0001t0001g0202
 1 HG00738.hp1
HG00738.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1018+8701A>T
c.1018+8701A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113603261
chr1:113603352 C
C
 CCAA
CCAA
 68 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
others(65): Show 
a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0018
a0001c0001t0001g0024
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0054
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a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0142
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a0001c0001t0001g0147
a0001c0001t0001g0148
a0001c0001t0001g0151
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0153
a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0158
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0162
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0167
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0169
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0171
a0001c0001t0001g0172
a0001c0001t0001g0174
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0177
a0001c0001t0001g0181
a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0193
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0196
a0001c0001t0001g0199
a0001c0001t0001g0202
a0001c0001t0001g0206
a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0002g0150
a0001c0001t0004g0017
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a0001c0001t0007g0133
a0001c0001t0010g0134
a0001c0001t0011g0186
a0001c0001t0012g0073
a0001c0008t0009g0056
a0004c0005t0001g0175
 68 HG00099.hp2
HG00642.hp2
HG00738.hp1
others(65): Show 
HG00099.hp2
HG00642.hp2
HG00738.hp1
HG00741.hp1
HG01070.hp2
HG01081.hp2
HG01099.hp1
HG01099.hp2
HG01109.hp1
HG01123.hp2
HG01175.hp1
HG01192.hp1
HG01255.hp2
HG01257.hp1
HG01346.hp2
HG01433.hp1
HG01496.hp1
HG01516.hp2
HG01952.hp2
HG02015.hp1
HG02630.hp2
HG02647.hp1
HG02738.hp1
HG02897.hp1
HG02922.hp1
HG02965.hp1
HG02976.hp2
HG03041.hp1
HG03098.hp1
HG03098.hp2
HG03654.hp2
HG03834.hp1
HG03927.hp2
HG04115.hp1
HG04204.hp1
NA18939.hp1
NA18942.hp1
NA18943.hp2
NA18948.hp2
NA18950.hp1
NA18952.hp1
NA18953.hp2
NA18957.hp1
NA18972.hp2
NA18973.hp1
NA18980.hp1
NA18984.hp1
NA18985.hp1
NA18986.hp1
NA18990.hp2
NA18992.hp2
NA18995.hp2
NA18998.hp2
NA19000.hp1
NA19002.hp2
NA19003.hp1
NA19004.hp2
NA19064.hp2
NA19074.hp1
NA19077.hp1
NA19080.hp1
NA19081.hp2
NA19083.hp2
NA19091.hp2
NA20300.hp2
NA20805.hp2
NA20905.hp1
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1018+8817_1018+881
others(7): Show 
c.1018+8817_1018+8819dupCAA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113603352
chr1:113603352 CCAACAA
CCAACAA
 C
C
 42 a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0006g0062
a0001c0002t0002g0007
others(39): Show 
a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0006g0062
a0001c0002t0002g0007
a0001c0002t0002g0008
a0001c0002t0002g0020
a0001c0002t0002g0021
a0001c0002t0002g0031
a0001c0002t0002g0032
a0001c0002t0002g0042
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C
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G
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A
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A
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T
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A
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C
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C
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CA
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c.1019-10006dupA
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CA
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c.1019-10006delA
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CAAA
 C
C
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 C
C
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T
 C
C
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HG02897.hp2
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c.1019-9910T>C
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 C
C
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A
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A
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G
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A
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T
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c.1019-7967G>T
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C
 A
A
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a0001c0001t0001g0193
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NA20300.hp2
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c.1019-7934C>A
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G
 A
A
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a0001c0003t0006g0130
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c.1019-7780G>A
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T
 G
G
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c.1019-7773T>G
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T
 C
C
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a0001c0002t0002g0058
a0001c0002t0002g0156
a0001c0002t0002g0179
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HG01243.hp2
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HG03239.hp2
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c.1019-7760T>C
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A
 T
T
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 C
C
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c.1019-7527T>C
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chr1:113607081 T
T
 A
A
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HG00741.hp2
HG02055.hp1
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c.1019-7520T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113607081
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A
 T
T
 154 a0001c0001t0001g0001
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G
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G
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c.1019-6061A>G
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C
 T
T
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C
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T
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a0001c0001t0006g0061
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HG03209.hp1
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A
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G
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C
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A
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A
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G
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C
 G
G
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NA19083.hp1
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G
 A
A
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a0001c0001t0006g0061
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HG03209.hp1
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CAAATA
 C
C
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HG02630.hp1
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NA21309.hp1
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T
 C
C
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T
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A
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NA21309.hp1
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C
 G
G
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T
 G
G
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a0001c0001t0004g0022
a0001c0001t0005g0064
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NA18994.hp1
NA18990.hp1
NA18994.hp1
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T
 A
A
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a0001c0001t0006g0061
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HG03209.hp1
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T
 G
G
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HG02630.hp1
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 T
T
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HG03209.hp1
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HG02630.hp2
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G
 A
A
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NA18944.hp1
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 A
A
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C
 A
A
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 C
C
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NA20300.hp2
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T
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 A
A
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c.1019-3659T>A
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C
 CT
CT
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c.1019-3497dupT
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A
 G
G
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a0001c0001t0004g0034
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NA19004.hp1
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c.1019-3452A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113611149
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G
 C
C
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a0001c0003t0002g0178
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NA21309.hp1
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c.1019-3302G>C
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chr1:113611364 A
A
 G
G
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HG02015.hp1
NA18943.hp2
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c.1019-3237A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113611364
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T
 C
C
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a0001c0001t0003g0071
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NA19077.hp2
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c.1019-3232T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113611369
chr1:113611421 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0006g0061
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HG03209.hp1
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c.1019-3180G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113611421
chr1:113611826 C
C
 T
T
 1 a0001c0009t0002g0057
a0001c0009t0002g0057
 1 HG02897.hp2
HG02897.hp2
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c.1019-2775C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113611826
chr1:113611871 A
A
 G
G
 1 a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0002g0178
 1 NA21309.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1019-2730A>G
c.1019-2730A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113611871
chr1:113611936 C
C
 CTTAT
CTTAT
 3 a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0116
a0001c0001t0003g0125
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0116
a0001c0001t0003g0125
 3 HG02015.hp2
NA19078.hp2
NA20300.hp1
HG02015.hp2
NA19078.hp2
NA20300.hp1
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others(8): Show 
c.1019-2634_1019-2631dupATTT
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C
 CTTATTTA
others(1): Show 
CTTATTTAT
 5 a0001c0001t0001g0184
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others(2): Show 
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 5 HG01257.hp2
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others(2): Show 
HG01257.hp2
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others(12): Show 
c.1019-2638_1019-2631dupATTTATTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113611936
chr1:113611936 C
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 CTTATTTA
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CTTATTTATTTAT
 97 a0001c0001t0001g0001
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others(94): Show 
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others(94): Show 
HG00099.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1019-2642_1019-263
others(16): Show 
c.1019-2642_1019-2631dupATTTATTTATTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113611936
chr1:113611936 C
C
 CTTATTTA
others(9): Show 
CTTATTTATTTATTTAT
 15 a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0153
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a0001c0001t0001g0153
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C
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A
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G
 A
A
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HG03209.hp2
HG01109.hp2
HG03209.hp2
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c.1019-2598G>A
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 G
G
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c.1019-2571A>G
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C
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A
 G
G
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a0001c0001t0003g0090
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HG02071.hp1
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c.1019-1467A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113613134
chr1:113613317 C
C
 T
T
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a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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c.1019-1284C>T
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chr1:113613476 G
G
 T
T
 1 a0001c0009t0002g0057
a0001c0009t0002g0057
 1 HG02897.hp2
HG02897.hp2
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c.1019-1125G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113613476
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G
 A
A
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c.1019-1006G>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0002g0219
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HG01517.hp2
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c.1019-992T>C
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T
 C
C
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a0001c0001t0005g0098
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NA18989.hp1
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c.1019-320T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 6/20 chr1 113614281
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G
 A
A
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c.1019-200G>A
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C
 T
T
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c.1076+46C>T
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A
 T
T
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a0001c0001t0003g0067
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NA19011.hp1
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c.1076+376A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113615034
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A
 G
G
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HG03209.hp1
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c.1076+470A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113615128
chr1:113615166 C
C
 T
T
 157 a0001c0001t0001g0001
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c.1076+508C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113615166
chr1:113615184 A
A
 C
C
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a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 3 HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
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c.1076+526A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113615184
chr1:113615355 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0120
a0001c0001t0003g0120
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HG01070.hp1
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c.1076+697G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113615355
chr1:113615377 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0061
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HG03209.hp1
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chr1:113615560 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0061
 1 HG03209.hp1
HG03209.hp1
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c.1076+902A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113615560
chr1:113615934 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0006g0061
a0001c0001t0006g0061
 1 HG03209.hp1
HG03209.hp1
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c.1076+1276T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113615934
chr1:113615946 T
T
 G
G
 1 a0001c0009t0002g0057
a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113615946
chr1:113616343 A
A
 T
T
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a0001c0002t0002g0220
a0001c0002t0002g0233
a0001c0002t0002g0209
a0001c0002t0002g0220
a0001c0002t0002g0233
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HG03927.hp1
HG04199.hp2
HG03490.hp1
HG03927.hp1
HG04199.hp2
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c.1076+1685A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113616343
chr1:113616361 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0163
 1 HG02897.hp1
HG02897.hp1
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c.1076+1703G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113616361
chr1:113616400 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0002g0156
a0001c0002t0002g0156
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HG03239.hp2
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c.1076+1742G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113616400
chr1:113616600 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0160
 1 HG02630.hp2
HG02630.hp2
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c.1076+1942T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113616600
chr1:113616728 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0172
a0001c0001t0001g0172
 1 NA18986.hp1
NA18986.hp1
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c.1076+2070T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113616728
chr1:113616765 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0138
a0001c0001t0001g0138
 1 HG03834.hp1
HG03834.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1076+2107G>A
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113616765
chr1:113616813 G
G
 A
A
 3 a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 3 HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
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c.1076+2155G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113616813
chr1:113616829 G
G
 A
A
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a0001c0001t0006g0061
 1 HG03209.hp1
HG03209.hp1
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c.1076+2171G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113616829
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C
 CT
CT
 74 a0001c0001t0002g0006
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others(71): Show 
HG00140.hp2
HG00423.hp1
HG00642.hp1
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HG02004.hp2
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HG02129.hp1
HG02129.hp2
HG02293.hp1
HG02300.hp1
HG02630.hp1
HG02683.hp2
HG02738.hp2
HG02897.hp2
HG02965.hp2
HG03239.hp2
HG03490.hp1
HG03490.hp2
HG03834.hp2
HG03927.hp1
HG04115.hp2
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NA18747.hp2
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NA18947.hp2
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NA18971.hp1
NA18978.hp1
NA18983.hp1
NA18989.hp1
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NA18995.hp1
NA19004.hp1
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NA19078.hp1
NA19080.hp1
NA19082.hp1
NA20752.hp1
NA21309.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1076+2245dupT
c.1076+2245dupT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113616885
chr1:113616947 G
G
 A
A
 1 a0001c0009t0002g0057
a0001c0009t0002g0057
 1 HG02897.hp2
HG02897.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1076+2289G>A
c.1076+2289G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113616947
chr1:113617001 G
G
 A
A
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1076+2343G>A
c.1076+2343G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113617001
chr1:113617290 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0002g0208
a0001c0002t0002g0208
 1 HG00140.hp2
HG00140.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1077-2446A>G
c.1077-2446A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113617290
chr1:113617416 G
G
 A
A
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a0001c0001t0006g0062
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others(1): Show 
a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0006g0062
a0001c0004t0002g0183
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 4 HG00741.hp2
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others(1): Show 
HG00741.hp2
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG03041.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1077-2320G>A
c.1077-2320G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113617416
chr1:113617788 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0199
a0001c0001t0001g0199
 1 HG01109.hp1
HG01109.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1077-1948A>T
c.1077-1948A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113617788
chr1:113618136 G
G
 A
A
 77 a0001c0001t0002g0016
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c.1077-1559delA
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A
 T
T
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a0001c0001t0004g0046
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HG03834.hp2
HG03041.hp1
HG03834.hp2
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c.1077-1559A>T
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G
 C
C
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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c.1077-1404G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113618332
chr1:113618352 T
T
 G
G
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a0001c0001t0003g0071
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NA19077.hp2
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c.1077-1384T>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 7/20 chr1 113618352
chr1:113618356 G
G
 T
T
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c.1077-1380G>T
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C
 A
A
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C
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HG03209.hp1
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c.1077-852A>C
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C
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A
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HG02630.hp1
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 T
T
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c.1077-167G>T
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A
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HG02965.hp1
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c.1171+501A>G
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T
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C
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c.1171+1165A>T
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AC
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A
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c.1172-1176delC
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G
 A
A
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C
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T
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HG03927.hp1
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c.1172-758C>T
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A
 G
G
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HG02897.hp2
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c.1172-510A>G
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A
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HG01192.hp2
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C
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T
 C
C
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TACACAC
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113623453
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113623453
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113623453
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T
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HG01099.hp1
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T
 C
C
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c.1360+495T>C
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T
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C
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c.1360+497T>C
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T
 C
C
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c.1360+499T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113623493
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T
 C
C
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c.1360+501T>C
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 T
T
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c.1360+502delA
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AT
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c.1360+511dupT
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ATAT
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G
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A
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c.1360+517G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0161
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c.1360+554C>T
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A
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G
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HG00738.hp2
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c.1360+598A>G
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G
 A
A
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HG02965.hp2
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c.1360+637G>A
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A
 AT
AT
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others(1): Show 
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c.1360+814dupT
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ACT
 A
A
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c.1360+945A>G
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T
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A
 G
G
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 C
C
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NA18986.hp1
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c.1360+1073A>C
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 T
T
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T
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C
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T
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A
 G
G
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c.1360+1578A>G
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A
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c.1360+1639G>A
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T
 C
C
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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c.1360+1801T>C
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A
 G
G
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HG02004.hp2
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A
 C
C
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c.1360+1979A>C
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0171
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NA19064.hp2
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c.1360+2057A>G
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T
 C
C
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HG00423.hp1
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A
 G
G
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NA18984.hp2
NA18998.hp1
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c.1360+2125A>G
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G
 T
T
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T
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A
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NA18960.hp1
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A
 G
G
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113626107
chr1:113626114 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0185
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HG03098.hp1
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113626114
chr1:113626726 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0100
a0001c0001t0003g0100
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NA19091.hp1
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c.1360+3732A>T
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chr1:113627350 A
A
 T
T
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a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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A
 T
T
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NA18948.hp2
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 G
G
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c.1360+4622T>G
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T
 C
C
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c.1360+5136T>C
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A
 T
T
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A
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c.1360+6767_1360+6768delTC
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CCTCT
 C
C
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a0001c0001t0002g0192
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HG02976.hp1
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c.1360+6765_1360+6768delTCTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113629729
chr1:113629744 C
C
 CTCTG
CTCTG
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HG00642.hp1
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c.1360+6753_1360+6754insGTCT
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chr1:113629757 T
T
 C
C
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HG00642.hp1
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c.1360+6763T>C
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T
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a0001c0001t0001g0024
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NA18952.hp1
NA18953.hp2
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NA18972.hp2
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NA18985.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.1360+6766_1360+676
others(14): Show 
c.1360+6766_1360+6767insCCTCTCCCTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113629757
chr1:113629757 T
T
 TCTCTCCC
others(5): Show 
TCTCTCCCTCTCC
 11 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0010
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others(8): Show 
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a0001c0001t0001g0010
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others(8): Show 
HG00621.hp2
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HG04204.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1360+6772_1360+677
others(16): Show 
c.1360+6772_1360+6773insTCCCTCTCCCTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113629757
chr1:113629757 T
T
 TCTCTCTC
others(7): Show 
TCTCTCTCCCTCTCC
 1 a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0182
 1 HG01175.hp1
HG01175.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1360+6768_1360+676
others(18): Show 
c.1360+6768_1360+6769insTCCCTCTCCCTCTC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113629757
chr1:113629759 T
T
 C
C
 79 a0001c0001t0002g0006
a0001c0001t0002g0016
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others(76): Show 
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c.1360+6765T>C
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T
 C
C
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HG02647.hp2
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c.1360+6767T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113629761
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T
 TCTCTCC
TCTCTCC
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chr1:113629761 T
T
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others(1): Show 
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HG02056.hp1
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others(12): Show 
c.1360+6768_1360+6769insTCTCTCCC
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113629761
chr1:113629761 T
T
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others(1): Show 
a0001c0001t0004g0011
a0001c0001t0004g0017
a0001c0001t0004g0036
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NA18965.hp2
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HG00423.hp1
NA18960.hp2
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others(14): Show 
c.1360+6768_1360+6769insTCTCTCTCCC
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chr1:113629761 T
T
 TCTCTCTC
others(5): Show 
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a0001c0001t0004g0173
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NA19082.hp2
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others(16): Show 
c.1360+6768_1360+6769insTCTCTCTCTCCC
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0004g0002
a0001c0001t0004g0003
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c.1360+6769C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113629763
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C
 G
G
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others(1): Show 
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others(1): Show 
HG02630.hp1
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c.1360+6879C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113629873
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C
 A
A
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others(1): Show 
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others(1): Show 
HG02630.hp1
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c.1360+6961C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113629955
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T
 C
C
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HG01243.hp2
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c.1360+7013T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113630007
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G
 A
A
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HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
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c.1360+7264G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113630258
chr1:113630788 A
A
 G
G
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C
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A
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HG01109.hp1
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C
 T
T
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a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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c.1360+8398C>T
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C
 T
T
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c.1360+8423C>T
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 T
T
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 A
A
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c.1360+9062C>A
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T
 C
C
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HG03209.hp1
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 A
A
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c.1361-9387G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0199
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HG01109.hp1
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c.1361-9217C>T
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A
 C
C
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HG02055.hp1
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c.1361-9107A>C
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GT
 G
G
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c.1361-9002delT
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T
 TC
TC
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c.1361-8858dupC
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G
 A
A
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c.1361-8763G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113633148
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A
 AT
AT
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c.1361-8632dupT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113633238
chr1:113633238 A
A
 ATT
ATT
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NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1361-8633_1361-863
others(6): Show 
c.1361-8633_1361-8632dupTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113633238
chr1:113633238 A
A
 ATTT
ATTT
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others(2): Show 
a0001c0001t0003g0077
a0001c0001t0003g0095
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NA18950.hp2
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HG00621.hp1
NA18950.hp2
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others(7): Show 
c.1361-8634_1361-8632dupTTT
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chr1:113633238 A
A
 ATTTTTTT
others(7): Show 
ATTTTTTTTTTTTTT
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a0001c0001t0002g0033
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NA18948.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1361-8645_1361-863
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c.1361-8645_1361-8632dupTTTTTTTTTTTTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113633238
chr1:113633238 AT
AT
 A
A
 13 a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0135
others(10): Show 
a0001c0001t0001g0001
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0165
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0172
a0001c0001t0001g0185
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a0001c0001t0002g0219
a0001c0001t0002g0223
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 13 HG00621.hp2
HG00741.hp1
HG01070.hp2
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HG00621.hp2
HG00741.hp1
HG01070.hp2
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HG03209.hp2
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NA18986.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1361-8632delT
c.1361-8632delT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113633238
chr1:113633238 ATT
ATT
 A
A
 25 a0001c0001t0001g0024
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0050
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a0001c0001t0001g0024
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0137
a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0148
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a0001c0001t0001g0152
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a0001c0001t0001g0158
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a0001c0001t0001g0174
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a0001c0001t0001g0184
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 25 HG00099.hp2
HG01081.hp2
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HG00099.hp2
HG01081.hp2
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NA18998.hp2
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NA19081.hp2
NA19091.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1361-8633_1361-863
others(6): Show 
c.1361-8633_1361-8632delTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113633238
chr1:113633238 ATTT
ATTT
 A
A
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a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0053
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a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0138
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a0001c0001t0001g0143
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a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0177
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a0001c0001t0001g0196
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 20 HG01123.hp2
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others(17): Show 
HG01123.hp2
HG03834.hp1
HG04115.hp1
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NA18992.hp2
NA18995.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.1361-8634_1361-863
others(7): Show 
c.1361-8634_1361-8632delTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113633238
chr1:113633238 ATTTT
ATTTT
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0146
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0139
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NA18985.hp1
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HG02976.hp2
HG03654.hp2
NA18985.hp1
NA19064.hp2
NA19074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1361-8635_1361-863
others(8): Show 
c.1361-8635_1361-8632delTTTT
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others(3): Show 
ATTTTTTTTTT
 A
A
 11 a0001c0002t0002g0007
a0001c0002t0002g0031
a0001c0002t0002g0032
others(8): Show 
a0001c0002t0002g0007
a0001c0002t0002g0031
a0001c0002t0002g0032
a0001c0002t0002g0042
a0001c0002t0002g0043
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a0001c0002t0002g0048
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 11 HG00642.hp1
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others(8): Show 
HG00642.hp1
HG02083.hp1
HG02738.hp2
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NA18961.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.1361-8641_1361-863
others(14): Show 
c.1361-8641_1361-8632delTTTTTTTTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113633238
chr1:113633238 ATTTTTTT
others(4): Show 
ATTTTTTTTTTT
 A
A
 26 a0001c0001t0003g0065
a0001c0002t0002g0008
a0001c0002t0002g0020
others(23): Show 
a0001c0001t0003g0065
a0001c0002t0002g0008
a0001c0002t0002g0020
a0001c0002t0002g0021
a0001c0002t0002g0058
a0001c0002t0002g0156
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a0001c0002t0002g0200
a0001c0002t0002g0201
a0001c0002t0002g0203
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 26 HG00140.hp2
HG01069.hp2
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others(23): Show 
HG00140.hp2
HG01069.hp2
HG01243.hp2
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NA18978.hp1
NA18989.hp2
NA19054.hp1
NA19058.hp2
NA19063.hp2
NA20752.hp1
NA20752.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1361-8642_1361-863
others(15): Show 
c.1361-8642_1361-8632delTTTTTTTTTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113633238
chr1:113633238 ATTTTTTT
others(7): Show 
ATTTTTTTTTTTTTT
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0189
a0001c0001t0002g0189
 1 HG00738.hp2
HG00738.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1361-8645_1361-863
others(18): Show 
c.1361-8645_1361-8632delTTTTTTTTTTTTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113633238
chr1:113633238 ATTTTTTT
others(8): Show 
ATTTTTTTTTTTTTTT
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0163
 1 HG02897.hp1
HG02897.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1361-8646_1361-863
others(19): Show 
c.1361-8646_1361-8632delTTTTTTTTTTTTTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113633238
chr1:113633238 ATTTTTTT
others(9): Show 
ATTTTTTTTTTTTTTTT
 A
A
 4 a0001c0001t0006g0062
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
others(1): Show 
a0001c0001t0006g0062
a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0013g0127
 4 HG02055.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
others(1): Show 
HG02055.hp1
HG02630.hp1
HG02965.hp2
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1361-8647_1361-863
others(20): Show 
c.1361-8647_1361-8632delTTTTTTTTTTTTTTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113633238
chr1:113633238 ATTTTTTT
others(10): Show 
ATTTTTTTTTTTTTTTTT
 A
A
 5 a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0003g0071
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others(2): Show 
a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0003g0071
a0001c0004t0002g0183
a0001c0004t0002g0195
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 5 HG00741.hp2
HG02647.hp2
HG02897.hp2
others(2): Show 
HG00741.hp2
HG02647.hp2
HG02897.hp2
HG03041.hp2
NA19077.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1361-8648_1361-863
others(21): Show 
c.1361-8648_1361-8632delTTTTTTTTTTTTTTTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113633238
chr1:113633238 ATTTTTTT
others(13): Show 
ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
 A
A
 37 a0001c0001t0004g0002
a0001c0001t0004g0003
a0001c0001t0004g0004
others(34): Show 
a0001c0001t0004g0002
a0001c0001t0004g0003
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a0001c0001t0004g0005
a0001c0001t0004g0009
a0001c0001t0004g0011
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a0001c0001t0004g0017
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a0001c0001t0004g0041
a0001c0001t0004g0045
a0001c0001t0004g0046
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a0001c0001t0004g0173
a0001c0001t0004g0191
a0001c0001t0004g0213
a0001c0001t0004g0214
a0001c0001t0004g0234
a0001c0001t0005g0064
a0001c0001t0005g0083
a0001c0001t0005g0088
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a0001c0001t0005g0105
a0001c0001t0005g0107
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 37 HG00099.hp1
HG00423.hp1
HG01081.hp1
others(34): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp1
HG01081.hp1
HG01433.hp2
HG01943.hp2
HG02056.hp1
HG02071.hp2
HG02129.hp2
HG02300.hp1
HG02683.hp2
HG03834.hp2
HG04199.hp1
HG04204.hp2
NA18747.hp2
NA18940.hp1
NA18943.hp1
NA18944.hp2
NA18947.hp2
NA18960.hp2
NA18962.hp2
NA18965.hp2
NA18967.hp1
NA18971.hp1
NA18983.hp1
NA18989.hp1
NA18990.hp1
NA18994.hp1
NA18995.hp1
NA19006.hp2
NA19011.hp2
NA19054.hp2
NA19056.hp1
NA19058.hp1
NA19060.hp1
NA19064.hp1
NA19080.hp1
NA19082.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1361-8651_1361-863
others(24): Show 
c.1361-8651_1361-8632delTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113633238
chr1:113633238 ATTTTTTT
others(14): Show 
ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0034
a0001c0001t0004g0034
 1 NA19004.hp1
NA19004.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1361-8652_1361-863
others(25): Show 
c.1361-8652_1361-8632delTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
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 A
A
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T
 A
A
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 C
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T
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NA18960.hp2
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C
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NA18944.hp1
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c.1361-8486C>T
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 T
T
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HG03209.hp1
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C
 T
T
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NA18747.hp2
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A
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A
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C
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T
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 C
C
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A
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C
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C
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T
 G
G
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HG03041.hp1
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G
 C
C
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NA18986.hp1
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T
 C
C
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NA18967.hp2
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A
 G
G
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NA18747.hp1
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T
 C
C
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 A
A
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NA18986.hp1
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G
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HG03927.hp2
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C
 T
T
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a0001c0001t0004g0015
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NA19056.hp1
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T
 G
G
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NA18972.hp2
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G
 T
T
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a0001c0001t0004g0003
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NA19006.hp2
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c.1361-5864G>T
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G
 A
A
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others(1): Show 
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others(1): Show 
HG02630.hp1
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NA21309.hp1
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c.1361-5848G>A
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 C
C
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c.1361-5769T>C
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G
 A
A
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c.1361-5764G>A
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C
 A
A
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a0001c0001t0004g0015
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NA19056.hp1
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c.1361-5748C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113636163
chr1:113636237 T
T
 C
C
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a0001c0001t0002g0159
a0001c0001t0002g0192
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HG02922.hp2
HG02976.hp1
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c.1361-5674T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113636237
chr1:113636374 A
A
 C
C
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HG00642.hp1
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c.1361-5537A>C
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chr1:113636507 C
C
 G
G
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a0001c0001t0001g0136
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a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0137
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HG01257.hp1
HG03927.hp2
HG01081.hp2
HG01257.hp1
HG03927.hp2
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c.1361-5404C>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113636507
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TAGTTG
 T
T
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HG02630.hp1
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HG03209.hp1
NA21309.hp1
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others(9): Show 
c.1361-5383_1361-5379delTTGAG
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113636525
chr1:113636535 G
G
 A
A
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a0001c0002t0002g0205
 1 HG01069.hp2
HG01069.hp2
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c.1361-5376G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113636535
chr1:113636621 A
A
 T
T
 4 a0001c0001t0006g0061
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others(1): Show 
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a0001c0003t0002g0178
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others(1): Show 
HG02630.hp1
HG02965.hp2
HG03209.hp1
NA21309.hp1
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c.1361-5290A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113636621
chr1:113636717 G
G
 A
A
 1 a0001c0003t0006g0130
a0001c0003t0006g0130
 1 HG02965.hp2
HG02965.hp2
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c.1361-5194G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113636717
chr1:113636787 G
G
 A
A
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T
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A
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A
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C
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T
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HG02897.hp2
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A
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HG04204.hp2
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T
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A
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T
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c.1361-1945C>T
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A
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A
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c.1361-1911G>A
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c.1361-1907C>G
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T
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C
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T
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NA21309.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.1361-959A>C
c.1361-959A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 chr1 113640952
chr1:113640989 C
C
 CTATATAT
others(27): Show 
CTATATATGATATATATAATATATATGATATATAA
 7 a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0076
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a0001c0001t0003g0055
a0001c0001t0003g0076
a0001c0001t0003g0087
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 7 NA18944.hp1
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NA18944.hp1
NA18950.hp2
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others(36): Show 
c.1361-889_1361-856dupAATATATATGATATATATAATATATATG
ATATAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113640989
chr1:113641008 T
T
 TATATATG
TATATATG
 5 a0001c0001t0006g0061
a0001c0003t0002g0178
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others(2): Show 
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a0001c0003t0002g0178
a0001c0003t0006g0130
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HG02630.hp1
HG02965.hp2
HG03041.hp1
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others(9): Show 
c.1361-896_1361-890dupGATATAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113641008
chr1:113641021 TAATATAT
others(4): Show 
TAATATATATGA
 T
T
 80 a0001c0001t0002g0180
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others(77): Show 
a0001c0001t0002g0180
a0001c0001t0004g0002
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 80 HG00099.hp1
HG00140.hp2
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others(77): Show 
HG00099.hp1
HG00140.hp2
HG00423.hp1
HG00642.hp1
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NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1361-889_1361-879d
others(13): Show 
c.1361-889_1361-879delAATATATATGA
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A
 G
G
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others(67): Show 
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 70 HG00099.hp2
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HG00642.hp2
others(67): Show 
HG00099.hp2
HG00621.hp2
HG00642.hp2
HG00738.hp1
HG00741.hp1
HG01070.hp2
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HG01081.hp2
HG01099.hp1
HG01099.hp2
HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01123.hp2
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HG01192.hp1
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HG01346.hp2
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HG03098.hp2
HG03209.hp2
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HG03927.hp2
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NA18939.hp1
NA18942.hp1
NA18943.hp2
NA18948.hp2
NA18950.hp1
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NA18953.hp2
NA18957.hp1
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NA18980.hp1
NA18984.hp1
NA18985.hp1
NA18986.hp1
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ATGAT
 A
A
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HG00621.hp2
HG01109.hp2
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 A
A
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a0001c0001t0004g0214
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HG01081.hp1
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T
 A
A
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G
 T
T
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T
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TATATG
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A
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T
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T
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G
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A
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G
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a0001c0001t0002g0192
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HG02976.hp1
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G
 GATATATT
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GATATATTATATATGATATATATAATATATATGAGAT
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HG03239.hp1
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others(38): Show 
c.1361-848_1361-813dupGATATATATAATATATATGAGATATATA
TTATATAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 9/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113641049
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T
 A
A
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T
 G
G
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HG02897.hp2
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c.1361-855T>G
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G
 A
A
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A
 T
T
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T
 G
G
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HG00621.hp2
HG01109.hp2
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T
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 T
T
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GATATATAT
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A
 G
G
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a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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c.1361-839A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.1361-831T>C
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G
 T
T
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c.1361-828G>T
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T
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a0001c0001t0001g0152
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HG01516.hp2
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c.1361-824_1361-823insTATATATATG
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TATATTA
 T
T
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HG00621.hp2
HG01109.hp2
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T
 A
A
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a0001c0001t0001g0152
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HG01516.hp2
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c.1361-819T>A
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chr1:113641092 T
T
 G
G
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a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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c.1361-819T>G
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chr1:113641093 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0152
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HG01516.hp2
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c.1361-818A>T
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A
 AT
AT
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T
 A
A
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A
 G
G
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NA18747.hp2
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c.1967-95A>G
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A
 G
G
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HG02071.hp1
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T
 A
A
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G
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A
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A
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T
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G
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C
 T
T
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A
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C
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A
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c.1998+1275G>A
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A
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c.1999-1170G>A
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T
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C
 T
T
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HG02630.hp1
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c.1999-14C>T
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G
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HG02897.hp2
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c.2155+33A>G
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chr1:113646675 A
A
 T
T
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HG01175.hp1
HG02897.hp1
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c.2155+33A>T
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G
 A
A
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c.2155+616G>A
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G
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C
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C
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c.2156-1273C>T
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A
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G
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C
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T
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c.2156-686C>T
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A
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c.2156-682T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 12/20 chr1 113648555
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G
 A
A
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c.2156-532G>A
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G
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c.2156-530T>G
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A
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G
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c.2156-501A>G
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T
 C
C
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c.2156-467T>C
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0165
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a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0165
a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
HG01109.hp2
HG03209.hp2
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c.2156-328T>C
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A
 G
G
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a0001c0001t0003g0093
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NA18992.hp1
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c.2156-246A>G
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chr1:113649025 G
G
 A
A
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c.2156-212G>A
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G
 A
A
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c.2247+44G>A
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A
 C
C
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a0001c0009t0002g0057
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HG02897.hp2
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c.2247+296A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 13/20 chr1 113649624
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0194
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HG02965.hp1
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c.2247+320C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 13/20 chr1 113649648
chr1:113649665 A
A
 G
G
 15 a0001c0001t0001g0029
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others(12): Show 
HG01192.hp2
NA18942.hp1
NA18948.hp2
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c.2247+337A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 13/20 chr1 113649665
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A
 T
T
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others(1): Show 
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c.2247+451A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 13/20 chr1 113649779
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T
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TTGG
 73 a0001c0001t0001g0001
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a0001c0001t0001g0151
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a0001c0001t0001g0211
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T
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T
 C
C
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A
 G
G
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 C
C
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A
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T
 A
A
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 C
C
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A
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A
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G
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A
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A
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A
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T
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T
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A
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c.2441-1017T>A
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 A
A
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HG01257.hp1
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 T
T
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T
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G
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A
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c.2629+243C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 15/20 chr1 113654261
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A
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NA19063.hp1
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 15/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113654518
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C
 T
T
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c.2629+1053C>T
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G
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A
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HG02083.hp2
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c.2629+1653G>A
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A
 G
G
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c.2630-416T>A
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chr1:113658674 G
G
 A
A
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a0001c0001t0006g0061
 1 HG03209.hp1
HG03209.hp1
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c.2630-406G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 15/20 chr1 113658674
chr1:113658918 A
A
 C
C
 1 a0001c0008t0009g0056
a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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c.2630-162A>C
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chr1:113658936 C
C
 T
T
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a0001c0001t0003g0082
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a0001c0001t0003g0075
a0001c0001t0003g0082
a0001c0001t0003g0123
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NA18939.hp2
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HG00423.hp2
NA18939.hp2
NA18965.hp1
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c.2630-144C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 15/20 chr1 113658936
chr1:113659036 G
G
 C
C
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a0001c0002t0002g0235
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a0001c0002t0002g0230
a0001c0002t0002g0235
a0001c0002t0002g0236
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NA18978.hp1
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HG02129.hp1
NA18978.hp1
NA19054.hp1
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c.2630-44G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 15/20 chr1 113659036
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C
 G
G
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HG00642.hp2
HG01070.hp2
HG01099.hp2
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c.2815+107C>G
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CTG
 C
C
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HG00140.hp2
HG00642.hp1
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NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.2815+111_2815+112d
others(4): Show 
c.2815+111_2815+112delGT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113659372
chr1:113659542 T
T
 A
A
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a0001c0001t0003g0108
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NA19063.hp1
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c.2815+277T>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113659542
chr1:113659610 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0108
a0001c0001t0003g0108
 1 NA19063.hp1
NA19063.hp1
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c.2815+345A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113659610
chr1:113659634 G
G
 A
A
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a0001c0003t0006g0130
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HG02965.hp2
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c.2815+369G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113659634
chr1:113660406 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0108
a0001c0001t0003g0108
 1 NA19063.hp1
NA19063.hp1
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c.2815+1141G>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113660406
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G
 C
C
 73 a0001c0001t0001g0001
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others(70): Show 
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NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.2815+1214G>C
c.2815+1214G>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113660479
chr1:113660616 A
A
 AT
AT
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NA19064.hp1
 intron_variant MODIFIER c.2815+1367dupT
c.2815+1367dupT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113660616
chr1:113660616 AT
AT
 A
A
 124 a0001c0001t0001g0001
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c.2815+1367delT
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AT
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c.2815+1521dupT
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ATT
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AT
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A
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c.2815+1521delT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113660766
chr1:113660865 C
C
 T
T
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a0001c0001t0003g0122
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HG01928.hp2
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c.2815+1600C>T
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G
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A
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c.2815+1673G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113660938
chr1:113661204 A
A
 T
T
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NA19063.hp1
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c.2815+1939A>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113661204
chr1:113661338 A
A
 T
T
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NA19063.hp1
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c.2815+2073A>T
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G
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A
 T
T
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a0001c0001t0003g0108
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NA19063.hp1
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c.2815+2364A>T
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AGAG
 A
A
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T
 C
C
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HG00741.hp1
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c.2815+2500T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113661765
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T
 G
G
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a0001c0003t0002g0178
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HG02630.hp1
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c.2815+2777T>G
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A
 G
G
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G
 A
A
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a0001c0002t0002g0021
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HG01261.hp2
HG01516.hp1
HG01517.hp1
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c.2815+2991G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113662256
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A
 G
G
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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G
 A
A
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a0001c0001t0003g0123
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HG00423.hp2
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c.2815+3730G>A
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A
 AAT
AAT
 49 a0001c0001t0001g0027
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NA18994.hp1
NA18995.hp1
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others(6): Show 
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A
 AATAT
AATAT
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a0001c0001t0001g0024
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HG00099.hp2
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c.2815+3989_2815+3992dupATAT
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chr1:113663235 A
A
 AATATAT
AATATAT
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a0001c0001t0001g0141
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HG01081.hp2
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c.2815+3987_2815+3992dupATATAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113663235
chr1:113663235 A
A
 AATATATA
others(1): Show 
AATATATAT
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HG01099.hp2
HG01257.hp2
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others(12): Show 
c.2815+3985_2815+3992dupATATATAT
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113663235
chr1:113663414 C
C
 T
T
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others(1): Show 
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a0001c0001t0006g0062
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c.2815+4149C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113663414
chr1:113663736 C
C
 A
A
 4 a0001c0001t0002g0180
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others(1): Show 
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a0001c0001t0006g0062
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a0001c0004t0002g0195
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HG02055.hp1
HG02647.hp2
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c.2815+4471C>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113663736
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G
 A
A
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a0001c0001t0003g0120
a0001c0001t0010g0134
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HG01070.hp1
NA21309.hp2
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c.2815+4472G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113663737
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A
 G
G
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HG00621.hp1
NA18747.hp1
NA18952.hp2
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A
 G
G
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a0001c0001t0004g0030
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NA18983.hp1
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c.2815+4558A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113663823
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T
 C
C
 38 a0001c0001t0004g0002
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HG00099.hp1
HG00423.hp1
HG01081.hp1
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c.2815+4812T>C
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chr1:113664272 G
G
 A
A
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a0001c0008t0009g0056
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HG03041.hp1
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c.2815+5007G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113664272
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G
 A
A
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HG03654.hp2
HG04115.hp1
NA18939.hp1
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NA18998.hp2
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c.2815+5323G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113664588
chr1:113664692 G
G
 T
T
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A
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C
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A
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T
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AT
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A
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C
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A
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T
 C
C
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G
 A
A
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A
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T
 C
C
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C
 T
T
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 A
A
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c.2816-3399C>T
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T
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CT
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c.2816-3141dupT
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C
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CTT
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CT
 C
C
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c.2816-3141delT
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A
 T
T
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c.2816-3133A>T
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C
 T
T
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G
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A
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c.2816-3110G>A
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G
 A
A
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HG01175.hp1
HG02897.hp1
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c.2816-2969G>A
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113668765
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C
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T
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c.2816-2906C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113668828
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C
 T
T
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a0001c0001t0007g0129
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HG00621.hp2
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c.2816-2542C>T
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113669192
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A
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G
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HG01433.hp1
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c.2816-2473A>G
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113669261
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 C
C
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a0001c0001t0001g0194
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HG02965.hp1
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c.2816-2257A>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113669477
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0014
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NA19054.hp2
NA19058.hp1
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MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 16/20 chr1 113669569
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 T
T
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c.2816-1709delA
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G
 A
A
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c.2816-1543G>A
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A
 G
G
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HG03098.hp2
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A
 G
G
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c.2816-880A>G
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T
 G
G
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HG03209.hp1
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T
 A
A
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C
 T
T
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A
 G
G
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G
 C
C
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c.2816-421G>C
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 C
C
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a0001c0002t0002g0203
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HG02300.hp2
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c.2816-295G>C
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A
 G
G
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a0001c0001t0014g0063
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HG02055.hp2
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T
 C
C
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T
 A
A
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c.2918+332T>A
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C
 T
T
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CTCTGA
 C
C
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G
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c.3189+362T>G
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G
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A
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HG02897.hp2
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c.3189+620G>A
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chr1:113674087 A
A
 T
T
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c.3189+622A>T
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T
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C
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c.3189+697T>C
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C
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A
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C
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c.3189+1771G>A
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 G
G
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HG03098.hp2
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c.3189+1824A>G
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C
 T
T
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T
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T
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C
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A
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C
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T
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G
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T
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GT
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c.3190-1495A>G
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C
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HG03041.hp1
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c.3190-1344C>T
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C
 A
A
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c.3190-1229A>T
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T
 C
C
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a0001c0001t0003g0068
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HG02004.hp1
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c.3190-1057T>C
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G
 A
A
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c.3190-718G>A
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 C
C
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HG02922.hp2
HG02976.hp1
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G
 T
T
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HG02647.hp2
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c.3190-572G>T
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C
 T
T
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c.3190-569C>T
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A
 G
G
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c.3190-555A>G
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G
 A
A
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c.3190-524G>A
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chr1:113681013 C
C
 T
T
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HG01517.hp1
HG01928.hp1
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c.3190-185C>T
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CTCA
 C
C
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others(12): Show 
HG01192.hp2
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NA19000.hp1
NA19002.hp2
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others(5): Show 
c.3190-151_3190-149delTCA
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 19/20 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 113681043
chr1:113681650 T
T
 C
C
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a0001c0001t0003g0090
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HG02071.hp1
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c.3328+314T>C
MAGI3 ENSG00000081026.19 transcript ENST00000307546.14 protein_coding 20/20 chr1 113681650
chr1:113681853 C
C
 T
T
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HG01192.hp2
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C
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C
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T
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AT
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ATT
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T
 C
C
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G
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A
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  • KoGES (Korean)
  • Mouse Phenotype
  • Zebra Phenotype
  • TogoVar

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  • Satellite
  • All Snps 1.4.2
  • RC
  • snRNA
  • SINE
  • GC %
  • Simple_repeat
  • RNA
  • Retroposon
  • Unknown
  • Low_complexity
  • LINE
  • scRNA
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  • Common Snps 1.4.2
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