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chr1:31363367	T T	A A	83	a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0022 a0001c0001t0001g0023 others(80): Show a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0022 a0001c0001t0001g0023 a0001c0001t0001g0113 a0001c0001t0001g0114 a0001c0001t0001g0115 a0001c0001t0003g0016 a0001c0001t0003g0017 a0001c0001t0003g0018 a0001c0001t0003g0020 a0001c0001t0003g0272 a0001c0001t0003g0273 a0001c0001t0003g0275 a0001c0001t0003g0276 a0001c0001t0003g0277 a0001c0001t0003g0278 a0001c0001t0003g0279 a0001c0001t0003g0280 a0001c0001t0003g0281 a0001c0001t0003g0282 a0001c0001t0003g0283 a0001c0001t0003g0284 a0001c0001t0003g0285 a0001c0001t0003g0286 a0001c0001t0003g0287 a0001c0001t0003g0288 a0001c0001t0003g0289 a0001c0001t0003g0290 a0001c0001t0003g0291 a0001c0001t0003g0292 a0001c0001t0003g0293 a0001c0001t0003g0294 a0001c0001t0003g0295 a0001c0001t0003g0296 a0001c0001t0003g0297 a0001c0001t0003g0298 a0001c0001t0003g0299 a0001c0001t0003g0300 a0001c0001t0003g0301 a0001c0001t0003g0302 a0001c0001t0003g0303 a0001c0001t0003g0304 a0001c0001t0003g0305 a0001c0001t0003g0306 a0001c0001t0003g0307 a0001c0001t0003g0308 a0001c0001t0003g0309 a0001c0001t0003g0310 a0001c0001t0003g0311 a0001c0001t0003g0312 a0001c0001t0003g0313 a0001c0001t0003g0314 a0001c0001t0003g0315 a0001c0001t0003g0316 a0001c0001t0003g0317 a0001c0001t0003g0318 a0001c0001t0003g0319 a0001c0001t0003g0321 a0001c0001t0003g0322 a0001c0001t0003g0323 a0001c0001t0003g0324 a0001c0001t0005g0012 a0001c0001t0005g0117 a0001c0001t0005g0118 a0001c0001t0005g0119 a0001c0001t0005g0120 a0001c0001t0005g0121 a0001c0001t0005g0122 a0001c0001t0005g0123 a0001c0001t0005g0124 a0001c0001t0005g0125 a0001c0001t0005g0126 a0001c0001t0005g0127 a0001c0001t0005g0128 a0001c0001t0005g0129 a0001c0001t0005g0160 a0001c0001t0005g0161 a0001c0001t0005g0260 a0001c0001t0007g0019 a0001c0001t0007g0116 a0001c0001t0007g0159 a0001c0001t0010g0112 a0002c0002t0001g0024	87	HG00280.hp1 HG00438.hp1 HG00438.hp2 others(84): Show HG00280.hp1 HG00438.hp1 HG00438.hp2 HG00597.hp2 HG00621.hp2 HG00642.hp2 HG00741.hp1 HG01109.hp2 HG01167.hp1 HG01175.hp1 HG01243.hp1 HG01346.hp2 HG01433.hp2 HG01517.hp1 HG01884.hp1 HG01891.hp1 HG01928.hp2 HG01934.hp2 HG01952.hp2 HG02040.hp2 HG02055.hp1 HG02056.hp2 HG02071.hp2 HG02074.hp1 HG02080.hp1 HG02083.hp2 HG02109.hp1 HG02109.hp2 HG02132.hp1 HG02280.hp2 HG02300.hp1 HG02559.hp1 HG02572.hp1 HG02572.hp2 HG02602.hp2 HG02622.hp2 HG02630.hp1 HG02698.hp1 HG02717.hp2 HG02735.hp2 HG02809.hp2 HG02818.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp2 HG02896.hp1 HG02897.hp1 HG02922.hp1 HG02965.hp1 HG03017.hp1 HG03041.hp1 HG03130.hp2 HG03209.hp1 HG03239.hp1 HG03471.hp2 HG03492.hp1 HG03579.hp1 HG03654.hp2 HG03688.hp2 HG03710.hp1 HG04115.hp1 HG04204.hp1 HG04228.hp2 NA18747.hp2 NA18940.hp1 NA18941.hp1 NA18945.hp2 NA18952.hp2 NA18962.hp2 NA18970.hp1 NA18972.hp2 NA18993.hp1 NA18995.hp2 NA18997.hp2 NA18999.hp1 NA19012.hp2 NA19043.hp1 NA19043.hp2 NA19058.hp1 NA19060.hp1 NA19066.hp2 NA19068.hp1 NA19079.hp2 NA19084.hp2 NA19090.hp2 NA20805.hp1 NA20905.hp2 homoSapiens_chm13v2.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.565-665T>A c.565-665T>A	ZCCHC17	ENSG00000121766.16	transcript	ENST00000344147.10	protein_coding	7/7		chr1	31363367
chr1:31363373	C C	T T	31	a0001c0001t0004g0010 a0001c0001t0004g0011 a0001c0001t0004g0130 others(28): Show a0001c0001t0004g0010 a0001c0001t0004g0011 a0001c0001t0004g0130 a0001c0001t0004g0131 a0001c0001t0004g0132 a0001c0001t0004g0133 a0001c0001t0004g0134 a0001c0001t0004g0135 a0001c0001t0004g0136 a0001c0001t0004g0137 a0001c0001t0004g0138 a0001c0001t0004g0139 a0001c0001t0004g0140 a0001c0001t0004g0141 a0001c0001t0004g0142 a0001c0001t0004g0143 a0001c0001t0004g0144 a0001c0001t0004g0145 a0001c0001t0004g0146 a0001c0001t0004g0147 a0001c0001t0004g0148 a0001c0001t0004g0149 a0001c0001t0004g0150 a0001c0001t0004g0151 a0001c0001t0004g0152 a0001c0001t0004g0251 a0001c0001t0004g0252 a0001c0001t0004g0253 a0001c0001t0004g0254 a0001c0001t0004g0255 a0001c0001t0004g0271	33	HG00408.hp1 HG00609.hp2 HG02071.hp1 others(30): Show HG00408.hp1 HG00609.hp2 HG02071.hp1 HG02080.hp2 HG02135.hp2 HG02523.hp1 NA18939.hp1 NA18950.hp1 NA18952.hp1 NA18956.hp2 NA18957.hp1 NA18962.hp1 NA18963.hp1 NA18965.hp1 NA18968.hp2 NA18981.hp1 NA18984.hp2 NA18986.hp2 NA18987.hp1 NA18993.hp2 NA18994.hp2 NA18998.hp1 NA19003.hp2 NA19007.hp2 NA19009.hp2 NA19010.hp2 NA19057.hp2 NA19062.hp1 NA19070.hp1 NA19075.hp1 NA19076.hp1 NA19087.hp1 NA19091.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.565-659C>T c.565-659C>T	ZCCHC17	ENSG00000121766.16	transcript	ENST00000344147.10	protein_coding	7/7		chr1	31363373
chr1:31363435	G G	A A	1	a0001c0001t0003g0299 a0001c0001t0003g0299	1	NA18747.hp2 NA18747.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.565-597G>A c.565-597G>A	ZCCHC17	ENSG00000121766.16	transcript	ENST00000344147.10	protein_coding	7/7		chr1	31363435
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JoGo Online Haplotype Explorer ZCCHC17_chr1_31292032_31369936

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 2)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 11)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 324)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 2)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 12)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 324)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 348)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 0)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 12)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 723)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)