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chr1:235109964	T T	C C	1	a0001c0001t0006 a0001c0001t0006	4	HG01891.hp2 HG02922.hp1 HG02965.hp1 others(1): Show HG01891.hp2 HG02922.hp1 HG02965.hp1 HG06807.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2100A>G c.2100A>G	TOMM20	ENSG00000173726.11	transcript	ENST00000366607.5	protein_coding	5/5	2100	chr1	235109964
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chr1:235128731	G G	A A	1	a0001c0001t0019 a0001c0001t0019	1	HG00673.hp1 HG00673.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-16C>T c.-16C>T	TOMM20	ENSG00000173726.11	transcript	ENST00000366607.5	protein_coding	1/5	16	chr1	235128731
chr1:235128741	G G	A A	1	a0001c0001t0020 a0001c0001t0020	1	HG01243.hp1 HG01243.hp1	5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant	LOW	c.-26C>T c.-26C>T	TOMM20	ENSG00000173726.11	transcript	ENST00000366607.5	protein_coding	1/5		chr1	235128741

chr:pos	ref	alt	# # of ghapid:genebody level	ghapids	# # of haplotypeids	haplotypeids	annotation	impact	hgvs_c	genename	geneid	featuretype	featureid	genebody_biotype	rank	chr	pos
chr1:235112123	A A	T T	2	a0001c0001t0007g0045 a0001c0001t0007g0162 a0001c0001t0007g0045 a0001c0001t0007g0162	3	HG01981.hp1 HG02109.hp2 HG03130.hp1 HG01981.hp1 HG02109.hp2 HG03130.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.394-15T>A c.394-15T>A	TOMM20	ENSG00000173726.11	transcript	ENST00000366607.5	protein_coding	4/4	chr1	235112123
chr1:235112259	A A	G G	1	a0001c0001t0002g0109 a0001c0001t0002g0109	1	HG02027.hp2 HG02027.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.394-151T>C c.394-151T>C	TOMM20	ENSG00000173726.11	transcript	ENST00000366607.5	protein_coding	4/4	chr1	235112259
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chr1:235112288	T T	C C	2	a0001c0001t0003g0016 a0001c0001t0003g0029 a0001c0001t0003g0016 a0001c0001t0003g0029	6	HG01106.hp1 HG02622.hp1 HG02630.hp2 others(3): Show HG01106.hp1 HG02622.hp1 HG02630.hp2 HG02886.hp2 HG03041.hp1 HG03453.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.394-180A>G c.394-180A>G	TOMM20	ENSG00000173726.11	transcript	ENST00000366607.5	protein_coding	4/4	chr1	235112288
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JoGo Online Haplotype Explorer TOMM20_chr1_235104341_235133837

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 20)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 208)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 1)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 20)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 208)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 398)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 0)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 0)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 20)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 216)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)