Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr1:28768228	T T	A A	1	a0001c0001t0001g0245 a0001c0001t0001g0245	1	HG01106.hp2 HG01106.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.1717-701T>A c.1717-701T>A	YTHDF2	ENSG00000198492.16	transcript	ENST00000373812.8	protein_coding	4/4		chr1	28768228
chr1:28768610	C C	G G	2	a0001c0001t0001g0179 a0001c0001t0001g0201 a0001c0001t0001g0179 a0001c0001t0001g0201	2	HG01891.hp2 HG02055.hp1 HG01891.hp2 HG02055.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.1717-319C>G c.1717-319C>G	YTHDF2	ENSG00000198492.16	transcript	ENST00000373812.8	protein_coding	4/4		chr1	28768610
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JoGo Online Haplotype Explorer YTHDF2_chr1_28731940_28774775

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 5)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 4)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 284)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 5)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 8)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 284)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 292)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 3)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 3)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 420)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)