Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr2:176118951	T T	C C	4	a0001c0001t0017g0025 a0001c0001t0030g0008 a0001c0001t0060g0008 others(1): Show a0001c0001t0017g0025 a0001c0001t0030g0008 a0001c0001t0060g0008 a0001c0001t0062g0008	5	HG02258.hp2 HG02922.hp1 HG03486.hp2 others(2): Show HG02258.hp2 HG02922.hp1 HG03486.hp2 NA19043.hp2 NA19240.hp2	splice_region_variant&intron_variant	LOW	c.746-3T>C c.746-3T>C	HOXD10	ENSG00000128710.6	transcript	ENST00000249501.5	protein_coding	1/1		chr2	176118951

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🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 6)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 11)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 63)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 26)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 11)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 71)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 108)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 428)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 7)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 6)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 35)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 26)

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