Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr8:133238956	C C	CCCCTCGC others(23): Show CCCCTCGCTGGTGTGCGAGCGGCTGCGGGTG	2	a0003 a0005 a0003 a0005	2	HG02572.hp1 HG03195.hp2 HG02572.hp1 HG03195.hp2	disruptive_inframe_insertion	MODERATE	c.1077_1106dupCACCCG others(24): Show c.1077_1106dupCACCCGCAGCCGCTCGCACACCAGCGAGGG	p.Gly369_Ala370insTh others(28): Show p.Gly369_Ala370insThrArgSerArgSerHisThrSerGluGly	NDRG1	ENSG00000104419.17	transcript	ENST00000323851.13	protein_coding	16/16	1243/3025	1106/1185	369/394	chr8	133238956
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chr8:133256822	G G	A A	1	a0001c0008 a0001c0008	1	HG01099.hp2 HG01099.hp2	synonymous_variant	LOW	c.492C>T c.492C>T	p.Asn164Asn p.Asn164Asn	NDRG1	ENSG00000104419.17	transcript	ENST00000323851.13	protein_coding	8/16	629/3025	492/1185	164/394	chr8	133256822
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chr8:133237256	A A	C C	3	a0001c0001t0008 a0001c0001t0011 a0001c0001t0016 a0001c0001t0008 a0001c0001t0011 a0001c0001t0016	8	HG01167.hp1 HG02257.hp2 HG02622.hp1 others(5): Show HG01167.hp1 HG02257.hp2 HG02622.hp1 HG02976.hp1 HG03041.hp2 HG03195.hp1 HG03225.hp1 NA18906.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1622T>G c.1622T>G	NDRG1	ENSG00000104419.17	transcript	ENST00000323851.13	protein_coding	16/16	1622	chr8	133237256
chr8:133237258	T T	C C	1	a0001c0001t0012 a0001c0001t0012	2	HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01069.hp2 HG01071.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1620A>G c.1620A>G	NDRG1	ENSG00000104419.17	transcript	ENST00000323851.13	protein_coding	16/16	1620	chr8	133237258
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chr8:133237683	C C	A A	1	a0001c0001t0021 a0001c0001t0021	1	HG03239.hp1 HG03239.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1195G>T c.1195G>T	NDRG1	ENSG00000104419.17	transcript	ENST00000323851.13	protein_coding	16/16	1195	chr8	133237683
chr8:133237733	A A	C C	1	a0001c0001t0023 a0001c0001t0023	1	NA19075.hp2 NA19075.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1145T>G c.1145T>G	NDRG1	ENSG00000104419.17	transcript	ENST00000323851.13	protein_coding	16/16	1145	chr8	133237733
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🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 5)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 9)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 25)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 370)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 9)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 38)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 370)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 378)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 3)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 4)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 25)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 757)

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