Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr17:1420904	G G	A A	1	a0001c0002t0029 a0001c0002t0029	1	HG06807.hp2 HG06807.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2609C>T c.2609C>T	CRK	ENSG00000167193.8	transcript	ENST00000300574.3	protein_coding	3/3	2609	chr17	1420904
chr17:1420981	C C	T T	1	a0001c0001t0030 a0001c0001t0030	1	NA18990.hp2 NA18990.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2532G>A c.2532G>A	CRK	ENSG00000167193.8	transcript	ENST00000300574.3	protein_coding	3/3	2532	chr17	1420981
chr17:1421099	AC AC	A A	1	a0001c0001t0011 a0001c0001t0011	4	HG02451.hp1 HG03486.hp2 HG03579.hp1 others(1): Show HG02451.hp1 HG03486.hp2 HG03579.hp1 NA19043.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2413delG c.2413delG	CRK	ENSG00000167193.8	transcript	ENST00000300574.3	protein_coding	3/3	2413	chr17	1421099
chr17:1421123	T T	C C	4	a0001c0001t0004 a0001c0001t0008 a0001c0001t0017 others(1): Show a0001c0001t0004 a0001c0001t0008 a0001c0001t0017 a0001c0001t0040	36	HG00323.hp2 HG00408.hp2 HG01081.hp2 others(33): Show HG00323.hp2 HG00408.hp2 HG01081.hp2 HG01167.hp1 HG01169.hp2 HG02080.hp2 HG02145.hp1 HG02683.hp1 HG02735.hp2 HG03017.hp1 HG03710.hp1 HG04204.hp2 NA18942.hp2 NA18943.hp2 NA18947.hp1 NA18950.hp2 NA18954.hp2 NA18967.hp2 NA18973.hp1 NA18982.hp2 NA18994.hp2 NA18998.hp2 NA19001.hp1 NA19002.hp2 NA19011.hp2 NA19054.hp2 NA19055.hp2 NA19062.hp1 NA19062.hp2 NA19066.hp2 NA19077.hp1 NA19079.hp2 NA19086.hp1 NA19090.hp2 NA19091.hp2 NA21309.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2390A>G c.2390A>G	CRK	ENSG00000167193.8	transcript	ENST00000300574.3	protein_coding	3/3	2390	chr17	1421123
chr17:1421287	CAAAGGA CAAAGGA	C C	13	a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0008 others(10): Show a0001c0001t0002 a0001c0001t0004 a0001c0001t0008 a0001c0001t0013 a0001c0001t0014 a0001c0001t0017 a0001c0001t0018 a0001c0001t0019 a0001c0001t0027 a0001c0001t0034 a0001c0001t0039 a0001c0001t0040 a0001c0001t0041	153	HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00323.hp2 others(150): Show HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00323.hp2 HG00408.hp2 HG00597.hp2 HG00609.hp2 HG00639.hp2 HG00642.hp2 HG00733.hp1 HG00735.hp1 HG00735.hp2 HG00738.hp2 HG00741.hp2 HG01070.hp1 HG01081.hp1 HG01081.hp2 HG01106.hp1 HG01106.hp2 HG01109.hp2 HG01123.hp2 HG01167.hp1 HG01168.hp1 HG01169.hp1 HG01169.hp2 HG01175.hp2 HG01192.hp2 HG01243.hp1 HG01255.hp1 HG01256.hp1 HG01257.hp1 HG01257.hp2 HG01346.hp1 HG01346.hp2 HG01361.hp2 HG01433.hp1 HG01433.hp2 HG01496.hp1 HG01517.hp2 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01934.hp2 HG01943.hp1 HG01952.hp1 HG01975.hp2 HG01978.hp2 HG01981.hp2 HG02015.hp1 HG02027.hp1 HG02040.hp2 HG02055.hp2 HG02074.hp2 HG02080.hp1 HG02080.hp2 HG02129.hp2 HG02132.hp2 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02148.hp1 HG02273.hp1 HG02293.hp1 HG02622.hp2 HG02683.hp1 HG02698.hp2 HG02723.hp1 HG02735.hp2 HG02738.hp2 HG02818.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp2 HG02896.hp2 HG02922.hp2 HG02970.hp1 HG02970.hp2 HG03017.hp1 HG03130.hp2 HG03139.hp1 HG03195.hp2 HG03225.hp1 HG03239.hp1 HG03453.hp1 HG03453.hp2 HG03490.hp1 HG03491.hp2 HG03669.hp1 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG03710.hp1 HG03710.hp2 HG03927.hp1 HG03927.hp2 HG03942.hp2 HG04184.hp1 HG04199.hp2 HG04204.hp2 HG04228.hp2 HG06807.hp1 NA18612.hp1 NA18747.hp2 NA18942.hp1 NA18942.hp2 NA18943.hp2 NA18947.hp1 NA18947.hp2 NA18950.hp2 NA18954.hp1 NA18954.hp2 NA18957.hp1 NA18957.hp2 NA18959.hp2 NA18964.hp2 NA18967.hp2 NA18971.hp1 NA18972.hp2 NA18973.hp1 NA18979.hp2 NA18982.hp2 NA18983.hp2 NA18984.hp2 NA18987.hp2 NA18990.hp1 NA18994.hp2 NA18998.hp2 NA19000.hp2 NA19001.hp1 NA19002.hp1 NA19002.hp2 NA19005.hp1 NA19011.hp2 NA19043.hp2 NA19054.hp2 NA19055.hp2 NA19056.hp1 NA19058.hp1 NA19060.hp1 NA19062.hp1 NA19062.hp2 NA19066.hp2 NA19072.hp1 NA19077.hp1 NA19079.hp2 NA19081.hp1 NA19083.hp2 NA19085.hp1 NA19086.hp1 NA19090.hp1 NA19090.hp2 NA19091.hp2 NA20129.hp1 NA20300.hp2 NA20752.hp1 NA20752.hp2 NA20805.hp1 NA21309.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2220_2225delTCCT others(2): Show c.2220_2225delTCCTTT	CRK	ENSG00000167193.8	transcript	ENST00000300574.3	protein_coding	3/3	2220	chr17	1421287
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chr17:1421555	C C	T T	1	a0001c0001t0036 a0001c0001t0036	1	NA18960.hp2 NA18960.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1958G>A c.1958G>A	CRK	ENSG00000167193.8	transcript	ENST00000300574.3	protein_coding	3/3	1958	chr17	1421555
chr17:1421583	T T	C C	1	a0001c0001t0031 a0001c0001t0031	1	HG00738.hp1 HG00738.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1930A>G c.1930A>G	CRK	ENSG00000167193.8	transcript	ENST00000300574.3	protein_coding	3/3	1930	chr17	1421583
chr17:1421811	T T	C C	1	a0001c0001t0032 a0001c0001t0032	1	HG02818.hp2 HG02818.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1702A>G c.1702A>G	CRK	ENSG00000167193.8	transcript	ENST00000300574.3	protein_coding	3/3	1702	chr17	1421811
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chr17:1455710	C C	T T	3	a0001c0001t0014g0130 a0001c0001t0014g0131 a0001c0001t0014g0132 a0001c0001t0014g0130 a0001c0001t0014g0131 a0001c0001t0014g0132	3	HG02145.hp2 HG02970.hp2 HG03130.hp2 HG02145.hp2 HG02970.hp2 HG03130.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.241+167G>A c.241+167G>A	CRK	ENSG00000167193.8	transcript	ENST00000300574.3	protein_coding	1/2	chr17	1455710

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JoGo Online Haplotype Explorer CRK_chr17_1415693_1461232

JoGo Local Haplotype Explorer (on iGV) CRK_chr17_1415693_1461232

Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 3)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 41)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 389)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 3)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 43)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 389)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 404)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 0)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 2)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 38)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 618)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)