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chr6:34466086	C C	G G	1	a0001c0001t0034 a0001c0001t0034	1	NA18999.hp1 NA18999.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-248C>G c.-248C>G	PACSIN1	ENSG00000124507.11	transcript	ENST00000244458.7	protein_coding	1/10	60220		chr6	34466086
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chr6:34532279	C C	T T	8	a0001c0001t0005g0021 a0001c0001t0005g0061 a0001c0001t0005g0068 others(5): Show a0001c0001t0005g0021 a0001c0001t0005g0061 a0001c0001t0005g0068 a0001c0001t0005g0096 a0001c0001t0005g0233 a0001c0001t0005g0299 a0001c0001t0005g0301 a0001c0001t0030g0076	8	HG01069.hp2 HG01123.hp2 HG01175.hp2 others(5): Show HG01069.hp2 HG01123.hp2 HG01175.hp2 HG02886.hp1 HG03130.hp1 HG03195.hp2 HG03225.hp1 HG03516.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.1226-142C>T c.1226-142C>T	PACSIN1	ENSG00000124507.11	transcript	ENST00000244458.7	protein_coding	9/9		chr6	34532279
chr6:34532303	G G	T T	1	a0001c0001t0002g0174 a0001c0001t0002g0174	1	HG01255.hp2 HG01255.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.1226-118G>T c.1226-118G>T	PACSIN1	ENSG00000124507.11	transcript	ENST00000244458.7	protein_coding	9/9		chr6	34532303

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JoGo Online Haplotype Explorer PACSIN1_chr6_34461076_34540223

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 5)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 34)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 305)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 5)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 38)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 305)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 310)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 2)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 29)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 816)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)