Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr16:71389657	T T	A A	1	a0001c0001t0002g0308 a0001c0001t0002g0308	1	NA18965.hp1 NA18965.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.700-92T>A c.700-92T>A	CALB2	ENSG00000172137.19	transcript	ENST00000302628.9	protein_coding	10/10		chr16	71389657

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JoGo Online Haplotype Explorer CALB2_chr16_71353723_71395433

JoGo Local Haplotype Explorer (on iGV) CALB2_chr16_71353723_71395433

Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 5)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 4)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 372)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 5)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 9)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 374)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 426)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 2)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 3)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 554)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)