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ALDH2_chr12_111761933_111822532 / BRCA1_chr17_43039295_43130364 etc.

  Error connecting to IGV?   LNX1_chr4_53454301_53596486  LNX1_chr4_53454301_53596486 (clean+top1000)

Multiple Alignments (by translate haplotype frequency)Multiple Alignments (by aa haplotype frequency) Multiple Alignments (by translate haplotype similarity)Multiple Alignments (by aa haplotype similarity)

Item Value
geneid 84708
ensemblid ENSG00000072201.14
hgncid 6657
symbol LNX1
name ligand of numb-protein X 1
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ver v1.2
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HG00544 hp1 a0001 c0001 t0003 g0193 EAS CHS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG00544 hp2 a0002 c0003 t0001 g0244 EAS CHS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG00558 hp1 a0008 c0008 t0002 g0081 EAS CHS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG00558 hp2 a0001 c0001 t0001 g0263 EAS CHS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG00597 hp1 a0001 c0001 t0002 g0329 EAS CHS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG00597 hp2 a0001 c0001 t0001 g0261 EAS CHS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG00621 hp1 a0001 c0001 t0001 g0265 EAS CHS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG00621 hp2 a0001 c0001 t0003 g0170 EAS CHS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG00642 hp1 a0001 c0001 t0004 g0080 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG00642 hp2 a0001 c0001 t0002 g0099 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG00673 hp1 a0001 c0001 t0001 g0049 EAS CHS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG00673 hp2 a0001 c0001 t0003 g0060 EAS CHS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
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HG00738 hp2 a0001 c0001 t0004 g0229 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG00741 hp1 a0001 c0001 t0003 g0205 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG00741 hp2 a0001 c0001 t0004 g0041 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01070 hp1 a0001 c0001 t0001 g0139 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01070 hp2 a0001 c0001 t0003 g0090 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01071 hp1 a0001 c0001 t0003 g0091 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01071 hp2 a0001 c0001 t0001 g0271 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01074 hp1 a0001 c0001 t0003 g0105 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01074 hp2 a0001 c0001 t0004 g0083 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01099 hp1 a0001 c0001 t0001 g0233 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01099 hp2 a0001 c0001 t0004 g0074 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01109 hp1 a0001 c0001 t0001 g0013 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
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HG01167 hp1 a0001 c0001 t0001 g0159 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01167 hp2 a0001 c0001 t0004 g0122 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01168 hp1 a0001 c0001 t0007 g0002 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01168 hp2 a0001 c0001 t0005 g0120 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01169 hp1 a0001 c0001 t0007 g0002 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01169 hp2 a0001 c0001 t0004 g0121 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01175 hp1 a0001 c0001 t0001 g0313 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01175 hp2 a0001 c0001 t0003 g0092 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01192 hp1 a0001 c0001 t0002 g0076 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
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HG01243 hp1 a0001 c0001 t0005 g0321 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01243 hp2 a0001 c0001 t0001 g0106 AMR PUR LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01255 hp1 a0001 c0001 t0007 g0166 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01255 hp2 a0001 c0001 t0005 g0151 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01256 hp1 a0001 c0001 t0001 g0315 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
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HG01257 hp1 a0001 c0001 t0001 g0014 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01257 hp2 a0001 c0001 t0004 g0001 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01258 hp1 a0001 c0001 t0001 g0316 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01258 hp2 a0001 c0001 t0004 g0001 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
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HG01346 hp2 a0001 c0001 t0001 g0130 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01358 hp1 a0001 c0001 t0001 g0248 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01358 hp2 a0001 c0001 t0006 g0097 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01433 hp1 a0001 c0001 t0004 g0039 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01433 hp2 a0001 c0001 t0001 g0273 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01496 hp1 a0010 c0011 t0001 g0274 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01496 hp2 a0001 c0001 t0001 g0249 AMR CLM LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01515 hp1 a0001 c0001 t0004 g0164 EUR IBS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01515 hp2 a0001 c0001 t0007 g0158 EUR IBS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01516 hp1 a0001 c0001 t0004 g0075 EUR IBS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01516 hp2 a0001 c0001 t0001 g0038 EUR IBS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01517 hp1 a0001 c0001 t0004 g0163 EUR IBS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01517 hp2 a0001 c0001 t0001 g0037 EUR IBS LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01884 hp1 a0001 c0001 t0020 g0172 AFR ACB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01884 hp2 a0001 c0001 t0001 g0145 AFR ACB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01934 hp1 a0001 c0001 t0003 g0086 AMR PEL LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01934 hp2 a0001 c0001 t0001 g0140 AMR PEL LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01952 hp1 a0001 c0001 t0001 g0272 AMR PEL LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01952 hp2 a0001 c0001 t0001 g0131 AMR PEL LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG01975 hp1 a0001 c0001 t0003 g0231 AMR PEL LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
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HG01978 hp1 a0001 c0001 t0003 g0082 AMR PEL LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
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HG02015 hp1 a0001 c0001 t0003 g0189 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
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HG02055 hp1 a0001 c0001 t0016 g0016 AFR ACB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02055 hp2 a0001 c0001 t0001 g0165 AFR ACB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02056 hp1 a0001 c0001 t0002 g0101 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
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HG02071 hp1 a0001 c0001 t0001 g0057 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02071 hp2 a0001 c0001 t0002 g0028 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02074 hp1 a0001 c0001 t0003 g0200 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02074 hp2 a0001 c0001 t0003 g0103 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02080 hp1 a0001 c0001 t0003 g0327 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02080 hp2 a0001 c0001 t0004 g0102 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02083 hp1 a0001 c0001 t0004 g0100 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02083 hp2 a0001 c0001 t0001 g0035 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02129 hp1 a0001 c0001 t0002 g0048 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02129 hp2 a0001 c0001 t0003 g0253 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02132 hp1 a0001 c0001 t0003 g0255 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02132 hp2 a0001 c0001 t0005 g0234 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02135 hp1 a0001 c0001 t0005 g0024 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02135 hp2 a0001 c0001 t0001 g0245 EAS KHV LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02145 hp1 a0001 c0001 t0005 g0135 AFR ACB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02145 hp2 a0001 c0001 t0001 g0160 AFR ACB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02148 hp1 a0001 c0001 t0001 g0250 AMR PEL LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02148 hp2 a0001 c0001 t0001 g0116 AMR PEL LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02165 hp1 a0001 c0001 t0005 g0310 EAS CDX LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02165 hp2 a0001 c0001 t0001 g0259 EAS CDX LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02258 hp1 a0001 c0001 t0012 g0222 AFR ACB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
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HG03927 hp2 a0001 c0001 t0002 g0295 SAS BEB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
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HG04199 hp2 a0007 c0012 t0003 g0011 SAS STU LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG04204 hp1 a0001 c0001 t0003 g0027 SAS STU LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG04204 hp2 a0012 c0007 t0005 g0055 SAS STU LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG04228 hp1 a0001 c0001 t0005 g0073 SAS STU LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
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NA19070 hp2 a0001 c0001 t0005 g0241 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19074 hp1 a0001 c0004 t0001 g0201 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19074 hp2 a0001 c0001 t0002 g0046 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19077 hp1 a0001 c0001 t0004 g0025 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19077 hp2 a0001 c0001 t0001 g0185 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19079 hp1 a0001 c0001 t0001 g0307 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19079 hp2 a0001 c0001 t0002 g0230 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19082 hp1 a0001 c0001 t0005 g0260 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19082 hp2 a0001 c0001 t0001 g0056 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19083 hp1 a0001 c0001 t0005 g0227 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19083 hp2 a0001 c0001 t0001 g0042 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19084 hp1 a0001 c0001 t0002 g0029 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19084 hp2 a0001 c0001 t0005 g0235 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19085 hp1 a0001 c0001 t0001 g0181 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19085 hp2 a0001 c0001 t0002 g0251 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19086 hp1 a0001 c0001 t0002 g0296 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19086 hp2 a0001 c0001 t0003 g0306 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19087 hp1 a0001 c0001 t0005 g0320 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19087 hp2 a0001 c0001 t0001 g0247 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19088 hp1 a0001 c0001 t0001 g0177 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19088 hp2 a0001 c0001 t0004 g0246 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19091 hp1 a0001 c0001 t0001 g0257 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19091 hp2 a0001 c0001 t0002 g0328 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19240 hp1 a0001 c0001 t0002 g0147 AFR YRI LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA19240 hp2 a0001 c0001 t0010 g0348 AFR YRI LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA20129 hp1 a0001 c0001 t0002 g0070 AFR ASW LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA20129 hp2 a0001 c0014 t0019 g0157 AFR ASW LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA20805 hp1 a0001 c0001 t0005 g0050 EUR TSI LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA20805 hp2 a0001 c0001 t0001 g0215 EUR TSI LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA20905 hp1 a0001 c0001 t0002 g0125 SAS GIH LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA20905 hp2 a0001 c0001 t0001 g0285 SAS GIH LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02109 hp1 a0001 c0001 t0002 g0220 AFR ACB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02109 hp2 a0001 c0001 t0005 g0143 AFR ACB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02486 hp1 a0001 c0001 t0004 g0337 AFR ACB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02486 hp2 a0001 c0001 t0006 g0240 AFR ACB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02559 hp1 a0001 c0001 t0005 g0153 AFR ACB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG02559 hp2 a0001 c0001 t0006 g0077 AFR ACB LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG03471 hp1 a0001 c0001 t0005 g0236 AFR MSL LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
HG03471 hp2 a0001 c0001 t0006 g0058 AFR MSL LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA18955 hp1 a0001 c0001 t0003 g0155 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA18955 hp2 a0001 c0001 t0002 g0003 EAS JPT LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA20300 hp1 a0001 c0001 t0003 g0004 AFR USA LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA20300 hp2 a0001 c0001 t0001 g0188 AFR USA LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA21309 hp1 a0001 c0001 t0002 g0146 AFR LWK LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
NA21309 hp2 a0001 c0001 t0009 g0124 AFR LWK LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
homoSapiens_chm13v2 hp1 a0001 c0001 t0003 g0089 REF REF LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486
homoSapiens_grch38 hp1 a0001 c0001 t0003 g0331 REF REF LNX1_chr4_53454301_53596486 LNX1 chr4 53454301 53596486

chr:pos ref alt #
# of ahapid:amino-acid(protein) level
 ahapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr4:53476939 A
A
 G
G
 1 a0010
a0010
 1 HG01496.hp1
HG01496.hp1
 missense_variant MODERATE c.1706T>C
c.1706T>C
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p.Val569Ala
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/11 1891/3978 1706/2187 569/728 chr4 53476939
chr4:53478601 C
C
 T
T
 1 a0011
a0011
 1 HG02698.hp1
HG02698.hp1
 missense_variant MODERATE c.1627G>A
c.1627G>A
 p.Gly543Arg
p.Gly543Arg
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 8/11 1812/3978 1627/2187 543/728 chr4 53478601
chr4:53481811 C
C
 T
T
 1 a0002
a0002
 2 HG00544.hp2
HG02523.hp2
HG00544.hp2
HG02523.hp2
 missense_variant MODERATE c.1394G>A
c.1394G>A
 p.Arg465Gln
p.Arg465Gln
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 7/11 1579/3978 1394/2187 465/728 chr4 53481811
chr4:53481830 C
C
 T
T
 1 a0009
a0009
 1 HG03486.hp1
HG03486.hp1
 missense_variant MODERATE c.1375G>A
c.1375G>A
 p.Val459Ile
p.Val459Ile
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 7/11 1560/3978 1375/2187 459/728 chr4 53481830
chr4:53481841 C
C
 T
T
 1 a0008
a0008
 1 HG00558.hp1
HG00558.hp1
 missense_variant MODERATE c.1364G>A
c.1364G>A
 p.Arg455His
p.Arg455His
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 7/11 1549/3978 1364/2187 455/728 chr4 53481841
chr4:53481842 G
G
 A
A
 1 a0007
a0007
 1 HG04199.hp2
HG04199.hp2
 missense_variant MODERATE c.1363C>T
c.1363C>T
 p.Arg455Cys
p.Arg455Cys
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 7/11 1548/3978 1363/2187 455/728 chr4 53481842
chr4:53481850 C
C
 G
G
 1 a0012
a0012
 1 HG04204.hp2
HG04204.hp2
 missense_variant MODERATE c.1355G>C
c.1355G>C
 p.Ser452Thr
p.Ser452Thr
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 7/11 1540/3978 1355/2187 452/728 chr4 53481850
chr4:53496023 C
C
 G
G
 1 a0006
a0006
 1 NA18960.hp1
NA18960.hp1
 missense_variant&splice_region_variant MODERATE c.1350G>C
c.1350G>C
 p.Gln450His
p.Gln450His
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/11 1535/3978 1350/2187 450/728 chr4 53496023
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C
 T
T
 1 a0005
a0005
 1 NA19062.hp2
NA19062.hp2
 missense_variant MODERATE c.1025G>A
c.1025G>A
 p.Arg342His
p.Arg342His
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/11 1210/3978 1025/2187 342/728 chr4 53496348
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G
 A
A
 1 a0004
a0004
 1 HG00323.hp2
HG00323.hp2
 missense_variant MODERATE c.1024C>T
c.1024C>T
 p.Arg342Cys
p.Arg342Cys
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/11 1209/3978 1024/2187 342/728 chr4 53496349
chr4:53573648 C
C
 A
A
 1 a0013
a0013
 1 HG02723.hp1
HG02723.hp1
 missense_variant MODERATE c.355G>T
c.355G>T
 p.Asp119Tyr
p.Asp119Tyr
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/11 540/3978 355/2187 119/728 chr4 53573648
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C
 T
T
 1 a0003
a0003
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HG03540.hp2
HG03098.hp1
HG03540.hp2
 missense_variant MODERATE c.25G>A
c.25G>A
 p.Asp9Asn
p.Asp9Asn
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/11 210/3978 25/2187 9/728 chr4 53573978

chr:pos ref alt #
# of chapid
 chapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr4:53478602 G
G
 A
A
 1 a0001c0004
a0001c0004
 2 NA19057.hp1
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NA19057.hp1
NA19074.hp1
 synonymous_variant LOW c.1626C>T
c.1626C>T
 p.Pro542Pro
p.Pro542Pro
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 8/11 1811/3978 1626/2187 542/728 chr4 53478602
chr4:53508221 T
T
 C
C
 1 a0001c0014
a0001c0014
 1 NA20129.hp2
NA20129.hp2
 synonymous_variant LOW c.387A>G
c.387A>G
 p.Lys129Lys
p.Lys129Lys
 LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 3/11 572/3978 387/2187 129/728 chr4 53508221

chr:pos ref alt #
# of thapid:transcript level
 thapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr4:53459823 T
T
 C
C
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a0001c0001t0002
a0001c0001t0004
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a0001c0001t0001
a0001c0001t0002
a0001c0001t0004
a0001c0001t0005
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c.*1084A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0017
a0001c0001t0016
a0001c0001t0017
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HG02055.hp1
HG03486.hp2
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c.*986A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 11/11 986 chr4 53459921
chr4:53459987 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0016
a0001c0001t0016
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HG02055.hp1
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c.*920G>A
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chr4:53460054 T
T
 C
C
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a0001c0001t0020
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HG01884.hp1
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c.*853A>G
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chr4:53460055 AAATT
AAATT
 A
A
 29 a0001c0001t0001
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others(26): Show 
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a0001c0001t0002
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c.*848_*851delAATT
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chr4:53460150 G
G
 C
C
 1 a0001c0014t0019
a0001c0014t0019
 1 NA20129.hp2
NA20129.hp2
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c.*757C>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 11/11 757 chr4 53460150
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C
 CAGTT
CAGTT
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a0001c0001t0008
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HG02683.hp2
HG03704.hp1
NA18963.hp1
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c.*675_*678dupAACT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 11/11 678 chr4 53460228
chr4:53460228 C
C
 T
T
 7 a0001c0001t0002
a0001c0001t0012
a0001c0001t0016
others(4): Show 
a0001c0001t0002
a0001c0001t0012
a0001c0001t0016
a0001c0001t0017
a0008c0008t0002
a0011c0010t0002
a0013c0015t0002
 71 HG00558.hp1
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others(68): Show 
HG00558.hp1
HG00597.hp1
HG00642.hp2
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HG02735.hp2
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NA19064.hp1
NA19066.hp2
NA19074.hp2
NA19079.hp2
NA19084.hp1
NA19085.hp2
NA19086.hp1
NA19091.hp2
NA19240.hp1
NA20129.hp1
NA20905.hp1
NA21309.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*679G>A
c.*679G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 11/11 679 chr4 53460228
chr4:53460247 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0021
a0001c0001t0021
 1 NA19030.hp1
NA19030.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*660T>C
c.*660T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 11/11 660 chr4 53460247
chr4:53460357 CAAAT
CAAAT
 C
C
 2 a0001c0001t0006
a0001c0001t0020
a0001c0001t0006
a0001c0001t0020
 18 HG01358.hp2
HG01884.hp1
HG02280.hp2
others(15): Show 
HG01358.hp2
HG01884.hp1
HG02280.hp2
HG02486.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp2
HG02647.hp1
HG02818.hp2
HG02970.hp2
HG03098.hp2
HG03195.hp1
HG03195.hp2
HG03209.hp1
HG03225.hp1
HG03471.hp2
HG03579.hp2
NA18906.hp1
NA19043.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*546_*549delATTT
c.*546_*549delATTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 11/11 546 chr4 53460357
chr4:53460377 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0018
a0001c0001t0018
 1 HG02622.hp1
HG02622.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*530T>C
c.*530T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 11/11 530 chr4 53460377
chr4:53460383 A
A
 T
T
 4 a0001c0001t0005
a0001c0001t0015
a0004c0013t0005
others(1): Show 
a0001c0001t0005
a0001c0001t0015
a0004c0013t0005
a0012c0007t0005
 41 HG00323.hp2
HG00408.hp1
HG01109.hp2
others(38): Show 
HG00323.hp2
HG00408.hp1
HG01109.hp2
HG01168.hp2
HG01243.hp1
HG01255.hp2
HG02109.hp2
HG02132.hp2
HG02135.hp1
HG02145.hp1
HG02165.hp1
HG02300.hp1
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HG02559.hp1
HG02735.hp1
HG02976.hp1
HG03017.hp1
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HG03491.hp2
HG03492.hp2
HG03540.hp1
HG04204.hp2
HG04228.hp1
NA18941.hp1
NA18951.hp1
NA18954.hp2
NA18964.hp1
NA18974.hp2
NA18975.hp2
NA18978.hp2
NA18990.hp2
NA18995.hp1
NA19005.hp2
NA19009.hp1
NA19062.hp1
NA19070.hp2
NA19082.hp1
NA19083.hp1
NA19084.hp2
NA19087.hp1
NA20805.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*524T>A
c.*524T>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 11/11 524 chr4 53460383
chr4:53460624 A
A
 AAATC
AAATC
 6 a0001c0001t0002
a0001c0001t0016
a0001c0001t0017
others(3): Show 
a0001c0001t0002
a0001c0001t0016
a0001c0001t0017
a0008c0008t0002
a0011c0010t0002
a0013c0015t0002
 69 HG00558.hp1
HG00597.hp1
HG00642.hp2
others(66): Show 
HG00558.hp1
HG00597.hp1
HG00642.hp2
HG01192.hp1
HG02015.hp2
HG02055.hp1
HG02056.hp1
HG02071.hp2
HG02109.hp1
HG02129.hp1
HG02258.hp2
HG02523.hp1
HG02572.hp1
HG02602.hp1
HG02622.hp2
HG02630.hp2
HG02647.hp2
HG02683.hp1
HG02698.hp1
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02735.hp2
HG02809.hp2
HG02886.hp2
HG02895.hp2
HG02896.hp1
HG02896.hp2
HG02897.hp1
HG02965.hp1
HG03041.hp1
HG03130.hp1
HG03139.hp1
HG03209.hp2
HG03453.hp1
HG03453.hp2
HG03486.hp2
HG03654.hp2
HG03669.hp2
HG03834.hp2
HG03927.hp2
HG04228.hp2
NA18522.hp2
NA18906.hp2
NA18942.hp2
NA18955.hp2
NA18957.hp2
NA18959.hp2
NA18960.hp2
NA18965.hp2
NA18967.hp1
NA18970.hp1
NA18991.hp2
NA19004.hp2
NA19007.hp1
NA19030.hp2
NA19043.hp2
NA19060.hp2
NA19064.hp1
NA19066.hp2
NA19074.hp2
NA19079.hp2
NA19084.hp1
NA19085.hp2
NA19086.hp1
NA19091.hp2
NA19240.hp1
NA20129.hp1
NA20905.hp1
NA21309.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*279_*282dupGATT
c.*279_*282dupGATT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 11/11 282 chr4 53460624
chr4:53460757 G
G
 C
C
 2 a0001c0001t0009
a0001c0001t0021
a0001c0001t0009
a0001c0001t0021
 4 HG03130.hp2
HG03579.hp1
NA19030.hp1
others(1): Show 
HG03130.hp2
HG03579.hp1
NA19030.hp1
NA21309.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*150C>G
c.*150C>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 11/11 150 chr4 53460757
chr4:53460865 C
C
 CTA
CTA
 1 a0001c0001t0007
a0001c0001t0007
 5 HG00140.hp2
HG01168.hp1
HG01169.hp1
others(2): Show 
HG00140.hp2
HG01168.hp1
HG01169.hp1
HG01255.hp1
HG01515.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*40_*41dupTA
c.*40_*41dupTA
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 11/11 41 chr4 53460865
chr4:53460865 C
C
 CTAT
CTAT
 4 a0001c0001t0004
a0001c0001t0008
a0001c0001t0014
others(1): Show 
a0001c0001t0004
a0001c0001t0008
a0001c0001t0014
a0003c0002t0004
 53 HG00140.hp1
HG00423.hp1
HG00642.hp1
others(50): Show 
HG00140.hp1
HG00423.hp1
HG00642.hp1
HG00738.hp2
HG00741.hp2
HG01074.hp2
HG01099.hp2
HG01167.hp2
HG01169.hp2
HG01257.hp2
HG01258.hp2
HG01346.hp1
HG01433.hp1
HG01515.hp1
HG01516.hp1
HG01517.hp1
HG02004.hp2
HG02080.hp2
HG02083.hp1
HG02486.hp1
HG02683.hp2
HG02717.hp1
HG02723.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG02895.hp1
HG02897.hp2
HG03098.hp1
HG03225.hp2
HG03540.hp2
HG03688.hp2
HG03704.hp1
HG03710.hp1
HG04199.hp1
NA18612.hp2
NA18939.hp2
NA18940.hp1
NA18941.hp2
NA18953.hp2
NA18956.hp2
NA18963.hp1
NA18969.hp1
NA18970.hp2
NA18975.hp1
NA18977.hp2
NA18984.hp2
NA18998.hp2
NA19005.hp1
NA19060.hp1
NA19063.hp2
NA19064.hp2
NA19077.hp1
NA19088.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*39_*41dupATA
c.*39_*41dupATA
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 11/11 41 chr4 53460865
chr4:53591441 A
A
 AT
AT
 3 a0001c0001t0011
a0001c0001t0014
a0001c0001t0015
a0001c0001t0011
a0001c0001t0014
a0001c0001t0015
 4 NA18945.hp1
NA18974.hp2
NA19063.hp1
others(1): Show 
NA18945.hp1
NA18974.hp2
NA19063.hp1
NA19063.hp2
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-141dupA
c.-141dupA
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/11 17440 chr4 53591441
chr4:53591443 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0010
a0001c0001t0010
 3 HG02922.hp2
HG02970.hp1
NA19240.hp2
HG02922.hp2
HG02970.hp1
NA19240.hp2
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-142A>T
c.-142A>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/11 17441 chr4 53591443
chr4:53591470 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0013
a0001c0001t0013
 2 HG00738.hp1
HG03710.hp2
HG00738.hp1
HG03710.hp2
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-169A>G
c.-169A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/11 17468 chr4 53591470

chr:pos ref alt #
# of ghapid:genebody level
 ghapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid genebody_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr4:53461044 T
T
 TA
TA
 55 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0010
a0001c0001t0002g0015
others(52): Show 
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0010
a0001c0001t0002g0015
a0001c0001t0002g0028
a0001c0001t0002g0029
a0001c0001t0002g0046
a0001c0001t0002g0048
a0001c0001t0002g0051
a0001c0001t0002g0066
a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0068
a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0076
a0001c0001t0002g0093
a0001c0001t0002g0096
a0001c0001t0002g0099
a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0117
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0125
a0001c0001t0002g0146
a0001c0001t0002g0147
a0001c0001t0002g0154
a0001c0001t0002g0171
a0001c0001t0002g0183
a0001c0001t0002g0192
a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0209
a0001c0001t0002g0221
a0001c0001t0002g0228
a0001c0001t0002g0230
a0001c0001t0002g0251
a0001c0001t0002g0252
a0001c0001t0002g0275
a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0002g0295
a0001c0001t0002g0296
a0001c0001t0002g0297
a0001c0001t0002g0298
a0001c0001t0002g0299
a0001c0001t0002g0322
a0001c0001t0002g0323
a0001c0001t0002g0328
a0001c0001t0002g0329
a0001c0001t0002g0334
a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
a0001c0001t0002g0346
a0001c0001t0003g0132
a0008c0008t0002g0081
a0011c0010t0002g0142
 56 HG00558.hp1
HG00597.hp1
HG00642.hp2
others(53): Show 
HG00558.hp1
HG00597.hp1
HG00642.hp2
HG01192.hp1
HG02015.hp2
HG02056.hp1
HG02071.hp2
HG02129.hp1
HG02258.hp2
HG02523.hp1
HG02572.hp1
HG02602.hp1
HG02622.hp2
HG02683.hp1
HG02698.hp1
HG02717.hp2
HG02735.hp2
HG02809.hp2
HG02895.hp2
HG02896.hp1
HG02965.hp1
HG03130.hp1
HG03209.hp2
HG03453.hp1
HG03453.hp2
HG03654.hp2
HG03669.hp2
HG03834.hp2
HG03927.hp2
HG04228.hp2
NA18942.hp2
NA18955.hp2
NA18957.hp2
NA18959.hp2
NA18960.hp2
NA18965.hp2
NA18967.hp1
NA18970.hp1
NA18991.hp2
NA18997.hp1
NA19004.hp2
NA19007.hp1
NA19043.hp2
NA19060.hp2
NA19064.hp1
NA19066.hp2
NA19074.hp2
NA19079.hp2
NA19084.hp1
NA19085.hp2
NA19086.hp1
NA19091.hp2
NA19240.hp1
NA20129.hp1
NA20905.hp1
NA21309.hp1
 splice_region_variant&intron_variant LOW c.2052-3dupT
c.2052-3dupT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 10/10 chr4 53461044
chr4:53461066 T
T
 C
C
 9 a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0004g0148
others(6): Show 
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0149
a0001c0001t0004g0150
a0001c0001t0004g0289
a0001c0001t0004g0337
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
 9 HG02486.hp1
HG02723.hp2
HG02818.hp1
others(6): Show 
HG02486.hp1
HG02723.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG02895.hp1
HG02897.hp2
HG03098.hp1
HG03225.hp2
HG03540.hp2
 intron_variant MODIFIER c.2052-24A>G
c.2052-24A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 10/10 chr4 53461066
chr4:53461068 T
T
 C
C
 145 a0001c0001t0001g0005
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
others(142): Show 
a0001c0001t0001g0005
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0031
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0036
a0001c0001t0001g0037
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0042
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0057
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0094
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A
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C
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A
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A
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G
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HG03041.hp2
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c.1893-1315T>C
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C
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G
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NA18964.hp1
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A
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G
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c.1893-1385T>C
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A
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G
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a0001c0001t0002g0275
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c.1893-1421T>C
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C
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CTT
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NA19079.hp2
NA19084.hp1
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NA19240.hp1
NA20129.hp1
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T
 A
A
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c.1893-1878A>T
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T
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C
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C
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C
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T
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c.1893-3079G>A
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T
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C
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a0001c0001t0002g0046
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NA19074.hp2
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c.1893-3089A>G
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A
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G
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c.1893-3803G>C
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A
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T
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c.1893-3888T>A
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G
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G
 A
A
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A
 G
G
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c.1893-3946T>C
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A
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HG00741.hp1
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0119
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HG03453.hp2
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c.1893-4094T>C
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 G
G
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c.1893-4107T>C
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AAT
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G
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T
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A
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A
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G
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A
 C
C
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C
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C
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C
 T
T
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G
 A
A
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a0001c0001t0012g0226
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HG02630.hp1
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chr4:53466549 C
C
 T
T
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a0001c0001t0004g0100
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HG02083.hp1
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c.1893-4956G>A
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C
 T
T
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G
 A
A
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HG04204.hp2
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c.1893-5004C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53466597
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G
 T
T
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HG02258.hp1
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LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53466711
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G
 A
A
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NA19091.hp1
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c.1893-5170C>T
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G
 A
A
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others(1): Show 
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 4 HG03130.hp2
HG03579.hp1
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others(1): Show 
HG03130.hp2
HG03579.hp1
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NA21309.hp2
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c.1893-5323C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53466916
chr4:53466929 C
C
 A
A
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others(6): Show 
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
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a0001c0001t0004g0149
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HG02486.hp1
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c.1893-5336G>T
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C
 G
G
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HG02109.hp1
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LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53467008
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 T
T
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a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
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HG02630.hp1
HG02258.hp1
HG02630.hp1
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c.1893-5473G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0183
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NA19066.hp2
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c.1893-5509G>A
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chr4:53467418 A
A
 C
C
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a0001c0001t0004g0108
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HG02717.hp1
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chr4:53467434 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0108
a0001c0001t0004g0108
 1 HG02717.hp1
HG02717.hp1
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c.1893-5841G>A
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chr4:53467595 A
A
 C
C
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a0001c0001t0002g0276
a0011c0010t0002g0142
a0001c0001t0002g0275
a0001c0001t0002g0276
a0011c0010t0002g0142
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HG02683.hp1
HG02698.hp1
HG02735.hp2
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chr4:53467606 A
A
 T
T
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a0001c0001t0021g0217
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NA19030.hp1
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c.1893-6013T>A
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chr4:53467630 G
G
 T
T
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a0001c0001t0003g0306
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NA19086.hp2
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c.1893-6037C>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53467630
chr4:53467717 G
G
 A
A
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a0001c0001t0021g0217
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NA19030.hp1
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c.1893-6124C>T
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chr4:53467734 G
G
 C
C
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HG00597.hp1
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c.1893-6141C>G
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T
 C
C
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C
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G
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A
 G
G
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a0001c0001t0005g0227
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A
 T
T
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a0001c0001t0005g0260
a0001c0001t0005g0227
a0001c0001t0005g0260
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NA19082.hp1
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T
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G
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a0001c0001t0001g0038
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C
 G
G
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a0001c0001t0009g0107
a0001c0001t0009g0118
a0001c0001t0009g0124
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HG03579.hp1
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c.1893-6483G>C
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G
 A
A
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A
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HG02630.hp1
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 A
A
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A
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HG00597.hp1
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GGAA
 G
G
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T
 C
C
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HG02896.hp1
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 A
A
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a0001c0001t0002g0323
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HG02896.hp1
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C
 T
T
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NA19030.hp1
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 C
C
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a0001c0001t0021g0217
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NA19030.hp1
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G
 T
T
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c.1893-7227C>A
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 C
C
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c.1893-7257C>G
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A
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G
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A
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A
 C
C
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T
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A
 T
T
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c.1892+7213T>A
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A
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C
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c.1892+7111T>G
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chr4:53469753 A
A
 C
C
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HG01071.hp2
HG01496.hp1
HG01952.hp1
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c.1892+7000T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53469753
chr4:53469787 C
C
 G
G
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c.1892+6966G>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53469787
chr4:53469895 C
C
 T
T
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a0001c0001t0004g0074
a0001c0001t0004g0075
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HG01074.hp2
HG01099.hp2
HG01516.hp1
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c.1892+6858G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53469895
chr4:53470042 A
A
 G
G
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a0006c0006t0001g0168
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NA18960.hp1
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c.1892+6711T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53470042
chr4:53470152 T
T
 A
A
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HG00408.hp2
HG00544.hp2
HG00558.hp2
HG00597.hp2
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NA19077.hp2
NA19079.hp1
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NA19091.hp1
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c.1892+6601A>T
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chr4:53470204 C
C
 T
T
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a0010c0011t0001g0274
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HG01496.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1892+6549G>A
c.1892+6549G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53470204
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C
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0232
a0001c0001t0003g0232
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HG02004.hp1
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c.1892+6443G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53470310
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 G
G
 68 a0001c0001t0002g0003
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a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
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A
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G
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C
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A
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NA18939.hp1
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c.1892+5766G>T
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G
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T
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NA18960.hp2
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NA18964.hp2
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NA18965.hp2
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NA21309.hp2
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c.1892+5681T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471072
chr4:53471089 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0017
 1 HG02647.hp2
HG02647.hp2
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c.1892+5664A>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471089
chr4:53471107 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0060
 1 HG00673.hp2
HG00673.hp2
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c.1892+5646A>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471107
chr4:53471108 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0060
 1 HG00673.hp2
HG00673.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1892+5645T>A
c.1892+5645T>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471108
chr4:53471128 G
G
 C
C
 2 a0001c0001t0002g0297
a0001c0001t0002g0298
a0001c0001t0002g0297
a0001c0001t0002g0298
 2 NA18942.hp2
NA18965.hp2
NA18942.hp2
NA18965.hp2
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c.1892+5625C>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471128
chr4:53471129 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0002g0297
a0001c0001t0002g0298
a0001c0001t0002g0297
a0001c0001t0002g0298
 2 NA18942.hp2
NA18965.hp2
NA18942.hp2
NA18965.hp2
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c.1892+5624C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471129
chr4:53471144 T
T
 C
C
 52 a0001c0001t0004g0001
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0023
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a0001c0001t0004g0019
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a0001c0001t0004g0040
a0001c0001t0004g0041
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others(50): Show 
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HG00423.hp1
HG00642.hp1
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NA18998.hp2
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c.1892+5609A>G
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chr4:53471185 C
C
 T
T
 18 a0001c0001t0006g0018
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others(15): Show 
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others(15): Show 
HG01358.hp2
HG01884.hp1
HG02280.hp2
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c.1892+5568G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471185
chr4:53471264 G
G
 A
A
 1 a0002c0003t0001g0244
a0002c0003t0001g0244
 1 HG00544.hp2
HG00544.hp2
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c.1892+5489C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471264
chr4:53471289 C
C
 T
T
 48 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0010
a0001c0001t0002g0015
others(45): Show 
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a0001c0001t0002g0329
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a0001c0001t0017g0123
a0008c0008t0002g0081
a0011c0010t0002g0142
 49 HG00558.hp1
HG00597.hp1
HG01192.hp1
others(46): Show 
HG00558.hp1
HG00597.hp1
HG01192.hp1
HG02015.hp2
HG02056.hp1
HG02071.hp2
HG02129.hp1
HG02258.hp2
HG02523.hp1
HG02572.hp1
HG02602.hp1
HG02683.hp1
HG02698.hp1
HG02735.hp2
HG02895.hp2
HG03209.hp2
HG03453.hp1
HG03453.hp2
HG03486.hp2
HG03654.hp2
HG03669.hp2
HG03834.hp2
HG03927.hp2
HG04228.hp2
NA18942.hp2
NA18955.hp2
NA18957.hp2
NA18959.hp2
NA18960.hp2
NA18965.hp2
NA18967.hp1
NA18970.hp1
NA18991.hp2
NA19004.hp2
NA19007.hp1
NA19030.hp2
NA19060.hp2
NA19064.hp1
NA19066.hp2
NA19074.hp2
NA19079.hp2
NA19084.hp1
NA19085.hp2
NA19086.hp1
NA19091.hp2
NA19240.hp1
NA20129.hp1
NA20905.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1892+5464G>A
c.1892+5464G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471289
chr4:53471293 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0017g0123
a0001c0001t0017g0123
 1 HG03486.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1892+5460C>G
c.1892+5460C>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471293
chr4:53471295 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0017g0123
a0001c0001t0017g0123
 1 HG03486.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1892+5458C>T
c.1892+5458C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471295
chr4:53471347 G
G
 T
T
 9 a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0065
a0001c0001t0003g0187
others(6): Show 
a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0065
a0001c0001t0003g0187
a0001c0001t0003g0200
a0001c0001t0003g0278
a0001c0001t0003g0284
a0001c0001t0003g0303
a0001c0001t0003g0304
a0001c0001t0003g0305
 9 HG02074.hp1
NA18747.hp2
NA18948.hp1
others(6): Show 
HG02074.hp1
NA18747.hp2
NA18948.hp1
NA18959.hp1
NA18963.hp2
NA18967.hp2
NA18990.hp1
NA19004.hp1
NA19055.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1892+5406C>A
c.1892+5406C>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471347
chr4:53471409 A
A
 G
G
 70 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0010
a0001c0001t0002g0015
others(67): Show 
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0010
a0001c0001t0002g0015
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0028
a0001c0001t0002g0029
a0001c0001t0002g0046
a0001c0001t0002g0048
a0001c0001t0002g0051
a0001c0001t0002g0066
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a0001c0001t0002g0068
a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0072
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HG00597.hp1
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c.1892+5344T>C
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T
 C
C
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a0001c0001t0002g0220
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HG02109.hp1
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c.1892+5331A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471422
chr4:53471525 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0005g0314
a0001c0001t0005g0314
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HG02300.hp1
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c.1892+5228C>T
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A
 T
T
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NA18940.hp2
NA18945.hp2
NA18995.hp2
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c.1892+5194T>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471559
chr4:53471733 A
A
 C
C
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a0001c0001t0021g0217
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NA19030.hp1
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c.1892+5020T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471733
chr4:53471794 C
C
 G
G
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a0001c0001t0003g0203
a0001c0001t0003g0210
a0001c0001t0003g0098
a0001c0001t0003g0203
a0001c0001t0003g0210
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NA18968.hp1
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NA18953.hp1
NA18968.hp1
NA19057.hp2
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c.1892+4959G>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53471794
chr4:53472122 C
C
 T
T
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a0001c0001t0004g0075
a0001c0001t0004g0083
a0001c0001t0004g0074
a0001c0001t0004g0075
a0001c0001t0004g0083
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HG01516.hp1
HG01074.hp2
HG01099.hp2
HG01516.hp1
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c.1892+4631G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53472122
chr4:53472152 T
T
 G
G
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a0001c0001t0005g0151
a0001c0001t0005g0135
a0001c0001t0005g0151
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HG02145.hp1
HG01255.hp2
HG02145.hp1
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c.1892+4601A>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53472152
chr4:53472239 A
A
 C
C
 55 a0001c0001t0002g0003
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a0001c0001t0002g0146
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a0001c0001t0002g0154
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a0001c0001t0002g0183
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a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
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 56 HG00558.hp1
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others(53): Show 
HG00558.hp1
HG00597.hp1
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HG01192.hp1
HG02015.hp2
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NA19086.hp1
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NA19240.hp1
NA20129.hp1
NA20905.hp1
NA21309.hp1
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c.1892+4514T>G
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chr4:53472250 T
T
 C
C
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a0001c0001t0012g0226
a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
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HG02630.hp1
HG02258.hp1
HG02630.hp1
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c.1892+4503A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53472250
chr4:53472253 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
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HG02630.hp1
HG02258.hp1
HG02630.hp1
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c.1892+4500A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53472253
chr4:53472254 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
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HG02630.hp1
HG02258.hp1
HG02630.hp1
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c.1892+4499C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53472254
chr4:53472258 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
a0001c0001t0012g0222
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 2 HG02258.hp1
HG02630.hp1
HG02258.hp1
HG02630.hp1
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c.1892+4495T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53472258
chr4:53472324 C
C
 G
G
 70 a0001c0001t0002g0003
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a0001c0001t0002g0068
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a0001c0001t0002g0072
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a0001c0001t0002g0093
a0001c0001t0002g0096
a0001c0001t0002g0099
a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0117
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C
 T
T
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c.1892+4368G>A
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G
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NA19030.hp1
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c.1892+4246T>C
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 C
C
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c.1892+4199T>G
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T
 TCAA
TCAA
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CAACAACAAAAA
 C
C
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a0001c0001t0016g0016
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HG02055.hp1
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chr4:53472682 C
C
 A
A
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HG01071.hp1
HG01175.hp2
HG03017.hp2
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c.1892+4071G>T
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chr4:53472682 C
C
 CA
CA
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HG00423.hp2
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c.1892+4070dupT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53472682
chr4:53472682 C
C
 CAA
CAA
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NA18997.hp1
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others(6): Show 
c.1892+4069_1892+4070dupTT
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 C
C
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a0001c0001t0017g0123
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HG03486.hp2
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others(15): Show 
c.1892+4060_1892+4070delTTTTTTTTGTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53472682
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AC
 A
A
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HG00140.hp2
HG00558.hp1
HG00597.hp1
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HG01975.hp2
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HG02056.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.1892+4068delG
c.1892+4068delG
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53472684
chr4:53472685 C
C
 A
A
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c.1892+4068G>T
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CA
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C
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c.1892+4065T>G
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A
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C
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HG02486.hp1
NA19062.hp2
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c.1892+4062T>G
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chr4:53472698 AAC
AAC
 A
A
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A
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NA20805.hp1
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c.1892+4053delG
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A
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G
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A
 G
G
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a0003c0002t0004g0338
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c.1892+2852T>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0004g0074
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HG01099.hp2
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A
 G
G
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a0001c0001t0003g0327
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HG02080.hp1
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c.1892+2387T>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0269
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c.1892+2304G>A
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A
 G
G
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c.1892+620G>A
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C
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CAGCTACT
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a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0010g0347
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LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53476181
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T
 C
C
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a0001c0001t0004g0040
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HG00140.hp1
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c.1892+488A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 9/10 chr4 53476265
chr4:53476491 G
G
 T
T
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c.1892+262C>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0005g0024
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HG02135.hp1
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c.1664-33A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 8/10 chr4 53477014
chr4:53477111 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0007g0002
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HG01168.hp1
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HG01167.hp1
HG01168.hp1
HG01169.hp1
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c.1664-130C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 8/10 chr4 53477111
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A
 G
G
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others(144): Show 
HG00140.hp2
HG00323.hp2
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HG01496.hp2
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HG01952.hp2
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HG01978.hp2
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HG02109.hp2
HG02132.hp2
HG02135.hp1
HG02135.hp2
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NA18977.hp1
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A
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T
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C
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A
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T
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T
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A
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NA19043.hp1
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T
 A
A
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TTCTA
 T
T
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C
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c.1486-1152G>A
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A
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C
 T
T
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a0001c0001t0012g0226
a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
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HG02258.hp1
HG02630.hp1
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0296
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G
 A
A
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a0001c0001t0017g0123
a0001c0001t0016g0016
a0001c0001t0017g0123
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HG02055.hp1
HG03486.hp2
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c.1485+672C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 7/10 chr4 53481048
chr4:53481191 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0089
a0001c0001t0003g0089
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chr4:53481340 G
G
 A
A
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a0001c0001t0003g0105
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HG01074.hp1
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c.1485+380C>T
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chr4:53481549 C
C
 T
T
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a0001c0001t0005g0162
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HG02451.hp1
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c.1485+171G>A
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chr4:53481585 G
G
 A
A
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a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
a0001c0001t0004g0337
a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
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HG02486.hp1
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HG02258.hp1
HG02486.hp1
HG02630.hp1
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c.1485+135C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 7/10 chr4 53481585
chr4:53482015 C
C
 T
T
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a0001c0001t0003g0264
a0001c0001t0003g0193
a0001c0001t0003g0264
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NA18942.hp1
HG00544.hp1
NA18942.hp1
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c.1351-161G>A
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chr4:53482051 C
C
 A
A
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HG00423.hp2
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NA19086.hp2
NA19091.hp2
NA19240.hp1
NA20129.hp1
NA20905.hp1
NA21309.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1351-197G>T
c.1351-197G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53482051
chr4:53482272 G
G
 A
A
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a0001c0001t0017g0123
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a0001c0001t0017g0123
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HG03486.hp2
HG02055.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1351-418C>T
c.1351-418C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53482272
chr4:53482293 C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0004g0337
a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
a0001c0001t0004g0337
a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
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HG02486.hp1
HG02630.hp1
HG02258.hp1
HG02486.hp1
HG02630.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1351-439G>A
c.1351-439G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53482293
chr4:53482600 G
G
 C
C
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c.1351-1283G>C
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T
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NA20905.hp2
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A
 G
G
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a0001c0014t0019g0157
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NA20129.hp2
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c.1351-1532T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53483386
chr4:53483427 T
T
 C
C
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G
 C
C
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a0001c0001t0004g0108
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HG02717.hp1
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T
 A
A
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c.1351-1630A>T
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C
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C
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c.1351-1981A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0009g0124
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HG03579.hp1
NA21309.hp2
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chr4:53485271 T
T
 A
A
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a0001c0001t0003g0190
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NA18984.hp1
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c.1351-3417A>T
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chr4:53485299 A
A
 G
G
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a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
a0001c0001t0004g0337
a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
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HG02630.hp1
HG02258.hp1
HG02486.hp1
HG02630.hp1
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c.1351-3445T>C
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chr4:53485300 T
T
 C
C
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a0001c0001t0003g0187
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NA19055.hp2
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c.1351-3446A>G
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C
 T
T
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c.1351-3508G>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0002g0295
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HG03927.hp2
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c.1351-3660A>G
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chr4:53485520 A
A
 G
G
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C
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A
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T
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c.1351-4514A>G
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C
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T
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T
 C
C
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A
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A
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A
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A
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A
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c.1350+6336A>G
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C
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a0001c0001t0002g0324
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c.1350+6042C>G
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C
 G
G
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c.1350+6034G>C
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C
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T
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NA21309.hp2
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c.1350+5883dupT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53490139
chr4:53490246 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0103
a0001c0001t0003g0103
 1 HG02074.hp2
HG02074.hp2
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c.1350+5777T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53490246
chr4:53490385 T
T
 C
C
 8 a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
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others(5): Show 
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a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0149
a0001c0001t0004g0150
a0001c0001t0004g0289
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a0003c0002t0004g0339
 8 HG02723.hp2
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others(5): Show 
HG02723.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG02895.hp1
HG02897.hp2
HG03098.hp1
HG03225.hp2
HG03540.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1350+5638A>G
c.1350+5638A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53490385
chr4:53490474 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0021g0217
a0001c0001t0021g0217
 1 NA19030.hp1
NA19030.hp1
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c.1350+5549T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53490474
chr4:53490521 G
G
 GAGTA
GAGTA
 55 a0001c0001t0003g0022
a0001c0001t0003g0027
a0001c0001t0003g0043
others(52): Show 
a0001c0001t0003g0022
a0001c0001t0003g0027
a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0045
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a0001c0001t0011g0006
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a0007c0012t0003g0011
 55 HG00323.hp1
HG00423.hp2
HG00544.hp1
others(52): Show 
HG00323.hp1
HG00423.hp2
HG00544.hp1
HG00621.hp2
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HG01978.hp1
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NA18942.hp1
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NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA18973.hp2
NA18984.hp1
NA18990.hp1
NA18991.hp1
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NA19086.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1350+5498_1350+550
others(8): Show 
c.1350+5498_1350+5501dupTACT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53490521
chr4:53490547 T
T
 C
C
 3 a0001c0001t0004g0337
a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
a0001c0001t0004g0337
a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0012g0226
 3 HG02258.hp1
HG02486.hp1
HG02630.hp1
HG02258.hp1
HG02486.hp1
HG02630.hp1
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c.1350+5476A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53490547
chr4:53490895 T
T
 C
C
 55 a0001c0001t0003g0022
a0001c0001t0003g0027
a0001c0001t0003g0043
others(52): Show 
a0001c0001t0003g0022
a0001c0001t0003g0027
a0001c0001t0003g0043
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a0001c0001t0003g0060
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a0001c0001t0003g0210
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a0001c0001t0003g0304
a0001c0001t0003g0305
a0001c0001t0003g0306
a0001c0001t0003g0327
a0001c0001t0011g0006
a0001c0001t0011g0007
a0007c0012t0003g0011
 55 HG00323.hp1
HG00423.hp2
HG00544.hp1
others(52): Show 
HG00323.hp1
HG00423.hp2
HG00544.hp1
HG00621.hp2
HG00673.hp2
HG00741.hp1
HG01070.hp2
HG01071.hp1
HG01074.hp1
HG01175.hp2
HG01256.hp2
HG01934.hp1
HG01975.hp1
HG01978.hp1
HG02004.hp1
HG02015.hp1
HG02056.hp2
HG02074.hp1
HG02074.hp2
HG02080.hp1
HG02129.hp2
HG02132.hp1
HG02698.hp2
HG03017.hp2
HG03492.hp1
HG03654.hp1
HG03669.hp1
HG03688.hp1
HG03831.hp2
HG04199.hp2
HG04204.hp1
NA18747.hp2
NA18942.hp1
NA18945.hp1
NA18948.hp1
NA18948.hp2
NA18953.hp1
NA18955.hp1
NA18959.hp1
NA18963.hp2
NA18966.hp1
NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA18973.hp2
NA18984.hp1
NA18990.hp1
NA18991.hp1
NA18997.hp1
NA19004.hp1
NA19055.hp1
NA19055.hp2
NA19057.hp2
NA19063.hp1
NA19086.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1350+5128A>G
c.1350+5128A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53490895
chr4:53490932 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0021g0217
a0001c0001t0021g0217
 1 NA19030.hp1
NA19030.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1350+5091C>A
c.1350+5091C>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53490932
chr4:53490948 A
A
 G
G
 11 a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0196
a0001c0001t0002g0197
others(8): Show 
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0196
a0001c0001t0002g0197
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T
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a0001c0001t0001g0032
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 A
A
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others(179): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
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C
 T
T
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a0001c0001t0003g0284
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NA18747.hp2
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c.1350+4831G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53491192
chr4:53491239 T
T
 C
C
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a0001c0001t0006g0240
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HG02486.hp2
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c.1350+4784A>G
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 G
G
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 28 HG01358.hp2
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others(25): Show 
HG01358.hp2
HG01884.hp1
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A
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a0001c0001t0003g0205
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HG00741.hp1
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T
 C
C
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G
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G
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C
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a0001c0001t0016g0016
a0001c0001t0017g0123
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A
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G
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chr4:53491602 A
A
 C
C
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NA18969.hp2
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c.1350+4421T>G
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chr4:53491622 C
C
 A
A
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c.1350+4401G>T
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T
 G
G
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c.1350+4397A>C
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C
 CT
CT
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c.1350+4219A>C
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NA21309.hp2
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c.1350+4214C>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53491809
chr4:53491936 C
C
 T
T
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a0001c0001t0004g0134
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a0001c0001t0004g0149
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HG02818.hp1
HG02886.hp1
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c.1350+4087G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53491936
chr4:53492007 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0013
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HG01109.hp1
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c.1350+4016C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492007
chr4:53492294 G
G
 A
A
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a0001c0001t0005g0241
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NA19070.hp2
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c.1350+3729C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492294
chr4:53492334 G
G
 A
A
 47 a0001c0001t0004g0001
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NA21309.hp2
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c.1350+3689C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492334
chr4:53492440 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0003g0103
a0001c0001t0003g0103
 1 HG02074.hp2
HG02074.hp2
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c.1350+3583C>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492440
chr4:53492460 G
G
 A
A
 11 a0001c0001t0002g0017
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others(8): Show 
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a0001c0001t0002g0196
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others(8): Show 
HG02109.hp1
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HG02897.hp1
HG03041.hp1
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c.1350+3563C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492460
chr4:53492481 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0180
a0001c0001t0003g0180
 1 HG00323.hp1
HG00323.hp1
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c.1350+3542A>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492481
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T
 TGA
TGA
 38 a0001c0001t0003g0022
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others(35): Show 
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 38 HG00323.hp1
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others(35): Show 
HG00323.hp1
HG00423.hp2
HG00621.hp2
HG00741.hp1
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HG01934.hp1
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HG04204.hp1
NA18747.hp2
NA18945.hp1
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NA18955.hp1
NA18959.hp1
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NA18967.hp2
NA18973.hp2
NA18990.hp1
NA19004.hp1
NA19063.hp1
NA19086.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1350+3515_1350+351
others(6): Show 
c.1350+3515_1350+3516dupTC
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492506
chr4:53492506 T
T
 TGAGA
TGAGA
 31 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0010
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others(28): Show 
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0010
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TGAGAGA
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a0001c0001t0001g0032
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T
 TGAGAGAG
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T
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TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
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 TGAGAGAG
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TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
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a0001c0001t0013g0351
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T
 TGAGAGAG
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TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
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a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0145
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HG01192.hp2
HG01884.hp2
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T
 TGAGAGAG
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a0001c0001t0001g0245
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a0001c0001t0001g0265
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HG00621.hp1
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LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492506
chr4:53492506 T
T
 TGAGAGAG
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TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
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a0001c0001t0001g0178
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a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0128
a0001c0001t0001g0178
a0001c0001t0001g0188
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HG00597.hp2
HG01243.hp2
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others(32): Show 
c.1350+3489_1350+3516dupTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TC
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492506
chr4:53492506 T
T
 TGAGAGAG
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TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
 7 a0001c0001t0001g0094
a0001c0001t0001g0126
a0001c0001t0001g0185
others(4): Show 
a0001c0001t0001g0094
a0001c0001t0001g0126
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0248
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HG01358.hp1
HG01496.hp1
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NA18747.hp1
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others(34): Show 
c.1350+3487_1350+3516dupTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTC
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492506
chr4:53492506 T
T
 TGAGAGAG
others(25): Show 
TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
 12 a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0175
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others(9): Show 
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0001g0177
a0001c0001t0001g0181
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a0001c0001t0001g0233
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a0001c0001t0001g0263
a0001c0001t0001g0270
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 12 HG00408.hp2
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others(9): Show 
HG00408.hp2
HG00558.hp2
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NA19085.hp1
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others(36): Show 
c.1350+3485_1350+3516dupTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTC
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492506
chr4:53492506 T
T
 TGAGAGAG
others(27): Show 
TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
 7 a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0176
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a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0176
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others(4): Show 
HG01071.hp2
NA18940.hp2
NA18964.hp2
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NA19074.hp1
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others(38): Show 
c.1350+3483_1350+3516dupTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTC
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492506
chr4:53492506 T
T
 TGAGAGAG
others(29): Show 
TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
 4 a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0184
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0262
a0001c0001t0001g0272
 4 HG01952.hp1
NA18612.hp1
NA18943.hp1
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HG01952.hp1
NA18612.hp1
NA18943.hp1
NA18995.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1350+3481_1350+351
others(40): Show 
c.1350+3481_1350+3516dupTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTC
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492506
chr4:53492506 T
T
 TGAGAGAG
others(31): Show 
TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
 2 a0001c0001t0001g0167
a0001c0001t0001g0307
a0001c0001t0001g0167
a0001c0001t0001g0307
 2 HG01978.hp2
NA19079.hp1
HG01978.hp2
NA19079.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1350+3516_1350+351
others(42): Show 
c.1350+3516_1350+3517insTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTCTC
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492506
chr4:53492506 T
T
 TGAGAGAG
others(18): Show 
TGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGA
 1 a0002c0003t0001g0286
a0002c0003t0001g0286
 1 HG02523.hp2
HG02523.hp2
 intron_variant MODIFIER c.1350+3516_1350+351
others(29): Show 
c.1350+3516_1350+3517insTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492506
chr4:53492544 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0248
 1 HG01358.hp1
HG01358.hp1
 intron_variant MODIFIER c.1350+3479A>T
c.1350+3479A>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53492544
chr4:53492652 A
A
 G
G
 194 a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0269
a0001c0001t0002g0003
others(191): Show 
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0269
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0010
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a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0029
a0001c0001t0002g0046
a0001c0001t0002g0048
a0001c0001t0002g0051
a0001c0001t0002g0069
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a0001c0001t0002g0093
a0001c0001t0002g0096
a0001c0001t0002g0099
a0001c0001t0002g0117
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0125
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a0001c0001t0002g0251
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T
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C
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T
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T
 A
A
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c.1350+2789A>T
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A
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T
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A
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c.1350+2627G>T
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G
 A
A
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T
 C
C
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A
 G
G
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C
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T
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a0001c0001t0010g0347
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HG02922.hp2
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c.1350+1787G>A
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T
 C
C
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 G
G
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HG02717.hp1
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A
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G
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T
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G
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CT
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NA19030.hp1
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HG03579.hp1
NA21309.hp2
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HG03688.hp2
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c.1350+474_1350+475insAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
A
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C
 T
T
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C
 A
A
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G
 A
A
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0251
a0001c0001t0002g0252
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HG00558.hp1
NA18957.hp2
NA19085.hp2
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c.1350+243C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 6/10 chr4 53495780
chr4:53495983 G
G
 A
A
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G
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a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0106
 2 HG01243.hp2
HG03139.hp2
HG01243.hp2
HG03139.hp2
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c.979-437T>C
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chr4:53496846 C
C
 T
T
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a0001c0001t0021g0217
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NA19030.hp1
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c.979-452G>A
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chr4:53496859 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0003g0098
a0001c0001t0003g0210
a0001c0001t0003g0098
a0001c0001t0003g0210
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NA18968.hp1
NA19057.hp2
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chr4:53496885 G
G
 C
C
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a0001c0001t0002g0252
a0008c0008t0002g0081
a0001c0001t0002g0251
a0001c0001t0002g0252
a0008c0008t0002g0081
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NA18957.hp2
NA19085.hp2
HG00558.hp1
NA18957.hp2
NA19085.hp2
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c.979-491C>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 5/10 chr4 53496885
chr4:53496955 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0106
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a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0012g0226
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HG02630.hp1
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HG01243.hp2
HG02630.hp1
HG03139.hp2
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c.979-561C>T
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G
 A
A
 51 a0001c0001t0001g0139
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c.979-620C>T
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A
 G
G
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others(182): Show 
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HG00323.hp1
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c.978+971C>G
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chr4:53497822 C
C
 T
T
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a0001c0001t0004g0134
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c.978+819G>A
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G
 C
C
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a0001c0001t0004g0149
a0001c0001t0004g0150
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others(8): Show 
HG02258.hp1
HG02486.hp1
HG02630.hp1
HG02723.hp2
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c.978+679C>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0110
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NA18943.hp1
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c.978+481G>A
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T
 C
C
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others(42): Show 
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a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0068
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others(42): Show 
HG00323.hp2
HG00408.hp1
HG01109.hp2
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NA18995.hp1
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NA19083.hp1
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NA19087.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.978+414A>G
c.978+414A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 5/10 chr4 53498227
chr4:53498350 T
T
 C
C
 55 a0001c0001t0003g0022
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others(52): Show 
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a0001c0001t0003g0027
a0001c0001t0003g0043
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a0001c0001t0003g0060
a0001c0001t0003g0062
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 55 HG00323.hp1
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HG00544.hp1
others(52): Show 
HG00323.hp1
HG00423.hp2
HG00544.hp1
HG00621.hp2
HG00673.hp2
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HG01070.hp2
HG01071.hp1
HG01074.hp1
HG01175.hp2
HG01256.hp2
HG01934.hp1
HG01975.hp1
HG01978.hp1
HG02004.hp1
HG02015.hp1
HG02056.hp2
HG02074.hp1
HG02074.hp2
HG02080.hp1
HG02129.hp2
HG02132.hp1
HG02698.hp2
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NA18942.hp1
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NA18948.hp2
NA18953.hp1
NA18955.hp1
NA18959.hp1
NA18963.hp2
NA18966.hp1
NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA18973.hp2
NA18984.hp1
NA18990.hp1
NA18991.hp1
NA18997.hp1
NA19004.hp1
NA19055.hp1
NA19055.hp2
NA19057.hp2
NA19063.hp1
NA19086.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.978+291A>G
c.978+291A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 5/10 chr4 53498350
chr4:53498413 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0003g0090
a0001c0001t0003g0091
a0001c0001t0003g0092
a0001c0001t0003g0090
a0001c0001t0003g0091
a0001c0001t0003g0092
 3 HG01070.hp2
HG01071.hp1
HG01175.hp2
HG01070.hp2
HG01071.hp1
HG01175.hp2
 intron_variant MODIFIER c.978+228T>C
c.978+228T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 5/10 chr4 53498413
chr4:53498506 T
T
 C
C
 47 a0001c0001t0004g0001
a0001c0001t0004g0023
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others(44): Show 
a0001c0001t0004g0001
a0001c0001t0004g0023
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a0001c0001t0004g0041
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a0001c0001t0004g0280
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a0001c0001t0004g0283
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 48 HG00140.hp1
HG00423.hp1
HG00642.hp1
others(45): Show 
HG00140.hp1
HG00423.hp1
HG00642.hp1
HG00738.hp2
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HG01099.hp2
HG01167.hp2
HG01169.hp2
HG01257.hp2
HG01258.hp2
HG01346.hp1
HG01433.hp1
HG01515.hp1
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HG02004.hp2
HG02080.hp2
HG02083.hp1
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HG02717.hp1
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c.978+135A>G
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C
 T
T
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HG02622.hp2
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c.978+110G>A
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C
 T
T
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HG00597.hp1
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T
 C
C
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a0001c0001t0012g0226
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c.776-364A>G
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C
 T
T
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c.776-489G>A
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G
 A
A
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HG03654.hp1
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c.776-552C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53499395
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G
 A
A
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HG00423.hp1
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HG03579.hp1
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NA18612.hp2
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NA18940.hp1
NA18941.hp2
NA18953.hp2
NA18956.hp2
NA18963.hp1
NA18969.hp1
NA18970.hp2
NA18975.hp1
NA18977.hp2
NA18984.hp2
NA18998.hp2
NA19005.hp1
NA19030.hp1
NA19060.hp1
NA19063.hp2
NA19064.hp2
NA19077.hp1
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NA21309.hp2
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c.776-788C>T
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C
 T
T
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 T
T
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c.776-2461C>A
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T
 C
C
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c.776-2462A>G
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chr4:53501305 T
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G
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0051
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chr4:53501309 G
G
 T
T
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c.776-2466C>A
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G
 A
A
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c.776-2802C>T
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T
 C
C
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 55 HG00323.hp1
HG00423.hp2
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others(52): Show 
HG00323.hp1
HG00423.hp2
HG00544.hp1
HG00621.hp2
HG00673.hp2
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HG03654.hp1
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NA18747.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.776-3220A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53502063
chr4:53502071 G
G
 T
T
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a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0106
 2 HG01243.hp2
HG03139.hp2
HG01243.hp2
HG03139.hp2
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c.776-3228C>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53502071
chr4:53502122 A
A
 ATAATAAT
others(6058): Show 
ATAATAATAATTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAT
TATACTCTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACATTGTGCAGGTTAGTTACAT
ATGTATACATGTGCCATGCTGGTGCGCTGCACCCACTAATGTGTCATCTA
GCATTAGGTATATCTCCCAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCGACCCCAC
CACAGTCCCCAGAGTGTGATATTCCCCTTCCTGTGTCCATGTGATCTCAT
TGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAATATGCGGTGTTTGGTTTTTTGTT
CTTGCGATAGTTTACTGAGAATGATGGTTTCCAATTTCATCCATGTCCCT
ACAAAGGATATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGT
GTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGG
GTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAATAAACATACGT
GTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATACTCATTTGGGTATATACC
CAGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCTGA
GGAATCGCCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCAC
CAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCGCATCCTCTCCAGCACCTGTT
GTTTCCTGACTTTTTAATGATTGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATC
TCATAGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCAT
TTCTTCATGTGTTTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCT
GTTCATGTCCTTCACCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGT
AAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGAT
GAGTAGGTTGCGAAAATTTTCTCCCATGTTGTAGGTTGCCTGTTCACTCT
GATGGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCC
ATTTGTCAATTTTGTCTTTTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTGGACATG
AAGTCCTTGCCCACGCCTATGTCCTGAATGGTAATGCCTAGGTTTTCTTC
TAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTTTAACGTTTAAATCTTTAATCCATCTTG
AATTGATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGATCCAGTTTCAGCTTTCTA
CATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTT
TCCCCATTGCTTGTTTTTCTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATAGTTGTAGG
TATGCGGCATTATTTCTGAGGGCTCTGTTCTGTTCCATTGATCTATATCT
CTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTAGTA
TAGTTTGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCCAGCTTTGTTCTTTTGGCTTA
GGATTGACTTGGCAATGCGGGCTCTTTTTTGGTTCCATATGAACTTTAAA
GTAGTTTTTTCCAATTCTGTGAAGAAAGTCATTGGTAGCTTGATGGGGAT
GGCATTGAATCTGTAAATTACCTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACGATAT
TGATTCTTCCTACCCATGAGCATGGAATGTTCTTCCATTTGTTTGTGTCC
TCTTTTATTTCCTTGAGCAGTGGTTTGTAGTTCTCCTTGAAGAGGTCCTT
CACATCCCTTGTAAGTTGGATTCCTAGGTATTTTATTCTCTTTGAAGCAA
TTACGAATGGGAGTTCACCCATGATTTGGCTCTCTGTTTGTCTGTTGTTG
GTGTATAAGAATGCTTGTGATTTTTGTACATTGATTTTGTATCCTGAGAC
TTTGCTGAAGTTGCTTATCAGCTTAAGGAGATTTTGGGCTGAGACGATGG
GGTTTTCTAGATATACAATCATGTCGTCTGCAAACAGGGACAATTTGACT
TCCTCTTTTCCTAATTGAATACCCTTTATTTCCTTCTCCTGCCTGATTGC
CCTGGCCAGAACTTCCAACACTATGTTGAATAGGAGCGGTGAGAGAGGGC
ATCCCTGTCTTGTGCCGGTTTTCAAAGGGAATGCTTCCAGTTTTTGCCCA
TTCAGTATGATATTGGCTGTGGGTTTGTCATAGATAGCTCTTATTATTTT
GAAATACGTCCCATCAATACCTAATTTATTGAGAGTTTTTAGCATGAAGG
GTTGTTGAATTTTGTCAAAGGCTTTTTCTGCATCTATTGAGATAATCATG
TGGTTTTTGTCTTTGGCTCTGTTTATATGCTGGATTACATTTATTGATTT
GCGTATATTGAACCAGCCTTGCATCCCAGGGATGAAGCCCACTTGATCAT
GGTGGATAAGCTTTTTGATGTGCAACTGGATTCGGTTTGCCAGTATTTTA
TTGAGGATTTTTGCATCAATGTTCATCAAGGATATTGGTCTAAAATTCTC
TTTTTTGGTTGTGTCTCTGCCCGGCTTTGGTATCAGAATGATGCTGGCCT
CATAAAATGAGTTAGGGAGGATTCCCTCTTTTTCTATTGATTGGAATAGT
TTCAGAAGGAATGGTACCAGTTCCTCCATGTACCTCTGGTAGAATTCGGC
TGTGAATCCATCTGGTCCTGGACTCTTTTTGGTTGGTAAACTATTGATTA
TTGCCACAATTTCAGAGCCTGTTATTGGTCTATTCAGAGATTCAACTTCT
TCCTGGTTTAGTCTTGGGAGAGTGTATGTGTCGAGGAATGTATCCATTTC
TTCTAGATTTTCTAGTTTATTTGCGTAGAGGTGTTTGTAGTATTCTCTGA
TGGTAGTTTGTATTTCTGTGGGATCGGTGGTGATATCCCCTTTATCATTT
TTTATTGTGTCTATTTGATTCTTCTCTCTTTTTTTCTTTATTAGTCTTGC
TAGCGGTCTATCAATTTTGTTGATCCTTTCAAAAAACCAGCTCCTGGATT
CATTGATTTTTTGAAGGGTTTTTTGTGTCTCTATTTCCTTCAGTTCTGCT
CTGATTTTAGTTATTTCTTGCCTTCTGCTAGCTTTTGAATGTGTTTGCTC
TTGCTTTTCTAGTTCTTTTAATTGTGATGTTAGGGTGTCAATTTTGGATC
TTTCCTGCTTTCTCTTGTAGGCATTTAGTGCTATAAATTTCCCTCTACAC
ACTGCTTTGAATGCGTCCCAGAGATTCTGGTATGTGGTGTCTTTGTTCTC
GTTGGTTTCAAAGAACATCTTTATTTCTGCCTTCATTTCGTTATGTACCC
AGTAGTCATTCAGGAGCAGGTTGTTCAGTTTCCATGTAGTTGAGCGGCTT
TGAGTGAGATTCTTAATCCTGAGTTCTAGTTTGATTGCACTGTGGTCTGA
GAGATAGTTTGTTATAATTTCTGTTCTTTTACATTTGCTGAGGAGAGCTT
TACTTCCAACTATGTGGTCAATTTTGGAATAGGTGTGGTGTGGTGCTGAA
AAAAAGGTATATTCTGTTGATTTGGGGTGGAGAGTTCTGTAGATGTCTAT
TAGGTCTGCTTGGTGCAGAGCTGAGTTCAATTCCTGGGTATCCTTGTTGA
CTTTCTGTCTCGTTGATCTGTCTAATGTTGACAGTGGGGTGTTAAAGTCT
CCCATTATTAATGTGTGGGAGTCTAAGTCTCTTTGTAGGTCACTCAGGAC
TTGCTTTATGAATCTGGGTGCTCCTGTATTGGGTGCATAAATATTTAGGA
TAGTTAGCTCCTCTTGTTGAATTGATCCCTTTACCATTATGTAATGGCCT
TCTTTGTCTCTTTTGATCTTTGTTGGTTTAAAGTCTGTTTTATCAGAGAC
TAGGATTGCAACCCCTGCCTTTTTTTGTTTTCCATTGGCTTGGTAGATCT
TCCTCCATCCTTTTATTTTGAGCCTATGTGTGTCTCTGCACGTGAGATGG
GTTTCCTGAATACAGCACACTGATGGGTCTTGACTCTTTATCCAACTTGC
CAGTCTGTGTCTTTTAATTGCAGAATTTAGTCCATTTATATTTAAAGTTA
ATATTGTTATGTGTGAATTTGATCCTGTCATTATGATGTTAGCTGGTGAT
TTTGCTCATTAGTTGATGCAGTTTCTTCCTAGTCTCAATGGTCTTTACAT
TTTGGCATGATTTTGCAGCGGCTGGTACCGGTTGTTCCTTTCCATGTTTA
GCGCTTCCTTCAGGAGCTCTTTTAGGGCAGGCCTGGTGGTGACAAAATCT
CTCAACATTTGCTTGTCTATAAAGTATTTTATTTCTCCTTCACTTATGAA
GCTTAGTTTGGCTGGATATGAAATTCTGGGTTGAAAATTCTTTTCTTTAA
GAATGTTGAATATTGGCCCCCACTCTCTTCTGGCTTGTAGGGTTTCTGCC
GAGAGATCCACTGTTAGTCTGATGGGCTTTCCTTTGAGGGTAACCCGACC
TTTCTCTCTGGCTGCCCTTAACATTTTTTCCTTCATTTCAACTTTGGTGA
ATCTGACAATTATGTGTCTTGGAGTTGCTCTTCTCGAGGAGTATCTTTGT
GGCGTTCTCTGTATTTCCTGAATCTGAACGTTGGCCTGCCTTGCTAGATT
GGGGAAGTTCTCCTGGATAATATCCTGCAGAGTGTTTTCCAACTTGGTTC
CATTCTCCACATCACTTTCAGGTACACCAATCAGACGTAGATTTGGTCTT
TTCACATAGTCCCATATTTCTTGGAGGCTTTGCTCATTTCTTTTTATTCT
TTTTTCTCTAAACTTCCCTTCTCGCTTCATTTCATTCATTTCATCTTCCA
TTGCTGATACCCTTTCTTCCAGTTGATCGCATCGGCTCCTGAGGCTTCTG
CATTCTTCACGTAGTTCTCGAGCCTTGGTTTTCAGCTCCATCAGCTCCTT
TAAGCACTTCTCTGTATTGGTTATTCTAGTTATACATTCTTCTAAATTTT
TTTCAAAGTTTTCAACTTCTTTGCCTTTGGTTTGAATGTCCTCCCGTAGC
TCAGAGTAATTTGATCGTCTGAAGCCTTCTTCTCTCAGCTCGTCAAAATC
ATTCTCCATCCAGCTTTGTTCTGTTGCTGGTGAGGAACTGCGTTCCTTTG
GAGGAGGAGAGGCGCTCTGCGTTTTAGAGTTTCCAGTTTTTCTGTTCTGT
TTTTTCCCCATCTTTGTGGTTTTATCTACTTTTGGTCTTTGATGATGGTG
ATGTACAGATGGGTTTTCGGTGTAGATGTCCTTTCTGGTTGTTAGTTTTC
CTTCTAACAGACAGGACCCTCAGCTGCAGGTCTGTTGGAATACCCTGCCG
TGTGAGGTGTCAGTGTGCCCCTGCTGGGGGGTGCCTCCCAGTTAGGCTGC
TCGGGGGTCAGGGGTCAGGGACCCACTTGAGGAGGCAGTCTGCCCGTTCT
CAGATCTCCAGCTGCGTGCTGGGAGAACCACTGCTCTCTTCAAAGCTGTC
AGACAGGGACACTTAAGTCTGCAGAGGTTACTGCTGCCTTTTTGTTTGTC
TGTGCCCTGCCCCCAGAGGTGGAGCCTACAGAGGCAGGCAGGCCTCCTTG
AGCTGTGGTGGGCTCCACCCAGTTCGAGCTTCCCGGCTGCTTTGTTTACC
TAAGCAAGCCTGGGCAATGGCGGGCGCCCCTCCCCCAGCCTCGTTGCCGC
CTTGCAGTTTGATCTCAGACTGCTGTGCTAGCAATCAGCGAGATTCCGTG
GGCGTAGGACCCTCCGAGCCAGGTGTGGGATATAGTCTCGTGGTGCGCCG
TTTCTTAAGCCGGTCTGAAAAGCGCAATATTCGGGTGGGAGTGACCCGAT
TTTCCAGGTGCGACCGTCACCCCTTTCTTTGACTCAGAAAGGGAACTCCC
TGACCCCTTGCGCTTCCCAGGTGAGGCAATGCCTCGCCCTGCTTCGGCTC
GCGCACGGTGCGCACACACACTGGCCTGCGCCCACTGTCTGGCACTCCCT
AGTGAGATGAACCCGGTACCTCAGATGGAAATGCAGAAATCACCGTCTTC
TGCGTCGCTCACGCTGGGAGCTGTAGACCGGAGCTGTTCCTATTCGGCCA
TCTTGGCTCCTCCCCC
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AGACCAAAAGTAGATAAAACCACAAAGATGGGGAAAAAACAGAACAGAAA
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ACAAGCCAGAAGAGAGTGGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGA
ATTTTCAACCCAGAATTTCATATCCAGCCAAACTAAGCTTCATAAGTGAA
GGAGAAATAAAATACTTTATAGACAAGCAAATGTTGAGAGATTTTGTCAC
CACCAGGCCTGCCCTAAAAGAGCTCCTGAAGGAAGCGCTAAACATGGAAA
GGAACAACCGGTACCAGCCGCTGCAAAATCATGCCAAAATGTAAAGACCA
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CATCATAATGACAGGATCAAATTCACACATAACAATATTAACTTTAAATA
TAAATGGACTAAATTCTGCAATTAAAAGACACAGACTGGCAAGTTGGATA
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CAGAGACACACATAGGCTCAAAATAAAAGGATGGAGGAAGATCTACCAAG
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ACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAGAGACAAAGAAGGCCATTACAT
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ATGCACCCAATACAGGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTCCTGAGTGAC
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CCCAGGAATTGAACTCAGCTCTGCACCAAGCAGACCTAATAGACATCTAC
AGAACTCTCCACCCCAAATCAACAGAATATACCTTTTTTTCAGCACCACA
CCACACCTATTCCAAAATTGACCACATAGTTGGAAGTAAAGCTCTCCTCA
GCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATCTCTCAGACCACAGT
GCAATCAAACTAGAACTCAGGATTAAGAATCTCACTCAAAGCCGCTCAAC
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AAATGAAGGCAGAAATAAAGATGTTCTTTGAAACCAACGAGAACAAAGAC
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GAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAAAGAGGAAGTCAAATTGTC
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AACAGAGAGCCAAATCATGGGTGAACTCCCATTCGTAATTGCTTCAAAGA
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ATGGAACCAAAAAAGAGCCCGCATTGCCAAGTCAATCCTAAGCCAAAAGA
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ACAGTAACCAAAACAGCATGGTACTGGTACCAAAACAGAGATATAGATCA
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AAGATTTAAACGTTAAACCTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTA
GGCATTACCATTCAGGACATAGGCGTGGGCAAGGACTTCATGTCCAAAAC
ACCAAAAGCAATGGCAACAAAAGACAAAATTGACAAATGGGATCTAATTA
AACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTACCATCAGAGTGAACAGG
CAACCTACAACATGGGAGAAAATTTTCGCAACCTACTCATCTGACAAAGG
GCTAATATCCAGAATCTACAATGAACTCAAACAAATTTACAAGAAAAAAA
CAAACAACCCCATCAAAAAGTGGGTGAAGGACATGAACAGACACTTCTCA
AAAGAAGACATTTATGCAGCCAAAAAACACATGAAGAAATGCTCATCATC
ACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCACTATGAGATATCATCTCA
CACCAGTTAGAATGGCAATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACAGGTGCTGG
AGAGGATGCGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAA
ACTAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAG
AACTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCA
AATGAGTATAAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGTTTAT
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TATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATATCCTTTGTAGGGACATGGAT
GAAATTGGAAACCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCA
AACACCGCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACAT
GGACACAGGAAGGGGAATATCACACTCTGGGGACTGTGGTGGGGTCGGGG
GAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAGATGACACAT
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TTTTTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTATACTCTAAGT
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TTATAGCAGCATGATTTATACTCATTTGGGTATATACCCAGTAATGGGAT
GGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCTGAGGAATCGCCACA
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AAAATTTTCTCCCATGTTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGGTAGTTTC
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GGTTTTAGGTTTAACGTTTAAATCTTTAATCCATCTTGAATTGATTTTTG
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CAGTTTTCCCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTT
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AATTCTGTGAAGAAAGTCATTGGTAGCTTGATGGGGATGGCATTGAATCT
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CCCATGAGCATGGAATGTTCTTCCATTTGTTTGTGTCCTCTTTTATTTCC
TTGAGCAGTGGTTTGTAGTTCTCCTTGAAGAGGTCCTTCACATCCCTTGT
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ATACAATCATGTCGTCTGCAAACAGGGACAATTTGACTTCCTCTTTTCCT
AATTGAATACCCTTTATTTCCTTCTCCTGCCTGATTGCCCTGGCCAGAAC
TTCCAACACTATGTTGAATAGGAGCGGTGAGAGAGGGCATCCCTGTCTTG
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GCATCAATGTTCATCAAGGATATTGGTCTAAAATTCTCTTTTTTGGTTGT
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TAGGGAGGATTCCCTCTTTTTCTATTGATTGGAATAGTTTCAGAAGGAAT
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CAGAGCCTGTTATTGGTCTATTCAGAGATTCAACTTCTTCCTGGTTTAGT
CTTGGGAGAGTGTATGTGTCGAGGAATGTATCCATTTCTTCTAGATTTTC
TAGTTTATTTGCGTAGAGGTGTTTGTAGTATTCTCTGATGGTAGTTTGTA
TTTCTGTGGGATCGGTGGTGATATCCCCTTTATCATTTTTTATTGTGTCT
ATTTGATTCTTCTCTCTTTTTTTCTTTATTAGTCTTGCTAGCGGTCTATC
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GAAGGGTTTTTTGTGTCTCTATTTCCTTCAGTTCTGCTCTGATTTTAGTT
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GCGTCCCAGAGATTCTGGTATGTGGTGTCTTTGTTCTCGTTGGTTTCAAA
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CGCTCTGCGTTTTAGAGTTTCCAGTTTTTCTGTTCTGTTTTTTCCCCATC
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CTCCACCCAGTTCGAGCTTCCCGGCTGCTTTGTTTACCTAAGCAAGCCTG
GGCAATGGCGGGCGCCCCTCCCCCAGCCTCGTTGCCGCCTTGCAGTTTGA
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GTCTGAAAAGCGCAATATTCGGGTGGGAGTGACCCGATTTTCCAGGTGCG
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GCAAATGTAAAAGAACAGAAATTATAACAAACTATCTCTCAGACCACAGT
GCAATCAAACTAGAACTCAGGATTAAGAATCTCACTCAAAGCCGCTCAAC
TACATGGAAACTGAACAACCTGCTCCTGAATGACTACTGGGTACATAACG
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ACCACATACCAGAATCTCTGGGACGCATTCAAAGCAGTGTGTAGAGGGAA
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ACACCCTAACATCACAATTAAAAGAACTAGAAAAGCAAGAGCAAACACAT
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GGAAATAGAGACACAAAAAACCCTTCAAAAAATCAATGAATCCAGGAGCT
GGTTTTTTGAAAGGATCAACAAAATTGATAGACCGCTAGCAAGACTAATA
AAGAAAAAAAGAGAGAAGAATCAAATAGACACAATAAAAAATGATAAAGG
GGATATCACCACCGATCCCACAGAAATACAAACTACCATCAGAGAATACT
ACAAACACCTCTACGCAAATAAACTAGAAAATCTAGAAGAAATGGATACA
TTCCTCGACACATACACTCTCCCAAGACTAAACCAGGAAGAAGTTGAATC
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TACCAACCAAAAAGAGTCCAGGACCAGATGGATTCACAGCCGAATTCTAC
CAGAGGTACATGGAGGAACTGGTACCATTCCTTCTGAAACTATTCCAATC
AATAGAAAAAGAGGGAATCCTCCCTAACTCATTTTATGAGGCCAGCATCA
TTCTGATACCAAAGCCGGGCAGAGACACAACCAAAAAAGAGAATTTTAGA
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AAACCGAATCCAGTTGCACATCAAAAAGCTTATCCACCATGATCAAGTGG
GCTTCATCCCTGGGATGCAAGGCTGGTTCAATATACGCAAATCAATAAAT
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A
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A
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HG03453.hp1
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T
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c.775+3184G>A
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T
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HG02486.hp1
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c.775+2919G>A
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G
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c.775+2807T>C
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T
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c.775+2708G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
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HG02818.hp1
HG02886.hp1
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c.775+2602G>A
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G
 A
A
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c.775+2530C>T
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0032
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HG03139.hp2
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c.775+2433G>A
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CA
 C
C
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a0001c0001t0009g0107
a0001c0001t0009g0118
a0001c0001t0009g0124
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HG03130.hp2
HG03579.hp1
NA21309.hp2
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c.775+2424delT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53504892
chr4:53504907 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0266
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HG03834.hp1
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c.775+2410G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53504907
chr4:53504961 T
T
 G
G
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a0001c0001t0001g0106
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HG01243.hp2
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c.775+2356A>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53504961
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 CT
CT
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c.775+2051dupA
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53505265
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C
 T
T
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NA19074.hp2
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c.775+2028G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53505289
chr4:53505548 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0012g0226
a0001c0001t0012g0226
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HG02630.hp1
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c.775+1769C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53505548
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G
 C
C
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others(3): Show 
a0001c0001t0003g0098
a0001c0001t0003g0203
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 6 NA18953.hp1
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others(3): Show 
NA18953.hp1
NA18968.hp1
NA18973.hp2
NA18991.hp1
NA19057.hp2
NA19086.hp2
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c.775+1700C>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0329
a0001c0001t0002g0328
a0001c0001t0002g0329
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NA19091.hp2
HG00597.hp1
NA19091.hp2
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c.775+1589C>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0212
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NA18977.hp1
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c.775+1512C>T
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chr4:53505807 G
G
 A
A
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a0012c0007t0005g0055
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HG04204.hp2
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c.775+1510C>T
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chr4:53505870 A
A
 T
T
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c.775+1447T>A
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T
 C
C
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c.775+1147A>G
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chr4:53506213 A
A
 T
T
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HG02258.hp1
HG02486.hp1
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c.775+1104T>A
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T
 A
A
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a0001c0001t0004g0163
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HG01515.hp1
HG01517.hp1
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CAT
 C
C
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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others(2): Show 
c.775+889_775+890delAT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506426
chr4:53506573 C
C
 T
T
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HG02258.hp1
HG02486.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.775+744G>A
c.775+744G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506573
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C
 A
A
 11 a0001c0001t0004g0019
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others(8): Show 
a0001c0001t0004g0019
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a0001c0001t0004g0148
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a0001c0001t0004g0150
a0001c0001t0004g0289
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a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
 11 HG02258.hp1
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others(8): Show 
HG02258.hp1
HG02486.hp1
HG02630.hp1
HG02723.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG02895.hp1
HG02897.hp2
HG03098.hp1
HG03225.hp2
HG03540.hp2
 intron_variant MODIFIER c.775+637G>T
c.775+637G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506680
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G
 A
A
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HG02258.hp1
HG02486.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.775+519C>T
c.775+519C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506798
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 T
T
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c.775+480G>A
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T
 TA
TA
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c.775+460dupT
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T
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TAAA
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c.775+458_775+460dupTTT
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TAAAAAAA
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others(38): Show 
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others(7): Show 
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T
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others(9): Show 
c.775+452_775+460dupTTTTTTTTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506856
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T
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others(10): Show 
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HG03130.hp2
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others(13): Show 
c.775+448_775+460dupTTTTTTTTTTTTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506856
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others(7): Show 
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others(14): Show 
c.775+447_775+460dupTTTTTTTTTTTTTT
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T
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c.775+445_775+460dupTTTTTTTTTTTTTTTT
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chr4:53506856 T
T
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a0001c0001t0001g0012
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a0001c0001t0001g0110
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HG01109.hp1
HG01192.hp2
NA18943.hp1
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c.775+444_775+460dupTTTTTTTTTTTTTTTTT
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T
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NA18943.hp2
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c.775+443_775+460dupTTTTTTTTTTTTTTTTTT
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T
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HG00621.hp1
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HG01070.hp1
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others(20): Show 
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T
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HG01975.hp2
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T
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HG02895.hp2
HG02683.hp1
HG02895.hp2
 intron_variant MODIFIER c.775+460_775+461ins
others(22): Show 
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HG02258.hp2
HG03209.hp2
HG03453.hp1
 intron_variant MODIFIER c.775+460_775+461ins
others(23): Show 
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T
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HG02572.hp1
HG02622.hp2
 intron_variant MODIFIER c.775+460_775+461ins
others(25): Show 
c.775+460_775+461insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
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T
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HG03453.hp2
 intron_variant MODIFIER c.775+460_775+461ins
others(26): Show 
c.775+460_775+461insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506856
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T
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others(1): Show 
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others(1): Show 
HG02071.hp1
HG03041.hp2
HG03491.hp1
NA18960.hp1
 intron_variant MODIFIER c.775+460_775+461ins
others(31): Show 
c.775+460_775+461insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506856
chr4:53506856 T
T
 TAAAAAAA
others(25): Show 
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a0001c0001t0001g0131
a0001c0001t0001g0198
a0001c0001t0001g0315
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NA18997.hp2
HG01256.hp1
HG01952.hp2
NA18997.hp2
 intron_variant MODIFIER c.775+460_775+461ins
others(32): Show 
c.775+460_775+461insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TT
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T
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others(26): Show 
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others(11): Show 
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a0001c0001t0001g0036
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others(11): Show 
HG00738.hp1
HG01257.hp1
HG01258.hp1
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others(33): Show 
c.775+460_775+461insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506856
chr4:53506856 T
T
 TAAAAAAA
others(27): Show 
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0165
a0001c0001t0001g0188
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others(1): Show 
HG01175.hp1
HG02055.hp2
HG02300.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.775+460_775+461ins
others(34): Show 
c.775+460_775+461insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506856
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T
 TAAAAAAA
others(30): Show 
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a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0049
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HG02083.hp2
HG00673.hp1
HG02083.hp2
 intron_variant MODIFIER c.775+460_775+461ins
others(37): Show 
c.775+460_775+461insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506856
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T
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others(32): Show 
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NA19087.hp2
 intron_variant MODIFIER c.775+460_775+461ins
others(39): Show 
c.775+460_775+461insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506856
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T
 TAAAAAAA
others(33): Show 
TAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
 1 a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0106
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HG01243.hp2
 intron_variant MODIFIER c.775+460_775+461ins
others(40): Show 
c.775+460_775+461insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506856
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T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0290
a0001c0001t0001g0290
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HG02809.hp1
 intron_variant MODIFIER c.775+412A>G
c.775+412A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53506905
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A
 T
T
 3 a0001c0001t0009g0107
a0001c0001t0009g0118
a0001c0001t0009g0124
a0001c0001t0009g0107
a0001c0001t0009g0118
a0001c0001t0009g0124
 3 HG03130.hp2
HG03579.hp1
NA21309.hp2
HG03130.hp2
HG03579.hp1
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.775+55T>A
c.775+55T>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 4/10 chr4 53507262
chr4:53507297 C
C
 T
T
 168 a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0269
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others(165): Show 
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a0001c0001t0001g0269
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C
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T
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a0001c0001t0002g0299
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NA18991.hp2
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C
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G
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A
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a0001c0001t0004g0164
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HG01515.hp1
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A
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A
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C
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HG03579.hp1
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A
 G
G
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c.622+79T>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0299
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NA18991.hp2
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c.622+59G>A
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 T
T
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A
 G
G
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AT
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A
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T
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C
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T
 G
G
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T
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C
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A
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A
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A
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GTA
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 GTGTGTGT
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others(16): Show 
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C
 T
T
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C
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T
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c.381-6023G>A
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A
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A
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G
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A
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A
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A
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G
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A
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C
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C
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G
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c.381-8720T>C
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A
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C
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T
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T
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G
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C
 T
T
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G
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A
 G
G
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NA18978.hp2
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 T
T
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C
 T
T
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C
 T
T
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C
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 T
T
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 TG
TG
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c.381-10819A>C
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chr4:53519084 G
G
 A
A
 1 a0001c0014t0019g0157
a0001c0014t0019g0157
 1 NA20129.hp2
NA20129.hp2
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c.381-10857C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53519084
chr4:53519127 C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0004g0138
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0004g0138
 3 HG01109.hp1
HG01192.hp2
HG03710.hp1
HG01109.hp1
HG01192.hp2
HG03710.hp1
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c.381-10900G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53519127
chr4:53519176 G
G
 A
A
 1 a0011c0010t0002g0142
a0011c0010t0002g0142
 1 HG02698.hp1
HG02698.hp1
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c.381-10949C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53519176
chr4:53519411 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0270
a0001c0001t0001g0270
 1 HG02273.hp1
HG02273.hp1
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c.381-11184C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53519411
chr4:53519438 G
G
 GT
GT
 14 a0001c0001t0002g0015
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others(11): Show 
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a0001c0001t0002g0029
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others(11): Show 
HG02055.hp1
HG02145.hp1
HG02602.hp1
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c.381-11212dupA
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53519438
chr4:53519438 GT
GT
 G
G
 39 a0001c0001t0001g0031
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others(36): Show 
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others(37): Show 
HG00140.hp2
HG00408.hp2
HG00738.hp2
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c.381-11212delA
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chr4:53519518 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0322
a0001c0001t0002g0322
 1 HG03654.hp2
HG03654.hp2
 intron_variant MODIFIER c.381-11291C>G
c.381-11291C>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53519518
chr4:53519656 A
A
 ATCTGACA
others(3): Show 
ATCTGACACAC
 333 a0001c0001t0001g0005
a0001c0001t0001g0012
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others(330): Show 
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a0001c0001t0001g0012
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C
 T
T
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a0001c0001t0003g0104
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HG03492.hp1
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chr4:53519731 C
C
 A
A
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HG02647.hp2
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A
 G
G
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c.381-11530T>C
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A
 G
G
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a0001c0001t0004g0246
a0001c0001t0004g0279
a0001c0001t0004g0280
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HG00423.hp1
NA18612.hp2
NA19088.hp2
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c.381-11534T>C
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chr4:53519853 A
A
 C
C
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0002g0276
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HG02735.hp2
HG03139.hp2
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G
 A
A
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HG00323.hp2
HG00408.hp1
HG00544.hp1
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HG01258.hp1
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HG02300.hp1
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c.381-11728C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53519955
chr4:53519982 A
A
 G
G
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a0001c0001t0005g0236
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HG03471.hp1
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c.381-11755T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53519982
chr4:53520207 C
C
 A
A
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a0001c0001t0006g0223
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HG03579.hp2
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c.381-11980G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53520207
chr4:53520458 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0165
a0001c0001t0004g0163
a0001c0001t0004g0164
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HG02055.hp2
HG01515.hp1
HG01517.hp1
HG02055.hp2
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c.381-12231A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53520458
chr4:53520496 G
G
 A
A
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 35 HG00423.hp1
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others(32): Show 
HG00423.hp1
HG00558.hp1
HG00597.hp1
HG02074.hp1
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NA18940.hp1
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NA18957.hp2
NA18959.hp2
NA18975.hp1
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NA18984.hp2
NA18990.hp1
NA18990.hp2
NA18995.hp1
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NA19005.hp1
NA19055.hp2
NA19060.hp1
NA19063.hp2
NA19064.hp1
NA19079.hp2
NA19083.hp2
NA19085.hp2
NA19088.hp2
NA19091.hp2
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c.381-12269C>T
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G
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0315
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HG01258.hp1
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LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53520544
chr4:53520573 T
T
 C
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A
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C
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HG03579.hp2
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A
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HG02970.hp1
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G
 C
C
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C
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T
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T
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C
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C
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T
 C
C
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HG01884.hp2
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C
 T
T
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c.381-13420G>A
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G
 GA
GA
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c.381-13475dupT
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G
 A
A
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a0001c0001t0003g0155
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A
 C
C
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T
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C
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A
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A
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T
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T
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A
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0296
a0001c0001t0003g0303
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 A
A
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T
 C
C
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T
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T
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A
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T
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G
 T
T
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a0001c0001t0010g0349
a0001c0001t0010g0348
a0001c0001t0010g0349
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HG02970.hp1
NA19240.hp2
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c.381-16644C>A
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C
 A
A
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c.381-16757G>T
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C
 T
T
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a0001c0001t0003g0218
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HG03017.hp2
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c.381-16757G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53524984
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C
 T
T
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a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
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HG03098.hp1
HG03540.hp2
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c.381-16865G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0012g0226
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HG02630.hp1
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c.381-16997G>A
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 C
C
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NA19240.hp2
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c.381-17043A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0171
a0001c0001t0002g0196
a0001c0001t0002g0197
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HG02258.hp2
HG02572.hp2
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c.381-17065C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53525292
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C
 T
T
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a0001c0001t0018g0287
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HG02622.hp1
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c.381-17169G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53525396
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G
 C
C
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a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0134
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HG02886.hp1
HG02647.hp2
HG02886.hp1
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c.381-17448C>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53525675
chr4:53525715 T
T
 A
A
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a0001c0001t0005g0059
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HG02976.hp1
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c.381-17488A>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53525715
chr4:53525754 T
T
 G
G
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a0007c0012t0003g0011
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HG04199.hp2
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c.381-17527A>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53525754
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C
 T
T
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c.381-17563G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53525790
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ATT
 A
A
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a0001c0001t0005g0234
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NA19079.hp1
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c.381-17770_381-17769delAA
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53525995
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T
 G
G
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a0001c0001t0006g0077
a0009c0009t0001g0078
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HG03486.hp1
HG02559.hp2
HG03486.hp1
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c.381-17801A>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53526028
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G
 GAA
GAA
 333 a0001c0001t0001g0005
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c.381-18224dupA
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A
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HG02723.hp2
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c.381-18270C>T
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A
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G
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HG01070.hp2
HG01071.hp1
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c.381-18317T>C
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chr4:53526555 G
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C
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a0001c0001t0004g0083
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HG01074.hp2
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c.381-18328C>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0246
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NA19088.hp2
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c.381-18587C>T
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A
 G
G
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c.381-18660T>C
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chr4:53526895 C
C
 T
T
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HG03098.hp1
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c.381-18668G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53526895
chr4:53526896 G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0099
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HG00642.hp2
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c.381-18669C>T
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A
 G
G
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C
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others(6): Show 
c.381-18826_381-18825dupTT
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chr4:53527051 T
T
 TAAA
TAAA
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a0001c0001t0001g0188
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a0001c0001t0001g0057
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0211
a0001c0001t0001g0293
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a0001c0001t0003g0303
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HG00423.hp1
HG00642.hp1
HG02071.hp1
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others(7): Show 
c.381-18827_381-18825dupTTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53527051
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T
 A
A
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a0001c0001t0002g0322
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HG03654.hp2
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c.381-18937A>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53527164
chr4:53527365 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0004g0214
a0001c0001t0005g0308
a0001c0001t0004g0214
a0001c0001t0005g0308
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NA19005.hp1
NA18990.hp2
NA19005.hp1
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c.381-19138G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53527365
chr4:53527425 C
C
 T
T
 2 a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
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HG03540.hp2
HG03098.hp1
HG03540.hp2
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c.381-19198G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53527425
chr4:53527440 A
A
 G
G
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a0001c0001t0002g0147
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others(9): Show 
a0001c0001t0002g0117
a0001c0001t0002g0147
a0001c0001t0002g0171
a0001c0001t0002g0196
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0221
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a0001c0001t0006g0174
a0001c0001t0006g0223
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a0001c0001t0010g0349
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 12 HG01884.hp1
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HG02572.hp2
others(9): Show 
HG01884.hp1
HG02258.hp2
HG02572.hp2
HG02818.hp2
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HG02896.hp2
HG02897.hp1
HG02970.hp1
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HG03579.hp2
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NA19240.hp2
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c.381-19213T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53527440
chr4:53527441 C
C
 A
A
 6 a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
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others(3): Show 
a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
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 6 HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp2
others(3): Show 
HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp2
HG02809.hp2
HG02886.hp2
HG02965.hp1
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c.381-19214G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53527441
chr4:53527463 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0006g0077
a0009c0009t0001g0078
a0001c0001t0006g0077
a0009c0009t0001g0078
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HG03486.hp1
HG02559.hp2
HG03486.hp1
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c.381-19236G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53527463
chr4:53527694 T
T
 C
C
 2 a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
 2 HG03098.hp1
HG03540.hp2
HG03098.hp1
HG03540.hp2
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c.381-19467A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53527694
chr4:53527758 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0181
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0181
a0001c0001t0001g0184
 2 NA18995.hp2
NA19085.hp1
NA18995.hp2
NA19085.hp1
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c.381-19531C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53527758
chr4:53527771 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0002g0323
a0001c0001t0002g0346
a0001c0001t0017g0123
a0001c0001t0002g0323
a0001c0001t0002g0346
a0001c0001t0017g0123
 3 HG02896.hp1
HG03209.hp2
HG03486.hp2
HG02896.hp1
HG03209.hp2
HG03486.hp2
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c.381-19544T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53527771
chr4:53527796 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0076
a0001c0001t0002g0076
 1 HG01192.hp1
HG01192.hp1
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c.381-19569G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53527796
chr4:53527926 T
T
 C
C
 93 a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0036
others(90): Show 
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0036
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 94 HG00423.hp1
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others(91): Show 
HG00423.hp1
HG00558.hp1
HG00597.hp1
HG00642.hp1
HG00738.hp1
HG01168.hp2
HG01175.hp1
HG01192.hp1
HG01243.hp1
HG01257.hp1
HG01515.hp1
HG01517.hp1
HG02015.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG02071.hp2
HG02074.hp1
HG02080.hp2
HG02083.hp1
HG02109.hp1
HG02129.hp1
HG02135.hp1
HG02486.hp1
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HG02523.hp1
HG02602.hp1
HG02622.hp1
HG02630.hp1
HG02630.hp2
HG02647.hp1
HG02735.hp1
HG02809.hp1
HG02818.hp1
HG02970.hp2
HG03041.hp2
HG03098.hp2
HG03139.hp1
HG03209.hp1
HG03225.hp1
HG03471.hp1
HG03471.hp2
HG03669.hp1
HG03688.hp2
HG03710.hp2
HG03831.hp1
HG03834.hp2
HG03927.hp2
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NA18522.hp2
NA18612.hp2
NA18906.hp1
NA18939.hp2
NA18940.hp1
NA18941.hp2
NA18942.hp2
NA18948.hp1
NA18955.hp2
NA18956.hp2
NA18957.hp2
NA18959.hp2
NA18963.hp1
NA18965.hp2
NA18966.hp2
NA18969.hp1
NA18975.hp1
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NA18984.hp1
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C
 T
T
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HG02630.hp1
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C
 T
T
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C
 T
T
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C
 T
T
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NA19074.hp2
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 T
T
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C
 T
T
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NA19043.hp2
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NA19085.hp2
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NA20129.hp1
NA20805.hp1
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c.381-20263G>A
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chr4:53528491 G
G
 A
A
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a0001c0001t0006g0058
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HG03471.hp2
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c.381-20264C>T
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AG
 A
A
 229 a0001c0001t0001g0005
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C
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G
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A
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 A
A
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 A
A
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a0001c0001t0004g0214
a0001c0001t0005g0308
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NA19005.hp1
NA18990.hp2
NA19005.hp1
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 A
A
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a0001c0014t0019g0157
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A
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A
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a0001c0001t0003g0086
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HG01934.hp1
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ACACACACACACACACACACAC
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a0001c0001t0001g0094
a0001c0001t0003g0132
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NA18997.hp1
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A
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ACACACACACACACACACACACACAC
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A
 C
C
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NA18957.hp1
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NA18939.hp1
NA18957.hp1
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A
 T
T
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a0001c0001t0001g0145
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HG01884.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0251
a0001c0001t0002g0252
a0008c0008t0002g0081
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HG00558.hp1
NA18957.hp2
NA19085.hp2
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T
 C
C
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a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
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G
 T
T
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a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0325
a0001c0001t0002g0326
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HG03139.hp1
NA18522.hp2
NA19043.hp2
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c.381-21156C>A
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T
 C
C
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G
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T
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A
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HG04228.hp1
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A
 G
G
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C
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A
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T
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a0001c0001t0003g0327
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c.381-22575T>A
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T
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C
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HG01884.hp2
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c.381-22629A>G
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C
 G
G
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A
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C
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c.381-24457C>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0006g0223
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HG03579.hp2
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c.381-24607C>T
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C
 A
A
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NA18939.hp1
NA18957.hp1
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A
 G
G
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HG01884.hp1
HG02055.hp1
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c.381-24646T>C
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TC
 T
T
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HG00738.hp1
HG01175.hp1
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c.381-24665delG
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0093
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NA19007.hp1
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c.381-24718T>C
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chr4:53532974 C
C
 A
A
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c.381-25034A>G
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A
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a0001c0001t0021g0217
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c.381-25062G>T
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G
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A
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others(33): Show 
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NA18906.hp1
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G
 T
T
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a0001c0001t0011g0006
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0307
a0001c0001t0005g0234
a0001c0001t0005g0235
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HG02132.hp2
NA19079.hp1
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chr4:53534046 C
C
 A
A
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a0001c0001t0002g0117
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HG02258.hp2
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chr4:53534111 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0145
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HG01884.hp2
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chr4:53534222 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
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HG01358.hp1
HG01496.hp2
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T
 C
C
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C
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CTT
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A
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A
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C
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T
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 T
T
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A
 T
T
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a0001c0001t0021g0217
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NA19030.hp1
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c.381-27644T>A
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chr4:53535878 C
C
 T
T
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a0001c0001t0010g0349
a0001c0001t0010g0348
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NA19240.hp2
HG02970.hp1
NA19240.hp2
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c.381-27651G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53535878
chr4:53535920 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0010g0348
a0001c0001t0010g0349
a0001c0001t0010g0348
a0001c0001t0010g0349
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NA19240.hp2
HG02970.hp1
NA19240.hp2
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c.381-27693G>A
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chr4:53535940 C
C
 A
A
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a0001c0001t0001g0186
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NA18943.hp2
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c.381-27713G>T
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C
 A
A
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a0001c0001t0002g0076
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HG01192.hp1
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c.381-27768G>T
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G
 A
A
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HG01109.hp2
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HG01167.hp2
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C
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G
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A
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A
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0010
a0001c0001t0001g0301
a0001c0001t0002g0010
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HG04228.hp2
NA18964.hp2
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G
 C
C
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a0009c0009t0001g0078
a0001c0001t0006g0077
a0009c0009t0001g0078
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HG02559.hp2
HG03486.hp1
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 A
A
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a0001c0001t0001g0145
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HG01884.hp2
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G
 A
A
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c.381-28440C>T
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C
 T
T
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T
 A
A
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others(28): Show 
HG01168.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0145
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HG01884.hp2
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LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53536993
chr4:53537056 G
G
 A
A
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a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0104
a0001c0001t0003g0231
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HG01975.hp1
HG03492.hp1
HG03831.hp2
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chr4:53537058 A
A
 G
G
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c.381-29191C>T
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G
 A
A
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c.381-29287C>T
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chr4:53537713 T
T
 C
C
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a0001c0001t0010g0349
a0001c0001t0010g0348
a0001c0001t0010g0349
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HG02970.hp1
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c.381-29486A>G
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chr4:53537731 C
C
 T
T
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c.381-29504G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0220
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c.381-29548G>A
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G
 A
A
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 C
C
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A
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A
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c.381-30703C>T
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A
 G
G
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c.381-30735T>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0004g0001
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HG01258.hp2
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c.381-30758G>A
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chr4:53538986 G
G
 A
A
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a0001c0014t0019g0157
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NA20129.hp2
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c.381-30759C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53538986
chr4:53539049 C
C
 T
T
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a0001c0001t0002g0323
a0001c0001t0002g0346
a0001c0001t0017g0123
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HG02896.hp1
HG03209.hp2
HG03486.hp2
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c.381-30822G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53539049
chr4:53539339 C
C
 T
T
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a0001c0001t0002g0332
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NA18906.hp2
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c.381-31112G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53539339
chr4:53539388 C
C
 CA
CA
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T
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T
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G
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A
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a0001c0001t0001g0290
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HG02809.hp1
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 TA
TA
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T
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T
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C
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T
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HG01515.hp2
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A
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c.380+32475T>C
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A
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AG
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 G
G
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c.380+32474T>C
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A
 C
C
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HG00408.hp2
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c.380+32321T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53541302
chr4:53541478 A
A
 AT
AT
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c.380+32144dupA
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G
 T
T
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NA18970.hp2
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NA19088.hp1
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c.380+32051C>A
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C
 A
A
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a0001c0001t0004g0100
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HG02083.hp1
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AT
 A
A
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A
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NA19057.hp1
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A
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A
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A
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NA19043.hp1
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 C
C
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G
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T
 A
A
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a0003c0002t0004g0338
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HG03098.hp1
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c.380+28873A>T
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C
 A
A
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a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
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HG03098.hp1
HG03540.hp2
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c.380+28737G>T
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A
 G
G
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c.380+28605T>C
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G
 C
C
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HG00140.hp1
HG00423.hp1
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HG01258.hp2
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C
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T
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NA20129.hp2
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c.380+28114G>A
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 G
G
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c.380+27863T>C
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T
 C
C
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HG02109.hp1
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c.380+27855A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53545768
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CAT
 C
C
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others(10): Show 
HG01255.hp2
HG02109.hp2
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others(6): Show 
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A
 AT
AT
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HG01099.hp1
HG01099.hp2
HG01346.hp2
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 A
A
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 A
A
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A
 G
G
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a0011c0010t0002g0142
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HG02698.hp1
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C
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T
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c.380+27695G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0004g0122
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HG01169.hp2
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 G
G
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G
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A
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NA18990.hp2
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NA19079.hp2
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NA21309.hp2
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c.380+27380C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53546243
chr4:53546501 G
G
 A
A
 1 a0007c0012t0003g0011
a0007c0012t0003g0011
 1 HG04199.hp2
HG04199.hp2
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c.380+27122C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53546501
chr4:53546571 A
A
 C
C
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a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
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HG02647.hp2
HG02886.hp1
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02886.hp1
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c.380+27052T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53546571
chr4:53546768 A
A
 G
G
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a0001c0001t0002g0067
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others(4): Show 
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a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0068
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 7 HG02129.hp2
HG02132.hp1
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HG02129.hp2
HG02132.hp1
NA18966.hp1
NA18967.hp1
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c.380+26855T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53546768
chr4:53546869 G
G
 A
A
 22 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0002g0015
others(19): Show 
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a0001c0001t0001g0032
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 22 HG01168.hp2
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HG02280.hp2
others(19): Show 
HG01168.hp2
HG02109.hp1
HG02280.hp2
HG02486.hp2
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HG02622.hp2
HG02647.hp1
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NA21309.hp1
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c.380+26754C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53546869
chr4:53546902 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0110
others(68): Show 
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a0001c0001t0001g0057
a0001c0001t0001g0110
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a0001c0001t0001g0188
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a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0195
a0001c0001t0001g0198
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a0001c0001t0002g0333
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a0001c0001t0005g0162
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a0001c0001t0007g0158
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a0001c0001t0007g0166
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others(70): Show 
HG00140.hp2
HG00408.hp2
HG00621.hp2
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HG01978.hp2
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NA18943.hp2
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NA19030.hp2
NA19043.hp1
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NA20300.hp1
NA20300.hp2
NA20805.hp2
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c.380+26721G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53546902
chr4:53547137 C
C
 T
T
 16 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
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others(13): Show 
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a0001c0001t0001g0032
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 16 HG01168.hp2
HG02109.hp1
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others(13): Show 
HG01168.hp2
HG02109.hp1
HG02486.hp2
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NA18906.hp1
NA19030.hp1
NA20129.hp2
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+26486G>A
c.380+26486G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53547137
chr4:53547197 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0021g0217
a0001c0001t0021g0217
 1 NA19030.hp1
NA19030.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+26426G>A
c.380+26426G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53547197
chr4:53547382 A
A
 T
T
 22 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0002g0015
others(19): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0002g0015
a0001c0001t0002g0146
a0001c0001t0002g0192
a0001c0001t0002g0220
a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
a0001c0001t0002g0345
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0005g0120
a0001c0001t0005g0236
a0001c0001t0006g0033
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a0001c0001t0006g0237
a0001c0001t0006g0238
a0001c0001t0006g0239
a0001c0001t0006g0240
a0001c0001t0021g0217
a0001c0014t0019g0157
 22 HG01168.hp2
HG02109.hp1
HG02280.hp2
others(19): Show 
HG01168.hp2
HG02109.hp1
HG02280.hp2
HG02486.hp2
HG02602.hp1
HG02622.hp2
HG02647.hp1
HG02717.hp2
HG02809.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp2
HG03041.hp2
HG03139.hp2
HG03209.hp1
HG03471.hp1
HG03834.hp2
NA18906.hp1
NA19030.hp1
NA20129.hp2
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+26241T>A
c.380+26241T>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53547382
chr4:53547400 G
G
 A
A
 8 a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0001g0176
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others(5): Show 
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a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0177
a0001c0001t0001g0181
a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
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 8 NA18940.hp2
NA18945.hp2
NA18995.hp2
others(5): Show 
NA18940.hp2
NA18945.hp2
NA18995.hp2
NA18998.hp1
NA19066.hp2
NA19077.hp2
NA19085.hp1
NA19088.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+26223C>T
c.380+26223C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53547400
chr4:53547404 A
A
 G
G
 79 a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0035
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others(76): Show 
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0036
a0001c0001t0001g0037
a0001c0001t0001g0038
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c.380+25501dupT
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chr4:53548121 G
G
 GAA
GAA
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others(6): Show 
c.380+25500_380+25501dupTT
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GA
 G
G
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HG00544.hp2
HG00673.hp2
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c.380+25501delT
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C
 T
T
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a0001c0001t0006g0238
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a0001c0001t0006g0240
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HG01168.hp2
HG02109.hp1
HG02280.hp2
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c.380+25472G>A
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G
 A
A
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HG02280.hp2
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c.380+25435C>T
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 T
T
 85 a0001c0001t0001g0005
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a0001c0001t0001g0012
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HG00323.hp2
HG00408.hp1
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NA18965.hp1
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NA18970.hp1
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NA19004.hp1
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NA19063.hp2
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NA19082.hp1
NA19084.hp1
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NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+25425C>A
c.380+25425C>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53548198
chr4:53548303 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0215
a0001c0001t0001g0215
 1 NA20805.hp2
NA20805.hp2
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c.380+25320T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53548303
chr4:53548418 T
T
 C
C
 5 a0001c0001t0001g0056
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others(2): Show 
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a0001c0001t0001g0292
a0001c0001t0001g0293
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 5 NA18957.hp1
NA18964.hp2
NA18969.hp2
others(2): Show 
NA18957.hp1
NA18964.hp2
NA18969.hp2
NA18978.hp1
NA19082.hp2
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c.380+25205A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53548418
chr4:53548529 C
C
 A
A
 84 a0001c0001t0001g0005
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
others(81): Show 
a0001c0001t0001g0005
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
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a0001c0001t0001g0248
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a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0001g0257
a0001c0001t0001g0259
a0001c0001t0001g0261
a0001c0001t0001g0262
a0001c0001t0001g0263
a0001c0001t0001g0265
a0001c0001t0001g0266
a0001c0001t0001g0270
a0001c0001t0001g0271
a0001c0001t0001g0272
a0001c0001t0001g0273
a0001c0001t0001g0313
a0001c0001t0001g0315
a0001c0001t0001g0316
a0001c0001t0002g0066
a0001c0001t0002g0067
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A
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A
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G
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C
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HG03225.hp2
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C
 A
A
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a0001c0001t0002g0297
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c.380+24472G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53549151
chr4:53549208 C
C
 T
T
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HG02976.hp1
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c.380+24415G>A
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T
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NA20905.hp1
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c.380+24352G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53549271
chr4:53549333 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0262
a0001c0001t0001g0262
 1 NA18612.hp1
NA18612.hp1
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c.380+24290A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53549333
chr4:53549449 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0052
a0001c0001t0004g0052
 1 NA18939.hp2
NA18939.hp2
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c.380+24174T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53549449
chr4:53549476 T
T
 TAAGAGAT
others(314): Show 
TAAGAGATGTGGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT
TGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCT
GGCTAACAAGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCG
GGCGCGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG
GAGAATGGCGTGAACCCGGGAAGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCG
CCACTGCAGTCCGCAGTCCGACCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
 40 a0001c0001t0001g0031
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others(37): Show 
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a0001c0001t0001g0057
a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0139
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a0001c0001t0001g0159
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a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0188
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a0001c0001t0007g0161
a0001c0001t0007g0166
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a0011c0010t0002g0142
 41 HG00140.hp2
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others(38): Show 
HG00140.hp2
HG00408.hp2
HG00621.hp2
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HG01109.hp2
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NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+24146_380+2414
others(325): Show 
c.380+24146_380+24147insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAG
ACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGTCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCA
ATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGC
CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCGCCCGGC
TAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGA
TGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGT
GCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCACATCTCTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53549476
chr4:53549476 T
T
 TAAGAGAT
others(315): Show 
TAAGAGATGTGGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT
TGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCT
GGCTAACAAGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCG
GGCGCGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG
GAGAATGGCGTGAACCCGGGAAGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCG
CCACTGCAGTCCGCAGTCCGACCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
 9 a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0165
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0165
a0001c0001t0001g0290
a0001c0001t0002g0323
a0001c0001t0002g0324
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a0001c0001t0002g0326
a0001c0001t0002g0346
 9 HG01884.hp2
HG02055.hp2
HG02145.hp2
others(6): Show 
HG01884.hp2
HG02055.hp2
HG02145.hp2
HG02809.hp1
HG02896.hp1
HG03139.hp1
HG03209.hp2
NA18522.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+24146_380+2414
others(326): Show 
c.380+24146_380+24147insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGA
GACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGTCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGC
AATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTG
CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCGCCCGG
CTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGG
ATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAG
TGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCACATCTCTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53549476
chr4:53549476 T
T
 TAAGAGAT
others(316): Show 
TAAGAGATGTGGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT
TGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCT
GGCTAACAAGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCG
GGCGCGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAG
GAGAATGGCGTGAACCCGGGAAGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATTGCG
CCACTGCAGTCCGCAGTCCGACCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
 3 a0001c0001t0006g0133
a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0017g0123
a0001c0001t0006g0133
a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0017g0123
 3 HG02258.hp1
HG03195.hp2
HG03486.hp2
HG02258.hp1
HG03195.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+24146_380+2414
others(327): Show 
c.380+24146_380+24147insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG
AGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGTCGGACTGCGGACTGCAGTGGCG
CAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCT
GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCGCCCG
GCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAG
GATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAA
GTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCACATCTCTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53549476
chr4:53549502 G
G
 A
A
 99 a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
others(96): Show 
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0036
a0001c0001t0001g0037
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0042
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a0001c0001t0001g0049
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a0001c0001t0001g0292
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a0001c0001t0002g0010
a0001c0001t0002g0015
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a0001c0001t0002g0029
a0001c0001t0002g0046
a0001c0001t0002g0048
a0001c0001t0002g0051
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a0001c0001t0005g0024
a0001c0001t0005g0050
a0001c0001t0005g0053
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a0001c0001t0006g0237
a0001c0001t0006g0238
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a0001c0001t0006g0240
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a0001c0001t0013g0351
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 100 HG00140.hp1
HG00423.hp1
HG00558.hp1
others(97): Show 
HG00140.hp1
HG00423.hp1
HG00558.hp1
HG00597.hp1
HG00642.hp1
HG00673.hp1
HG00738.hp1
HG00741.hp2
HG01168.hp2
HG01257.hp1
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HG01258.hp2
HG01433.hp1
HG01516.hp2
HG01517.hp2
HG02015.hp1
HG02015.hp2
HG02056.hp1
HG02071.hp2
HG02074.hp1
HG02080.hp2
HG02083.hp2
HG02109.hp1
HG02129.hp1
HG02135.hp1
HG02280.hp2
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HG02523.hp1
HG02559.hp2
HG02602.hp1
HG02622.hp2
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HG03471.hp2
HG03486.hp1
HG03654.hp1
HG03669.hp1
HG03710.hp2
HG03831.hp1
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HG04204.hp2
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NA18612.hp2
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NA18957.hp1
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NA18959.hp2
NA18964.hp2
NA18965.hp2
NA18967.hp2
NA18969.hp2
NA18973.hp1
NA18977.hp2
NA18978.hp1
NA18984.hp1
NA18990.hp1
NA18990.hp2
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NA18995.hp1
NA18998.hp2
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NA19043.hp2
NA19057.hp1
NA19060.hp1
NA19070.hp1
NA19074.hp2
NA19077.hp1
NA19079.hp2
NA19082.hp2
NA19083.hp1
NA19083.hp2
NA19084.hp1
NA19085.hp2
NA19086.hp1
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NA20129.hp1
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G
 C
C
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a0001c0001t0003g0170
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G
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G
 T
T
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C
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HG02896.hp1
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G
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C
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T
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C
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HG00423.hp1
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A
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0102
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HG02080.hp2
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c.380+23202C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53550421
chr4:53550445 C
C
 T
T
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a0001c0001t0002g0343
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a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
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HG02717.hp2
HG02809.hp2
HG02965.hp1
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c.380+23178G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53550445
chr4:53550461 C
C
 T
T
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a0001c0001t0003g0091
a0001c0001t0003g0092
a0001c0001t0003g0090
a0001c0001t0003g0091
a0001c0001t0003g0092
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HG01070.hp2
HG01071.hp1
HG01175.hp2
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c.380+23162G>A
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chr4:53551108 G
G
 T
T
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a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0004g0019
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HG02818.hp1
HG03041.hp2
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c.380+22515C>A
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chr4:53551138 TG
TG
 T
T
 77 a0001c0001t0001g0014
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c.380+22484delC
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T
 C
C
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c.380+22439A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53551184
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G
 A
A
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 6 HG02280.hp1
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HG02280.hp1
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c.380+22363C>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0012
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HG01192.hp2
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c.380+22316T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53551307
chr4:53551309 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0012
 1 HG01192.hp2
HG01192.hp2
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c.380+22314C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53551309
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A
 G
G
 3 a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0072
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a0001c0001t0002g0070
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a0001c0001t0006g0071
 3 HG03098.hp2
NA19043.hp2
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HG03098.hp2
NA19043.hp2
NA20129.hp1
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c.380+22254T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53551369
chr4:53551371 G
G
 T
T
 11 a0001c0001t0003g0004
a0001c0001t0003g0136
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others(8): Show 
a0001c0001t0003g0004
a0001c0001t0003g0136
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 12 HG01255.hp2
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others(9): Show 
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G
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A
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C
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T
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CA
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HG01168.hp2
HG02280.hp1
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CA
 C
C
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HG01884.hp1
HG02258.hp2
HG02572.hp2
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c.380+20794delT
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T
 G
G
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HG02109.hp2
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c.380+20766A>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0267
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HG02273.hp2
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c.380+20723G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53552900
chr4:53552934 C
C
 T
T
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others(48): Show 
HG00544.hp2
HG00558.hp2
HG00597.hp2
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c.380+20689G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53552934
chr4:53552998 G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 3 HG02055.hp1
HG02647.hp2
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HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02886.hp1
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c.380+20625C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53552998
chr4:53553076 A
A
 G
G
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others(3): Show 
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 6 HG02280.hp2
HG02622.hp2
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others(3): Show 
HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp2
HG02809.hp2
HG02886.hp2
HG02965.hp1
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c.380+20547T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53553076
chr4:53553091 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0115
a0001c0001t0001g0115
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NA19066.hp1
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c.380+20532T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53553091
chr4:53553391 T
T
 C
C
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others(2): Show 
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a0001c0001t0002g0017
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 5 HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
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c.380+20232A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53553391
chr4:53553416 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0018g0287
a0001c0001t0018g0287
 1 HG02622.hp1
HG02622.hp1
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c.380+20207C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53553416
chr4:53553540 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0146
a0001c0001t0002g0146
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NA21309.hp1
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c.380+20083A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53553540
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G
 T
T
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a0001c0001t0016g0016
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HG02055.hp1
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c.380+20071C>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53553552
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T
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0014
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HG01257.hp1
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c.380+19983A>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53553640
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A
 G
G
 323 a0001c0001t0001g0005
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a0001c0001t0001g0012
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NA19043.hp1
NA19043.hp2
NA19055.hp1
NA19055.hp2
NA19057.hp1
NA19057.hp2
NA19060.hp1
NA19060.hp2
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NA19063.hp1
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NA19079.hp2
NA19082.hp1
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NA19083.hp2
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NA19084.hp2
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NA21309.hp1
NA21309.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+19964T>C
c.380+19964T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53553659
chr4:53553897 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0005g0024
a0001c0001t0005g0024
 1 HG02135.hp1
HG02135.hp1
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c.380+19726A>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53553897
chr4:53553986 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0146
a0001c0001t0002g0146
 1 NA21309.hp1
NA21309.hp1
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c.380+19637G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53553986
chr4:53554017 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0088
a0001c0001t0003g0088
 1 HG03688.hp1
HG03688.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+19606G>C
c.380+19606G>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53554017
chr4:53554178 G
G
 A
A
 12 a0001c0001t0002g0154
a0001c0001t0003g0004
a0001c0001t0003g0136
others(9): Show 
a0001c0001t0002g0154
a0001c0001t0003g0004
a0001c0001t0003g0136
a0001c0001t0003g0137
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0149
a0001c0001t0004g0150
a0001c0001t0005g0135
a0001c0001t0005g0143
a0001c0001t0005g0151
a0001c0001t0005g0152
a0001c0001t0005g0153
 13 HG01255.hp2
HG02109.hp2
HG02145.hp1
others(10): Show 
HG01255.hp2
HG02109.hp2
HG02145.hp1
HG02559.hp1
HG02572.hp1
HG02723.hp2
HG02895.hp1
HG02897.hp2
HG02922.hp1
HG02976.hp2
HG03540.hp1
NA18522.hp1
NA20300.hp1
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c.380+19445C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53554178
chr4:53554253 C
C
 T
T
 1 a0007c0012t0003g0011
a0007c0012t0003g0011
 1 HG04199.hp2
HG04199.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+19370G>A
c.380+19370G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53554253
chr4:53554357 C
C
 A
A
 2 a0001c0001t0009g0124
a0001c0001t0017g0123
a0001c0001t0009g0124
a0001c0001t0017g0123
 2 HG03486.hp2
NA21309.hp2
HG03486.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+19266G>T
c.380+19266G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53554357
chr4:53554591 C
C
 T
T
 6 a0001c0001t0002g0295
a0001c0001t0002g0296
a0001c0001t0002g0297
others(3): Show 
a0001c0001t0002g0295
a0001c0001t0002g0296
a0001c0001t0002g0297
a0001c0001t0002g0298
a0001c0001t0002g0299
a0001c0001t0003g0303
 6 HG03927.hp2
NA18942.hp2
NA18965.hp2
others(3): Show 
HG03927.hp2
NA18942.hp2
NA18965.hp2
NA18967.hp2
NA18991.hp2
NA19086.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+19032G>A
c.380+19032G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53554591
chr4:53554638 G
G
 A
A
 4 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 4 HG02055.hp1
HG02818.hp1
HG02886.hp1
others(1): Show 
HG02055.hp1
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+18985C>T
c.380+18985C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53554638
chr4:53554851 C
C
 CA
CA
 6 a0001c0001t0001g0031
a0001c0001t0001g0273
a0001c0001t0001g0285
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0031
a0001c0001t0001g0273
a0001c0001t0001g0285
a0001c0001t0002g0048
a0001c0001t0003g0062
a0001c0001t0004g0041
 6 HG00741.hp2
HG01433.hp2
HG02056.hp2
others(3): Show 
HG00741.hp2
HG01433.hp2
HG02056.hp2
HG02129.hp1
HG02602.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+18771dupT
c.380+18771dupT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53554851
chr4:53554851 C
C
 CAA
CAA
 10 a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
others(7): Show 
a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
a0001c0001t0002g0345
a0001c0001t0006g0018
a0001c0001t0006g0064
a0001c0001t0011g0006
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
 10 HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp2
others(7): Show 
HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp2
HG02809.hp2
HG02886.hp2
HG02965.hp1
HG03098.hp1
HG03540.hp2
NA19043.hp1
NA19063.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+18770_380+1877
others(6): Show 
c.380+18770_380+18771dupTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53554851
chr4:53554851 C
C
 CAAA
CAAA
 50 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0145
others(47): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0313
a0001c0001t0001g0315
a0001c0001t0001g0316
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0117
a0001c0001t0002g0147
a0001c0001t0002g0171
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a0001c0001t0002g0197
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a0001c0001t0002g0332
a0001c0001t0002g0333
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a0001c0001t0003g0336
a0001c0001t0004g0019
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a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0004g0337
a0001c0001t0005g0021
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a0001c0001t0005g0241
a0001c0001t0005g0242
a0001c0001t0005g0300
a0001c0001t0005g0310
a0001c0001t0005g0311
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a0001c0001t0005g0314
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a0001c0001t0005g0319
a0001c0001t0005g0320
a0001c0001t0005g0321
a0001c0001t0006g0071
a0001c0001t0006g0133
a0001c0001t0006g0173
a0001c0001t0006g0174
a0001c0001t0011g0007
a0001c0001t0012g0222
a0001c0001t0014g0008
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a0001c0001t0016g0016
a0001c0001t0018g0287
a0001c0001t0020g0172
a0004c0013t0005g0309
a0013c0015t0002g0335
 50 HG00323.hp2
HG00408.hp1
HG01175.hp1
others(47): Show 
HG00323.hp2
HG00408.hp1
HG01175.hp1
HG01243.hp1
HG01256.hp1
HG01258.hp1
HG01884.hp1
HG01884.hp2
HG02055.hp1
HG02165.hp1
HG02258.hp1
HG02258.hp2
HG02280.hp1
HG02300.hp1
HG02486.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp1
HG02647.hp2
HG02723.hp1
HG02818.hp1
HG02818.hp2
HG02886.hp1
HG02895.hp2
HG02896.hp2
HG02897.hp1
HG02976.hp1
HG03041.hp1
HG03041.hp2
HG03098.hp2
HG03130.hp1
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HG03195.hp2
HG03453.hp1
NA18906.hp2
NA18941.hp1
NA18945.hp1
NA18951.hp1
NA18964.hp1
NA18974.hp2
NA18975.hp1
NA18975.hp2
NA19005.hp2
NA19009.hp1
NA19043.hp2
NA19062.hp1
NA19063.hp2
NA19070.hp2
NA19087.hp1
NA19240.hp1
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+18769_380+1877
others(7): Show 
c.380+18769_380+18771dupTTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53554851
chr4:53554882 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0008g0216
a0001c0001t0008g0216
 1 NA18963.hp1
NA18963.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+18741A>G
c.380+18741A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53554882
chr4:53555017 AG
AG
 A
A
 8 a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
others(5): Show 
a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
a0001c0001t0002g0345
a0001c0001t0006g0064
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
 8 HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp2
others(5): Show 
HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp2
HG02809.hp2
HG02886.hp2
HG02965.hp1
HG03098.hp1
HG03540.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+18605delC
c.380+18605delC
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53555017
chr4:53555088 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0004g0134
 1 HG02886.hp1
HG02886.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+18535G>A
c.380+18535G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53555088
chr4:53555218 A
A
 G
G
 8 a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
others(5): Show 
a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
a0001c0001t0002g0345
a0001c0001t0006g0064
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
 8 HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp2
others(5): Show 
HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp2
HG02809.hp2
HG02886.hp2
HG02965.hp1
HG03098.hp1
HG03540.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+18405T>C
c.380+18405T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53555218
chr4:53555220 C
C
 T
T
 9 a0001c0001t0001g0233
a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0086
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0233
a0001c0001t0003g0085
a0001c0001t0003g0086
a0001c0001t0003g0087
a0001c0001t0003g0104
a0001c0001t0003g0105
a0001c0001t0003g0205
a0001c0001t0003g0231
a0001c0001t0003g0232
 9 HG00741.hp1
HG01074.hp1
HG01099.hp1
others(6): Show 
HG00741.hp1
HG01074.hp1
HG01099.hp1
HG01256.hp2
HG01934.hp1
HG01975.hp1
HG02004.hp1
HG03492.hp1
HG03831.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+18403G>A
c.380+18403G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53555220
chr4:53555221 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0202
a0001c0001t0004g0202
 1 NA18984.hp2
NA18984.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+18402C>T
c.380+18402C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53555221
chr4:53555325 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0049
 1 HG00673.hp1
HG00673.hp1
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c.380+18298G>T
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chr4:53555372 C
C
 T
T
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a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
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others(6): Show 
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HG02622.hp2
HG02717.hp2
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c.380+18251G>A
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chr4:53555655 A
A
 C
C
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a0001c0001t0002g0326
a0001c0001t0002g0325
a0001c0001t0002g0326
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NA18522.hp2
HG03139.hp1
NA18522.hp2
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c.380+17968T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53555655
chr4:53555785 T
T
 C
C
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a0001c0001t0005g0169
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NA19062.hp1
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LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53555785
chr4:53555785 T
T
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others(10): Show 
TGGCAAAGTATGATTCCC
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a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
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HG03098.hp1
HG03540.hp2
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others(21): Show 
c.380+17821_380+17837dupGGGAATCATACTTTGCC
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chr4:53555835 G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0015
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HG02602.hp1
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c.380+17788C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53555835
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T
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0015
a0001c0001t0002g0015
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HG02602.hp1
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c.380+17747A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53555876
chr4:53555893 T
T
 A
A
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a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0313
a0001c0001t0001g0315
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a0001c0001t0002g0197
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a0001c0001t0002g0341
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a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
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 61 HG00323.hp2
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others(58): Show 
HG00323.hp2
HG00408.hp1
HG01175.hp1
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NA18975.hp2
NA18978.hp2
NA19005.hp2
NA19009.hp1
NA19043.hp1
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NA19063.hp2
NA19070.hp2
NA19087.hp1
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NA20129.hp1
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c.380+17730A>T
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chr4:53555985 G
G
 T
T
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a0008c0008t0002g0081
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HG00558.hp1
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c.380+17638C>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53555985
chr4:53556149 G
G
 A
A
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a0001c0001t0005g0227
 1 NA19083.hp1
NA19083.hp1
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c.380+17474C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53556149
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A
 C
C
 54 a0001c0001t0001g0145
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a0001c0001t0001g0315
others(51): Show 
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0313
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 54 HG00323.hp2
HG00408.hp1
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others(51): Show 
HG00323.hp2
HG00408.hp1
HG01175.hp1
HG01243.hp1
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HG01258.hp1
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HG02897.hp1
HG02965.hp1
HG02976.hp1
HG03041.hp1
HG03098.hp1
HG03098.hp2
HG03130.hp1
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NA18975.hp1
NA18975.hp2
NA18978.hp2
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NA19009.hp1
NA19043.hp1
NA19043.hp2
NA19062.hp1
NA19063.hp1
NA19063.hp2
NA19070.hp2
NA19087.hp1
NA19240.hp1
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+17351T>G
c.380+17351T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53556272
chr4:53556272 A
A
 G
G
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a0001c0001t0018g0287
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0018g0287
 2 HG02622.hp1
HG03139.hp2
HG02622.hp1
HG03139.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+17351T>C
c.380+17351T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53556272
chr4:53556328 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0003g0004
a0001c0001t0003g0137
a0001c0001t0003g0004
a0001c0001t0003g0137
 3 HG02922.hp1
HG02976.hp2
NA20300.hp1
HG02922.hp1
HG02976.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+17295A>G
c.380+17295A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53556328
chr4:53556464 C
C
 T
T
 15 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
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others(12): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
a0001c0001t0002g0345
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a0001c0001t0006g0018
a0001c0001t0006g0064
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a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
 15 HG02055.hp1
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HG02622.hp2
others(12): Show 
HG02055.hp1
HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02647.hp2
HG02717.hp2
HG02809.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG02886.hp2
HG02965.hp1
HG03041.hp2
HG03098.hp1
HG03540.hp2
NA19043.hp1
NA19088.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+17159G>A
c.380+17159G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53556464
chr4:53556478 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0009g0124
a0001c0001t0017g0123
a0001c0001t0009g0124
a0001c0001t0017g0123
 2 HG03486.hp2
NA21309.hp2
HG03486.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+17145C>T
c.380+17145C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53556478
chr4:53556735 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0322
a0001c0001t0002g0322
 1 HG03654.hp2
HG03654.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+16888G>A
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T
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C
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G
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NA18940.hp2
NA18943.hp2
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G
 C
C
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a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0068
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HG02129.hp2
HG02132.hp1
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G
 T
T
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HG02055.hp1
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HG02818.hp1
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A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0178
a0001c0001t0001g0178
 1 NA18951.hp2
NA18951.hp2
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c.380+15360T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53558263
chr4:53558270 G
G
 A
A
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 6 HG02280.hp2
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HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp2
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c.380+15353C>T
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A
 C
C
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a0001c0001t0001g0057
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HG02071.hp1
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c.380+15291T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53558332
chr4:53558333 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0057
a0001c0001t0001g0057
 1 HG02071.hp1
HG02071.hp1
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c.380+15290C>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53558333
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A
 G
G
 4 a0001c0001t0001g0012
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a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0002g0015
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 4 HG01109.hp1
HG01168.hp2
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others(1): Show 
HG01109.hp1
HG01168.hp2
HG01192.hp2
HG02602.hp1
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c.380+15235T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53558388
chr4:53558598 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0021g0217
a0001c0001t0021g0217
 1 NA19030.hp1
NA19030.hp1
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c.380+15025C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53558598
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A
 T
T
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a0001c0001t0002g0017
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
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 5 HG02055.hp1
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others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
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c.380+14934T>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53558689
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A
 C
C
 1 a0001c0001t0006g0018
a0001c0001t0006g0018
 1 NA19043.hp1
NA19043.hp1
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c.380+14868T>G
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chr4:53558775 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0221
a0001c0001t0002g0221
 1 HG03453.hp1
HG03453.hp1
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c.380+14848G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53558775
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G
 A
A
 2 a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
 2 HG03098.hp1
HG03540.hp2
HG03098.hp1
HG03540.hp2
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c.380+14746C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53558877
chr4:53559017 T
T
 C
C
 59 a0001c0001t0001g0020
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others(56): Show 
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a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0313
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a0001c0001t0006g0018
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 59 HG00323.hp2
HG00408.hp1
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others(56): Show 
HG00323.hp2
HG00408.hp1
HG01175.hp1
HG01243.hp1
HG01256.hp1
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HG01884.hp1
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HG02965.hp1
HG02976.hp1
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HG03098.hp2
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NA18906.hp2
NA18941.hp1
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NA18951.hp1
NA18964.hp1
NA18974.hp2
NA18975.hp1
NA18975.hp2
NA18978.hp2
NA19005.hp2
NA19009.hp1
NA19043.hp1
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NA19062.hp1
NA19063.hp1
NA19063.hp2
NA19070.hp2
NA19087.hp1
NA19240.hp1
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+14606A>G
c.380+14606A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53559017
chr4:53559051 T
T
 C
C
 7 a0001c0001t0002g0341
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others(4): Show 
a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
a0001c0001t0002g0345
a0001c0001t0006g0018
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 7 HG02280.hp2
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others(4): Show 
HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp2
HG02809.hp2
HG02886.hp2
HG02965.hp1
NA19043.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+14572A>G
c.380+14572A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53559051
chr4:53559114 G
G
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0056
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a0001c0001t0001g0293
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0292
a0001c0001t0001g0293
a0001c0001t0001g0294
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 5 NA18957.hp1
NA18964.hp2
NA18969.hp2
others(2): Show 
NA18957.hp1
NA18964.hp2
NA18969.hp2
NA18978.hp1
NA19082.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+14509C>T
c.380+14509C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53559114
chr4:53559124 C
C
 T
T
 1 a0007c0012t0003g0011
a0007c0012t0003g0011
 1 HG04199.hp2
HG04199.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+14499G>A
c.380+14499G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53559124
chr4:53559159 A
A
 T
T
 12 a0001c0001t0002g0154
a0001c0001t0003g0004
a0001c0001t0003g0136
others(9): Show 
a0001c0001t0002g0154
a0001c0001t0003g0004
a0001c0001t0003g0136
a0001c0001t0003g0137
a0001c0001t0004g0148
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a0001c0001t0004g0150
a0001c0001t0005g0135
a0001c0001t0005g0143
a0001c0001t0005g0151
a0001c0001t0005g0152
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 13 HG01255.hp2
HG02109.hp2
HG02145.hp1
others(10): Show 
HG01255.hp2
HG02109.hp2
HG02145.hp1
HG02559.hp1
HG02572.hp1
HG02723.hp2
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HG02922.hp1
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HG03540.hp1
NA18522.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+14464T>A
c.380+14464T>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53559159
chr4:53559467 C
C
 T
T
 2 a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
 2 HG03098.hp1
HG03540.hp2
HG03098.hp1
HG03540.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+14156G>A
c.380+14156G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53559467
chr4:53559582 A
A
 G
G
 2 a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
 2 HG03098.hp1
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HG03098.hp1
HG03540.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+14041T>C
c.380+14041T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53559582
chr4:53559601 T
T
 A
A
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a0001c0001t0006g0237
 1 HG03209.hp1
HG03209.hp1
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c.380+14022A>T
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T
 TA
TA
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HG00408.hp1
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c.380+13810dupT
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chr4:53559812 T
T
 TAA
TAA
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HG00323.hp2
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others(6): Show 
c.380+13809_380+13810dupTT
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chr4:53559812 T
T
 TAAA
TAAA
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others(3): Show 
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others(3): Show 
HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp2
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others(7): Show 
c.380+13808_380+13810dupTTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53559812
chr4:53559837 C
C
 G
G
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a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0006g0071
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NA19043.hp2
HG03098.hp2
NA19043.hp2
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c.380+13786G>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53559837
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CCTCT
 C
C
 59 a0001c0001t0001g0035
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a0001c0001t0001g0037
others(56): Show 
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a0001c0001t0001g0036
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others(57): Show 
HG00140.hp1
HG00423.hp1
HG00558.hp1
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NA18969.hp2
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NA18977.hp2
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NA20805.hp1
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others(8): Show 
c.380+13762_380+13765delAGAG
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C
 T
T
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a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
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HG03098.hp1
HG03540.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+13730G>A
c.380+13730G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53559893
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0036
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others(57): Show 
HG00140.hp1
HG00423.hp1
HG00558.hp1
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HG02135.hp1
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NA19083.hp1
NA19083.hp2
NA19084.hp1
NA19086.hp1
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NA20805.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+13667A>G
c.380+13667A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53559956
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G
 T
T
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others(57): Show 
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T
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C
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C
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T
 A
A
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C
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T
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A
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C
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T
 C
C
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C
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C
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T
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T
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C
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C
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T
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a0001c0001t0002g0276
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T
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C
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TA
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A
 G
G
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a0001c0001t0005g0073
a0001c0001t0005g0054
a0001c0001t0005g0073
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HG02735.hp1
HG04228.hp1
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c.380+11694T>C
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T
 C
C
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a0001c0001t0002g0125
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 T
T
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HG02630.hp1
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 A
A
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a0001c0001t0012g0226
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HG02630.hp1
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0006g0077
a0009c0009t0001g0078
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c.380+11302T>C
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G
 C
C
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a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
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HG03098.hp1
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 T
T
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others(4): Show 
HG02280.hp2
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A
 G
G
 2 a0003c0002t0004g0338
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a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
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HG03098.hp1
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c.380+10853T>C
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C
 T
T
 6 a0001c0001t0002g0332
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others(3): Show 
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others(3): Show 
HG02280.hp1
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G
 A
A
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HG02683.hp2
HG03704.hp1
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c.380+10482C>T
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 C
C
 61 a0001c0001t0001g0020
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others(58): Show 
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HG01175.hp1
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c.380+10461A>G
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G
 A
A
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c.380+10460C>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0006g0058
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HG03471.hp2
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c.380+10376T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53563247
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C
 T
T
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HG02896.hp1
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c.380+10334G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53563289
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C
 T
T
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a0001c0001t0005g0310
a0001c0001t0005g0241
a0001c0001t0005g0242
a0001c0001t0005g0310
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HG00408.hp1
HG02165.hp1
NA19070.hp2
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c.380+10147G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53563476
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G
 C
C
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a0005c0005t0001g0258
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NA19062.hp2
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c.380+10108C>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53563515
chr4:53563537 C
C
 CTTT
CTTT
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others(5): Show 
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a0001c0001t0002g0333
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a0003c0002t0004g0338
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others(5): Show 
HG02280.hp1
HG02486.hp1
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others(7): Show 
c.380+10083_380+10085dupAAA
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chr4:53563537 C
C
 CTTTT
CTTTT
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a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0313
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a0001c0001t0001g0316
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a0001c0001t0005g0317
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a0001c0001t0005g0320
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a0001c0001t0006g0133
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a0001c0001t0006g0174
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HG00408.hp1
HG01175.hp1
others(49): Show 
HG00323.hp2
HG00408.hp1
HG01175.hp1
HG01243.hp1
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NA19240.hp1
NA20129.hp1
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others(8): Show 
c.380+10082_380+10085dupAAAA
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53563537
chr4:53563537 CT
CT
 C
C
 24 a0001c0001t0001g0005
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others(21): Show 
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others(22): Show 
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HG00558.hp2
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c.380+10085delA
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53563537
chr4:53563537 CTT
CTT
 C
C
 9 a0001c0001t0001g0126
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others(6): Show 
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a0001c0001t0001g0212
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others(6): Show 
HG00597.hp2
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NA18612.hp1
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others(6): Show 
c.380+10084_380+10085delAA
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53563537
chr4:53563566 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0005g0151
a0001c0001t0005g0151
 1 HG01255.hp2
HG01255.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+10057C>T
c.380+10057C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53563566
chr4:53563638 G
G
 C
C
 5 a0001c0001t0001g0056
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others(2): Show 
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a0001c0001t0001g0292
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 5 NA18957.hp1
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others(2): Show 
NA18957.hp1
NA18964.hp2
NA18969.hp2
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NA19082.hp2
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c.380+9985C>G
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C
 T
T
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c.380+9900G>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0209
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NA19004.hp2
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c.380+9838C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53563785
chr4:53563829 G
G
 T
T
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a0001c0001t0004g0202
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NA18984.hp2
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c.380+9794C>A
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chr4:53563916 C
C
 T
T
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a0001c0001t0003g0063
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NA19055.hp1
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c.380+9707G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53563916
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T
 G
G
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a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
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HG03098.hp1
HG03540.hp2
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c.380+9674A>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53563949
chr4:53564007 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0006g0018
a0001c0001t0006g0018
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NA19043.hp1
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c.380+9616C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53564007
chr4:53564051 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0006g0133
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HG01884.hp2
HG02258.hp1
HG03195.hp2
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c.380+9572G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53564051
chr4:53564235 G
G
 T
T
 5 a0001c0001t0001g0020
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HG02055.hp1
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HG02818.hp1
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c.380+9388C>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53564235
chr4:53564255 G
G
 C
C
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a0001c0001t0004g0034
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NA18977.hp2
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c.380+9368C>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53564255
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 A
A
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a0001c0001t0001g0265
a0001c0001t0001g0262
a0001c0001t0001g0265
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NA18612.hp1
HG00621.hp1
NA18612.hp1
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c.380+9344C>T
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chr4:53564319 C
C
 T
T
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C
 T
T
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a0001c0001t0012g0226
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HG02630.hp1
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chr4:53564542 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0012g0226
a0001c0001t0012g0226
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HG02630.hp1
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c.380+9081G>A
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A
 G
G
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HG03927.hp2
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c.380+9080T>C
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G
 A
A
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A
 C
C
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T
 C
C
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HG02055.hp1
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c.380+9075A>G
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T
 C
C
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A
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T
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A
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A
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A
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A
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A
 G
G
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chr4:53565316 C
C
 G
G
 5 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
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a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 5 HG02055.hp1
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HG02818.hp1
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HG02055.hp1
HG02647.hp2
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HG02886.hp1
HG03041.hp2
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c.380+8307G>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53565316
chr4:53565429 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0270
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HG02273.hp1
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c.380+8194G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53565429
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G
 A
A
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a0001c0001t0003g0103
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HG02074.hp2
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c.380+8080C>T
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chr4:53565556 A
A
 C
C
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HG01975.hp1
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c.380+8067T>G
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A
 G
G
 1 a0010c0011t0001g0274
a0010c0011t0001g0274
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HG01496.hp1
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c.380+7993T>C
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 A
A
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HG00140.hp2
HG00323.hp1
HG00408.hp2
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NA18998.hp1
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c.380+7982C>T
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chr4:53565644 C
C
 T
T
 1 a0010c0011t0001g0274
a0010c0011t0001g0274
 1 HG01496.hp1
HG01496.hp1
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c.380+7979G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53565644
chr4:53565645 A
A
 G
G
 1 a0010c0011t0001g0274
a0010c0011t0001g0274
 1 HG01496.hp1
HG01496.hp1
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c.380+7978T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53565645
chr4:53565669 A
A
 T
T
 5 a0001c0001t0001g0020
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 5 HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
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c.380+7954T>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53565669
chr4:53565674 A
A
 G
G
 4 a0001c0001t0001g0012
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
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 4 HG01109.hp1
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HG01192.hp2
others(1): Show 
HG01109.hp1
HG01168.hp2
HG01192.hp2
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c.380+7949T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53565674
chr4:53565716 T
T
 C
C
 1 a0010c0011t0001g0274
a0010c0011t0001g0274
 1 HG01496.hp1
HG01496.hp1
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c.380+7907A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53565716
chr4:53565814 G
G
 C
C
 1 a0010c0011t0001g0274
a0010c0011t0001g0274
 1 HG01496.hp1
HG01496.hp1
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c.380+7809C>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53565814
chr4:53565815 A
A
 G
G
 72 a0001c0001t0001g0005
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a0001c0001t0001g0013
others(69): Show 
a0001c0001t0001g0005
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
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a0001c0001t0002g0322
a0001c0001t0002g0332
a0001c0001t0002g0333
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a0001c0001t0003g0060
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 73 HG00544.hp2
HG00558.hp2
HG00597.hp2
others(70): Show 
HG00544.hp2
HG00558.hp2
HG00597.hp2
HG00621.hp1
HG00673.hp2
HG01071.hp2
HG01109.hp1
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HG01168.hp2
HG01169.hp2
HG01192.hp2
HG01358.hp1
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HG01496.hp2
HG01952.hp1
HG02056.hp2
HG02109.hp1
HG02129.hp2
HG02132.hp1
HG02135.hp2
HG02148.hp1
HG02165.hp2
HG02273.hp1
HG02280.hp1
HG02486.hp1
HG02486.hp2
HG02523.hp2
HG02602.hp1
HG02630.hp2
HG02647.hp1
HG02683.hp1
HG02723.hp1
HG02970.hp2
HG03041.hp1
HG03130.hp1
HG03209.hp1
HG03471.hp1
HG03486.hp2
HG03579.hp2
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HG03688.hp2
HG03834.hp1
HG04199.hp2
NA18612.hp1
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NA18906.hp1
NA18906.hp2
NA18942.hp1
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NA21309.hp2
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c.380+7808T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53565815
chr4:53565832 C
C
 T
T
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C
 T
T
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a0003c0002t0004g0339
a0001c0001t0010g0347
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
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HG02922.hp2
HG03098.hp1
HG03540.hp2
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c.380+7782G>A
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chr4:53565871 C
C
 T
T
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a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0006g0077
a0009c0009t0001g0078
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HG02559.hp2
HG02735.hp2
HG03486.hp1
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c.380+7752G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53565871
chr4:53565896 C
C
 T
T
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a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
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HG03098.hp1
HG03540.hp2
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c.380+7727G>A
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chr4:53565928 C
C
 T
T
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HG02055.hp1
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c.380+7695G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53565928
chr4:53565938 A
A
 C
C
 5 a0001c0001t0001g0020
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a0001c0001t0016g0016
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HG02055.hp1
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c.380+7685T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53565938
chr4:53565967 G
G
 C
C
 54 a0001c0001t0001g0031
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 55 HG00140.hp2
HG00323.hp1
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others(52): Show 
HG00140.hp2
HG00323.hp1
HG00544.hp1
HG00621.hp2
HG00738.hp2
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NA18995.hp2
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NA18997.hp2
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c.380+7656C>G
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G
 C
C
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a0001c0001t0003g0193
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HG00544.hp1
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c.380+7473C>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566150
chr4:53566178 C
C
 A
A
 72 a0001c0001t0001g0035
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others(69): Show 
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 74 HG00140.hp1
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others(71): Show 
HG00140.hp1
HG00423.hp1
HG00558.hp1
HG00597.hp1
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HG02145.hp1
HG02523.hp1
HG02559.hp1
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NA18940.hp1
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NA18965.hp2
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NA19077.hp1
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NA19084.hp1
NA19086.hp1
NA19091.hp2
NA20300.hp1
NA20805.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+7445G>T
c.380+7445G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566178
chr4:53566292 C
C
 T
T
 5 a0001c0001t0001g0020
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
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a0001c0001t0016g0016
 5 HG02055.hp1
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HG02818.hp1
others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+7331G>A
c.380+7331G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566292
chr4:53566293 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0005g0050
a0001c0001t0005g0050
 1 NA20805.hp1
NA20805.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+7330C>T
c.380+7330C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566293
chr4:53566302 T
T
 G
G
 5 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
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a0001c0001t0016g0016
 5 HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+7321A>C
c.380+7321A>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566302
chr4:53566372 T
T
 C
C
 5 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 5 HG02055.hp1
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others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
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c.380+7251A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566372
chr4:53566421 G
G
 T
T
 6 a0001c0001t0002g0332
a0001c0001t0002g0333
a0001c0001t0002g0334
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a0001c0001t0002g0332
a0001c0001t0002g0333
a0001c0001t0002g0334
a0001c0001t0003g0336
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a0013c0015t0002g0335
 6 HG02280.hp1
HG02486.hp1
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HG02280.hp1
HG02486.hp1
HG02723.hp1
HG03041.hp1
HG03130.hp1
NA18906.hp2
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c.380+7202C>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566421
chr4:53566474 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0104
a0001c0001t0003g0104
 1 HG03492.hp1
HG03492.hp1
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c.380+7149C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566474
chr4:53566500 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0005g0059
a0001c0001t0005g0059
 1 HG02976.hp1
HG02976.hp1
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c.380+7123C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566500
chr4:53566522 C
C
 T
T
 5 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
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a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 5 HG02055.hp1
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HG02818.hp1
others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
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c.380+7101G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566522
chr4:53566523 G
G
 A
A
 6 a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
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a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
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 6 HG02280.hp2
HG02622.hp2
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HG02280.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp2
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c.380+7100C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566523
chr4:53566604 A
A
 C
C
 2 a0001c0001t0008g0084
a0001c0001t0008g0219
a0001c0001t0008g0084
a0001c0001t0008g0219
 2 HG02683.hp2
HG03704.hp1
HG02683.hp2
HG03704.hp1
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c.380+7019T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566604
chr4:53566676 A
A
 G
G
 5 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 5 HG02055.hp1
HG02647.hp2
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others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+6947T>C
c.380+6947T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566676
chr4:53566681 C
C
 A
A
 8 a0001c0001t0002g0117
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others(5): Show 
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a0001c0001t0002g0171
a0001c0001t0002g0196
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0221
a0001c0001t0006g0173
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 8 HG01884.hp1
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others(5): Show 
HG01884.hp1
HG02258.hp2
HG02572.hp2
HG02818.hp2
HG02895.hp2
HG02896.hp2
HG02897.hp1
HG03453.hp1
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c.380+6942G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566681
chr4:53566685 C
C
 T
T
 7 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
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others(4): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
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a0003c0002t0004g0339
 7 HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
others(4): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
HG03098.hp1
HG03540.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+6938G>A
c.380+6938G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566685
chr4:53566946 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0330
a0001c0001t0001g0330
 1 NA19070.hp1
NA19070.hp1
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c.380+6677A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53566946
chr4:53567376 A
A
 C
C
 4 a0001c0001t0002g0066
a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0068
others(1): Show 
a0001c0001t0002g0066
a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0068
a0001c0001t0003g0065
 4 NA18967.hp1
NA18970.hp1
NA19004.hp1
others(1): Show 
NA18967.hp1
NA18970.hp1
NA19004.hp1
NA19060.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+6247T>G
c.380+6247T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567376
chr4:53567418 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0005g0111
a0001c0001t0005g0112
a0001c0001t0005g0113
a0001c0001t0005g0111
a0001c0001t0005g0112
a0001c0001t0005g0113
 3 HG03017.hp1
HG03491.hp2
HG03492.hp2
HG03017.hp1
HG03491.hp2
HG03492.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+6205C>T
c.380+6205C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567418
chr4:53567504 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0018g0287
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0018g0287
 2 HG02622.hp1
HG03139.hp2
HG02622.hp1
HG03139.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+6119T>C
c.380+6119T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567504
chr4:53567532 A
A
 G
G
 5 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 5 HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+6091T>C
c.380+6091T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567532
chr4:53567534 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0193
a0001c0001t0003g0193
 1 HG00544.hp1
HG00544.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+6089C>T
c.380+6089C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567534
chr4:53567565 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0012
 1 HG01192.hp2
HG01192.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+6058G>A
c.380+6058G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567565
chr4:53567606 A
A
 G
G
 5 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 5 HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+6017T>C
c.380+6017T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567606
chr4:53567692 T
T
 C
C
 4 a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0002g0015
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0002g0015
a0001c0001t0005g0120
 4 HG01109.hp1
HG01168.hp2
HG01192.hp2
others(1): Show 
HG01109.hp1
HG01168.hp2
HG01192.hp2
HG02602.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+5931A>G
c.380+5931A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567692
chr4:53567822 C
C
 T
T
 6 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0013g0350
a0001c0001t0016g0016
 6 HG00738.hp1
HG02055.hp1
HG02647.hp2
others(3): Show 
HG00738.hp1
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+5801G>A
c.380+5801G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567822
chr4:53567868 C
C
 T
T
 54 a0001c0001t0001g0031
a0001c0001t0001g0057
a0001c0001t0001g0139
others(51): Show 
a0001c0001t0001g0031
a0001c0001t0001g0057
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0156
a0001c0001t0001g0159
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a0001c0001t0003g0079
a0001c0001t0003g0132
a0001c0001t0003g0170
a0001c0001t0003g0180
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a0001c0001t0004g0083
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a0001c0001t0004g0141
a0001c0001t0004g0163
a0001c0001t0004g0164
a0001c0001t0004g0229
a0001c0001t0004g0268
a0001c0001t0005g0144
a0001c0001t0005g0162
a0001c0001t0005g0302
a0001c0001t0006g0179
a0001c0001t0007g0002
a0001c0001t0007g0158
a0001c0001t0007g0161
a0001c0001t0007g0166
a0006c0006t0001g0168
a0011c0010t0002g0142
 55 HG00140.hp2
HG00323.hp1
HG00544.hp1
others(52): Show 
HG00140.hp2
HG00323.hp1
HG00544.hp1
HG00621.hp2
HG00738.hp2
HG01070.hp1
HG01074.hp2
HG01109.hp2
HG01167.hp1
HG01168.hp1
HG01169.hp1
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HG01346.hp1
HG01515.hp1
HG01515.hp2
HG01517.hp1
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HG01975.hp2
HG01978.hp2
HG02004.hp2
HG02015.hp1
HG02055.hp2
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HG02145.hp2
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HG02451.hp1
HG02602.hp2
HG02698.hp1
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HG03491.hp1
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HG03834.hp2
NA18939.hp1
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c.380+5755G>A
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chr4:53567875 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0110
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NA18943.hp1
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c.380+5748G>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567875
chr4:53567886 G
G
 T
T
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a0001c0001t0001g0037
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HG00741.hp2
HG01257.hp2
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A
 C
C
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a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0006g0077
a0009c0009t0001g0078
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HG03486.hp1
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c.380+5715T>G
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chr4:53567915 T
T
 C
C
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a0001c0001t0002g0017
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a0001c0001t0002g0017
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HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
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LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567915
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A
 C
C
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a0001c0001t0021g0217
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NA19030.hp1
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c.380+5706T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567917
chr4:53567941 A
A
 T
T
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a0001c0001t0002g0322
a0001c0001t0002g0340
a0001c0001t0006g0223
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HG03654.hp2
HG02630.hp2
HG03579.hp2
HG03654.hp2
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c.380+5682T>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567941
chr4:53567981 A
A
 C
C
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others(5): Show 
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a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
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HG02622.hp2
HG02717.hp2
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c.380+5642T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53567981
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G
 A
A
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others(2): Show 
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a0001c0001t0002g0017
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others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
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c.380+5601C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53568022
chr4:53568089 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0264
a0001c0001t0003g0264
 1 NA18942.hp1
NA18942.hp1
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c.380+5534G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53568089
chr4:53568133 C
C
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0020
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others(2): Show 
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a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
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HG02818.hp1
others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
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HG03041.hp2
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c.380+5490G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53568133
chr4:53568156 T
T
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
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a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
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HG02647.hp2
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others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
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c.380+5467A>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53568156
chr4:53568243 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0013
others(64): Show 
a0001c0001t0001g0005
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
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a0001c0001t0006g0033
a0001c0001t0006g0223
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others(65): Show 
HG00544.hp2
HG00558.hp2
HG00597.hp2
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NA19070.hp1
NA19082.hp1
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NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+5380G>A
c.380+5380G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53568243
chr4:53568265 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0074
a0001c0001t0004g0074
 1 HG01099.hp2
HG01099.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+5358T>C
c.380+5358T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53568265
chr4:53568293 C
C
 T
T
 54 a0001c0001t0001g0031
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others(51): Show 
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a0001c0001t0001g0057
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 55 HG00140.hp2
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others(52): Show 
HG00140.hp2
HG00323.hp1
HG00544.hp1
HG00621.hp2
HG00738.hp2
HG01070.hp1
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HG02647.hp2
HG02818.hp1
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HG02055.hp1
HG02647.hp2
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C
 A
A
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a0001c0001t0003g0022
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HG03669.hp1
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c.380+5009G>T
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chr4:53568708 A
A
 G
G
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a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 5 HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
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HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
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c.380+4915T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53568708
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0204
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HG00408.hp2
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c.380+4856A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53568767
chr4:53568787 T
T
 G
G
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a0001c0001t0002g0275
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HG02683.hp1
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c.380+4836A>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53568787
chr4:53568800 C
C
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
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others(2): Show 
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a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
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 5 HG02055.hp1
HG02647.hp2
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others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
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c.380+4823G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53568800
chr4:53568801 G
G
 A
A
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others(3): Show 
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a0001c0001t0002g0017
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a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 6 HG01074.hp1
HG02055.hp1
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others(3): Show 
HG01074.hp1
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
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c.380+4822C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53568801
chr4:53568854 C
C
 T
T
 5 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 5 HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+4769G>A
c.380+4769G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53568854
chr4:53568987 A
A
 C
C
 3 a0001c0001t0002g0276
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a0009c0009t0001g0078
a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0006g0077
a0009c0009t0001g0078
 3 HG02559.hp2
HG02735.hp2
HG03486.hp1
HG02559.hp2
HG02735.hp2
HG03486.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+4636T>G
c.380+4636T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53568987
chr4:53569026 T
T
 G
G
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others(4): Show 
a0001c0001t0001g0290
a0001c0001t0002g0323
a0001c0001t0002g0324
a0001c0001t0002g0325
a0001c0001t0002g0326
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 7 HG02809.hp1
HG02896.hp1
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others(4): Show 
HG02809.hp1
HG02896.hp1
HG03139.hp1
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HG03225.hp2
NA18522.hp2
NA19030.hp2
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c.380+4597A>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53569026
chr4:53569078 C
C
 T
T
 47 a0001c0001t0001g0005
a0001c0001t0001g0061
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others(44): Show 
a0001c0001t0001g0005
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0126
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a0001c0001t0001g0266
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 48 HG00544.hp2
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others(45): Show 
HG00544.hp2
HG00558.hp2
HG00597.hp2
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HG01071.hp2
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HG01496.hp2
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NA18612.hp1
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NA19091.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+4545G>A
c.380+4545G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53569078
chr4:53569226 C
C
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
 2 HG01167.hp1
HG02145.hp2
HG01167.hp1
HG02145.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+4397G>C
c.380+4397G>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53569226
chr4:53569245 C
C
 T
T
 54 a0001c0001t0001g0031
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a0001c0001t0001g0139
others(51): Show 
a0001c0001t0001g0031
a0001c0001t0001g0057
a0001c0001t0001g0139
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a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
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a0001c0001t0001g0177
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 55 HG00140.hp2
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others(52): Show 
HG00140.hp2
HG00323.hp1
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NA18939.hp1
NA18940.hp2
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NA18984.hp1
NA18995.hp2
NA18997.hp1
NA18997.hp2
NA18998.hp1
NA19055.hp2
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NA19077.hp2
NA19085.hp1
NA19088.hp1
NA20300.hp2
NA20805.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+4378G>A
c.380+4378G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53569245
chr4:53569288 C
C
 G
G
 6 a0001c0001t0002g0332
a0001c0001t0002g0333
a0001c0001t0002g0334
others(3): Show 
a0001c0001t0002g0332
a0001c0001t0002g0333
a0001c0001t0002g0334
a0001c0001t0003g0336
a0001c0001t0004g0337
a0013c0015t0002g0335
 6 HG02280.hp1
HG02486.hp1
HG02723.hp1
others(3): Show 
HG02280.hp1
HG02486.hp1
HG02723.hp1
HG03041.hp1
HG03130.hp1
NA18906.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+4335G>C
c.380+4335G>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53569288
chr4:53569354 C
C
 T
T
 5 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 5 HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+4269G>A
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 A
A
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 C
C
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 A
A
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 A
A
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 G
G
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G
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C
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T
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c.380+3946G>A
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G
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A
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c.380+3773C>T
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A
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G
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NA18945.hp1
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c.380+3723T>C
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G
 T
T
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c.380+3602C>A
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A
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G
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c.380+3528T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570095
chr4:53570104 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0006g0077
a0009c0009t0001g0078
a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0006g0077
a0009c0009t0001g0078
 3 HG02559.hp2
HG02735.hp2
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HG02735.hp2
HG03486.hp1
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c.380+3519C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570104
chr4:53570107 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0051
a0001c0001t0002g0051
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HG02523.hp1
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c.380+3516C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570107
chr4:53570124 G
G
 T
T
 13 a0001c0001t0001g0031
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HG01070.hp1
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c.380+3499C>A
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A
 AG
AG
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HG02258.hp2
HG02572.hp2
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c.380+3475dupC
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C
 A
A
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a0001c0001t0009g0118
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0009g0118
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HG03130.hp2
HG03453.hp2
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c.380+3470G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570153
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A
 T
T
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a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
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HG01496.hp2
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HG01358.hp1
HG01496.hp2
HG02148.hp1
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c.380+3392T>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570231
chr4:53570262 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0326
a0001c0001t0002g0326
 1 NA18522.hp2
NA18522.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+3361G>T
c.380+3361G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570262
chr4:53570289 A
A
 G
G
 5 a0001c0001t0001g0020
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others(2): Show 
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 5 HG02055.hp1
HG02647.hp2
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others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
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c.380+3334T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570289
chr4:53570299 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0002g0276
 1 HG02735.hp2
HG02735.hp2
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c.380+3324A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570299
chr4:53570304 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0002g0276
 1 HG02735.hp2
HG02735.hp2
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c.380+3319G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570304
chr4:53570329 T
T
 C
C
 5 a0001c0001t0001g0020
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 5 HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
others(2): Show 
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
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c.380+3294A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570329
chr4:53570343 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0016g0016
a0001c0001t0016g0016
 1 HG02055.hp1
HG02055.hp1
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c.380+3280C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570343
chr4:53570416 A
A
 C
C
 2 a0001c0001t0002g0066
a0001c0001t0002g0067
a0001c0001t0002g0066
a0001c0001t0002g0067
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NA19060.hp2
NA18967.hp1
NA19060.hp2
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c.380+3207T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570416
chr4:53570427 T
T
 C
C
 347 a0001c0001t0001g0005
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T
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 C
C
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A
 C
C
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G
 A
A
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T
 C
C
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A
 T
T
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TATA
 T
T
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a0001c0001t0002g0017
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HG02055.hp1
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T
 TAATA
TAATA
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T
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T
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a0001c0001t0004g0121
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HG01167.hp2
HG01168.hp2
HG01169.hp2
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TAATA
 T
T
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others(6): Show 
c.380+2955_380+2958delTATT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570664
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T
 A
A
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a0001c0001t0005g0235
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NA19084.hp2
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c.380+2956A>T
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C
 T
T
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HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
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c.380+2870G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570753
chr4:53570802 C
C
 T
T
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others(71): Show 
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HG03540.hp1
HG03654.hp1
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HG04228.hp2
NA18522.hp1
NA18612.hp2
NA18939.hp2
NA18940.hp1
NA18941.hp2
NA18942.hp2
NA18948.hp1
NA18955.hp1
NA18957.hp1
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NA19057.hp1
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NA19077.hp1
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NA19083.hp1
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A
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c.380+2799C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570824
chr4:53570830 A
A
 G
G
 8 a0001c0001t0002g0341
a0001c0001t0002g0342
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a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
a0001c0001t0002g0345
a0001c0001t0006g0064
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 8 HG02280.hp2
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HG02717.hp2
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HG02622.hp2
HG02717.hp2
HG02809.hp2
HG02886.hp2
HG02965.hp1
HG03098.hp1
HG03540.hp2
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c.380+2793T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570830
chr4:53570888 G
G
 A
A
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a0001c0001t0004g0108
a0001c0001t0009g0107
a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0004g0108
a0001c0001t0009g0107
 3 HG01243.hp2
HG02717.hp1
HG03579.hp1
HG01243.hp2
HG02717.hp1
HG03579.hp1
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c.380+2735C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570888
chr4:53570983 C
C
 T
T
 60 a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0036
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others(57): Show 
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a0001c0001t0001g0036
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others(58): Show 
HG00140.hp1
HG00423.hp1
HG00558.hp1
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HG04228.hp2
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NA18955.hp1
NA18957.hp1
NA18959.hp2
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NA18965.hp2
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NA18973.hp1
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NA18990.hp1
NA18991.hp2
NA18995.hp1
NA18998.hp2
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NA19057.hp1
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NA19077.hp1
NA19082.hp2
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NA19083.hp2
NA19084.hp1
NA19086.hp1
NA19091.hp2
NA20805.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+2640G>A
c.380+2640G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53570983
chr4:53571006 G
G
 A
A
 1 a0001c0004t0001g0281
a0001c0004t0001g0281
 1 NA19057.hp1
NA19057.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+2617C>T
c.380+2617C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53571006
chr4:53571021 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0035
 1 HG02083.hp2
HG02083.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+2602G>A
c.380+2602G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53571021
chr4:53571025 TA
TA
 T
T
 10 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0276
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0006g0077
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a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
a0009c0009t0001g0078
 10 HG02055.hp1
HG02559.hp2
HG02647.hp2
others(7): Show 
HG02055.hp1
HG02559.hp2
HG02647.hp2
HG02735.hp2
HG02818.hp1
HG02886.hp1
HG03041.hp2
HG03098.hp1
HG03486.hp1
HG03540.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+2597delT
c.380+2597delT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53571025
chr4:53571079 C
C
 CCTAATCT
others(1): Show 
CCTAATCTT
 6 a0001c0001t0002g0332
a0001c0001t0002g0333
a0001c0001t0002g0334
others(3): Show 
a0001c0001t0002g0332
a0001c0001t0002g0333
a0001c0001t0002g0334
a0001c0001t0003g0336
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a0013c0015t0002g0335
 6 HG02280.hp1
HG02486.hp1
HG02723.hp1
others(3): Show 
HG02280.hp1
HG02486.hp1
HG02723.hp1
HG03041.hp1
HG03130.hp1
NA18906.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+2536_380+2543d
others(10): Show 
c.380+2536_380+2543dupAAGATTAG
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53571079
chr4:53571312 C
C
 A
A
 2 a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0006g0071
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0006g0071
 2 HG03098.hp2
NA19043.hp2
HG03098.hp2
NA19043.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+2311G>T
c.380+2311G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53571312
chr4:53571316 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0006g0018
a0001c0001t0006g0018
 1 NA19043.hp1
NA19043.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+2307C>T
c.380+2307C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53571316
chr4:53571318 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
a0001c0001t0002g0342
a0001c0001t0002g0343
a0001c0001t0002g0344
 3 HG02717.hp2
HG02809.hp2
HG02965.hp1
HG02717.hp2
HG02809.hp2
HG02965.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+2305C>T
c.380+2305C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53571318
chr4:53571330 TC
TC
 T
T
 24 a0001c0001t0001g0313
a0001c0001t0001g0315
a0001c0001t0001g0316
others(21): Show 
a0001c0001t0001g0313
a0001c0001t0001g0315
a0001c0001t0001g0316
a0001c0001t0004g0127
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a0001c0001t0005g0059
a0001c0001t0005g0169
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a0001c0001t0005g0242
a0001c0001t0005g0300
a0001c0001t0005g0310
a0001c0001t0005g0311
a0001c0001t0005g0312
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a0001c0001t0005g0317
a0001c0001t0005g0318
a0001c0001t0005g0319
a0001c0001t0005g0320
a0001c0001t0005g0321
a0001c0001t0011g0006
a0001c0001t0011g0007
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 24 HG00323.hp2
HG00408.hp1
HG01175.hp1
others(21): Show 
HG00323.hp2
HG00408.hp1
HG01175.hp1
HG01243.hp1
HG01256.hp1
HG01258.hp1
HG02165.hp1
HG02300.hp1
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NA18941.hp1
NA18945.hp1
NA18951.hp1
NA18964.hp1
NA18974.hp2
NA18975.hp1
NA18975.hp2
NA18978.hp2
NA19005.hp2
NA19009.hp1
NA19062.hp1
NA19063.hp1
NA19063.hp2
NA19070.hp2
NA19087.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+2292delG
c.380+2292delG
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53571330
chr4:53571563 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0277
a0001c0001t0004g0277
 1 NA18998.hp2
NA18998.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+2060G>A
c.380+2060G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53571563
chr4:53571674 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0269
a0001c0001t0001g0269
 1 HG01975.hp2
HG01975.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+1949A>G
c.380+1949A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53571674
chr4:53571724 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0005g0024
a0001c0001t0005g0024
 1 HG02135.hp1
HG02135.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+1899C>T
c.380+1899C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53571724
chr4:53571806 A
A
 C
C
 3 a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0006g0077
a0009c0009t0001g0078
a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0006g0077
a0009c0009t0001g0078
 3 HG02559.hp2
HG02735.hp2
HG03486.hp1
HG02559.hp2
HG02735.hp2
HG03486.hp1
 intron_variant MODIFIER c.380+1817T>G
c.380+1817T>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53571806
chr4:53571913 A
A
 T
T
 2 a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
 2 HG03098.hp1
HG03540.hp2
HG03098.hp1
HG03540.hp2
 intron_variant MODIFIER c.380+1710T>A
c.380+1710T>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 2/10 chr4 53571913
chr4:53571924 A
A
 G
G
 55 a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0036
a0001c0001t0001g0037
others(52): Show 
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0036
a0001c0001t0001g0037
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0042
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a0001c0001t0002g0298
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A
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 A
A
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T
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C
 T
T
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T
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A
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 A
A
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 A
A
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chr4:53572599 A
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C
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A
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A
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C
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T
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c.-86-362delT
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A
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HG03453.hp2
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c.-86-583C>T
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C
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a0001c0001t0003g0109
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A
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C
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A
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C
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T
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C
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T
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A
 C
C
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a0001c0001t0002g0275
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A
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c.-86-1368A>C
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chr4:53575574 G
G
 T
T
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a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0006g0077
a0009c0009t0001g0078
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c.-86-1486C>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53575574
chr4:53575613 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0130
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HG01346.hp2
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c.-86-1525G>A
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chr4:53575675 C
C
 G
G
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c.-86-1587G>C
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C
 T
T
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HG02818.hp1
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c.-86-1602G>A
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T
 C
C
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HG03688.hp2
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c.-86-1655A>G
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C
 T
T
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a0002c0003t0001g0244
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HG00544.hp2
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c.-86-1685G>A
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T
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C
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T
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A
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C
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A
 G
G
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A
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c.-86-2028C>T
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T
 C
C
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HG02622.hp1
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c.-86-2044A>G
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T
 C
C
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T
 A
A
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 TA
TA
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T
 TAA
TAA
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A
 G
G
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c.-86-2705T>C
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C
 T
T
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A
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C
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 A
A
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a0001c0001t0006g0077
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HG02559.hp2
HG03486.hp1
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c.-86-3203C>T
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C
 A
A
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a0001c0001t0002g0345
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HG02886.hp2
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 T
T
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c.-86-3325C>A
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G
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A
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A
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C
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A
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G
 A
A
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T
 TAAAAAAT
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AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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NA18948.hp2
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CGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGGTCACGCCATTCTCCTGCCTCA
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GGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCATTAATCATATTTTTT
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chr4:53578919 T
T
 TAAAAAAT
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TAAAAAATATGATTAATGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA
GCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGAC
CATCCCGGCTAAAAACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA
TTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCT
GAGGCAGGAGAATGGCGTGACCCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGA
GATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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HG01346.hp2
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TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCT
GGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGGT
CACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCC
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ACCGTTTTTAGCCGGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCG
CCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGG
CCATTAATCATATTTTTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53578919
chr4:53578919 T
T
 TAAAAAAT
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GCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGAC
CATCCCGGCTAAAAACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA
TTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCT
GAGGCAGGAGAATGGCGTGACCCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGA
GATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAA
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NA19066.hp1
HG01952.hp2
HG02148.hp2
NA19066.hp1
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others(361): Show 
c.-86-4832_-86-4831insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTC
TGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTC
CGCCTCCCGGGGTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG
GACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTA
GAGACGGGGTTTCACCGTTTTTAGCCGGGATGGTCTCGATCTCCTGACCT
CGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAG
CCACCGCGCCCGGCCATTAATCATATTTTTT
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C
 A
A
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a0001c0001t0018g0287
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HG02622.hp1
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c.-86-4925G>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53579013
chr4:53579018 C
C
 T
T
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a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
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HG02647.hp2
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HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02886.hp1
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c.-86-4930G>A
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chr4:53579098 G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0028
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HG02071.hp2
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c.-86-5010C>T
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A
 G
G
 1 a0001c0001t0006g0018
a0001c0001t0006g0018
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NA19043.hp1
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c.-86-5105T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53579193
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A
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0132
a0001c0001t0003g0132
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NA18997.hp1
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c.-86-5133T>C
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G
 A
A
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T
 C
C
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HG02280.hp1
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C
 T
T
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A
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c.-86-5499C>T
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 G
G
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a0001c0001t0006g0223
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T
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NA19043.hp1
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c.-86-5678G>A
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C
 A
A
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A
 T
T
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c.-86-5784T>A
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 T
T
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c.-86-5893C>A
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 A
A
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c.-86-6067T>G
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A
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C
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A
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c.-86-6605C>T
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c.-86-6707G>A
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c.-86-6993C>T
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0329
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HG00597.hp1
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c.-86-7064G>A
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G
 A
A
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HG02258.hp2
HG02559.hp2
HG02622.hp1
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G
 A
A
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a0001c0001t0005g0120
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HG01168.hp2
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c.-86-7106C>T
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T
 C
C
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HG00423.hp1
HG00558.hp1
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c.-86-7160A>G
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chr4:53581385 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0006g0133
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HG03195.hp2
HG01884.hp2
HG03195.hp2
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c.-86-7297A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53581385
chr4:53581561 G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0125
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NA20905.hp1
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c.-86-7473C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53581561
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G
 A
A
 97 a0001c0001t0001g0005
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 98 HG00323.hp2
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others(95): Show 
HG00323.hp2
HG00408.hp1
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HG00558.hp2
HG00597.hp2
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HG01175.hp1
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HG01952.hp1
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HG02280.hp2
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HG03130.hp1
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HG03209.hp2
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NA18612.hp1
NA18906.hp2
NA18941.hp1
NA18942.hp1
NA18951.hp1
NA18953.hp2
NA18954.hp1
NA18956.hp1
NA18957.hp2
NA18964.hp1
NA18965.hp1
NA18966.hp1
NA18967.hp1
NA18970.hp1
NA18974.hp2
NA18975.hp2
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NA19004.hp1
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NA19009.hp1
NA19030.hp1
NA19030.hp2
NA19043.hp1
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NA19063.hp2
NA19064.hp2
NA19070.hp1
NA19070.hp2
NA19082.hp1
NA19085.hp2
NA19087.hp1
NA19087.hp2
NA19088.hp2
NA19091.hp1
NA20905.hp1
NA21309.hp2
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c.-86-7518C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53581606
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C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0246
a0001c0001t0004g0246
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NA19088.hp2
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c.-86-7540G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53581628
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G
 T
T
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others(4): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0002g0276
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c.-87+7954C>T
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chr4:53583479 G
G
 T
T
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a0001c0004t0001g0201
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c.-87+7909C>A
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G
 GA
GA
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HG00408.hp1
HG00558.hp2
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c.-87+7835dupT
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chr4:53583552 G
G
 GAA
GAA
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others(4): Show 
c.-87+7834_-87+7835dupTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53583552
chr4:53583552 G
G
 GAAA
GAAA
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 6 HG02280.hp1
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others(3): Show 
HG02280.hp1
HG02486.hp1
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others(5): Show 
c.-87+7833_-87+7835dupTTT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53583552
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GA
 G
G
 48 a0001c0001t0001g0035
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 49 HG00140.hp1
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others(46): Show 
HG00140.hp1
HG00423.hp1
HG00558.hp1
HG00673.hp1
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HG01258.hp2
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NA20805.hp1
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c.-87+7835delT
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53583552
chr4:53583711 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0018g0287
a0001c0001t0018g0287
 1 HG02622.hp1
HG02622.hp1
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c.-87+7677C>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53583711
chr4:53583761 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
 3 HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02886.hp1
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02886.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-87+7627C>T
c.-87+7627C>T
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53583761
chr4:53583772 C
C
 T
T
 2 a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
a0003c0002t0004g0338
a0003c0002t0004g0339
 2 HG03098.hp1
HG03540.hp2
HG03098.hp1
HG03540.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-87+7616G>A
c.-87+7616G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53583772
chr4:53583793 T
T
 C
C
 13 a0001c0001t0001g0012
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others(10): Show 
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 13 HG01109.hp1
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others(10): Show 
HG01109.hp1
HG01168.hp2
HG01192.hp2
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NA18906.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-87+7595A>G
c.-87+7595A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53583793
chr4:53583860 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0004g0134
a0001c0001t0016g0016
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HG02647.hp2
HG02886.hp1
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c.-87+7528T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53583860
chr4:53583914 A
A
 G
G
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a0001c0001t0002g0069
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HG02015.hp2
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c.-87+7474T>C
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A
 AAAC
AAAC
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A
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AAACAAC
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AAAC
 A
A
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AAACAAC
 A
A
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 A
A
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 A
A
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 A
A
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A
 G
G
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c.-87+7416T>C
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chr4:53583974 C
C
 T
T
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c.-87+7414G>A
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G
 A
A
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C
 T
T
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A
 C
C
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a0001c0001t0001g0020
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HG03041.hp2
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chr4:53584119 T
T
 C
C
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a0001c0001t0002g0146
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chr4:53584131 T
T
 C
C
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T
 C
C
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A
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A
 G
G
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A
 C
C
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G
 A
A
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 C
C
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G
 C
C
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C
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T
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C
 T
T
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HG02886.hp1
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c.-87+6670G>A
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C
 T
T
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HG03491.hp1
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c.-87+6495G>A
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 C
C
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c.-87+6456A>G
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 C
C
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c.-87+6309G>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0020
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T
 C
C
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a0001c0001t0010g0349
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HG02970.hp1
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T
 C
C
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c.-87+6077A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0006g0133
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HG03195.hp2
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c.-87+6071G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53585317
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T
 C
C
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a0001c0001t0002g0147
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NA19240.hp1
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c.-87+6043A>G
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G
 T
T
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a0001c0001t0012g0226
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HG02630.hp1
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c.-87+5995C>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53585393
chr4:53585600 T
T
 C
C
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a0001c0001t0004g0149
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a0001c0001t0004g0149
a0001c0001t0004g0150
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HG02723.hp2
HG02895.hp1
HG02897.hp2
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c.-87+5788A>G
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53585600
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others(12): Show 
AGAACTGTGAGACAATAAAT
 A
A
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a0001c0001t0003g0063
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NA19055.hp1
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others(21): Show 
c.-87+5560_-87+5578delATTTATTGTCTCACAGTTC
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53585809
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A
 G
G
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a0001c0001t0005g0227
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HG02135.hp1
NA19083.hp1
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c.-87+5191T>C
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chr4:53586307 C
C
 A
A
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a0003c0002t0004g0339
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HG03098.hp1
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c.-87+5081G>T
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chr4:53586320 A
A
 G
G
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c.-87+4677T>C
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T
 C
C
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c.-87+4471A>G
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chr4:53587020 GCAAACAT
others(33): Show 
GCAAACATACACCATGCACTAAATATGCCAAAAAAAATGAT
 G
G
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a0002c0003t0001g0286
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HG02523.hp2
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others(42): Show 
c.-87+4328_-87+4367delATCATTTTTTTTGGCATATTTAGTGCAT
GGTGTATGTTTG
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53587020
chr4:53587152 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0132
a0001c0001t0003g0132
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NA18997.hp1
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c.-87+4236T>C
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53587152
chr4:53587212 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0290
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HG02809.hp1
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c.-87+4176G>A
LNX1 ENSG00000072201.14 transcript ENST00000263925.8 protein_coding 1/10 chr4 53587212
chr4:53587231 G
G
 T
T
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others(227): Show 
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c.-87+4157C>A
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C
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G
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c.-87+4026T>C
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T
 C
C
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c.-87+3879A>G
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C
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T
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c.-87+3863G>A
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A
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A
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T
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c.-87+2991G>A
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C
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T
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 G
G
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HG03225.hp2
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c.-87+2622T>C
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A
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NA19064.hp2
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c.-87+2456C>T
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G
 A
A
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HG03017.hp2
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c.-87+2319C>T
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 A
A
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HG03704.hp1
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c.-87+2283C>T
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 A
A
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c.-87+2074C>T
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A
 G
G
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C
 G
G
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c.-87+1721G>C
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chr4:53589733 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0220
a0001c0001t0002g0220
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HG02109.hp1
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c.-87+1655C>T
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C
 A
A
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 A
A
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C
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A
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C
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C
 T
T
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c.-87+1170G>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0005g0227
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NA19083.hp1
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G
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 T
T
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