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chr15:42548901	C C	G G	1	a0003 a0003	1	NA18978.hp1 NA18978.hp1	missense_variant	MODERATE	c.29C>G c.29C>G	p.Ala10Gly p.Ala10Gly	HAUS2	ENSG00000137814.12	transcript	ENST00000260372.8	protein_coding	1/6	64/3921	29/708	10/235	chr15	42548901
chr15:42558214	C C	T T	1	a0002 a0002	2	HG02572.hp2 HG03471.hp2 HG02572.hp2 HG03471.hp2	missense_variant	MODERATE	c.110C>T c.110C>T	p.Ser37Phe p.Ser37Phe	HAUS2	ENSG00000137814.12	transcript	ENST00000260372.8	protein_coding	2/6	145/3921	110/708	37/235	chr15	42558214

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chr15:42566693	C C	T T	1	a0001c0002 a0001c0002	19	HG01109.hp2 HG01496.hp2 HG01981.hp1 others(16): Show HG01109.hp2 HG01496.hp2 HG01981.hp1 HG02109.hp1 HG02280.hp2 HG02559.hp2 HG02615.hp1 HG02630.hp2 HG02647.hp2 HG02897.hp1 HG03130.hp2 HG03139.hp2 HG03195.hp1 HG03579.hp2 HG06807.hp1 NA19030.hp2 NA19043.hp2 NA19240.hp2 NA20300.hp1	synonymous_variant	LOW	c.585C>T c.585C>T	p.Asn195Asn p.Asn195Asn	HAUS2	ENSG00000137814.12	transcript	ENST00000260372.8	protein_coding	6/6	620/3921	585/708	195/235			chr15	42566693

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chr15:42566431	T T	G G	16	a0001c0002t0004g0004 a0001c0002t0004g0296 a0001c0002t0004g0297 others(13): Show a0001c0002t0004g0004 a0001c0002t0004g0296 a0001c0002t0004g0297 a0001c0002t0004g0298 a0001c0002t0004g0299 a0001c0002t0004g0300 a0001c0002t0004g0301 a0001c0002t0004g0302 a0001c0002t0004g0303 a0001c0002t0004g0304 a0001c0002t0004g0305 a0001c0002t0004g0306 a0001c0002t0004g0307 a0001c0002t0004g0308 a0001c0002t0004g0309 a0001c0002t0004g0310	19	HG01109.hp2 HG01496.hp2 HG01981.hp1 others(16): Show HG01109.hp2 HG01496.hp2 HG01981.hp1 HG02109.hp1 HG02280.hp2 HG02559.hp2 HG02615.hp1 HG02630.hp2 HG02647.hp2 HG02897.hp1 HG03130.hp2 HG03139.hp2 HG03195.hp1 HG03579.hp2 HG06807.hp1 NA19030.hp2 NA19043.hp2 NA19240.hp2 NA20300.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.499-176T>G c.499-176T>G	HAUS2	ENSG00000137814.12	transcript	ENST00000260372.8	protein_coding	5/5		chr15	42566431

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JoGo Online Haplotype Explorer HAUS2_chr15_42543838_42574994

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 4)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 6)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 31)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 316)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 6)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 33)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 316)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 350)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 5)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 2)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 38)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 450)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)