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Regionname

ALDH2_chr12_111761933_111822532 / BRCA1_chr17_43039295_43130364 etc.

Chr

Snpeff genename

Sampleids

Snpeff haplotype class

Snpeff annotation impact

Snpeff annotation impact detail

Hapid

Enter haplotype IDs (e.g., a1c1t1g1, a1c1, a1) separated by commas <= a0001 (zero padding also accept)

Samplehapid

No_hapid

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ASB2_chr14_93929166_93981570	93967358	GTC GTC	G G	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG01081.hp1 HG01517.hp1 HG02055.hp1 others(22): Show HG01081.hp1 HG01517.hp1 HG02055.hp1 HG02071.hp2 HG02145.hp2 HG02257.hp2 HG02486.hp2 HG02615.hp2 HG02809.hp1 HG02818.hp2 HG02896.hp2 HG02897.hp2 HG02922.hp1 HG02970.hp1 HG03098.hp2 HG03130.hp1 HG03209.hp2 HG03471.hp1 HG03486.hp2 HG03540.hp1 HG03704.hp1 HG06807.hp1 NA19043.hp1 NA19240.hp2 NA21309.hp1	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 others(1): Show a0001c0001 a0001c0002 a0001c0003 a0001c0005	a0001c0001t0001 a0001c0002t0001 a0001c0002t0002 others(4): Show a0001c0001t0001 a0001c0002t0001 a0001c0002t0002 a0001c0002t0004 a0001c0003t0001 a0001c0005t0003 a0001c0005t0004	a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0022 others(21): Show a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0021 a0001c0001t0001g0022 a0001c0001t0001g0023 a0001c0001t0001g0278 a0001c0001t0001g0279 a0001c0001t0001g0294 a0001c0001t0001g0295 a0001c0001t0001g0298 a0001c0001t0001g0299 a0001c0001t0001g0302 a0001c0002t0001g0025 a0001c0002t0001g0027 a0001c0002t0001g0132 a0001c0002t0002g0026 a0001c0002t0002g0296 a0001c0002t0002g0300 a0001c0002t0002g0303 a0001c0002t0004g0301 a0001c0003t0001g0280 a0001c0003t0001g0304 a0001c0003t0001g0305 a0001c0005t0003g0297 a0001c0005t0004g0293	25	373	0.0670	-2	c.-73 others(19): Show c.-73-2748_-73-2747delGA	ASB2	ENSG00000100628.12	transcript	ENST00000555019.6	protein_coding	1/9			chr14	TogoVar
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