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Regionname

ALDH2_chr12_111761933_111822532 / BRCA1_chr17_43039295_43130364 etc.

Chr

Snpeff genename

Sampleids

Snpeff haplotype class

Snpeff annotation impact

Snpeff annotation impact detail

Hapid

Enter haplotype IDs (e.g., a1c1t1g1, a1c1, a1) separated by commas <= a0001 (zero padding also accept)

Samplehapid

No_hapid

No_samplehapid

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ATG4A_chrX_108086778_108159671	108148020	AAT AAT	A A	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00558.hp2 HG01981.hp2 HG02723.hp2 others(2): Show HG00558.hp2 HG01981.hp2 HG02723.hp2 NA18948.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0003 a0001c0001t0001 a0001c0001t0003	a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0025 a0001c0001t0001g0026 others(1): Show a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0025 a0001c0001t0001g0026 a0001c0001t0003g0151	5	249	0.0201	-2	c.815 others(19): Show c.815-2077_815-2076delAT	ATG4A	ENSG00000101844.18	transcript	ENST00000372232.8	protein_coding	9/12		INFO_REALIGN_3_PRIME	chrX	TogoVar
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