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Regionname

ALDH2_chr12_111761933_111822532 / BRCA1_chr17_43039295_43130364 etc.

Chr

Snpeff genename

Sampleids

Snpeff haplotype class

Snpeff annotation impact

Snpeff annotation impact detail

Hapid

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CYTH1_chr17_78669048_78787273	78685814	GGCT GGCT	G G	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00423.hp2 HG00558.hp1 HG02027.hp1 others(29): Show HG00423.hp2 HG00558.hp1 HG02027.hp1 HG02071.hp2 HG02135.hp2 HG02165.hp2 NA18941.hp2 NA18944.hp2 NA18945.hp1 NA18946.hp2 NA18956.hp1 NA18960.hp2 NA18971.hp1 NA18971.hp2 NA18974.hp2 NA18978.hp1 NA18981.hp1 NA18989.hp2 NA18993.hp2 NA18999.hp1 NA19003.hp2 NA19005.hp2 NA19057.hp1 NA19062.hp1 NA19063.hp1 NA19066.hp1 NA19068.hp1 NA19076.hp2 NA19081.hp2 NA19085.hp2 NA19086.hp1 NA20300.hp2	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0003 a0001c0001t0003	a0001c0001t0003g0063 a0001c0001t0003g0064 a0001c0001t0003g0065 others(29): Show a0001c0001t0003g0063 a0001c0001t0003g0064 a0001c0001t0003g0065 a0001c0001t0003g0066 a0001c0001t0003g0067 a0001c0001t0003g0068 a0001c0001t0003g0069 a0001c0001t0003g0070 a0001c0001t0003g0071 a0001c0001t0003g0072 a0001c0001t0003g0073 a0001c0001t0003g0074 a0001c0001t0003g0075 a0001c0001t0003g0076 a0001c0001t0003g0077 a0001c0001t0003g0078 a0001c0001t0003g0079 a0001c0001t0003g0080 a0001c0001t0003g0081 a0001c0001t0003g0082 a0001c0001t0003g0083 a0001c0001t0003g0084 a0001c0001t0003g0085 a0001c0001t0003g0086 a0001c0001t0003g0087 a0001c0001t0003g0088 a0001c0001t0003g0089 a0001c0001t0003g0090 a0001c0001t0003g0091 a0001c0001t0003g0127 a0001c0001t0003g0128 a0001c0001t0003g0129	32	378	0.0847	-3	c.892 others(20): Show c.892-4775_892-4773delAGC	CYTH1	ENSG00000108669.18	transcript	ENST00000446868.8	protein_coding	11/13			chr17	TogoVar
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CYTH1_chr17_78669048_78787273	78734432	CTTT CTTT	C C	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00140.hp1 others(180): Show HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00280.hp1 HG00280.hp2 HG00323.hp1 HG00408.hp2 HG00423.hp1 HG00544.hp2 HG00558.hp2 HG00621.hp1 HG00621.hp2 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp2 HG00733.hp1 HG00733.hp2 HG00735.hp2 HG00738.hp2 HG01069.hp1 HG01070.hp1 HG01071.hp1 HG01074.hp1 HG01074.hp2 HG01081.hp1 HG01099.hp1 HG01099.hp2 HG01106.hp2 HG01109.hp2 HG01168.hp1 HG01168.hp2 HG01175.hp1 HG01192.hp2 HG01243.hp1 HG01243.hp2 HG01255.hp1 HG01255.hp2 HG01257.hp1 HG01261.hp1 HG01261.hp2 HG01346.hp2 HG01361.hp1 HG01361.hp2 HG01433.hp1 HG01496.hp2 HG01516.hp1 HG01516.hp2 HG01928.hp1 HG01943.hp1 HG01943.hp2 HG01952.hp1 HG01952.hp2 HG02004.hp1 HG02004.hp2 HG02027.hp1 HG02040.hp2 HG02055.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp2 HG02071.hp1 HG02080.hp1 HG02083.hp1 HG02083.hp2 HG02109.hp1 HG02109.hp2 HG02165.hp1 HG02257.hp1 HG02257.hp2 HG02258.hp2 HG02280.hp2 HG02300.hp1 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