Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

Search by Variant

Regionname

Chr

Snpeff genename

Sampleids

Snpeff haplotype class

Snpeff annotation impact

Snpeff annotation impact detail

Hapid

Samplehapid

No_hapid

No_samplehapid

Start

End

Minac

Maxac

Minlen

Maxlen

Sort By

Order by

view	regionname	pos	ref	alt	annotation	impact	samples	ahapids	chapids	thapids	thapids	ac	an	af	len	hgvs_c	hgvs_p	genename	geneid	featuretype	featureid	transcript_biotype	rank	cdna cdna pos length	cds cds pos length	aa aa pos length	distance	status	chr	external
	WDR7_chr18_56646359_57034792	57024880	G G	GCAGGAAT others(1992): Show GCAGGAATAGGGATATGTGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTT CACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAACTATGATAGT TATGTCCCTTACAGGATTTCACATATCCCTATTCTCAGACAGGAATAGGG ATATGTGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTA TTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTAC AGGATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAGCTA TGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGG AATAGGGATATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTACAGGATTTCACAT ATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAGCTATGATAGTTATGT CCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATG TGAACTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTC AGGCAGGAATAGGGATATGTGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAAT TTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAACTATGATA GTTATGTCCCTTACAGGATTTCACATATCCCTATTCTCAGACAGGAATAG GGATATGTGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCC TATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTT ACAGGATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAGC TATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCA GGAATAGGGATATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCAC ATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAGCTATGATAGTTAT GTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATA TGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTACAGGATTTCACATATCCCTATTC TCAGACAGGAATAGGGATATGTGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTATAGA ATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAACTATGA TAGTTATGTCCCTTACAGGATTTCACATATCCCTATTCTCAGACAGGAAT AGGGATATGTGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACAAATC CCTATTCTCAGACAGGAATAGGGATATGTGACTATGATAGTTATGTCCCT TATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGACAGGAATAGGGATATGTGAG CTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGGC AGGAATAGGGATATGTGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTACAGGATTTCA CATATCCCTATTCTCAGACAGGAATAGGGATATGTGAACTATGATAGTTA TGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGACAGGAATAGGGAT ATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATT CTCAGACAGGAATAGGGATATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTACAG GATTTCACATATCCCTATTCTCAGACAGGAATAGGGATATGTGAGCTATG ATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAA TAGGGATATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTACAGGATTTCACATAT CCCTATTCTCAGACAGGAATAGGGATATGTGACTATGATAGTTATGTCCC TTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGA ACTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGA	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG02523.hp1 HG02523.hp1	a0001 a0001	a0001c0002 a0001c0002	a0001c0002t0001 a0001c0002t0001	a0001c0002t0001g0044 a0001c0002t0001g0044	1	144	0.0069	1999	c.427 others(2018): Show c.4270-2105_4270-2104insGCTATGATAGTTATGTCCCTTATAGA ATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAACTATGA TAGTTATGTCCCTTACAGGATTTCACATATCCCTATTCTCAGACAGGAAT AGGGATATGTGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATC CCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAACTATGATAGTTATGTCCC TTACAGGATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGA GCTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGG CAGGAATAGGGATATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTACAGGATTTC ACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAGCTATGATAGTT ATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGA TATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTAT TCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTATA GAATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAACTAT GATAGTTATGTCCCTTACAGGATTTCACATATCCCTATTCTCAGACAGGA ATAGGGATATGTGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATA TCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAACTATGATAGTTATGTC CCTTACAGGATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGT GAGCTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCA GGCAGGAATAGGGATATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATT TCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAGCTATGATAG TTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGG GATATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTACAGGATTTCACATATCCCT ATTCTCAGACAGGAATAGGGATATGTGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTA TAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATATGTGAACT ATGATAGTTATGTCCCTTACAGGATTTCACATATCCCTATTCTCAGACAG GAATAGGGATATGTGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACA AATCCCTATTCTCAGACAGGAATAGGGATATGTGACTATGATAGTTATGT CCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGACAGGAATAGGGATATG TGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTC AGGCAGGAATAGGGATATGTGAGCTATGATAGTTATGTCCCTTACAGGAT TTCACATATCCCTATTCTCAGACAGGAATAGGGATATGTGAACTATGATA GTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGACAGGAATAG GGATATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCC TATTCTCAGACAGGAATAGGGATATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTT ACAGGATTTCACATATCCCTATTCTCAGACAGGAATAGGGATATGTGAGC TATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCA GGAATAGGGATATGTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTACAGGATTTCAC ATATCCCTATTCTCAGACAGGAATAGGGATATGTGACTATGATAGTTATG TCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCTCAGGCAGGAATAGGGATAT GTGAACTATGATAGTTATGTCCCTTATAGAATTTCACATATCCCTATTCT CAGACAGGAATAGGGATATGTGA		WDR7	ENSG00000091157.15	transcript	ENST00000254442.8	protein_coding	27/27					INFO_REALIGN_3_PRIME	chr18	TogoVar