Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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MSLN_chr16_755734_773862	767619	G G	GGCGTGGA others(389): Show GGCGTGGAGGAGGGGCGCGTGGAGGGGGGAGTGTGGGGGGTGTGGAGGGG GGCGCGTGGAGGGGGGAGCGTGGGGGGCGTGGAGGAGGGGCGCGTGGAGG GGGGCGCGTGGGGGGGGCGCATGGGGGGGCGTGGAGGGGGGTGCGTGGAG GAGGGGCGCGTGGAGGAGGAGGGGCGCATGGGGGGGTGTGGAGGGGGGCG CGTGGAGGGGGCACGTGGAGGGGTCGCGTGGAGGAGGGGCGCGTGGAGGG GGCCGTGTGGGGGGGCGTGGAGGAGGGGCGCGTGGAGGGGGGCGCGTGGG GGGGTGTGGAGGGGGGCGCGTGGGGGTGTGTGGGGGGGGCACGTGGAGGG GGGCGTGTGGGGGGGGTGCGTGGAGGAGGGGCGCGTGGAGGAGGGGC	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG03834.hp2 HG03834.hp2	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0001	a0001c0001t0001g0142 a0001c0001t0001g0142	1	218	0.0046	396	c.159 others(413): Show c.1596+173_1596+174insGGGGAGTGTGGGGGGTGTGGAGGGGGGC GCGTGGAGGGGGGAGCGTGGGGGGCGTGGAGGAGGGGCGCGTGGAGGGGG GCGCGTGGGGGGGGCGCATGGGGGGGCGTGGAGGGGGGTGCGTGGAGGAG GGGCGCGTGGAGGAGGAGGGGCGCATGGGGGGGTGTGGAGGGGGGCGCGT GGAGGGGGCACGTGGAGGGGTCGCGTGGAGGAGGGGCGCGTGGAGGGGGC CGTGTGGGGGGGCGTGGAGGAGGGGCGCGTGGAGGGGGGCGCGTGGGGGG GTGTGGAGGGGGGCGCGTGGGGGTGTGTGGGGGGGGCACGTGGAGGGGGG CGTGTGGGGGGGGTGCGTGGAGGAGGGGCGCGTGGAGGAGGGGCGCGTGG AGGAGGGGCGCGTGGAGG	MSLN	ENSG00000102854.16	transcript	ENST00000545450.7	protein_coding	16/17		INFO_REALIGN_3_PRIME	chr16	TogoVar
MTTP_chr4_99569824_99628997	99589009	A A	ATATATGT others(389): Show ATATATGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCATATATATATTCAT ATATATATGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCATATATATATTC ATATATATATGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCATATATATAT TCATATATATATGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCATATATAT ATTCATATATATATGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCATATAT ATATTCATATATATATGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCATAT ATATATTCATATATATATGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCAT ATATATATTCATATATATATGTTCATATATATGTTCATATATATGTT	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG02145.hp1 HG02145.hp1	a0002 a0002	a0002c0021 a0002c0021	a0002c0021t0001 a0002c0021t0001	a0002c0021t0001g0092 a0002c0021t0001g0092	1	347	0.0029	396	c.394 others(411): Show c.394-634_394-633insTATATGTTCATATATATATTCATATATATA TGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCATATATATATTCATATATA TATGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCATATATATATTCATATA TATATGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCATATATATATTCATA TATATATGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCATATATATATTCA TATATATATGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCATATATATATT CATATATATATGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCATATATATA TTCATATATATATGTTCATATATATATTCATATATATATGTTCATATATA TGTTCATATATATGTT	MTTP	ENSG00000138823.14	transcript	ENST00000265517.10	protein_coding	3/17			chr4	TogoVar
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MYL2_chr12_110905845_110925579	110905991	T T	TATATAAT others(389): Show TATATAATATATATTATATAAAATATATATTATATTATATATAATATATA TTATATAAAATATATATTATATTATATATAATATATATTATATAAAATAT ATATTATATTATATATAATATATATTATATAAAATATATATTATATTATA TATAATATATATTATATAAAATATATATTATATTATATAATATATATTAT ATAAAATATATATTATATTATATAATATATATTTTATAAAATATATATTA TATTATATAATATATATTTTATAAAATATATATTATATTATATATAATAT ATATTATATAAAATATATATTATATTATATAATATATATTATATAAAATA TATATTATATTTTATAATATATATTATATAAAATATATATTATATTA	downstream_gene_variant downstream_gene_variant	MODIFIER	NA18969.hp1 NA18984.hp2 NA18998.hp2 NA18969.hp1 NA18984.hp2 NA18998.hp2	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0001	a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0001	3	355	0.0085	396	c.50 others(407): Show c.5085_*5086insTAATATAATATATATTTTATATAATATATATTAT AAAATATAATATATATTTTATATAATATATATTATATAATATAATATATA TTTTATATAATATATATTATATATAATATAATATATATTTTATAAAATAT ATATTATATAATATAATATATATTTTATAAAATATATATTATATAATATA ATATATATTTTATATAATATATATTATATAATATAATATATATTTTATAT AATATATATTATATATAATATAATATATATTTTATATAATATATATTATA TATAATATAATATATATTTTATATAATATATATTATATATAATATAATAT ATATTTTATATAATATATATTATATATAATATAATATATATTTTATATAA TATATATTATAT	MYL2	ENSG00000111245.17	transcript	ENST00000228841.15	protein_coding		4853		chr12	TogoVar
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NELFB_chr9_137250327_137278542	137273768	A A	AATAATTT others(389): Show AATAATTTCTGGGGGAGGATGATATAATTTCTGGGGGAGGTTGATGTAAT TTCTGGGGGAGGTTGATATAATTTCTGGGGGAGGATATAATAATTTCTGG GGGAGGTTGATAAAATTTCTGGGGGAGGATATAATAATTTCTGGGGGAGG TTGATATAATTTCTGGGGGAGGATGATATAATAATTTCTGGGGGAAGTTG ATATAATTTCTGGGGGAGGTTGATGTAATTTCTGGGGGAGGTTGATATAA TTTCTGGGGGAGGATATAATTTCTGGGGGAGGTTGATATAATTTCTGGGG GAGGTTGATATAATTTCTGGGGGAGGATATAATAATTTCTGGGGGAGGTT GATATAATTTCTGGGGGAGGTTGATGTAATTTCTGGGGGAGGTTGAT	downstream_gene_variant downstream_gene_variant	MODIFIER	HG01074.hp1 HG01167.hp2 NA20805.hp1 HG01074.hp1 HG01167.hp2 NA20805.hp1	a0001 a0001	a0001c0002 a0001c0002	a0001c0002t0002 a0001c0002t0002	a0001c0002t0002g0002 a0001c0002t0002g0056 a0001c0002t0002g0059 a0001c0002t0002g0002 a0001c0002t0002g0056 a0001c0002t0002g0059	3	8	0.3750	396	c.84 others(405): Show c.840_*841insATAATTTCTGGGGGAGGATGATATAATTTCTGGGGG AGGTTGATGTAATTTCTGGGGGAGGTTGATATAATTTCTGGGGGAGGATA TAATAATTTCTGGGGGAGGTTGATAAAATTTCTGGGGGAGGATATAATAA TTTCTGGGGGAGGTTGATATAATTTCTGGGGGAGGATGATATAATAATTT CTGGGGGAAGTTGATATAATTTCTGGGGGAGGTTGATGTAATTTCTGGGG GAGGTTGATATAATTTCTGGGGGAGGATATAATTTCTGGGGGAGGTTGAT ATAATTTCTGGGGGAGGTTGATATAATTTCTGGGGGAGGATATAATAATT TCTGGGGGAGGTTGATATAATTTCTGGGGGAGGTTGATGTAATTTCTGGG GGAGGTTGAT	NELFB	ENSG00000188986.9	transcript	ENST00000343053.6	protein_coding		227		chr9	TogoVar
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NOC4L_chr12_132139457_132157468	132150584	A A	ACACCACA others(389): Show ACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCA CACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCCC TAATCCCCTCGGTGAGTGCGGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCC CCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCACTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGG TGAGTGCCGCCGCCTCACTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTG CCGCCGCCTCGCTCCTACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCG CCTCGCTCCTACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCGGCCGCCTCGC TCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCC	intron_variant intron_variant	MODIFIER	NA19065.hp2 NA19083.hp1 NA19065.hp2 NA19083.hp1	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0001	a0001c0001t0001g0005 a0001c0001t0001g0005	2	250	0.0080	396	c.902 others(411): Show c.902-397_902-396insCACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGC CGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGC CTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCGGCCGCCTCGCT CACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCACTCACACC ACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCACTCACACCACACCC CTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCCTACCACACCCCTAATC CCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCCTACCACACCCCTAATCCCCTCG GTGAGTGCGGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGT GCCGCCGCCTCGCTCC	NOC4L	ENSG00000184967.7	transcript	ENST00000330579.6	protein_coding	9/14			chr12	TogoVar
NOC4L_chr12_132139457_132157468	132150672	A A	ACACCACA others(389): Show ACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCA CACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCCC TAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCC CCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGG TGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTG CCGCCGCCTCACTCCTACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCG CCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGC TCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCGGCCGCCTCACTCC	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG02027.hp2 HG02027.hp2	a0008 a0008	a0008c0025 a0008c0025	a0008c0025t0001 a0008c0025t0001	a0008c0025t0001g0106 a0008c0025t0001g0106	1	236	0.0042	396	c.902 others(411): Show c.902-309_902-308insCACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGC CGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGC CTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCT CACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACC ACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCC CTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCACTCCTACCACACCCCTAATC CCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCG GTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGT GCGGCCGCCTCACTCC	NOC4L	ENSG00000184967.7	transcript	ENST00000330579.6	protein_coding	9/14			chr12	TogoVar
NOC4L_chr12_132139457_132157468	132150747	C C	CGCCGCCT others(389): Show CGCCGCCTCACTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCGGCCGC CTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCACT CACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCGGCCGCCTCGCTCACACC ACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCCTACCACACCC CTAATCCCCTCGGTGAGTGCGGCCGCCTCACTCACACCACACCCCTAATC CCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCG GTGAGTGCCGCCGCCTCACTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGT GCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCG	intron_variant intron_variant	MODIFIER	NA18998.hp2 NA18998.hp2	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0001	a0001c0001t0001g0049 a0001c0001t0001g0049	1	190	0.0053	396	c.902 others(411): Show c.902-226_902-225insACTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTG AGTGCGGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCC GCCGCCTCACTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCGGCCGCC TCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTC CTACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCGGCCGCCTCACTCACACCA CACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCCC TAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCACTCACACCACACCCCTAATCC CCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGG TGAGTGCGGCCGCCTC	NOC4L	ENSG00000184967.7	transcript	ENST00000330579.6	protein_coding	9/14		INFO_REALIGN_3_PRIME	chr12	TogoVar
NOC4L_chr12_132139457_132157468	132150747	C C	CGCCGCCT others(389): Show CGCCGCCTCACTCATACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGC CTCGCTCCTACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCT CACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCACTCACACC CCACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCACTCACACCACACCC CTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCACTCCTACCACACCCCTAATC CCCTCGGTGAGTGCGGCCGCCTCACTCACACCCCACCCCTAATCCCCTCG GTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGT GCGGCCGCCTCACTCCTACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCG	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG01433.hp1 HG01433.hp1	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0001	a0001c0001t0001g0157 a0001c0001t0001g0157	1	190	0.0053	396	c.902 others(411): Show c.902-226_902-225insACTCATACCACACCCCTAATCCCCTCGGTG AGTGCCGCCGCCTCGCTCCTACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCC GCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCC TCACTCACACCCCACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCACTC ACACCACACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCACTCCTACCA CACCCCTAATCCCCTCGGTGAGTGCGGCCGCCTCACTCACACCCCACCCC TAATCCCCTCGGTGAGTGCCGCCGCCTCGCTCACACCACACCCCTAATCC CCTCGGTGAGTGCGGCCGCCTCACTCCTACCACACCCCTAATCCCCTCGG TGAGTGCGGCCGCCTC	NOC4L	ENSG00000184967.7	transcript	ENST00000330579.6	protein_coding	9/14		INFO_REALIGN_3_PRIME	chr12	TogoVar
NOS3_chr7_150986017_151019588	150995593	C C	CCCCCATC others(389): Show CCCCCATCCCACCCCTGCACCCCTTTCCCCCCTCCCACCCCTGCACCCTT CCTCCCTCTCCCCCATCCCACCCCTGCCCCCCCTCCCATCCCACCTCTAA ACCCCTCCTCCCTCTCCCCCGTCCCACCCCTAAACCCCACCTCCCTGTCC CCCTCTAAACCCCTCCTCCCTGTCCCCCTCTAAACCCCACCTCCCTCTCC CCATCCCACCCCTGCACCCTTCCTCCCTCTGCCCCCGTCCCACGCCTGTA CTCCTCCTCCCTCTCCCCCGTCACACCCCTGCACCCCTCCTCCCTCTCCC CATCCCATCCCTGCACCCCTCCTCCCTCTGCCCCCGTCCCACCCCTAAAC CCCTCCTCCCTCTGCCCCACCCCACCCTTGCACCCCTCCTCCCTCTT	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG02897.hp2 HG02897.hp2	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0001	a0001c0001t0001g0060 a0001c0001t0001g0060	1	4	0.2500	396	c.270 others(411): Show c.270+283_270+284insATCCCACCCCTGCACCCCTTTCCCCCCTCC CACCCCTGCACCCTTCCTCCCTCTCCCCCATCCCACCCCTGCCCCCCCTC CCATCCCACCTCTAAACCCCTCCTCCCTCTCCCCCGTCCCACCCCTAAAC CCCACCTCCCTGTCCCCCTCTAAACCCCTCCTCCCTGTCCCCCTCTAAAC CCCACCTCCCTCTCCCCATCCCACCCCTGCACCCTTCCTCCCTCTGCCCC CGTCCCACGCCTGTACTCCTCCTCCCTCTCCCCCGTCACACCCCTGCACC CCTCCTCCCTCTCCCCATCCCATCCCTGCACCCCTCCTCCCTCTGCCCCC GTCCCACCCCTAAACCCCTCCTCCCTCTGCCCCACCCCACCCTTGCACCC CTCCTCCCTCTTCCCC	NOS3	ENSG00000164867.11	transcript	ENST00000297494.8	protein_coding	3/26		INFO_REALIGN_3_PRIME	chr7	TogoVar
NOTCH1_chr9_136489433_136551048	136528378	A A	ATGGGCAG others(389): Show ATGGGCAGGGACAGTGGGGGGTGGGCAGGGACAGTGGGGGGGGATGGGCA GGGACAGTGCGGGGGGGATGGGCAGGGACGGTGAGGGGGGGATGGGCAGG GACGGTGAGGGGGGGATGGGCAGGGACAGTGAGGGGGATGGGCAGGGACA GTGGGGGGTGGGCAGGGACAGTGGGGGGTGGGCAGGGACAGTGGGGGGGA TGGGCAGGGACGGTGAGGGGGGGATGGGCAGGGACGGTGAGGGGGGGATG GGCAGGGATGGTGAGGGGGATGGGCAGGGACAGTGGGGGGTGGGCAGGGA CAGTGGGGGGTGGGCAGGGACAGTGGGGGGGGATGGGCAGGGACAGTGGG GGGGATGGGCAGGGACAGTGAGGGGGATGGGCAAGGACAGTGGGGGG	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG02109.hp2 HG02965.hp2 HG03471.hp2 others(1): Show HG02109.hp2 HG02965.hp2 HG03471.hp2 NA18906.hp2	a0001 a0001	a0001c0016 a0001c0058 a0001c0016 a0001c0058	a0001c0016t0012 a0001c0016t0020 a0001c0058t0021 a0001c0016t0012 a0001c0016t0020 a0001c0058t0021	a0001c0016t0012g0017 a0001c0016t0012g0021 a0001c0016t0020g0019 others(1): Show a0001c0016t0012g0017 a0001c0016t0012g0021 a0001c0016t0020g0019 a0001c0058t0021g0020	4	273	0.0147	396	c.141 others(413): Show c.141-4400_141-4399insCCCCCCACTGTCCTTGCCCATCCCCCTC ACTGTCCCTGCCCATCCCCCCCACTGTCCCTGCCCATCCCCCCCCACTGT CCCTGCCCACCCCCCACTGTCCCTGCCCACCCCCCACTGTCCCTGCCCAT CCCCCTCACCATCCCTGCCCATCCCCCCCTCACCGTCCCTGCCCATCCCC CCCTCACCGTCCCTGCCCATCCCCCCCACTGTCCCTGCCCACCCCCCACT GTCCCTGCCCACCCCCCACTGTCCCTGCCCATCCCCCTCACTGTCCCTGC CCATCCCCCCCTCACCGTCCCTGCCCATCCCCCCCTCACCGTCCCTGCCC ATCCCCCCCGCACTGTCCCTGCCCATCCCCCCCCACTGTCCCTGCCCACC CCCCACTGTCCCTGCCCA	NOTCH1	ENSG00000148400.13	transcript	ENST00000651671.1	protein_coding	2/33			chr9	TogoVar

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