Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr22:36816707	C C	T T	1	a0001c0001t0002g0060 a0001c0001t0002g0060	1	NA18952.hp1 NA18952.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.61+238G>A c.61+238G>A	PVALB	ENSG00000100362.13	transcript	ENST00000417718.7	protein_coding	1/3	chr22	36816707
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JoGo Online Haplotype Explorer PVALB_chr22_36795703_36822035

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 3)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 3)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 266)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 3)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 6)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 266)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 421)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 3)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 0)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 2)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 273)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)