Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr22:36816901	G G	T T	4	a0001c0001t0001g0029 a0001c0001t0001g0056 a0001c0001t0001g0057 others(1): Show a0001c0001t0001g0029 a0001c0001t0001g0056 a0001c0001t0001g0057 a0001c0001t0002g0055	5	HG00099.hp2 HG00735.hp1 HG01168.hp1 others(2): Show HG00099.hp2 HG00735.hp1 HG01168.hp1 HG01169.hp2 HG01346.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.61+44C>A c.61+44C>A	PVALB	ENSG00000100362.13	transcript	ENST00000417718.7	protein_coding	1/3	chr22	36816901

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PVALB_chr22_36795703_36822035 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

Coding Level Haplotype Info (Total: 3)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 6)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 253)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 421)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 3)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 0)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 2)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 272)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)