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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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regionname	pos	ref	alt	annotation	impact	samples	ahapids	achapids	acthapids	actghapids	ac	an	af	len	hgvs_c	hgvs_p	genename	geneid	featuretype	featureid	transcript_biotype	rank	cdna cdna pos length	cds cds pos length	aa aa pos length	status	chr	external
OR6K2_chr1_158694678_158705652	158700284	CAG CAG	C C	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	HG01891.hp2 HG02615.hp1 HG02615.hp2 others(2): Show HG01891.hp2 HG02615.hp1 HG02615.hp2 HG02886.hp2 HG03486.hp1	a0006 a0006	a0006c0008 a0006c0008	a0006c0008t0000 a0006c0008t0000	a0006c0008t0000g0000 a0006c0008t0000g0000	5	462	0.0108	-2	c.367 others(9): Show c.367_368delCT	p.Leu others(5): Show p.Leu123fs	OR6K2	ENSG00000196171.3	transcript	ENST00000359610.3	protein_coding	1/1	368/975	367/975	123/324		chr1	TogoVar
OR6Q1_chr11_58025953_58036906	58031636	AC AC	A A	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00741.hp2 others(25): Show HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00741.hp2 HG01069.hp2 HG01123.hp1 HG01167.hp1 HG01175.hp2 HG01192.hp1 HG01515.hp2 HG01884.hp2 HG01891.hp1 HG02258.hp1 HG02572.hp2 HG02630.hp1 HG02717.hp1 HG02723.hp1 HG02738.hp2 HG03098.hp1 HG03579.hp1 HG03654.hp2 HG04184.hp1 NA18747.hp2 NA18977.hp2 NA19063.hp1 NA19065.hp2 NA19067.hp2 NA19090.hp1 NA21309.hp2	a0004 a0004	a0004c0005 a0004c0005	a0004c0005t0000 a0004c0005t0000	a0004c0005t0000g0000 a0004c0005t0000g0000	28	416	0.0673	-1	c.685 others(4): Show c.685delC	p.Leu others(5): Show p.Leu229fs	OR6Q1	ENSG00000279051.5	transcript	ENST00000302622.4	protein_coding	1/1	685/954	685/954	229/317		chr11	TogoVar
OR7G3_chr19_9121012_9131950	9126022	G G	GATGGT GATGGT	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	HG00280.hp2 HG00408.hp1 HG00423.hp2 others(174): Show HG00280.hp2 HG00408.hp1 HG00423.hp2 HG00621.hp1 HG00621.hp2 HG00639.hp2 HG00673.hp1 HG00673.hp2 HG00733.hp2 HG00738.hp1 HG00738.hp2 HG01069.hp1 HG01069.hp2 HG01099.hp2 HG01109.hp2 HG01192.hp2 HG01256.hp2 HG01258.hp2 HG01261.hp2 HG01346.hp2 HG01433.hp1 HG01515.hp2 HG01517.hp1 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01891.hp1 HG01891.hp2 HG01928.hp1 HG01928.hp2 HG01952.hp2 HG01975.hp1 HG01993.hp2 HG02027.hp2 HG02040.hp2 HG02055.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp2 HG02071.hp2 HG02074.hp1 HG02083.hp1 HG02083.hp2 HG02109.hp2 HG02135.hp2 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02257.hp1 HG02257.hp2 HG02258.hp2 HG02280.hp1 HG02293.hp1 HG02300.hp2 HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02486.hp2 HG02559.hp2 HG02572.hp1 HG02572.hp2 HG02602.hp1 HG02615.hp1 HG02615.hp2 HG02622.hp1 HG02622.hp2 HG02630.hp1 HG02630.hp2 HG02647.hp2 HG02698.hp2 HG02717.hp1 HG02809.hp1 HG02809.hp2 HG02818.hp1 HG02818.hp2 HG02886.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp1 HG02895.hp2 HG02896.hp1 HG02897.hp1 HG02922.hp1 HG02922.hp2 HG02965.hp1 HG02965.hp2 HG02970.hp2 HG02976.hp1 HG02976.hp2 HG03017.hp1 HG03041.hp1 HG03041.hp2 HG03098.hp2 HG03130.hp2 HG03139.hp1 HG03139.hp2 HG03195.hp1 HG03195.hp2 HG03209.hp2 HG03225.hp1 HG03239.hp1 HG03239.hp2 HG03471.hp1 HG03471.hp2 HG03486.hp2 HG03491.hp1 HG03491.hp2 HG03492.hp1 HG03492.hp2 HG03516.hp2 HG03540.hp1 HG03579.hp1 HG03654.hp2 HG03669.hp1 HG03688.hp1 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG03704.hp2 HG03710.hp1 HG03927.hp2 HG03942.hp1 HG03942.hp2 HG04115.hp1 HG04184.hp1 HG04204.hp1 HG04228.hp2 NA18522.hp1 NA18747.hp1 NA18906.hp1 NA18906.hp2 NA18939.hp2 NA18944.hp2 NA18945.hp2 NA18947.hp1 NA18948.hp2 NA18951.hp2 NA18952.hp1 NA18954.hp1 NA18957.hp2 NA18960.hp2 NA18962.hp1 NA18964.hp1 NA18966.hp1 NA18968.hp1 NA18970.hp2 NA18971.hp1 NA18973.hp2 NA18974.hp2 NA18977.hp2 NA18979.hp2 NA18980.hp1 NA18980.hp2 NA18981.hp1 NA18982.hp2 NA18983.hp1 NA18984.hp2 NA18986.hp2 NA18988.hp1 NA18993.hp2 NA18995.hp2 NA18997.hp1 NA18997.hp2 NA18998.hp2 NA19000.hp2 NA19003.hp2 NA19006.hp1 NA19007.hp1 NA19009.hp1 NA19011.hp2 NA19012.hp2 NA19054.hp2 NA19055.hp1 NA19055.hp2 NA19059.hp1 NA19064.hp1 NA19074.hp2 NA19075.hp1 NA19087.hp1 NA19240.hp2 NA20129.hp2 NA20300.hp2 NA20905.hp2	a0000 a0002 a0003 others(1): Show a0000 a0002 a0003 a0005	a0000c0002 a0000c0007 a0000c0014 others(3): Show a0000c0002 a0000c0007 a0000c0014 a0002c0003 a0003c0004 a0005c0006	a0000c0002t0000 a0000c0007t0000 a0000c0014t0000 others(3): Show a0000c0002t0000 a0000c0007t0000 a0000c0014t0000 a0002c0003t0000 a0003c0004t0000 a0005c0006t0000	a0000c0002t0000g0000 a0000c0007t0000g0000 a0000c0014t0000g0000 others(3): Show a0000c0002t0000g0000 a0000c0007t0000g0000 a0000c0014t0000g0000 a0002c0003t0000g0000 a0003c0004t0000g0000 a0005c0006t0000g0000	177	402	0.4403	5	c.924 others(12): Show c.924_928dupACCAT	p.Ser others(5): Show p.Ser310fs	OR7G3	ENSG00000170920.2	transcript	ENST00000305444.2	protein_coding	1/1	928/939	928/939	310/312		chr19	TogoVar
OR7G3_chr19_9121012_9131950	9126240	AG AG	A A	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	HG00280.hp2 HG00738.hp1 HG01069.hp1 others(23): Show HG00280.hp2 HG00738.hp1 HG01069.hp1 HG01928.hp1 HG01928.hp2 HG01993.hp2 HG02257.hp2 HG02280.hp1 HG02293.hp1 HG02300.hp2 HG02717.hp1 HG02809.hp1 HG02818.hp1 HG02922.hp1 HG03041.hp2 HG03195.hp1 HG03195.hp2 HG03516.hp2 HG03579.hp1 HG03688.hp1 HG03704.hp2 HG03942.hp2 NA18522.hp1 NA18964.hp1 NA19006.hp1 NA19064.hp1	a0002 a0002	a0002c0003 a0002c0003	a0002c0003t0000 a0002c0003t0000	a0002c0003t0000g0000 a0002c0003t0000g0000	26	402	0.0647	-1	c.710 others(4): Show c.710delC	p.Ala others(5): Show p.Ala237fs	OR7G3	ENSG00000170920.2	transcript	ENST00000305444.2	protein_coding	1/1	710/939	710/939	237/312		chr19	TogoVar
OR8B3_chr11_124390534_124404024	124396801	A A	AG AG	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	HG01167.hp2 HG01169.hp1 HG01255.hp1 others(8): Show HG01167.hp2 HG01169.hp1 HG01255.hp1 HG01346.hp1 HG01496.hp2 HG03017.hp2 HG03704.hp1 HG03927.hp1 HG04199.hp2 HG04204.hp2 NA20805.hp2	a0005 a0005	a0005c0005 a0005c0020 a0005c0005 a0005c0020	a0005c0005t0001 a0005c0020t0001 a0005c0005t0001 a0005c0020t0001	a0005c0005t0001g0007 a0005c0020t0001g0042 a0005c0005t0001g0007 a0005c0020t0001g0042	11	452	0.0243	1	c.550 others(4): Show c.550dupC	p.Leu others(5): Show p.Leu184fs	OR8B3	ENSG00000284609.2	transcript	ENST00000641139.1	protein_coding	2/2	902/2170	550/942	184/313		chr11	TogoVar
OR8D4_chr11_123897167_123914229	123906734	G G	GT GT	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	HG01167.hp2 HG02647.hp2 HG02723.hp1 others(5): Show HG01167.hp2 HG02647.hp2 HG02723.hp1 HG02970.hp2 HG06807.hp1 NA19030.hp2 NA20129.hp1 NA20300.hp1	a0008 a0008	a0008c0008 a0008c0012 a0008c0008 a0008c0012	a0008c0008t0002 a0008c0008t0010 a0008c0008t0020 others(1): Show a0008c0008t0002 a0008c0008t0010 a0008c0008t0020 a0008c0012t0002	a0008c0008t0002g0013 a0008c0008t0002g0017 a0008c0008t0002g0018 others(3): Show a0008c0008t0002g0013 a0008c0008t0002g0017 a0008c0008t0002g0018 a0008c0008t0010g0013 a0008c0008t0020g0017 a0008c0012t0002g0013	8	450	0.0178	1	c.311 others(4): Show c.311dupT	p.Cys others(5): Show p.Cys105fs	OR8D4	ENSG00000181518.4	transcript	ENST00000641687.1	protein_coding	2/2	418/2904	312/945	104/314	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr11	TogoVar
OR8G1_chr11_124236095_124259364	124249871	CT CT	C C	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	HG01891.hp1 HG02145.hp1 HG02723.hp1 others(4): Show HG01891.hp1 HG02145.hp1 HG02723.hp1 HG02965.hp1 HG03486.hp1 NA18906.hp2 NA21309.hp2	a0004 a0004	a0004c0006 a0004c0006	a0004c0006t0003 a0004c0006t0014 a0004c0006t0036 others(1): Show a0004c0006t0003 a0004c0006t0014 a0004c0006t0036 a0004c0006t0041	a0004c0006t0003g0056 a0004c0006t0014g0014 a0004c0006t0036g0014 others(1): Show a0004c0006t0003g0056 a0004c0006t0014g0014 a0004c0006t0036g0014 a0004c0006t0041g0055	7	430	0.0163	-1	c.197 others(4): Show c.197delT	p.Leu others(4): Show p.Leu66fs	OR8G1	ENSG00000197849.7	transcript	ENST00000641972.1	protein_coding	3/3	563/5055	197/936	66/311		chr11	TogoVar
OR8G1_chr11_124236095_124259364	124250538	TGATTTAT others(844): Show TGATTTATAGCCTGAGGAATAAAGATGTCCATGTTTCCCTGAAGAAAATG CTACAGAGAAGAACATTATTGTAAACAGTAATAATAAGAAGATGATATAT TAATCCTAAGTAGTGGACTGTTACATTGTATGAATGGATGTCTTTCACTT TAATGCATCTGTCAATAATTTTTACCATTTGGTGAGATTATATTACCATT ATTTTTTCATTTCATGACCCTTTGATGTCATTTCCCATGTGGGGTTTTAA CTCATATGTATCAATGAGACACAAATTAATATAAATACTAAAATCGACAT GAGTACATAGACTCATTAATGCCAGCCCCATGTTCTTACCTCTTTTCTTT TACACAATTGATAAAATTCAGCTCAGTTCTCAACCATAATGAAAATACCA TCTTCCAAAAGTGATACCAATCTCCCTTATTCTGTCTTTTCAATAACAAC ATAAATTATTGCAATATGATAGCTGTAATTTTAGCCTGCAGCAATCTCTT TTCTGCCTTATTCATCTATTTACCTCATTTGTCTGCTGTATTTCTTCTTT AGCAACATAATCAAAATTTCAGAATATAAGTTACATATCCGTGTATGTGT TATAATTGTGCAATCCAATATATCATCTGCTTTGCATTTTCCTATTCTAG TTTGTACTTGCCTTCAACCTACACTGGACTTCAGTCTTCATGAAGATTCC CCCGTACATGTGGTTTATTGCCACGTCTCCAGCGTCTATCATAGTTCTTG CCACCTTAGGTCCTTGAAAGCTTTTTTATTATTTCCTCATTTAAGCTAAG TATAGGAAAGCCATATGTATGTCATACTTACTTTATCTATTTATCTCTCG AA	T T	frameshift_variant others(1): Show frameshift_variant 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OR8H3_chr11_56117373_56128311	56122412	ATCCTTAC others(3): Show ATCCTTACGGG	A A	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	HG02630.hp2 HG02630.hp2	a0015 a0015	a0015c0013 a0015c0013	a0015c0013t0000 a0015c0013t0000	a0015c0013t0000g0000 a0015c0013t0000g0000	1	415	0.0024	-10	c.41_ others(15): Show c.41_50delTCCTTACGGG	p.Ile others(4): Show p.Ile14fs	OR8H3	ENSG00000181761.5	transcript	ENST00000313472.3	protein_coding	1/1	41/939	41/939	14/312		chr11	TogoVar
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OR8J3_chr11_56129721_56145201	56137716	CATGTCAG others(9): Show CATGTCAGAGTTTGGAA	C C	frameshift_variant others(1): Show frameshift_variant start_lost	HIGH	HG01169.hp2 HG01169.hp2	a0009 a0009	a0009c0010 a0009c0010	a0009c0010t0029 a0009c0010t0029	a0009c0010t0029g0044 a0009c0010t0029g0044	1	412	0.0024	-16	c.-14 others(21): Show c.-14_2delTTCCAAACTCTGACAT	p.Met others(3): Show p.Met1fs	OR8J3	ENSG00000167822.3	transcript	ENST00000642058.1	protein_coding	2/2	810/3806	1/948	1/315		chr11	TogoVar
OR8U1_chr11_56370624_56381553	56376094	A A	ATTTCACA others(7591): Show ATTTCACACCATCCTCACCTTCCGCCTCTCCTATTGCCACTCCAACATTG TCAACCATTTCTATTGTGATGACATGCCTCTCCTCAGGCTAACTTGCTCA GACACTCGCTTCAAACAGCTATGGATTTTGGCCTGTGCTGGTATCACATT CATCTGCTCTGTTCTGATTGTCTTTGTCTCCTACATGTTCATTATTTTTG CCATCCTGAGGATGAGCTCAGCTGAAGGAAGACGCAAAGCCTTCTCCACC TGTAGCTCTCACATGCTGGCAGTCACCATATTCTATGGCACCCTGATCTT TATGTACTTACAACCAAGCTCAAGCCATTCTCTTGATGCAGACAAGATGG CCTCTGTCTTCTACACGGTGATTATTCCCATGTTGAATCCCTTGATTTAC AGTCTCAGGAACAAAGATGTAAAAGATGCCCTGAAGAAAGTCATCATCAA TAGAAACCATGCTTTTATTTTTCTGAAACTGAGAAAATGAGTTCAATAGA CAAAAATGGGCATTCCTTCATAACCAGGTTTTCCCCCACATTAATAAAAC TATTGGAATACCTTGCTCTTAATTGGTAAGCAATAAAGATCTGTTTACTG AAAAAATTATTCTTTGCATTTTTGTAATTTTTTTGACTTAAAACCATATT TCATATGTAGAAAGTACCATAAGAATTTACATCATTTCTCACAGGAAAAA TGTATTTTTAAAATGTATTATCTCATCTGATAGTTATACAATTAGGTGCT GCCAGGAATAGAAAAAATGAAAGCACTCTGAATGCCCAGTTCAGAGTTCT TTAACAATATGTTAAGACTATTTTATAGTATATTTAAAATTAAATTTAAT AATATTTAATTAAATTACCTGCAACAGTGTCTCTACATAGAGGTAATTTT 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GAATTTTGATGGAAAACATCATGGACTATATTGTAAAAGGTCATGTATAA TATTTTTTCAAATATAATGTACATTCTACCTTTGAGATGAGATAAAGTGG TACTTCAAGGTGAGATAATAAATGTCTTATAGTTGTCAAACAGTGCAGCC TTACCTGAAATCTCCAGACATGAAAACTAAATTTCCTATCAAATTGTTGC TTAATCATCTCAAAACAAAATTTATGTATTTGTATGAACACCAAAAAGTC TTTAAAAACTTTGATGATGCACATATTTCATGTAACAATAAGCAGCAGCA GCAGTAATAATAAATATTATCTGTTGTTATCTTCTTCATAGAAAGTGGTA GAAACATACATGCACACATACTCAAAAATATTCATTTTTGATTTTCATGT CCATGATTTATAAAGAACATCTAAATTTTCCTGATATATTCCCCTGCTGT TTCCTGAAATAATAAAAATATATCAATTAGGTTTCTTTTGTTAATTTATT ATTTGCTGAGATTATATTTCAGGAACTAAAATTTTAAGACACTTTTCTCT GTATTCAACTTAAAAGGTACATTACGTGTAAAAGTTTACCTATACCTATC TACTTGCATTACTTAAGGATTTTCCATGTGTTCTTACTTTTTTGTATTTA TTTCCTCAGACTTTTCTATGTTCAAGGCCTAGAGGTATATTACCTTGACC ACCCATACATACTATGTATGTAGAAGTCAGCATAATCACTTTTAAAATTC ATTGACAGCTGGGTGGTAAAGTGATTCTGCTGACTTATACATACGTGTAA CTTTTAATACATCAGGGAAGCAAGTTTTATGGTTTAATATTATTTTCTAA TTTAAAATATATTTATACCTGTTATGTGCAGGAGATAACTTTCTTTTGAT AGTAACAATGATTATTTCAGATAGAAAATAACACCTTTTATAGATTAGGA 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OS9_chr12_57689132_57726557	57720435	TGGGCTGA others(3): Show TGGGCTGAAGG	T T	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	NA18997.hp2 NA18997.hp2	a0005 a0005	a0005c0008 a0005c0008	a0005c0008t0001 a0005c0008t0001	a0005c0008t0001g0163 a0005c0008t0001g0163	1	352	0.0028	-10	c.179 others(19): Show c.1797_1806delGGCTGAAGGG	p.Trp others(5): Show p.Trp599fs	OS9	ENSG00000135506.17	transcript	ENST00000315970.12	protein_coding	14/15	1827/2682	1797/2004	599/667	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr12	TogoVar
OSBPL10_chr3_31655825_31986262	31981141	A A	AC AC	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	HG01175.hp1 HG01175.hp2 HG01255.hp2 others(14): Show HG01175.hp1 HG01175.hp2 HG01255.hp2 HG02109.hp1 HG02486.hp1 HG02809.hp2 HG03098.hp2 HG03209.hp1 HG04184.hp1 NA18940.hp1 NA18966.hp1 NA18966.hp2 NA18969.hp1 NA19030.hp1 NA19030.hp2 NA19063.hp1 NA19086.hp2	a0003 a0003	a0003c0008 a0003c0011 a0003c0013 others(8): Show a0003c0008 a0003c0011 a0003c0013 a0003c0015 a0003c0016 a0003c0017 a0003c0018 a0003c0019 a0003c0020 a0003c0021 a0003c0022	a0003c0008t0001 a0003c0008t0002 a0003c0011t0004 others(11): Show a0003c0008t0001 a0003c0008t0002 a0003c0011t0004 a0003c0011t0005 a0003c0013t0001 a0003c0013t0002 a0003c0015t0002 a0003c0016t0005 a0003c0017t0001 a0003c0018t0002 a0003c0019t0001 a0003c0020t0001 a0003c0021t0002 a0003c0022t0003	a0003c0008t0001g0001 a0003c0008t0001g0006 a0003c0008t0002g0005 others(14): Show a0003c0008t0001g0001 a0003c0008t0001g0006 a0003c0008t0002g0005 a0003c0008t0002g0008 a0003c0011t0004g0003 a0003c0011t0004g0014 a0003c0011t0005g0162 a0003c0013t0001g0011 a0003c0013t0002g0012 a0003c0015t0002g0009 a0003c0016t0005g0161 a0003c0017t0001g0004 a0003c0018t0002g0002 a0003c0019t0001g0007 a0003c0020t0001g0010 a0003c0021t0002g0013 a0003c0022t0003g0160	17	186	0.0914	1	c.38d others(3): Show c.38dupG	p.Ser others(4): Show p.Ser14fs	OSBPL10	ENSG00000144645.16	transcript	ENST00000396556.7	protein_coding	1/12	121/3625	38/2295	13/764		chr3	TogoVar
OSTM1_chr6_108036409_108079741	108074299	A A	AG AG	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	HG01175.hp1 HG01175.hp2 HG01517.hp2 others(7): Show HG01175.hp1 HG01175.hp2 HG01517.hp2 HG01978.hp2 HG02135.hp2 HG02148.hp1 NA18978.hp1 NA18987.hp1 NA19083.hp2 NA19086.hp1	a0003 a0003	a0003c0004 a0003c0004	a0003c0004t0001 a0003c0004t0004 a0003c0004t0005 others(2): Show a0003c0004t0001 a0003c0004t0004 a0003c0004t0005 a0003c0004t0011 a0003c0004t0022	a0003c0004t0001g0049 a0003c0004t0001g0050 a0003c0004t0001g0051 others(7): Show a0003c0004t0001g0049 a0003c0004t0001g0050 a0003c0004t0001g0051 a0003c0004t0001g0054 a0003c0004t0001g0056 a0003c0004t0001g0057 a0003c0004t0004g0055 a0003c0004t0005g0053 a0003c0004t0011g0052 a0003c0004t0022g0048	10	388	0.0258	1	c.352 others(4): Show c.352dupC	p.Leu others(5): Show p.Leu118fs	OSTM1	ENSG00000081087.16	transcript	ENST00000193322.8	protein_coding	1/6	442/4471	352/1005	118/334		chr6	TogoVar
OSTN_chr3_191194241_191270615	191250077	ATGGATCG others(6): Show ATGGATCGGATTGG	A A	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	HG01978.hp1 HG01978.hp1	a0000 a0000	a0000c0003 a0000c0003	a0000c0003t0002 a0000c0003t0002	a0000c0003t0002g0085 a0000c0003t0002g0085	1	402	0.0025	-13	c.360 others(20): Show c.360_372delGGATCGGATTGGT	p.Met others(5): Show p.Met120fs	OSTN	ENSG00000188729.7	transcript	ENST00000682035.1	protein_coding	4/5	427/3231	360/402	120/133	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr3	TogoVar
OTOL1_chr3_161491808_161508942	161503363	C C	CTCTCACA others(4): Show CTCTCACAAAGA	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	HG00642.hp1 HG00642.hp1	a0007 a0007	a0007c0010 a0007c0010	a0007c0010t0000 a0007c0010t0000	a0007c0010t0000g0001 a0007c0010t0000g0001	1	450	0.0022	11	c.855 others(18): Show c.855_856insTCTCACAAAGA	p.Lys others(5): Show p.Lys286fs	OTOL1	ENSG00000182447.4	transcript	ENST00000327928.4	protein_coding	4/4	856/1434	856/1434	286/477		chr3	TogoVar
OTOL1_chr3_161491808_161508942	161503480	GAAGGGCT others(9): Show GAAGGGCTCTCGGGGCT	G G	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	HG00642.hp1 HG00642.hp1	a0007 a0007	a0007c0010 a0007c0010	a0007c0010t0000 a0007c0010t0000	a0007c0010t0000g0001 a0007c0010t0000g0001	1	450	0.0022	-16	c.973 others(23): Show c.973_988delAAGGGCTCTCGGGGCT	p.Lys others(5): Show p.Lys325fs	OTOL1	ENSG00000182447.4	transcript	ENST00000327928.4	protein_coding	4/4	973/1434	973/1434	325/477		chr3	TogoVar
OTOP3_chr17_74930898_74954992	74949336	G G	GATTAGGC others(31): Show GATTAGGCGAGAACTCAGGCGTACTTTGTGAAGGTACTT	frameshift_variant others(1): Show frameshift_variant stop_gained	HIGH	NA18954.hp1 NA18954.hp1	a0015 a0015	a0015c0027 a0015c0027	a0015c0027t0001 a0015c0027t0001	a0015c0027t0001g0287 a0015c0027t0001g0287	1	468	0.0021	38	c.165 others(47): Show c.1657_1658insATTAGGCGAGAACTCAGGCGTACTTTGTGAAGGTAC TT	p.Val others(5): Show p.Val553fs	OTOP3	ENSG00000182938.7	transcript	ENST00000328801.6	protein_coding	7/7	1682/2337	1658/1737	553/578		chr17	TogoVar
OTUB1_chr11_63981438_64003412	63997203	TTCATCGA others(203): Show TTCATCGAGGGTGGACGGACTGTCAAGGAGTTCTGCCAGCAGGTGCCGTC CCCCTCCCCTTTACTCTCGGCCGGGGGAGTGCAGTGGGCCCACAGGGCCT GGGGCGGGGTGCGGAGACCAGGGCCTGACCGGCACCTGTGCCACAGGAGG TGGAGCCCATGTGCAAGGAGAGCGACCACATCCACATCATTGCGCTGGCC CAGGCCCTCAG	T T	frameshift_variant others(1): Show frameshift_variant stop_lost	HIGH	HG03654.hp2 HG03654.hp2	a0000 a0000	a0000c0003 a0000c0003	a0000c0003t0001 a0000c0003t0001	a0000c0003t0001g0103 a0000c0003t0001g0103	1	330	0.0030	-210	c.578 others(7): Show c.578_683del	p.Phe others(5): Show p.Phe193fs	OTUB1	ENSG00000167770.13	transcript	ENST00000538426.6	protein_coding	6/7	597/1701	578/816	193/271		chr11	TogoVar
OTUD5_chrX_48917024_48962607	48923710	G G	GC GC	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	NA18994.hp1 NA18994.hp1	a0004 a0004	a0004c0008 a0004c0008	a0004c0008t0001 a0004c0008t0001	a0004c0008t0001g0125 a0004c0008t0001g0125	1	266	0.0038	1	c.150 others(5): Show c.1501dupG	p.Ala others(5): Show p.Ala501fs	OTUD5	ENSG00000068308.15	transcript	ENST00000376488.8	protein_coding	8/9	1538/2888	1501/1701	501/566		chrX	TogoVar
OTUD5_chrX_48917024_48962607	48923897	TG TG	T T	frameshift_variant frameshift_variant	HIGH	NA19075.hp1 NA19075.hp1	a0005 a0005	a0005c0007 a0005c0007	a0005c0007t0010 a0005c0007t0010	a0005c0007t0010g0201 a0005c0007t0010g0201	1	266	0.0038	-1	c.141 others(5): Show c.1418delC	p.Pro others(5): Show p.Pro473fs	OTUD5	ENSG00000068308.15	transcript	ENST00000376488.8	protein_coding	7/9	1455/2888	1418/1701	473/566		chrX	TogoVar

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