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Search Genic Haplotype Catalog

Haplotypefield

Choose the ACTG layer used to define haplotypes.

Genename

e.g. ALDH2, HBB.

Chr

Chromosome number (1-22, X, Y).

GRCh38

1 = haplotype type matches GRCh38; 0 = does not match.

Chm13v2

1 = haplotype type matches CHM13v2; 0 = does not match.

Gpopname

Filter by superpopulation group.

Popname

Filter by population group.

Total

Minimum number of hits (≥).

Start

Start coordinate (GRCh38).

End

End coordinate (GRCh38).

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regionname	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	ghapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	genename	chr	start	end
CES1_chr16_55797851_55838096	0/0	g0076	1	0	0	1	0	0	CES1	chr16	55797851	55838096
CES1_chr16_55797851_55838096	0/0	g0077	1	0	0	1	0	0	CES1	chr16	55797851	55838096
CES1_chr16_55797851_55838096	0/0	g0078	1	0	0	1	0	0	CES1	chr16	55797851	55838096
CES1_chr16_55797851_55838096	0/0	g0079	1	1	0	0	0	0	CES1	chr16	55797851	55838096
CES1_chr16_55797851_55838096	0/0	g0080	1	1	0	0	0	0	CES1	chr16	55797851	55838096
CES1_chr16_55797851_55838096	0/0	g0081	1	0	1	0	0	0	CES1	chr16	55797851	55838096
CES1_chr16_55797851_55838096	0/0	g0082	1	1	0	0	0	0	CES1	chr16	55797851	55838096
CES1_chr16_55797851_55838096	0/0	g0083	1	1	0	0	0	0	CES1	chr16	55797851	55838096
CES2_chr16_66930516_66950096	1/1	g0001	133	18	26	63	5	19	CES2	chr16	66930516	66950096
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CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0003	23	0	4	19	0	0	CES2	chr16	66930516	66950096
CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0004	23	14	3	5	1	0	CES2	chr16	66930516	66950096
CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0005	21	0	1	20	0	0	CES2	chr16	66930516	66950096
CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0006	21	15	1	0	0	5	CES2	chr16	66930516	66950096
CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0007	11	11	0	0	0	0	CES2	chr16	66930516	66950096
CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0008	8	8	0	0	0	0	CES2	chr16	66930516	66950096
CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0009	5	5	0	0	0	0	CES2	chr16	66930516	66950096
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CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0011	4	1	0	3	0	0	CES2	chr16	66930516	66950096
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CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0018	2	0	2	0	0	0	CES2	chr16	66930516	66950096
CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0019	2	0	0	1	0	1	CES2	chr16	66930516	66950096
CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0020	2	0	0	2	0	0	CES2	chr16	66930516	66950096
CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0021	2	0	0	0	0	2	CES2	chr16	66930516	66950096
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CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0040	1	0	0	0	0	1	CES2	chr16	66930516	66950096
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CES2_chr16_66930516_66950096	0/0	g0042	1	0	0	0	1	0	CES2	chr16	66930516	66950096