JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Search Genic Haplotype Catalog

Haplotypefield

Choose the ACTG layer used to define haplotypes.

Genename

e.g. ALDH2, HBB.

Chr

Chromosome number (1-22, X, Y).

GRCh38

1 = haplotype type matches GRCh38; 0 = does not match.

Chm13v2

1 = haplotype type matches CHM13v2; 0 = does not match.

Gpopname

Filter by superpopulation group.

Popname

Filter by population group.

Total

Minimum number of hits (≥).

Start

Start coordinate (GRCh38).

End

End coordinate (GRCh38).

Sort By

Choose a field to sort by.

Order by

Ascending / Descending.

Show

Results per page.

regionname	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	ghapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	genename	chr	start	end
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0314	1	0	0	1	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0315	1	0	0	1	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0316	1	0	0	1	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0317	1	1	0	0	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0318	1	1	0	0	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0319	1	1	0	0	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0320	1	1	0	0	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0321	1	1	0	0	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0322	1	1	0	0	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0323	1	1	0	0	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0324	1	1	0	0	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0325	1	1	0	0	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0326	1	1	0	0	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0327	1	0	0	1	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1A_chr15_64906902_64963691	0/0	g0328	1	0	0	1	0	0	ANKDD1A	chr15	64906902	64963691
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0001	8	0	6	1	1	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0002	5	0	3	1	0	1	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0003	5	0	0	5	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0004	4	4	0	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0005	3	0	0	3	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0006	3	0	0	3	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0007	2	1	1	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0008	2	0	0	2	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0009	2	0	1	0	0	1	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0010	2	0	0	2	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0011	2	0	0	2	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0012	2	0	0	2	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0013	2	0	0	2	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0014	2	0	1	0	0	1	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0015	2	0	0	0	2	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0016	2	2	0	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0017	2	2	0	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0018	2	1	1	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0019	2	0	0	2	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0020	2	1	1	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0021	2	0	2	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0022	2	0	0	2	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0023	2	0	0	2	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0024	2	0	0	2	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0025	2	0	0	2	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0026	2	0	0	2	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0027	2	0	0	2	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0028	2	0	0	2	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0029	1	1	0	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0030	1	1	0	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0031	1	0	1	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0032	1	1	0	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0033	1	1	0	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0034	1	1	0	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846
ANKDD1B_chr5_75606453_75676846	0/0	g0035	1	1	0	0	0	0	ANKDD1B	chr5	75606453	75676846