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Search Genic Haplotype Catalog

Haplotypefield

Choose the ACTG layer used to define haplotypes.

Genename

e.g. ALDH2, HBB.

Chr

Chromosome number (1-22, X, Y).

GRCh38

1 = haplotype type matches GRCh38; 0 = does not match.

Chm13v2

1 = haplotype type matches CHM13v2; 0 = does not match.

Gpopname

Filter by superpopulation group.

Popname

Filter by population group.

Total

Minimum number of hits (≥).

Start

Start coordinate (GRCh38).

End

End coordinate (GRCh38).

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regionname	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	ghapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	genename	chr	start	end
ANKRD36_chr2_97108153_97269521	0/0	g0207	1	0	1	0	0	0	ANKRD36	chr2	97108153	97269521
ANKRD36_chr2_97108153_97269521	0/0	g0208	1	0	0	1	0	0	ANKRD36	chr2	97108153	97269521
ANKRD36_chr2_97108153_97269521	0/0	g0209	1	1	0	0	0	0	ANKRD36	chr2	97108153	97269521
ANKRD36_chr2_97108153_97269521	0/0	g0210	1	1	0	0	0	0	ANKRD36	chr2	97108153	97269521
ANKRD36_chr2_97108153_97269521	0/0	g0211	1	1	0	0	0	0	ANKRD36	chr2	97108153	97269521
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0001	141	19	33	61	9	19	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	1/0	g0002	34	16	6	3	2	6	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0003	31	12	1	14	0	4	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0004	23	18	2	0	0	3	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0005	21	0	0	18	0	3	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0006	18	8	8	0	0	2	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0007	9	1	4	3	0	1	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
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ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0009	3	3	0	0	0	0	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0010	3	0	0	0	1	2	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0011	2	1	0	0	0	1	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0012	2	2	0	0	0	0	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
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ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0019	1	0	0	0	0	1	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/1	g0020	1	0	0	0	0	0	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0021	1	0	0	0	0	1	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0022	1	0	1	0	0	0	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
ANKRD37_chr4_185391841_185405241	0/0	g0023	1	1	0	0	0	0	ANKRD37	chr4	185391841	185405241
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