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Search Genic Haplotype Catalog

Haplotypefield

Choose the ACTG layer used to define haplotypes.

Genename

e.g. ALDH2, HBB.

Chr

Chromosome number (1-22, X, Y).

GRCh38

1 = haplotype type matches GRCh38; 0 = does not match.

Chm13v2

1 = haplotype type matches CHM13v2; 0 = does not match.

Gpopname

Filter by superpopulation group.

Popname

Filter by population group.

Total

Minimum number of hits (≥).

Start

Start coordinate (GRCh38).

End

End coordinate (GRCh38).

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regionname	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	ghapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	genename	chr	start	end
ANKRD39_chr2_96842990_96863016	0/0	g0010	7	7	0	0	0	0	ANKRD39	chr2	96842990	96863016
ANKRD39_chr2_96842990_96863016	0/0	g0011	6	2	0	4	0	0	ANKRD39	chr2	96842990	96863016
ANKRD39_chr2_96842990_96863016	0/0	g0012	6	0	0	6	0	0	ANKRD39	chr2	96842990	96863016
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ANKRD39_chr2_96842990_96863016	0/0	g0014	5	4	0	1	0	0	ANKRD39	chr2	96842990	96863016
ANKRD39_chr2_96842990_96863016	0/0	g0015	5	0	0	5	0	0	ANKRD39	chr2	96842990	96863016
ANKRD39_chr2_96842990_96863016	0/0	g0016	4	4	0	0	0	0	ANKRD39	chr2	96842990	96863016
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ANKRD39_chr2_96842990_96863016	0/0	g0057	1	0	0	1	0	0	ANKRD39	chr2	96842990	96863016
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