JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Search Genic Haplotype Catalog

Haplotypefield

Choose the ACTG layer used to define haplotypes.

Genename

e.g. ALDH2, HBB.

Chr

Chromosome number (1-22, X, Y).

GRCh38

1 = haplotype type matches GRCh38; 0 = does not match.

Chm13v2

1 = haplotype type matches CHM13v2; 0 = does not match.

Gpopname

Filter by superpopulation group.

Popname

Filter by population group.

Total

Minimum number of hits (≥).

Start

Start coordinate (GRCh38).

End

End coordinate (GRCh38).

Sort By

Choose a field to sort by.

Order by

Ascending / Descending.

Show

Results per page.

regionname	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	ghapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	genename	chr	start	end
ANKRD53_chr2_70973630_70990499	0/0	g0060	1	0	1	0	0	0	ANKRD53	chr2	70973630	70990499
ANKRD53_chr2_70973630_70990499	0/0	g0061	1	0	0	1	0	0	ANKRD53	chr2	70973630	70990499
ANKRD53_chr2_70973630_70990499	0/0	g0062	1	0	0	0	1	0	ANKRD53	chr2	70973630	70990499
ANKRD53_chr2_70973630_70990499	0/0	g0063	1	0	0	0	0	1	ANKRD53	chr2	70973630	70990499
ANKRD53_chr2_70973630_70990499	0/0	g0064	1	1	0	0	0	0	ANKRD53	chr2	70973630	70990499
ANKRD53_chr2_70973630_70990499	0/0	g0065	1	0	0	1	0	0	ANKRD53	chr2	70973630	70990499
ANKRD53_chr2_70973630_70990499	0/0	g0066	1	0	0	1	0	0	ANKRD53	chr2	70973630	70990499
ANKRD53_chr2_70973630_70990499	0/0	g0067	1	1	0	0	0	0	ANKRD53	chr2	70973630	70990499
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0001	49	9	3	28	2	7	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0002	22	1	14	4	1	2	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0003	12	0	7	3	1	1	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0004	11	0	1	10	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0005	10	0	2	6	1	1	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0006	9	1	1	7	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0007	8	4	0	0	3	1	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0008	6	0	1	3	0	2	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0009	5	0	1	4	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0010	5	0	3	1	0	1	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0011	5	0	1	3	0	1	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0012	4	0	0	4	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0013	4	1	1	2	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	1/0	g0014	4	0	1	1	0	1	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0015	4	1	0	0	1	2	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0016	4	0	1	3	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0017	3	0	2	0	1	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0018	3	0	0	0	0	3	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0019	3	2	1	0	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0020	3	1	0	2	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0021	3	3	0	0	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/1	g0022	2	0	1	0	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0023	2	0	0	2	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0024	2	0	0	2	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0025	2	0	1	1	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0026	2	1	1	0	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0027	2	0	1	0	1	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0028	2	0	1	0	0	1	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0029	2	2	0	0	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0030	2	2	0	0	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0031	2	0	1	1	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0032	2	0	0	2	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0033	2	0	0	2	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0034	2	2	0	0	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0035	2	1	1	0	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0036	2	0	0	0	1	1	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0037	2	0	0	2	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0038	2	0	0	2	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0039	2	2	0	0	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0040	2	2	0	0	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0041	2	2	0	0	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334
ANKRD54_chr22_37825855_37849334	0/0	g0042	2	2	0	0	0	0	ANKRD54	chr22	37825855	37849334