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Search Genic Haplotype Catalog

Haplotypefield

Choose the ACTG layer used to define haplotypes.

Genename

e.g. ALDH2, HBB.

Chr

Chromosome number (1-22, X, Y).

GRCh38

1 = haplotype type matches GRCh38; 0 = does not match.

Chm13v2

1 = haplotype type matches CHM13v2; 0 = does not match.

Gpopname

Filter by superpopulation group.

Popname

Filter by population group.

Total

Minimum number of hits (≥).

Start

Start coordinate (GRCh38).

End

End coordinate (GRCh38).

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regionname	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	ghapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	genename	chr	start	end
ANKRD60_chr20_58211126_58233653	0/0	g0182	1	0	0	1	0	0	ANKRD60	chr20	58211126	58233653
ANKRD60_chr20_58211126_58233653	0/0	g0183	1	1	0	0	0	0	ANKRD60	chr20	58211126	58233653
ANKRD60_chr20_58211126_58233653	0/0	g0184	1	0	1	0	0	0	ANKRD60	chr20	58211126	58233653
ANKRD60_chr20_58211126_58233653	0/0	g0185	1	0	0	0	0	1	ANKRD60	chr20	58211126	58233653
ANKRD60_chr20_58211126_58233653	0/0	g0186	1	0	1	0	0	0	ANKRD60	chr20	58211126	58233653
ANKRD60_chr20_58211126_58233653	0/0	g0187	1	1	0	0	0	0	ANKRD60	chr20	58211126	58233653
ANKRD60_chr20_58211126_58233653	0/0	g0188	1	1	0	0	0	0	ANKRD60	chr20	58211126	58233653
ANKRD60_chr20_58211126_58233653	0/0	g0189	1	0	1	0	0	0	ANKRD60	chr20	58211126	58233653
ANKRD60_chr20_58211126_58233653	0/0	g0190	1	1	0	0	0	0	ANKRD60	chr20	58211126	58233653
ANKRD60_chr20_58211126_58233653	0/0	g0191	1	1	0	0	0	0	ANKRD60	chr20	58211126	58233653
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ANKRD61_chr7_6026376_6041552	0/0	g0032	1	0	0	0	0	1	ANKRD61	chr7	6026376	6041552
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