JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Search Genic Haplotype Catalog

Haplotypefield

Choose the ACTG layer used to define haplotypes.

Genename

e.g. ALDH2, HBB.

Chr

Chromosome number (1-22, X, Y).

GRCh38

1 = haplotype type matches GRCh38; 0 = does not match.

Chm13v2

1 = haplotype type matches CHM13v2; 0 = does not match.

Gpopname

Filter by superpopulation group.

Popname

Filter by population group.

Total

Minimum number of hits (≥).

Start

Start coordinate (GRCh38).

End

End coordinate (GRCh38).

Sort By

Choose a field to sort by.

Order by

Ascending / Descending.

Show

Results per page.

regionname	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	ghapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	genename	chr	start	end
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0001	39	0	5	20	1	13	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0002	20	1	6	9	0	4	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0003	18	4	2	12	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0004	17	1	4	11	0	1	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0005	16	7	2	3	4	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0006	15	0	5	7	1	2	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0007	13	0	1	8	0	4	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0008	13	0	1	11	0	1	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0009	11	1	2	7	1	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0010	8	0	6	0	2	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0011	8	5	3	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0012	8	0	0	8	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0013	7	0	0	7	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0014	6	4	0	2	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0015	5	0	3	2	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0016	5	0	4	1	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0017	5	0	3	0	1	1	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0018	5	0	0	5	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0019	5	4	0	0	0	1	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0020	5	5	0	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0021	4	0	2	2	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0022	4	1	1	2	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0023	4	2	1	0	0	1	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0024	4	1	2	0	0	1	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0025	4	4	0	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0026	4	4	0	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0027	4	2	2	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0028	3	0	0	3	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0029	3	0	0	2	0	1	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0030	3	0	1	2	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0031	3	3	0	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0032	2	0	2	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0033	2	0	1	0	0	1	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0034	2	0	0	2	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0035	2	1	0	1	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0036	2	0	0	2	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0037	2	0	2	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0038	2	0	0	2	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0039	2	0	0	2	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0040	2	0	0	2	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0041	2	1	1	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0042	2	2	0	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0043	2	0	0	2	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0044	2	2	0	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0045	2	2	0	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0046	2	2	0	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0047	1	0	0	1	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0048	1	0	0	1	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/1	g0049	1	0	0	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506
ANKRD66_chr6_46741933_46764506	0/0	g0050	1	0	1	0	0	0	ANKRD66	chr6	46741933	46764506