JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Search Genic Haplotype Catalog

Haplotypefield

Choose the ACTG layer used to define haplotypes.

Genename

e.g. ALDH2, HBB.

Chr

Chromosome number (1-22, X, Y).

GRCh38

1 = haplotype type matches GRCh38; 0 = does not match.

Chm13v2

1 = haplotype type matches CHM13v2; 0 = does not match.

Gpopname

Filter by superpopulation group.

Popname

Filter by population group.

Total

Minimum number of hits (≥).

Start

Start coordinate (GRCh38).

End

End coordinate (GRCh38).

Sort By

Choose a field to sort by.

Order by

Ascending / Descending.

Show

Results per page.

regionname	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	ghapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	genename	chr	start	end
APOBEC3B_chr22_38977347_38997779	0/0	g0211	1	1	0	0	0	0	APOBEC3B	chr22	38977347	38997779
APOBEC3B_chr22_38977347_38997779	0/0	g0212	1	0	0	0	1	0	APOBEC3B	chr22	38977347	38997779
APOBEC3B_chr22_38977347_38997779	0/0	g0213	1	0	1	0	0	0	APOBEC3B	chr22	38977347	38997779
APOBEC3B_chr22_38977347_38997779	0/0	g0214	1	0	0	0	1	0	APOBEC3B	chr22	38977347	38997779
APOBEC3B_chr22_38977347_38997779	0/0	g0215	1	1	0	0	0	0	APOBEC3B	chr22	38977347	38997779
APOBEC3B_chr22_38977347_38997779	0/0	g0216	1	1	0	0	0	0	APOBEC3B	chr22	38977347	38997779
APOBEC3B_chr22_38977347_38997779	0/0	g0217	1	1	0	0	0	0	APOBEC3B	chr22	38977347	38997779
APOBEC3B_chr22_38977347_38997779	0/0	g0218	1	0	0	1	0	0	APOBEC3B	chr22	38977347	38997779
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0001	64	6	13	37	2	6	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	1/0	g0002	59	10	6	33	0	9	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0003	53	2	8	36	1	6	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0004	36	1	8	19	1	7	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0005	17	3	6	8	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0006	12	0	3	7	2	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0007	10	1	2	3	1	3	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0008	8	7	0	1	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0009	6	5	1	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0010	6	0	6	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0011	6	0	0	6	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0012	5	5	0	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/1	g0013	5	0	2	0	1	1	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0014	5	0	1	4	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0015	4	2	0	2	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0016	4	4	0	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0017	4	1	0	0	2	1	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0018	4	0	1	3	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0019	4	0	4	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0020	4	4	0	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0021	4	0	0	3	0	1	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0022	4	0	0	3	0	1	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0023	4	0	1	0	1	2	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0024	3	0	0	3	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0025	3	0	3	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0026	3	1	0	2	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0027	3	3	0	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0028	3	2	0	1	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0029	2	0	0	2	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0030	2	0	1	0	0	1	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0031	2	2	0	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0032	2	2	0	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0033	2	1	0	1	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0034	2	0	0	2	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0035	2	0	0	2	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0036	2	0	0	2	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0037	2	2	0	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0038	2	2	0	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0039	2	0	0	0	0	2	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0040	2	0	2	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0041	2	0	0	0	2	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352
APOBEC3C_chr22_39009257_39025352	0/0	g0042	2	0	2	0	0	0	APOBEC3C	chr22	39009257	39025352